4WYBA

Structure of the bud6 flank domain in complex with actin
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
367
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Structure of a Bud6/Actin Complex Reveals a Novel WH2-like Actin Monomer Recruitment Motif.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 96
structure length 357
sequence length 367
chains with identical sequence C, E, G, I, K, M, O, Q, S, U, X
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4wybA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4wybA04
3CJ1A 1DEJA 3VF4A 2QWPA 2P9PB 4FOIA 2A6AA 2QW9A 4CZHA 2DPNA 3WQTA 4H5TA 4JNEA 4CZKA 1R59O 1BOTO 4PKGA 3U9DA 1BG3A 3SK3A 3A8YA 4CD1A 3LDPA 1BU6O 5AQMA 4BRFA 1MWKA 3MN5A 3LDQA 3R9PA 3L4IA 3EN9A 4FSVA 1XUPO 3VESA 4CZEA 1GLDG 1JCEA 5JLHA 2ZF5O 4CZGA 1NGGA 3WEEB 4H5VA 5AQYA 4WQ4C 3ZETA 2A40A 1U2VB 2FF6A 5AQIA 4JN4A 4H0OA 2A41A 3VEVA 3GL1A 4A2AA 3M1FA 5ADXH 5AQTA 5TKYA 1DKGD 4BR5A 3FR0A 1NM1A 2P9PA 3TPQA 1XQSC 4B9QA 2A5XA 2YHXA 3O5BA 4BR4A 4FWKA 1GLAG 1Z6RA 4E1JA 1WUAA 2PBDA 3VENA 4CZIA 4IJNA 2CH5A 1YVNA 3EO3A 4K41A 4BC5A 4H5NA 2E1ZA 3VGMA 4L3QA 2A3ZA 1BDGA 3S41A 3VGLA 3A5OC 4FPBA 5EX5A 4BR2A 1IJJA 2E88A 3VERA 4GNIA 2ITMA 3LL3A 3WUHA 2CH6A 3IMXA 3J8AA 3HBTA 5AQNA 3VGKA 3WEEA 2NLXA 2ASMA 4BR0A 4IJAA 3SMSA 2OANA 1U2VA 2FF3B 4BG9A 3CJBA 2P9IB 1RDWX 5F2RA 4BRKA 3I33A 4B1WB 1BWFO 2ASOA 1P8ZA 2F9WA 3GG4A 5BREA 2V7ZA 3BF1A 5BPMA 1ESVA 3EKSA 3RSEB 4BRIA 4C23A 3GBTA 3HZ6A 5B8HA 1GLLO 4H0XB 2CGKA 2H3GX 3WT0A 2GWJA 4PL7A 3CJCA 3A0IX 3ATVA 3D2EB 4FL9A 4BR9A 2KHOA 3CQYA 4ISEA 4KBOA 5AQPA 3VEXA 1OKJA 3QBXA 4H5RA 5I9EB 1KAXA 2D0PA 2D0OA 1TYQB 1SQKA 3HI0A 4PKIA 2CGJA 3H3OB 3CQXA 4K25A 1HUXA 2P9IA 3KVGA 3L0QA 3VEWA 4BGAA 3ZX3A 4BQLA 3AY9A 1Y64A 1WOQA 4BRGA 3RSEA 2E2QA 3G25A 4IO8A 3FZHA 4MO5A 5KPZA 4WQ4A 2QXLA 4Z94A 3D2FB 1SAZA 3QDKA 3WXKA 3ENHA 3D2EA 2P9UB 1CZAN 5AQGA 1H1VA 2GUPA 3M3ZA 4XH1A 3W3DA 1HKGA 2HMPA 4LC9B 3H46O 4PL8A 1RFQA 4H03B 1QZ5A 1V4TA 3CIPA 3H3NO 1T6DA 3FGUA 5AQZA 2VCPA 3LM2A 3P4IA 2GTDA 3R6MA 2GWKA 3B8AX 4CD3A 3EL2A 3ZEUA 4CZMA 3BEXA 2BTFA 4Y0WA 5BN8A 5LY3A 1HKBA 2V7YA 5AQWA 5BN9A 3O4WA 1NGFA 3QFUA 3WXLA 4BRDA 4BR7A 1BA0A 3VF2A 2Q0RA 4MLHA 1C0FA 4HTLA 2IIRA 2FSNA 4CZLA 1TUUA 2BUPA 4MLEA 5AQVA 4MO4A 3ATUA 2D1KA 4BGBA 2IVOA 5AQFA 2AP1A 2W41A 5AQHA 1HKCA 5AQUA 3D2FA 3FLCO 3L6QA 3O08A 3JXUA 4JHDB 3CI5A 2QWLA 4WYBA 2E1YA 4BROA 1HX1A 3W0LA 2P9UA 2VWBA 4M7YA 2J4RA 5AQQA 5JICA 4I6MB 2V52B 3MDQA 3U9ZA 3MN9A 3UB5A 2WUSA 1ATRA 1K8KB 2I7NA 4BRPA 4FWPA 5AQKA 3DXMB 4WQ5C 3VPZA 4BRLA 4BRQA 4QS9A 5AFUH 4A62A 5JMVA 2FLOA 3H1QA 1GLCG 4CZFA 4CBXA 1MDUB 4XH5A 1Z05A 5F0XA 2YCHA 4JHDA 4BRCA 2NRHA 5BRDA 2YJEA 3AARA 4QS7A 4BRMA 2Q36A 4K42A 3SJHA 1XC3A 2D4WA 1QQNA 5FPMA 1BUPA 1QQOA 4EAHD 4XH4A 4CBUA 4I6MA 1X3MA 3QBWA 1E4FT 3ZX2A 1T44A 1NGEA 1NGAA 1YXQA 1NGCA 4ISFA 1K8KA 1JCFA 3U8XA 3SLCA 4K43A 3IDHA 3DXMA 1D4XA 3O8MA 5AQLA 2P9SB 5ELZA 1JCGA 3FZMA 1EQYA 2YI1A 4FWRA 4B1ZA 2HOEA 4EHUA 1BO5O 2Q2RA 2HF4A 4EIAA 5FPNA 3MN6A 2P9LB 5E84A 1GLFO 5BR9A 1X3NA 2FXUA 3O80A 5BPNA 3FE1A 3C7NB 3CETA 2EWSA 1KAZA 4B1VA 4CJ7A 1HJOA 2IVNA 2I7PA 3WXJA 4B1XB 2ZGYA 2QWQA 3VF6A 4FWMA 5EY4A 4BC2A 2GEMA 1ATSA 1NGBA 4BVOA 5BPLA 5ADXA 1LOTB 4A2BA 2CGLA 1S3XA 1TUYA 3A5MC 5EOYA 1U6ZA 5KQ8A 4NB4A 3WQUA 4B1UB 5F1XA 4RTFD 3O1WA 1YUWA 4QS8A 4BRNA 4EHTA 2ZGZA 5JLFA 4H0PA 2P9SA 2QWNA 3C0BA 1TYQA 3OHRA 4FWOA 2Q0UA 3ZETB 1KAYA 2V51B 4O8KA 4FOEA 2ASPA 3HSCA 2E2NA 1NWKA 2P9LA 4DQ8A 5AQSA 3CERA 3LDLA 3HTVA 3U4LA 3I8BA 5EXWA 1RGIA 1E4GT 2E20A 2Q1NA 4WQ5A 3C7NA 3F9MA 3ZX0A 1GLJO 1Q18A 4CBWA 5AFUA 3FFKB 5AQOA 4JAXA 3CJ9A 3SMPA 3VETA 4HWIA 5FPDA 2ZWHA 4O5FA 2VYPA 3VOVA 3DXKB 1NBWA 3BF3A 3ULEB 4FPAA 4IXCA 1KXPA 2HF3A 1S22A 4IWVA 4DB3A 1IG8A 5E26A 3O6WA 3UKUB 4DHYA 3MN7A 4JD2B 3UE5A 3H1VX 5FPEA 1SZ2A 1YAGA 1MA9B 1BA1A 3CJAA 1QHAA 4BG8A 3LM9A 3LDNA 1DGKN 1QQMA 4CI6A 2QWRA 2GELA 1ATNA 3UKRB 3FZFA 3A5NC 1J6ZA 5BRFA 2NZTA 3R8EA 1HPMA 2P9NB 3GDQA 4ISGA 2PAVA 4H0TB 5AZIB 3DAWA 3CJ7A 3M6GA 4A61A 5EVZA 4GY2B 4XEIA 2Q31A 1ZBSA 4F9OA 2P9KB 3QFPA 3EZWA 4BRHA 3DXKA 3VEYA 2E8AA 3ULEA 2YJFA 4CZJA 3DWLA 3QB0A 5AQRA 3EKUA 3H45C 4FO0A 4FWSA 2QWOA 1C0GA 3VEOA 3MCPA 1ZXOA 1NGJA 3FZKA 3WXIA 1GLEG 4BREA 3CHWA 3MMVA 2E2OA 3QMLA 3UKUA 1NGIA 4FWQA 3KHYA 1LCUA 1NMDA 3BUZB 4JD2A 4BQZA 3H6EA 4M7XA 5KPTA 1GLBG 5KQDA 3QICA 1QZ6A 3BP8A 4AM7A 4YDUA 1MWMA 4IZ9A 4BRAA 2YHWA 3UKRA 4BC3A 3KZBA 2A42A 1G99A 2P9NA 4M63C 2QM1A 3AAPA 5KPRA 4FWNA 5AZIA 2W40A 5AZJB 4PKHA 5AQJA 2YHYA 4NO7A 2P9KA 1NGHA 2QWMA 4H0VB 4AM6A 4DCHA 2FSKA 4B1YB 3ENOA 1ZC6A 4BC4A 5AR0A 4J8FA 1V4SA 3MK6A 3O1BA 4H0YB 3ID8A 3FZLA 3HM8A 3AAQA 5CE3A 3ZEUB 1NGDA 5BRHA 3IFRA 4YDUC 4FWLA 5AQXA 2AA4A 4BVPA 1HLUA 3VEZA 2F9TA 3A5LC 1X9JA 3JS6A 3DJCA 2UYTA 3GE1A 2IVPA 4RCHA 2Q97A 4H5WA 5LJWA 3D7EO 1T6CA 3LDOA 2FSJA 3GOIA 1NLVA 5AZJA 2E2PA 3TU5A 3IUCA 4RWTA 4EFHA 5LJVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DEJA 1HRHA 4ILJA 2P9PB 3A2FA 4NCGA 4KHSA 2A6AA 4DTJA 5I42A 3NDKA 3QERA 3WQTA 3DMJA 4BDPA 1BOTO 1TVRA 1BG3A 2HBKA 4CD1A 1J53A 2E5LK 5AQMA 4LF6K 1MWKA 3MN5A 3LDQA 3E66A 3ISNC 3L4IA 3EN9A 3VESA 4E7HA 4B9SA 1VHXA 1NGGA 4JI5K 4FJ7A 2D0CA 3NVKA 2A40A 3OY9A 5AQIA 4RG8A 4H0OA 3I8DA 4BR5A 3FR0A 4ZHRA 1NM1A 3HPGA 2OZSA 3CXCM 4DTOA 4BR4A 2HHUA 1JJ2M 4E1JA 1WUAA 2PBDA 1ZBUA 4CZIA 4IJNA 3VQ4A 3OJUA 5C24A 3AO5A 2RHKA 3UIQA 2A3ZA 1BDGA 3S41A 3VGLA 5EX5A 4BR2A 1IJJA 4DV1K 4GNIA 1WB9A 3AGKA 3HM9A 1S6QA 3WEEA 1SUQA 4PQUA 4CJ5A 4FJLA 3SMSA 3MX2A 2FF3B 4C8NA 3O9TA 4BRKA 3I33A 4YOWA 1RT5A 1RTHA 3HSTB 1YTUA 4OO1J 5BPMA 1ESVA 1U04A 4HUGA 4FLYA 4BRIA 5C25A 4CGIA 4C23A 4IO9L 2P51A 1QVGM 2YNFA 3NMUA 4OVLA 3S3OA 3HP9A 4BACA 3ATVA 3WXMB 1TGOA 4ISEA 4KBOA 4CJPA 4LF5K 4BE7B 3F2KA 3F9KA 3QBXA 1EXQA 4H5RA 4NCBA 4Z4GA 4ELVA 4YOYA 4A59A 3HI0A 4DFJA 4ILGB 3AVIA 3CCMN 3H3OB 3T69A 2ZJRL 3CQXA 3NGIA 4KI6A 4K25A 1RCHA 4CW7B 5JS2A 4BGAA 1Y64A 4DF8A 1VSFA 3G25A 1HYSA 4QCLA 3OYHA 5J1EA 2G8FA 2HBMA 1IO2A 5KPZA 2QXLA 3DLLL 4CF2A 4BWJA 2VGNA 1NJXA 3QDKA 3ENHA 3D2EA 5D3GA 4FJ9A 1CZAN 1JLBA 3ZSWA 2HMPA 4N47A 1IBLK 3P38A 1WSHA 1VSDA 1WSJA 3CIPA 4DQQA 1T6DA 5AQZA 5HRRA 4CGFA 4ELTA 2PY5A 3CCUN 5M1KA 5KGXA 1HKBA 5AQWA 1BQMA 3QFUA 1N36K 1EX4A 3MXJA 1BA0A 4M42A 4B3MK 1ZBFA 1SL0A 4HTLA 2BUPA 4MLEA 1RBVA 1S1WA 4Y1DA 4CGHA 2AP1A 4CIFA 2G8WA 3S3NA 3JXUA 3CI5A 3KK2A 4WYBA 4BROA 5C2FA 1BHLA 2P9UA 2VWBA 4NLCA 2IDOA 4H4MA 3MEGA 5JICA 2O8DA 2E4LA 4YOTA 3MDQA 2BANA 3TAGA 3C6UA 4DS4A 3NH0A 4Z4EA 3CQ8A 1XHZA 4FZZA 1UOCA 1VAZA 4WQ5C 4Z4HA 4PHTX 4JKCA 3P39A 2OA8A 4BRQA 5C10A 1UWBA 3SNNA 4BECA 5AFUH 4A62A 2HHIA 1Q9YA 4B3TK 1GLCG 4CZFA 4B9VA 5JENA 4JHDA 2NRHA 5BRDA 4N5SA 3O9SA 4HHTA 2YJEA 4BRMA 4K42A 2G8IA 3PIOL 1GOAA 3V81A 1E4FT 1VRTA 4I7FA 1OH5A 2F8TA 3CG7A 2NRWA 4AHTA 1YT3A 4CJEA 4K43A 3VTIA 4DR5K 3DXMA 3O8MA 3V9XA 2P9SB 4AQYK 2PZSA 4M3UA 2YI1A 3SUOA 4JI0K 4YY3K 2BE2A 4CK2A 2Q2RA 4FJHA 2HF4A 1KFSA 4CF1A 5JVGL 2FXUA 1LAWA 3O80A 4B3RK 3C7NB 5KGWA 1VSIA 2IS3A 2YNIA 2OCEA 4B1XB 2ZGYA 3G10A 4RW4A 3DLBA 3V9UA 1NGBA 4JKFA 1WNSA 4BVOA 1WN7A 1RT7A 3NGYA 3VQ7A 1LOTB 2CGLA 1TUYA 1U6ZA 3WQUA 3SQ4A 4RTFD 3V9ZA 2ITGA 3O1WA 1HQUA 1YUWA 4EHTA 1UA1A 1T8EA 1YJWN 5DM7L 1TYQA 4B9MA 4FWOA 4IEIA 2Q0UA 4CHPA 1KAYA 2V51B 4RW6A 4FOEA 3ZT0A 5HRSA 4JI8K 3ZCMA 1X9SA 2HHVA 2O8BB 1I94K 4M3WA 1RDAA 1HPZA 1E4GT 4AHVA 1D5AA 4WQ5A 1N34K 1DLOA 3AO3A 4DV6K 2B4JA 5AQOA 4JAXA 4FW1A 4B9UA 3TI0A 3BZKA 3CJ9A 4TSXA 2WONA 3SMPA 3VETA 4O5FA 1B9DA 3DOLA 3TAPA 3DXKB 1NBWA 3BF3A 3ULEB 4CERA 4BDZA 3E9OA 1HNZK 4MDAA 1IG8A 3CCVN 4DTPA 4JD2B 5HOOA 2XY7A 4F3OA 2VWKA 5FPEA 3CJAA 5C15A 1QHAA 4BG8A 2X78A 4DSJA 3LM9A 4CGGA 2GELA 2GX9A 3UKRB 4CEZA 1VQKN 1KSPA 4DQSA 1TK8A 4KO0A 1NK8A 2NZTA 2XHBA 3R8EA 1VK0A 4YORA 2VG7A 3OTOK 4A61A 5EVZA 4GY2B 1IH7A 4CGDA 4F9OA 2P9KB 3QFPA 2FC0A 4DR3K 3KD1E 3VEYA 2E8AA 3WNEA 1RT3A 3QB0A 3EKUA 4FWSA 3QNOA 3VEOA 3CMEN 1RT2A 3WXIA 1Q9XA 4BREA 5M1NA 4GKKK 2YNHA 2E2OA 3SPYA 1C0MA 1NGIA 4DU1A 1J9AA 1NMDA 1B9FA 4CJWA 4BQZA 3K57A 5KQDA 2C1GA 1YHQN 4KB0A 3KD5E 3MX5A 3JSMA 4FLZA 4JRPA 2A1SA 1NK7A 2FBVA 4BC3A 4FVUA 2A42A 4CHQA 3IS9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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