4H0TB

Crystal structure of ia-adpr-actin complex
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 125
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0tB03
2OANA 3MK6A 1SAZA 1YAGA 2D0PA 2P9KB 2H3GX 4H5RA 3RSEA 2P9IB 4MO4A 5B8HA 1R59O 1WUAA 2IVNA 4EAHD 4DQ8A 3LM2A 3WT0A 2FLOA 2IVOA 3CJAA 5AZIA 2YHYA 4EHTA 3BEXA 4EHUA 3CIPA 1C0FA 5LJVA 3QBXA 1DEJA 1JCFA 1NGAA 5AQGA 3UE5A 2I7PA 1GLDG 1GLBG 4BRPA 3EN9A 4CZMA 3A5OC 3AAQA 3FZHA 5BPLA 4B1YB 5BN8A 2FSKA 1GLJO 5TKYA 4ISGA 3W3DA 2YJFA 2GEMA 3VEZA 5AQWA 5F0XA 4BG9A 5I9EB 3CHWA 1QZ5A 1NM1A 3VGMA 3LDNA 5FPNA 4C23A 1BU6O 3JXUA 2E1ZA 2V7ZA 4WQ5C 2NZTA 2QWPA 1HX1A 3WXKA 3GDQA 3WEEA 1U2VB 3MN6A 3U4LA 2PAVA 1NGGA 4H03B 3DXMA 1J6ZA 1BDGA 2ZGZA 4FOIA 1QHAA 2E2QA 4BR5A 2E8AA 4FL9A 3W0LA 4BVOA 5AQJA 2YI1A 3UB5A 4FWQA 4B1VA 1YXQA 3LDOA 1X3NA 4H5TA 1KXPA 3VEYA 3BP8A 3VGKA 1SQKA 1QQMA 3D2FA 3HZ6A 5FPMA 1GLFO 3O8MA 2YJEA 4GNIA 2Q0UA 5BPNA 3EO3A 2NRHA 1NGBA 1CZAN 4QS9A 5ADXH 4PKGA 3IDHA 4K25A 3M3ZA 3VEWA 3LM9A 3VESA 3CETA 4B1UB 2QWOA 3BUZB 4HTLA 4PL8A 3FE1A 3ZX3A 4XH5A 2HF3A 3CERA 4HWIA 5AQNA 3ULEA 3WQTA 5F2RA 3ZEUA 2J4RA 1K8KA 2BUPA 4CD3A 5BN9A 4QS7A 2Q97A 4JD2B 3GL1A 5BRFA 4BVPA 4BRAA 4YDUC 4YDUA 5BREA 4CD1A 1KAZA 1YVNA 3R9PA 3ZETB 2VWBA 3M1FA 5AQPA 4O5FA 4XH1A 3DXKB 1QQOA 4BR7A 4BREA 5AZJA 3H3OB 4FWKA 3A0IX 3DJCA 3UKRB 1C0GA 3C7NB 4BC5A 3GE1A 4RTFD 3IMXA 2WUSA 1BWFO 1MWMA 1HPMA 1TYQB 2ZWHA 2Q0RA 1ZBSA 4FWLA 4BRGA 4CZLA 3D7EO 3H45C 3SMSA 3HBTA 4M63C 4CZIA 2VYPA 4LC9B 4AM6A 4ISFA 5KPTA 3UKUB 2NLXA 3L0QA 4NB4A 3CJ7A 1U6ZA 2ZGYA 3DAWA 4DHYA 3SMPA 3LDLA 2GELA 2D0OA 3VOVA 2YCHA 3RSEB 4B1ZA 1XC3A 1IJJA 3CJCA 4CZFA 5LY3A 1JCGA 3AY9A 1S22A 5KPRA 1NGEA 5AZIB 1X3MA 5JICA 2E1YA 4XEIA 4DCHA 5BR9A 5JMVA 4FWRA 3O6WA 3CQXA 3FZLA 5EVZA 1X9JA 1T6DA 1BOTO 3O08A 1HKBA 3QDKA 4FO0A 3I33A 5AQXA 3BF3A 2QWRA 1XUPO 4BRCA 1NGHA 2A42A 3FR0A 4AM7A 4H5VA 2P9NA 1NGIA 2E88A 4PL7A 5AQRA 3AAPA 3LL3A 2QWQA 4BRNA 5AQMA 1BUPA 5E84A 2FSJA 2P9UA 2CH5A 3QICA 1NWKA 4FOEA 4H0TB 3HSCA 3WEEB 3GBTA 3A5LC 1ESVA 4JHDA 4B1WB 3DXMB 3R6MA 3SLCA 2CGJA 5ELZA 4B9QA 1TUUA 3H46O 1RDWX 2FXUA 1E4GT 3TU5A 2HOEA 4FWNA 2CGKA 5AQZA 1HKCA 1MWKA 2PBDA 2D4WA 4JNEA 5AQUA 1Y64A 1NBWA 4BC4A 2AP1A 4BRHA 5AR0A 1V4TA 3D2FB 2FF6A 4IO8A 4BGAA 1Z6RA 4MLEA 1EQYA 4MLHA 4BRDA 2E2OA 3VENA 1P8ZA 4I6MA 2IIRA 1E4FT 4NO7A 3J8AA 3WXLA 3QFPA 4CBUA 4BQLA 3QFUA 1G99A 2E20A 5JLFA 5F1XA 2F9TA 3KHYA 3H3NO 2A3ZA 4IZ9A 3U8XA 2DPNA 3LDQA 3VGLA 4A61A 3SJHA 4FWPA 3ZEUB 3CJ1A 4FWOA 1K8KB 4F9OA 2F9WA 3M6GA 3HI0A 5ADXA 2VCPA 3EKSA 2ASOA 4CBWA 4DB3A 4A2BA 4CZJA 3ID8A 3A5MC 4J8FA 1RFQA 1BA1A 2D1KA 2QWNA 3ZX0A 5AZJB 3AARA 5AFUH 3U9ZA 4RWTA 2QW9A 3O4WA 4M7XA 4O8KA 2A5XA 3D2EA 4B1XB 4BG8A 2P9SA 3MN9A 1HUXA 4BRIA 1WOQA 4EFHA 5KPZA 3VF2A 2KHOA 1ZC6A 3VERA 5AQVA 2ITMA 4BR9A 3G25A 4JAXA 3FZKA 2A6AA 3ENHA 3QB0A 1GLCG 3FGUA 2V52B 3MDQA 4CZGA 2P9PA 1ATRA 3ATUA 3QMLA 3P4IA 1DGKN 1ATSA 3EKUA 3O1WA 3L6QA 1QQNA 3DXKA 2YHWA 3R8EA 2Q31A 2QWLA 3U9DA 5EOYA 3UKRA 3WQUA 2YHXA 5CE3A 4L3QA 2E2PA 4CZEA 1GLAG 3IUCA 1QZ6A 2GUPA 1ATNA 5BRDA 3L4IA 1Z05A 5AQHA 3C0BA 3ZX2A 2ZF5O 4IJAA 4BROA 2P9NB 5AQFA 2Q1NA 4CZHA 3QBWA 2P9LA 3S41A 1TUYA 4FWMA 4H0XB 4BR4A 3EL2A 4Z94A 3HTVA 2Q36A 3CJBA 4CBXA 3VEXA 5FPEA 1LOTB 2P9UB 1KAYA 3FZFA 4BRKA 2V51B 3WUHA 4JHDB 1D4XA 3CQYA 3ATVA 3FLCO 1SZ2A 2GWKA 5BPMA 4BRFA 5EXWA 2P9KA 3GOIA 2P9IA 1NGDA 1MDUB 1NGFA 3KZBA 1NGCA 4H0YB 5AQSA 5EX5A 3B8AX 1HJOA 3VF6A 1RGIA 2QWMA 4IXCA 1JCEA 1Q18A 1YUWA 2CGLA 3WXIA 4K43A 3VEOA 4BGBA 1BO5O 4WYBA 5AQOA 4RCHA 4BC2A 1MA9B 4CI6A 4BRQA 1OKJA 1S3XA 3I8BA 3JS6A 4MO5A 1NGJA 1T6CA 4WQ5A 3GG4A 4I6MB 3H1QA 3MCPA 5AQLA 3HM8A 4CZKA 2Q2RA 5AQYA 4BRMA 4BRLA 3FFKB 3FZMA 2A40A 2HMPA 4XH4A 2ASPA 4PKHA 4E1JA 5AQTA 2QM1A 3MN5A 3O1BA 2AA4A 5AQIA 4BR0A 3ENOA 2V7YA 2CH6A 1U2VA 5KQDA 4IJNA 4BR2A 3BF1A 3IFRA 2UYTA 3ULEB 4KBOA 3H1VX 2GWJA 2W41A 5AQQA 1GLLO 3F9MA 1XQSC 2IVPA 1HKGA 2E2NA 3VPZA 4GY2B 1T44A 3O5BA 4H0OA 3CI5A 3OHRA 4FPAA 3MN7A 2FSNA 2ASMA 4K42A 2GTDA 3D2EB 2P9SB 1LCUA 4CJ7A 4K41A 1IG8A 4IWVA 1NMDA 4FSVA 4FWSA 2I7NA 2FF3B 5JLHA 1HLUA 3A5NC 1BG3A 4M7YA 5AFUA 5BRHA 1DKGD 3O80A 2BTFA 4BQZA 5FPDA 2HF4A 1NLVA 5KQ8A 3VETA 4FPBA 1GLEG 2P9PB 4H0VB 2EWSA 3VEVA 5E26A 4JN4A 4BC3A 4ISEA 3UKUA 3KVGA 4JD2A 4QS8A 3A8YA 3SK3A 3ZETA 2QXLA 3CJ9A 3VF4A 4H0PA 2A41A 4Y0WA 2W40A 4EIAA 4PKIA 5EY4A 3H6EA 4WQ4C 4WQ4A 3EZWA 3LDPA 4A62A 3C7NA 5AQKA 1V4SA 1BA0A 3WXJA 4A2AA 1ZXOA 2P9LB 1KAXA 1TYQA 4H5WA 1H1VA 5LJWA 4H5NA 3DWLA 3MMVA 3TPQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TSUA 3OYAA 2D0AA 3MK6A 3OYDA 4HVJA 4O4GA 1YJ9N 4M3XA 2PZSA 3TTDA 2P9KB 2H3GX 3AA4A 1R59O 2IVNA 1WAFA 4DQ8A 4BWJA 2FLOA 4JKFA 3BEXA 3CIPA 4ICLA 2NRVA 3QBXA 4Y1CA 3UE5A 5CYQA 4DUZK 1GLDG 1GLBG 3EN9A 4CZMA 2GX9A 4C8OA 5BN8A 1OH7A 2O4IA 3W3DA 3G10A 4OX9K 3CYMA 3VEZA 1C0MA 4OVLA 4BG9A 1RILA 1T3VA 1NM1A 3S3NA 3LDNA 3IAYA 4DFPA 3VQCA 3THYB 2UUAK 1DLOA 4JS4A 4YFUA 3GDQA 2PAVA 1I39A 3C6AA 4H03B 4ID1A 1J6ZA 3RMDA 1TAQA 1KLMA 3VQEA 1IBMK 4BR5A 4DF8A 2W6KA 3W0LA 1JLQA 5AQJA 3WXMB 3DLLL 1NJXA 4FWQA 3IG1A 4YOVA 3P38A 1YXQA 3LDOA 3VN5A 1VQPN 1NOYA 3OYJA 3QEIA 4AF1A 4FK4A 2R7YA 5FPMA 3V4IA 4CF2A 3MX2A 5GAGP 1I94K 3PIOL 1QSYA 4DV6K 5IWAK 2LSNA 3EO3A 2NRHA 1S1VA 4QS9A 1B9DA 1QE1A 3VEWA 3LM9A 3KD5E 4HTLA 3O9RA 3OYHA 3L2UA 4DQRA 1BI4B 4E7HA 1S1WA 2KZZA 3ULEA 4OKKA 3ZEUA 1LV5A 3CFPA 2BUPA 4CD3A 5BN9A 3O3GA 3OTOK 1VQ4N 2O8FA 3GL1A 5BRFA 4BVPA 4FXDA 4BRAA 4YDUA 5BREA 5D3GA 5JVHL 5HRRA 3AVNA 4WFBL 5AQPA 4XH1A 1LAVA 1QQOA 5M1OA 4DR3K 1S1UA 4BREA 5AZJA 3H3OB 4FWKA 3A0IX 4M3RA 3KD1E 3C7NB 4BC5A 3EY1A 3NH1A 4RTFD 2WUSA 4DQQA 1HPMA 5FRMA 4C1NK 4C8MA 4CZLA 3J7AP 3D7EO 4CEFA 1YF5L 3L3UA 2HNZA 2F96A 4KHUA 4M3YA 3L0QA 3CJ7A 1U6ZA 5M1FA 3OJUA 4DTUA 4B9VA 3SMPA 3ISNC 3AO1A 5K14A 2D0OA 4B1ZA 3CJCA 3AY9A 1S22A 4KH5A 1A5WA 4O44A 1NGEA 1HMVA 2ITGA 1KRPA 3O6WA 3CQXA 1VSMA 3K58A 1NJWA 3O08A 1HKBA 1KTQA 3QDKA 4U67L 4JKAA 3I33A 3CCRN 1ZBIA 4AM7A 4I2PA 5HLFA 2IAJA 1EKEA 2E88A 4N5SA 3R1XA 2VQFK 3V9ZA 1I3AA 4YNQA 1BIZA 3LZJA 2HHIA 1BUPA 1BGXT 1Q9YA 4KB0A 3VTIA 1DT9A 2CH5A 4H0TB 3HSCA 3GBTA 4IKFA 3A5LC 4RW4A 4DV2K 3M8PA 3R6MA 4OPKA 2CGJA 3ZSZA 3NF8A 4G9ZA 2QI2A 1TUUA 2W42A 1E3MA 1RDWX 1E4GT 3TU5A 4F2RA 5AQZA 3DOKA 5AQUA 1Y64A 1NBWA 3U6FA 2AP1A 1V4TA 2XY8A 1REVA 3PSFA 3TWHA 4DV0K 4V19S 2ZJQL 3OS1A 4XJXA 2HHXA 4JKDA 2E2OA 5GADP 1U48A 4HUGA 4NO7A 1RTHA 4Q0BA 1Q7YO 2E20A 3IRXA 2FBVA 2ZJPL 3ULDA 3TAPA 1N5YA 4DR6K 3P83D 2F9TA 3KHYA 2A3ZA 1HNVA 2DPNA 3KLIA 4JI2K 2IDOA 4W5TA 4A61A 3ZEUB 3B6PA 4FWPA 4I9LA 3SAGA 4B8AB 1KFDA 1EX4A 2F9WA 4LF7K 5ADXA 2O8FB 3EKSA 3RWUA 4CEDA 2P5OA 2QK9A 4A2BA 1XMOK 4GV6A 3ID8A 3A5MC 2XY5A 1C1CA 3MEEA 3C6HA 1W2BM 5DM6L 1BA1A 1EP4A 1VK0A 2D1KA 2G8UA 4JS5A 1KFSA 4CJFA 5AZJB 3QNNA 4W5RA 1IKXA 1KVAA 2QW9A 3F2KA 4YOYA 1S1TA 4YOUA 1TK5A 1HUXA 3TTFA 1NJIO 2BGGA 4BRIA 1WOQA 3M8RA 4IFVA 1ZC6A 3J7YP 2NUBA 2RF2A 4DFMA 3OS0A 4Z4CA 3THXA 4ZTFA 2X6NA 3QINA 2V52B 3KJVA 2OPPA 4CFAA 3AVCA 2JLEA 3ATUA 1W0HA 3ASMA 1DGKN 3EKUA 3VQ7A 3T7ZA 1TGOA 3R8EA 5EOYA 3K59A 4L3QA 1A5XA 2E2PA 1JXEA 5BRDA 1QZ6A 3PX0A 3P31A 3HO1A 1J9AA 4ELTA 3AVGA 3S41A 4BECA 3OYIA 1VQKN 4BR4A 3D0PA 4Z94A 4ELUA 4HCBA 3WNFA 4CBXA 5LMUK 3VEXA 3RMBA 1UAXA 3MAQA 3FZFA 1NJYA 3QIPA 4EZ9A 3ATVA 5BPMA 5DK5A 5EXWA 3K57A 4YORA 4CGFA 2G8HA 1NGFA 3RRGA 3E1YA 4FJ9A 4RG8A 3V1RA 1RGIA 4IXCA 4MDBA 3WNGA 1D9DA 3AVLA 1VQ7N 3PY8A 2KKZA 4K43A 3VEOA 3CCMN 4GKKK 1HNWK 3KLEA 1NKBA 3WNHA 1C0TA 4HHTA 3HXMA 3RRHA 4CI6A 1EO1A 1KC8O 4DV4K 4BRQA 3TABA 4DF4A 3I8BA 4CHOA 4Z4EA 2HNYA 4FJGA 3GG4A 5JVGL 3N4PA 1ZBFA 5AQLA 5AQYA 4BRLA 4FLWA 3RMAA 3HP9A 3FZMA 4H4MA 2FBTA 4GW6A 2HVHA 2QM1A 4BR0A 1FK9A 4CJRA 4A5BA 3BF1A 1T03A 1VQ5N 5M1NA 3ZLJA 4CF0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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