4RWTA

Structure of actin-lmod complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
ALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIREDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAKSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mechanisms of leiomodin 2-mediated regulation of actin filament in muscle cells.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Actin-5C
total genus 107
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rwtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4rwtA03
1YUWA 4BC4A 1XUPO 3HBTA 2GELA 4BRLA 5LY3A 5LJWA 1BDGA 2AP1A 1IJJA 1BU6O 3MK6A 3SK3A 1TUUA 3QDKA 2FLOA 4H5VA 1CZAN 4IZ9A 3D2EA 2P9KA 2P9PA 1NGBA 4BREA 5AZJB 3BF3A 3BEXA 4H0YB 3WXLA 1J6ZA 3IFRA 3I33A 1KAXA 2QXLA 4BRCA 2E1ZA 4BQLA 2NZTA 3CETA 3D7EO 1JCFA 3UB5A 1NGDA 1RDWX 5AFUA 4ISEA 3AAQA 2QW9A 3O08A 1NGEA 3A5NC 5EVZA 3ZX2A 2GUPA 3ATUA 2HF3A 3FLCO 2UYTA 3JXUA 4FPAA 5AQSA 3VGKA 5KQDA 1SZ2A 3VESA 5F0XA 3MDQA 5E84A 3R6MA 1K8KB 1LOTB 2CH5A 1RGIA 4XH5A 5AFUH 3P4IA 3FR0A 4MLHA 3MMVA 1GLLO 2W41A 4CJ7A 4DQ8A 2Q2RA 3IMXA 3ENHA 4BGAA 4DCHA 3WXJA 3U9ZA 3MN6A 2ZF5O 4B9QA 3MN7A 3HI0A 2E2OA 3ZEUA 3KVGA 3WT0A 1MDUB 4CZHA 1QQMA 4FWMA 3O80A 3R9PA 5AQMA 2ITMA 4CZJA 1Z6RA 4WQ5A 4AM7A 4BR0A 4B1XB 4WQ4A 2ASMA 4ISFA 3KZBA 1MWMA 3LDLA 5EX5A 4IO8A 3JS6A 4BRIA 3LDPA 2BTFA 2CGJA 2VWBA 4A61A 2HMPA 2P9SB 4JD2B 2V7ZA 5FPDA 3FFKB 3D2FA 4BQZA 4A62A 2QWPA 4I6MB 3SJHA 5AQUA 2GWJA 4EHTA 2A3ZA 1U2VB 2P9IA 2P9UB 2F9TA 1MWKA 1NGIA 2FSJA 2E2PA 3B8AX 4PL8A 5BPNA 1S22A 4BVPA 2Q0UA 4Z94A 5ADXA 2ASPA 5BREA 3EKUA 1K8KA 3MN9A 1HKBA 5AQJA 3ULEB 3H45C 5AQLA 1SAZA 1ATSA 4BRMA 3MCPA 4C23A 3FZMA 3UKUB 2V7YA 3C0BA 1HKGA 5AQFA 2HOEA 4FPBA 3H6EA 1NGGA 2Q1NA 4H5RA 2QWLA 3VEXA 5AQRA 4B1WB 2GEMA 3CI5A 5ADXH 3A5OC 3CJ9A 3J8AA 4NO7A 3HSCA 1E4GT 4FOIA 3VPZA 1NBWA 3DAWA 4CI6A 4IJAA 2F9WA 3FZFA 5JLFA 1TYQA 1XQSC 3FZLA 2IVOA 3QB0A 2A40A 4EIAA 3QBWA 1BO5O 4H03B 4BRQA 4CBXA 3VEWA 4M63C 2D1KA 3DXMB 2VYPA 4KBOA 3GG4A 3H1QA 4BGBA 3DJCA 1D4XA 1T6DA 2VCPA 5AZIB 1T6CA 3VEYA 4WQ5C 3HTVA 1NLVA 3VERA 3GE1A 4WQ4C 4CZFA 5AQXA 4EFHA 1NMDA 2KHOA 4I6MA 4BG8A 1GLEG 1EQYA 1BA1A 4CBUA 3UE5A 3AARA 3C7NB 5FPNA 3L0QA 3CJCA 4Y0WA 1BWFO 1ZBSA 3H3OB 1BUPA 3WEEB 2YCHA 4CD3A 3IUCA 3ZETB 5TKYA 3GL1A 1RFQA 3QBXA 4QS9A 3BP8A 3HZ6A 1KXPA 2ZGZA 3UKUA 2ASOA 4RTFD 3CHWA 2E88A 3LM2A 5FPMA 4QS8A 1E4FT 3G25A 3UKRA 1V4SA 1IG8A 1NGHA 4H0OA 4JN4A 1DGKN 3GOIA 5AQPA 4H5NA 1OKJA 1R59O 4K43A 4RWTA 4BRHA 2YI1A 3DXKB 4K41A 5CE3A 2HF4A 3H3NO 1BA0A 1NM1A 3GDQA 4PKIA 4O5FA 1C0FA 4JHDB 2GWKA 2CH6A 3DXMA 5AQNA 4H5TA 3LDNA 3M3ZA 5I9EB 5JLHA 5AZIA 4BC2A 1HX1A 2P9NB 2OANA 4H5WA 5JMVA 2E20A 3RSEB 4PKGA 1GLJO 4K25A 1HUXA 5B8HA 1NWKA 3BF1A 4K42A 4A2AA 4CZLA 4L3QA 5BPLA 5BR9A 3LDOA 1LCUA 5AQQA 5AZJA 3ZX0A 4DB3A 5AQTA 2PBDA 5F2RA 2E8AA 5KPZA 1C0GA 1U6ZA 3BUZB 4QS7A 1QZ6A 1NGAA 2P9LB 2Q97A 4M7YA 5AQKA 3L6QA 3A5MC 5EOYA 3QMLA 3WEEA 1Z05A 4ISGA 3ZX3A 1WUAA 2PAVA 4EHUA 4BROA 2NRHA 3M1FA 4CZGA 4F9OA 3S41A 1BOTO 4XH4A 3VOVA 2GTDA 3D2EB 3O6WA 4PL7A 3VF2A 4JAXA 5AQZA 1SQKA 3VEZA 3VENA 3QICA 2Q31A 4BVOA 4H0TB 1ESVA 3U4LA 3VETA 3W3DA 2E1YA 3DWLA 1JCEA 1YXQA 4FWRA 4CZIA 1X3MA 2E2QA 4H0PA 3WQUA 2CGKA 1QQNA 2FSNA 4BR4A 5BRFA 4JHDA 3VEOA 2YHXA 4CBWA 3CQYA 1MA9B 3L4IA 1H1VA 2QWMA 3EN9A 3CJBA 3O5BA 3RSEA 3FZHA 4FWNA 4O8KA 1X3NA 1DEJA 4IJNA 4BG9A 3VF6A 2A6AA 2IIRA 4B1ZA 2E2NA 4BC5A 4YDUA 1NGFA 5E26A 3WUHA 3F9MA 1GLDG 1DKGD 4MO5A 2P9SA 1GLAG 4JD2A 4RCHA 2P9LA 3LM9A 4LC9B 4BR9A 4CZEA 2CGLA 3FE1A 3EO3A 3ZEUB 4BR2A 3IDHA 1U2VA 4BRFA 3FZKA 2P9UA 2A42A 3CERA 1HLUA 4CD1A 4DHYA 2A41A 2YJEA 3LDQA 3TPQA 4BRDA 4BRAA 3O1WA 4CZKA 2W40A 2V51B 3U9DA 4B1YB 2YHYA 1Q18A 4HTLA 3H46O 3QFUA 4FL9A 4FWQA 2J4RA 3ULEA 2QWRA 3MN5A 5BRDA 1GLBG 3EKSA 1QHAA 2IVPA 2Q0RA 3EL2A 2V52B 1QZ5A 2FXUA 5AQWA 4A2BA 5AQHA 2WUSA 4FWKA 2QWOA 3D2FB 4EAHD 1P8ZA 2EWSA 3LL3A 4HWIA 3WQTA 3WXIA 2P9IB 4FWSA 3EZWA 4WYBA 5AQVA 3ID8A 4GNIA 5AQYA 5BN8A 3VGLA 3HM8A 5KPTA 4MLEA 5F1XA 4XEIA 3KHYA 3R8EA 1ATNA 5BN9A 3VF4A 3SMPA 4BC3A 5JICA 3H1VX 4MO4A 1HKCA 2BUPA 3TU5A 2YHWA 1ZC6A 3AAPA 5ELZA 5EY4A 4BR7A 1S3XA 4H0VB 1ZXOA 4GY2B 2YJFA 2ZWHA 4FSVA 2D0PA 4AM6A 2QWNA 5LJVA 2A5XA 4H0XB 5AR0A 4YDUC 1KAYA 1Y64A 5AQIA 1XC3A 2ZGYA 3C7NA 3CIPA 3CQXA 2H3GX 4IXCA 4JNEA 3CJ7A 1TYQB 3A8YA 1TUYA 5AQGA 5KPRA 3A5LC 1X9JA 1NGCA 2I7PA 1T44A 3ZETA 1HJOA 1WOQA 2NLXA 3WXKA 3OHRA 4FWPA 2Q36A 1KAZA 3SMSA 3W0LA 2FF3B 5BPMA 1GLFO 3CJAA 3ATVA 1HPMA 2D0OA 2P9KB 1G99A 2IVNA 2P9PB 4FWOA 5EXWA 1YVNA 3O1BA 4BRKA 3M6GA 2I7NA 3CJ1A 2QWQA 4BRNA 3VGMA 4E1JA 4NB4A 3O8MA 1ATRA 4IWVA 5FPEA 3DXKA 3U8XA 5BRHA 2DPNA 3O4WA 4BR5A 3I8BA 4FWLA 3FGUA 3QFPA 1NGJA 5AQOA 2D4WA 2P9NA 4FOEA 4J8FA 4B1UB 3GBTA 4PKHA 1QQOA 4FO0A 1YAGA 3UKRB 1BG3A 3VEVA 3SLCA 2FSKA 4XH1A 4B1VA 5KQ8A 1V4TA 2AA4A 3A0IX 3AY9A 2FF6A 1JCGA 3ENOA 4BRPA 4M7XA 4BRGA 4CZMA 1GLCG 2QM1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NCBA 4BY9C 2HW3A 2PY5A 5LY3A 1VSKA 1BDGA 3QEXA 2AP1A 4CGGA 2QEXN 4JKFA 3QIOA 3SK3A 4AHCA 2OYQA 3QDKA 2FLOA 3RMBA 4H5VA 1CZAN 4IZ9A 4CHZA 2P9KA 3RRGA 3ASMA 2NRRA 4JKGA 3S3OA 1NK0A 5CHIA 2IOCA 3H08A 3BF3A 2RF2A 5HRRA 3VQ9A 3IFRA 3O4NA 1KAXA 3JYTA 4A57A 1B9DA 2NZTA 3AGKA 4ELVA 4JI7K 3K2PA 3UIQA 5KGWA 4DTRA 3C95A 2O4GA 3BGRA 3FLCO 2UYTA 3DOKA 5AQSA 2XRIA 3OYDA 3ZSXA 2CH5A 2KKZA 4C8LA 3TAPA 2NRVA 3ZYYX 3MMVA 1L3TA 4LH5A 4DQ8A 4H4OA 4UQGA 4LSNA 4BGAA 3L8BA 3WXJA 3U9ZA 2ZF5O 2OA8A 3MN7A 2E2OA 3WT0A 1KFSA 4OLBA 2C1IA 1S1VA 4AHTA 1DTQA 2UXCK 4CZJA 4CJ3A 4WQ5A 4FJ5A 2FBVA 4Z4CA 1OVYA 3I0RA 4F4KA 1L3UA 4OGCA 3EE8A 3TABA 4LF9K 1MWMA 4CFDA 3SPYA 4DV7K 3SQ4A 4B8CA 3PSFA 4M3UA 4BRIA 4CF8A 2KQ2A 2HMPA 2P9SB 2QKBA 4JD2B 3KK3A 4JKBA 2YHAA 4BQZA 2QWPA 5K14A 4EHTA 3HSTB 4DV3K 4GV9A 2D0AA 3MCAB 1KD1O 1U49A 4YHHK 1MWKA 4I2QA 5FRMA 2FSJA 3QESA 4JK7A 3V9ZA 4LF7K 1KTQA 1FXXA 5AQLA 3SCXA 4BRMA 3MCPA 2W42A 3AVLA 5M1PA 1HKGA 1B92A 3C6TA 4JI1K 3DM2A 4V19S 3VEXA 4O55A 2GEMA 4CEFA 3K5OA 3OJUA 2JWLA 3AV9A 1S1TA 4CI6A 1WAFA 1WSHA 2F9WA 3D0PA 5HLFA 1TYQA 3NFAA 3I55N 1ZBLA 2A40A 4E7IA 3QBWA 4EP5A 2EHGA 3VQPA 1E3MA 3DXMB 2VYPA 3GG4A 3K5MA 4ILJA 4BGBA 4CHQA 1TKTA 3ID6A 1T6DA 2NRZA 3VEYA 4RW6A 3U6FA 1NLVA 2G8IA 4DTPA 2Z1JA 4CZFA 4GVEA 3CF5L 3CCSN 3EZ5A 3ZT3A 1DTTA 4HHTA 5DMRA 4EFHA 2KHOA 4FLZA 2VWKA 4CBUA 3D45A 3C7NB 3WXMB 1HQUA 1VQLN 1U4BA 3Q7BA 3TSPA 1S1UA 4KB1A 2NRXA 1Z25A 1VRTA 2A1SA 2FC0A 4CD3A 4B9LA 3DLRA 4DV0K 1KXPA 1C6VA 3KD5E 3LM2A 4MDAA 5FPMA 1E4FT 1NGHA 4H0OA 4FZXC 1DGKN 3EEQA 5AQPA 3QEPA 4H5NA 2HHUA 4K43A 3VQDA 4E1MA 4BRHA 3LPTA 4DG1A 1RTJA 3H3NO 3TTCA 3GDQA 3ULDA 4PKIA 4O5FA 4CF9A 1TAUA 3DXMA 5AQNA 4IG0A 2P51A 4LF8K 4H5WA 3RSEB 3QO9A 4ID5A 3SV4A 4DSLA 3LALA 1JLAA 2Z1GA 5BR9A 5AQQA 3V9XA 2ZE2A 5CR4A 3OBWA 4EZ9A 2ETJA 4CEEA 5F2RA 5C12A 1C0GA 3AVAA 1QZ6A 2P9LB 4M7YA 1TK0A 5AQKA 3CFRA 2O8EB 4CGFA 3P31A 3QMLA 3K59A 4FLTA 4HVJA 3OYIA 1WUAA 4CZGA 1YITN 1C1BA 3QERA 3S41A 1BOTO 1TAQA 1A5VA 3VOVA 4PL7A 4BDPA 4JAXA 1CXQA 5AQZA 1SQKA 1JLBA 1KCFA 3VEZA 3QICA 4E7JA 3LAKA 3E01A 4AF1A 1KFDA 1S6PA 3N4QA 3J7ZO 3OTOK 2E1YA 4CZIA 4OKKA 3WNEA 1CZ9A 3THVA 3VEOA 4DV2K 3OYNA 1U45A 4FJKA 2P1JA 3L4IA 1H1VA 3V6DA 1N32K 3HM9A 3O5BA 3RSEA 3V4IA 1DEJA 2ITGA 4ELUA 2UU9K 3QLHA 4C1NI 1NJXA 2A6AA 5HRSA 3QEWA 4YDUA 4X62K 4KHNA 1Q86O 4DR4K 2B5JA 1VHXA 5KI6A 4M3TA 2P9LA 2WONA 5HROA 3I8DA 4CZEA 1UA1A 2O8EA 3IDHA 1U2VA 4OPJA 1D9FA 3CFPA 4CD1A 1VQ6N 4IOCL 4M3ZA 2VGMA 3AVKA 3H46O 1RBVA 4FL9A 4FLWA 3ULEA 3NH1A 1HYZA 3AA5X 5BRDA 3TTFA 2D0BA 1ZYQA 2IVPA 4N41A 2FXUA 4I2PA 2WUSA 3ALYA 2HVIA 5SWMA 2QWOA 3D2FB 1IBMK 2D0CA 4DU1A 1YF5L 2YNIA 2G8UA 2PZSA 3I0SA 2P9IB 3KJVA 3EZWA 1QVFM 2KZMA 4N56A 4G1QA 3HM8A 3V1RA 4FLXA 4X65K 4XEIA 3LP2A 3RRHA 4CHNA 2DFEA 3SMPA 4BC3A 1QE1A 4FJIA 1RDAA 2BE2A 4CEBA 1C1AA 3DMJA 1N36K 5EY4A 1TGOA 4H0VB 1YTAA 1ZXOA 4H8KA 3IRXA 4FSVA 4JS5A 3ENBA 3SUPA 1HNWK 2Z1HA 2YX6A 1KAYA 2UUAK 3QEVA 4AH9A 3A8YA 2KW4A 4N47A 2W6KA 4KHWA 1IV0A 1TV6A 1T7PA 1JLCA 3PIPL 2XY5A 4PQUA 2RKIA 4W5TA 4M42A 3SMSA 3V1QA 3W0LA 2FF3B 4R79A 3CJAA 2XY6A 3CCMN 1VSLA 2JGUA 3HPOA 4DR3K 4OJRA 5EXWA 2XO7A 4OPKA 3M6GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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