5AFUH

Cryo-em structure of dynein tail-dynactin-bicd2n complex
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DYNEIN TAIL
molecule tags Motor protein
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5afuH03
1TUUA 2GUPA 2AP1A 2P9UA 3R8EA 4EHUA 4FWOA 2Q36A 2NLXA 1Z05A 1E4GT 1GLLO 2WUSA 4LC9B 1RDWX 3QBWA 4BGAA 1GLBG 3KZBA 4RWTA 3FZLA 1NWKA 1R59O 2E1ZA 3ID8A 3F9MA 4DB3A 3DJCA 3M6GA 2P9LB 4BRIA 2OANA 4PL8A 3EZWA 1NM1A 3JXUA 4BC2A 1GLDG 4H0OA 3VEOA 2AA4A 3WXJA 4FWQA 3IMXA 3QB0A 3O08A 4BRHA 5BRDA 2Q97A 5AQHA 5AFUA 1V4TA 5AQWA 2A3ZA 5BPNA 2CGKA 2CGJA 1U2VB 1EQYA 1BUPA 1GLJO 4PKIA 4JHDA 4FWSA 1HX1A 4BC3A 2HMPA 2Q0RA 5AQQA 1TUYA 2F9TA 4BRNA 4BREA 3HTVA 4Y0WA 4EFHA 3DXKB 2EWSA 3VGMA 4GNIA 4MO4A 4WQ5C 4ISFA 1NGAA 1ZBSA 1MDUB 4H5TA 4MLHA 4BRDA 5BR9A 4MLEA 2FXUA 3O1BA 3LL3A 4NO7A 4IO8A 2DPNA 4JAXA 1BO5O 4ISEA 1HJOA 3SJHA 3FZFA 4FOEA 4CZGA 2I7PA 3RSEB 4MO5A 3B8AX 1KAYA 4WYBA 4DCHA 3OHRA 4XH4A 2A42A 4BR2A 4CZLA 5ADXA 4CD3A 3ZETB 2QWQA 2CH5A 5AZJB 2V7YA 1QQNA 3A5NC 3CJCA 4H5NA 3JS6A 2QWNA 3GBTA 4BR9A 4BQLA 2D0PA 2E2NA 2QWLA 5AQGA 3D2FA 5KQDA 2NZTA 4BRPA 4XH5A 2HF3A 4K43A 3WXIA 5EY4A 3LM9A 3C7NA 1ATNA 1BA1A 3ATVA 3BF3A 2A41A 4BRFA 1NGIA 5AZIA 4BRLA 3FZKA 4BRAA 2J4RA 1C0GA 1XUPO 5JMVA 4IWVA 5EOYA 2QW9A 2Q31A 4YDUA 2ASMA 3U9ZA 5AQYA 4YDUC 1BA0A 4EIAA 4FOIA 3WT0A 5AQMA 3ENHA 4CZFA 4AM6A 4BRMA 3M1FA 4FWMA 4EHTA 3UKRB 3GE1A 5LJWA 2YJEA 3U4LA 3H45C 1TYQB 3W3DA 5BREA 3FZHA 4B1YB 3VF2A 3CQXA 3CJ1A 3VEZA 4A62A 4BRQA 4B1ZA 3GDQA 3A5LC 4XH1A 2P9KB 4L3QA 3MN5A 2P9PB 1NGGA 4IZ9A 1MA9B 3H1VX 2E8AA 4O8KA 5KPTA 1SAZA 3BEXA 5AQIA 2VCPA 1DEJA 4BR7A 2P9NA 3HBTA 3R6MA 1ATSA 4BQZA 3UKUA 5JICA 3ZEUB 2A6AA 3CHWA 2Q1NA 3QDKA 2HOEA 2V52B 3L4IA 1K8KA 5KPRA 3VEYA 2V51B 4B1WB 2YHYA 4GY2B 4CBWA 2GWKA 4CZEA 4B1VA 3D2EB 5AQNA 2BUPA 2ASOA 2YI1A 1OKJA 2YCHA 3AARA 3UE5A 4QS8A 3CERA 1GLCG 3SMPA 4PKGA 1E4FT 2W41A 1HPMA 1GLAG 1S22A 4BR0A 1XC3A 2YHXA 3O6WA 1G99A 1GLEG 2GEMA 1JCFA 2P9LA 3DXMB 4IJNA 1NGFA 3LDQA 2IIRA 2ZGYA 3EKUA 3WQTA 3VESA 3ATUA 4CI6A 3VEVA 1MWKA 3ZX2A 2P9SB 1QHAA 5EX5A 4BRKA 4WQ5A 3BUZB 2FSKA 3DAWA 3BF1A 1IG8A 1U2VA 1GLFO 1KXPA 4I6MB 3QBXA 3SMSA 5E26A 4BG9A 5AFUH 1XQSC 3DXKA 1JCEA 5LJVA 4BRCA 2CGLA 5AQPA 2FSNA 3MDQA 3H3NO 3WEEB 4A2BA 3QICA 3HSCA 3CIPA 3WQUA 2ZF5O 2E2OA 2E2QA 3CQYA 1X9JA 3WUHA 3A8YA 4B9QA 3H1QA 4FWKA 1BOTO 3C0BA 1YVNA 4BR4A 3GOIA 4BC4A 2QWOA 1HKGA 1ZC6A 3KHYA 4H0PA 3RSEA 5ELZA 3MMVA 3H3OB 4FPAA 5FPEA 1QQOA 2UYTA 4AM7A 1Y64A 2FF3B 3J8AA 3AAPA 3VETA 4FPBA 1BWFO 5EXWA 3ZETA 5AZJA 1HUXA 2E88A 3U8XA 2PAVA 1J6ZA 3SLCA 3IFRA 3KVGA 5AQZA 5ADXH 2VYPA 3CJ9A 3VENA 3BP8A 3EKSA 2A5XA 4HTLA 3GG4A 3I8BA 1HKBA 3MN6A 2F9WA 4CZMA 2ASPA 1NGDA 5LY3A 1QZ6A 1BG3A 1NBWA 5KQ8A 1ATRA 3ZX3A 4H5VA 3ULEB 1LOTB 1P8ZA 5AQRA 3FZMA 1YXQA 2IVNA 2E1YA 4DQ8A 1YAGA 4BVPA 3AAQA 4IXCA 4BGBA 2YHWA 3I33A 4J8FA 4KBOA 3L6QA 3UKRA 1T44A 4A2AA 4BR5A 1TYQA 3EL2A 2Q2RA 4H0VB 5AQLA 5AQXA 4FO0A 3LM2A 4JD2B 2CH6A 2W40A 4H03B 4FSVA 4QS9A 2P9IB 3H46O 3M3ZA 4BRGA 1DKGD 1HKCA 4IJAA 1CZAN 2ITMA 4QS7A 2QWRA 1IJJA 2P9KA 2D4WA 2P9PA 2P9UB 3DWLA 1NMDA 3TU5A 3ZX0A 1C0FA 3MK6A 1RGIA 3QFPA 5AQTA 3ZEUA 4A61A 2QM1A 2QWMA 4NB4A 1NLVA 2Q0UA 3O1WA 4FWPA 4FWRA 5FPNA 2GTDA 4M7XA 4JN4A 3O4WA 2A40A 3VF4A 5EVZA 3AY9A 4K25A 4CZJA 3CI5A 2HF4A 5JLFA 3D2EA 5B8HA 3FR0A 4M63C 3GL1A 5CE3A 3U9DA 5BRFA 5F0XA 1BU6O 3FGUA 4O5FA 3IUCA 2H3GX 3ENOA 3MN7A 4H5WA 1V4SA 1T6DA 1HLUA 1YUWA 2PBDA 2ZWHA 5F2RA 1NGBA 3CETA 1NGCA 4JHDB 2E20A 4EAHD 1NGHA 1BDGA 3HZ6A 5BRHA 3DXMA 2BTFA 1Z6RA 4CZHA 3VGKA 4BVOA 3LDNA 2P9SA 4CJ7A 1MWMA 1NGEA 5BPLA 3LDLA 1NGJA 3VPZA 4PKHA 1X3MA 3S41A 1ESVA 3D7EO 4I6MA 2IVOA 3QMLA 3VGLA 3HI0A 4FWLA 5AQKA 3O80A 4F9OA 3WEEA 2ZGZA 1SZ2A 3O8MA 4BG8A 1RFQA 3VERA 3P4IA 3VOVA 3HM8A 1Q18A 3A5OC 1QZ5A 4K41A 4E1JA 4CZIA 3LDPA 4DHYA 4RCHA 5KPZA 3A0IX 4H5RA 4ISGA 3D2FB 2FLOA 5AQOA 3A5MC 2FF6A 2GWJA 4RTFD 3C7NB 3SK3A 1KAZA 3CJBA 1SQKA 4CBUA 3CJAA 2D0OA 4CZKA 4JNEA 2NRHA 2KHOA 5FPDA 3R9PA 1T6CA 3FLCO 5AZIB 3VEXA 2YJFA 5F1XA 1ZXOA 3FFKB 5BN9A 2GELA 5TKYA 1H1VA 3G25A 3H6EA 4FL9A 2V7ZA 4B1UB 5FPMA 4CD1A 4BROA 1S3XA 4PL7A 3VF6A 4BC5A 5E84A 2IVPA 1QQMA 1KAXA 5I9EB 3EO3A 3EN9A 2D1KA 3L0QA 3MCPA 3TPQA 3CJ7A 1WOQA 1U6ZA 5AQVA 4H0XB 3ULEA 5AQJA 4M7YA 5AR0A 3FE1A 5AQFA 4B1XB 5BN8A 4H0YB 4HWIA 1D4XA 2FSJA 4XEIA 3W0LA 2QXLA 3WXKA 1X3NA 2I7NA 4FWNA 5BPMA 2VWBA 3UB5A 4CBXA 4Z94A 4H0TB 3LDOA 3O5BA 5JLHA 2P9NB 4C23A 3WXLA 2E2PA 3UKUB 1LCUA 4JD2A 1JCGA 3MN9A 4K42A 1DGKN 2P9IA 1WUAA 2QWPA 3VEWA 5AQSA 1K8KB 4WQ4A 3QFUA 3IDHA 5AQUA 4WQ4C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NH1A 2GUPA 4IOXA 3R8EA 4YY3K 4FWOA 4ZHRA 4OJRA 4IEEA 3MEGA 3VA0A 4NXNK 1RDWX 1W97L 3VQ7A 1GLBG 3KZBA 4RWTA 4FJIA 2RF2A 1R59O 3ID8A 3F9MA 4DB3A 3SQ2A 4BDPA 3DJCA 2NRZA 3S3MA 3CCSN 2G8VA 4PL8A 3VN5A 2Y1JA 1NM1A 3JXUA 4CECA 4BC2A 4H0OA 5HLFA 2AA4A 4O44A 3P83D 2ZJPL 4FWQA 2HHTA 1QVGM 3O08A 1IV0A 5AQHA 3I55N 1CZBA 1EQYA 4PKIA 4BC3A 4FM1A 3D45A 2WONA 4O55A 4Y0WA 3DXKB 2EWSA 4GNIA 5C25A 1ZBSA 2A1RA 1TL3A 4Z4HA 2FXUA 4DTJA 3LL3A 4NO7A 1TKXA 2QA4N 1VRTA 4JAXA 3ZLJA 3SJHA 4OGEA 4Z4GA 4JI5K 4NYFA 1T05A 3B8AX 3VTHA 2X74A 1RTHA 3OHRA 4XH4A 4BR2A 5HP1A 2QWQA 2CH5A 5AZJB 3A5NC 3ALYA 3CJCA 4NCBA 4BR9A 4LH4A 4BQLA 5AQGA 2NZTA 4BRPA 2HF3A 3RWUA 1K6YA 4LSNA 4CGJA 3K5MA 5IT9O 2A41A 3CG7A 3O4NA 1NGIA 2IS3A 5AZIA 2XO7A 3FZKA 1SKRA 3TARA 1N5YA 1WSFA 4FLVA 2DTUA 2QW9A 3PLAA 3Q7BA 3U9ZA 1VQ4N 4O0IA 1VQLN 1QSYA 3SZ2A 5AQMA 4JK8A 4CZFA 1YIJN 4DS5A 1XI1A 5LJWA 1XNRK 2G8HA 3ZSQA 4PUOA 3FZHA 1YJ9N 3VF2A 3L2RA 1C0MA 3CJ1A 1BQNA 4B3RK 3A5LC 3LANA 4X65K 1MA9B 1QHTA 3RR8A 4PWDA 3BEXA 1KVCA 1SKSA 1RBTA 2P9NA 3MEEA 4BQZA 4JEPA 3OS1A 1NJXA 2Q1NA 3O9QA 2F96A 4BDYA 1HPZA 3E66A 2PYLA 2HOEA 4LFCK 3L4IA 1K8KA 2V51B 1OH7A 4JKBA 3LPTA 1ZYQA 4CZEA 3CCRN 3THVA 4B1VA 1UAXA 2BUPA 4OPHA 2UUBK 1FKOA 3AARA 4W5NA 3CERA 3TTFA 2VWKA 3AGRA 3VQ9A 3SMPA 4PKGA 3C6AA 4FJNA 3ISNC 2YHXA 3ZSOA 4H4MA 4CGIA 4CK3A 3BGRA 3F9KA 1NOZA 3KJVA 1NNEA 4MFBA 1U4BA 2W6LA 2ZGYA 3ATUA 4CI6A 2XRIA 4FM0A 3VEVA 4FLYA 4BRKA 3QNOA 4F2RA 4CGHA 3AA4A 3BUZB 3DAWA 3SNNA 3BF1A 2PY5A 1N32K 1EETA 1U2VA 5J2MA 4J2DA 3OYNA 3VA3A 3NF9A 1OVQA 3SMSA 4NCAA 1RDBA 1XQSC 3ZT1A 1KC8O 4GMJB 3WQUA 4LH5A 2E2OA 3O9RA 1VSMA 1JL1A 2HNDA 3A8YA 1BOTO 4UY8O 1KFSA 3P38A 4BC4A 3K58A 3KHYA 2WC9A 5ELZA 4FPAA 3PX6A 4AM7A 1Y64A 1BWFO 3U8XA 1J6ZA 4AILC 3CJ9A 3VENA 2KFZA 4RW9A 3TTCA 2A5XA 3DRSA 3GG4A 3THXB 4LF6K 1HKBA 3MN6A 1FW6A 3SUPA 1NGDA 3OS0A 4CEQA 1ASWA 3K59A 4A5AA 1BG3A 2OZSA 3JAMO 4KTWA 3I8DA 2KW4A 1P8ZA 3K9KA 3DLBA 4KHQA 3MWTA 4CEDA 4DQ8A 3TAGA 1U49A 4IXCA 1UOCA 4B3OA 4FYDA 4ELVA 3KK1A 3QNNA 2YHWA 2ZJQL 4WCEL 4NYNA 4CF0A 4J8FA 4CJ5A 1TYQA 2Q2RA 5AQXA 4JD2B 3LM2A 4GV6A 3O4QA 4QS9A 2P9IB 3M3ZA 4OKEA 4AHCA 1BI4A 1DTTA 2O8EA 4IJAA 1CZAN 4QS7A 5J2PA 1IKYA 3QERA 3HP9A 2D4WA 1CXUA 2P9PA 3QEIA 4Q0BA 1JJ2M 3B6OA 3TSUA 1LW0A 3CCUN 4ZTJA 3L2VA 1C0FA 3MK6A 3QFPA 3ZEUA 4KPYA 4FJJA 4NB4A 3SAGA 4FWPA 4FWRA 3P1GA 4BECA 4M3XA 2A40A 4OKJA 3AY9A 3QEWA 1UA1A 3CI5A 1WAJA 4JKAA 1HJRA 5GINA 5CZ2A 3V9WA 1XMQK 3CCJN 2H3GX 4YOVA 4H5WA 1T6DA 3PIOL 4KB0A 2QEXN 4CESA 2P5GA 1WB9A 1NGHA 3IG1A 1BDGA 5BRHA 2BTFA 3G0ZA 4KV8A 1HNZK 3LDNA 1RBRA 3MX2A 2O4IA 2O8CA 3SAHA 1MWMA 2YNGA 4FZXC 1NGJA 3AA3A 4PKHA 1X3MA 1W2BM 3MAQA 3T69A 1ESVA 4B8CA 4YOXA 3OYIA 3VGLA 3AVMA 4OLBA 3KLIA 3HI0A 4KTQA 2ZQBA 4ILJA 4ELUA 4K8ZA 1SZ2A 4BG8A 3KK2A 3KTQA 4H4OA 1Q18A 1RNHA 1QZ5A 4E1JA 4RCHA 5KPZA 3A0IX 4H5RA 4DTOA 4PA1A 4DR6K 2OPPA 3A5MC 1LWFA 3SUOA 2BE2A 3K2PA 2YKMA 4CBUA 2D0OA 4N47A 1NJYA 2KHOA 4AF1A 1HNXK 1N36K 4Y1CA 5AZIB 3VEXA 1TK5A 2GELA 1NK7A 3H6EA 4FL9A 3QLHA 1RDDA 4JKEA 2C1GA 3VQCA 3HPGA 4NLCA 4BC5A 3ASMA 1XHZA 5GAEP 1QQMA 4G9ZA 3EO3A 3SQ0A 2NNWA 4AHUA 5EU7A 1Q82O 1RT3A 5AR0A 4M7YA 5BN8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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