4I6MA

Structure of arp7-arp9-snf2(hsa)-rtt102 subcomplex of swi/snf chromatin remodeler.
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
465
structure length
399
Chain Sequence
TLNRKCVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQCIIPSSYIKRTEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEEQKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQENNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKECYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASISPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of an actin-related subcomplex of the SWI/SNF chromatin remodeler.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 7
molecule tags Transcription/hydrolase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 107
structure length 399
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4i6mA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4i6mA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4i6mA03
1ESVA 2P9PB 4PKHA 3C7NB 2P9IB 3SLCA 3LDOA 2P9UA 2Q2RA 4MLHA 2D1KA 4HTLA 3MCPA 1LOTB 2HMPA 3CJ7A 1JCGA 3VGMA 5AQGA 3ZETB 2AA4A 4MLEA 4H5TA 5KQ8A 2E8AA 2OANA 2P9NA 4BRQA 4PL7A 5KPRA 4O5FA 4YDUA 3WXJA 4FWQA 2HF3A 4BQLA 2I7NA 1TYQB 1J6ZA 3I33A 3RSEB 3KHYA 4BRPA 1X3MA 2Q31A 4FL9A 1KAYA 1GLLO 3O5BA 3EKSA 4KBOA 2YHWA 3FR0A 4WQ5C 2A6AA 4LC9B 4BC2A 3AAQA 3CHWA 4A2AA 1ZXOA 3O8MA 1LCUA 5EXWA 4K43A 5JLFA 3EL2A 4JHDB 3UE5A 1BUPA 3L0QA 5AZIB 3DXKA 4BC5A 4A62A 4DQ8A 5LY3A 3I8BA 2CH6A 4JD2A 1ATRA 3QICA 2V52B 3W3DA 3H3OB 4DCHA 1MDUB 3O80A 2P9IA 4FPBA 1K8KB 4CBXA 2GWKA 2Q1NA 4XH5A 3ZX2A 1OKJA 3B8AX 4H5WA 2YCHA 4JN4A 3VERA 3VEYA 3ZX0A 4FWRA 2E2OA 2GUPA 2P9LB 3VEXA 3ZETA 4BC3A 1KAZA 1C0GA 5BN8A 3VF2A 2J4RA 3HTVA 4BG9A 2BTFA 5BN9A 1XUPO 3A8YA 4WQ5A 4BRMA 3CJBA 1EQYA 4H0VB 5EX5A 5F2RA 2E1ZA 3QFUA 4CBWA 4BGBA 1Q18A 4BRGA 3MN9A 1GLAG 4IJNA 2D0PA 3DJCA 1QQOA 3CETA 4IZ9A 2QWNA 1V4SA 1HPMA 2ITMA 4RTFD 3ENOA 4AM6A 2W40A 4BR7A 3HM8A 3HI0A 5I9EB 3IDHA 3ZEUB 4BRCA 3FGUA 3VGLA 5KQDA 2A41A 3H6EA 1T44A 3D2FB 1BG3A 3DAWA 3LM9A 3MDQA 2VYPA 3AAPA 5BREA 3BP8A 1ATSA 3OHRA 4Y0WA 4CZJA 4B1YB 2CH5A 5AZJB 5F0XA 3ID8A 4K41A 3J8AA 3DXMA 1D4XA 2FF3B 1S3XA 4PKIA 1SQKA 3QBWA 1T6CA 4RWTA 1BDGA 4FOIA 2FSNA 3GOIA 4PL8A 5EVZA 3MN6A 4EFHA 4GY2B 3WXKA 1RDWX 2E20A 1NGEA 3CJCA 3D2EA 4BVPA 3W0LA 3M1FA 4B1XB 3DWLA 2P9SA 2V7YA 3L4IA 1IG8A 2ZGZA 3U4LA 4XEIA 3S41A 1U2VB 3FZMA 5TKYA 4ISEA 4PKGA 4QS7A 1NGDA 2QWQA 4K25A 1QZ6A 2H3GX 1YVNA 1E4GT 3A5NC 2VWBA 3KZBA 3CI5A 5B8HA 3JS6A 5LJWA 5F1XA 3UKUB 4Z94A 4M63C 4MO5A 4IXCA 3ZEUA 4BRFA 3ZX3A 2YJFA 4FSVA 2V51B 4ISFA 4H5RA 2E88A 3JXUA 1Y64A 3MMVA 2A40A 3TU5A 2E2QA 3ENHA 2FF6A 2FSKA 2GEMA 1SZ2A 3ATUA 3LDNA 4B1ZA 3VEZA 4ISGA 4WQ4C 4B1VA 4CZEA 1TUUA 2A5XA 5AQXA 1GLBG 2EWSA 3LL3A 4B1UB 1JCFA 3ATVA 4DB3A 5AQPA 3WEEB 4C23A 5FPDA 3VF4A 2ZWHA 4MO4A 1KAXA 2P9PA 2ZF5O 3H1QA 4FPAA 3C7NA 2YHXA 4RCHA 1BA1A 3WQUA 4DHYA 5BRFA 3VEWA 3O1BA 3HSCA 1NGCA 2CGKA 3M3ZA 4BRIA 3CIPA 2D0OA 2D4WA 2QWLA 2A3ZA 1JCEA 1V4TA 5ADXA 4BRNA 5AFUA 4CZMA 4I6MB 1Z6RA 5KPTA 4FWSA 4WYBA 3LM2A 3LDPA 3FZKA 2ASMA 3H1VX 2UYTA 4BRKA 1NMDA 1TYQA 2Q0UA 4EIAA 3RSEA 1TUYA 3D7EO 5EOYA 3ULEB 3GDQA 3BEXA 4BVOA 3H3NO 5KPZA 4BROA 2NRHA 1QHAA 2QWPA 1NWKA 5ELZA 1NGJA 3AY9A 2FSJA 2P9UB 4JNEA 4J8FA 4FWPA 4XH1A 3CJ9A 5JMVA 5JLHA 1MA9B 3LDLA 4JHDA 3VGKA 5AQFA 3U9DA 5AZIA 3BF1A 1G99A 4H03B 4CZKA 3QMLA 2QM1A 3MK6A 3H46O 4BREA 3H45C 2QXLA 3MN7A 4BR2A 2P9NB 3R6MA 3HBTA 2ZGYA 3GL1A 2BUPA 5FPNA 4CJ7A 1Z05A 2YJEA 3G25A 4BR4A 5BR9A 5AQUA 4CZGA 1K8KA 3QFPA 4JAXA 3EN9A 1GLFO 4YDUC 5JICA 2YI1A 3BF3A 4H0XB 4NB4A 5ADXH 4NO7A 3LDQA 5AFUH 1NBWA 1GLEG 4BR0A 1GLJO 1NGIA 3SK3A 3VESA 3UKRB 4BR9A 2GTDA 5CE3A 2P9LA 1BA0A 2F9TA 5E26A 3M6GA 4FWNA 2IIRA 1NLVA 4H5VA 2VCPA 2GELA 5AQVA 1NM1A 1HKBA 4H0TB 4A61A 3DXKB 3SMSA 4M7XA 4FWLA 4CI6A 1HUXA 1IJJA 2HF4A 3WQTA 2E2NA 2IVNA 2FXUA 2ASOA 3FE1A 5AQIA 3ULEA 3BUZB 1KXPA 4JD2B 1BWFO 4BG8A 2QWRA 2AP1A 3FZFA 2GWJA 1GLCG 1WOQA 1GLDG 2CGLA 3VEVA 3GE1A 4EHTA 3U9ZA 1XC3A 3CQYA 3UB5A 5AQQA 1CZAN 4BGAA 3CQXA 3D2FA 2Q97A 5AQHA 1NGAA 4FOEA 4FO0A 1YXQA 3AARA 4H5NA 3U8XA 4CZLA 1HKCA 3EZWA 5AZJA 1RFQA 3P4IA 5AQKA 2ASPA 1HLUA 2FLOA 2Q0RA 2WUSA 3HZ6A 4CZIA 1DEJA 1NGFA 3VPZA 1ZC6A 3VF6A 4F9OA 1YAGA 4XH4A 4B1WB 4HWIA 4BR5A 1DGKN 2NLXA 3EKUA 1HKGA 2Q36A 3GG4A 3O08A 4B9QA 3TPQA 1E4FT 2NZTA 4BRAA 3UKRA 3FLCO 5FPEA 4A2BA 1X9JA 3KVGA 3QDKA 5BPLA 1C0FA 1U2VA 1BO5O 2PBDA 3WXIA 3VOVA 1NGBA 4QS8A 3WXLA 2QWMA 5AQJA 3R8EA 2CGJA 1QQNA 2V7ZA 5AQZA 1MWMA 4IWVA 5LJVA 3DXMB 5AQNA 3L6QA 3C0BA 4M7YA 1H1VA 3A5MC 3A5OC 3CERA 3WT0A 1RGIA 3QB0A 4AM7A 3UKUA 2P9KB 3O6WA 4FWMA 1P8ZA 1NGGA 2E1YA 2YHYA 3D2EB 4K42A 5BRDA 5FPMA 1ZBSA 2PAVA 2P9SB 4WQ4A 5AQOA 3IUCA 1MWKA 4L3QA 4BQZA 4EHUA 3CJ1A 2A42A 3GBTA 4O8KA 5AQWA 3MN5A 5EY4A 1QZ5A 5BRHA 1HX1A 3F9MA 2KHOA 3EO3A 4H0OA 5AQTA 5AQYA 2DPNA 2QW9A 4QS9A 1R59O 2E2PA 5AR0A 3WEEA 3CJAA 1SAZA 1XQSC 1BOTO 1BU6O 1WUAA 2I7PA 3QBXA 5AQRA 4CZHA 1DKGD 3IFRA 1HJOA 4H0YB 4CZFA 3FFKB 3O4WA 4IJAA 4CD1A 3O1WA 4IO8A 4BC4A 3IMXA 1S22A 5BPMA 4BRHA 1U6ZA 3VEOA 4BRLA 1ATNA 4GNIA 2IVPA 5AQLA 4CD3A 5AQMA 2QWOA 3VETA 3VENA 4CBUA 5E84A 3A0IX 4E1JA 4I6MA 2HOEA 4H0PA 4BRDA 1QQMA 1NGHA 1T6DA 5BPNA 3SMPA 5AQSA 1YUWA 1X3NA 4FWOA 3FZLA 3WUHA 3A5LC 2F9WA 3SJHA 2IVOA 3R9PA 2P9KA 2W41A 4EAHD 3FZHA 4FWKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ESVA 1VQLN 2G8IA 3C7NB 1C6VA 3RRHA 1HNVA 3HVTA 1UA1A 2P9IB 3O9TA 4JK9A 3SLCA 3L8BA 2P9UA 2E6LA 1NJWA 1T3VA 3O3GA 2D1KA 1X1PA 2YNFA 1LOTB 3VQAA 3NF7A 1N5YA 3AVGA 2O8EB 4FLYA 2OANA 4O5FA 4YDUA 2OTJN 3C6AA 1TYQB 2BH1A 1RTIA 3KHYA 4A5BA 3S9HA 1X3MA 1GLLO 1A5XA 5C2DA 1U48A 2HSTA 3T1HK 3OYLA 1JLGA 1W7AA 5HRRA 4O44A 2ZE2A 4X66K 3SQ0A 2JGUA 3ZT4A 3VTIA 3CCUN 5EXWA 3L0QA 4X62K 3DXKA 3AV9A 4FJMA 3MWTA 4V19S 4NLCA 2CH6A 2Z1GA 3QICA 1S9EA 3HSTB 2FBYA 3NDKA 3P5JA 4DCHA 4DR5K 3O80A 2P9IA 1K8KB 3I0SA 2BANA 3VERA 3PY8A 4FCYA 1W97L 2E2OA 5IT9O 1GOCA 3KJVA 2O8EA 2ITGA 4CJEA 1C0GA 3VF2A 1WB9A 5BN9A 1XUPO 1S5JA 4Z4IA 3A8YA 3U3YA 2E1ZA 4CBWA 1L3UA 3T3FA 1IBKK 5H1SQ 2HVIA 4W5OA 3DJCA 3SQ2A 4KV8A 5E41A 3IRXA 3CETA 4IZ9A 2QWNA 4TSXA 3MCAB 3M8QA 4CFAA 1NK8A 4J2BA 4ILHA 2KFNA 4RW9A 4AM6A 3U3GA 3HI0A 5I9EB 3IDHA 1K8AO 4DR7K 4BRCA 4E7JA 3VGLA 3V6DA 3ZSXA 4DMNA 5HOOA 2A1SA 3BP8A 1SKRA 2UXBK 3ZYYX 1JXEA 4EP5A 3NMUA 4CGHA 1WSEA 5JVGL 4FLXA 3DXMA 1D4XA 2FF3B 4DV5K 3HJFA 4RWTA 4IOCL 3QEPA 1WBBA 4DTNA 4C8NA 4EFHA 4FK0A 3WXKA 5GIOA 4FLWA 1TKXA 2E20A 4B3SK 4M3XA 2PFUA 4FJHA 3M1FA 2HMIA 1BHLA 4EP4A 3L4IA 1IG8A 3SUNA 1U2VB 4JK8A 1NK7A 4OVLA 3L2VA 4QS7A 3NAEA 5HL7L 4AILC 4I9LA 1NGDA 4YORA 4CECA 2HVHA 1NK9A 1E4GT 3NFAA 3KZBA 3VN5A 4FVMA 3O4QA 2I5JA 5KI6A 3TAEA 3UKUB 3H08A 3RMDA 3I0RA 4I9QA 4CJ5A 4FSVA 1ILYA 1NJIO 3T69A 3T1YK 4JI0K 2O8FB 3MMVA 3TU5A 2E2QA 3ENHA 1B9FA 3PSIA 1HYZA 3CC4N 3ATUA 3MXJA 5DMRA 3E66A 4B8AB 2EWSA 3LL3A 4Q5VA 3ATVA 2IOCA 1YTAA 3UIQA 2A1RA 1RDCA 4M3RA 1TAUA 1TVRA 2FC0A 3E9PA 2P9PA 1FK9A 3HP6A 2AJQA 5BRFA 1KFDA 3VEWA 3O1BA 5FRMA 1ITGA 3M3ZA 1ZBHA 3CIPA 2D0OA 4N47A 1JCEA 1RDDA 1C1CA 3C6HA 1TV6A 2F8SA 1K9MO 5AFUA 3SZ2A 4B9NA 3D6RA 3SAHA 5J2QA 3LM2A 3SV3A 3LDPA 4DU4A 3FZKA 2ASMA 3V9WA 1TL1A 1JJ2M 4BRKA 3IKMA 2Q0UA 4EIAA 3V9XA 3RSEA 1LWEA 5DM6L 1RILA 3CCLN 5KGXA 3HXMA 1P90A 4BROA 4CJKA 4KTWA 4FYDA 2QWPA 4CHNA 4DFKA 1NGJA 3AY9A 1NNEA 3AVMA 4WCEL 2DFFA 4XH1A 5JMVA 3VQEA 4Z4HA 3VGKA 5AQFA 3U9DA 2BGGA 4GKKK 4DSLA 3MK6A 3LP0A 2YNGA 1D9FA 1IKXA 3C6UA 5CYMA 3EYZA 3QIPA 2Y1JA 2G8HA 2QI2A 4JKDA 3V9ZA 1UA0A 3MEDA 1Z05A 4BR4A 4WFNL 4KI4A 5AQUA 4C1NI 4KH4A 4JAXA 3EEQA 4FJ5A 2YI1A 4PWDA 1L3VA 4NB4A 4NO7A 1W9HA 3LDQA 3TAFA 3P31A 1NBWA 1NGIA 3UKRB 4BR9A 2GTDA 2P9LA 1B9DA 1BA0A 2F9TA 4FWNA 1NLVA 3DI6A 3RMAA 3CCQN 5AQVA 2W00A 4DQIA 1NM1A 3SMSA 4FWLA 1HUXA 1IJJA 2QA4N 4DTOA 3HT3A 4DSIA 3BUZB 3NGZA 1YIJN 4CEBA 3FZFA 3OYHA 4LFAK 2FBVA 4E1MA 2P1JA 3K2PA 3P39A 4CESA 3QEXA 3UB5A 3D2FA 3NH0A 4FOEA 1IH7A 2G8WA 4Z4GA 4FO0A 1YXQA 4FM0A 4HUGA 4CZLA 1HKCA 1BL3A 4KTQA 1RFQA 4Z4CA 5AQKA 5I42A 2Q0RA 2GBZA 2WUSA 2LSNA 1S1WA 3OYFA 3VF6A 4F9OA 4B3OA 1X9SA 4B1WB 3J7AP 4A57A 4YOUA 3N4QA 4N5SA 3V9SA 4DFMA 3UKRA 5IWAK 4A2BA 4DR6K 4FJLA 4LFCK 3AGRA 1JXBA 2GX9A 3O9SA 1C0TA 1BO5O 4FK4A 4B9SA 3KIOA 1EO1A 5M1KA 4FJJA 3V4IA 1WN7A 3TAQA 2C1IA 1QQNA 2V7ZA 3AVJA 3NGYA 4LF9K 1S6QA 3RMBA 3VQ9A 4OGEA 3CERA 2Z1IA 3AA4A 3QB0A 2ZM6K 4AM7A 2OPQA 1JL2A 1IKWA 4FWMA 3V1RA 2E1YA 3D2EB 4K42A 4DV4K 1LV5A 3K59A 4BWJA 3DLEA 2EHGA 3HVRA 4WQ4A 5AQOA 3ZSQA 4Q0BA 3OYEA 4KH6A 2WTUA 4DU1A 4DG1A 4CFCA 2ZQBA 5AQTA 4FM2A 4XJXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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