4CZJA

C. crescentus mreb, double filament, amppnp
Total Genus 94

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
323
structure length
314
Chain Sequence
DIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNVGGRKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPEGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEH

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTII2 (60-63)S2 (21-26)S4 (39-44)AH2 (82-97)TII1 (26-29)O1 (36-38)S3 (30-36)S5 (47-53)TIV4 (43-46)AH1 (55-59)S12 (168-174)TI1 (65-68)TIV5 (61-64)S6 (68-71)S7 (74-75)TI2 (112-115)TI3 (151-154)TI4 (164-167)S10 (134-139)TVIII1 (132-135)AH7 (252-276)AH4 (140-148)O2 (154-156)S11 (158-163)AH5 (188-203)TIV8 (173-176)S13 (177-184)AH6 (209-219)AH8 (279-288)S14 (205-206)S15 (232-239)TI5 (239-242)TI6 (240-243)S16 (245-251)S17 (290-293)TII3 (299-302)AH9 (302-310)S18 (314-316)S1 (13-17)TIV1 (18-21)TIV6 (74-77)S8 (78-79)TIV7 (79-82)AH3 (117-130)O3 (184-186)3H1 (295-298)S9 (106-111)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 94
structure length 314
sequence length 323
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czjA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czjA03
3WUHA 3IFRA 2QWNA 1ATNA 5EXWA 1U2VB 5JLFA 1WUAA 4JNEA 3ZX2A 5ADXA 2IVPA 3FGUA 3CQXA 1GLLO 2AP1A 2Q97A 5AQVA 5AQXA 4CD3A 2P9PB 5AQZA 3VESA 4CZKA 1X3MA 3TU5A 5AQNA 1NGGA 1GLJO 3H1QA 2NRHA 2ZGYA 4RWTA 5KPRA 4QS8A 3UKUA 1LOTB 2E1YA 5AQYA 4H0XB 1YXQA 4B1YB 2UYTA 5AQFA 3MN9A 2ZF5O 4BRMA 3U9DA 3QFUA 1GLEG 1K8KB 4H0YB 3M3ZA 3AAQA 4FOIA 4J8FA 4H0TB 1RDWX 1NGDA 1U6ZA 2HF3A 4MLEA 3ZEUB 2GEMA 2I7NA 2I7PA 5AQQA 3GBTA 1QZ5A 5AQTA 3GOIA 3FLCO 2ITMA 2Q0RA 1G99A 2P9IA 3D7EO 3CJCA 3DWLA 2QWOA 5KPZA 3OHRA 2W41A 2P9SB 2YHXA 2ZWHA 4BR7A 1WOQA 4IWVA 4CI6A 3CJ7A 3EKSA 4FOEA 3O6WA 4NB4A 2FSNA 3DXKA 1E4FT 5BREA 4I6MA 1J6ZA 4EAHD 3ENOA 3G25A 3VENA 1D4XA 4WQ5A 3VOVA 3QBXA 3LDPA 3VF4A 3WXLA 3WT0A 2Q2RA 4E1JA 4BRKA 2QWLA 4JD2B 2GUPA 1S22A 1OKJA 3D2EA 4K42A 3R9PA 4FWOA 1JCFA 4JHDB 3JXUA 3UE5A 3BF3A 1HX1A 4BRQA 4HWIA 3SMPA 1NGHA 4CZFA 1V4SA 2Q31A 2QWMA 4BC5A 3GE1A 4K25A 3A0IX 3CJ1A 2E2PA 5TKYA 2IVOA 3H3OB 1BO5O 4WQ5C 2ASPA 3U9ZA 4CJ7A 4FWQA 3GG4A 3A5OC 1SZ2A 1C0GA 2QWRA 4ISEA 3TPQA 5LJWA 3O5BA 3BF1A 4EHTA 1HJOA 3LDLA 1C0FA 5BPNA 3QDKA 1HKGA 1X3NA 3H45C 2Q1NA 4FO0A 4GY2B 1LCUA 4H5VA 1QQNA 4C23A 3LDQA 5AZIB 4BR9A 3A5MC 4BC3A 4RCHA 2YHYA 3KHYA 1BDGA 4Y0WA 4BRNA 4BROA 1GLFO 3M6GA 4JN4A 1NLVA 4FSVA 2D1KA 2GTDA 3GDQA 2P9NA 3EN9A 5F2RA 4BGAA 5ADXH 5AQJA 1ZC6A 1KAZA 3FZLA 4BRGA 3DJCA 3HTVA 1BU6O 3VERA 2D0PA 3GL1A 4BRCA 3FZHA 1ZXOA 3H1VX 4WQ4C 2PBDA 5JMVA 4NO7A 2FLOA 4BRPA 4BRLA 2P9SA 4BR4A 5E26A 4H0PA 2V52B 2GWJA 4ISFA 4B9QA 2AA4A 5BRHA 5AFUH 3MK6A 1DGKN 3LL3A 1NMDA 3VEXA 4JD2A 1YVNA 4BRHA 3BP8A 3IMXA 4DHYA 1XUPO 4JHDA 5AFUA 4PKHA 3FZFA 5EY4A 1ESVA 1QQOA 3RSEB 5BN8A 4BC2A 4BREA 4FWPA 4H5RA 1BOTO 2Q36A 3AY9A 2P9UB 3R6MA 4H5WA 4QS9A 3O8MA 4FWLA 3DXMB 3FR0A 3CETA 4AM7A 3FZMA 2EWSA 4FWNA 2QXLA 3H3NO 2YI1A 5AQIA 4BRAA 1NGFA 1JCGA 2NLXA 2FF6A 3VF6A 4FWSA 3C7NB 4H0OA 4CZEA 3MCPA 5AQGA 4H5TA 2VYPA 2ASOA 3EO3A 2CH5A 4FL9A 2H3GX 2FXUA 2YCHA 4FWKA 4K43A 4CZJA 2F9TA 5FPNA 4CZLA 5JLHA 3O08A 1Z05A 3ATVA 5EX5A 3W3DA 3VEOA 2V7YA 3B8AX 1MWMA 5AQRA 4IO8A 4PKIA 5AZIA 1KAXA 4DQ8A 3WQTA 5B8HA 1QHAA 3QB0A 4IXCA 2F9WA 3LDOA 5CE3A 1Z6RA 3AARA 1EQYA 4RTFD 4L3QA 5AQUA 5AQSA 3LM9A 3EKUA 1U2VA 4O8KA 4F9OA 2A42A 3ZX3A 4PKGA 1HKCA 3CERA 4BR2A 1KXPA 3A8YA 3S41A 1KAYA 1RFQA 3HBTA 4MO5A 5BPMA 2IVNA 4EFHA 3O1BA 1HLUA 2FF3B 2P9PA 4FPBA 3WEEB 4BR5A 5E84A 3LM2A 3H46O 1RGIA 2HF4A 1HPMA 3A5LC 3I33A 1TYQB 2GELA 2PAVA 2QM1A 4WQ4A 5LY3A 5AR0A 1Y64A 5AQOA 3H6EA 1NGIA 1GLBG 1HKBA 4K41A 4Z94A 3ZETB 4CBXA 3CI5A 2P9IB 2V51B 2J4RA 1K8KA 3M1FA 4A62A 1YUWA 3D2FB 2CGKA 5ELZA 1GLAG 3VGKA 5BN9A 1SAZA 3VGMA 3DXMA 2V7ZA 3ZEUA 2E2OA 1R59O 1MDUB 5F1XA 3VF2A 3VEVA 2W40A 5BRFA 1NGBA 2ASMA 3ID8A 4MLHA 1T6DA 4O5FA 2P9KB 3L4IA 5KQ8A 1BG3A 4MO4A 3P4IA 2D4WA 3I8BA 1MA9B 3L6QA 4IJAA 5FPEA 4CBUA 3SLCA 5AZJB 4B1ZA 3KZBA 1NGJA 5KQDA 4BR0A 3VPZA 2A40A 1BA0A 2WUSA 1HUXA 4DCHA 3IDHA 3O80A 4M7XA 5AQWA 4BC4A 3QFPA 1QQMA 4JAXA 4H03B 4BRFA 4B1XB 1ATSA 4PL7A 3ULEB 5EOYA 1XQSC 4GNIA 3EZWA 4AM6A 5BRDA 3AAPA 3VEWA 3FE1A 3HSCA 2FSJA 3CJBA 2HMPA 4KBOA 2P9LB 3R8EA 2E2QA 4XH5A 3KVGA 2KHOA 5LJVA 2QWPA 2A3ZA 2E8AA 3JS6A 3ENHA 4ISGA 4YDUA 4CD1A 3MN6A 3UKRB 4BG9A 4CZMA 4EHUA 1IG8A 3U8XA 5KPTA 2CGLA 4FWMA 3WEEA 1BA1A 4LC9B 3QBWA 2Q0UA 3VEYA 3L0QA 3O4WA 3SJHA 1NWKA 1TUYA 1TYQA 2A41A 2P9NB 4CZHA 3CQYA 2BUPA 4M63C 2GWKA 4FPAA 3CHWA 1TUUA 4CZGA 1SQKA 1MWKA 4BGBA 4A2AA 3SK3A 4QS7A 1IJJA 3C0BA 1P8ZA 3ZETA 2CH6A 2VCPA 1V4TA 2CGJA 4YDUC 4XH1A 2E1ZA 2QW9A 2A6AA 3CIPA 3SMSA 3D2FA 2E2NA 4B1VA 4IJNA 3O1WA 3CJ9A 1CZAN 5JICA 1DKGD 4BRDA 1E4GT 4DB3A 1ATRA 2NZTA 3FFKB 3HI0A 3MN7A 2ZGZA 4WYBA 5I9EB 4B1UB 3A5NC 3J8AA 3UKUB 5AQKA 1BWFO 2VWBA 2P9KA 3CJAA 3VGLA 4HTLA 5EVZA 4H0VB 4CZIA 3ZX0A 1Q18A 3BEXA 1NM1A 2BTFA 1QZ6A 4FWRA 1NBWA 4A61A 5AZJA 3VETA 4B1WB 1NGEA 2YJFA 3W0LA 3ATUA 4EIAA 3BUZB 2A5XA 2YJEA 5AQHA 3EL2A 5BPLA 2FSKA 1YAGA 3WXIA 1GLDG 3UB5A 4IZ9A 3ULEA 5AQPA 3MN5A 3F9MA 3U4LA 3VEZA 4BVPA 5FPMA 2QWQA 2E20A 3FZKA 3RSEA 4BG8A 3HZ6A 2YHWA 4XH4A 1NGCA 2E88A 2IIRA 5AQLA 1T44A 2P9LA 4A2BA 2P9UA 3HM8A 3QICA 4BQLA 3LDNA 2OANA 4XEIA 4BQZA 1NGAA 5FPDA 3UKRA 3DXKB 2D0OA 3DAWA 4I6MB 3QMLA 3WQUA 1BUPA 4M7YA 4PL8A 1JCEA 5F0XA 4BVOA 2HOEA 3WXJA 3IUCA 1DEJA 4H5NA 5AQMA 5BR9A 1X9JA 3C7NA 1H1VA 4BRIA 3WXKA 2DPNA 1T6CA 1S3XA 3MMVA 1ZBSA 3D2EB 1XC3A 4CBWA 1GLCG 3MDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3Q7CA 3WUHA 5EXWA 1YIJN 3VMFB 2GUIA 2ATQA 3CM6A 4JNEA 4LF9K 3ZX2A 4YNQA 4DV3K 1JLEA 3CQXA 1GLLO 2FBTA 1QVFM 3K0SA 2KFZA 4FLTA 4RW9A 3ZSVA 5FLXO 2ZE2A 3KK7A 4FW1A 3CF5L 4DR1K 1HYVA 3TU5A 5AQNA 1GLJO 3AVNA 2ZJQL 5M1PA 3SUQA 1SL2A 5LMUK 5FRMA 4CF8A 2UXDK 3UKUA 4JI2K 4KV8A 4OLBA 4DFPA 3CYGA 4BRMA 3PLAA 1K8KB 4JV5K 3CMAN 2OYQA 4IDKA 1RDWX 4EZ6A 2HF3A 4LF5K 5KGWA 3E9PA 3HVTA 3DOLA 4YOUA 5AQQA 1QZ5A 3ZT2A 3GOIA 2ITMA 3SBTA 2G8WA 5HRPA 2P9IA 1EP4A 3DWLA 2QWOA 5HP1A 2VGNA 2Z1HA 2B5JA 4C8LA 5DMRA 1VQMN 3SJJA 2D5RA 1TKTA 2FSNA 3HT3A 4JKFA 4DTPA 4DU3A 1A5WA 4FW2A 1D4XA 4WQ5A 4FJHA 3LDPA 3DLEA 1JLQA 2Q2RA 3T3FA 4BRKA 3CD6N 2GUPA 4Z4FA 1BCMA 3D2EA 3T19A 1JCFA 2HBMA 1VQNN 3JXUA 1S1XA 3SQ4A 4OGCA 2QI2A 1BI4B 4KB0A 1KQSM 1V4SA 4A59A 1NK8A 3V6DA 1VSJA 3GE1A 4CEEA 2VWJA 1OVQA 2RN2A 3HYFA 2IVOA 4NXMK 3H3OB 1TAQA 4BE2A 3TTFA 3VQ7A 3U9ZA 4FJGA 4FZZA 1B9DA 4W5QA 3HVRA 4HUEA 1VK0A 4FM2A 1JJ2M 3SAHA 3NH1A 1BQNA 3CCRN 1J9AA 2P5GA 4GY2B 3V1RA 3SYZA 4GVEA 3LDQA 3IAYA 4B3OA 4BR9A 4MQ3A 4CEBA 2X78A 3KHYA 1BDGA 2FBVA 4Y0WA 4BRNA 3V9ZA 4BROA 3M6GA 4JN4A 4FSVA 2D1KA 3GDQA 5C12A 4K8XA 4FYDA 5AQJA 4IBNA 1VSIA 2KFNA 3SV4A 3OS1A 2FBXA 1TL1A 1LWFA 4M41A 4ELVA 1EETA 4X64K 4HCBA 3VERA 1U45A 3FZHA 2ETJA 5TKWA 4OKKA 4JS5A 3E9LA 3OY9A 1VQON 2P9SA 1DTQA 3LP0A 4Z4EA 4CVNE 3P39A 2GWJA 4ISFA 2AA4A 4NCBA 3O9TA 2NNWA 3OYAA 3OYNA 1WAJA 4F2SA 2ZQBA 3VEXA 4K0KK 4F4KA 4BRHA 2QA4N 1O13A 3CCLN 2VG7A 1XUPO 2XY8A 3OYGA 4JHDA 4PKHA 1ESVA 5BN8A 1C1CA 1ZBLA 2Q36A 2HVHA 1T05A 2P9UB 3DRRA 4C8MA 3C94A 1D5AA 3KLFA 4PY5A 1RTJA 5HBMA 4X62K 4CK3A 2O8CB 4FWNA 4NCGA 3NF8A 3BZCA 1VSKA 1NGFA 1JL2A 3OYMA 4PQUA 4JI5K 5IT9O 4JKBA 4FVMA 5CY4A 4JKDA 2CH5A 3HPOA 2YCHA 4K43A 3NGZA 5FPNA 5JLHA 3TAGA 1HNZK 3O08A 2P1JA 5HRRA 2KTQA 1Z05A 3W3DA 2NRZA 2DFFA 4BWMA 2V7YA 5AQRA 1S72N 4PKIA 4FVUA 4CJKA 1VQLN 3VQ8A 3WQTA 4DFKA 2UXCK 3QB0A 4BE0A 4FJIA 3CCJN 3ASMA 3KTQA 5AQUA 3LM9A 1KD1O 3L8BA 4GV6A 2AJQA 3QEXA 3S5TA 3EE9A 4BR2A 3R1XA 3S41A 3V81A 4IOAL 1JXEA 2HHQA 2IVNA 4EFHA 3E9OA 1Z26A 2FF3B 4Q5VA 3DRPA 3DYAA 2HF4A 3NH0A 3G6EN 5FRNA 3I33A 4CEAA 2D0CA 2GELA 2PAVA 4CFDA 4B9NA 3CCEN 3QEPA 1VQPN 4HUGA 3H6EA 2NRWA 1D8YA 1NGIA 4K41A 1HKBA 4JK9A 5C2FA 1LWEA 1OH5A 4A57A 3NF9A 4X66K 3R3LA 1K8KA 3M1FA 1J5EK 1BGXT 2CGKA 3BGRA 1TKZA 4DTXA 3RR7A 3DXMA 3QERA 1TAUA 1IBKK 4CJ5A 1T8EA 1FJGK 1CXUA 3VQDA 3OYBA 4DTSA 4KPYA 2ASMA 4O5FA 4CF2A 3CCQN 3K59A 1QSSA 3P4IA 3CFRA 4OO1J 2WC9A 3AO2A 5FPEA 3SI6A 1FKPA 4LF8K 3S3MA 1NGJA 5KQDA 2WUSA 4M7XA 4YOVA 3LP1A 4AHTA 3LWLA 4FCYA 3NF6A 1C6VA 4PL7A 3ULEB 3VQ5A 4CJ4A 4GNIA 3EZWA 4E0DA 2NRRA 3RMCA 3FE1A 4B3SK 3HXMA 4PWDA 1IBLK 2P9LB 3KVGA 3LAMA 4CD1A 3MWTA 3TI0A 3MN6A 4LD0A 3UKRB 4BG9A 3AO4A 3HJFA 4DTUA 4LC9B 3QBWA 4ILHA 2Q0UA 5M1FA 3EE8A 3O4WA 3SJHA 1TYQA 4FJJA 2P9NB 1HNXK 4M63C 1L3VA 2GWKA 3VN5A 3CHWA 3V9UA 1U49A 4A2AA 5M1KA 3BDPA 4QS7A 3OJUA 1TK8A 1P8ZA 3SPZA 4M3RA 1BHLA 2G8VA 4IG0A 1NJIO 1V4TA 4YOXA 1IO2A 4IOXA 4B1VA 4B9VA 3QINA 4DTJA 5E41A 5JICA 5I42A 1E4GT 3OYHA 2NZTA 3CFPA 2ZGZA 2Q3SA 4WYBA 5I9EB 4IG3A 3UKUB 5AQKA 3K58A 2VWBA 2P9KA 4M3XA 2E5LK 4CZIA 3ZX0A 4WCEL 1QZ6A 3PX6A 3AVAA 3MWPA 4JI1K 3W0LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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