4CZFA

C. crescentus mreb, single filament, adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
337
structure length
329
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLEST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
total genus 105
structure length 329
sequence length 337
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czfA03
1MA9B 3DJCA 5BN9A 3O6WA 4JNEA 4BR4A 2E20A 5AQRA 2E2OA 3A5MC 4L3QA 5AQJA 4WQ5A 4XEIA 5E26A 5FPNA 5BREA 3ATVA 1RFQA 3FZKA 2CGJA 1ZXOA 4EIAA 1ZBSA 4O8KA 1BA0A 1H1VA 2V51B 4H5RA 3LDNA 4GNIA 2HOEA 3EZWA 3M3ZA 2CGLA 1S22A 5EVZA 1EQYA 2P9PA 2VWBA 5EOYA 3ZETB 4B1WB 3CQYA 4E1JA 5KPTA 4J8FA 2KHOA 3W0LA 3U8XA 3P4IA 1OKJA 5KPZA 4PKIA 4BC2A 1ATNA 3O1WA 3HSCA 4PL7A 2Q97A 3RSEA 5CE3A 2E88A 3G25A 4CZGA 1IG8A 1Z6RA 1TYQA 5AQXA 3UKRB 3LDLA 3D2FB 1E4GT 4PKHA 2F9WA 4BVPA 3CJCA 3B8AX 5FPMA 4CBWA 2DPNA 2IVPA 4BRCA 2FXUA 5AZJA 1KAZA 1U2VB 3ULEA 1HKCA 2YHYA 3QICA 2W41A 4H5WA 4BC5A 1CZAN 4DCHA 5B8HA 3FZLA 3WEEB 3J8AA 3VENA 3VETA 1JCFA 2QWRA 3SJHA 2OANA 2ITMA 1X9JA 4JD2B 3SK3A 2FSKA 4M7YA 1E4FT 3VF2A 5F1XA 2I7PA 5FPEA 4BR2A 5KQ8A 2QWNA 3VEWA 3JS6A 4NO7A 4H5NA 3CERA 3BEXA 4ISEA 4FPAA 1GLLO 3BF3A 4RCHA 3M1FA 1ATRA 2BUPA 4BGBA 1YUWA 2GUPA 2ZF5O 3WEEA 3VEVA 3LM9A 4K43A 1QQOA 3ZEUA 2V52B 4CZMA 1QQMA 4BGAA 3WXIA 1T6DA 2QWQA 2YJEA 3FZFA 3U9ZA 5AQMA 5BRHA 3C7NA 4A62A 2F9TA 1MDUB 3SMPA 4DHYA 4ISFA 3ENHA 1NGEA 5F2RA 4WQ4A 4BG8A 1HPMA 3MDQA 3QDKA 2P9IA 2A3ZA 4WQ5C 3I33A 3H1QA 5AQKA 5AQLA 4IJAA 1KAXA 5AQWA 2P9LA 3EL2A 3KHYA 4BQZA 4DB3A 4FL9A 1NGAA 2GWJA 3O4WA 2HF4A 4AM6A 5TKYA 5AR0A 2A5XA 3D2EB 4O5FA 1T44A 3O08A 2Q0UA 5AZIB 4H5TA 2NZTA 5AFUH 3AAQA 3CJ1A 3BUZB 1BDGA 5BPNA 4NB4A 5I9EB 3GOIA 3GL1A 2FSNA 2FSJA 3LDQA 2GELA 2IIRA 3H45C 5FPDA 1Y64A 5JLHA 2D0OA 3LDPA 4DQ8A 5E84A 3VEZA 2AP1A 2A6AA 1T6CA 2BTFA 2QWOA 3BP8A 2CH6A 3AARA 1U6ZA 2VYPA 3R9PA 4FWQA 4BREA 3H3OB 2P9SB 4CZLA 4ISGA 4JN4A 1R59O 1WUAA 1BOTO 2GEMA 2QXLA 3CJ9A 3FE1A 4QS9A 4EHTA 2EWSA 4MO5A 2ZWHA 4YDUA 4PL8A 1QZ5A 3A5NC 5EX5A 5JMVA 4EFHA 3WXLA 2P9KB 2YHXA 3UE5A 2FLOA 1BUPA 2V7YA 4H0PA 4BR9A 4CD1A 4IJNA 1YAGA 4BR5A 1XUPO 3MN5A 4B1UB 3O5BA 3ZETA 3QFUA 3DXMB 3HZ6A 4XH1A 3VGKA 4H0XB 5LJWA 1XQSC 3IFRA 1KXPA 4FO0A 4CI6A 4BRMA 4H0VB 1YVNA 1ZC6A 3ENOA 4B1VA 4K42A 2GWKA 3A0IX 2YJFA 5AQOA 1Q18A 2QW9A 3UKRA 2AA4A 3GBTA 4FSVA 3ZX3A 1C0FA 3D2FA 2HF3A 4BRIA 4CZKA 2ASOA 1BO5O 2D4WA 3FGUA 2E2QA 3L6QA 3BF1A 3TU5A 3A8YA 3H1VX 3U4LA 5AQHA 3WT0A 4HTLA 3VGMA 4A61A 5AQZA 3UKUB 2HMPA 5JLFA 1NM1A 3CIPA 1QHAA 4JHDB 5AQSA 1U2VA 3CJBA 3OHRA 1SAZA 4BRGA 3IMXA 4FWRA 4BRFA 4CZIA 2A42A 4FOIA 2E1YA 2FF3B 3CQXA 1D4XA 3ZX2A 1HUXA 1NWKA 1GLAG 3DXKB 4MLEA 3EO3A 4JD2A 4MLHA 2Q31A 2FF6A 4BROA 3GDQA 4EHUA 3VERA 1C0GA 4I6MB 4CZFA 4BC3A 1TUUA 3WQUA 1K8KB 1S3XA 3FR0A 1NGGA 1HKGA 3KZBA 1DEJA 3SLCA 2E2NA 1JCGA 1GLJO 2P9UB 2A40A 2P9NB 1GLEG 4F9OA 2ASPA 3QMLA 1BWFO 3CI5A 2H3GX 3ATUA 3IUCA 1NGIA 5BPMA 1NGBA 3C0BA 1WOQA 5LJVA 5KQDA 5ELZA 4A2AA 4FWNA 3QBXA 3L4IA 4K41A 1YXQA 1X3MA 3FZMA 4Y0WA 1BG3A 3MN7A 5BR9A 1KAYA 1ESVA 1GLBG 4M63C 3HI0A 1NGHA 5ADXA 4BVOA 3F9MA 4AM7A 1G99A 3EKUA 1P8ZA 2ZGZA 3I8BA 3MCPA 3QB0A 4JAXA 4YDUC 4BR7A 4EAHD 3IDHA 3R8EA 3WUHA 2Q36A 3S41A 4RTFD 2PBDA 4C23A 4BRQA 2P9PB 3M6GA 1NGJA 1MWKA 4PKGA 1LOTB 3VPZA 2CH5A 4CBXA 2D1KA 2QWPA 3D2EA 4FWLA 3VF6A 2J4RA 3O1BA 5EXWA 2QWLA 3KVGA 2E1ZA 4BRHA 5AZIA 4BC4A 4FWMA 3ZX0A 3RSEB 5AQQA 5ADXH 1TUYA 2D0PA 2YI1A 4B1ZA 2A41A 5AQFA 1TYQB 1GLFO 4BRDA 1SZ2A 1NGFA 3ID8A 4FOEA 2Q1NA 4HWIA 1GLCG 1HX1A 3H6EA 3H3NO 1X3NA 3EKSA 3VEXA 5KPRA 3O8MA 1RDWX 1SQKA 3CJ7A 5AZJB 4CZHA 3ULEB 1DGKN 1NGDA 2P9SA 3QBWA 3SMSA 5AQVA 5LY3A 3H46O 3LM2A 5AQPA 4BRAA 1DKGD 1GLDG 3EN9A 4IZ9A 3VESA 3FFKB 1HLUA 2GTDA 2VCPA 3W3DA 3GG4A 5AQGA 3L0QA 3MK6A 4IWVA 2YHWA 3WXKA 4LC9B 3VGLA 4FWKA 2P9KA 4BRLA 3U9DA 4WQ4C 1QQNA 4XH5A 2CGKA 3HM8A 1NBWA 2IVNA 4CZJA 3R6MA 5F0XA 4B9QA 3MN9A 4BRNA 3DXMA 4CBUA 4H0YB 3AY9A 4BRKA 4GY2B 3JXUA 2E2PA 3ZEUB 1LCUA 4BR0A 3FLCO 2I7NA 2IVOA 4FWPA 3A5LC 2W40A 2QWMA 3VEOA 5JICA 1QZ6A 1HKBA 2UYTA 4A2BA 3C7NB 5AQYA 5BRFA 4QS7A 3DWLA 4IXCA 4Z94A 2Q0RA 1ATSA 2E8AA 3AAPA 5AQUA 2PAVA 4CD3A 2P9IB 1HJOA 4FPBA 1NGCA 3UKUA 4XH4A 2YCHA 1J6ZA 4JHDA 1XC3A 1RGIA 4MO4A 4BRPA 1NMDA 5BN8A 1V4SA 2P9LB 4B1XB 2Q2RA 4H0TB 3LDOA 3UB5A 4BG9A 2ASMA 5EY4A 4RWTA 5BRDA 4H5VA 5AQTA 3DXKA 3VEYA 2ZGYA 3CETA 3CJAA 4FWSA 1Z05A 3HBTA 4I6MA 5AFUA 3HTVA 3DAWA 1K8KA 3VOVA 2V7ZA 4CJ7A 3TPQA 3FZHA 4B1YB 2WUSA 2NRHA 4KBOA 5AQNA 4CZEA 4QS8A 3MN6A 2QM1A 3MMVA 4K25A 3QFPA 2P9UA 3WQTA 1NLVA 2P9NA 3A5OC 4IO8A 4H03B 1MWMA 3O80A 1BA1A 1IJJA 5BPLA 3CHWA 3WXJA 1V4TA 2NLXA 3D7EO 5AQIA 4WYBA 1BU6O 3VF4A 3LL3A 4M7XA 4FWOA 4BQLA 3GE1A 4H0OA 1JCEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HNWK 2KW4A 4LFCK 1MA9B 4BWMA 3TI0A 4CIEA 4L3QA 2B4JA 3LP2A 4WQ5A 1T03A 2KZMA 4KB1A 4N5SA 4IDHA 1O1WA 1ZXOA 5C25A 3BZCA 2KQ2A 2V51B 4CEDA 1BGXT 1G15A 3CFRA 3LDNA 4GNIA 4CW7B 3S9HA 3AO4A 4LSLA 1MU2A 2JWKA 2CGLA 4E1JA 5EVZA 4B1WB 4KHPK 3L4QA 1RNHA 4IEIA 2HB5A 3W0LA 5EU7A 2W6KA 3U8XA 1VQON 1OKJA 4PKIA 1L3UA 4BC2A 4PL7A 4DV1K 4CESA 1KVAA 4PHTX 1LAVA 2P5OA 3UKRB 3U6FA 4CGGA 2ZD1A 4OLAA 2HHXA 3VTHA 5GIPA 2X78A 2KKZA 5HRSA 3TAGA 2G8FA 1JXBA 1WB9A 4CK1A 4KB0A 4CF8A 5AZJA 3BDPA 1HQEA 3KK3A 3QICA 2WBNA 4CEOA 1BIUA 5D3GA 3J8AA 3VENA 3VETA 4IOCL 3AVHA 2OA8A 1JCFA 3O4QA 2OANA 3SUOA 1NKCA 1SKSA 3Q7BA 5J1EA 4Z4IA 3AVMA 2O8BB 3V9ZA 1UA0A 4BDPA 4FK2A 4E1MA 1EKEA 3N4QA 4CJVA 4Q0BA 4DUYK 1SV5A 1LAWA 4F4KA 4X66K 2HNDA 3BF3A 1SKWA 3M1FA 1W7AA 1J53A 1KRPA 2ZF5O 1YTAA 1LV5A 3TAQA 1VRUA 4KH4A 3LM9A 1QQOA 4N56A 4CZMA 1QQMA 3AV9A 4B9VA 4CGDA 4FK0A 1EXQA 3CMEN 1W9HA 3ZT3A 2G8UA 4FLVA 4DHYA 4BE7B 1MDUB 4ISFA 3HPGA 1RDAA 4KHYA 3SPZA 5F2RA 3VQ8A 4WQ4A 1HPMA 3MDQA 2A3ZA 1RT5A 5HL7L 5J2PA 3QERA 2P5GA 4F2RA 4B9SA 4FLWA 4LY7A 3OTOK 4GV3A 5KGXA 4BQZA 4DSLA 4PA1A 3AA4A 1NGAA 4FL9A 3DOKA 1X9WA 3NHGA 4O44A 3L3UA 5TKYA 1UAXA 5AR0A 4O5FA 3TAPA 1T05A 2Q0UA 4DWIA 1K8AO 1YI2N 3CJ1A 3UIQA 1XHXA 3K59A 4DR3K 4A5BA 5GINA 1N8RO 3LDQA 3L2RA 3HJFA 1TAUA 2IIRA 3H45C 5FPDA 1M1KO 1Y64A 2FBTA 5JLHA 1VSDA 3VEZA 3THVA 3A2FA 2BTFA 1U6ZA 2VYPA 5SZTA 3NAEA 5IWAK 1KD1O 3EY1A 2R7YA 5AJ3K 4FLTA 4K8XA 3SQ4A 2YHBA 3RRHA 2GEMA 3TR8A 3V81A 2DFEA 4QS9A 4M3YA 2VWKA 4DTPA 3IRXA 4DU4A 4DV2K 2HVHA 4O55A 3O4NA 3BY5A 3A5NC 1LW0A 4DTNA 4DTOA 3KLGA 1W97L 2FLOA 2V7YA 4IJNA 2B5JA 1P90A 3QEIA 4AF1A 3OYHA 3QFUA 1VAZA 1NJZA 4XH1A 3VGKA 3KLEA 1U04A 1KXPA 4BRMA 4H0VB 4J2EA 3L2VA 3A0IX 3HPOA 1KCFA 5AQOA 3UKRA 1C0FA 3PY8A 2ASOA 1HYZA 1T7PA 3WT0A 4NXMK 3UKUB 3E9LA 2O8FB 1NM1A 4JHDB 4AHVA 3CJBA 4FZZA 1S1WA 1SAZA 3IMXA 4OJRA 4BRFA 2A42A 3AVIA 1NK9A 5TKWA 3VQ9A 1HUXA 5DK5A 4FK4A 4GV6A 3EO3A 4PWDA 3AVLA 4FXDA 3ZCMA 1DTQA 4ILGB 2O8BA 4DQSA 3WQUA 1DLOA 1K8KB 1L3SA 4CFBA 3KZBA 2YNGA 1N32K 3VQBA 2E2NA 3ZT0A 4J2DA 5CZ1A 4M3UA 3LALA 3LANA 4F9OA 3VQCA 5C42A 1NK4A 1YIJN 3NMUA 2H3GX 3IUCA 3ZT2A 1WOQA 5LJVA 3ZSYA 5M1PA 1N5YA 1VSFA 4K41A 4KHNA 4HTUA 1X3MA 3HOTA 1U48A 1BG3A 3MN7A 5BR9A 3RMAA 3LWLA 3HI0A 4C8MA 5ADXA 3NH0A 4JI4K 5J2QA 3NVKA 1S1XA 1XC9A 3VMFB 3D0PA 4M3ZA 2OPSA 3IDHA 3R8EA 3K2PA 5FRMA 4B8AB 1N36K 2FBVA 2PBDA 5HRPA 1SL1A 3TARA 1ZBHA 4JI5K 4PKGA 2OZSA 3KK2A 4KRFA 3N4PA 3DLBA 1D9FA 3KVGA 3T3FA 5JVHL 4K0KK 1EP4A 3AO3A 4W5TA 4BE2A 5AQQA 5ADXH 4IOAL 2D0PA 4Q5VA 4IG3A 2HHVA 3H08A 1RT4A 3CCMN 2P51A 4HWIA 3H6EA 3VTIA 2HVIA 3PSIA 4QAGA 4KHQA 4DS5A 3CJ7A 4GMJB 1HRHA 2D0BA 4O4GA 3M8PA 3VA3A 1IBLK 1IKYA 3QBWA 3MAQA 3H46O 1JKHA 4DSJA 2UUAK 4O5BA 3L2WA 3HT3A 1GLDG 4JKFA 1W0HA 2FC0A 4DQPA 5BR8K 5AQGA 3TWHA 2O8DB 1E3MA 3VGLA 4FWKA 4ELVA 3NF6A 3U9DA 4Z0UA 1QQNA 4XH5A 1U4BA 2CGKA 4K8ZA 3R6MA 5C12A 1ZBLA 4YFUA 1KTQA 4AHRA 3ZEUB 1LCUA 5KRSA 3FLCO 1Q81O 2QWMA 3MXJA 2XY6A 2HMIA 3DI6A 1QTMA 2XRIA 4CHOA 4H4OA 3KIOA 3PO4A 4OPHA 3HP6A 2E8AA 2GV9A 4Z4EA 4QCLA 3TSUA 4DV6K 4LF5K 1NGCA 3UKUA 1CZBA 4M41A 2O8FA 3P31A 4JHDA 1XC3A 1RGIA 4MO4A 4BRPA 2HBKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4CIF A;  1KAY A;  1ESV A;  3U3G A;  4M63 C;  2WON A;  4R79 A;  1NGH A;  1LW2 A;  3L3V A;  1NOY A;  1NU0 A;  4BVO A;  5M1K A;  1O13 A;  4IEE A;  3PX0 A;  3C6H A;  3MCP A;  4N41 A;  4JAX A;  3K9K A;  4YDU C;  4EAH D;  3WUH A;  1YHQ N;  4DV7 K;  4RTF D;  3LWM A;  5FDL A;  1CLQ A;  3LDS A;  4C23 A;  4BE0 A;  4ZTF A;  3SYZ A;  4JI0 K;  3TSQ A;  1WN7 A;  1SL0 A;  1NG9 A;  3OYN A;  2WFB A;  2IGI A;  3VF6 A;  3O1B A;  5EXW A;  4BDZ A;  1WSJ A;  4FWM A;  4DTR A;  4A57 A;  4GV9 A;  4B1Z A;  4X62 K;  4FJL A;  4FCY A;  5CY4 A;  3V1R A;  4BRD A;  1GLF O;  3IKM A;  4FOE A;  2Q1N A;  2IDO A;  1GLC G;  1HX1 A;  4DTU A;  1YJN N;  3H3N O;  1X3N A;  4KHU A;  3EKS A;  2A1S A;  5KPR A;  2W00 A;  1SQK A;  2IAJ A;  2YNF A;  5AZJ B;  4CZH A;  1IO2 A;  1OH6 A;  1KLN A;  4FJI A;  5AQV A;  3LPU A;  1ASU A;  4KHW A;  5M1Q A;  1DKG D;  3VES A;  4IZ9 A;  4MDB A;  2NUB A;  1TV6 A;  3ASM A;  1IH7 A;  2DFH A;  3AA5 X;  3K0S A;  3RWU A;  1VQP N;  1BHL A;  3TAM A;  4IWV A;  3WXK A;  3PUF A;  4BRL A;  2ZJQ L;  1REV A;  3VQ7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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