4PL7A

Structure of komagataella pastoris actin-thymosin beta4 hybrid
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
425
structure length
382
Chain Sequence
VAALVIDNGSGMCKAGYAGDDAPHTVFPSVVGSFVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRLAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYTFSTSAEREIVRDIKEKLCYVALDFDQELQTSSQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLEASGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYSNIVMSGGTTMFPGIAERMQKELTALAPSSMKVKISAPPERKYSVWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYDESDMAEIEKFDKSKLKKTETQEKNPLPSKETIEQEKQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of thymosin-beta 4/profilin exchange leading to actin filament polymerization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein, contractile protein
source organism Komagataella pastoris
molecule keywords Actin,Thymosin beta-4
total genus 126
structure length 382
sequence length 425
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01290 Thymosin Thymosin beta-4 family
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl7A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl7A01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4pl7A03
1EQYA 2NLXA 4FO0A 5AFUA 5KQ8A 4A62A 3VGLA 1HPMA 3VEYA 2A3ZA 4CD1A 5LJVA 3VEXA 1NM1A 2P9PA 5FPDA 4B1YB 4EHTA 1LCUA 2D4WA 3M1FA 5AQKA 5FPNA 4H0YB 5BN9A 3UKUA 5AQSA 1V4SA 1ZC6A 4Z94A 1NGBA 2FF3B 1E4GT 1GLEG 4M7YA 4RWTA 4MO4A 2YJFA 4H5NA 4BVPA 2I7NA 4JD2B 3VETA 3QBWA 2F9WA 5AQWA 2IVPA 3CERA 5JLFA 1Y64A 4CD3A 3LDNA 2UYTA 3HZ6A 2BUPA 2W41A 3VENA 1ESVA 4FPAA 5ADXH 3L4IA 3IDHA 3AARA 2ASMA 3WT0A 3O08A 3VOVA 1GLDG 1X9JA 4BG8A 4CZGA 4BR4A 4FWKA 5KQDA 5AQYA 4FWMA 1XC3A 3CJAA 1HX1A 2QW9A 4BR9A 4CBUA 3DXKA 3UKUB 1D4XA 3U9ZA 4BC5A 2Q2RA 1HKCA 4A2AA 3BEXA 2AA4A 3CQYA 3WXJA 3EN9A 3HSCA 5ELZA 2P9LA 4O5FA 3EZWA 2E1ZA 3JXUA 5AZJB 3VF2A 4NO7A 4BRCA 5AQIA 3H6EA 3BF3A 2P9NA 2ZGZA 3EO3A 1Z6RA 2VCPA 3ATVA 2P9SB 3R8EA 1V4TA 5KPTA 2IVNA 3ZEUA 3C7NA 1R59O 3VEOA 4XH5A 2E2PA 4RCHA 3VEVA 3CJ1A 4JAXA 2GTDA 2J4RA 1XQSC 4BRKA 1QZ6A 1HKGA 2WUSA 4BR0A 1LOTB 2FSNA 1GLAG 5AZIA 4CBWA 1QZ5A 4J8FA 1E4FT 3FZHA 1OKJA 2P9UB 4QS7A 2HF3A 5AQNA 3I33A 4RTFD 1TYQB 2E2OA 1MDUB 3S41A 3A5MC 1C0FA 3BF1A 4B9QA 5B8HA 2FXUA 4BRHA 2YHYA 5FPEA 3DAWA 4FPBA 4M63C 1GLJO 3IUCA 5F2RA 4IZ9A 1KAYA 1QQNA 3UE5A 2QWPA 2HMPA 4CZJA 2ASPA 2FSKA 2W40A 2DPNA 3AAPA 2Q0UA 2CGLA 3FE1A 3C7NB 1GLBG 4FWOA 4IO8A 4AM6A 4IWVA 5AQGA 4MLEA 1SAZA 2ZWHA 3L6QA 1NGGA 3H45C 5AQJA 2QWNA 1NGCA 1ATRA 3I8BA 1NGAA 4JD2A 1HUXA 3M3ZA 4IJAA 2P9KA 1T6CA 1GLFO 5AQQA 3GOIA 3VPZA 4BC4A 1BU6O 3IFRA 5AQMA 1QHAA 5AR0A 3U8XA 1G99A 3MN9A 2CGKA 4PKHA 3W3DA 1CZAN 3KVGA 1NGFA 2QWRA 3QFPA 3FZLA 4Y0WA 4H5RA 5JMVA 2A41A 2YCHA 4CZLA 4H03B 4H0VB 3WEEA 3O6WA 4A2BA 3VF6A 2V52B 1MWKA 5E26A 5AZJA 1SQKA 2YI1A 5AQTA 3QFUA 2FSJA 4CZFA 3ULEA 4QS8A 1RDWX 1JCGA 2GELA 2P9KB 4DCHA 2P9SA 4BRMA 1JCFA 2CGJA 3L0QA 3AY9A 5EX5A 2CH5A 1QQMA 3BUZB 1NGJA 4FOEA 2IIRA 4WQ5C 4FWRA 5TKYA 4FSVA 4BGAA 4CZHA 5KPZA 3VERA 3ATUA 3CETA 3SMSA 4BRPA 2QWQA 3UKRB 2VYPA 3FLCO 3SLCA 1ZXOA 3MK6A 3F9MA 3CIPA 3ID8A 1XUPO 2Q31A 2P9UA 2ZF5O 5FPMA 1ZBSA 3MCPA 4CJ7A 1TYQA 3LDPA 3WEEB 2VWBA 3VGMA 1KXPA 5EXWA 4BQLA 3GDQA 2QWMA 3QB0A 1TUUA 3ULEB 1WOQA 3G25A 4HWIA 3WUHA 5EOYA 5LJWA 4FWQA 5AQHA 1S22A 3H3OB 5AQUA 3A0IX 3ZX2A 2AP1A 3LDLA 2Q97A 2Q1NA 5BPLA 5AQOA 1MWMA 5AQVA 2BTFA 3HBTA 4JN4A 4GNIA 4O8KA 1BG3A 1KAXA 4C23A 3CJ7A 3VEZA 4JHDA 3CQXA 4EIAA 3MN6A 1HLUA 3ZX3A 4B1XB 4CZIA 2A5XA 3SMPA 1WUAA 5AQPA 4WQ4C 3ENHA 2QM1A 2D1KA 1GLLO 4CI6A 3MDQA 1ATSA 1K8KA 4FWSA 3CJCA 4MO5A 3R6MA 4BGBA 1NGHA 3QMLA 3QICA 3VGKA 4BRGA 2OANA 4DB3A 3MMVA 4DHYA 4NB4A 4BC2A 2FLOA 3RSEB 5AQZA 3VEWA 4CZMA 2YHXA 3O1WA 4H0TB 3GL1A 1P8ZA 4JHDB 4BVOA 4EAHD 5KPRA 3WXIA 5BPMA 2Q36A 2QWLA 3LM2A 2QXLA 1T6DA 4PKIA 3H1VX 5AQLA 3HM8A 4I6MB 3O8MA 5BRDA 1K8KB 3LL3A 4WYBA 4B1ZA 5JLHA 1DKGD 3H1QA 1U6ZA 4YDUA 4BG9A 5BRFA 4HTLA 2E2NA 2I7PA 5F1XA 1MA9B 3GG4A 1YAGA 3J8AA 1TUYA 5BRHA 1IJJA 3UKRA 2KHOA 2NZTA 1IG8A 4L3QA 2D0OA 3R9PA 2GUPA 3WQTA 3QBXA 2P9IB 4BRIA 1RGIA 4ISGA 3OHRA 2H3GX 4H0XB 4PKGA 3AAQA 3H46O 1BO5O 2PAVA 2IVOA 3D2EB 4JNEA 2F9TA 4DQ8A 1ATNA 4K41A 3H3NO 3MN7A 3LDOA 5BR9A 4H5VA 3A5NC 1NGEA 1BUPA 2GWJA 4IXCA 5AQFA 4BROA 3A5OC 3D2FB 1T44A 3A8YA 4FOIA 1HKBA 5BREA 1KAZA 3O4WA 3DXMA 4XEIA 3VF4A 4LC9B 2A6AA 2Q0RA 2HF4A 2ZGYA 3ENOA 3FZMA 3LM9A 3WQUA 5CE3A 2ASOA 3QDKA 2YHWA 4CZKA 5JICA 3U4LA 1RFQA 4EHUA 4B1UB 3EKUA 3WXLA 3SK3A 3FGUA 5LY3A 4XH4A 3KHYA 3UB5A 3P4IA 4ISEA 4BREA 4AM7A 2E2QA 4CZEA 4K43A 1BOTO 1YXQA 3FR0A 4K42A 1NGIA 1X3NA 4A61A 3HTVA 1GLCG 4WQ5A 2FF6A 2P9PB 5F0XA 4GY2B 1SZ2A 4H0PA 1NLVA 2E20A 4XH1A 3RSEA 1DGKN 2ITMA 4H5WA 4BRLA 3DWLA 1J6ZA 1JCEA 2D0PA 4FWPA 3O1BA 2V7YA 1S3XA 4F9OA 3M6GA 4MLHA 3ZETA 3DXMB 5EY4A 3BP8A 4BR5A 4PL8A 3CHWA 2YJEA 2E88A 4BR2A 1Q18A 3FZKA 4BRNA 2HOEA 3ZX0A 4BQZA 1BA1A 3B8AX 4I6MA 1NBWA 1BWFO 1NGDA 4FL9A 3EKSA 5I9EB 5BN8A 4E1JA 4B1VA 4BRFA 2V51B 3KZBA 2PBDA 2QWOA 3TPQA 3GBTA 3U9DA 2V7ZA 4H5TA 3DJCA 1YVNA 4FWLA 5AFUH 4IJNA 3IMXA 3HI0A 3DXKB 3A5LC 5E84A 3D7EO 4B1WB 5AQXA 4PL7A 2A40A 1NWKA 5ADXA 1U2VA 2GEMA 3GE1A 5AQRA 2E1YA 2P9IA 3O80A 1Z05A 3ZETB 2P9LB 3W0LA 3CJBA 3FFKB 3SJHA 3WXKA 4WQ4A 3D2EA 2E8AA 2NRHA 3EL2A 4FWNA 4H0OA 4BR7A 3MN5A 2P9NB 3O5BA 4ISFA 1X3MA 4BRQA 4M7XA 3JS6A 3CJ9A 4YDUC 1BA0A 4EFHA 3ZEUB 1QQOA 4BC3A 3VESA 4K25A 1DEJA 2GWKA 1H1VA 3D2FA 1BDGA 5EVZA 3C0BA 3LDQA 1HJOA 2EWSA 5AZIB 1YUWA 3TU5A 4CBXA 3CI5A 5BPNA 3FZFA 2CH6A 1C0GA 4KBOA 1U2VB 4QS9A 2A42A 4BRAA 4BRDA 1NMDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2G8IA 2ETJA 1EQYA 1X9WA 1ZBUA 4AH9A 3JYTA 2IS3A 4E1NA 1NJIO 1I39A 5KQ8A 1LWFA 1HPMA 4X66K 4J2AA 2A3ZA 4DR2K 4B3OA 4FLUA 1S1VA 2D4WA 5FPNA 1N36K 3UKUA 2WTUA 1ZC6A 3FFIA 5J2NA 1GLEG 4M7YA 4G1QA 1J54A 3SUNA 2HVIA 5TKWA 4CEAA 2G8VA 2I7NA 3D6RA 4J2BA 4AQYK 3EY1A 3EE8A 3RMAA 1OH6A 3LP1A 4LY7A 3KLEA 3TANA 3OYLA 3ZSOA 1Y64A 5DMRA 4GV9A 3HZ6A 2BUPA 5C2FA 1ESVA 4FPAA 3Q7BA 1EO1A 3SPZA 2VWKA 4V19S 2KFZA 3M5RA 5AQYA 5KRTA 4B08A 3NGZA 4JI8K 4NXMK 2QW9A 4OPJA 4BC5A 1S1TA 3OYJA 2OZMA 2Z1GA 4A2AA 3BEXA 4WFNL 2AA4A 1HNWK 5SWMA 1WSFA 5AZJB 2E1ZA 3KK1A 4DR5K 3VF2A 4BRCA 3L8BA 3H6EA 3BF3A 2ZGZA 3EO3A 1W9HA 3R8EA 4B3SK 3CMEN 4KFBA 4RW6A 3CM6A 4C1NK 3C7NA 1SL0A 1RBRA 2E6LA 4K0KK 3J7AP 1QHTA 1J5OA 2OTJN 2HNDA 4ZTFA 3NHGA 3LANA 4BR0A 3OJUA 3VA0A 1JKHA 3DYAA 5AZIA 1VRUA 1U45A 1DT9A 4DS5A 4LF7K 4QS7A 2HF3A 2RPIA 3QEXA 4O5BA 2E2OA 4B9QA 4NLCA 3NF9A 4MDAA 3CCLN 2RKIA 4M63C 4ILHA 3V9WA 3IUCA 5GAEP 4IZ9A 5GIOA 2QWPA 2HMPA 5FRMA 1N32K 2XRIA 4E72A 4B9UA 3L2RA 3ZT1A 4CGJA 2X6NA 4BE1A 1GLBG 3JAMO 1NK9A 3DM2A 3OVNA 2G8HA 1SAZA 2P5OA 5AQJA 2BH1A 4DFMA 2WBNA 3NGIA 1WSHA 3I8BA 1W97L 3QNNA 1KRPA 3O9SA 1HUXA 2HBMA 1VQLN 2G8UA 3RRGA 4AILC 5AQQA 3KWGA 4NYNA 1NU0A 5KGWA 1EETA 4DV7K 1NNEA 3CFRA 5DK5A 4PKHA 4QOZB 1FKOA 3T19A 1GOBA 3IAYA 3TR8A 3KVGA 2QWRA 4NLBA 3LZJA 4CJEA 4H03B 4ELTA 4X64K 3H08A 3SUQA 1ZYQA 1TK0A 5AZJA 1SQKA 3TABA 4DTUA 1YF5L 1Y97A 4Z4IA 3PIOL 1RDWX 3ZSRA 1JCGA 2OPPA 2GELA 3PX6A 1JCFA 4DU3A 3P1GA 2IIRA 2GX9A 4FWRA 5TKYA 1BI4A 3ZSQA 3QNOA 3VERA 3SMSA 1VSEA 2X74A 1U47A 4C8LA 5JS1A 3SLCA 4DTRA 3O9RA 3SPYA 3K0SA 4JI7K 3OS2A 4Z4FA 3AVJA 4FJ5A 3NVKA 2Q31A 3CF5L 5FPMA 3LWMA 4OGEA 4CJ7A 3GDQA 4HWIA 3CYMA 4L8RB 4JK9A 3RMCA 3L2UA 1S22A 4Y1DA 1TVRA 3ZX2A 2AP1A 3LDLA 1C1BA 2Q97A 5BPLA 3SQ0A 3ASMA 3DOKA 3MXJA 2O4IA 2NRRA 4I2PA 3NVMA 1XHZA 2QI2A 3CQXA 4EIAA 3VQEA 4HCCA 5KI6A 3ZX3A 4CZIA 1SS6A 2Z1HA 5AQPA 4WQ4C 1TKTA 2D1KA 2I5JA 4E3SA 1Q7YO 3TI0A 4MDBA 5C25A 3PV8A 1KC8O 4BRGA 3TAFA 3NGYA 4DB3A 4DHYA 1HMVA 4BACA 2DTUA 4BC2A 5IWAK 3EEQA 2PYJA 5JENA 1VQON 1IBKK 3V81A 4JHDB 4AHRA 3WNGA 2QXLA 4WCEL 3NFAA 3HM8A 3DRPA 3K9KA 2QKKA 2BGGA 1RTHA 1TGOA 2X78A 4Z4EA 3LL3A 3CCQN 1DKGD 1ASVA 3H1QA 3EE9A 4OKJA 2RN2A 1BQNA 4BG9A 5BRFA 2E2NA 5GADP 2I7PA 5HRNA 3CCRN 1YAGA 3J8AA 1QTMA 2NZTA 4L3QA 2D0OA 1TK5A 2GUPA 3N4PA 3QBXA 4JS5A 4BRIA 3DLBA 3UIQA 3P38A 4A57A 4WFBL 1YT3A 2PAVA 4E7LA 3OYNA 4K41A 2A1SA 3MN7A 5BR9A 3CMAN 4DV2K 1BUPA 2XY6A 4CECA 5AQFA 3RMDA 3A5OC 3D2FB 3VA3A 1VQNN 3OYAA 1NK6A 1KAZA 2B5JA 2B4JA 3ITHA 3OYKA 3DLHA 2YHBA 4LC9B 2A6AA 3LM9A 4CZKA 3QDKA 3ZLJA 2IDOA 3QEPA 3KHYA 1LWCA 3OY9A 3OYFA 2IAJA 3AA4A 4ISEA 2E2QA 4CGGA 1YXQA 3CQ8A 3T1HK 3LAMA 2OPRA 5F0XA 1N6QA 4XH1A 1NLVA 1SL2A 4I2QA 1WSEA 2D0AA 1IH7A 2ITMA 4BRLA 4E19A 3DWLA 4F3TA 3HYFA 1XI1A 1XWLA 3O1BA 4CHZA 4F9OA 5JS2A 2F7TA 4EZ6A 2D0CA 3DXMB 4Z0UA 2YJEA 3V9UA 1NJWA 4YHHK 3FZKA 4B3TK 1P90A 3ZX0A 2HBLA 4C8KA 3B8AX 3DLKA 3J80O 1NGDA 4CGIA 3EKSA 4CHYA 4W5QA 1S6PA 3M8PA 3SAFA 1BHLA 1HYSA 2YNGA 3HJFA 1JXBA 3OS1A 3NAEA 2NRWA 2PBDA 3TPQA 3THWB 1YHQN 4DTXA 1KSPA 3NE6A 2IC3A 2G8KA 3M8QA 2KKZA 4GKKK 1JXEA 3HI0A 1IKVA 3TAGA 3GE1A 5AQRA 2E1YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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