4CZEA

C. crescentus mreb, double filament, empty
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
324
structure length
321
Chain Sequence
SNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNVGGRKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGFVNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPEGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 97
structure length 321
sequence length 324
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czeA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czeA03
4H0OA 3LDPA 3ULEA 2YJFA 2FXUA 3CJ7A 1BA0A 1G99A 4FWSA 5F0XA 3O8MA 5JICA 3A8YA 1K8KB 3EO3A 4O5FA 3HI0A 2P9UA 1SZ2A 2E88A 4H5TA 3A5MC 1MWKA 4MO5A 5EY4A 4CBXA 2P9SB 3VESA 3DJCA 3TU5A 3CJ1A 3VGMA 4BRFA 2E20A 2P9IB 3CERA 4GY2B 3SLCA 5BPLA 2QXLA 5AQUA 3EN9A 4FOEA 2VYPA 5AFUA 3O08A 4CZJA 3S41A 1T6DA 4H0YB 4IWVA 3J8AA 1HPMA 3KVGA 3D2EA 4EIAA 3ATUA 5BREA 3WEEB 5BN8A 3VGKA 4BQZA 1ZXOA 4BRQA 2FF3B 2V7ZA 5AQSA 3UKUB 4PKHA 3EZWA 1NGAA 3SMSA 4Y0WA 1GLCG 3QDKA 4M7YA 4CZGA 2HOEA 4KBOA 5AQLA 3WQUA 4FWLA 5AQIA 3VEWA 3W3DA 4BREA 1QZ5A 5AFUH 1YVNA 2P9NA 4BGBA 3DXMB 1DEJA 1NBWA 5BRFA 1X9JA 4JHDA 3H3NO 4CZKA 4A61A 3QFPA 5EVZA 3DWLA 5JLHA 2YJEA 2E2PA 3M6GA 1NM1A 2FLOA 4BR0A 1NWKA 4PKGA 3I8BA 4MLHA 2P9PB 4F9OA 3GE1A 2Q97A 4FWNA 5BR9A 2IVPA 5KQ8A 3CETA 1TYQB 2FSJA 2YHWA 3ID8A 3FGUA 3EKSA 2Q1NA 3LM2A 3A5LC 1HLUA 5FPMA 3M1FA 5EOYA 3W0LA 2ZWHA 2P9KB 5TKYA 3D2FB 3O5BA 4B9QA 2E1ZA 2FF6A 1D4XA 3GOIA 3H1QA 4H0PA 2GEMA 2QWRA 5AQQA 2F9TA 2V7YA 3O4WA 3QBXA 3CI5A 4BR2A 5AQJA 3LDQA 2FSNA 4FWPA 1TUUA 1BO5O 1NGBA 3CJBA 3FZHA 2V51B 1NGGA 2GTDA 2ZGYA 3WXLA 5AZJA 5BPNA 1IG8A 1KAXA 4XEIA 3G25A 2A41A 1ATNA 1RDWX 2QWQA 2NZTA 4K41A 5AQMA 4CZIA 1ZC6A 5E26A 4IXCA 5ADXA 2P9LB 3VEXA 4WYBA 3WXKA 3FZLA 2EWSA 3CJAA 5FPDA 1GLFO 1GLAG 3VF4A 2W40A 5F1XA 4BR4A 3FR0A 2NRHA 3CHWA 1U2VA 3QICA 1NLVA 3L0QA 3P4IA 1LCUA 4E1JA 2OANA 2YHYA 1R59O 3H3OB 3LDNA 3VEYA 2I7PA 3DXKB 3CQXA 5ELZA 1LOTB 4YDUC 3VEVA 4FWRA 4CZHA 4BG8A 3SK3A 5AQVA 2YI1A 4WQ5C 5AQFA 3U8XA 5F2RA 4M63C 3HM8A 1RFQA 1RGIA 3MN6A 4PL8A 5ADXH 4BRKA 1Q18A 1JCFA 2AA4A 4WQ4C 3ZETB 1GLBG 2A5XA 2A40A 3ZEUA 4DQ8A 4DHYA 4CZMA 3IMXA 4BG9A 4FPAA 1U6ZA 4JAXA 3HBTA 1T6CA 4O8KA 5CE3A 2D0OA 3H45C 4IO8A 3EKUA 3ZX3A 3ZX0A 3L4IA 2QM1A 3LDOA 2ITMA 1CZAN 2IVOA 3BEXA 3QFUA 4QS8A 4BRPA 1WOQA 3ENOA 3RSEB 5E84A 4AM7A 3GBTA 3QB0A 5AQOA 1K8KA 3O1WA 2A42A 4CD3A 1C0FA 2KHOA 4I6MB 1HKBA 5BPMA 3AARA 2QW9A 2P9SA 1IJJA 2QWLA 4BR9A 4C23A 4B1VA 3R9PA 3BUZB 3UKRB 2P9IA 4BROA 5JMVA 3O1BA 3A5NC 2Q0UA 2AP1A 3B8AX 5KPZA 2YCHA 1GLJO 3VEZA 4BRGA 4FWMA 5KQDA 4XH1A 1V4SA 3MN7A 3WEEA 4MO4A 5BRDA 4IJAA 3O80A 4JD2B 3UKUA 3WXJA 5FPNA 2D4WA 3MMVA 4FL9A 2HF4A 2E2NA 3I33A 4CJ7A 3O6WA 4LC9B 3QBWA 1P8ZA 5AQXA 1BUPA 2IIRA 3A5OC 5AZIB 3U9DA 3U9ZA 4BRHA 3DXMA 5BRHA 3SMPA 1YXQA 2E2OA 1V4TA 1XC3A 2UYTA 4BRIA 1SQKA 4H5NA 2GELA 3HSCA 4B1ZA 4QS7A 5LY3A 2VCPA 2ASPA 1BDGA 3ENHA 4CZFA 1EQYA 1XUPO 4L3QA 3QMLA 4FOIA 3U4LA 4RWTA 3BF3A 2P9PA 3EL2A 3FFKB 4EFHA 3C0BA 1NGJA 3FE1A 5AQNA 1YUWA 3BF1A 4FWQA 4NO7A 4A62A 1KAZA 3GDQA 1TYQA 1NMDA 1KAYA 2H3GX 4FO0A 1OKJA 1WUAA 4BVOA 3OHRA 3C7NB 3FZKA 1NGHA 3VF2A 1QQOA 1HUXA 2HMPA 4FWOA 4PKIA 4B1WB 4BRDA 2P9KA 3D2FA 1MDUB 2A3ZA 2D0PA 3DAWA 5AR0A 4B1UB 1DKGD 1H1VA 3VPZA 3GG4A 5LJWA 4BRCA 3KHYA 1SAZA 3MCPA 1BWFO 2A6AA 1ATSA 5AQTA 3ULEB 3R8EA 3MK6A 3WT0A 1Y64A 3IDHA 4QS9A 2ASMA 2P9UB 3HTVA 1DGKN 1GLDG 1NGDA 2D1KA 4GNIA 3VF6A 3VERA 1HKGA 2P9LA 2W41A 2I7NA 4IZ9A 4XH4A 4MLEA 4ISFA 4BGAA 4BRNA 3L6QA 4BR7A 2BTFA 3D2EB 5B8HA 4BC3A 4A2BA 4H5VA 1JCGA 2E1YA 5AQZA 1BG3A 3DXKA 3IUCA 5FPEA 1KXPA 3FZMA 1BU6O 5JLFA 4FWKA 4XH5A 3F9MA 3H1VX 1TUYA 5AQGA 4K43A 5AQKA 3CIPA 4BC4A 1BOTO 4HTLA 3ZETA 3D7EO 4JN4A 1XQSC 3M3ZA 4HWIA 4B1XB 4CBWA 4PL7A 2P9NB 3IFRA 4YDUA 1ESVA 2QWPA 5AQHA 3VGLA 1MA9B 1NGEA 4WQ5A 4JHDB 4CD1A 1C0GA 3JXUA 3FLCO 4K42A 4B1YB 2GWJA 3SJHA 4WQ4A 2BUPA 1JCEA 3MN9A 2Q31A 5I9EB 3UB5A 4H03B 4BVPA 1J6ZA 3ZX2A 4FSVA 3RSEA 1X3MA 3CJCA 4H0TB 2Q36A 4DCHA 3VETA 2J4RA 4EHUA 3JS6A 4NB4A 3H46O 4I6MA 3BP8A 3UE5A 1YAGA 3KZBA 1BA1A 2CGLA 3FZFA 3UKRA 4FPBA 1T44A 1NGFA 2F9WA 1E4GT 4H0VB 1MWMA 4ISGA 3VOVA 3WQTA 4H5WA 4CI6A 1S3XA 2PAVA 5EX5A 2ZGZA 1NGIA 2WUSA 5EXWA 1ATRA 1X3NA 3VEOA 4JD2A 3GL1A 2QWOA 1HX1A 4IJNA 2FSKA 4H5RA 4BQLA 5AZJB 4RTFD 1E4FT 1HKCA 3CQYA 5AQWA 2QWNA 3WXIA 3VENA 1GLEG 1ZBSA 4A2AA 5AZIA 4BR5A 3A0IX 5LJVA 4ISEA 1U2VB 3WUHA 4RCHA 4BRMA 2V52B 4CZLA 5KPRA 2CH5A 3AAQA 2GWKA 2QWMA 3CJ9A 4DB3A 3R6MA 2YHXA 2HF3A 3MDQA 1QHAA 3HZ6A 2ASOA 3AY9A 1HJOA 1NGCA 4M7XA 1QQMA 4K25A 2DPNA 2GUPA 5BN9A 4BRAA 4EHTA 4BC5A 2Q0RA 2E8AA 2IVNA 3ZEUB 5AQRA 1Z05A 3LL3A 3LDLA 5AQPA 3C7NA 3H6EA 5KPTA 2CH6A 2CGJA 3MN5A 4H0XB 4BC2A 4AM6A 4Z94A 3AAPA 1S22A 2VWBA 4CBUA 1QZ6A 2PBDA 4JNEA 2Q2RA 3LM9A 2CGKA 1Z6RA 3ATVA 1GLLO 4EAHD 4BRLA 4J8FA 1QQNA 3TPQA 2E2QA 2NLXA 4CZEA 5AQYA 2ZF5O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IC3A 2JWLA 4KH4A 2G8VA 1T7PA 5GAEP 3CD6N 3O8MA 4NCGA 2AJQA 4Z4IA 4JYAK 1IKWA 3EO3A 1KTQA 3OVNA 4O5FA 3LWMA 1QS4A 3K5MA 3AV9A 1VAZA 3ULDA 5EY4A 4CBXA 1G15A 3I56N 1HYZA 3VESA 1VSFA 4FM2A 4EZ6A 3KTQA 4FOEA 2HNYA 4B3RK 1LWCA 3M8PA 3P5JA 4CZJA 3S41A 1T6DA 2Q3SA 4H0YB 2NNWA 4CJ4A 3ATUA 3L2VA 5BN8A 4B3TK 4BQZA 1ZXOA 1CXUA 4BRQA 3AVCA 5AQSA 4CHNA 3UKUB 3K9KA 4YFUA 3KLHA 4Y0WA 4M7YA 3VTHA 3C94A 5K14A 4YOTA 1JLCA 1RT5A 2HMIA 2B4JA 2VGNA 1C1AA 2KW4A 3KIOA 3O4NA 3CFOA 4PHTX 1YVNA 2P9NA 3TARA 1TL1A 4CGIA 4B9MA 4B3MK 1XHXA 3LPUA 1XHZA 4BE2A 3DWLA 5M1QA 5SZTA 4JI0K 4KAZA 4JRPA 2FLOA 4C8LA 4FW2A 4YOVA 4FJJA 4DU1A 1QVGM 1C6VA 3NF6A 5JS2A 3AVFA 2P9PB 4CEOA 1K73O 4F9OA 3HL8A 4MQ3A 1SL1A 2Q97A 5BR9A 4LF7K 5LMUK 4DQPA 1XNRK 3MWPA 4CJTA 4FJ9A 4WE1A 3LPTA 4DSFA 2P9KB 1HPZA 3LZIA 3O5BA 1WSIA 3GOIA 3H1QA 3PV8A 2QWRA 4AHCA 1S9EA 3O4WA 2KLAA 3CI5A 3LDQA 4FWPA 1OVYA 1TUUA 3NDKA 1NGGA 5KI6A 5BPNA 3O3HA 1RT2A 4CF8A 3TSUA 3Q7CA 4O0JA 2A41A 2PZSA 3TAFA 4DR3K 5E26A 5ADXA 3FZLA 2W40A 4BR4A 3FR0A 3CHWA 2HHHK 5CYMA 3L0QA 3SAHA 4DFJA 3M8RA 4EP5A 4O44A 4XJXA 2YHYA 4J2EA 1VSIA 1VQKN 3VEVA 3E9LA 4FWRA 2HHWA 4CZHA 1RT1A 1EETA 5F2RA 4M63C 3MN6A 1A5VA 4PL8A 1RILA 4B9TA 3TTDA 2G8FA 4RG8A 2VQEK 3IMXA 4X64K 3A2FA 4MDBA 4O8KA 5CE3A 3QIPA 4CJEA 2D0OA 4CIFA 4CEFA 1I3AA 2ITMA 4KHPK 1X9SA 4FVMA 3GBTA 3QB0A 2NRWA 1K8KA 5M1OA 1YIJN 2VG7A 1IKVA 2O4GA 1C0FA 2YNIA 1HKBA 3AARA 2ZE2A 4BR9A 4C23A 3BUZB 2P9IA 3EE8A 2XY8A 4E1NA 3B8AX 5KPZA 4DUYK 2YCHA 1M90O 1GLJO 4FWMA 4XH1A 3MXMA 5GAGP 3PO5A 2HBLA 4GV9A 5DM6L 4IJAA 3VA3A 3O80A 2VG5A 3VQDA 4KREA 5C10A 4FCYA 3WXJA 4LF8K 4JK8A 1IBLK 3WNHA 2F96A 3E01A 2QKKA 1WSEA 3I33A 3O9QA 1B92A 3LP1A 4DU4A 2P5GA 4CJKA 5JVHL 3O6WA 4HCBA 3QBWA 1P8ZA 1X9WA 3TR8A 2RHKA 1L3SA 3K5NA 4BRHA 5BRHA 3SMPA 3KJVA 3DLLL 3ZSXA 4CK3A 5LL6Z 3V1RA 4H5NA 2GELA 3HSCA 4B1ZA 1O1WA 1BDGA 1XUPO 2B6AA 4IBNA 1WSGA 1O13A 2ETJA 4L3QA 3MECA 1LAVA 3KKRA 3EL2A 4EFHA 3AVAA 1BI4A 1VQ9N 1QSLA 4NO7A 3B6PA 1KAZA 3C6HA 1NJZA 3VQQA 3GDQA 1TYQA 3NGZA 1S6QA 2GX9A 1YVUA 1FXXA 1WUAA 4BVOA 4KRFA 4FLUA 1OH5A 1W9HA 4B1WB 4CJRA 4ILHA 3D2FA 3ZLJA 2A3ZA 1YITN 2WFBA 1HNXK 1DKGD 3VPZA 3GG4A 2HB5A 3OJSA 3MCPA 4FZYA 5C25A 3R8EA 2F8SA 3NFAA 3AGRA 4FLYA 3ID6A 4QS9A 3HTVA 1K8AO 3EY1A 4LF5K 4DSIA 1NGDA 1S1UA 1OH7A 1RTDA 3HPHA 4OJRA 5C15A 5T7BA 1UOCA 4BACA 3SYZA 4IZ9A 1S1TA 4LSNA 4PUOA 3QERA 4DTOA 1ASVA 1X1PA 3SQ2A 4A2BA 4H5VA 3SUPA 4GKKK 1KXPA 3OYNA 1JLBA 1C0UA 2I5JA 3OBWA 4XH5A 5JLFA 1QTMA 4GVEA 3H1VX 3O9UA 4FM0A 4A5BA 4K43A 2Z1JA 3HP9A 3V1QA 4M3TA 3DLRA 4DV4K 3TSPA 1RTHA 3M3ZA 4KTZA 2P9NB 2G8WA 1ESVA 3RR8A 4DTSA 1MA9B 4WQ5A 1TKZA 2VG6A 4HTUA 2C1IA 4CESA 2C1GA 1JLQA 2GWJA 1JCEA 5I9EB 2Q31A 3UB5A 4H03B 4BVPA 1J6ZA 4Z4GA 4FW1A 4DCHA 4M41A 4CHQA 2J4RA 4DR1K 3JS6A 5M1FA 4I6MA 4OKJA 2O8BA 2E6MA 3UE5A 3ASMA 4CEDA 5FROA 2RPIA 3KZBA 2PYJA 1EKEA 4Z4HA 4DSKA 1T44A 4IEIA 4O8UA 1FKOA 4ID1A 2YHBA 2UUAK 2G8HA 3RRGA 5TKWA 3SV3A 3CM5A 3EE9A 4DQIA 1NGIA 2FBTA 3QINA 5EXWA 3GL1A 4IKFA 2QWOA 3QETA 3HSTB 4IJNA 3CMAN 4BQLA 1TGOA 4DSEA 4RTFD 3NH2A 1HKCA 3CQYA 4YNQA 1YHQN 3TAGA 4LY7A 4CERA 5CYQA 1ZBSA 3QEIA 4A2AA 4YOYA 2A1SA 3A0IX 3SI6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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