5ADXH

Cryoem structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution
Total Genus 92

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS2 (16-21)TI10 (332-335)TIV6 (98-101)AH2 (79-92)S1 (8-12)TVIII3 (69-72)S13 (176-178)TIV1 (13-16)TII1 (21-24)S3 (29-32)TVIII1 (27-30)TVIII2 (50-53)TIV2 (45-48)TIV3 (61-64)AH1 (56-60)O2 (32-34)S6 (71-72)TI1 (62-65)S5 (66-68)TI3 (171-174)S8 (103-107)AH3 (113-126)TI2 (97-100)TIV7 (108-111)AH13 (359-365)TI14 (351-354)TI12 (349-352)S9 (131-136)AH10 (289-295)AH4 (137-145)TIV8 (156-159)S10 (150-155)TI4 (172-175)AH9 (274-284)S11 (160-166)S12 (169-170)AH6 (203-216)AH5 (182-196)TIV10 (242-245)TI5 (234-237)TVIII5 (220-223)TI7 (301-304)TII2 (306-309)AH11 (309-320)AH7 (223-232)S15 (247-249)S14 (239-241)AH8 (252-262)3H1 (264-266)S16 (297-300)S17 (329-330)TI8 (302-305)TIV11 (303-306)TI11 (334-337)AH12 (337-348)TI13 (350-353)TI16 (353-356)S18 (357-358)TI15 (352-355)TIV4 (71-74)TVIII4 (76-79)S7 (75-76)AH14 (368-374)TI6 (286-289)TI9 (322-325)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural protein
publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN RELATED PROTEIN 1
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5adxH03
3FLCO 4BRLA 2QWRA 2DPNA 3B8AX 4CBUA 5AQHA 5AQPA 3L6QA 2P9NB 2FXUA 2FSNA 3W0LA 5AQZA 1U6ZA 4I6MB 1BO5O 4B1ZA 1YVNA 1NMDA 2HOEA 1Q18A 1EQYA 3OHRA 2HF3A 1GLCG 3O1WA 2NRHA 2BUPA 3VENA 1NLVA 5AQMA 1G99A 5ADXH 3UKUB 1NBWA 3UKRB 2A3ZA 1ATSA 2VWBA 4GNIA 4CZIA 4BRQA 3AY9A 4FWLA 5KPTA 1Z05A 3EN9A 1OKJA 4O8KA 1BA1A 2FLOA 5TKYA 3WXLA 5AQOA 2H3GX 5F0XA 3ATUA 3QB0A 3MDQA 3ENOA 4XH1A 4K25A 4EHTA 4XH4A 5FPMA 4Z94A 3FGUA 1NGIA 2PAVA 4JD2A 3CQYA 3LDQA 3EO3A 1JCGA 4BREA 2I7NA 4H0PA 2UYTA 3ZEUA 5BN9A 1LCUA 3VESA 4A62A 5AQLA 1BG3A 3BF3A 1NGAA 1QZ6A 4FL9A 2V52B 3ULEA 1X3NA 3HI0A 3WXJA 2QWNA 4WYBA 3CJAA 4FWKA 4JD2B 4IWVA 4DQ8A 4MO4A 3W3DA 3ZEUB 3VEXA 4K43A 1GLLO 1TYQA 4ISFA 5AQJA 3O5BA 3CERA 4FWOA 1RDWX 1Y64A 3ULEB 3P4IA 2A5XA 3CJ1A 1S22A 3J8AA 3JS6A 4BC5A 4EHUA 4BR2A 4IZ9A 3O4WA 3DXKA 4H5WA 3IDHA 4FO0A 2E2QA 3M6GA 3WXKA 2YHXA 1NM1A 1D4XA 2GUPA 2QWMA 4H5RA 1TYQB 5BPMA 4HWIA 4CZJA 5JLFA 3BUZB 2P9SA 4EIAA 4IO8A 1H1VA 5JLHA 2ZGYA 4BG8A 3ID8A 3KVGA 1K8KA 3VF6A 3A8YA 3DXKB 2D0PA 3CJ7A 4FWNA 2PBDA 3FZMA 3LDLA 4ISGA 4J8FA 5F2RA 3A5MC 3KZBA 4E1JA 4RCHA 1T6DA 2F9WA 3SK3A 5JICA 4AM7A 3QMLA 1GLEG 1HKBA 2P9SB 5ADXA 1NGFA 2CGJA 3GDQA 3VEOA 3QFUA 4WQ5A 2Q97A 3SMPA 1K8KB 3MN7A 3HBTA 4H0YB 3WEEA 2HF4A 1ZBSA 2QWPA 2QW9A 4HTLA 4BR4A 4FWPA 2OANA 3FFKB 5BRHA 4PL8A 3MN6A 5EVZA 3DXMA 2A6AA 3VGKA 4BR7A 4CZGA 3IMXA 4H5NA 2J4RA 4H5TA 3KHYA 4FWMA 3CHWA 3M1FA 5AFUA 1BOTO 2Q0UA 1DGKN 3MN5A 1NGGA 3DJCA 1V4SA 5AQNA 1ATNA 1HLUA 3AAPA 2D0OA 4IJAA 3WUHA 1QZ5A 1U2VA 4M7YA 2P9KA 5AQTA 1KAYA 1GLAG 4PKHA 2IVPA 2FSJA 5AQVA 5LJWA 4MO5A 3S41A 5EOYA 4BRDA 1HKGA 4BRNA 3D7EO 4K42A 3BF1A 1XUPO 2Q0RA 1QQOA 3ZETA 2E1YA 4B1YB 4CZEA 3LDOA 1NGCA 1IG8A 1ZC6A 2P9KB 3VGLA 1TUUA 3F9MA 3A5NC 2GEMA 2VCPA 4KBOA 1GLDG 4RTFD 5BRFA 4CD1A 3ZETB 4BQLA 2AP1A 1IJJA 2CGKA 1P8ZA 2BTFA 4WQ5C 4H0OA 2ZGZA 5EX5A 1J6ZA 4BRPA 1JCFA 4FPAA 4DCHA 5LY3A 1GLBG 2E1ZA 3QFPA 3GG4A 3MCPA 2QWOA 4XH5A 2V51B 5AQIA 5KPRA 2GTDA 4QS9A 1BWFO 2VYPA 2QWQA 2P9UA 4GY2B 3O6WA 4BRIA 3QBXA 1TUYA 3HZ6A 5AQQA 4O5FA 2A40A 4B1UB 1KAXA 5AQSA 3VGMA 1QHAA 4BQZA 4IXCA 3GL1A 5AR0A 4JHDA 3EL2A 5AQUA 4NB4A 2IVOA 3U4LA 3CJBA 2FSKA 5AQGA 5LJVA 2P9UB 1NGBA 5BR9A 3FE1A 4BRKA 5CE3A 3VERA 1GLFO 4Y0WA 1DEJA 5AZIA 4BVPA 3GE1A 3WXIA 1RGIA 4JHDB 1LOTB 3U9DA 3JXUA 3GOIA 1T44A 5BREA 4BGAA 4H0TB 2P9LA 4H0VB 3ENHA 4FWRA 2NLXA 3H1QA 1NGDA 2HMPA 4CZHA 5AZIB 2ZF5O 5FPDA 3A0IX 3QBWA 2A42A 1KAZA 3QICA 2E8AA 4FPBA 3TPQA 5E26A 4BRFA 4DB3A 1NGHA 4BRHA 2IIRA 2Q2RA 3MN9A 1JCEA 1X3MA 2IVNA 1E4FT 4MLEA 3LDPA 4CBWA 4CZLA 3U8XA 3LDNA 4XEIA 2ZWHA 4BRCA 3DWLA 3FZFA 4DHYA 3VPZA 4H0XB 1HPMA 1YXQA 3C7NA 3O80A 5AZJA 3WT0A 1NGEA 1CZAN 2YI1A 4WQ4C 1MWKA 3QDKA 3BEXA 3WEEB 5BN8A 1S3XA 4IJNA 4A61A 2E20A 1V4TA 4FWSA 4B1XB 2YCHA 3DXMB 2V7YA 5AQFA 3ZX0A 4EAHD 5EXWA 5AZJB 1DKGD 1ESVA 5JMVA 1E4GT 5AQXA 4CJ7A 5KQDA 4PKIA 1YAGA 4I6MA 2E2PA 4JAXA 3D2EA 2Q31A 1NWKA 2YHWA 5I9EB 1XC3A 2WUSA 5AQWA 1U2VB 3O8MA 3FZKA 4FSVA 4ISEA 4H03B 1KXPA 3AARA 3UKUA 4PL7A 5FPNA 1NGJA 3UKRA 4BC3A 2D4WA 3O08A 3D2FA 3H1VX 4CI6A 4NO7A 1T6CA 3D2EB 4B1VA 2ASPA 5BPNA 3U9ZA 1RFQA 2KHOA 4BG9A 4YDUA 3I33A 2YJFA 4PKGA 4AM6A 4L3QA 2QM1A 3ZX3A 3VF4A 4BRGA 4BRAA 3RSEA 2AA4A 3VF2A 3D2FB 3VETA 2P9IA 4BR9A 4BR0A 3O1BA 5F1XA 4F9OA 4RWTA 4WQ4A 3MK6A 2P9PA 1MDUB 5BPLA 4BRMA 3I8BA 3M3ZA 1HJOA 2CGLA 1HUXA 1SAZA 3UB5A 3R6MA 3AAQA 4CBXA 4M63C 2A41A 1GLJO 5EY4A 3RSEB 3ATVA 4B9QA 2P9IB 2Q36A 4FOIA 5AFUH 1SZ2A 2P9PB 1WOQA 2YJEA 1QQNA 2FF3B 5E84A 3SMSA 3R8EA 2YHYA 3EZWA 1BDGA 3MMVA 4FWQA 3L4IA 1BUPA 3H3NO 5AQYA 4B1WB 1C0GA 3CETA 1Z6RA 2ASOA 3H45C 3H3OB 3LL3A 5AQRA 3HSCA 4A2AA 2F9TA 4CD3A 3H6EA 3HM8A 2ASMA 1HKCA 2E2NA 4FOEA 1QQMA 1XQSC 4H5VA 2CH5A 2W41A 1C0FA 2I7PA 3IFRA 3FZLA 3LM9A 2V7ZA 5KPZA 3EKSA 3WQTA 2GWKA 2QXLA 1ATRA 1ZXOA 4QS7A 5B8HA 4BVOA 4A2BA 4BR5A 3IUCA 5FPEA 3H46O 3A5OC 4QS8A 2EWSA 3SLCA 1R59O 5KQ8A 2E88A 4CZKA 4YDUC 3L0QA 3SJHA 2FF6A 2P9LB 3A5LC 3HTVA 3ZX2A 3CIPA 3CI5A 1SQKA 3VEVA 3VEWA 4LC9B 1BU6O 3R9PA 2E2OA 3GBTA 2GELA 3VEYA 2D1KA 4MLHA 1MWMA 2W40A 1MA9B 3VEZA 2GWJA 3CJ9A 4M7XA 4BC4A 3DAWA 4CZFA 3FR0A 4JN4A 3WQUA 3BP8A 2NZTA 1BA0A 4CZMA 1X9JA 1HX1A 4BGBA 2CH6A 5ELZA 5AQKA 2Q1NA 3UE5A 5BRDA 3CQXA 3C7NB 3EKUA 4C23A 3FZHA 4BC2A 2QWLA 4BROA 2P9NA 3CJCA 3LM2A 4K41A 4JNEA 2ITMA 1YUWA 3VOVA 3G25A 1WUAA 3C0BA 3TU5A 4EFHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRLA 4C8OA 3B8AX 4CBUA 2WC9A 3RTVA 1GOAA 3L6QA 2YNGA 3QNNA 2FXUA 5GIPA 3CMAN 1KVAA 1BO5O 3OBYA 1NMDA 4W5OA 1LWCA 5SWMA 2Z1GA 3HP6A 3VENA 1S5JA 4I9LA 1ZBFA 1YJ9N 1S1VA 4CJRA 4CGFA 2A3ZA 4BRQA 3VQPA 4Z4GA 2XHBA 4IBNA 3SBTA 4O8KA 1W7AA 2F96A 2E4LA 2H3GX 2WBNA 3PY8A 2HSTA 2PAVA 4JD2A 2D5RA 4F3TA 3RMAA 3ZEUA 4DF8A 5GADP 1LCUA 3VESA 3DLKA 1NGAA 1QZ6A 4FL9A 3V9UA 4B9UA 4W5NA 1BQNA 3AVBA 1YHQN 3RMBA 3TWHA 4X66K 4MO4A 3HO1A 3KD1E 4K43A 1IV0A 1TYQA 1WNSA 4CEEA 1X1PA 1RDUA 2W42A 2BANA 5C2DA 3HVRA 4LFBK 3ULEB 3P4IA 2A5XA 4FW2A 4CGIA 1SKWA 4EHUA 2VWJA 4CHPA 3E01A 2HVHA 3HOTA 3M6GA 3DLBA 2AJQA 3WXKA 3CQ8A 3IRXA 2YHXA 1NM1A 1REVA 4CECA 1NU0A 2QWMA 3LPUA 4BDZA 1U49A 2P51A 4EIAA 5HRSA 3NH2A 5HRPA 4BG8A 4JEPA 5KRSA 1K8KA 3CJ7A 3DYAA 2UXBK 3OYBA 4FJIA 4B3RK 4FJKA 3L8BA 3LANA 1IBKK 3CFPA 2KFZA 3A5MC 3AO5A 3KZBA 3R1XA 4BY9C 1WLJA 1GLEG 4Q0BA 5KRTA 2Y1IA 2A1RA 3WNGA 4DUZK 1IO2A 3AA5X 3SMPA 3MXIA 3MN7A 4NYFA 3HBTA 4ILJA 3WEEA 2EX3A 2G8UA 2VG6A 3KK3A 4FWPA 3MN6A 3G4SN 3K9JA 1SL1A 4H5NA 1U48A 4H5TA 2WOMA 5HOOA 4BE2A 4DUYK 1WAFA 1BOTO 1S1TA 4RW6A 3MX2A 3MN5A 4CIFA 4FK4A 1NOZA 1IG9A 1LV5A 1XHZA 4ELUA 3HP9A 3CCVN 2DFEA 1UA0A 3C6HA 3BZKA 3RRHA 3PUFA 4A59A 3DOLA 1KAYA 3LP0A 4JKBA 3MX5A 2JGUA 2FSJA 1VK0A 4BRDA 4XIUA 2HBKA 4O5BA 3U3YA 4K42A 2QKKA 4N56A 4KFBA 3OYLA 1RBUA 1XUPO 3V9XA 3O4QA 4PY5A 4LH4A 4B1YB 2EHGA 3E66A 1RTJA 3LDOA 1NGCA 1ZC6A 3F9MA 3IAYA 5CY4A 4OLBA 3FFIA 1LAWA 4RTFD 3VQ4A 2O8FB 1T7PA 5BRFA 2OPQA 4JI7K 2X6SA 3ZETB 4JI0K 4OKJA 2BTFA 5M1FA 3QEXA 1RBTA 2P1JA 3ALYA 2ZGZA 5JS1A 1K73O 1J6ZA 2ZQBA 3CM6A 4FPAA 5JVGL 3UIQA 4NXMK 2G8VA 1GLBG 4E7KA 4JV5K 3GG4A 4IOXA 4JK7A 3O3FA 3QEIA 3CC2N 3L3UA 4NLCA 3PX4A 4B9SA 2IC3A 3ZSZA 5C12A 1VSLA 4QS9A 4B3TK 3QLHA 4BRIA 1TUYA 3MWTA 3G10A 3PIPL 4B3SK 4AQYK 4CGJA 5AQSA 3C6AA 3TSQA 4BQZA 1QSLA 3ZT2A 4JHDA 3KLIA 5AQUA 4A5AA 2G8WA 2OPRA 2F8TA 3DOKA 3U4LA 3CJBA 5J2PA 3THVA 5DK5A 1NGBA 4OPHA 3FE1A 2RF2A 1KFDA 5CE3A 5AZIA 3LAKA 3VA3A 4ILHA 1RT4A 4CJLA 3U9DA 1IKXA 3SZ2A 3T19A 3J81O 3OYJA 3GOIA 4KTWA 3LALA 3ENHA 2NLXA 1D8YA 2DTUA 4CZHA 5FPDA 2JWKA 4F2SA 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3ZSOA 3SLCA 3NGIA 4IFVA 4EP5A 3K59A 4F2RA 4LF9K 1SQKA 4ZHRA 3R9PA 2W6KA 3O9SA 3VEYA 2NRRA 4MLHA 5T7BA 4CK1A 3CJ9A 5TKWA 3OY9A 3AO3A 4KHNA 3FR0A 4JN4A 2WTUA 4AHRA 1HNXK 1BA0A 2CH6A 5ELZA 5AQKA 3Q7BA 3M8QA 1VSEA 4BC2A 3CJCA 4OPJA 2QXFA 3VOVA 4Z4FA 4FLYA 3C6TA 5DM6L 5JENA 1WUAA 4OX9K 1YJWN 1BIZA 3TU5A 4CJUA 1RTDA 2OTJN 3E9OA 3K57A 5AQPA 5HP1A 1NJYA 4CHNA 1L3TA 5GAHP 2P9NB 4DSKA 1XWLA 1U47A 4I6MB 2VQFK 1NK7A 1FJGK 1YVNA 3F73A 2HOEA 2UXCK 2HF3A 3S3OA 1GLCG 3EE9A 2BUPA 1S9GA 3UKUB 1HR0K 3UKRB 4MDBA 4FWLA 3EN9A 1BA1A 1WSIA 5TKYA 3WXLA 3T1YK 1D5AA 5AQOA 1JLEA 4GKKK 3MDQA 1CZ9A 3FGUA 3LDQA 4AH9A 4BREA 3MEEA 3LPTA 4H0PA 2UYTA 2WFBA 4AHVA 3D0PA 2PYLA 5AQLA 1W97L 1NK5A 4CJ4A 3KLFA 3ULEA 4DR6K 1W2BM 4CEDA 2QI2A 3T7ZA 1ITGA 1Q81O 4IWVA 3W3DA 5J2NA 5C15A 4JI1K 4CEFA 4IG0A 4KI4A 1GLLO 4DR5K 4ISFA 4O55A 2NRZA 3CJ1A 3RMDA 1M90O 1IKYA 4KTQA 2YNHA 4FO0A 1X9WA 3VMFB 4BDPA 2F7TA 3ISNC 2XY5A 4H5RA 5BPMA 1NKEA 4E89A 4CZJA 5JLFA 1VSDA 4Y1DA 3AO2A 4DV7K 4DQQA 4FYDA 4KHWA 2VGNA 5IWAK 4Z4EA 3JYTA 1UOCA 1ZBUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4BRL A;  4C8O A;  3B8A X;  4CBU A;  2WC9 A;  3RTV A;  1GOA A;  3L6Q A;  2YNG A;  3QNN A;  2FXU A;  5GIP A;  3CMA N;  1KVA A;  1BO5 O;  3OBY A;  1NMD A;  4W5O A;  1LWC A;  5SWM A;  2Z1G A;  3HP6 A;  3VEN A;  1S5J A;  4I9L A;  1ZBF A;  1YJ9 N;  1S1V A;  4CJR A;  4CGF A;  2A3Z A;  4BRQ A;  3VQP A;  4Z4G A;  2XHB A;  4IBN A;  3SBT A;  4O8K A;  1W7A A;  2F96 A;  2E4L A;  2H3G X;  2WBN A;  3PY8 A;  2HST A;  2PAV A;  4JD2 A;  2D5R A;  4F3T A;  3RMA A;  3ZEU A;  4DF8 A;  5GAD P;  1LCU A;  3VES A;  3DLK A;  1NGA A;  1QZ6 A;  4FL9 A;  3V9U A;  4B9U A;  4W5N A;  1BQN A;  3AVB A;  1YHQ N;  3RMB A;  3TWH A;  4X66 K;  4MO4 A;  3HO1 A;  3KD1 E;  4K43 A;  1IV0 A;  1TYQ A;  1WNS A;  4CEE A;  1X1P A;  1RDU A;  2W42 A;  2BAN A;  5C2D A;  3HVR A;  4LFB K;  3ULE B;  3P4I A;  2A5X A;  4FW2 A;  4CGI A;  1SKW A;  4EHU A;  2VWJ A;  4CHP A;  3E01 A;  2HVH A;  3HOT A;  3M6G A;  3DLB A;  2AJQ A;  3WXK A;  3CQ8 A;  3IRX A;  2YHX A;  1NM1 A;  1REV A;  4CEC A;  1NU0 A;  2QWM A;  3LPU A;  4BDZ A;  1U49 A;  2P51 A;  4EIA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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