4WYBA

Structure of the bud6 flank domain in complex with actin
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
367
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structure of a Bud6/Actin Complex Reveals a Novel WH2-like Actin Monomer Recruitment Motif.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 96
structure length 357
sequence length 367
chains with identical sequence C, E, G, I, K, M, O, Q, S, U, X
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4wybA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4wybA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4wybA04
4HWIA 4EAHD 2CH5A 1KXPA 4JD2B 2FSJA 3CJ7A 3IFRA 2YHYA 1RGIA 5KPZA 1GLAG 3M3ZA 3UKUB 4K42A 1ATRA 3LM2A 3FFKB 1H1VA 3F9MA 2GTDA 5AR0A 2YHXA 3CHWA 2Q97A 4XH4A 3VEZA 2D4WA 3FZKA 4WQ4A 5BRFA 3MN9A 5EOYA 4JN4A 5LJWA 5AZJB 2ZGZA 2I7NA 2Q2RA 3BF3A 3GL1A 3VF4A 4BR4A 1HKBA 3O1BA 3H1QA 3ATUA 1NGHA 2D0OA 1NGCA 2YJEA 1XQSC 4FWOA 3IMXA 3G25A 3VGKA 4H5VA 5FPEA 4MLHA 1BA1A 3IUCA 3MDQA 3WXIA 1MWKA 4YDUA 3BUZB 2YI1A 3ULEB 4B9QA 3D2FB 4J8FA 2YJFA 3MMVA 1ZXOA 2DPNA 3LM9A 3MN5A 3WXLA 4M63C 5EX5A 4CZLA 3LL3A 4QS7A 1ATNA 4BVOA 3VENA 4CZIA 4K25A 5AQRA 3CJCA 1E4GT 3C0BA 5CE3A 1MDUB 3MN7A 3FGUA 1HKGA 3O8MA 3L4IA 3LDQA 3M6GA 5BR9A 5ADXA 3QMLA 3RSEA 3L0QA 2UYTA 5E84A 5AQZA 3MCPA 4IZ9A 3DJCA 4O8KA 1HUXA 3ENOA 5AQUA 3U8XA 3H3OB 3VERA 3GOIA 1RDWX 2GELA 2IIRA 4I6MB 2CGKA 2ASPA 3FZFA 4FWPA 1ZC6A 5AFUH 2FSKA 3QBXA 4E1JA 3AARA 3BEXA 5KPRA 1T6CA 4B1YB 3A8YA 2E8AA 1TYQB 2E2QA 4DHYA 4GNIA 3DXKA 2ZWHA 4CZEA 2FSNA 3O80A 2E2PA 4FPBA 2QWRA 4H0OA 5AQOA 1XC3A 5JLHA 2HF4A 3VEYA 1WUAA 2IVNA 2QWOA 5AQTA 3O6WA 5AQIA 4QS9A 2BUPA 4BQZA 1BOTO 5AQJA 2CGJA 3D2FA 1GLJO 2P9LB 3H46O 3O4WA 5AQSA 1S3XA 4A2AA 4A61A 1Q18A 4WQ5C 5BRDA 2Q0UA 3VF6A 2P9PB 5AQXA 4BRMA 3CETA 4B1ZA 1NMDA 4CJ7A 5BN9A 1YVNA 1P8ZA 4BQLA 2A40A 2CGLA 1BUPA 2V7YA 3EKSA 1JCFA 4FWRA 1QQMA 5B8HA 4BR7A 4DCHA 1DEJA 4B1WB 3DXMA 3WEEA 3UB5A 1TUUA 1ZBSA 2E2OA 3GE1A 4BG9A 1NGDA 4K41A 4MO4A 1KAYA 2PAVA 4BGBA 3UE5A 4B1XB 1NLVA 4BRPA 4DB3A 4I6MA 3VEXA 1YUWA 1WOQA 1T6DA 2E2NA 1V4TA 2A41A 4BC4A 3RSEB 5KQDA 3ENHA 1NGGA 2GEMA 3A5MC 1BA0A 1BO5O 1NGJA 4BVPA 4FWKA 2ZF5O 1TYQA 2BTFA 3O08A 3FR0A 3EL2A 3S41A 4XEIA 4WQ5A 3ZEUB 5AFUA 4H0PA 2P9SB 4BRCA 3SK3A 4CZFA 2KHOA 1QZ6A 1NM1A 4CZGA 1GLCG 4BRQA 2P9LA 4C23A 3DXKB 5AQFA 3EO3A 4H0TB 2QWPA 4H0XB 2P9PA 1X3MA 3KVGA 3C7NA 2YCHA 3SMSA 3I33A 2GWKA 3VOVA 5AQHA 4CD3A 1OKJA 1E4FT 4HTLA 3JS6A 1ATSA 4MO5A 4H0VB 5LY3A 4BC2A 2E1ZA 5AQPA 3MK6A 2Q1NA 3GG4A 2Q31A 1NGAA 3VEWA 1K8KA 1BDGA 1TUYA 4PL7A 4QS8A 1BU6O 3QDKA 5EXWA 4BR0A 1DGKN 1Z05A 2GWJA 3ID8A 3FZLA 4EIAA 1SAZA 5BREA 3DXMB 1V4SA 3QFPA 3WEEB 2NRHA 3D2EB 4KBOA 5JICA 2V51B 2Q36A 3HM8A 3QBWA 4H0YB 3R8EA 3A5OC 4CZMA 4H5RA 3U9ZA 4H5WA 3FE1A 3HBTA 4BRHA 4BRIA 2QM1A 3ZEUA 1CZAN 2P9SA 1RFQA 4GY2B 4BRNA 2V52B 4MLEA 4M7YA 3H6EA 5AQVA 1BG3A 1NGEA 2P9KA 4CZHA 1X9JA 3O5BA 3WUHA 3VGMA 2HF3A 4FOIA 4ISGA 4IJNA 3WXJA 3VF2A 1Z6RA 3CIPA 3H45C 3DWLA 2H3GX 2QWMA 4XH5A 2P9UB 4K43A 4JNEA 3B8AX 3P4IA 5I9EB 4FSVA 4PKHA 1ESVA 4BR9A 2P9NA 2V7ZA 2PBDA 3HZ6A 4RCHA 1LOTB 5KPTA 4DQ8A 2QW9A 3C7NB 4CI6A 4EHUA 2OANA 5AQKA 5FPDA 3ATVA 4H5NA 1EQYA 2FF3B 3R6MA 3WT0A 3GBTA 3J8AA 5AQYA 3M1FA 3ZX2A 1C0FA 3VETA 3R9PA 3QICA 4BR5A 1GLFO 4FOEA 3D2EA 3GDQA 1K8KB 3VEVA 1C0GA 1IJJA 5AQMA 3DAWA 2VCPA 1NGBA 3QB0A 2ZGYA 4XH1A 3TPQA 1GLBG 1IG8A 4F9OA 2FLOA 1XUPO 3ZETB 3CJBA 3L6QA 1NGFA 3IDHA 4EHTA 1HLUA 4L3QA 2ASOA 2NZTA 3EZWA 5F2RA 4AM7A 4AM6A 2D1KA 4ISFA 2J4RA 4A62A 2P9IB 5AZIA 2I7PA 1DKGD 3H1VX 3HTVA 1NBWA 1G99A 5F1XA 2P9UA 2EWSA 4A2BA 2D0PA 3UKRB 2YHWA 2P9KB 1NWKA 2AA4A 3CJ9A 2QWLA 3LDPA 5BN8A 1HX1A 3SJHA 1GLEG 3VGLA 4CBWA 5BPLA 3W3DA 2HOEA 4Y0WA 2GUPA 3VPZA 3U9DA 2E20A 3W0LA 1HKCA 5EVZA 5JLFA 4IO8A 4JHDB 4PKGA 3MN6A 4BGAA 2NLXA 2FF6A 3KHYA 2P9NB 5BPNA 4FWQA 4CZJA 3H3NO 4FL9A 5FPMA 1YXQA 2VYPA 4CD1A 3A5NC 4RTFD 3LDLA 5FPNA 1QHAA 3BF1A 3O1WA 4IJAA 4JAXA 2ITMA 3WQTA 2A3ZA 5TKYA 4BC5A 4FWNA 3FLCO 1NGIA 5KQ8A 4EFHA 4CZKA 4ISEA 2W41A 2A6AA 4RWTA 3VESA 3U4LA 1R59O 2HMPA 3FZHA 3OHRA 4BRLA 1S22A 1U2VB 3FZMA 4BRAA 3CQXA 4BG8A 3ZETA 2VWBA 4BR2A 3SLCA 4BRGA 3LDNA 4NO7A 5BRHA 1JCGA 2A42A 3CERA 3EKUA 4CBUA 1SQKA 1QQNA 2P9IA 4H03B 4JD2A 4BC3A 1KAXA 4FWMA 4FWLA 1JCEA 3AAPA 1T44A 2QXLA 3I8BA 5BPMA 1HPMA 4Z94A 3UKRA 3UKUA 1MA9B 3CJ1A 2WUSA 3HI0A 3D7EO 4BRKA 3ZX0A 1KAZA 4B1UB 2E1YA 2W40A 3AAQA 4LC9B 5AZIB 1Y64A 1SZ2A 2FXUA 3WQUA 1QQOA 2F9TA 2Q0RA 3KZBA 2E88A 3CQYA 4FPAA 5AQNA 1HJOA 4NB4A 5AZJA 3EN9A 1LCUA 4JHDA 4PL8A 1YAGA 3ZX3A 3BP8A 3TU5A 1U6ZA 4BRFA 2IVOA 5AQLA 4O5FA 4PKIA 4B1VA 1GLLO 2CH6A 3A5LC 1X3NA 3AY9A 4FWSA 3A0IX 5E26A 4WQ4C 3SMPA 5F0XA 3ULEA 1BWFO 1MWMA 4H5TA 3JXUA 2AP1A 4WYBA 2QWQA 3WXKA 1U2VA 4IXCA 2QWNA 5JMVA 3VEOA 5AQGA 1GLDG 2ASMA 1J6ZA 4FO0A 4BRDA 5EY4A 4IWVA 3HSCA 2IVPA 1QZ5A 5ELZA 3QFUA 3LDOA 2A5XA 3CI5A 3CJAA 4CBXA 5LJVA 5AQQA 4BREA 1D4XA 4BROA 2F9WA 4M7XA 5ADXH 4YDUC 5AQWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RVCA 3T3FA 5FDLA 2CH5A 3PV8A 1KXPA 4FK4A 5I42A 5DK5A 1UOCA 5HROA 3AA2A 4JI3K 4DWIA 4FJMA 1S1WA 4HVJA 5IWAK 3UKUB 3NDKA 3F9MA 1XI1A 5JENA 2GTDA 1O1WA 2YHXA 3CHWA 4IG0A 3DLLL 4XH4A 3KD5E 3G10A 3FZKA 4UQGA 5EOYA 1VSJA 4I9LA 3NGYA 3ITHA 5AZJB 3KTQA 1NG9A 2F8TA 1MU2A 4BEBA 1JXEA 2GUIA 4HCBA 4AQYK 2I7NA 4E1MA 1HKBA 1YITN 1NGCA 1JKHA 1HPZA 2F96A 3HOSA 5TKWA 4I2PA 1Q7YO 5FPEA 4MLHA 3MDQA 1WLJA 1VSHA 4JKGA 3RWUA 4YDUA 1YTAA 3BUZB 3HP6A 1KLNA 1SL1A 1VSMA 4N41A 1S6PA 2YJFA 4ELUA 1NJXA 2D5RA 3NH0A 2NRVA 1TV6A 4CHZA 1RTIA 3HP9A 4CZLA 4BVOA 4GV6A 3VENA 4KHSA 2XHBA 4K25A 5AQRA 5CE3A 4B9MA 4FVUA 4KAZA 1HKGA 4DTSA 1WNSA 4HUGA 3E9OA 3P38A 1UAXA 3MXMA 4KO0A 3AVHA 2F7TA 5E84A 2UYTA 3MCPA 4IZ9A 3DJCA 4YHHK 3SUQA 4JKDA 4JKCA 1VSEA 4CHQA 3U8XA 3GOIA 4FM1A 2JGUA 4EZ9A 2IIRA 4M3TA 2O8DA 4FWPA 3V1OA 1NJYA 3THXB 4CEBA 4E1JA 3AARA 1BISA 5GADP 5KPRA 4CJEA 1KQSM 2DFFA 3A8YA 3E9LA 4Y1CA 1NNEA 4GNIA 3DXKA 5E41A 1J5EK 4O4GA 3IS9A 1NMNA 2E2PA 4CIGA 2QWRA 4H0OA 4W5QA 3D0PA 1XC3A 5C42A 1HYVA 3TWHA 4FVMA 3O6WA 4DU1A 1Z25A 3N4PA 1HNWK 1BOTO 2QEXN 1HNZK 4DQPA 4A61A 4DQQA 1JLFA 3TAPA 1Q18A 4WQ5C 4F2SA 2Q0UA 2O8BB 3CETA 2P5GA 1NMDA 5BN9A 1UWBA 1P8ZA 2WTUA 4DG1A 3PUFA 2CGLA 4FJGA 1BUPA 3OA9A 1JLCA 4OKEA 1C1CA 3VMFB 4JI7K 4JKBA 3DXMA 3U3YA 4DS4A 3UB5A 4DR1K 4BE0A 1ZBSA 1D9FA 4KREA 4BGBA 3UE5A 4BRPA 1J5OA 4I6MA 3S3MA 3SAHA 4J2DA 2E2NA 1V4TA 2A41A 4IKFA 1RT3A 1L3UA 5K14A 4CFBA 2GEMA 2XY8A 4DR2K 2YHAA 3C6HA 1KCFA 4YORA 1TYQA 3L2WA 4HUEA 3EL2A 3ZEUB 3HVRA 3NHGA 2P9SB 4CZFA 2KKZA 3AVFA 4CZGA 3NE6A 4CFDA 4IDHA 4BRQA 4LH4A 1B92A 4WE1A 4NLBA 4GKKK 2QWPA 4Q5VA 1R0AA 3AVGA 1SKSA 1DLOA 2HHVA 3SMSA 4BWJA 2WONA 3OYGA 3BZCA 1VK0A 4IEIA 3JS6A 4MO5A 4H0VB 4E19A 4BC2A 1Q9YA 4XIUA 2Q1NA 1U47A 4PUOA 1NGAA 1RTHA 3VQCA 2BGGA 3VN5A 4QS8A 3NGIA 1RT5A 3KD1E 1NJIO 3DLHA 3AA3A 2GX9A 2UXBK 4KBOA 3HM8A 1S72N 3A5OC 4CZMA 4YOXA 5CYMA 3OW2M 3FE1A 4U67L 2O8CA 4Z4FA 4Z0UA 4GY2B 1TK5A 1ZBLA 3F5TA 3C95A 1BG3A 5FLXO 1NGEA 4CHNA 4Z4IA 3I55N 2HF3A 2G8WA 3VA0A 3K59A 1E3MA 2OZSA 1RBTA 4FM0A 4CJPA 3DWLA 3O9TA 1EO1A 2P9UB 4JI5K 4JNEA 4FSVA 4CIEA 3HM9A 4NCGA 3V9ZA 4RCHA 3HXMA 3OYFA 4DQ8A 3C7NB 2WOMA 5FPDA 2FF3B 3R6MA 3SPYA 3WT0A 4F8RA 5HOOA 3ZX2A 1T3VA 3O9UA 4CIFA 4BR5A 1GLFO 3VQAA 3T7ZA 1X9MA 4NLCA 1IJJA 3DAWA 4MDAA 3L2VA 1NGBA 1XC9A 4F2RA 5MLCQ 3QB0A 3D6RA 1L3SA 3LP2A 1IG8A 1TVRA 3K9JA 2FLOA 3ZETB 3CJBA 1NGFA 3WNEA 4FLXA 1S1TA 1HLUA 1FKOA 4DQSA 4A62A 4FLUA 4CK3A 5AZIA 4O0IA 4KH6A 3HTVA 2HVIA 1QVFM 2EWSA 3UKRB 1NK0A 2P9KB 1NWKA 2AA4A 3LDPA 1W7AA 3G71N 5BN8A 2HBMA 1GLEG 1EXQA 4CBWA 3W3DA 2HOEA 1N5YA 1NK5A 1VQPN 4KHYA 1N6QA 4O44A 3UIQA 4ZTJA 2E20A 3TTCA 3W0LA 3SUOA 2E6MA 4IO8A 4PKGA 2FBTA 4BGAA 1WAJA 2VWJA 2HBJA 4A59A 3BGRA 4W5NA 1Q82O 4FZYA 4FL9A 3Q7BA 4LF9K 4Z4CA 4DV6K 3TAQA 2P1JA 1O13A 4RTFD 4PWDA 3LDLA 3PO4A 1L5UA 3NGZA 1ZYQA 3RR8A 3I0RA 1TK0A 3ZT3A 4YOTA 4EFHA 3T19A 1XNRK 1R59O 3OYAA 3CCJN 1VAZA 2C1IA 1C0UA 3RMCA 1XMOK 2VWBA 4LFBK 1YJ9N 2HNZA 5BRHA 4CBUA 3EKUA 1QQNA 4X64K 4H03B 4BC3A 4DF8A 2HBKA 4FWMA 3OYKA 1VQ5N 4FWLA 3AAPA 3LP3A 3KLFA 2QXLA 3SQ0A 2GBZA 4Z94A 3UKUA 3L4QA 3OJUA 4G9ZA 3HI0A 2KQ2A 2E1YA 2W40A 3NH2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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