4RWTA

Structure of actin-lmod complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
ALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIREDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAKSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Drosophila melanogaster
publication title Mechanisms of leiomodin 2-mediated regulation of actin filament in muscle cells.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
total genus 107
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4rwtA03
2Q0UA 4B1YB 4CZHA 1NGJA 1CZAN 5AQPA 3CJ7A 1YUWA 3VEZA 3O5BA 5BPNA 3D2FA 2E2QA 3LDOA 4PKIA 3O1WA 3O8MA 2A3ZA 4BRCA 5EVZA 3UE5A 3P4IA 3ID8A 4NO7A 1ATRA 5B8HA 5BR9A 2KHOA 3CERA 2VWBA 2WUSA 1NBWA 4BRLA 4K42A 4MO5A 2Q2RA 3MN6A 1NGFA 4ISFA 1EQYA 5BPMA 1QHAA 2D1KA 1RGIA 1BA0A 1G99A 2E20A 3GDQA 1MWMA 3BEXA 2YHYA 4AM7A 5AQXA 2I7NA 4CBWA 2CGKA 1D4XA 1KXPA 4FWRA 4H0OA 3CIPA 4QS8A 4Y0WA 2W40A 3KHYA 4CJ7A 2ZGZA 3DXMB 4FOIA 1NGEA 1T6CA 5LJVA 2D0OA 4B9QA 5F1XA 3O80A 4L3QA 5AQGA 4XH1A 4BRHA 3D2EB 4FL9A 3U8XA 4H5TA 1P8ZA 3MDQA 4BREA 4ISGA 4BC5A 4DQ8A 2ZGYA 3C0BA 2QWMA 1YVNA 4GY2B 3H3NO 4WQ4A 3WXIA 3VGKA 1LOTB 5ADXH 4FWKA 5AQHA 3R6MA 1BDGA 2P9KA 3DJCA 3CJ1A 1BU6O 1T44A 2D4WA 4JD2A 4FSVA 3HTVA 4M63C 4BR4A 1QZ6A 1ZBSA 1H1VA 2P9LB 1SZ2A 1NGGA 4M7YA 5CE3A 5EX5A 4K41A 4XH4A 3BP8A 4BG8A 1V4TA 3FFKB 4BRFA 4QS9A 4QS7A 3EO3A 3EN9A 1XC3A 1C0FA 5TKYA 1XUPO 2Q36A 1TYQA 2BTFA 2VYPA 4MLEA 4CZLA 2YJEA 1KAYA 2P9IA 3VOVA 4H0TB 3RSEA 3H3OB 4BR5A 3EZWA 2QXLA 2GWKA 1GLEG 2ZF5O 3QMLA 2F9WA 4FO0A 2Q1NA 1TUUA 1J6ZA 1X3NA 2E88A 4IJAA 3H1VX 4BRQA 5EY4A 4CZIA 3DAWA 3CJBA 5BRFA 2A40A 2CH6A 2HF3A 4EHUA 1NM1A 3IDHA 2ASPA 3CETA 2Q0RA 5AQMA 2QWLA 2ASOA 3SMSA 2GWJA 3FR0A 3ZETA 4EHTA 4FOEA 3D7EO 5AQOA 1WUAA 3GG4A 2YCHA 4B1ZA 4FPAA 4IJNA 3H1QA 2P9KB 2V52B 2FLOA 3GOIA 1TUYA 3VENA 1QQMA 3KZBA 4FWSA 4HTLA 3ZX0A 4JNEA 4JD2B 3VGLA 2GELA 4BGAA 4H5NA 5AZIB 5F0XA 3SLCA 5AQKA 3I33A 1V4SA 1GLJO 2CH5A 3DXKA 4EIAA 3FLCO 3W3DA 2YHXA 5ELZA 3O4WA 3FZFA 2NZTA 3R9PA 1JCEA 3FZLA 1QQNA 5AQQA 3L0QA 5BPLA 2D0PA 3CJAA 3LDPA 1SAZA 1X9JA 1TYQB 3A5OC 3WUHA 1LCUA 3AAQA 2P9IB 5AQVA 3IFRA 4BROA 3RSEB 3UKUA 5AQLA 5BREA 1NWKA 4CZFA 1BWFO 4BQZA 1HKGA 3VPZA 1X3MA 1U6ZA 3H45C 5KQ8A 3O1BA 3W0LA 4CZMA 2P9PA 3WQTA 2P9NA 3KVGA 4H0YB 2PAVA 4C23A 5JICA 1XQSC 4JHDA 5AQTA 2IVOA 2W41A 3TPQA 5KPRA 3SK3A 3LL3A 4H0VB 4BRKA 1JCGA 3HZ6A 3MN9A 5AQSA 3VEVA 4EAHD 4CI6A 4B1UB 1OKJA 2J4RA 1Z05A 5AZJA 3D2FB 2HOEA 4YDUC 4BRDA 2CGLA 3M1FA 3ATUA 4CD3A 3A5LC 3HBTA 2EWSA 3S41A 3U9DA 3VGMA 4EFHA 5LY3A 1R59O 5AQYA 3BF3A 3ENOA 5AQRA 2A42A 2P9UA 2I7PA 3ATVA 4I6MA 1QZ5A 2YJFA 4BG9A 4H03B 5ADXA 3ZEUA 2E1YA 3JS6A 1YXQA 1IG8A 2H3GX 5E84A 5AQJA 2V7ZA 3ZX2A 3LDQA 3LM9A 3BUZB 1T6DA 3ULEA 3J8AA 4HWIA 5FPEA 2HF4A 3QFUA 3JXUA 4WQ5C 5AQWA 4PL7A 3VEWA 4J8FA 4FWQA 3UKUB 5BN8A 4FWPA 2QWQA 3IMXA 5AQUA 3U4LA 4WYBA 4BRMA 4JAXA 3VESA 3VF4A 3C7NA 2P9PB 2P9NB 1MWKA 4FWNA 3FZKA 2A6AA 3LDNA 2CGJA 3G25A 2QWNA 4B1WB 3GE1A 4H5WA 4K43A 3VF2A 2E2OA 1K8KA 4Z94A 2A5XA 4BVPA 2YHWA 3QBWA 5KQDA 3AARA 1BG3A 3CHWA 3VF6A 5FPDA 2QW9A 2AA4A 2FSKA 2IIRA 5F2RA 2QWOA 3I8BA 5BN9A 5AZJB 5KPZA 2QM1A 4BRAA 4H5VA 3SMPA 2Q97A 3MCPA 1E4FT 3A8YA 2ZWHA 3DXMA 2P9UB 4BRNA 2FSNA 4I6MB 3VETA 3VEYA 5FPNA 3ZEUB 5EXWA 4CZKA 3WXKA 4MO4A 4YDUA 1Z6RA 4IXCA 4DB3A 1MDUB 1NGDA 3MN7A 3OHRA 4O8KA 4AM6A 1YAGA 2FF3B 1NGCA 3VEXA 4A2AA 1S22A 1JCFA 1ATNA 3ULEB 3ENHA 3AY9A 3GBTA 1HLUA 3DWLA 4CZJA 4DCHA 3M3ZA 3TU5A 3IUCA 2FSJA 5FPMA 4M7XA 2UYTA 4CD1A 3CI5A 4BVOA 1HKCA 1GLCG 3L6QA 4PL8A 4O5FA 3ZX3A 2P9LA 5BRDA 3C7NB 3QDKA 5AQNA 3WEEA 4WQ5A 3O08A 2FXUA 4BGBA 1DGKN 3FGUA 4KBOA 1WOQA 3H6EA 1DKGD 1K8KB 5JLHA 3WXJA 2V51B 1BO5O 5AFUH 2NRHA 3H46O 3ZETB 1GLFO 4IWVA 4XEIA 4BR2A 3U9ZA 3O6WA 1GLLO 4BRIA 3B8AX 4F9OA 5JLFA 5EOYA 4BC2A 5AQIA 1GLAG 4RWTA 1NMDA 4FPBA 3MK6A 4IZ9A 3MN5A 2BUPA 2QWRA 4PKGA 4CZEA 1GLDG 3HM8A 1Q18A 4BR9A 4H0PA 1NGIA 2P9SA 3UKRA 3WQUA 3DXKB 1C0GA 2OANA 3CJCA 4PKHA 5AQZA 1HUXA 5E26A 3VEOA 3HSCA 5AR0A 4BC4A 1U2VA 3QB0A 3A5MC 2E8AA 3CQYA 3QFPA 4BRPA 3FE1A 4ISEA 1KAZA 4DHYA 4RCHA 3QBXA 4RTFD 3LM2A 3FZHA 1QQOA 1E4GT 2GUPA 2HMPA 3GL1A 1BUPA 5AZIA 5JMVA 4A2BA 4BQLA 4BR7A 5KPTA 1NGAA 1HKBA 3WEEB 1RFQA 1ZXOA 1KAXA 2E1ZA 3CQXA 4FWMA 3SJHA 2DPNA 4MLHA 1Y64A 1RDWX 3EKUA 2GEMA 3L4IA 5AQFA 3EKSA 1SQKA 2IVPA 1NGHA 1NLVA 4FWOA 5I9EB 1HX1A 1MA9B 2V7YA 3R8EA 3AAPA 3WT0A 1ESVA 4H0XB 1HPMA 4JHDB 2NLXA 4LC9B 3WXLA 1HJOA 3A5NC 4NB4A 1ATSA 4E1JA 2ITMA 3CJ9A 3UB5A 4BRGA 1NGBA 2Q31A 1S3XA 1IJJA 2E2NA 2ASMA 4FWLA 3FZMA 2VCPA 2GTDA 3F9MA 3A0IX 2E2PA 2YI1A 5LJWA 3M6GA 5BRHA 4BC3A 2IVNA 3LDLA 4XH5A 3VERA 1BA1A 2QWPA 4JN4A 1GLBG 2P9SB 5AFUA 3UKRB 1BOTO 4BR0A 3MMVA 4A62A 3EL2A 4IO8A 4CBUA 4WQ4C 2A41A 1ZC6A 4CZGA 3HI0A 4H5RA 4B1XB 4CBXA 2PBDA 2F9TA 2FF6A 3QICA 1U2VB 4B1VA 4K25A 3D2EA 4A61A 3BF1A 1DEJA 4GNIA 2AP1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q0UA 4B1YB 4CZHA 1TAUA 3VQ4A 3MX5A 5AQPA 1FW6A 3CJ7A 3VEZA 1VQLN 5BPNA 1YF5L 3LDOA 4Z4GA 1HQUA 3O1WA 4JK9A 1L3SA 3N4PA 1S1WA 1S1TA 1ZBHA 1ATRA 3K5MA 2VWBA 2NRRA 1JL2A 1WAFA 1U4BA 4X64K 4M3UA 1WAJA 1NJIO 1N34K 4ISFA 4DFPA 2WTUA 5M1PA 2VG5A 1VQPN 1RGIA 4NCAA 4J2AA 4CJ4A 2W6LA 3HVRA 3SYZA 1VAZA 4DG1A 5LMNK 4KPYA 4E72A 1W9HA 3BEXA 2YHYA 4AM7A 3K2PA 4YOYA 3MWPA 3C65A 2CGKA 2HHWA 3EE8A 1L3VA 4E3SA 3DXMB 4E89A 4LH5A 3CCQN 3V4IA 5GIOA 4DR3K 4L3QA 4DV2K 1D5AA 3O4NA 3DOKA 4BRHA 1IG9A 3F2KA 3D2EB 3U8XA 4HTUA 1SUQA 4BREA 4YOVA 1KCFA 4I9LA 4IO9L 1QTMA 3RMDA 2O8FB 4GY2B 4YOTA 4AHUA 3WXIA 3VGKA 2HNDA 1LOTB 4FWKA 4GV6A 3R6MA 1NK7A 2BDPA 1W7AA 1L5UA 4JLHA 1X9SA 4M3XA 2DFEA 4RW8A 4NYNA 3EZ5A 2I5JA 4DQSA 5C24A 1HQEA 1EX4A 1ZBSA 2Z1JA 4LF5K 1KQSM 4DV0K 4NXNK 3K0SA 3LP2A 4U7BA 3P39A 1KTQA 3EO3A 3ULDA 3CQ8A 1Q9XA 4B8AB 5TKYA 3NDKA 4DKWA 4FK0A 2Q36A 2YNFA 4KB0A 2DTUA 2GBZA 3QEVA 4GW6A 4MLEA 4CZLA 3VOVA 3E01A 4BR5A 3HPHA 1NJYA 3R1XA 2HNYA 4DUZK 1NMNA 2O8EB 3ZT2A 5DK5A 3EE9A 5HRSA 1J6ZA 1X3NA 4IJAA 4B9NA 5BRFA 1NG9A 4NCGA 1JJ2M 2A40A 2NRVA 4EHUA 2HBLA 3IDHA 1KVAA 3CETA 2Q0RA 3K9JA 1TGOA 4GKJK 5KRTA 1Q9YA 3HPOA 3H1QA 4CEEA 1DTTA 1OH6A 3GOIA 3T1HK 1NK0A 4FWSA 4JNEA 4JD2B 3VGLA 2GELA 4DFJA 4H5NA 3UIQA 5AZIB 3W3DA 2W00A 2YHXA 4LF4K 1VHXA 1U48A 2XY7A 4CVNE 3FZLA 2NNWA 4DV4K 5AQQA 3L0QA 2BH1A 5CYMA 1T7PA 2RN2A 3ZSZA 1TYQB 3A5OC 3WUHA 1RT3A 1LCUA 4V19S 2P9IB 5AQVA 1QE1A 1SS6A 3RSEB 4B9VA 1NWKA 3C6TA 4CZFA 4CGFA 1HKGA 3M8QA 5CR4A 3VA0A 2QTDA 3H45C 5KQ8A 3W0LA 1CXQA 3WQTA 3K59A 2P9NA 3SAHA 4HUFA 4CE9A 3I0SA 3O9SA 4DR7K 2VQEK 2Y1JA 5AQTA 4DSKA 2W41A 4BRKA 4H0VB 1JCGA 4CF1A 4YOXA 4WFAL 3RRHA 4EAHD 4CI6A 4B1UB 1OKJA 2F8TA 4OJRA 4FZYA 3DOLA 4IBNA 4BEBA 4BRDA 3AA4A 3M1FA 2G8HA 3ATUA 3U9DA 3JYTA 3VGMA 4CFCA 4JI3K 5AQRA 4N76A 3BF3A 4Y1CA 1QZ5A 2YJFA 4JKAA 3DM2A 1HJRA 3SNNA 1YXQA 4DLEA 3VMFB 5AQJA 4MDBA 3LDQA 3BUZB 3KTQA 4CEAA 3J8AA 3CC4N 5FPEA 2QKBA 4I7FA 4WQ5C 1XMQK 3VEWA 1VQ4N 2OPSA 3IG1A 4FWPA 4DS4A 1XMOK 1RDCA 1YHQN 4JAXA 3VESA 3VF4A 3CMAN 3CCVN 3HK2A 2ZQBA 4Z4FA 1ASVA 2P9PB 2RF2A 1MWKA 4FWNA 4CGDA 1G15A 3G25A 4B1WB 2D0CA 3ASMA 4K43A 4Z4HA 3CG7A 3CPWM 1U47A 3NHGA 4CF2A 2YHWA 1BG3A 3VF6A 3TI0A 5F2RA 2QWOA 3J7ZO 5GADP 5BN9A 5AZJB 4DF8A 4HUGA 2Q97A 1E4FT 1J54A 1NOZA 2P9UB 4KH4A 3B6OA 1NU0A 2NUBA 5FPNA 4AHSA 3L3VA 3OJSA 2X74A 4MO4A 3OHRA 4AM6A 4O8KA 2YNIA 3P83D 3NH2A 2HSTA 1NGCA 4A2AA 4JI2K 3TAFA 4LSLA 3ULEB 1N6QA 3AY9A 1L3TA 1N8RO 1A5XA 3GBTA 3VQ9A 3D6RA 1YJWN 4DSIA 1RNHA 4YORA 1RT1A 3DLEA 1HRHA 4QAGA 4KO0A 4HUEA 5HLFA 4PL8A 4O5FA 3ZX3A 3QDKA 3BF1A 3KKRA 1RTIA 1A5WA 3MXMA 3E9PA 2HHSA 4DV1K 4GVEA 4DU1A 4ID1A 1BGXT 1DKGD 1TKTA 3H08A 4NXMK 1NKCA 1DTQA 2ZJQL 1XC9A 2HHTA 1Z26A 2KW4A 4JI6K 4XEIA 1RT2A 4BR2A 1NJZA 3PO5A 5EOYA 1GOAA 3KWIA 2XY6A 1TKDA 3SUQA 1ASUA 4IZ9A 1QVFM 3PSIA 1J9AA 1BHLA 4PKGA 1GLDG 1C1BA 1UA0A 2QA4N 3KD1E 3AA5X 2P9SA 2Z1IA 4TSXA 1C0GA 5JS1A 3SQ2A 1RBVA 4CHPA 2HBJA 3I8DA 3TR8A 2E8AA 3EEQA 3V9ZA 1T3VA 4JS4A 3AVKA 4ISEA 1ZYQA 4X62K 1KAZA 3CMEN 5AJ3K 5FROA 5HL7L 4BY9C 4CJVA 4BE1A 2F8SA 1IBKK 4KFBA 3NGIA 1E4GT 2GUPA 2E4LA 4ELTA 4E7HA 3WEEB 1RFQA 3KLIA 4HVJA 3SJHA 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1E3MA 1XI1A 1FJGK 2LSNA 3DJCA 5CZ2A 1WNSA 5C12A 1T44A 4FM1A 4JD2A 4FSVA 3HTVA 4BR4A 1NK4A 3RWUA 1SZ2A 2HHIA 5EX5A 4EZ6A 4CJUA 4XH4A 3ZYYX 1V4TA 4QS9A 2YHAA 3M8RA 4W5NA 3SBTA 3MECA 5DM7L 1RDBA 1EWRA 1J5OA 3OYEA 4BDYA 5HRNA 4O0JA 1TYQA 2VYPA 1HNVA 4PA1A 2P9IA 4MFBA 3RSEA 3EZWA 2QXLA 4B8CA 4O0IA 2GWKA 1GLEG 1X9MA 3V9XA 2ZF5O 3ZSXA 1FKOA 3QMLA 4NLBA 5GIPA 4FO0A 2Q1NA 1TUUA 2VGMA 1GOBA 4BE2A 3THWA 1ASWA 4BDZA 1N33K 1OH5A 1ILYA 2HF3A 1LWFA 2OTLN 4CHNA 1NM1A 4DR6K 2ASPA 1C6VA 3TTFA 4C8KA 4FJHA 3G71N 4FOEA 4B9TA 4R79A 1RBSA 2ZJRL 4FM2A 4OPAA 2UXBK 2KFZA 3SUNA 3THYB 3TAPA 4CJPA 3VQBA 3VENA 3OJUA 3KZBA 3ZX0A 4FCYA 4FJKA 5F0XA 3SLCA 3I33A 3OYAA 1LV5A 2O4IA 1EKEA 4EIAA 3FFIA 3FLCO 3QINA 4HCBA 1OVQA 3R9PA 4DSFA 2NRTA 4E1MA 3LDPA 1B9FA 1SAZA 3RMCA 1X9JA 3T69A 1JLBA 3V1OA 4FXDA 3AAQA 1VK0A 5J2PA 1YJNN 3LP0A 5J1EA 3U6FA 4DR4K 3PV8A 3HT3A 1BWFO 3NGZA 3OW2M 1OVYA 1IV0A 5M1NA 3ALYA 4JI8K 1X3MA 1J53A 1U6ZA 1I39A 3VA3A 4CZMA 1K6YA 4CIFA 3TSQA 2P9PA 2ETJA 4DTSA 4KTQA 4H0YB 3SUPA 2HHVA 4K0KK 3BZKA 1O13A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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