4XEIA

Orthorhombic isomorph of bovine arp2/3 complex
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
415
structure length
400
Chain Sequence
MAGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystals of the Arp2/3 complex in two new space groups with structural information about actin-related protein 2 and potential WASP binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 102
structure length 400
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4xeiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xeiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xeiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4xeiA04
4L3QA 3HSCA 3WXJA 3MN9A 4BC2A 1NM1A 1ZBSA 3SLCA 1YVNA 4WQ5A 5E84A 1NGCA 3I33A 1KAYA 1XC3A 2ASMA 1S3XA 2W40A 4LC9B 1SAZA 2P9PB 5AQUA 2P9KB 1R59O 1KAXA 3QB0A 3R8EA 1MWMA 1X9JA 1HKBA 1QQOA 2E20A 3LDNA 2A42A 4WYBA 3CERA 4ISEA 5BPLA 2YHYA 2V51B 3JXUA 3CJAA 4GY2B 5AZJB 3ULEB 2W41A 4ISFA 4FWQA 4CD1A 3WQUA 2A6AA 3D2EB 2Q0UA 1NGJA 1NLVA 4AM6A 3WT0A 1ZC6A 5JICA 3W0LA 2NRHA 5AFUH 5I9EB 5BR9A 3ID8A 2QW9A 5ADXA 3G25A 3O4WA 2P9IA 4QS8A 2BUPA 5AQGA 2GELA 3SMSA 4BC4A 1X3NA 2EWSA 3AY9A 5LJWA 2Q0RA 3WEEB 2CGJA 4E1JA 3R6MA 4H0YB 1Z05A 3R9PA 2CH5A 2IVPA 2YI1A 5CE3A 3GL1A 1GLJO 5AQTA 2Q2RA 4BRPA 4IJAA 5F0XA 2A41A 3BF1A 4NO7A 3EKUA 2E1ZA 2NLXA 5AQHA 3JS6A 2E1YA 5BRHA 4FPAA 4JD2B 3C0BA 5FPEA 5AQSA 3MK6A 5KPTA 4BGBA 4EIAA 2DPNA 2HF3A 4H5TA 2QWRA 5KQ8A 5AQRA 1GLLO 4EAHD 4MO5A 5E26A 1NBWA 2FSKA 1HUXA 1QZ5A 3CJ9A 3DXMB 2GWJA 2V52B 1KAZA 2ASPA 1NGFA 3DJCA 5ELZA 3FZMA 4H03B 4BRLA 3ZX3A 1Q18A 1ATNA 3AAPA 1HPMA 5AQLA 3VGLA 1K8KB 4BQZA 3HI0A 3LM9A 3VPZA 1EQYA 2PBDA 2GWKA 3GG4A 5AQOA 4I6MB 4ISGA 2QWPA 1QQMA 4K41A 3TPQA 3VESA 2A3ZA 2P9LA 3D7EO 1NGGA 2D4WA 1GLAG 1HLUA 3M1FA 4IZ9A 1S22A 4CBUA 3SK3A 1YXQA 5AQKA 3MN6A 3ZETA 4BVPA 3H45C 4KBOA 3J8AA 3VEVA 3GE1A 5EXWA 5AQQA 3MCPA 3ATVA 4CBWA 3BUZB 2VCPA 2D1KA 4JNEA 3WUHA 3LDLA 3DAWA 5FPMA 3A5MC 4A61A 2A40A 2QWLA 4B1UB 2HOEA 2P9SA 3LDQA 4BRIA 1NWKA 2YHXA 3VGMA 3AARA 3CJBA 3LM2A 4M7XA 2P9IB 3BEXA 1RDWX 4GNIA 3GOIA 2YCHA 1BUPA 4B1XB 3IDHA 2GUPA 4FSVA 2Q36A 3ATUA 3I8BA 1MWKA 1NGBA 1K8KA 4JAXA 4IWVA 4I6MA 1LCUA 5AQXA 5F2RA 1HJOA 2WUSA 2I7PA 1WOQA 3O1BA 3O80A 4FWOA 4IJNA 1BA1A 3A0IX 4PL7A 1C0GA 1BG3A 3F9MA 2PAVA 3OHRA 4FWRA 3MN5A 4O8KA 1XQSC 1T6DA 3P4IA 5JLHA 4M63C 1U2VA 4CBXA 1E4GT 3FGUA 2F9TA 1X3MA 3WXIA 4BRQA 4H0PA 3FFKB 4BRNA 4HWIA 3WXKA 4CZHA 4XH4A 2E2NA 3RSEA 3WQTA 4CZMA 5AFUA 3ZX0A 2P9UA 3U8XA 5AQMA 4WQ4C 3A8YA 3L4IA 3O6WA 4H0XB 4BR7A 1XUPO 3HTVA 2P9LB 3CHWA 2HMPA 3LDPA 3CJ7A 4PKHA 2ZGYA 5AQYA 4CI6A 3FZHA 1TYQA 5ADXH 5F1XA 1D4XA 3ZETB 4XH1A 4BRAA 3FZLA 4EFHA 3LDOA 4BRHA 2FF3B 2FSJA 2P9NA 2GTDA 4CZJA 3HZ6A 3MMVA 3VETA 4AM7A 3DXKB 2P9SB 1GLFO 1BA0A 3H3OB 3M3ZA 5AQJA 4C23A 1BWFO 3O1WA 2F9WA 4FWPA 1U6ZA 1JCFA 3ZEUA 5BN8A 3B8AX 1JCEA 3CJ1A 4FWLA 4Y0WA 3EO3A 2NZTA 3O08A 1SQKA 4IO8A 4BREA 1BDGA 3L6QA 2IVNA 4H5RA 5KPZA 3QBWA 2VYPA 5AR0A 1HKGA 4FOEA 3QFPA 4RTFD 5AQPA 5JMVA 3FZFA 2CH6A 3SJHA 3KZBA 2H3GX 2V7YA 1NGEA 3CQXA 1TUYA 4DB3A 3FZKA 3GBTA 2YHWA 3H6EA 3GDQA 1JCGA 1E4FT 2FLOA 2GEMA 2QM1A 5BN9A 1TUUA 3A5LC 4CD3A 2Q31A 3UKUB 2IIRA 4BRDA 3VGKA 3TU5A 1U2VB 4XH5A 3QICA 2QXLA 4IXCA 2VWBA 3VERA 5BRDA 3CETA 3L0QA 4FWNA 5LJVA 4MLHA 3DXKA 3U9ZA 5AQZA 3H1VX 4H0VB 1CZAN 4BR4A 3RSEB 4K42A 2P9UB 2KHOA 1HX1A 1BO5O 3EN9A 1IJJA 4PKIA 5AQWA 3CI5A 2AA4A 3EZWA 1HKCA 3D2FA 3VEXA 4CZEA 2FSNA 2Q97A 4A62A 1MDUB 1IG8A 4BR2A 1H1VA 3U9DA 1NGDA 1NGAA 4QS7A 3VEOA 3QFUA 4K25A 4WQ4A 1TYQB 5AZIA 3UKRA 1KXPA 3W3DA 5JLFA 2ZGZA 3LL3A 4O5FA 4BC3A 4BRCA 2HF4A 3WXLA 3EKSA 1V4TA 3U4LA 1BU6O 1NGHA 5BPNA 1NGIA 1J6ZA 2P9NB 3MN7A 4JHDA 3VF2A 4EHTA 1QHAA 4DQ8A 4BG9A 3KVGA 1GLCG 3UKUA 3FR0A 3ENHA 5KQDA 4CZIA 4QS9A 1LOTB 3QMLA 4YDUC 4H5WA 3ZEUB 1G99A 3A5OC 3M6GA 3BF3A 2YJFA 1NMDA 4BGAA 5LY3A 4RCHA 5EOYA 3HM8A 1GLDG 5BRFA 4H0TB 2CGLA 2CGKA 1MA9B 1YUWA 2QWMA 4J8FA 2Q1NA 2YJEA 3VF6A 4A2AA 4BR9A 5AQFA 2J4RA 3ZX2A 4BRMA 2E88A 4FWKA 4MLEA 2E8AA 5KPRA 2I7NA 2QWOA 2FF6A 3UB5A 4BQLA 1DKGD 3VOVA 4H5VA 4M7YA 1ESVA 4CZFA 2V7ZA 3IFRA 1DEJA 3IUCA 4WQ5C 5B8HA 1V4SA 3CJCA 3MDQA 3KHYA 5BREA 3HBTA 3H1QA 3H3NO 4DHYA 2A5XA 2ASOA 5TKYA 4BR0A 4B9QA 4BROA 3C7NB 3O5BA 5EX5A 5AQVA 4CJ7A 2ITMA 5AQIA 2P9PA 3D2FB 2P9KA 3BP8A 4RWTA 1GLEG 1RFQA 2OANA 3CQYA 5EVZA 2ZWHA 4BC5A 4B1YB 3VF4A 3O8MA 5AZIB 3VEZA 3UKRB 4FPBA 3DWLA 3VEWA 3IMXA 5FPDA 1WUAA 5AZJA 3ULEA 1P8ZA 1DGKN 1T6CA 2E2PA 3D2EA 4FOIA 4B1VA 4BG8A 4A2BA 1T44A 2D0PA 4JHDB 2ZF5O 1YAGA 2E2QA 4BRFA 3A5NC 4Z94A 3FE1A 1ATSA 1ZXOA 4XEIA 3EL2A 3VENA 4HTLA 4PL8A 1GLBG 1QZ6A 2BTFA 4CZLA 4B1WB 2IVOA 4FWSA 4BRKA 3QBXA 4NB4A 3UE5A 3H46O 3VEYA 3WEEA 4EHUA 4H5NA 4CZGA 5BPMA 4FWMA 1Z6RA 3C7NA 2D0OA 2AP1A 3SMPA 4YDUA 2QWQA 4FO0A 1OKJA 1SZ2A 4H0OA 3AAQA 4PKGA 3QDKA 4K43A 2QWNA 4BR5A 4BRGA 2E2OA 3CIPA 4JD2A 3FLCO 4BVOA 1Y64A 4DCHA 1QQNA 2UYTA 4CZKA 5FPNA 1C0FA 1ATRA 1BOTO 4MO4A 3ENOA 5EY4A 3S41A 3DXMA 1RGIA 4B1ZA 4F9OA 4FL9A 4JN4A 5AQNA 2FXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KJVA 1DTTA 1VSHA 1YTAA 3MN9A 1C1AA 3K9JA 3SLCA 4JKDA 4DG1A 1QQCA 2ASMA 4JKHA 1WBDA 2PY5A 4FLWA 4DKWA 4Z4EA 1R59O 1Q9XA 4FVUA 1HKBA 1QQOA 3CCVN 2A42A 4BDYA 5BPLA 1SKSA 3JXUA 3CJAA 3AGRA 1WB9A 1ILYA 4DMNA 1ZBLA 3CCEN 2YKMA 5HRNA 3F73A 2OYQA 1ZBIA 3ZT3A 1ZC6A 4KHWA 4IFVA 3TANA 4V19S 1HNVA 4CJSA 2BDPA 3PX0A 3O4WA 2P9IA 4JRQA 3MX2A 1LV5A 4YOWA 2BUPA 2GELA 2HHWA 1X3NA 4DTRA 1EO1A 2Z1JA 5TKWA 4FJNA 1T05A 4BDZA 4HHTA 3R6MA 2CH5A 5CE3A 3GL1A 3K5NA 5AQTA 4JLHA 2HHSA 1NJYA 4BWMA 5KRTA 5JVGL 1LWFA 3DLHA 5BRHA 4FPAA 5FPEA 3C0BA 4AQYK 5C24A 3MK6A 3V4IA 4YOUA 2PZSA 4BGBA 3RWUA 1N36K 1KTQA 4M3ZA 4MQ3A 2HF3A 3HPHA 4IO9L 1IKXA 2QWRA 2KKZA 2IAJA 4ILGB 3OY9A 5E26A 1QZ5A 5J2MA 1KAZA 3OYGA 2ASPA 3NH1A 2W6KA 3DJCA 1ASVA 3ZX3A 3QNNA 4GW6A 5AQLA 1I94K 4IFYA 3VGLA 4BQZA 3V1QA 4CIEA 3NVMA 4KHSA 4Z4CA 5CZ1A 1WSIA 1N8RO 3GG4A 4FLZA 4I6MB 4DTNA 5HRRA 4DFPA 3VQ5A 3CCSN 4FYDA 3M1FA 3SYZA 2F8TA 1QE1A 3VTIA 2C1GA 4BVPA 2OTLN 3J8AA 5EXWA 3MCPA 3ATVA 4CBWA 4OJRA 2D1KA 1U04A 5FPMA 3VQ9A 3ISNC 5HOOA 1RT7A 3P1GA 4NYNA 4BRIA 4JKBA 3VGMA 3AARA 3LM2A 1KFSA 2P9IB 4GNIA 3OJSA 3IDHA 4KKOA 4FSVA 4WFAL 2Q36A 4E3SA 4X65K 1TK0A 1MWKA 1K8KA 4JAXA 4CECA 3L3VA 1VSLA 5AQXA 3ZSWA 3QEPA 1SKWA 4DR4K 5J1EA 3ITHA 2KFNA 1VQNN 2D0CA 1HPZA 4E7IA 3E01A 4IJNA 1YTUA 3MWPA 4WCEL 4OLAA 1VQ4N 4IOXA 3TAGA 1JJ2M 3MN5A 1S6QA 4O8KA 2B5JA 1XQSC 1T6DA 3T1YK 3O3HA 4DTPA 3ENBA 3QIPA 1X3MA 1BCOA 1N34K 4BRQA 2HBLA 4BRNA 4HWIA 4OPHA 4NLBA 2E2NA 3RSEA 3KK3A 3NFAA 1L5UA 3ZX0A 2P9UA 3U8XA 3SUPA 4H0XB 4FM1A 4Y1DA 2HNZA 4BR7A 5T7BA 4B9MA 1T3VA 3LPUA 1ASUA 2IDOA 5CYQA 3K2PA 5AQYA 1YJNN 1B9FA 1TYQA 1OVYA 4CK3A 4KFBA 1D4XA 2NNWA 1FKOA 4XH1A 3FZLA 3LDOA 3QESA 4R79A 3CF5L 2FSJA 1B9DA 2GTDA 2UXBK 1Q86O 5CZ2A 4Z4HA 4U67L 3BGRA 3H3OB 1BA0A 2JLEA 3T1HK 1CZBA 2O4IA 1WSFA 4CJKA 1WAJA 1VSFA 1EKEA 4FWLA 1NK9A 4BECA 3L6QA 1KFDA 4CGDA 5KPZA 3QBWA 5AR0A 4CESA 1HKGA 4CF8A 1RTIA 1QVFM 4JRPA 3LP0A 1D8YA 3QNOA 3FZFA 2CH6A 3SJHA 5JS2A 3OYFA 2H3GX 1L3SA 2QI2A 3HO1A 4CERA 4AHUA 1QHTA 4FW2A 3O3FA 4X64K 3FZKA 3CCLN 2QTDA 4M3WA 4DV6K 2GEMA 3U3GA 4CD3A 3ZLJA 3VGKA 4CJFA 2AJQA 2XY5A 2HW3A 2HHIA 2RPIA 2Q3SA 4GVEA 3Q7BA 4CEEA 4B08A 3CETA 4AHVA 3JAMO 3H1VX 1HRHA 3RSEB 4K42A 2RE2A 1CXQA 2XHBA 2P9UB 2KHOA 4ELUA 1IJJA 4O0JA 2VQEK 3CPWM 5GADP 3QO9A 3CYGA 1IBKK 3KTQA 4K8ZA 4CZEA 2A1RA 2Q97A 2DFFA 2UXCK 3SPYA 2WONA 4LH4A 4KPYA 4WQ4A 3DRPA 1TYQB 3AVGA 4JKEA 3I0RA 1A5XA 2G8HA 3MEDA 2HF4A 3WXLA 4JKFA 3S3OA 1BU6O 5LMUK 1A5WA 1J6ZA 1NGIA 1TVRA 2HBKA 3HL8A 4JHDA 2PYJA 1N33K 3AGKA 4NXMK 3OA9A 4KREA 3OS2A 4JI1K 3K0SA 4QS9A 1LOTB 3D45A 3AO2A 4JK9A 3CC7N 4DTUA 4ILJA 1K73O 3BF3A 4JV5K 5LY3A 4KRFA 3LP3A 5A2QO 3CFRA 3VN5A 3ZSYA 3L4QA 3PO5A 2CGKA 2Q1NA 1KQSM 3KK1A 1TV6A 3HXMA 3CD6N 4CEDA 4B9UA 2KTQA 2QEXN 3J7YP 4FWKA 4F8RA 2DFEA 1LW2A 2I7NA 1RCHA 1D9DA 1O13A 3UB5A 3NDKA 3VQ4A 1DKGD 1X9MA 4FLTA 4K8XA 3DLRA 1HJRA 4H5VA 4CZFA 4J2EA 3IUCA 5B8HA 5HBMA 3HYFA 2E6LA 3H1QA 3H3NO 4AHTA 4FJJA 4BACA 1BQMA 1SKRA 3CPEA 2ITMA 2DTUA 1J9AA 1B92A 3WXMB 4ELVA 2P9PA 3SUNA 3PIOL 1RFQA 1KLNA 3AVJA 3VEZA 4JI8K 3SI6A 5FPDA 4DU1A 5AZJA 4R5PA 1P8ZA 4FJKA 4RG8A 1EP4A 2E2PA 3V6DA 4JHDB 4AILC 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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