4XEIA

Orthorhombic isomorph of bovine arp2/3 complex
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
415
structure length
400
Chain Sequence
MAGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Crystals of the Arp2/3 complex in two new space groups with structural information about actin-related protein 2 and potential WASP binding sites.
pubmed doi rcsb
total genus 102
structure length 400
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4xeiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xeiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xeiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4xeiA04
3U8XA 5TKYA 3O8MA 3EO3A 2P9LB 1GLEG 3ZETB 3TU5A 3ZEUA 5AQVA 1CZAN 3C7NB 1NGDA 2ASMA 2FF3B 2QWLA 2AA4A 3H6EA 2FSNA 2P9KB 3A5OC 1T6CA 3WT0A 2P9UA 2I7NA 1KXPA 4FL9A 5I9EB 2QWMA 5ELZA 5KPZA 3O08A 4C23A 2E8AA 5AQRA 3UKUB 3ZX3A 3C0BA 2HF3A 4BC5A 4WQ5A 2E20A 3MN6A 4BQZA 2ITMA 4K25A 3O80A 4BQLA 1BUPA 4H5NA 2P9IA 3CQXA 5AR0A 3VGLA 5KQDA 4FPBA 4MLEA 4CZJA 3A8YA 2GUPA 4BRCA 4PKIA 3CETA 3AAPA 3EKUA 5E84A 1RGIA 1TYQA 3WEEB 2GTDA 5BPMA 5EOYA 4PKHA 1BA1A 1QHAA 3SMPA 4NO7A 4CZKA 1GLAG 2CH5A 4FWQA 5F0XA 4FOIA 3R6MA 1X3NA 3EZWA 5AQMA 3GL1A 2Q2RA 2BUPA 5BPNA 1NMDA 3VETA 4HTLA 4Z94A 3JXUA 5LJVA 4PKGA 1BG3A 3FZMA 4RWTA 2Q36A 2QWOA 4FWSA 4WQ4A 4XH1A 4H5VA 3VEOA 3ZEUB 1WOQA 4MO4A 3LDQA 5EX5A 3GOIA 3I33A 3LDPA 5BRHA 1QQOA 3FE1A 1X9JA 3A5MC 3WXJA 4QS9A 1RFQA 3HTVA 2CGLA 3ATVA 5AQOA 3DAWA 4BG8A 3CQYA 3QFPA 2P9UB 4I6MB 4B1ZA 4FSVA 1WUAA 5AQLA 4BR4A 3H45C 1MWKA 5AQTA 5AQKA 2H3GX 4CBUA 4CZLA 1KAYA 3FR0A 1G99A 2FF6A 2ZGZA 2D0OA 3BP8A 2D0PA 2P9IB 4M7YA 2Q31A 4JD2A 1KAXA 4H0VB 4ISEA 1NGJA 4B1YB 2HMPA 1C0FA 4XH4A 1H1VA 1SZ2A 2HF4A 1HLUA 4H0PA 5AFUH 3U9ZA 2Q97A 4CZHA 1EQYA 1LOTB 3HZ6A 1DGKN 3IMXA 2NRHA 3I8BA 3G25A 5BRFA 3CJ7A 2ZGYA 1TYQB 1QQNA 3DXKA 4BR2A 1NM1A 3DXMA 4BREA 3EN9A 3CJAA 3M3ZA 4AM6A 3WQUA 5AZJA 3CJCA 5JLFA 4MO5A 3JS6A 3LM9A 3BEXA 4WYBA 1BOTO 3CJBA 1R59O 2WUSA 1ATNA 4BC3A 3LDNA 3QFUA 4B1UB 4EFHA 4J8FA 4IXCA 2KHOA 2D4WA 5E26A 3AAQA 5AQPA 4YDUA 4LC9B 1X3MA 3MK6A 4H03B 5AZIA 3WXKA 4BRHA 5F1XA 1QZ6A 1HUXA 3D2FA 5JICA 4GY2B 4IJAA 5LY3A 3MDQA 5EXWA 1MWMA 4H0OA 3VEVA 2E2OA 3IDHA 4BGAA 1V4SA 3KZBA 3MN9A 3O5BA 2F9WA 4FPAA 3W0LA 1NGFA 3ENOA 3QMLA 4BVPA 1BO5O 1SAZA 3GG4A 1J6ZA 3CJ1A 2Q0RA 3L4IA 1GLDG 4BC4A 4DB3A 4FWKA 2IVPA 2VCPA 1GLBG 3DWLA 3L0QA 1C0GA 2ASPA 5FPEA 4DQ8A 3WUHA 1Y64A 4JD2B 2GWKA 1YAGA 5ADXH 4XH5A 4NB4A 4BRMA 1U2VA 5BREA 3WXLA 2FSKA 1IG8A 3RSEA 1GLLO 3TPQA 3KHYA 3MCPA 1E4FT 2P9SA 2VYPA 4EHUA 3BF1A 4BROA 3H3OB 1JCFA 1YUWA 5BR9A 3DXMB 1D4XA 2DPNA 4BRPA 5AZJB 3VEXA 1HKCA 4H0XB 1ESVA 4DHYA 1XQSC 5AQXA 2V51B 3CI5A 3VOVA 2W41A 4M7XA 4H0YB 4Y0WA 2IVOA 1NGIA 3D2EA 3SMSA 4BG9A 4PL7A 2UYTA 2V7YA 1JCGA 3M6GA 1U6ZA 1TUUA 2J4RA 2QM1A 3P4IA 3D2FB 4AM7A 1Z6RA 5B8HA 1ZBSA 3DJCA 3R9PA 1Z05A 3FGUA 5AQUA 2QWPA 5ADXA 4JAXA 4RTFD 5LJWA 3F9MA 4BC2A 4O5FA 3U9DA 4JNEA 4BRIA 3LDOA 3UE5A 4CD1A 4H5WA 3VESA 1S22A 3UKRA 4EAHD 1QQMA 1V4TA 1DKGD 2E2NA 3KVGA 5FPMA 2P9PA 5CE3A 2I7PA 2A42A 1HX1A 1QZ5A 2CGJA 1U2VB 4CZIA 1NGAA 4DCHA 3WXIA 1K8KA 1YXQA 3RSEB 1BU6O 4BRFA 4F9OA 2CGKA 3H3NO 4B1XB 2EWSA 3LL3A 3OHRA 4IWVA 1XUPO 1NWKA 1GLJO 3O1BA 2P9SB 3A5NC 3R8EA 1Q18A 2F9TA 4CJ7A 4A61A 2FXUA 2IIRA 4A2AA 1T6DA 4CI6A 4FWOA 2FLOA 1GLCG 4BR5A 2E88A 3VERA 4BRDA 2QWRA 4PL8A 3WQTA 5EVZA 2BTFA 3ATUA 3LM2A 3MMVA 5AQIA 4CZEA 3H1QA 3SJHA 4M63C 4HWIA 2A3ZA 2E2PA 2YHYA 3D2EB 4XEIA 3CIPA 3ENHA 4FWPA 2W40A 3CHWA 4FO0A 3VGMA 2E2QA 3W3DA 2P9NA 3H46O 4K42A 3SK3A 1TUYA 4FWRA 3VF4A 4KBOA 5FPDA 2ZF5O 1BA0A 2A5XA 1P8ZA 5AFUA 3L6QA 5JMVA 3AY9A 3ULEA 4K43A 1NLVA 2YHWA 3FZHA 2D1KA 4BRLA 2OANA 4WQ4C 4A2BA 3BUZB 4GNIA 4CZFA 1GLFO 4CZMA 4I6MA 2YCHA 4QS7A 4EIAA 3UKRB 5AQGA 2A6AA 3VGKA 3S41A 3A0IX 3ZX2A 3IFRA 2P9PB 4JHDA 3BF3A 1NGGA 3O6WA 1KAZA 1HKGA 4ISGA 3CERA 1OKJA 3ID8A 1HKBA 4O8KA 3UB5A 3QDKA 3QBWA 1K8KB 3DXKB 2ZWHA 3QICA 5AQYA 5FPNA 4BVOA 5AQFA 3VEZA 1MDUB 1SQKA 2Q0UA 4L3QA 5EY4A 4CBXA 5AQQA 3VF6A 5BPLA 3EL2A 3D7EO 3VEWA 4A62A 3VEYA 5F2RA 4BRQA 1NGCA 3O1WA 3B8AX 2HOEA 4IJNA 5JLHA 3HBTA 1T44A 5BN8A 3O4WA 4BR9A 2QW9A 4QS8A 3ZX0A 4B1VA 3MN7A 4H5RA 4FWMA 4BR0A 1MA9B 5AZIB 1E4GT 3HM8A 1BDGA 5KQ8A 2P9LA 3ZETA 2YHXA 3VPZA 4E1JA 2AP1A 2GEMA 3FZFA 1NGBA 5BN9A 1NBWA 3VENA 3C7NA 4FWNA 1LCUA 2P9NB 4BGBA 4H5TA 2QWNA 2Q1NA 4IZ9A 4BRAA 3FFKB 5AQJA 2A41A 5AQWA 4B9QA 5AQSA 5AQNA 2P9KA 5AQHA 4CZGA 4RCHA 3MN5A 1ATSA 3ULEB 1ZC6A 1BWFO 2QXLA 3CJ9A 4ISFA 4FOEA 4BRNA 4YDUC 4H0TB 3LDLA 3UKUA 3U4LA 1RDWX 1S3XA 1NGEA 2NLXA 4FWLA 3QB0A 1XC3A 3AARA 4JHDB 1DEJA 3SLCA 4JN4A 3H1VX 2PBDA 2YI1A 3FZKA 5KPTA 2E1ZA 2GELA 4IO8A 3EKSA 2V7ZA 1ATRA 2YJEA 4EHTA 4WQ5C 3HI0A 1ZXOA 3GBTA 4MLHA 2VWBA 4BR7A 5AQZA 1JCEA 2GWJA 3HSCA 3WEEA 2E1YA 4B1WB 2CH6A 2QWQA 2V52B 2PAVA 3FLCO 2YJFA 3J8AA 1YVNA 3GDQA 3QBXA 1HPMA 2ASOA 5BRDA 5KPRA 3FZLA 3M1FA 2NZTA 4CD3A 2A40A 1IJJA 2FSJA 4CBWA 2IVNA 3IUCA 3VF2A 3A5LC 4BRKA 4K41A 1NGHA 3GE1A 4BRGA 1HJOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TTCA 5TKYA 1ZYQA 3EO3A 2P9LB 1BI4A 3NVMA 4KH4A 2UXDK 4DS4A 1S1WA 3PX4A 3VQ5A 1NGDA 2HHVA 2DFEA 2AA4A 4CGGA 3ZLJA 1K9MO 3A5OC 3IRXA 3G71N 4YOUA 3SV3A 2ETJA 1KXPA 2OPSA 3AVNA 5ELZA 3HJFA 3SBTA 3TARA 5KPZA 3L2VA 1VQLN 3ZX3A 3CMAN 1JLBA 1QE1A 3CPWM 2PYLA 1KD1O 3DRPA 2X78A 4FJHA 4RW6A 1MU2A 1VSKA 4BQLA 4IEEA 3CQXA 5AR0A 2UUBK 5KQDA 2HVHA 4FPBA 5C42A 3TAFA 1HYZA 4LH5A 1BGXT 1JLAA 3AAPA 3NMUA 5E84A 2QXFA 5DMRA 5M1KA 2GTDA 5BPMA 4Q0BA 4GMJB 3TR8A 1BA1A 1QHAA 4J2AA 4B9MA 1YTAA 3I0SA 3R6MA 1X3NA 4CJLA 2QKKA 3MEEA 4A5BA 4KTQA 1S9GA 1KCFA 4E1NA 1LW2A 3GL1A 4CK2A 5BR8K 4UY8O 4OX9K 4KHNA 3AVMA 1BG3A 3SPZA 3TABA 2KW4A 3ZSYA 3VQCA 4DV0K 1WOQA 4MO4A 5C15A 3S9HA 4AHVA 3ISNC 4O0JA 4GV9A 1QQOA 1EKEA 3WXJA 4QS9A 4WFBL 2B6AA 3HTVA 1CXUA 2CGLA 2EX3A 4BG8A 1HRHA 1NK8A 1D5AA 4I6MB 1WLJA 4B1ZA 3PV8A 5CHIA 5HROA 5AQLA 1ZBIA 4BR4A 4WCEL 4DWIA 4XJXA 1C0TA 3SCXA 1CLQA 3CF5L 1S1UA 4JYAK 3K5OA 1VQ6N 3OYHA 4JI0K 2FF6A 3KLFA 3O3FA 1IKYA 4CJWA 4FJJA 2IS3A 4FVUA 4M7YA 4B3MK 2A1SA 4ISEA 4OO1J 1RT7A 2GX9A 4XH4A 1HLUA 4JRPA 4CZHA 2KKZA 3HZ6A 3SQ0A 1EP4A 2NRHA 3I8BA 5HBMA 1U45A 1CXQA 2RPIA 3DXKA 1WN7A 4E7JA 2Y1JA 2XY8A 4F8RA 1EWQA 3WNEA 5AZJA 3CJCA 3OYLA 4MO5A 3JS6A 3CCEN 3THVA 4YOWA 3TAEA 3C6TA 4DV3K 1UAXA 4YHHK 3L3UA 3JAMO 4B1UB 4EFHA 4J8FA 1IKXA 3ZT2A 3CCSN 3AAQA 2NRXA 1LWEA 3MK6A 4BE7B 3CM5A 1W7AA 2HBMA 4M41A 4QAGA 3TWHA 4JKGA 4GV6A 5EXWA 1RDDA 4FZZA 2W00A 3NE6A 4BY9C 3KZBA 3K59A 3CC7N 2QK9A 1Q81O 1RTIA 4JI2K 1P90A 4X65K 3W0LA 4Z4FA 1JLQA 4JI3K 1SAZA 3MXJA 1J6ZA 1Y97A 2Q0RA 1GLDG 4MDBA 4DB3A 2VCPA 3VQ6A 1GLBG 3VA3A 1C0GA 4DQ8A 4JD2B 1YAGA 3BZKA 4JI4K 3B6OA 4XH5A 4BRMA 1U2VA 1RT1A 2FSKA 3QLHA 4KKOA 1K73O 3RSEA 1J54A 4X64K 3MCPA 2P9SA 4EHUA 3BF1A 1TVRA 5HLFA 4PWDA 4IG0A 1R0AA 4W5TA 2QI2A 1TKDA 4CHYA 1ASVA 3CMEN 1QTMA 4DSKA 2DPNA 3VEXA 2HBJA 4JEPA 4HUFA 3CYGA 4H0XB 3CI5A 5C25A 4ELVA 2KLAA 2WBNA 1VAZA 4E7HA 3VOVA 2W41A 4KB0A 3TAQA 1NGIA 3D2EA 3DM2A 4DR4K 3SMSA 4PL7A 4JK7A 3N4QA 2FC0A 2LSNA 4JI5K 2G8FA 2J4RA 2QM1A 4C8NA 2UU9K 1NK9A 1OH5A 2OZMA 1TGOA 3FGUA 4CEQA 5ADXA 4CHZA 5LJWA 1LW0A 4OPAA 3V9SA 3U9DA 4FJIA 4KRFA 4CD1A 4H5WA 1W9HA 1QQMA 1V4TA 1JLGA 3KD5E 3CCRN 2E5LK 4PQUA 5CE3A 3DOLA 1BHLA 4DV6K 4FLXA 1HX1A 3KLIA 1C1CA 5M1NA 1LAWA 1K8KA 1WSGA 3ZYYX 1BU6O 4ZTFA 2CGKA 5CYQA 1S5JA 3NGYA 1ZBUA 1GLJO 3A5NC 3R8EA 4CK1A 5GINA 4U7BA 1U48A 2FXUA 2NNWA 3IS9A 1FW6A 4DR6K 3LAKA 5JENA 2XY7A 4JI1K 4KHWA 3AA4A 3N4PA 3EYZA 4PL8A 3WQTA 3HT3A 1B9DA 4BECA 4OGCA 1KSPA 3K58A 4CZEA 1Q8IA 4BACA 4M63C 3DLKA 4HWIA 4CJKA 2YHYA 3RTVA 4XEIA 4I9QA 1LV5A 3CIPA 3ENHA 1NMNA 3R3LA 1VHXA 3THWB 4W5OA 3KLHA 3TTDA 3VGMA 2E2QA 4DS5A 3DLBA 1TUYA 4FK0A 5FPDA 2A5XA 4DSJA 3RVCA 5JMVA 1IBKK 3AY9A 3D0PA 4E1MA 2YHWA 1HNXK 4YOVA 2UXBK 3FZHA 1JLFA 2D1KA 4E0DA 4BRLA 1L3VA 2X74A 2DTUA 1JL2A 1GLFO 4CZMA 2YCHA 3L4QA 1IO2A 4QS7A 3C95A 4FW1A 3S41A 3KK2A 1IG9A 2P9PB 4JHDA 4KAZA 2JGUA 3SQ1A 4YOTA 3CERA 4NCAA 3ID8A 3QBWA 4AHUA 4N41A 4AHCA 5FPNA 3VQEA 2XO7A 3DLRA 4GV3A 1MDUB 3TAGA 1SQKA 1WSHA 1VSIA 5BPLA 5KRSA 1VSDA 4C1NI 1SKRA 3D7EO 4WF9L 3LWLA 2HSTA 5DM6L 3NH1A 3VEYA 4IOCL 1TKXA 1T7PA 4NXNK 4IJNA 3I55N 1FJGK 2Z1GA 5BN8A 4X66K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3K9J A;  3OHR A;  4DR5 K;  3B6P A;  4CJP A;  4CVN E;  2F9T A;  4FJG A;  5CZ2 A;  5J1E A;  5FRM A;  2XRI A;  4G9Z A;  1T6D A;  1IH7 A;  2ZJR L;  3AO1 A;  4B8A B;  4BR5 A;  4U67 L;  4BRD A;  4WFN L;  4E72 A;  5KRT A;  3J7Y P;  1RT6 A;  3V9X A;  2F8T A;  2BTF A;  3ATU A;  2OPQ A;  3MMV A;  3SJH A;  3L2Q A;  3TSP A;  2A3Z A;  4LSL A;  2E2P A;  2G8U A;  3PX0 A;  3NGI A;  3L2W A;  3ITH A;  4FWP A;  3HPG A;  2W40 A;  4FO0 A;  3CHW A;  1VQ9 N;  4LH4 A;  4FZX C;  3H46 O;  4K42 A;  3ZT0 A;  4FWR A;  3VF4 A;  1K8A O;  3MEG A;  4B9V A;  1BA0 A;  3V9W A;  3AVK A;  5EU7 A;  3C6H A;  1HYS A;  4O5B A;  1NKC A;  4K43 A;  1NG9 A;  4ELU A;  4F2R A;  3BUZ B;  1QHT A;  3T1A A;  2HHQ A;  4CJU A;  3OYI A;  3QET A;  3RRG A;  5AQG A;  2A6A A;  4DFK A;  3EZ5 A;  3IFR A;  3O6W A;  2YKN A;  4ISG A;  3VMF B;  3UB5 A;  1NK6 A;  1RNH A;  5JS2 A;  2ZWH A;  5AQY A;  3P5J A;  3VEZ A;  1DT9 A;  4C8O A;  1WSI A;  2Q0U A;  4L3Q A;  4O4G A;  5AQQ A;  4DU1 A;  3EL2 A;  1VQ8 N;  2HND A;  3EEQ A;  4PHT X;  5FRN A;  4Z4I A;  1I3A A;  4YOR A;  4BRQ A;  1NGC A;  3B8A X;  4CJR A;  5JLH A;  3HBT A;  2FBV A;  1Q82 O;  3CFP A;  4BR9 A;  2OCE A;  2PYJ A;  4B1V A;  3MXI A;  3LPU A;  1RCH A;  1LWC A;  3QIP A;  3KJV A;  2BGG A;  3HM8 A;  3LZJ A;  4CW7 B;  4KV8 A;  3ZET A;  3C6A A;  4X62 K;  4LF5 K;  5DM7 L;  4DKW A;  1T3V A;  2Q1N A;  4DG1 A;  4LF4 K;  1OH8 A;  4B9Q A;  1LAV A;  2P9K A;  5AQH A;  4CZG A;  3TI0 A;  4RCH A;  3VN5 A;  3MN5 A;  1ATS A;  4HVJ A;  2HBL A;  4E89 A;  5JS1 A;  1RT2 A;  4R5P A;  1RDW X;  4CEA A;  4B08 A;  1XC3 A;  3PLA A;  1J5E K;  4FXD A;  4OVL A;  5KPT A;  3NVK A;  4JI8 K;  2E1Z A;  3AVC A;  4IO8 A;  4EHT A;  2YJE A;  1ATR A;  3T69 A;  1RTJ A;  2P5O A;  2YKM A;  1G15 A;  2O8F A;  3ULD A;  2YHB A;  1ZXO A;  3K5M A;  5LMN K;  2VWB A;  4BE0 A;  4JV5 K;  3HSC A;  2E1Y A;  1QVG M;  3FFI A;  4O8U A;  1N8R O;  3H08 A;  5GAH P;  2YJF A;  4DF4 A;  3QBX A;  5BRD A;  4CIE A;  3V1O A;  2RE2 A;  3LAM A;  2FSJ A;  4KI6 A;  2IVN A;  4BRG A;  3A5L C;  3BGR A;  1NK0 A;  1KC8 O;  2B5J A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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