4PL7A

Structure of komagataella pastoris actin-thymosin beta4 hybrid
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
425
structure length
382
Chain Sequence
VAALVIDNGSGMCKAGYAGDDAPHTVFPSVVGSFVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRLAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYTFSTSAEREIVRDIKEKLCYVALDFDQELQTSSQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLEASGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYSNIVMSGGTTMFPGIAERMQKELTALAPSSMKVKISAPPERKYSVWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYDESDMAEIEKFDKSKLKKTETQEKNPLPSKETIEQEKQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein, contractile protein
molecule keywords Actin,Thymosin beta-4
publication title Structural basis of thymosin-beta 4/profilin exchange leading to actin filament polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Komagataella pastoris
total genus 126
structure length 382
sequence length 425
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01290 Thymosin Thymosin beta-4 family
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl7A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl7A01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4pl7A03
3GL1A 3ATUA 4ISEA 5BR9A 4FWOA 4FOEA 3U4LA 5ELZA 5AQMA 4NO7A 3B8AX 3I33A 4JAXA 3CQXA 1DEJA 1ATRA 3SJHA 3CJ7A 4WQ4C 4MO4A 5FPEA 5EVZA 2IVPA 1BG3A 4B1YB 3D2EA 1GLFO 1X3NA 2P9KA 2Q1NA 4FSVA 4FWRA 3QBXA 2F9TA 5AR0A 5TKYA 4XH5A 1D4XA 2ZWHA 3HM8A 4YDUA 1YUWA 1RGIA 5AQXA 1NGDA 3ENOA 2E20A 5JMVA 3VF6A 4ISGA 5B8HA 3FR0A 3C7NB 3DXMB 1BUPA 5AZJB 4BRCA 3FZLA 5BN9A 5BRFA 4BR5A 4K41A 3EKSA 2CGKA 4B9QA 1YXQA 4QS8A 5AQJA 5CE3A 3H46O 4B1ZA 3ZEUB 5BPMA 2QWNA 4AM6A 3BF1A 3ID8A 4EHUA 3DWLA 1NGIA 1NGAA 4A2BA 1DGKN 3LDOA 3WT0A 5EXWA 3H1VX 2CGJA 3TPQA 1LOTB 2NLXA 2QW9A 3MN9A 1XUPO 4H5RA 4RCHA 3VF2A 3CI5A 3C7NA 4O5FA 3DXMA 3VGMA 4BGBA 1QQOA 2BTFA 3MK6A 5AZJA 3MN6A 2FSKA 1ATSA 2Q0UA 2P9UB 1S3XA 4CBWA 1T6CA 4WQ4A 3L4IA 2FSNA 2IVNA 5BPLA 3ZEUA 1ZXOA 4BR4A 4CZEA 2A5XA 2YHWA 3WXLA 2CH5A 4A62A 5LY3A 5ADXH 4H5TA 4BRAA 4FWPA 3ENHA 3CETA 4K42A 2IVOA 4BRLA 5ADXA 3A5MC 2FLOA 2YHYA 4I6MB 2P9PB 3A0IX 4M7XA 3AY9A 2E1YA 4M63C 4BRHA 2P9UA 1X9JA 3SK3A 4BG9A 1NGGA 3MN7A 2A3ZA 2HMPA 1BU6O 4CZJA 1XC3A 1V4SA 1Q18A 5AQPA 4QS7A 4E1JA 2YCHA 3O1WA 2QM1A 1GLBG 3BP8A 3LL3A 5I9EB 4JNEA 4JD2B 1KAXA 1NLVA 1NGHA 3MMVA 4CZLA 1MDUB 2ITMA 2D0OA 4CBUA 2VCPA 4I6MA 4CZMA 2P9PA 1BA1A 5AQHA 3GDQA 4IJNA 1G99A 4BRQA 3VEVA 4MLHA 5AQUA 3IUCA 3EL2A 2ASPA 3J8AA 2ASOA 2E2QA 5KPZA 1HKBA 1OKJA 2E8AA 1C0GA 4CD3A 4BQLA 1BO5O 3L0QA 4BR2A 3EO3A 3O80A 4JD2A 3D2FA 3H1QA 1JCGA 3JXUA 3ZETB 2A6AA 1Z05A 1NBWA 2EWSA 3VPZA 3VENA 3MN5A 1GLAG 4BREA 3O5BA 4FPBA 1YVNA 4BVOA 3CJ1A 1NGFA 3FZMA 4C23A 2QWQA 2VYPA 3IMXA 2CGLA 2YJEA 3U9ZA 3UE5A 4RWTA 2WUSA 4M7YA 3VOVA 2PBDA 2YJFA 3VGLA 4BRIA 2Q2RA 3ZX0A 4BC2A 3P4IA 4FWNA 1GLDG 4Z94A 5JICA 2FF3B 4CBXA 4K43A 4CZKA 1BOTO 2P9LB 2AA4A 4MLEA 4K25A 3ZETA 2GWKA 2BUPA 5AFUH 1QZ5A 2E2PA 1NMDA 3FZFA 3F9MA 4PKHA 1SZ2A 4F9OA 2YI1A 4IZ9A 5AQSA 4DB3A 5AQQA 1R59O 3IDHA 5KQ8A 1X3MA 3EN9A 3M1FA 3VEZA 4CZIA 3GOIA 3L6QA 4FWKA 4BR9A 1U2VB 3QFUA 4RTFD 5BN8A 1GLEG 2ZGZA 2D4WA 5AQNA 2D0PA 4CZGA 3DJCA 2ASMA 2A40A 3KHYA 3IFRA 3CERA 3EZWA 3O4WA 3ZX2A 2P9LA 1ZC6A 3UKUB 3FE1A 4CZHA 3HI0A 3FFKB 3OHRA 1Y64A 5KPRA 3VETA 5AQYA 1SQKA 4BRPA 4BC3A 4BR7A 1GLLO 4B1XB 4BRKA 4IWVA 4JN4A 3HTVA 3LDQA 3M6GA 5F2RA 2E2NA 3CJ9A 3LM2A 1NGCA 4BRGA 3A5NC 4NB4A 5E84A 1RFQA 1RDWX 4H0VB 1S22A 4ISFA 2D1KA 4JHDB 1U2VA 3U8XA 1E4FT 1CZAN 1MA9B 5JLHA 2E88A 3CJAA 3VEXA 4FPAA 5BRDA 2I7NA 1HUXA 2QXLA 3LDNA 3LDPA 1ESVA 3UKUA 4KBOA 3MDQA 3WQUA 1TYQB 2NRHA 3QFPA 3CHWA 1GLJO 1NGEA 1IJJA 3FZHA 5JLFA 3W3DA 1NGJA 3C0BA 2QWRA 2VWBA 2QWMA 1HLUA 5KQDA 3QMLA 3QB0A 4JHDA 1QHAA 3VF4A 5AQGA 2W41A 5FPNA 4FO0A 3RSEB 1HPMA 3D2FB 4BC4A 3CJCA 1QZ6A 3JS6A 3DXKB 4BR0A 3VEOA 3VEYA 3UB5A 1NWKA 3AAQA 3CQYA 2FF6A 4LC9B 1GLCG 1MWMA 1TYQA 5FPMA 3WXJA 3G25A 2YHXA 1KXPA 2Q36A 1WOQA 2GTDA 4IXCA 2F9WA 4BROA 3CJBA 3D7EO 3R8EA 4Y0WA 2V7ZA 1QQNA 2P9SB 5F1XA 3UKRB 5AQRA 3RSEA 5LJVA 4BRNA 3H3OB 5AQTA 1ZBSA 4PKIA 2P9NB 3H3NO 3DXKA 1XQSC 4H0YB 4WQ5C 2IIRA 4H0PA 4H5NA 3VERA 2H3GX 1T6DA 5FPDA 1Z6RA 3HZ6A 4EFHA 3A5LC 4HTLA 3S41A 3SMSA 2ZGYA 3GE1A 3FLCO 2P9SA 3ULEB 2FXUA 3UKRA 2KHOA 1JCFA 2W40A 3CIPA 4MO5A 4EHTA 5EOYA 4CJ7A 3WXKA 2P9NA 4A2AA 3H45C 1KAYA 1J6ZA 3R6MA 1BWFO 2CH6A 4CI6A 3FGUA 4B1UB 4BRDA 5AFUA 1T44A 3O1BA 1DKGD 1QQMA 3VGKA 4IJAA 2Q0RA 5BRHA 2QWOA 2GELA 1U6ZA 4O8KA 1YAGA 2FSJA 3ULEA 4H0TB 3VESA 1BDGA 4L3QA 5AQFA 4PL7A 3BUZB 5F0XA 3MCPA 2V52B 3H6EA 2HOEA 3QDKA 4HWIA 5AZIB 3ZX3A 1NM1A 1KAZA 5E26A 1TUUA 2NZTA 3KZBA 4BC5A 5AQIA 4FL9A 4BG8A 4QS9A 5EX5A 3HBTA 3DAWA 4WQ5A 2E2OA 1IG8A 4H03B 4EAHD 2P9IB 1EQYA 1TUYA 4AM7A 2OANA 4H0OA 2AP1A 4H5WA 5EY4A 3WXIA 4B1VA 5AQZA 3QBWA 4FWMA 3QICA 4PKGA 1V4TA 3WEEB 3WUHA 1ATNA 3O08A 3KVGA 4BVPA 4CD1A 2I7PA 1K8KB 5BREA 2Q31A 3O6WA 4B1WB 1HX1A 3AARA 5LJWA 3EKUA 3SLCA 1E4GT 3A8YA 5AQLA 5AZIA 1MWKA 5AQKA 1LCUA 5AQVA 3BF3A 4FWLA 3M3ZA 4GNIA 4H0XB 4J8FA 5KPTA 1HJOA 1H1VA 2UYTA 5BPNA 2P9IA 3BEXA 3VEWA 2ZF5O 2GEMA 4DQ8A 3TU5A 1JCEA 2E1ZA 3O8MA 2HF4A 2PAVA 3W0LA 1SAZA 3WEEA 5AQWA 1BA0A 4PL8A 2A41A 3SMPA 2GUPA 3HSCA 3R9PA 4YDUC 1K8KA 1NGBA 3LDLA 4BRMA 3AAPA 3GBTA 4BRFA 4BQZA 3ATVA 3WQTA 4IO8A 1WUAA 1HKCA 5AQOA 4FWQA 2HF3A 2GWJA 4CZFA 4FOIA 4GY2B 4DCHA 4XH1A 2QWLA 4FWSA 4H5VA 3I8BA 4BGAA 3U9DA 4A61A 2DPNA 1P8ZA 4XEIA 4EIAA 1HKGA 2V7YA 4WYBA 2Q97A 1C0FA 3D2EB 4DHYA 3A5OC 2P9KB 2A42A 3GG4A 3FZKA 2V51B 4XH4A 2QWPA 2J4RA 3LM9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GL1A 1KLNA 4ISEA 4FWOA 4FOEA 4KO0A 4ZTJA 4N41A 1QHTA 5FRMA 3KWGA 3E01A 4JAXA 2F4VK 2IVPA 4CW7B 1C0UA 3D2EA 1B9DA 4W5RA 3KLIA 4DU1A 1B9FA 4AHSA 2X6SA 2KLAA 3LP3A 1RTIA 3AA4A 1RDCA 1RGIA 4YY3K 3K5NA 4FJHA 4E3SA 4KB0A 3VF6A 5B8HA 3PO5A 2VG7A 4DTRA 2O8EB 1QS4A 2RPIA 3L2RA 4LH4A 3V6DA 3EEQA 3FZLA 5BRFA 3CM5A 1F21A 4K41A 4PWDA 1Y97A 1N36K 5M1OA 3F73A 1C6VA 1U4BA 4EHUA 2KW4A 3DWLA 1NGIA 3THXA 4RCHA 1XUPO 4CK2A 2WTUA 3C7NA 4O5FA 1C1CA 4WFBL 2F8TA 3QIPA 3VGMA 3OA9A 4BGBA 4KV8A 5AZJA 2Q0UA 2AJQA 5MLCQ 4CBWA 1VQ5N 1RILA 3AA5X 2RHKA 2A1SA 1GOBA 5C12A 1ZXOA 2A5XA 3F5TA 2YHWA 3NBPA 4R79A 1EKEA 2CH5A 4F8RA 5LY3A 1BHLA 4YNQA 4OKEA 5ADXH 3CF5L 1YF5L 4C8LA 4B3OA 4I2QA 4BRLA 4DU3A 3SQ0A 4DV6K 2WFBA 3PUFA 3V1QA 3VQBA 2P9PB 5KGWA 3AGKA 4DQRA 1X9JA 3CCQN 1VRTA 4M41A 4LD0A 1QTMA 3CCUN 1BI4A 2OPQA 5HRPA 2W42A 4OPJA 3N4QA 4CGJA 3HJFA 3LP2A 3LAKA 1QE1A 2JGUA 4KI6A 1NGHA 3MMVA 1RT6A 1MDUB 2C1IA 4CBUA 1SUQA 3M8SA 1NK4A 3MEGA 1TKXA 3L8BA 2G8IA 4CEBA 4C1NI 4RW9A 3VEVA 5AQUA 2E2QA 3KD5E 2HHTA 4DFMA 4DWIA 1W97L 4CD3A 1OVYA 1BO5O 3L0QA 3V9WA 4JI6K 1ASWA 3I55N 4AQYK 1N33K 4CVNE 2IAJA 5LMNK 1NJIO 3LZJA 3O9UA 4JS4A 2A6AA 1Z05A 2EWSA 2YNGA 3ISNC 4LSLA 2UU9K 3DOLA 3NGYA 3MEEA 1EWQA 4HHTA 1NGFA 1WNSA 2W6LA 1WLJA 2YJEA 4RWTA 2YJFA 5M1QA 3V9SA 4BRIA 2Q2RA 4BC2A 4NYFA 3JYTA 1VQLN 1W9HA 5K14A 3OYHA 5JICA 4EP5A 4PY5A 2OPSA 2BANA 4CZKA 5KRSA 3MX2A 3NH0A 3VQQA 3ZETA 2HNZA 4GKKK 2GWKA 3VMFB 4Z4HA 4JKCA 3FZFA 4PKHA 1SZ2A 4IZ9A 5AQSA 1QVFM 3IDHA 5GADP 5KQ8A 3EN9A 3M1FA 3VEZA 1XNQK 4B3RK 4BR9A 5FLXO 5E41A 1JXEA 3QFUA 4RTFD 5KGXA 3HM9A 4FZYA 3PSIA 4ID1A 4O8UA 3QNOA 5HRRA 2HMIA 3IFRA 5CZ1A 4CJLA 1C1BA 2QTDA 3LDSA 1ZC6A 1U48A 3FE1A 1NKCA 4CZHA 3HI0A 1EETA 3FFKB 5KPRA 3NAEA 4DV7K 4PUOA 3PV8A 3NF6A 3OYNA 3L2QA 3DYAA 3QEIA 5C0YA 3LM2A 1NJYA 1RFQA 3TABA 4H0VB 4YOWA 1HJRA 4DTNA 3QERA 1KVBA 3NGIA 4K0KK 4NCGA 3HK2A 3AVJA 2YHBA 1HUXA 3VQCA 3U3GA 3LDNA 2UUBK 3ZT1A 4CF8A 1IG9A 1HNWK 3WQUA 1TYQB 3HRGA 4J2EA 4HTUA 3QFPA 1T05A 1RTHA 5JLFA 3FZHA 3C6HA 3IS9A 2QWRA 2VWBA 4KH5A 2QWMA 4CERA 5C2DA 1TKTA 4JHDA 2JWKA 2W41A 4FO0A 4OPKA 3LWMA 4TSXA 3D0PA 1QZ6A 4DV4K 4BR0A 4F2SA 3CQYA 1MWMA 5FPMA 3OYKA 3DLGA 3F2KA 4FJGA 4UQGA 4DQPA 3UKRB 3CYMA 1NNEA 4IFEA 4B9SA 4B9UA 4CHPA 5LJVA 3KKSA 4M3UA 1K73O 3OS0A 4CJKA 3OYMA 1SKWA 3O9TA 4PKIA 2P9NB 1WB9A 1VQKN 4WQ5C 4FLVA 1T8EA 2G8WA 2IIRA 4FJIA 4ILJA 4B8CA 4B08A 1XNRK 3HZ6A 4DV2K 3S9HA 4B9TA 4JKGB 4XJXA 5GINA 4A57A 3MEDA 4DV5K 4M3YA 3NF9A 3WXKA 1YHQN 2GX9A 4H8KA 3ZLJA 3SQ2A 4KKOA 3LAMA 1KAYA 3R6MA 3AA2A 4Z4GA 2CH6A 4CCHA 2NUBA 3MECA 3PX6A 2FBYA 1FK9A 3O1BA 1UA0A 1DKGD 4DU4A 4IJAA 3S3OA 4IDHA 4U7BA 1U6ZA 3ULEA 2O8BB 2VG5A 1LV5A 3VESA 4HCCA 5LL6Z 3BUZB 2V52B 4B3MK 3H6EA 4LF5K 3AO2A 2HOEA 3ID6A 4FYDA 1TVRA 1LW0A 1TUUA 3OYEA 4BC5A 3AVIA 1WAJA 4QS9A 4WQ5A 3KD1E 1IG8A 1EQYA 3LWLA 2O8CA 1WSEA 4E89A 1NU0A 4A5BA 1UA1A 3QO9A 4FWMA 3QICA 4DV0K 5C24A 4A59A 1K8KB 1D8YA 4DR7K 1HX1A 2RN2A 3EKUA 4YOTA 1E4GT 2UUCK 4JKEA 3HYFA 3QIOA 1L3SA 3MX5A 1QQCA 1S6PA 1YT3A 3BF3A 4JKAA 3ULDA 3IKMA 3M3ZA 2HHUA 1IKYA 4CGFA 2Z1GA 1KD1O 1RNHA 2YNHA 4XIUA 4KHUA 4QOZB 3O8MA 3K59A 3NHGA 2YKMA 1JL1A 1BA0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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