5ADXH

Cryoem structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN RELATED PROTEIN 1
molecule tags Structural protein
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5adxH03
1U2VB 3SJHA 1SZ2A 1J6ZA 4BGBA 3L4IA 4QS7A 4XH5A 3HSCA 4MO4A 3UE5A 3QICA 4BRCA 2QWQA 3GE1A 4CBUA 1K8KB 2I7PA 3AAQA 4B1VA 3HZ6A 1KAZA 1NGJA 3A5LC 5AQLA 2HMPA 3ZETA 4LC9B 1Y64A 2A6AA 3AARA 4WQ4C 3I33A 2H3GX 3SMPA 3BUZB 3M3ZA 4BG9A 1XUPO 5AQZA 4DHYA 4EAHD 4BR7A 1QZ5A 2YJFA 3LM9A 1OKJA 5FPEA 2YHXA 1GLCG 2QM1A 2DPNA 5BPLA 4H5VA 2CH6A 3FZLA 4FWQA 1BA1A 2E8AA 3H3NO 5LY3A 3BF1A 2CGJA 1TYQB 4BRPA 4ISEA 3MMVA 2VWBA 1WUAA 4JHDA 4J8FA 4MLHA 4DB3A 3U4LA 1HX1A 2A3ZA 1BA0A 4NB4A 3RSEB 4PKHA 3WEEB 2P9KB 2I7NA 5AFUH 1JCEA 3O80A 4CZJA 1HLUA 3QBXA 3IFRA 4BRLA 1ESVA 2GEMA 2E2OA 3VEVA 1S3XA 2WUSA 2Q0UA 3O8MA 3LDPA 2A5XA 4RTFD 4CJ7A 1X3NA 4IJNA 5AQIA 3DXMA 1RGIA 5F2RA 5EX5A 2A40A 3C0BA 4FWPA 5AQKA 3VOVA 5AQTA 3WQTA 1G99A 1MWMA 3A5OC 5AZJB 4K25A 2P9NA 5E26A 5EXWA 1DEJA 1JCGA 2Q0RA 3QFPA 5KQ8A 2BUPA 3O08A 2ZGZA 5AQGA 3QDKA 4FPAA 4IWVA 3MN5A 3CQXA 4FSVA 3CJ9A 2A42A 5I9EB 4ISGA 4BR0A 1BUPA 4Y0WA 1WOQA 4H0PA 2CGKA 1YVNA 2A41A 4A2AA 4PL7A 2BTFA 3FZFA 3CJCA 4H0XB 3UB5A 1ZXOA 2YCHA 2PAVA 3AAPA 2E2PA 5AQFA 4M7XA 2E1YA 2Q2RA 3GDQA 4CZLA 5ELZA 2UYTA 1JCFA 1NGEA 1RDWX 5EOYA 1ZBSA 1MA9B 2F9TA 1ATSA 4PKGA 4BRNA 4K41A 1KXPA 4B1UB 5BRDA 4RWTA 1HPMA 4PL8A 5BRHA 1MDUB 3VENA 1HJOA 3WXKA 1LOTB 5AZIA 3VERA 5KPZA 3A8YA 4JD2A 3WXIA 3VETA 1NGIA 2E1ZA 4B1ZA 3AY9A 5AQSA 1GLEG 5ADXA 2P9UA 1NBWA 2V51B 5AQVA 1Z6RA 4CZKA 4B1WB 3HTVA 4DCHA 1NGFA 1HKBA 1NGBA 3QFUA 1U2VA 4BVPA 4BR4A 1NMDA 4H0TB 4BRKA 3C7NB 1GLJO 2KHOA 1K8KA 4CZMA 3IDHA 4JN4A 4K43A 4BRIA 2QXLA 3ZEUB 2ASPA 4FL9A 3R8EA 4A61A 3WQUA 2CGLA 4GY2B 1RFQA 4BRHA 3ATVA 3WXLA 3BF3A 3HBTA 1Z05A 2YHWA 4QS9A 2QWPA 2QWLA 1T44A 3H6EA 2QWOA 3QMLA 4BR5A 1TYQA 2FSKA 3DXKB 5ADXH 5CE3A 1R59O 1HKCA 3D2EA 4CD1A 4B1XB 4EFHA 4FWNA 3WEEA 2Q97A 2P9KA 5AQHA 4C23A 1YAGA 2P9IA 3O5BA 1KAXA 1EQYA 3VF2A 1GLAG 3IUCA 1V4SA 4CZEA 3UKRB 4EHTA 2QWMA 3J8AA 3VEXA 3UKUB 3H1QA 4QS8A 5BR9A 1C0FA 5KQDA 2ZF5O 1T6CA 1TUUA 2GWJA 2W40A 5JLHA 2D4WA 3KZBA 5AQQA 1QHAA 2D1KA 4CD3A 4BC2A 4FOEA 4BRDA 3G25A 4H5NA 1SQKA 3HI0A 2NLXA 5AZJA 4CI6A 2ASMA 4WQ4A 2IVNA 3EKSA 3ULEA 2ZGYA 1GLDG 2HF3A 1YXQA 3M1FA 1X3MA 3SK3A 2Q36A 3MN9A 5BN8A 1ATRA 3DAWA 3ENOA 1BOTO 5JLFA 3DXMB 3GBTA 5E84A 4YDUC 5FPNA 4F9OA 3LM2A 2NZTA 3F9MA 4ISFA 3O1WA 1HKGA 5EVZA 2D0OA 3D2FB 1QZ6A 1X9JA 2P9SB 3DJCA 4FPBA 2V52B 5F1XA 3LDLA 1CZAN 5AQJA 3FZMA 4BRMA 4FWOA 1QQNA 2HOEA 1YUWA 3S41A 3JXUA 2FF6A 4I6MB 3CJ7A 3LDOA 3VPZA 3P4IA 1NGCA 4BQZA 2Q31A 3MN6A 1XQSC 3H46O 4IO8A 1DKGD 3ENHA 3U8XA 3H1VX 2P9PB 3I8BA 3EZWA 3FR0A 4M7YA 3CJBA 4O5FA 1S22A 4H03B 4B1YB 1NM1A 3EO3A 2D0PA 1HUXA 5JICA 1DGKN 4JNEA 5B8HA 4BGAA 4K42A 1NGHA 3FZKA 3LL3A 3MDQA 3VGKA 3L0QA 1IG8A 3B8AX 5AQMA 3U9ZA 3VF4A 2V7YA 4RCHA 3U9DA 3CJ1A 5AZIB 3W0LA 2AP1A 5BREA 4JD2B 2GUPA 3C7NA 4IZ9A 2ITMA 5AQRA 4MO5A 4BREA 1TUYA 3LDNA 2E88A 3ZEUA 3GL1A 2HF4A 2P9LB 1XC3A 4O8KA 5AFUA 4BC5A 3KVGA 2IVPA 3O4WA 2ASOA 4GNIA 2FXUA 4FWMA 4BRGA 2FLOA 2EWSA 3FFKB 5BRFA 3ZETB 1NGGA 3MN7A 1E4FT 3O1BA 4NO7A 5AR0A 5EY4A 1SAZA 4HWIA 3SLCA 1D4XA 3FLCO 2QW9A 4FOIA 2PBDA 3DXKA 1BDGA 5AQPA 2YI1A 1QQMA 3RSEA 2CH5A 2NRHA 3W3DA 3BP8A 2QWRA 3VEZA 4CZIA 2F9WA 3UKRA 5KPTA 4JHDB 3UKUA 4H0VB 1E4GT 3LDQA 3ZX0A 4M63C 1QQOA 3DWLA 4CZGA 3CJAA 3HM8A 3D2EB 1C0GA 3VGMA 5BPNA 5AQUA 2E2QA 2QWNA 2P9IB 4A2BA 4BROA 5F0XA 2IVOA 2YHYA 2GWKA 2J4RA 2E2NA 3R9PA 2OANA 5AQOA 3A5NC 4EIAA 4WQ5C 3D7EO 5FPMA 3WT0A 1ZC6A 2AA4A 4FWLA 5KPRA 1P8ZA 1NGAA 4WYBA 1T6DA 3VGLA 4EHUA 3EKUA 2GTDA 1NWKA 4BC4A 3OHRA 3CQYA 4IJAA 4AM7A 4XH1A 3CHWA 1V4TA 4JAXA 1BO5O 2P9NB 3FZHA 4H5WA 4BRQA 3A0IX 4BR2A 3WUHA 3ULEB 4H5RA 4FWRA 5AQWA 3BEXA 5BN9A 4H5TA 2VYPA 3CETA 4KBOA 4BQLA 1GLBG 3VESA 3KHYA 3D2FA 4PKIA 2P9SA 2ZWHA 5BPMA 2Q1NA 3QB0A 3VF6A 4CZFA 4BR9A 4B9QA 4FWKA 3JS6A 1BWFO 4FO0A 5AQYA 3ZX3A 3SMSA 5JMVA 2FSJA 4AM6A 3R6MA 2VCPA 3FE1A 4I6MA 4L3QA 1U6ZA 5TKYA 4H0YB 4A62A 4BVOA 2GELA 4BG8A 4CZHA 5LJVA 2P9PA 4BC3A 3CI5A 3A5MC 3ATUA 3CERA 4MLEA 1GLFO 2YJEA 3ID8A 1NGDA 2W41A 4H0OA 4DQ8A 1MWKA 2IIRA 3GG4A 3GOIA 1LCUA 4E1JA 3WXJA 1H1VA 2FSNA 4FWSA 1GLLO 3MCPA 4WQ5A 4CBXA 1BG3A 5AQXA 3CIPA 3H45C 3EN9A 4HTLA 3FGUA 3H3OB 4YDUA 4XH4A 4IXCA 1BU6O 3TU5A 3VEWA 1KAYA 3QBWA 3M6GA 5FPDA 4BRFA 4XEIA 3ZX2A 1ATNA 3MK6A 3VEYA 1Q18A 2P9UB 5AQNA 3IMXA 1NLVA 3EL2A 1IJJA 3TPQA 4Z94A 4BRAA 3O6WA 4CBWA 3L6QA 5LJWA 3VEOA 2V7ZA 2E20A 2FF3B 2P9LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SJHA 4B8AB 4QCLA 1J6ZA 3L4IA 3LDSA 4BRCA 4CBUA 5HRSA 5CHIA 3AVJA 3QETA 3VQPA 2DTUA 2DY4A 2IDOA 3HZ6A 3WNHA 3AVBA 4LC9B 1RT1A 2WTUA 3OYCA 3QEIA 1IO2A 2BANA 3BUZB 3QIPA 4KREA 5AQZA 3CYGA 1N36K 3LM9A 1GLCG 1QVGM 4FZXC 1JLFA 5DM7L 3LZIA 3C94A 4M3UA 5FRNA 3MMVA 4DTJA 3QEWA 4JHDA 1SV5A 4DB3A 1TVRA 1HX1A 2A3ZA 1BA0A 3U3GA 1HR0K 3SI6A 2Q3SA 4CZJA 1WN7A 3V1RA 3V9UA 4IG3A 4F8RA 1ESVA 3VEVA 1QTMA 2WUSA 1B92A 2Q0UA 3LDPA 4RTFD 4IJNA 5AQIA 4C8NA 4M41A 5F2RA 3QNNA 2BDPA 4DR7K 4XJXA 5EX5A 4V19S 4YOVA 3C0BA 5HBMA 2QEXN 3WQTA 1G99A 1HNIA 3Q7CA 4YFUA 4IKFA 2PYLA 5EXWA 1JCGA 4CJKA 3NF9A 1RDBA 3O08A 3SQ1A 2ZGZA 5AQGA 4DQRA 2JWKA 4CJSA 4BY9C 3K2PA 1MU2A 3MN5A 3SUNA 1UAXA 3AO4A 1HNZK 5I9EB 4CJ5A 4EZ9A 1I3AA 4ISGA 1HQEA 4CFBA 4Z4IA 1WOQA 4F3TA 4FK4A 4BE0A 4AQYK 1YVNA 2X78A 4PL7A 2UUCK 3NH2A 3FZFA 4H0XB 1ZXOA 2HSTA 3AAPA 4KHPK 4TSXA 2LSNA 3ZT2A 4PY5A 5JVHL 2UYTA 3OYAA 4H4MA 5EOYA 1TKZA 2HBKA 2OZMA 1OH8A 1KXPA 3OYNA 3ZSWA 4B1UB 4RWTA 4B08A 1Q86O 1HPMA 4IFEA 3VENA 1HJOA 1RT5A 2RE2A 3VERA 4DSEA 2E5LK 4FJ9A 2HVIA 3QLHA 4JI3K 5CR4A 4MDAA 4AHRA 3OY9A 1L5UA 3DLRA 3AY9A 2O8CA 5AQSA 4CHOA 2PYJA 1EWQA 4CZKA 4I9QA 2G8UA 4B1WB 1NGFA 3DMJA 4U67L 3KLFA 1BCMA 3QFUA 1VRUA 4AHVA 1JLGA 1EX4A 1NMDA 4I2PA 4BRKA 1GLJO 4JN4A 4I7FA 1WB9A 2QXLA 3ZEUB 1RCHA 3WQUA 3SQ4A 1Q7YO 3C6UA 4E7JA 1LAVA 3L3VA 3BF3A 3HBTA 2YHWA 2ZE2A 4DR5K 4DV3K 2HHIA 4YHHK 3H6EA 3VQQA 3I56N 1ASVA 3TAFA 2HHSA 3SZ2A 1YF5L 4F3OA 5CE3A 2G8HA 4CEEA 1SL2A 1ITGA 4EFHA 4FWNA 4B8CA 5AQHA 2P9KA 2HW3A 3OYFA 4FJ7A 4IBNA 4DUYK 3O5BA 1GLAG 1S1VA 4FCYA 3AGRA 1V4SA 1VSFA 3E9LA 1K6YA 5HRNA 1BISA 2PY5A 3G0ZA 2UXCK 5KQDA 3LP1A 1T6CA 4B3MK 2GWJA 5AJ3K 1JLEA 3MXIA 3VMFB 5JENA 3PX0A 4FOEA 1NK8A 4H5NA 2WONA 3OJUA 5AZJA 4OKEA 4OO1J 4CI6A 2KFZA 3M8QA 1YXQA 5CZ1A 4JKEA 4CGGA 2P5OA 1U45A 2XY6A 3THYB 4CCHA 4DKWA 3LM2A 2NZTA 3F9MA 1S9EA 3O1WA 1TL3A 3IAYA 1SKRA 2FBXA 3VQ8A 4RW4A 1Q9YA 2P9SB 3JSMA 3TTCA 3SCXA 4DTOA 1NJIO 1IBLK 1BL3A 5AQJA 4DU1A 3MEDA 2KW4A 4FJXA 2KKZA 4AHCA 4KTWA 3K9JA 3CJ7A 2O8DA 3LDOA 3HVRA 1HQUA 4OPJA 3M8SA 5CYQA 4IO8A 3ENHA 4J2DA 3IS9A 4CGHA 4CEDA 3SPYA 3EZWA 1NK7A 3J81O 4B3OA 4FLZA 4M7YA 3OS1A 3OTOK 4RW7A 3N4PA 3KK3A 3C65A 5JICA 3CFOA 4JNEA 3CM5A 4IDHA 1RTHA 3CCJN 2VWKA 3LL3A 2VG7A 4LH5A 3MWPA 4CK3A 3O9SA 4DV6K 2AJQA 3O9RA 4OPHA 1RTJA 4Q0BA 4RCHA 1BCOA 3U9DA 2OCEA 2OPQA 4LF7K 4KTZA 2NRRA 3V1OA 4DFJA 3W0LA 4JS4A 3TTFA 4U7BA 3THXA 1EO1A 5AQRA 4FW2A 3DRSA 2OPPA 3VQ5A 3LDNA 1BI4B 1OVQA 2HBLA 3GL1A 5SWMA 4DUZK 2I5JA 4J2AA 1HMVA 4B9VA 1XC3A 4NCBA 2XY7A 3KVGA 4RW8A 2ASOA 3HL8A 3F2KA 3OYKA 3S3NA 4FWMA 2FLOA 3J7AP 2EWSA 1SUQA 2YX6A 3CCSN 4M3WA 1VQ8N 1E4FT 3ZCMA 4HWIA 2IGIA 3FLCO 4FOIA 3THWA 5AQPA 1KRPA 1QQMA 2ETJA 3LP0A 4LY7A 3ZYYX 2VGNA 1JL2A 4BE7B 2QWRA 3VEZA 3SQ0A 4CEQA 4DTUA 3KLHA 4OLBA 4E19A 4LF6K 1WAFA 2UU9K 1SKSA 4CJWA 3ZX0A 4M63C 3NDKA 4KRFA 3KLIA 3VQEA 4LFAK 5C25A 3ZSYA 1JXBA 2P9IB 4DTRA 4B3SK 2YHYA 3E66A 1NK5A 1LW0A 1S9GA 3LAKA 1S6QA 3P39A 3CCEN 3TANA 1NGAA 1T6DA 4GMJB 3EKUA 3DOLA 3OHRA 4YORA 1VRTA 4IJAA 3TARA 4LFCK 3RRGA 4AM7A 3O9TA 4XH1A 1V4TA 1BO5O 2P9NB 3A0IX 1SS6A 5AQWA 3BEXA 3CETA 2G8IA 3KHYA 3D2FA 4OVLA 2E20A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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