4CBUA

Crystal structure of plasmodium falciparum actin i
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
365
structure length
357
Chain Sequence
EDVQALVVDNGSGNVKAGVAGDDAPRSVFPSIVGRPKNPKDAFVGDEAQTKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRAAPEEHPVLLTEAPLNPKGNRERMTQIMFESFNVPAMYVAIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTEYLMKILHERGYGFSTSAEKEIVRDIKEKLCYIALNFDEEMKTSEQSSDIEKSYELPDGNIITVGNERFRCPEALFQPSFLGKEAAGIHTTTFNSIKKCDVDIRKDLYGNIVLSGGTTMYEGIGERLTRDITTLAPSTMKIKVVAPPERKYSVWIGGSILSSLSTFQQMWITKEEYDESGP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Differences Explain Diverse Functions of Plasmodium Actins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Motor protein
source organism Plasmodium falciparum
molecule keywords ACTIN-1
total genus 119
structure length 357
sequence length 365
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cbuA03
5AQRA 4FWSA 3VESA 2YHXA 4WQ5A 5BREA 3B8AX 3WXLA 1XC3A 2F9TA 4BRKA 2BTFA 4BQLA 1NGCA 2E88A 2A41A 3DAWA 4FO0A 3H3OB 4H0TB 3UKUB 2D4WA 2E2PA 1MDUB 2HMPA 2QWRA 4FWLA 4CBXA 1SZ2A 4DQ8A 5BPNA 3SJHA 5KPTA 4FOEA 2VWBA 2V7YA 2EWSA 3DWLA 3HBTA 1DKGD 1KAZA 5BPLA 4LC9B 2A6AA 1X3NA 4H0VB 1T6DA 3ATVA 3RSEA 4BGBA 4BRNA 4WQ4C 4BR0A 3VF4A 1GLCG 1Q18A 1JCFA 3FZFA 4XEIA 2QWOA 3WEEA 1BG3A 1ATRA 2CH6A 2I7PA 2HF3A 4K25A 1YUWA 3AY9A 3VEZA 4CZEA 1NWKA 3CETA 2ASOA 2ZF5O 2YI1A 3I8BA 3P4IA 4BRMA 4XH1A 3WT0A 4NO7A 1GLFO 3VEWA 5FPDA 4A61A 3H45C 4IO8A 4MLHA 3WXIA 5AQWA 3I33A 4JHDA 2A42A 4BC2A 4BVPA 2YJEA 3EKUA 3GG4A 3VEYA 3LM9A 4FWKA 3FE1A 1NBWA 3BF1A 4BQZA 1Z05A 3VPZA 3WEEB 2NRHA 3L4IA 3M6GA 2ZGZA 1NGIA 3QBWA 2Q1NA 2Q0UA 1P8ZA 4FWQA 3AAQA 1BUPA 3AAPA 1ZBSA 3M3ZA 3D2EA 3LDQA 1HLUA 4CZMA 3LDNA 3WQUA 3SK3A 2J4RA 2P9SB 1MWKA 5EX5A 4H03B 2GWJA 4CZIA 1QQOA 3CJBA 3H1QA 4BC4A 1NGGA 3GL1A 4JN4A 1R59O 2Q2RA 4QS7A 2V7ZA 3HM8A 3QDKA 3A8YA 3SMSA 3CI5A 3L0QA 3D2EB 3HZ6A 4B1UB 1D4XA 3O1BA 2Q97A 1BU6O 5AQHA 5ELZA 5AQPA 3IUCA 4L3QA 1X3MA 4C23A 2KHOA 4BRGA 2P9UB 4XH5A 5AQNA 2F9WA 4BR5A 3W3DA 2A5XA 4FWOA 3ENHA 3ENOA 3D2FA 4MO5A 4O5FA 1NMDA 4FWMA 5F1XA 4HWIA 3VGKA 4WQ5C 4BREA 4QS9A 4M7YA 1E4GT 4ISFA 4H0PA 3VENA 1RGIA 1GLBG 3VGMA 3HSCA 4RWTA 1OKJA 5AQVA 2CH5A 5BR9A 4BR2A 1KAXA 4BVOA 4JNEA 3GOIA 1ZC6A 3EL2A 5FPMA 3UKUA 4BRHA 4EIAA 2P9IA 2Q31A 3A5MC 4ISGA 1ZXOA 5KQ8A 3FZMA 4CZJA 1QZ6A 1KAYA 1Y64A 1XQSC 4BC3A 4PKHA 2AA4A 3D2FB 1LCUA 2GEMA 3VF6A 3GDQA 1E4FT 2YHYA 4H5RA 4RTFD 2NLXA 3VERA 2ZGYA 4FPAA 5AQYA 4BG9A 1MWMA 2P9PA 2NZTA 5E26A 4DHYA 2IVPA 2Q36A 4B1VA 4DCHA 5BRHA 2P9IB 3QBXA 1GLLO 2Q0RA 3DXMA 1NGJA 1NGEA 2E2QA 2V51B 1HJOA 3M1FA 3QFPA 4O8KA 5JMVA 3SLCA 3GE1A 1J6ZA 4PL8A 3CQXA 3DJCA 3ZX2A 3TU5A 4CI6A 1BDGA 2ASMA 3QICA 4H0XB 3MN5A 1BA1A 1CZAN 2P9PB 3J8AA 3BF3A 2FSNA 3CQYA 3LDOA 3H1VX 3IMXA 1WOQA 2W41A 4GNIA 1HKGA 3DXMB 4K42A 3W0LA 3L6QA 3BUZB 4AM6A 2P9SA 4J8FA 4IZ9A 2HOEA 2D0PA 3MN7A 5CE3A 4KBOA 3KHYA 3U9DA 2E1YA 4CZKA 4H0YB 1IG8A 3U9ZA 1K8KA 5EOYA 4BGAA 3G25A 4PKIA 4BRPA 5AFUH 3OHRA 4M63C 1IJJA 1RFQA 3KVGA 3MK6A 1V4SA 1DGKN 5TKYA 4FPBA 1GLEG 1T6CA 2GUPA 3ZEUA 4CZHA 3UB5A 1QQNA 3UKRA 2P9LB 3MCPA 4A2BA 3VEVA 2P9UA 5KPZA 2FXUA 1K8KB 4FOIA 4FSVA 3O8MA 1TUUA 5AQMA 2QXLA 3ZETA 2E2NA 3O6WA 5BRDA 4BR7A 2P9KA 3F9MA 1GLDG 4DB3A 2FF6A 4AM7A 2E2OA 3VETA 5AZIA 1QZ5A 2GELA 1NM1A 2E20A 3ZEUB 3ATUA 3UKRB 5BN9A 5AFUA 4PL7A 5AR0A 4BRDA 4CD1A 1BOTO 4FWNA 3O5BA 1NGBA 3HTVA 1EQYA 2P9NB 3CIPA 4BR9A 2QWLA 4RCHA 3ZETB 4H5TA 2IVOA 4B1XB 3CJ1A 2VYPA 2D0OA 2P9KB 2E1ZA 2CGJA 4EAHD 5AZJB 3TPQA 2CGLA 5AZIB 3A5OC 1U6ZA 1NGFA 2FSJA 2FLOA 1S22A 2QWPA 4A2AA 3ULEA 1ATSA 2YCHA 3C7NA 4BR4A 3IDHA 2WUSA 1HX1A 5F2RA 3WXKA 1TYQA 3CJCA 3DXKB 5JLFA 4M7XA 1C0FA 3ID8A 4I6MB 5FPEA 3MDQA 3O4WA 4YDUA 1NLVA 3O80A 1GLAG 2PAVA 2FF3B 1QHAA 4E1JA 4IJAA 3R9PA 3ZX3A 1BO5O 3ULEB 1YXQA 3A5LC 2OANA 4CD3A 1HUXA 3C7NB 3GBTA 1C0GA 4XH4A 3LDPA 5BPMA 1TUYA 1TYQB 3C0BA 2IVNA 5AQIA 5KQDA 4JAXA 4EHTA 2QWQA 3R8EA 2DPNA 4BRLA 5AQLA 3EO3A 1YVNA 3KZBA 5FPNA 3U4LA 1RDWX 4IJNA 4H5NA 1SQKA 1V4TA 1DEJA 4IXCA 2QW9A 1HPMA 3FLCO 3A5NC 4JD2B 2E8AA 2VCPA 5F0XA 1NGAA 5EVZA 1S3XA 3O1WA 4QS8A 3LM2A 3MN9A 3FZKA 4NB4A 5AQOA 5EXWA 3JS6A 4MO4A 2A40A 3FR0A 1JCGA 4BC5A 2GWKA 3VEXA 1T44A 5JICA 1NGDA 2P9LA 2ITMA 3BP8A 4BRFA 5LJWA 3H3NO 5AQFA 1LOTB 4BG8A 3CERA 1H1VA 4CBUA 5JLHA 2PBDA 4IWVA 3UE5A 1NGHA 1WUAA 3CJ9A 4B1WB 5AQZA 2UYTA 1Z6RA 2YJFA 1JCEA 4B1YB 3JXUA 3VF2A 5AQXA 4BROA 3LL3A 5BN8A 4CZGA 1SAZA 4BRCA 4BRAA 3RSEB 4A62A 5AQKA 4WQ4A 1ATNA 4FWPA 5LY3A 4H5WA 3FFKB 3BEXA 5AQJA 3HI0A 3IFRA 5ADXH 4Y0WA 4BRQA 5AQTA 3QB0A 2P9NA 3FZHA 1QQMA 2CGKA 4K43A 5B8HA 3R6MA 4PKGA 1G99A 3SMPA 1HKBA 1YAGA 4WYBA 4CBWA 5AZJA 4JHDB 1HKCA 3WXJA 2D1KA 1XUPO 2I7NA 4CZLA 4H0OA 3H6EA 2AP1A 2FSKA 3VOVA 5AQUA 2BUPA 3S41A 1U2VA 4B1ZA 3H46O 3ZX0A 5I9EB 3WUHA 4BRIA 3DXKA 4K41A 2V52B 4MLEA 3FGUA 3U8XA 1MA9B 4I6MA 1X9JA 4FWRA 3QFUA 5ADXA 3FZLA 3VEOA 4YDUC 4FL9A 2A3ZA 2IIRA 4CZFA 4GY2B 5E84A 3AARA 1KXPA 3O08A 2W40A 4F9OA 2ZWHA 3WQTA 3A0IX 5EY4A 1U2VB 3CJ7A 4EHUA 5LJVA 3VGLA 4Z94A 3QMLA 4B9QA 2ASPA 1ESVA 1GLJO 3EZWA 3MN6A 4H5VA 3MMVA 4CJ7A 4HTLA 3EKSA 2HF4A 5AQQA 2H3GX 2QWMA 5BRFA 4EFHA 5KPRA 2QM1A 4ISEA 1BWFO 3LDLA 5AQSA 5AQGA 3EN9A 2QWNA 3CHWA 4JD2A 3CJAA 1BA0A 2YHWA 3D7EO 2GTDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HP1A 5AQRA 3J80O 4IKFA 3VESA 2RHKA 4WQ5A 5BREA 3QNNA 4DWIA 2E5LK 4KH5A 1SKRA 2F9TA 1VQ9N 4Z4IA 1TK0A 1XNQK 1A5VA 1S9EA 3H3OB 3UKUB 1RBUA 1SZ2A 2QI2A 4FOEA 2VWBA 4AQYK 2RF2A 4J2DA 5BPLA 1W97L 2OTJN 3LZJA 4BRNA 4LH5A 4CEBA 3CMAN 3WNFA 3VF4A 1GLCG 1JCFA 3KKRA 1YTUA 3AY9A 1NWKA 1WAJA 3O9TA 5KTQA 3P4IA 3AA2A 4KTWA 3NH0A 3CCRN 1GLFO 4RG8A 5JVHL 4G1QA 3PO4A 2WFBA 3VTIA 5AQWA 5J2MA 2ZE2A 1B9DA 3EKUA 5CYQA 1HMVA 1YHQN 4FWKA 3FE1A 3HP9A 4CEZA 3BF1A 3OVNA 4KO0A 3KWGA 3VPZA 3SPYA 4CEFA 2KFNA 2ZGZA 1NGIA 5SZTA 3DRRA 3DRSA 4B9SA 4FWQA 4UY8O 3CCLN 1WSGA 3CF5L 3M3ZA 3LDQA 3ZSZA 1VHXA 4CZMA 3IRXA 4CJKA 2J4RA 3K0SA 4E7JA 4DSJA 5EX5A 4E72A 2XRIA 3A2FA 3H1QA 1NGGA 1LAWA 4FZZA 4LSNA 1CZ9A 3MWPA 1GOBA 1REVA 2F8TA 3KTQA 1WNSA 4CECA 1C6VA 4DSLA 5ELZA 4NYFA 4IOAL 5AQPA 3IUCA 4BWMA 4CEAA 1RTDA 1LW0A 3HOSA 2P9UB 5AQNA 4EZ6A 1TL1A 4O5FA 5F1XA 5C12A 4HWIA 4DV2K 4WQ5C 4BREA 3K5MA 1HNWK 3SBTA 2PY5A 1A5XA 4M7YA 4H0PA 3VENA 1WSJA 1GLBG 2X6NA 3F9KA 1WSHA 1YT3A 4CIFA 4BVOA 1ZC6A 1U48A 3ZT2A 3I0SA 4BRHA 3QIPA 2Q31A 3A5MC 1ZXOA 3K9JA 1X1PA 2UU9K 1IH7A 4PA1A 4J2EA 3CG7A 4H4MA 1HNXK 3OYLA 4RW7A 1HNVA 2NRRA 2B4JA 3BDPA 1CZBA 3DRPA 3ZYYX 3DOLA 1YJWN 3RMAA 4RTFD 3VERA 3I0RA 2ZGYA 4I2QA 5AQYA 2IVPA 4C1NI 3KKSA 1RT5A 5BRHA 1Q81O 4KREA 3QBXA 3KK3A 1BCMA 3SUQA 3WNEA 4DF8A 4AHSA 2V51B 3DM2A 1NJZA 3G4SN 3OYBA 1EKEA 4OKKA 4FJXA 4CHPA 2G8WA 4HTUA 4OVLA 3TU5A 1BDGA 3NGYA 2ASMA 3MN5A 3U3YA 2O8EA 2NNWA 4FLUA 3J8AA 1RDBA 3MEEA 3EE8A 2W41A 1Q8IA 4GNIA 4DFMA 3W0LA 5C15A 3BUZB 4DSKA 4HHTA 4AM6A 2P9SA 2JWKA 4IZ9A 1BIUA 5CHIA 1GOAA 4CZKA 2FBVA 2HHSA 1IG8A 3U9ZA 2O8EB 4DG1A 2HB5A 4BGAA 3O9QA 4JI1K 1TKZA 2NRZA 3MK6A 2KTQA 2KFZA 3ZSVA 2O8BA 4M45A 5M1NA 1GLEG 2NRVA 2QKKA 1Z25A 4BDPA 3UB5A 1S1XA 1QQNA 3MCPA 1CLQA 5KPZA 4UQGA 1OH7A 4FOIA 5HROA 4ILGB 3HVRA 4JEPA 3C65A 5J2QA 2D0AA 5HL7L 3CCSN 4BR7A 3NF8A 4B9UA 3F9MA 3HRGA 1GLDG 1RDCA 2FF6A 3VQQA 4FZYA 2E2OA 1UA1A 1N34K 1VAZA 4JS4A 3NCIA 4M3WA 3HSTB 4LF5K 1HPZA 3CFOA 3M8QA 5AR0A 4CD1A 3V9UA 3SUPA 1W7AA 1VSHA 2P9NB 3CIPA 5FLXO 3MEGA 4H5TA 4B1XB 4BE2A 3VA3A 4OX9K 2D0OA 3J7ZO 4GMJB 4IFYA 3SJJA 4Z4FA 2CGJA 4EAHD 4DF4A 1TAQA 5M1FA 1N6QA 3SV3A 2FSJA 2FLOA 1TK5A 2QWPA 1ATSA 3MXIA 4HCCA 4CJ5A 3Q7CA 1IKVA 3CJCA 5GAGP 2O8DB 3THWA 5JLFA 1VQ5N 1CXUA 3KLEA 1NK6A 2XY8A 3O4WA 4JS5A 1BIZA 1WSEA 4B8CA 1QHAA 4DQPA 1VQNN 4MQ3A 2HHQA 4CD3A 1IO2A 1C0GA 1HNZK 5BPMA 3K58A 1U4BA 5AQIA 4DR2K 1NKBA 3THWB 3P1GA 2QWQA 4CJEA 3TWHA 3O3FA 1VSIA 2WTUA 4CIGA 4FVMA 4IJNA 2ZM6K 4AHRA 4E1MA 1SQKA 4IXCA 4AHVA 1KD1O 4E7HA 4IEEA 1KCFA 2VCPA 3CC2N 3O1WA 4B3OA 3MX5A 4NXNK 1T3VA 3FR0A 1JCGA 3ZT4A 4BC5A 4N5SA 4CHOA 5JICA 1NGDA 1NJYA 1ILYA 4KTQA 3BP8A 4BRFA 5LJWA 3AVNA 3THYA 2RN2A 3HO1A 3UE5A 1NK8A 2YJFA 4CK1A 4DS5A 4OGCA 5GADP 4DR1K 1FKPA 1RT2A 5BN8A 1SAZA 4O44A 2Y1IA 4CHQA 4HUFA 3G6EN 1ATNA 3LPUA 3NE6A 4DTJA 3HI0A 3IFRA 4CESA 1OH8A 4CFAA 2NRWA 2Y1JA 3QB0A 5GINA 1RT3A 2CGKA 4KAZA 4K43A 4FM0A 1W0HA 5B8HA 3R6MA 4JLHA 3T7ZA 2R7YA 4DR6K 3AVHA 4B9VA 1XUPO 5TKWA 3H6EA 1J9AA 3TTCA 4CJVA 2D5RA 5AQUA 4FJ8A 1UOCA 2DY4A 4JKCA 3ZX0A 3AVIA 3OYKA 2HBJA 1EETA 1C1BA 3HPGA 1BQMA 2UUCK 3NVMA 1MA9B 5GAEP 1X9JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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