4CZMA

C. crescentus mreb, monomeric, amppnp
Total Genus 98

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
336
structure length
336
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNVGGRKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPADGEGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELADDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLES

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTI1 (18-21)AH10 (322-333)S1 (13-17)AH2 (82-96)S5 (47-53)TII1 (26-29)S3 (30-36)TIV3 (43-46)AH1 (54-60)TIV5 (65-68)TVIII1 (72-75)S6 (68-71)S9 (106-111)S7 (74-75)S8 (78-79)S11 (158-163)TIV7 (102-105)S12 (168-174)AH4 (140-148)TI4 (164-167)TI'3 (174-177)S13 (177-184)AH5 (188-203)TIV10 (227-230)AH6 (209-219)TVIII4 (221-224)TIV12 (240-243)S15 (232-239)S16 (245-251)S17 (290-293)3H1 (295-298)AH9 (302-310)TII3 (299-302)S18 (314-316)TI5 (319-322)TIV13 (317-320)AH11 (335-343)S2 (21-26)TII2 (60-63)TIV6 (74-77)TVIII2 (79-82)AH3 (117-129)TIV8 (112-115)S10 (134-139)TI3 (151-154)O3 (184-186)S14 (205-206)TIV11 (239-242)TIV9 (225-228)AH7 (252-276)AH8 (279-288)TI2 (98-101)S4 (39-44)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 98
structure length 336
sequence length 336
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czmA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czmA03
2QXLA 3WT0A 2F9TA 2GUPA 2V7ZA 3FE1A 5AQUA 4BRLA 3KHYA 5BRFA 1MDUB 1NWKA 2FLOA 3FZLA 4BR9A 3H1VX 2YI1A 3IUCA 4IJNA 5AZIB 1OKJA 4CBXA 1HX1A 3MN7A 5AQSA 2E8AA 1DEJA 4JD2A 3AAPA 5JICA 2V51B 3U9DA 4Y0WA 2A3ZA 3FLCO 4FWPA 2YHYA 3WEEA 2QWLA 3MMVA 4K41A 3KZBA 3QFPA 4GNIA 5LJWA 4L3QA 4M7XA 5AQQA 3CQYA 2FF3B 3DXMA 3O4WA 2CH6A 1MWKA 3VGMA 3A0IX 3D2EB 4H5TA 4B1WB 5BRHA 2CGKA 3CJAA 3UKUB 2HMPA 5BPLA 3CQXA 3A5MC 1NGAA 1BG3A 1HKGA 5AQPA 1NBWA 3H3OB 5ELZA 3O1BA 4FWSA 2Q0RA 5CE3A 2ASMA 4BRQA 1JCEA 4ISGA 3ZX2A 3SMSA 4BQLA 1Q18A 3WQUA 1JCGA 3C7NB 4I6MA 2P9PB 1HJOA 4FWOA 3CERA 3LL3A 3DXKB 2P9SA 5BRDA 3HBTA 2IVNA 2Q1NA 3ZEUB 5ADXA 2V7YA 4RTFD 4BG9A 4FL9A 2QW9A 3R9PA 1QQNA 1NGIA 4AM7A 3EN9A 3IMXA 4BQZA 5F0XA 4H5WA 3FZMA 3L4IA 3O1WA 3RSEB 2AA4A 3JS6A 5E84A 3W3DA 4MLHA 2W41A 4BR5A 5AQTA 1YUWA 5AQWA 3ULEB 2P9UB 3H46O 4CZMA 3EO3A 4H5NA 5LY3A 1BU6O 3HSCA 2GELA 1EQYA 4CZGA 1YVNA 1NGGA 4BGAA 4QS8A 1U6ZA 3B8AX 1GLEG 2E1ZA 3HTVA 3O5BA 4CZLA 5AZJB 2D4WA 4H0PA 1MA9B 3CIPA 4H0TB 4BRHA 4WQ4A 1QQMA 2FF6A 4DB3A 4C23A 1BUPA 4J8FA 4BR7A 2CGJA 5F2RA 2QM1A 3ZETA 2FSNA 5KPZA 2QWOA 5FPDA 4BRCA 4B1VA 2IIRA 4IXCA 2E2QA 3LDPA 4QS9A 5EX5A 3HM8A 4NB4A 5FPNA 3MCPA 4A2BA 4BRAA 3BP8A 3GOIA 3VGLA 5AQJA 1HKCA 4QS7A 5AQHA 4WQ5A 3VF2A 1NGCA 1TYQA 2W40A 4JHDA 1CZAN 1LCUA 3WXKA 5F1XA 4CI6A 4FWRA 1ZC6A 2UYTA 3CHWA 2VWBA 1XUPO 2DPNA 3EKUA 4CD3A 5I9EB 3A5NC 4CZEA 3CJ7A 4M7YA 3SK3A 2E88A 2A5XA 5KPTA 4IWVA 1WUAA 2P9IA 5AZIA 4B1ZA 4FPAA 3QB0A 2QWPA 3UKRA 2NZTA 2EWSA 3MDQA 4CJ7A 4PKIA 1NGBA 3BF1A 2ASOA 1GLLO 3LDOA 3U4LA 4RWTA 4BRPA 5AR0A 1HUXA 5AQVA 4FPBA 2AP1A 1HKBA 4EFHA 2A42A 5JLHA 1P8ZA 1SZ2A 4M63C 3MN6A 2GTDA 1BWFO 2OANA 4JNEA 4CBWA 3D2FB 5AQNA 4F9OA 4FO0A 2P9LA 3CJ9A 4H5VA 2FXUA 1TUYA 1BA1A 1WOQA 3H45C 2E1YA 1NMDA 2FSJA 3WUHA 5AQMA 2P9KA 4PKHA 1YAGA 3OHRA 3F9MA 3AARA 4O5FA 1R59O 1G99A 3UB5A 5AQGA 3O80A 3FFKB 3C7NA 3FR0A 4PL8A 3BF3A 4A62A 3QDKA 4DQ8A 3DXKA 3L0QA 2I7PA 3VEWA 3SLCA 5LJVA 5BPNA 2ZGYA 3ZEUA 4KBOA 3QBWA 1RFQA 1T6CA 4BRNA 2Q2RA 4H0OA 4A2AA 3ENHA 3TPQA 1ZBSA 3M3ZA 2Q36A 4FWMA 2PBDA 4BROA 5AQYA 5KQ8A 1BOTO 2YJEA 3KVGA 4CZFA 3ID8A 3VGKA 5KPRA 1IJJA 2PAVA 3VOVA 3H3NO 4I6MB 4BC3A 4B1XB 2KHOA 4YDUC 2P9SB 4BVOA 3MN9A 2Q0UA 3ULEA 2P9UA 4XH4A 3P4IA 1E4GT 4H0VB 4IZ9A 3IDHA 3IFRA 3FZHA 4MO5A 3LM2A 4HTLA 2P9NB 1HPMA 4BR4A 1GLBG 1K8KA 5EOYA 3U8XA 4FSVA 4MLEA 2E2NA 4EHTA 3A5LC 4H03B 2HF3A 1NGDA 2Q31A 3BUZB 1D4XA 3O8MA 5AQKA 4BRKA 4BVPA 2A40A 5AFUA 2H3GX 2QWMA 3CJBA 3AAQA 1NGFA 3O6WA 4NO7A 2YHXA 1Z6RA 2IVPA 4BREA 3S41A 3JXUA 4LC9B 1KAXA 5JLFA 2F9WA 1X3MA 4IJAA 4B1UB 1IG8A 1XC3A 4CZIA 1U2VA 2VYPA 3ZETB 1BO5O 3VEZA 3MK6A 1NM1A 3A8YA 2D0OA 3EZWA 3VERA 5BR9A 3ZX0A 3HI0A 1QZ5A 4BR0A 3AY9A 1BDGA 1KXPA 2V52B 1BA0A 3H6EA 4B9QA 3TU5A 2A6AA 3GG4A 2ASPA 4Z94A 1KAYA 3U9ZA 2YCHA 1TYQB 3LDQA 2BUPA 4K42A 5AQXA 3WXLA 1T6DA 2D0PA 4IO8A 1ZXOA 2CGLA 4CBUA 4K43A 2GWKA 3VF4A 3I33A 4BC4A 3CJCA 5KQDA 3WQTA 1TUUA 3HZ6A 2HOEA 3CI5A 3MN5A 2I7NA 2YJFA 3D2EA 2P9IB 3D2FA 4CD1A 4DHYA 3UKUA 2E2PA 3W0LA 1S3XA 3GDQA 3UKRB 5E26A 1SQKA 3QBXA 4JD2B 1GLDG 3SJHA 1NGJA 4XH1A 4AM6A 3ATVA 1Y64A 5BN9A 3J8AA 3WEEB 5BREA 1DKGD 1GLCG 1HLUA 1X3NA 1YXQA 4O8KA 4A61A 4B1YB 3VEYA 4E1JA 3SMPA 1V4TA 2QWRA 3D7EO 5EVZA 3DXMB 4FOIA 2P9PA 2E20A 3GBTA 1RGIA 4K25A 3DAWA 2P9LB 5TKYA 1NGEA 1QZ6A 3ZX3A 1LOTB 1GLFO 1QQOA 2QWNA 5AQIA 2J4RA 2BTFA 1XQSC 3FZFA 2NLXA 1RDWX 2P9KB 5JMVA 5AQOA 3ATUA 3BEXA 5AQZA 2GEMA 4RCHA 1X9JA 3RSEA 4ISFA 3A5OC 5FPMA 2CH5A 2IVOA 2ITMA 3VEOA 1Z05A 5EY4A 4FOEA 3VETA 5FPEA 3LDNA 3DJCA 3G25A 1DGKN 3WXIA 4PKGA 5BPMA 4JN4A 3VENA 2WUSA 4FWLA 3VEVA 5AQFA 5EXWA 1KAZA 3C0BA 2FSKA 5AQRA 3VF6A 4H0YB 4WQ4C 2P9NA 4EHUA 3CETA 3R8EA 5ADXH 4CZKA 3FZKA 1SAZA 2E2OA 2QWQA 2YHWA 3VPZA 4BR2A 4EAHD 4BG8A 5AZJA 3FGUA 1GLAG 4BGBA 2A41A 4BC2A 3ENOA 3R6MA 5B8HA 4JAXA 2VCPA 1ATSA 3GE1A 2GWJA 2ZF5O 3DWLA 3O08A 4BRDA 1ESVA 4GY2B 3L6QA 1H1VA 4MO4A 4BC5A 4BRGA 4YDUA 1ATNA 1GLJO 3I8BA 3H1QA 3EKSA 4WQ5C 4XH5A 3QFUA 4PL7A 1K8KB 2HF4A 1C0FA 4WYBA 4DCHA 3UE5A 4CZJA 1NGHA 3EL2A 4ISEA 1MWMA 2Q97A 4H0XB 3M6GA 1QHAA 5BN8A 4BRFA 1S22A 1ATRA 5AQLA 4EIAA 1JCFA 3LM9A 3QICA 3CJ1A 4FWKA 1V4SA 1C0GA 5AFUH 3QMLA 3VESA 2ZWHA 4CZHA 4FWQA 3M1FA 1T44A 2ZGZA 4FWNA 1U2VB 2D1KA 2NRHA 4JHDB 4BRMA 3GL1A 1E4FT 3LDLA 1NLVA 4H5RA 4HWIA 3WXJA 4BRIA 1J6ZA 3VEXA 4XEIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OW2M 5HRNA 2GUPA 3OS1A 2D0AA 4DTJA 3FE1A 1S9EA 4B9MA 4BRLA 4G1QA 1C0MA 5BRFA 5HL7L 3DLBA 2E4LA 4H4MA 4FJLA 4M3UA 2P51A 3DLKA 4Y0WA 3FLCO 4FWPA 4C8MA 2YHYA 4CFDA 4B9LA 3RMBA 4JRPA 4L3QA 3SZ2A 3G4SN 1ITGA 3T7ZA 2EHGA 1FW6A 4F3OA 1N5YA 4JS5A 2RKIA 4LFAK 2O4GA 4DR4K 3D45A 4BE0A 3D2EB 4DF4A 3KK7A 4Z4EA 3A5MC 3A2FA 1YTAA 1NGAA 1YT3A 1BG3A 2OZSA 4DF8A 1NBWA 2JGUA 1U4BA 2ASMA 4BRQA 1TK8A 4F8RA 3PY8A 3VQ7A 3I55N 4FM0A 3SI6A 3OVNA 4IFVA 3WQUA 4I6MA 3NFAA 3CERA 4JI3K 4X62K 2P9SA 4M45A 4GV6A 1EP4A 5D3GA 3OYKA 2BDPA 3R9PA 3CCSN 4M3ZA 1WAJA 3DLHA 1NJZA 1SV5A 1T03A 3TABA 3O1WA 4NLBA 3RSEB 4DMNA 1RT1A 2OA8A 5E84A 4MLHA 3CC7N 1CZBA 2W41A 4BR5A 4M3TA 4DR6K 4B08A 3ULEB 4CZMA 3EO3A 3EE9A 2GELA 4CERA 1EQYA 1JLQA 1WSJA 1NGGA 4BGAA 5HRPA 1NK4A 2O8EA 4H4OA 2E1ZA 4HCCA 4GVMA 1DT9A 2YNGA 4X64K 4H0PA 3S9HA 3CIPA 2VG7A 3R3LA 4BRHA 3T69A 4DQQA 1LW0A 5DM7L 4XJXA 4DB3A 1BUPA 5F2RA 1ZBIA 1LWEA 3C94A 4OLBA 4F3TA 5FPDA 1U47A 4IXCA 1E3MA 3ZT0A 3BZKA 4JI5K 4FXDA 1TV6A 4ICLA 3PSFA 4BWMA 4BRAA 3V9SA 4MFBA 2G8KA 1TYQA 3RRHA 3WXKA 5F1XA 3THYA 4KREA 4KRFA 4X65K 4JYAK 1ZC6A 3WXMB 2DFFA 5HP1A 4H8KA 4Y1CA 2DFEA 4JS4A 1RTIA 2DPNA 4CD3A 4JV5K 1TAUA 3CJ7A 1EWRA 1A5XA 3OA9A 2QA4N 5GAGP 3NBPA 3RVCA 4JKBA 1WUAA 1SL2A 2FBVA 3SPZA 2P9IA 4CIGA 1T8EA 3PIOL 4FJ5A 4LF4K 4C1NI 4C8OA 2HVIA 4Z4CA 4LD0A 3CCUN 3BF1A 4CK3A 1VQNN 2OCEA 1L3VA 3ZT4A 3CFPA 1XNRK 3NH2A 4PQUA 1HKBA 4NXMK 5M1KA 1OVQA 3EZ5A 1IKXA 3CCVN 1WSEA 2D0BA 2OANA 4N56A 4F9OA 4FO0A 1P90A 3THXA 4H5VA 2FXUA 2P5OA 4KHPK 3H45C 1YJNN 1NMDA 2FSJA 5AQMA 4DR2K 4PKHA 1YAGA 3OHRA 3AARA 4O5FA 5AQGA 4KTZA 4LF9K 3L3VA 4A62A 3O9RA 3IS9A 3SLCA 2VWKA 2VQFK 5J1EA 1B9DA 4KB0A 3KD5E 3M3ZA 1KVAA 2Q36A 4FWMA 2PBDA 5SWMA 3KVGA 3AVFA 3V9UA 3QEVA 4IOXA 1U48A 1GOCA 2YHBA 4BVOA 2Q0UA 2JLEA 1LAVA 4XH4A 3P4IA 4AILC 1S5JA 4GW6A 4KH6A 4NCGA 1Q86O 2NRTA 4MO5A 3LM2A 1GLBG 5EOYA 3U8XA 1EX4A 5CZ1A 4FSVA 3J80O 4HUEA 4QCLA 4MLEA 4KH5A 3O3HA 4M3YA 2HF3A 3CMAN 1HR0K 3DM2A 2WTUA 4IKFA 3HOSA 3SQ1A 3F9KA 1J5OA 3CJBA 3AVIA 2Q3SA 2YHXA 4YOYA 3S41A 1KLNA 4LC9B 1QHTA 4IJAA 1W0HA 3DRSA 1T7PA 1KFSA 5GINA 3ZETB 3KK3A 3MAQA 1BO5O 3MX5A 2E6LA 1NM1A 4DTXA 1TK0A 3ID6A 4CK1A 5BR9A 2HBJA 4BR0A 3AY9A 1IKYA 1QVGM 3P38A 3TU5A 2G8IA 3GG4A 1NK6A 2IC3A 4ELUA 3U9ZA 3V1OA 1TL1A 4OKKA 2BUPA 3ZT3A 4B3RK 5AQXA 3HJFA 2D0PA 4IBNA 2W00A 2C1GA 3SUNA 2GWKA 3Q7CA 3DLLL 3I33A 4ZTJA 2HHVA 1C0UA 3BZCA 4JKCA 4DHYA 2E2PA 4A59A 1GLDG 4M3RA 3WEEB 1DKGD 5TKWA 1GLCG 3M8PA 2KLAA 1IKWA 2OTLN 4FJJA 1LV5A 3ZT2A 3DXMB 4CFBA 1RGIA 4K25A 2UXBK 3ZSXA 4DSFA 3DAWA 4V19S 2P9LB 2G8HA 4E7KA 1LOTB 1QQOA 5AQIA 2BTFA 1KLMA 4J2BA 1XQSC 4E19A 2NLXA 1JL2A 1RT4A 5JMVA 2KW4A 1ASUA 1BIZA 3ATUA 4MDAA 3BEXA 4YNQA 4K8ZA 3CCQN 4FJGA 1FJGK 3SNNA 1X9JA 1NMNA 1VSJA 4DSEA 3VN5A 4M3WA 4ELTA 2ITMA 1VSDA 3VETA 3PX0A 3WXIA 3E66A 4E3SA 3VEVA 3NE6A 4GMJB 5EXWA 1KAZA 4IDHA 2FSKA 3OYEA 1UOCA 1VAZA 2NNWA 3CETA 1XMQK 3L2WA 4C8LA 1VQMN 3FZKA 1SAZA 4BR2A 4EAHD 5AZJA 3K2PA 1C0TA 4B3MK 3FGUA 4BGBA 2HHQA 4BC2A 3ENOA 2HSTA 4KHWA 1JXEA 1D5AA 1ATSA 2GWJA 4L8RB 4UQGA 2X74A 4CVNE 4YDUA 3I8DA 5IT9O 3I8BA 3EKSA 4CF1A 4XH5A 3QFUA 1K8KB 2HF4A 3KIOA 2B5JA 4M3XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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