4CBXA

Crystal structure of plasmodium berghei actin ii
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
369
structure length
358
Chain Sequence
SIALVVDNGSGMVKSGLAGDDAPKCVFPSIIGIPKECYVGDEAQNKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWRHTFFNELRVSPEEHPVLLTEAPLNPKTNREKMTQIMFESFDVPAMYVSIQAILSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHTVPIYEGYVLPHAINRTDMAGRDLTYYMMKLFTERGYTFTTTAEREIVRDIKEKLCYIALDYDEELKKSEERTEEVEEMYELPDGNLITVGSERFRCPEALFNPSLIGRECPGLHITAYQSIMKCDIDIRKELYNNIVLSGGTTMYNYIGERLTNEMTSLAPPSMKIKVIAPPERKYSVWIGGSILSSLSTFQKMWITKEEYDESGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Differences Explain Diverse Functions of Plasmodium Actins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Motor protein
source organism Plasmodium berghei
molecule keywords ACTIN-2
total genus 115
structure length 358
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cbxA03
3DXKA 5AQIA 1TYQB 3WT0A 3H46O 4DQ8A 3VEYA 2QWLA 1HJOA 3D2FA 1WOQA 3A5LC 1C0GA 1MWKA 3D7EO 3JXUA 1NGFA 1Y64A 1HKGA 1BA0A 3UKUB 1Z05A 3ULEA 4CBUA 1BU6O 4IO8A 2VWBA 5EY4A 2QWOA 4CBWA 5AFUH 1G99A 3O1WA 4NO7A 5F2RA 2QM1A 5AQSA 4B9QA 1NLVA 2VCPA 4ISFA 3CJAA 5AQNA 3AY9A 4H03B 5F0XA 4FWMA 2A3ZA 1D4XA 4CZGA 5AQRA 4JHDB 3QDKA 4XH5A 4A2BA 3WQTA 4BRMA 4FWLA 4IZ9A 4H5NA 2F9WA 1GLDG 5KPTA 5I9EB 3FR0A 2QXLA 2YJEA 4B1YB 4BGAA 5AQUA 2YJFA 3HM8A 2P9NA 4BR9A 4BRKA 1SQKA 1LOTB 4I6MA 1NGGA 2DPNA 2H3GX 2QWMA 3AARA 3TPQA 4BG8A 3MN5A 5FPMA 4CD3A 4K41A 1ATNA 3CQXA 4IXCA 3U8XA 4BRCA 1KAYA 3A5NC 1DKGD 1QQNA 1Z6RA 3GDQA 3EKSA 3IFRA 1BG3A 2V7ZA 3QFUA 4EFHA 2GUPA 3WXJA 1T6CA 4MO4A 2HF4A 3LDLA 1MWMA 1BUPA 3SLCA 4NB4A 4ISGA 3QBWA 2ZGYA 2E2NA 4H0YB 3UKUA 5AQMA 3A5OC 5FPDA 3A8YA 4CZEA 2ZF5O 2GEMA 4BRLA 3D2FB 4BC5A 1NGIA 4PL8A 2BUPA 4BG9A 4RCHA 5AQQA 1ATSA 3MN7A 2V52B 2EWSA 3EKUA 5E26A 3R9PA 4BR4A 3CJ7A 3VETA 5AQOA 2QWRA 4K43A 3ZEUB 3CQYA 1YUWA 4CZLA 3IDHA 2QW9A 3H3OB 2NRHA 3H45C 4FWKA 5BR9A 4IWVA 2HOEA 1E4GT 3LDOA 4E1JA 2YCHA 2E2QA 5AZJB 4EHTA 1JCGA 4C23A 1S3XA 3S41A 2FF6A 2P9SA 5AQVA 2QWPA 3VEZA 2Q0UA 4GNIA 3D2EA 1MDUB 4A61A 4I6MB 3VEVA 4BQZA 3QB0A 4FWRA 2GWKA 1QQOA 3KHYA 3O8MA 4XH1A 3BUZB 4CZJA 4IJNA 5B8HA 3R8EA 2ZGZA 2CGJA 3LDQA 1CZAN 3OHRA 4JNEA 2E2OA 1DGKN 2IVPA 4H0OA 4B1WB 5BN9A 1QZ5A 1H1VA 4K42A 1GLJO 5AQHA 4BRGA 3WQUA 3W3DA 5BN8A 3ENOA 2AP1A 3LDNA 5JMVA 3P4IA 1NM1A 4QS9A 4CBXA 3EN9A 2W40A 1BO5O 1HKBA 3FZMA 3VGKA 1X3NA 3WXIA 4BVOA 4BR0A 3VF6A 5AQTA 2HMPA 1ZC6A 5AQPA 3ZEUA 4BRNA 1NMDA 4QS8A 3VF4A 2ASOA 1GLFO 4BRFA 1DEJA 1NGBA 2ZWHA 5JLHA 2A40A 1GLLO 5EOYA 3SK3A 5BREA 2V7YA 4M63C 3QICA 2FSNA 1QZ6A 2NZTA 5AZJA 2YHXA 3EZWA 4WYBA 2P9LA 1IJJA 3GG4A 1QQMA 1KAZA 3CJ9A 4HTLA 1NGHA 2I7NA 4MLHA 3MMVA 3CJBA 3TU5A 5AQXA 2P9SB 1GLBG 2Q31A 2KHOA 3BP8A 4J8FA 4KBOA 1T44A 2NLXA 2Q2RA 3D2EB 4PKHA 2QWQA 2IIRA 4MO5A 2W41A 2V51B 3EO3A 2ITMA 2E1ZA 5KPRA 4WQ4C 4QS7A 1X9JA 3UB5A 3FE1A 2OANA 4CZMA 4PL7A 1K8KA 4FWNA 3SJHA 4BR5A 4BR2A 3GL1A 2A5XA 3FZLA 3VPZA 4F9OA 4H5RA 4CJ7A 1NWKA 2BTFA 4FWPA 4A2AA 4AM6A 1P8ZA 4FOIA 2UYTA 4BVPA 5BRDA 3O4WA 1RDWX 3VEWA 3HI0A 3F9MA 4RWTA 3JS6A 3LM2A 3ZX3A 2FLOA 2YHYA 3QFPA 4FL9A 1J6ZA 4B1ZA 5KQDA 4FPAA 4CZKA 3ZETA 4Y0WA 3A0IX 3VEXA 1HUXA 2VYPA 1R59O 2Q36A 4BRQA 2A6AA 2D1KA 3GBTA 3U9DA 3GOIA 2IVNA 3ZX0A 2Q1NA 3G25A 5AR0A 2ASMA 5BRFA 2A42A 2P9KA 1RFQA 5BPMA 3C7NA 3VF2A 1ATRA 3U4LA 5AQLA 5LJWA 4CZIA 3VERA 2P9LB 5JLFA 3W0LA 5KPZA 2ASPA 4B1XB 3A5MC 1BA1A 3GE1A 2D0OA 4FWOA 3FLCO 3UE5A 1NGEA 2GTDA 4HWIA 5BRHA 1HPMA 1KXPA 1GLEG 1NBWA 5TKYA 3HTVA 1HX1A 4GY2B 1YAGA 3LL3A 2P9PA 3WEEA 1SZ2A 4FO0A 1U2VB 1TUYA 3DJCA 3CHWA 4WQ5C 4BRAA 1NGDA 4M7YA 5FPNA 4FPBA 4JD2A 4EHUA 4B1UB 3FGUA 1K8KB 1S22A 1JCEA 3IUCA 1HKCA 3CETA 2D0PA 3O1BA 4WQ4A 2P9IA 3BEXA 4DB3A 3ID8A 3O80A 2E20A 4LC9B 4BROA 3MN6A 3C0BA 5BPNA 1V4TA 1OKJA 1X3MA 3H6EA 3WXKA 1NGAA 1GLCG 2CGLA 3O5BA 5EX5A 4YDUA 3ZETB 3VENA 5AZIB 3J8AA 4AM7A 3M6GA 1ESVA 2Q97A 1RGIA 3FZHA 2GELA 3R6MA 4H5VA 1ZBSA 3RSEA 4H0PA 4EIAA 3QMLA 1YVNA 2HF3A 1Q18A 2Q0RA 3EL2A 2P9KB 4K25A 4O5FA 3C7NB 5AQYA 3M3ZA 2FSKA 5AQKA 3H3NO 2P9UB 5LJVA 4RTFD 2PBDA 3L0QA 2J4RA 3MN9A 4CZHA 4L3QA 3ATVA 4BC4A 1U2VA 4H0XB 4XEIA 2F9TA 2I7PA 3QBXA 5JICA 3MDQA 4IJAA 3CJCA 5EVZA 3VOVA 2D4WA 5AFUA 2E1YA 2FXUA 3WXLA 3CIPA 3UKRB 2AA4A 2PAVA 3IMXA 1EQYA 3VESA 2P9PB 3DXMB 3WEEB 4FOEA 4EAHD 5AQFA 5F1XA 3WUHA 1ZXOA 3O08A 2GWJA 2QWNA 2YI1A 4BRPA 4YDUC 4JD2B 4JN4A 1TUUA 3I8BA 1C0FA 3MK6A 4BC2A 3SMSA 2FF3B 3CJ1A 1U6ZA 2CGKA 2E88A 4WQ5A 1TYQA 4A62A 3BF3A 3DWLA 2P9IB 4FWQA 4XH4A 5AZIA 4BC3A 5KQ8A 1V4SA 3VEOA 3HBTA 4H5TA 4CI6A 1HLUA 3AAQA 5AQJA 3LM9A 4CZFA 4BQLA 1NGCA 3DXKB 4DHYA 3M1FA 4JAXA 2A41A 2YHWA 5FPEA 3LDPA 5LY3A 4FWSA 4M7XA 3KZBA 1LCUA 1XUPO 2IVOA 1MA9B 5CE3A 1BOTO 3ULEB 4PKIA 2P9UA 3FZKA 3HZ6A 4H0TB 3RSEB 3CI5A 1SAZA 4BR7A 4CD1A 4BRDA 4JHDA 5E84A 3FFKB 5ADXH 3I33A 4FSVA 2CH6A 4H5WA 4B1VA 3DAWA 1NGJA 3BF1A 5AQWA 1QHAA 3U9ZA 1IG8A 2WUSA 4Z94A 4BGBA 4DCHA 1GLAG 4PKGA 2CH5A 3UKRA 1BWFO 4MLEA 5BPLA 1JCFA 3DXMA 2FSJA 1YXQA 4ISEA 1T6DA 1KAXA 5AQGA 4BRHA 3B8AX 3VGLA 2P9NB 5ELZA 5EXWA 3SMPA 5ADXA 2E2PA 3ENHA 1E4FT 3O6WA 3H1VX 3ZX2A 3VGMA 1BDGA 3L6QA 3H1QA 3MCPA 4BREA 3L4IA 3HSCA 5AQZA 3KVGA 4H0VB 4BRIA 1WUAA 3ATUA 2E8AA 1XQSC 4O8KA 3FZFA 3CERA 1XC3A 3AAPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CFOA 4CF2A 3ASMA 1NNEA 3DLGA 4DQ8A 1HJOA 1NU0A 3D7EO 1L3TA 1NGFA 1YIJN 3UKUB 3HSTB 3CCRN 3TAFA 5F2RA 2QM1A 5AQSA 4FJXA 1SL0A 2IGIA 5GAHP 3O3FA 3CC7N 5AQNA 2G8HA 3AVCA 2GUIA 1RT1A 4E7JA 5C12A 5AQRA 4JHDB 3QDKA 4A2BA 4KH4A 3EE9A 4IZ9A 1Q9XA 3TI0A 4H5NA 3D0PA 3G71N 5KPTA 2VG5A 1K6YA 5KGXA 4BECA 1RTJA 4BR9A 4CK2A 1SUQA 1NGGA 2DPNA 1UWBA 2H3GX 4RG8A 5LMUK 3VQ6A 4CD3A 5CY4A 5C15A 1D9FA 4IXCA 3M8QA 4HUEA 1Q7YO 3DOLA 1KAYA 1IG9A 4FXDA 4OGEA 1QQNA 3L2QA 3C95A 3IFRA 1ILYA 4L8RB 3QFUA 4DV6K 4CJ5A 3WXJA 4MO4A 1IBKK 4B08A 1TL1A 3LDLA 1MWMA 3THVA 1BUPA 4LH4A 2QTDA 3HRGA 3A5OC 4A5AA 4V19S 4JKFA 2OPPA 1NOYA 3DLKA 2ZF5O 3LPTA 5KRSA 4BC5A 3RMCA 3RMDA 4BG9A 4RCHA 3MN7A 1TGOA 3PLAA 3R9PA 1JLGA 1HQEA 4W5RA 4BR4A 5AQOA 3CQYA 3TTCA 5BR9A 1LWEA 2RE2A 4JRPA 5E41A 2QK9A 5CR4A 4FW1A 4BDYA 4B3OA 4MQ3A 4TSXA 3V9SA 4I9LA 3U6FA 3D2EA 3MXIA 1YTUA 3ULDA 3ID6A 2PYLA 5CHIA 4XH1A 3BUZB 1IKWA 4NYFA 3LDQA 1ZBUA 1SS6A 4LF4K 1U47A 1VQ6N 1S6QA 5BN9A 4HUFA 4F8RA 4ZHRA 4K42A 4DLEA 5BN8A 1ZBFA 3AVLA 5JMVA 4QS9A 2W40A 3TSPA 1RDUA 1BO5O 1Z26A 4BVOA 3SV3A 4CJKA 3SCXA 3KD5E 1YJWN 3DM2A 1EP4A 4QS8A 3VF4A 2HW3A 2ASOA 4BRFA 1N6QA 2ZWHA 3B6OA 4M41A 4IEIA 3TWHA 1GLLO 1KVBA 2ZJQL 1HR0K 2FSNA 3QNOA 4ELTA 4Z4GA 3EZWA 1N34K 4QOZB 1IJJA 4O55A 1QQMA 3CJ9A 2ZJRL 3PY8A 2I7NA 1CZBA 3CJBA 5SZTA 3DRPA 1ASWA 2GX9A 3K9JA 3EEQA 4DS4A 2KHOA 4KBOA 2NRTA 3CMAN 3D2EB 5M1QA 3ZCMA 4B9UA 4MO5A 2W41A 1VSJA 1HYSA 4IOCL 2E1ZA 4XJXA 3BZCA 5BR8K 3CPEA 4WQ4C 4QS7A 4FJ9A 5FRMA 2DFEA 4CEQA 3QESA 1B9DA 4CESA 4BR5A 4BR2A 4CJPA 2ZQBA 4LSLA 3O9QA 4CJ7A 4PUOA 3AVAA 4GKKK 2BTFA 4FWPA 2I5JA 2UYTA 4BVPA 3VEWA 3CC4N 4QCLA 1DTTA 4DV2K 1VAZA 2FLOA 4BE2A 4O5BA 5KQDA 3VMFB 1EWRA 1SL2A 4DSJA 3QEVA 3N4QA 1DT9A 1HUXA 2A6AA 4FZYA 5GAEP 1N5YA 2IVNA 4CCHA 2Q1NA 3G25A 5BRFA 2A42A 3KK7A 1RFQA 2R7YA 1SL1A 3OYKA 2IS3A 4MDBA 4OPJA 2HHIA 4CZIA 4DTUA 4O4GA 3W0LA 3THWB 1QSLA 2D0OA 4FWOA 4HHTA 2HHTA 3O9UA 1REVA 2OZMA 4JK9A 3QO9A 4LF8K 3IS9A 1KXPA 4CEAA 1U2VB 3KLEA 4ILHA 2G8WA 3QLHA 3CHWA 4WQ5C 2HHQA 3N4PA 4CHOA 2O4IA 3FGUA 1NK8A 2C1IA 1JCEA 3HPOA 3IUCA 1HKCA 5KGWA 3TAEA 4WQ4A 2P9IA 4CHYA 4PA1A 3HK2A 1YT3A 3O80A 4ILGB 3ZT1A 5BPNA 4FYDA 2W6LA 3AA4A 1IO2A 5I3UA 5AZIB 4W5OA 3M6GA 2Q97A 1RGIA 3AGKA 3TAPA 3RSEA 3QMLA 3SPYA 2YX6A 2VG7A 5AQYA 3M3ZA 4DV7K 2HVIA 1VQ4N 4IFEA 2P9UB 2OZSA 4FJ8A 5LJVA 5CZ2A 2PBDA 4CJSA 2G8FA 3UIQA 4E7KA 4XEIA 2I7PA 3F9KA 1BCMA 2JGUA 3MDQA 4IJAA 4CFAA 4B3RK 4CF8A 3EY1A 3UKRB 1G15A 3IMXA 1EQYA 2O4GA 3VQDA 4CE9A 4DQPA 5AQFA 3SPZA 2RF2A 4KHWA 4DV3K 3KD1E 1ZXOA 3O4QA 4JN4A 5M1OA 3SV4A 3I8BA 4BC2A 3MX2A 3CJ1A 4KI6A 3SUPA 2CGKA 4WQ5A 1TYQA 5FLXO 3I8DA 4CJEA 5J2MA 3CFRA 2P9IB 3WNGA 3F2KA 4H5TA 1CLQA 3NGIA 4CZFA 4BQLA 4EP4A 1NGCA 3DXKB 3AA3A 3KK3A 2X6NA 4K8XA 1W7AA 4CJQA 3ZSOA 5C2FA 1WB9A 4DR1K 2IVOA 4F3TA 3C6UA 4DR7K 2HBJA 3SUOA 1BOTO 3VQCA 4PKIA 3THYA 3RSEB 3VTIA 4CD1A 5E84A 1JXEA 3SQ1A 3I33A 4FSVA 4H5WA 4C1NK 3HJFA 4FK4A 1QHAA 4OPHA 2KW4A 4OPKA 2WUSA 4Z94A 2W42A 4BGBA 2Y1JA 1R0AA 3ZSYA 4WCEL 4DWIA 4DCHA 2CH5A 3F73A 4MDAA 3DXMA 4FLUA 2FSJA 4ISEA 4BRHA 1VSEA 3NGYA 3R3LA 1NKBA 4KHUA 1JLEA 2P9NB 3SMPA 3QINA 3H1VX 3L6QA 2O8CA 3H1QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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