4CZLA

C. crescentus mreb, monomeric, adp
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
339
structure length
333
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNVGGRKVVHAVGIEAKQMLMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPADGEGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELADDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLESTLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
total genus 100
structure length 333
sequence length 339
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czlA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czlA03
4PKIA 5AFUA 3M6GA 1X3NA 5BREA 2QWRA 4H0VB 4MO5A 2A42A 3TU5A 2EWSA 1YXQA 1U2VA 3D2FA 1BUPA 4H0TB 2Q2RA 4XH5A 4YDUC 3VGKA 1S3XA 3GOIA 1T44A 1V4TA 2GWKA 4EHUA 2VYPA 3FZFA 4PL8A 1R59O 4BREA 4CZHA 1E4GT 5EOYA 3U9DA 1HKGA 4B1VA 4B1YB 1J6ZA 2CH6A 3CJCA 1XQSC 4B1UB 3P4IA 4EFHA 3ID8A 1Z05A 4F9OA 1K8KA 3CETA 3MDQA 3QDKA 3FZMA 4FWLA 2ASMA 3FLCO 3SLCA 2GUPA 3SJHA 1ZBSA 3R9PA 5BR9A 2P9UB 5AZIB 1BA1A 5BPNA 4A62A 4JD2A 4BR0A 4AM6A 4BRLA 3IMXA 4I6MB 4ISFA 3GE1A 4WQ5A 3WXKA 1QQMA 4PKGA 3QB0A 3JXUA 4QS9A 2H3GX 3VOVA 4H5NA 4BVOA 4CBXA 5AR0A 3TPQA 1P8ZA 3L6QA 2D0PA 2IVPA 2Q0RA 4JHDA 4YDUA 1ZXOA 3SMSA 2YHWA 4BG9A 3EN9A 3QFUA 4NO7A 3C7NB 2E2PA 4CD3A 3H1QA 1YAGA 1NGIA 1V4SA 3MN6A 4AM7A 1XUPO 4MLEA 3OHRA 2F9TA 3EZWA 3D2EB 2WUSA 3I8BA 3M1FA 2D0OA 4H5RA 4BRDA 1QZ5A 2Q36A 1DKGD 3WT0A 1MA9B 3H46O 1JCFA 3FR0A 3VENA 2UYTA 3HSCA 3KVGA 1T6CA 4DHYA 5F0XA 1SQKA 3LDPA 2P9SB 2I7NA 3MN5A 5AQPA 3CQYA 2NZTA 3MMVA 3WXJA 1SAZA 1C0FA 2DPNA 1NWKA 4CJ7A 1GLAG 3VF2A 3ZX3A 1GLEG 4BRGA 5AZJA 1DEJA 4JNEA 3L4IA 4MLHA 3C0BA 4M7YA 3VF6A 3BF3A 3EO3A 2YJFA 5FPMA 4RWTA 1RGIA 4K43A 1KAXA 2E1YA 5ELZA 3VEZA 3ZETB 4O5FA 5JLHA 1QHAA 2J4RA 5AQYA 4QS7A 3UKRB 3S41A 5F2RA 4BC5A 1C0GA 1TUUA 3VESA 3WQTA 1BG3A 3FZKA 2QM1A 1WOQA 2BUPA 4A2BA 3ULEB 3WUHA 5JMVA 1NLVA 1NM1A 2HF4A 1GLDG 4WQ5C 4PL7A 2Q97A 3A5LC 2I7PA 1TYQB 4RCHA 1NBWA 3LL3A 2Q31A 3D7EO 2A40A 1RDWX 2FSJA 3A5MC 3HM8A 4FL9A 4CZKA 4IJAA 2W41A 5JLFA 3VEYA 4B9QA 2VWBA 1NGCA 3AAPA 5LJVA 4BG8A 3QFPA 2PBDA 4CBWA 3LDNA 4DQ8A 5CE3A 5AQJA 2D1KA 2P9IB 2A6AA 5KQ8A 2P9UA 1OKJA 4H5WA 4EAHD 3DXKB 5BRHA 3CERA 3FZHA 1JCEA 3MN7A 2FSKA 2YHXA 2QWLA 3DXMA 4H03B 1GLFO 1BDGA 4H0YB 2ZWHA 4BR2A 3VETA 4K41A 4BRPA 3O4WA 2Q1NA 3W0LA 3CJAA 1MWMA 2P9NA 2P9LA 2W40A 4C23A 4JN4A 5EVZA 3LDOA 3AARA 1BU6O 4BRMA 3H6EA 2AP1A 5AQNA 1U6ZA 4BRKA 4RTFD 3WEEA 5EY4A 2E8AA 4XH4A 5LY3A 4BROA 5AQWA 3FFKB 3AAQA 2ITMA 4A61A 3FE1A 3ATUA 4CZEA 5KPTA 1BOTO 3QBXA 4BRFA 4BQZA 2P9KA 3U8XA 1ATNA 3UKUA 2FSNA 3B8AX 3BEXA 2P9PB 5AQLA 3FZLA 3A5NC 5JICA 3GDQA 2CGJA 2GTDA 4PKHA 1NGAA 3EL2A 1G99A 2ZF5O 3CI5A 1U2VB 3D2FB 5AQQA 1HJOA 1NGBA 3BP8A 4J8FA 1LCUA 2FF6A 5BRFA 4FWRA 2E2NA 4WQ4A 3WQUA 3U9ZA 1WUAA 5TKYA 1BA0A 5AQRA 4A2AA 1HX1A 4H5VA 4BR9A 4BRNA 3IUCA 3O08A 3R8EA 1K8KB 3KHYA 4FO0A 4BRIA 2E1ZA 2CGLA 2KHOA 4BRHA 1GLCG 5E84A 3HTVA 5KQDA 1XC3A 2FLOA 5ADXH 4H0OA 1NGGA 3CQXA 2FXUA 4JD2B 4CZLA 3EKUA 3RSEA 4GY2B 2IIRA 5BN8A 3QMLA 5FPNA 1Y64A 4M7XA 5AQHA 3L0QA 3QICA 2NRHA 3GBTA 2QW9A 3KZBA 1DGKN 2BTFA 1E4FT 1X3MA 3ZX2A 2HOEA 5F1XA 4DB3A 2QXLA 4FPBA 4ISEA 3VEWA 4H5TA 3VGLA 3EKSA 3QBWA 4JHDB 2QWMA 4FPAA 3DJCA 3U4LA 1S22A 5BRDA 4L3QA 1GLJO 4GNIA 5AQKA 2E2QA 3VF4A 1NGDA 1LOTB 1MDUB 1H1VA 4CZJA 2GEMA 2NLXA 1D4XA 4FWSA 3F9MA 3ATVA 2IVNA 2A3ZA 3O1WA 3MCPA 3HZ6A 3O5BA 5I9EB 4BC4A 4QS8A 4BR5A 4HTLA 1GLBG 1Q18A 3HBTA 3MN9A 3M3ZA 2YHYA 1HKCA 5BPMA 5AFUH 4NB4A 2AA4A 5AZIA 3JS6A 4WQ4C 3SMPA 3W3DA 3O8MA 5FPDA 4K25A 1QQOA 3A0IX 4IO8A 4K42A 3VERA 3GG4A 2P9PA 4I6MA 4H0XB 3WXIA 4WYBA 4CI6A 4O8KA 5AZJB 5FPEA 3LM9A 4FWMA 3IDHA 5AQSA 4CZGA 4FWPA 2OANA 4MO4A 2ASOA 2HF3A 3J8AA 3WXLA 3I33A 3ZEUB 2V7ZA 2IVOA 4E1JA 3VPZA 3ENHA 3H1VX 3CJ1A 2FF3B 3O1BA 4FOIA 5BPLA 5AQFA 1MWKA 2ZGYA 4M63C 3C7NA 1JCGA 4LC9B 4B1ZA 1YVNA 1CZAN 3R6MA 4BGBA 3CHWA 1ZC6A 4XH1A 3G25A 1ESVA 1IJJA 3D2EA 3VGMA 3GL1A 2CGKA 1NMDA 4CZFA 5AQOA 5AQZA 2QWNA 3A8YA 3A5OC 3DWLA 5KPRA 3VEXA 3FGUA 3UE5A 4H0PA 2E88A 1RFQA 3DXMB 4IJNA 4BR4A 1ATSA 2YCHA 5EXWA 2P9SA 2P9NB 4EIAA 1KAYA 3ENOA 3MK6A 5AQVA 2P9LB 2YI1A 4EHTA 4FOEA 4BRAA 2HMPA 4IXCA 2E2OA 1IG8A 1HUXA 2PAVA 1NGJA 2GWJA 3WEEB 1KAZA 3H3OB 3ZX0A 5AQTA 3O80A 5AQGA 3H45C 2QWQA 4IWVA 5AQMA 1NGFA 4BR7A 3LDLA 3ZETA 2ZGZA 2P9KB 3UKRA 5AQUA 2A41A 3UKUB 2A5XA 2V52B 4IZ9A 1YUWA 4BC3A 2CH5A 3ULEA 4Z94A 3VEVA 5EX5A 4BVPA 1X9JA 3LDQA 2D4WA 3UB5A 5ADXA 3BF1A 1GLLO 4ISGA 2F9WA 4BGAA 1TYQA 5KPZA 4BC2A 3H3NO 2V7YA 1BO5O 1BWFO 4JAXA 3CJ7A 3CJBA 4BRQA 4CZIA 4KBOA 5AQIA 4BQLA 1HLUA 3CJ9A 2P9IA 4FWQA 4B1WB 2QWPA 3DAWA 4XEIA 1NGHA 1EQYA 3DXKA 4FSVA 4BRCA 3IFRA 5AQXA 5LJWA 5BN9A 1TUYA 1HKBA 3AY9A 4DCHA 1QQNA 2V51B 3LM2A 2ASPA 1T6DA 2Q0UA 1Z6RA 4FWOA 4Y0WA 3VEOA 3BUZB 1KXPA 1HPMA 2YJEA 3O6WA 5E26A 2E20A 4CBUA 3ZEUA 4FWKA 4FWNA 3HI0A 3RSEB 3CIPA 4CD1A 4CZMA 1ATRA 1NGEA 1QZ6A 2VCPA 4HWIA 3SK3A 1SZ2A 2QWOA 5B8HA 4B1XB 2GELA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RT4A 3EZ5A 4OJRA 4DSEA 4MO5A 1B92A 1KQSM 4F3OA 4FK2A 3TU5A 3D2FA 3HVRA 1P90A 1BUPA 4H0TB 3VGKA 4CJ4A 3GOIA 4R5PA 5C25A 3BZCA 4MDBA 4BREA 1E4GT 3U9DA 4CJFA 2A1SA 4B1VA 2Z1GA 4DR2K 4B1YB 3N4PA 1J6ZA 1QVGM 3AA3A 4B9MA 3AO4A 4N56A 3G0ZA 2XY7A 1K8KA 2YKMA 3S3NA 3MDQA 1KFSA 5M1NA 4PA1A 3FLCO 2HHSA 1XMOK 1JLBA 2GUPA 5M1PA 4CCHA 3THXB 5BR9A 3KLHA 2F4VK 4CHZA 1RT1A 4JD2A 4BR0A 3EEQA 3OS1A 1ILYA 2R7YA 4BRLA 4OX9K 2G8IA 5M1FA 3JYTA 2G8HA 1TAQA 3VOVA 1WSJA 4BVOA 3NE6A 3AA5X 3TPQA 3OS0A 1P8ZA 2GV9A 2PZSA 1YTUA 4JRPA 4YDUA 4BG9A 1ZXOA 2KQ2A 4M3WA 3CM5A 1EWRA 3NH0A 3EN9A 4NO7A 2IDOA 4CEEA 5LMNK 4FJLA 4CIGA 4BWMA 4DG1A 1QS4A 4JKFA 3I0SA 2FBVA 3S9HA 1NK8A 3CCLN 4KTQA 3HYFA 3D2EB 4JKBA 1R0AA 3M1FA 1NK9A 4G1QA 4JK9A 3WT0A 4JI2K 3FR0A 4BE7B 3HSCA 3CXCM 4KO0A 3KVGA 3K5LA 4CJ3A 3P5JA 5JVGL 1GOCA 4CJSA 2YNHA 2NZTA 3MX5A 2DPNA 1NWKA 3VF2A 1GLEG 2IS3A 3AVHA 1A5XA 3L4IA 4J2AA 3O9RA 4RW6A 3VF6A 2YJFA 3M8PA 5FPMA 1VQLN 1N36K 3DLBA 3ZETB 2XHBA 1U04A 3CPEA 3UKRB 3S41A 2ATQA 3ZLJA 1KD1O 4YOYA 4B3RK 3U3GA 1NM1A 2DFEA 3HT3A 4GV9A 2QK9A 2KZMA 2A40A 2O4IA 4K8ZA 3WNHA 5DM6L 4CZKA 1D8YA 4IJAA 1KVCA 3VEYA 3AAPA 5CE3A 3T1AA 3THXA 4CK2A 3HSTB 1OKJA 1W97L 4H5WA 4KHNA 4ZHRA 3CERA 3FZHA 1JCEA 3VQ8A 3DI6A 4FZYA 2OPPA 3DXMA 1GLFO 1BDGA 4RW7A 3NAEA 1SL0A 4WFNL 4IFEA 3D0PA 3QERA 2P1JA 4JN4A 3SAGA 3AARA 3OYEA 1Q9XA 4JI5K 4Y1CA 4FJKA 1TL1A 3PLAA 1QTMA 4CF0A 4BY9C 4KAZA 2ITMA 4OO1J 2O8EB 1YIJN 3LAMA 4KH6A 3C6AA 3DLLL 4HCBA 3I0RA 4C1NI 2F96A 5CY4A 3NVKA 3U8XA 3UKUA 1TKXA 3CMEN 5AQLA 3GDQA 2RF2A 2CGJA 5C12A 2O8DA 4IDKA 4V19S 4YORA 3THYA 3CCRN 1VSEA 1U2VB 3AV9A 4OPKA 4DV7K 2QA4N 4AHVA 3BP8A 4DV5K 4IOCL 3M8RA 3SYZA 1IG9A 3AGKA 3U9ZA 5TKYA 1BA0A 4A2AA 1HX1A 2XY6A 4BR9A 4BRNA 3IUCA 2NRWA 1Q8IA 3HTVA 2EX3A 1T03A 1XC3A 4LH5A 3LP3A 1N33K 4H0OA 1NGGA 4DU3A 3KJVA 4AILC 2GBZA 5BN8A 3V81A 2NRVA 4C8MA 4EP4A 1FKPA 2HMIA 3J81O 4N41A 2UUCK 3GBTA 3KZBA 3CCUN 4QOZB 2BTFA 1E4FT 1GOAA 4BE0A 2OPRA 4KHUA 3C95A 4JKHA 4DB3A 3OYNA 1TAUA 1NK0A 2PY5A 3VGLA 4JHDB 3PX6A 3U4LA 4QCLA 1S22A 4AHSA 2WBNA 3VF4A 3PSIA 1VSLA 2GEMA 2HHXA 2JLEA 4A57A 1K9MO 1WAFA 4FJ8A 4NLCA 3HZ6A 2YNGA 5I9EB 2KZZA 4MQ3A 1NNEA 3VQ7A 4BR5A 4DTUA 1RT6A 4KKOA 4DV4K 4F8RA 4K8XA 3HBTA 2HVIA 3MN9A 3HM9A 3EE9A 1SS6A 3PO4A 1HQUA 4MFBA 3Q7CA 5AZIA 4WQ4C 2O8EA 3W3DA 3M8QA 3O8MA 3T1HK 3LALA 1IKWA 4K42A 3VERA 4DQQA 5I42A 1OH6A 1IKYA 1HYVA 3OBYA 3WXIA 4CI6A 3CCSN 3E9LA 5AZJB 4M3ZA 3IDHA 4CZGA 2OZSA 3KLIA 4MO4A 1BI4B 2ASOA 4CK3A 2HF3A 3WXLA 3V4IA 2IVOA 3SV4A 4CHOA 4E1JA 3CCQN 1BQMA 3QINA 3NMUA 3ENHA 3H1VX 5J2PA 3O1BA 3NBPA 5BPLA 3L2VA 4DF8A 3RWUA 4IOAL 2YHBA 3MAQA 2ZGYA 4M63C 4LC9B 1ITGA 3R6MA 4BGBA 3CHWA 1WSFA 3ALYA 4GW6A 4XH1A 4E7IA 1ESVA 2CGKA 1NMDA 4CZFA 4DTXA 3EY1A 3OW2M 4Z4GA 3VEXA 3FGUA 3UE5A 3TAFA 2E88A 1Q7YO 3AO2A 3ZT0A 3QLHA 2PYLA 1BCOA 3SQ2A 5HRPA 3VA0A 3TANA 1WBBA 5MLCQ 2OCEA 4EHTA 4FW2A 4FOEA 4BRAA 3TWHA 3A2FA 5DK5A 3O4QA 2ZM6K 4CEOA 4Z4CA 4DSLA 5AQTA 1BGXT 3O80A 1RBRA 4CVNE 5T7BA 3P39A 4FVUA 1S1VA 1NGFA 3LDLA 4Z4IA 2ZGZA 5AQUA 2A41A 3OY9A 1T05A 1CXUA 3THWB 4BC3A 2RKIA 3VTIA 1NKEA 2YV0X 3OYFA 3BF1A 1M90O 5DM7L 1TYQA 3NF7A 3H3NO 1VQNN 3OVNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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