4H0XB

Crystal structure of nad+-ia(e380a)-actin complex
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 121
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0xB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0xB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0xB03
1NGJA 5BR9A 5BREA 4H0XB 3SLCA 1K8KA 3U4LA 1YAGA 2P9UA 3VESA 4AM6A 2NLXA 2ASOA 4MLHA 3I33A 4JNEA 1SQKA 2Q31A 1JCEA 1C0FA 1ZC6A 4M7XA 5AZIA 2I7PA 4I6MB 1KAZA 4F9OA 2V7YA 4B1WB 3GG4A 5AQWA 4BG8A 3EKSA 4DQ8A 4B1XB 4B9QA 5ELZA 4EFHA 4FOIA 3H3OB 2FF3B 3U9DA 4YDUC 5CE3A 1GLLO 1U2VB 3MN7A 3DAWA 3UKRA 3RSEB 4CZJA 3GDQA 4H0YB 2OANA 4NB4A 4DHYA 1T44A 2FLOA 4PL8A 4BREA 1IG8A 4BRCA 1DGKN 4RCHA 2W41A 1ATSA 2ASMA 4JN4A 4B1ZA 4H5TA 3DXMA 4H0TB 3H46O 4AM7A 2NRHA 2ZF5O 2W40A 3MN5A 3D7EO 1KXPA 2GEMA 4J8FA 3CQXA 5AQRA 2QWLA 3R6MA 1NGHA 3R9PA 1X9JA 2FSJA 3HI0A 4HTLA 4Y0WA 4K41A 3W3DA 1BOTO 4BC3A 4FWOA 1QZ5A 3CJ7A 3LDPA 1ATRA 2A5XA 3FZLA 4BQZA 1NWKA 3FGUA 3WEEB 3H1VX 3VGMA 3CJ1A 3L4IA 1ZBSA 2FXUA 4XH1A 4FWMA 1BG3A 2GUPA 3VENA 2F9WA 3WT0A 1K8KB 4L3QA 4BR7A 4BRLA 4BC4A 4BRQA 2E2QA 1GLDG 5F2RA 3B8AX 3A5MC 2QM1A 2QWRA 3O80A 5AQHA 4IO8A 3D2FA 4B1VA 3FR0A 2V51B 5F1XA 3M6GA 1Q18A 3O4WA 1NGEA 2HF4A 2D4WA 2UYTA 4ISFA 3ULEA 4CZGA 1TYQB 2P9NA 1JCFA 2Q0RA 3FE1A 3IDHA 3JS6A 4GY2B 2A40A 1KAXA 2FSKA 2P9KA 2VWBA 4QS8A 5AR0A 2QWMA 4A2BA 1XUPO 1RGIA 4BR2A 5AQMA 1Y64A 2CH5A 4CZFA 1EQYA 2CH6A 3JXUA 3L6QA 3A5LC 3FZFA 1HJOA 2E20A 5AQFA 1HUXA 2BUPA 3AY9A 2F9TA 4BRNA 4BRPA 4CZHA 3HZ6A 3DXKB 1BWFO 3VEXA 3F9MA 5AQUA 2H3GX 4FWSA 2GELA 1WUAA 3TU5A 4EHUA 2E2PA 2PBDA 4IXCA 3VEOA 3EZWA 4O8KA 3H1QA 4H0OA 3CI5A 4FWQA 3VEZA 4BRAA 4PKGA 4JHDA 3LL3A 2I7NA 4BVOA 3ZEUA 2YHYA 4JD2A 1GLEG 2A3ZA 2ZGYA 3FZKA 5KPTA 4B1UB 4FWLA 4FO0A 3CERA 4WQ5A 4FOEA 3ZETA 5JICA 1D4XA 5BPLA 4MO5A 4XEIA 1NGGA 4CD1A 5BN9A 2Q1NA 2ITMA 1J6ZA 2A41A 3VF6A 3ID8A 5BRDA 3A5OC 3O1WA 3A5NC 3D2FB 5KQDA 3O1BA 1S3XA 1V4TA 4BR0A 3VOVA 1NGDA 3SK3A 3WXKA 5JMVA 1E4GT 1T6DA 1HLUA 2AP1A 3EKUA 1MWMA 3DJCA 3ATVA 5BRHA 3KHYA 2YHXA 1P8ZA 5AFUA 1BA0A 3UKUA 4EHTA 2YCHA 4K25A 4BRKA 1NLVA 2YJEA 3QFUA 3HTVA 1T6CA 4A61A 4YDUA 2P9KB 2P9PB 1H1VA 2GWJA 3MCPA 2P9SA 1QHAA 3GE1A 2J4RA 5AQXA 1Z05A 5EY4A 3WXJA 4MLEA 3ZX2A 5TKYA 1MA9B 1ZXOA 1DKGD 4H5NA 1GLFO 2ZWHA 1ATNA 1GLAG 3M1FA 1NGAA 5AQVA 3MMVA 4BR4A 1GLJO 1V4SA 2P9LB 5FPEA 3ZX0A 1R59O 1YXQA 1OKJA 3VF4A 5I9EB 1QZ6A 5ADXA 2IVPA 3GBTA 4FWNA 4WQ4C 3C7NA 5FPDA 4JHDB 5AQYA 4JD2B 4NO7A 3CQYA 1MWKA 4BR5A 2A6AA 3MK6A 3BF1A 3WQTA 3ENHA 1LCUA 1TUYA 2EWSA 2P9UB 5AQOA 3ZETB 1NGBA 1BO5O 3D2EA 2CGJA 1HPMA 2Q2RA 3ENOA 3EN9A 3LDNA 2QWPA 5AZIB 2E1ZA 4CZKA 2KHOA 5LJVA 3VPZA 3TPQA 1CZAN 5AQNA 5AQGA 2IIRA 4BC5A 2CGKA 2NZTA 3J8AA 3BEXA 2VCPA 4I6MA 4XH5A 4CD3A 3UKRB 2ZGZA 3LM9A 2CGLA 4BROA 4FPBA 3U8XA 1NGCA 3UKUB 4M63C 4DCHA 3IMXA 1U2VA 1XC3A 4XH4A 3RSEA 1RFQA 4CZIA 4CZMA 3I8BA 1NMDA 3DXMB 4BG9A 3QICA 2E2OA 3CETA 3BF3A 4ISEA 5EXWA 4IJAA 4BC2A 1QQNA 5AQIA 1QQOA 4BGAA 3A0IX 3WQUA 4IJNA 4FPAA 1S22A 5AQPA 1HKGA 2WUSA 3HSCA 5AQZA 4FL9A 3ZX3A 4BRFA 4O5FA 1WOQA 4ISGA 3QFPA 4B1YB 4DB3A 2E88A 1HKBA 5LY3A 3VEWA 2HMPA 3QBWA 5EVZA 2QWQA 1G99A 3CJAA 4MO4A 2D0PA 5BN8A 1MDUB 5E84A 3O8MA 1C0GA 4LC9B 2GWKA 4E1JA 3C0BA 3QMLA 3MDQA 3VF2A 1BA1A 4RTFD 1HKCA 4CZEA 3H45C 3ULEB 2P9NB 1RDWX 4IWVA 3UE5A 2P9IA 3LM2A 3VEYA 4CBUA 4BVPA 4CBWA 1GLCG 5AQKA 4PL7A 4BRIA 1NGIA 4H5RA 3W0LA 3CJCA 1TYQA 4QS9A 4H0VB 3O5BA 4FWPA 1SAZA 2Q36A 4BRMA 5E26A 3VGKA 2AA4A 5FPMA 2IVOA 4EIAA 4PKIA 4BQLA 1KAYA 5BPMA 4BRDA 4K42A 1X3MA 1Z6RA 1NGFA 3CHWA 3U9ZA 3VERA 5LJWA 3KZBA 2E1YA 5KPRA 3MN9A 4GNIA 4A2AA 3FLCO 3DXKA 2YJFA 4JAXA 5AZJA 3BUZB 3VETA 4K43A 4C23A 3ZEUB 4Z94A 3FZHA 2A42A 1X3NA 2Q0UA 3AARA 4KBOA 3CJBA 3O08A 5FPNA 3AAPA 2D1KA 1SZ2A 1DEJA 4PKHA 4HWIA 4BR9A 2PAVA 1XQSC 2Q97A 3IFRA 3KVGA 4WQ4A 3O6WA 2IVNA 2DPNA 3GOIA 3IUCA 3OHRA 5EX5A 3H3NO 2V52B 3QBXA 2D0OA 2YHWA 3QDKA 5AQLA 3BP8A 1LOTB 2QWNA 3FFKB 3HBTA 2HOEA 1NBWA 3DWLA 5KPZA 3MN6A 5AFUH 5JLFA 1NM1A 2FF6A 2QW9A 2QWOA 4IZ9A 2YI1A 3S41A 2ASPA 4EAHD 2P9IB 5AQSA 3EL2A 4CBXA 1JCGA 3HM8A 3VGLA 2BTFA 3SMPA 1GLBG 2P9SB 3CIPA 5AQTA 3WXIA 4CJ7A 1IJJA 1TUUA 3ATUA 1BU6O 2V7ZA 4M7YA 3H6EA 5AQQA 1ESVA 2E8AA 3FZMA 4A62A 2P9PA 3LDQA 4H5WA 1QQMA 2GTDA 5BRFA 3QB0A 5JLHA 4BGBA 3CJ9A 5BPNA 3SJHA 4H03B 1HX1A 3LDOA 3GL1A 1BDGA 3VEVA 5B8HA 2VYPA 1YVNA 5ADXH 4BRHA 2FSNA 2QXLA 3L0QA 3A8YA 3G25A 3AAQA 3WXLA 4CI6A 1BUPA 3C7NB 5KQ8A 3R8EA 3EO3A 5AZJB 2P9LA 2HF3A 4H0PA 4RWTA 1YUWA 3P4IA 4CZLA 4WQ5C 3LDLA 3WUHA 4QS7A 5F0XA 2E2NA 4WYBA 3M3ZA 5AQJA 4FWRA 5EOYA 3WEEA 4FWKA 4H5VA 3SMSA 4BRGA 1U6ZA 1E4FT 3D2EB 3UB5A 4FSVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PUFA 3T69A 5BR9A 3SLCA 4JI7K 2QI2A 2X6NA 5I3UA 2YV0X 2NLXA 1BIUA 4JNEA 3V9UA 1WBBA 1BHLA 4N76A 1TL3A 5AZIA 1UA1A 3SYZA 1SL2A 4JKFA 2V7YA 3NMUA 1UA0A 4FOIA 5HRPA 2VGNA 3H3OB 1GLLO 1U2VB 3RSEB 4E72A 3I0RA 1T44A 4PL8A 2G8UA 3HVTA 3DLBA 1Q9XA 1HJRA 4RCHA 4B9SA 4B9UA 4JLHA 4CEQA 4BWMA 3HK2A 4B1ZA 3DXMA 4RW6A 4YORA 4CJWA 2NRHA 1EWQA 3SAHA 2ZF5O 4B9TA 2W40A 3D7EO 1LAWA 3CQXA 3R9PA 1X9JA 4HTLA 4K41A 3AA4A 4BC3A 4E7LA 5TKWA 4FWOA 4RG8A 4LF9K 4YFUA 3ZSZA 2ZQBA 2DFEA 3CJ7A 4YOWA 1I39A 4BQZA 1LWEA 2G8WA 1BIZA 2WFBA 3WEEB 3V9ZA 1ZYQA 3CJ1A 4LD0A 4M3UA 2ZJRL 4AQYK 3KK3A 4FWMA 4E7IA 2RE2A 2F9WA 3WT0A 1K8KB 1Q81O 1VSLA 1GLDG 4DUYK 4GKJK 5AQHA 4FVUA 4CF8A 2GUIA 1S6PA 1EXQA 5C15A 4CJKA 4DLEA 1RTHA 4WCEL 3ZSQA 3QEWA 3M6GA 1S72N 1X1PA 1GOBA 1NGEA 2WOMA 5HOOA 1TYQB 4MFBA 4I9LA 1FXXA 1JCFA 4HUGA 4OKKA 4RW9A 1M1KO 2KTQA 3THWA 1B9FA 3OS2A 3NF9A 2VWBA 5AR0A 4R5PA 3AVHA 1TAUA 1Y64A 1EQYA 1VSKA 4DU1A 3A5LC 3FZFA 1HUXA 3V81A 4FJMA 1UOCA 5HROA 2F9TA 3MAQA 3IG1A 2UUBK 3QEIA 1NK9A 3DXKB 1QSLA 4XJXA 1TK0A 1BWFO 1NOZA 5AQUA 2H3GX 4E7JA 4HUEA 2GELA 1WUAA 3TU5A 4EHUA 1R0AA 2E2PA 4Z4HA 4FLUA 5E41A 2HHUA 4BRAA 3EE8A 3KWIA 5JVHL 2VG7A 4QAGA 3WXMB 4BVOA 4KHWA 3THXA 4B9VA 2ZGYA 3L3VA 2YNFA 1W0HA 4FOEA 4WQ5A 3JAMO 3ZSOA 1D4XA 3SV3A 2IS3A 3LZJA 2Q1NA 2ITMA 4O5BA 4CGGA 1ASVA 4G9ZA 4N56A 5A2QO 1D9FA 3O9RA 3V9XA 4B3TK 4B9MA 1V4TA 1BL3A 1WSJA 3WXKA 1E4GT 1T6DA 1S9GA 3HOSA 4LF7K 1VSIA 5AFUA 1BA0A 1S1VA 4C8OA 1NLVA 3QFUA 3VQ9A 3G71N 3HT3A 1H1VA 3MEGA 4JK8A 4CJFA 2QTDA 3WXJA 4JKGA 2NUBA 3K9KA 1C1BA 1DKGD 4H5NA 4B3OA 2VQFK 4K8ZA 4FJKA 1VSMA 4KTZA 1ZBFA 3MMVA 3R3LA 1U48A 1R59O 1YXQA 4DTOA 4CEAA 3IAYA 1GOCA 4KB0A 2XY5A 4CIEA 3C7NA 3P1GA 4JHDB 2XY7A 4JD2B 5M1KA 3CQYA 4AHCA 4BR5A 1W2BM 4CF2A 3P38A 1LCUA 1TUYA 3U6FA 3AO3A 3D2EA 1VSJA 4KAZA 2WTUA 2E1ZA 4IG3A 3SJJA 3DOLA 2KW4A 3EZ5A 4DU4A 3ZT3A 5LJVA 3RR8A 3CPWM 1NK0A 2D5RA 1XC9A 4O0IA 2VCPA 2A1RA 3TANA 1OH8A 2HW3A 2ZGZA 3LM9A 4LH4A 4NXMK 3AVBA 3U8XA 4BE7B 3L2QA 3UKUB 2UUCK 3C6UA 1U2VA 4OLBA 3RSEA 3I8BA 2HHTA 3LP0A 3L3UA 2E2OA 3LP3A 5EXWA 4BC2A 3RMBA 4LF4K 3C6AA 1QQOA 2BANA 2FBTA 4CJTA 4CK3A 1WB9A 4B3SK 4BGAA 4M3RA 2HMIA 4IFEA 2F8TA 1IKYA 4CERA 3TTDA 1D9DA 2G8KA 2GV9A 4IFYA 1N6QA 2E88A 3PSIA 3MWTA 5IT9O 3VEWA 4C1NI 3OS1A 2HMPA 3QBWA 2NRRA 4E89A 2HVHA 2W00A 3L2UA 3EYZA 4GV9A 1G99A 3CJAA 4HHTA 4IO9L 4FJXA 2D0PA 4FJJA 3MWPA 5BN8A 4AHVA 4W5TA 2B5JA 3SV4A 3MDQA 1VSFA 4ICLA 5EU7A 1HRHA 4CZEA 3H45C 4IWVA 1KTQA 3CCRN 3KTQA 3LM2A 1IG9A 2HNZA 2KFNA 5GINA 5AQKA 4DR6K 4PL7A 4BEBA 1B9DA 4BRIA 1NGIA 4K8XA 1JKHA 1TYQA 4JKEA 2A1SA 3KLEA 4DF8A 3DM2A 4BWJA 1SAZA 1BISA 1WSFA 3QNOA 4PQUA 4Z4GA 3KK1A 3TABA 4EIAA 2P5OA 4M42A 1X3MA 1NGFA 3CHWA 4W5NA 3ULDA 1KC8O 1MU2A 2E1YA 3NF7A 3SQ2A 3AVGA 5C0YA 4FZZA 5AJ3K 2W6LA 4IEIA 3VQ4A 5HLFA 3DXKA 2G8IA 1K73O 3UIQA 4DLGA 4CCHA 3I56N 2Q0UA 3VA0A 3AARA 2QKKA 2YHAA 1SZ2A 2O8BB 4Q0BA 4BR9A 4AHTA 1P90A 3TI0A 2PAVA 3IFRA 2OPSA 2IVNA 5IWAK 4BE1A 3T19A 3OHRA 5EX5A 2V52B 3QBXA 3PIOL 4KRFA 4JI6K 4M3XA 2DTUA 4DSIA 1W9HA 2YHWA 3C6TA 4JI0K 1VQMN 3BGRA 3BZKA 4J2DA 1OVYA 4E1NA 3QNNA 1UWBA 3S41A 3SZ2A 1NK7A 2ASPA 4AH9A 3EL2A 4HCCA 3VGLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4DTM A;  3NH2 A;  1W7A A;  4FJ7 A;  4FPA A;  1J5O A;  3AVC A;  1S1X A;  1XWL A;  4CE9 A;  1WOQ A;  2E6M A;  4OO1 J;  3PX0 A;  1ASU A;  4JK9 A;  4DSE A;  1HKB A;  2D0A A;  5LY3 A;  3KJV A;  3E66 A;  1VSD A;  1VQ9 N;  3QIO A;  2QWQ A;  1C1A A;  1X9W A;  4W5R A;  1FKO A;  5GAH P;  4JV5 K;  1MDU B;  4DR3 K;  3OBY A;  3O8M A;  3LP1 A;  4LC9 B;  5FRO A;  2GWK A;  4E1J A;  3C0B A;  3QML A;  4DV4 K;  1RTI A;  3VF2 A;  3ASM A;  1A5X A;  3ALY A;  4K0K K;  3AVL A;  2P9I A;  4CBU A;  4CBW A;  4OPJ A;  3AGR A;  2X74 A;  3QLH A;  2IOC A;  2Z1G A;  4QS9 A;  4H0V B;  4FWP A;  2Q36 A;  4BRM A;  4BDZ A;  2E5L K;  3CG7 A;  3VGK A;  1M90 O;  2AA4 A;  2KZZ A;  3RVC A;  4DR7 K;  1NJZ A;  2UUA K;  4BQL A;  1C0U A;  5BPM A;  4K42 A;  5LJW A;  2RN2 A;  4Z4I A;  3ISN C;  3HP9 A;  3HJF A;  3I0S A;  3RRG A;  2UXC K;  1RTD A;  4KTQ A;  4BDY A;  1JJ2 M;  4FM1 A;  1U45 A;  4JAX A;  3VET A;  4K43 A;  1QSS A;  2HVI A;  3KK7 A;  2OZM A;  3FZH A;  3E01 A;  3THX B;  5FPN A;  3P31 A;  4BAC A;  3MXM A;  4G1Q A;  1CLQ A;  4HWI A;  3V4I A;  2NRW A;  3KVG A;  4OJR A;  4WQ4 A;  2PZS A;  4OX9 K;  1LV5 A;  2F4V K;  4PHT X;  3IUC A;  2E4L A;  2PYL A;  4F4K A;  1HYS A;  4M3Y A;  1QS4 A;  1K8A O;  4KHP K;  1K6Y A;  5DK5 A;  3CCV N;  3QDK A;  1LOT B;  2F7T A;  3DLR A;  4JRQ A;  3FFK B;  3HBT A;  5KPZ A;  3OYL A;  3MN6 A;  4LH5 A;  5AFU H;  3CCS N;  3U3G A;  1EO1 A;  1NJI O;  2HHV A;  2QWO A;  3PIP L;  4FJH A;  4EAH D;  5AQS A;  1NK6 A;  3HOT A;  4CBX A;  2W42 A;  3SMP A;  3LAK A;  3CIP A;  4CEZ A;  4CJ7 A;  1IJJ A;  4JI8 K;  1BU6 O;  2V7Z A;  5GIP A;  4M7Y A;  2ZM6 K;  5CZ1 A;  1ESV A;  5DMR A;  3C6H A;  5BRF A;  1JLB A;  2GTD A;  3AVJ A;  3OYK A;  3CJ9 A;  1N33 K;  1VQ8 N;  4H03 B;  4DR5 K;  1BDG A;  5SWM A;  1VQ7 N;  3TAP A;  1YVN A;  2ATQ A;  3L8B A;  3AAQ A;  3C94 A;  4M3Z A;  2UU9 K;  3SPZ A;  1BUP A;  3C7N B;  4TSX A;  5KQ8 A;  3DLH A;  3R8E A;  3EO3 A;  1HYV A;  2UXD K;  1ILY A;  1ZBH A;  4WQ5 C;  3LDL A;  4CGF A;  3VTI A;  4JKB A;  4CHZ A;  1C1C A;  3E9O A;  3KKS A;  3D2E B;  3UB5 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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