5AFUH

Cryo-em structure of dynein tail-dynactin-bicd2n complex
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Motor protein
molecule keywords DYNEIN TAIL
publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5afuH03
1G99A 5AZIB 3VEXA 2IVOA 2AP1A 1NWKA 2V51B 5AQPA 3WQUA 1GLCG 2KHOA 5E26A 1QQOA 3CQXA 2A40A 1Y64A 4MLEA 3U8XA 3ULEA 1KAXA 5AQNA 4QS8A 4BROA 2D4WA 3ID8A 4FWLA 2P9KB 4PKIA 4FO0A 5AQFA 3J8AA 3M3ZA 4NO7A 5AQLA 3VEWA 2P9IB 4CZKA 3WXKA 3VEZA 1NGJA 3MK6A 2NLXA 4BRIA 3UKUB 4K25A 5AZJA 3A5OC 4FWSA 4EFHA 2V7ZA 3WUHA 1BDGA 3M1FA 2P9LB 2E88A 4XEIA 2I7PA 1NGCA 3VGMA 1NLVA 2E2QA 1QHAA 4PKHA 1BO5O 2VYPA 4CZMA 3R8EA 3GBTA 2P9PB 3WEEB 1C0GA 3ZEUB 1ZXOA 4PKGA 5EY4A 1DEJA 2V52B 2ASMA 4A2AA 4BGBA 1SAZA 2YJEA 1R59O 1CZAN 5FPNA 3LM9A 1YAGA 3UB5A 5BPNA 3A8YA 3SMSA 3IFRA 1H1VA 3M6GA 2VWBA 4M7XA 3QMLA 4BREA 3L6QA 1DGKN 3L4IA 4A61A 4B1ZA 2FLOA 2QWOA 3A5MC 3SJHA 3VPZA 3WT0A 4BG8A 1XC3A 4B1VA 3FR0A 3VGKA 4CJ7A 2IIRA 4F9OA 1SQKA 3H1QA 2A42A 3LDQA 3HM8A 4BR0A 1IG8A 4IWVA 2P9SB 3HBTA 4IJNA 4H03B 3H46O 2E20A 2HF3A 3CJ7A 3HI0A 2OANA 5JLFA 3D2EA 3FZHA 2CH6A 4LC9B 2D0PA 2I7NA 2F9WA 4MO4A 3LDOA 2P9LA 3VF4A 3BUZB 1NGAA 2BUPA 3MN6A 3H1VX 3HZ6A 2HMPA 4ISEA 4CD3A 5JMVA 4BR2A 2CGKA 2QWNA 1Q18A 2WUSA 5AQQA 3O8MA 4JNEA 4NB4A 2GWJA 3ZEUA 4B1UB 3IDHA 4H0YB 1V4SA 5ELZA 4BC4A 3MDQA 3BEXA 4HWIA 4B1XB 3FE1A 5AQZA 5AQYA 5BPMA 1ATRA 4XH1A 3U9DA 3KHYA 3CJAA 3H45C 3O80A 5I9EB 5B8HA 2YJFA 4O8KA 2YCHA 4BRPA 5AQRA 3VENA 4BR4A 2FXUA 3H6EA 5EVZA 5AQWA 1XUPO 3BP8A 1SZ2A 1KAYA 4CZEA 3ZX3A 4CZLA 3ATUA 4EHTA 4XH4A 3G25A 5BPLA 1U2VB 4IXCA 3U9ZA 4BC3A 2PAVA 1EQYA 2QXLA 3LM2A 4KBOA 4WQ4C 1QQNA 4BQLA 1ZC6A 3I8BA 3B8AX 1NMDA 4M7YA 4H5RA 4JHDB 1KXPA 3VF6A 4Y0WA 4BR5A 3JS6A 4CZJA 3CI5A 3DXMB 3SMPA 2YI1A 4WQ5A 3FZLA 2QWRA 5EOYA 2Q36A 5AQJA 2DPNA 4CBUA 5E84A 4C23A 4RWTA 1BU6O 4AM6A 3GG4A 2AA4A 2E8AA 3WXJA 4H5VA 3QFPA 3O4WA 5BN8A 4BRNA 3MMVA 4YDUA 2W40A 3O1WA 3CETA 5BRDA 2Q31A 4H0PA 2QWMA 3R9PA 3UKRB 2D0OA 5AQKA 1LOTB 3VF2A 3JXUA 4GNIA 5F1XA 4QS7A 3RSEA 4BRQA 5F0XA 1NGHA 2YHWA 4I6MA 4H5NA 3AARA 1MWKA 5F2RA 1BOTO 3GL1A 1NGGA 4BGAA 2Q0UA 1RFQA 5ADXA 4PL8A 4K42A 3CJBA 5AZIA 4CD1A 2YHXA 3VEYA 4H0OA 5LJWA 4FPAA 1TYQB 4Z94A 1K8KB 3F9MA 3C7NB 3C0BA 4JHDA 2A41A 5FPMA 4CZGA 1RGIA 2D1KA 1NGFA 5AFUH 5JICA 2FF3B 4EIAA 2GWKA 2GELA 3MCPA 3DXMA 3LL3A 1GLDG 2P9KA 3O5BA 3VGLA 2P9UB 4H5TA 4FOIA 5AQSA 4AM7A 2P9IA 1S22A 3VESA 5LY3A 5AR0A 3UKUA 4H0TB 3FFKB 4FPBA 1HKGA 4CBXA 3LDPA 3EZWA 3AAQA 3ZETB 3DJCA 3D7EO 2QW9A 4JD2B 3WXLA 4FWNA 3L0QA 3CJ1A 3EKUA 4GY2B 1JCEA 2P9PA 3MN7A 4BRHA 3HSCA 5TKYA 2VCPA 4CI6A 3WEEA 2CGJA 3EL2A 2QWLA 1JCGA 4HTLA 4BQZA 5AQMA 3MN5A 4RTFD 2YHYA 1MA9B 2A3ZA 3HTVA 3OHRA 4BRDA 4BRGA 3EN9A 4IZ9A 4H0XB 5AQIA 2A5XA 3BF1A 4B9QA 3W3DA 3H3OB 1HKCA 1K8KA 5JLHA 3C7NA 3FZMA 5AQUA 4BR7A 1MWMA 3U4LA 4FWKA 2QWQA 3ATVA 1Z6RA 3DAWA 5AZJB 4EAHD 3ENHA 2P9SA 2IVNA 3A0IX 4FWQA 1QQMA 1ESVA 2QM1A 4DHYA 4PL7A 3CJ9A 2CGLA 1GLJO 4O5FA 2GEMA 2E1ZA 1BA1A 3EO3A 3P4IA 3ZETA 4BRKA 3CJCA 4CZHA 2Q97A 1ZBSA 3D2FB 1BA0A 3QBXA 2CH5A 3WXIA 4CZIA 5AQTA 2E2NA 4JN4A 3A5LC 1HJOA 1NGDA 3O08A 5KQ8A 1X3NA 4FWPA 5AQOA 5EX5A 1TUUA 2HOEA 2GTDA 4WYBA 1P8ZA 1C0FA 4BRLA 1QZ5A 1V4TA 1X3MA 3SK3A 3FZKA 4WQ5C 4BRAA 3WQTA 3QDKA 1NGIA 4BVOA 1S3XA 5AQHA 3KZBA 1T6CA 1HUXA 1T6DA 4BC2A 3KVGA 4M63C 2Q0RA 4CBWA 5KQDA 3UE5A 1J6ZA 2E2OA 3GOIA 2E1YA 4IJAA 3ENOA 4XH5A 4EHUA 3QICA 3TPQA 4FWOA 2ZF5O 4YDUC 1U2VA 1NGEA 3A5NC 1HPMA 3D2EB 2FSJA 1NM1A 4ISFA 3ZX2A 2J4RA 3H3NO 3I33A 1WUAA 4DCHA 4BR9A 3EKSA 5AQXA 2V7YA 3S41A 4B1YB 4A2BA 1LCUA 4QS9A 4DB3A 1JCFA 1IJJA 5AQGA 1NGBA 1GLBG 3IUCA 2ITMA 5FPEA 2FF6A 2F9TA 3DXKB 3VEVA 3D2FA 3FGUA 2PBDA 5BRHA 5KPTA 2A6AA 1ATSA 1X9JA 1NBWA 2P9NB 4J8FA 3VETA 3W0LA 1BG3A 5BR9A 4H5WA 1DKGD 3AY9A 3TU5A 4A62A 4DQ8A 4K41A 2Q2RA 1GLAG 2EWSA 3LDLA 1YUWA 5CE3A 1GLEG 4CZFA 3QBWA 1T44A 3LDNA 5KPZA 2ASOA 2NZTA 4K43A 3GDQA 4B1WB 1Z05A 3GE1A 5BRFA 1E4GT 1YVNA 1BUPA 2E2PA 2W41A 4L3QA 5BREA 1OKJA 3CERA 1MDUB 4BVPA 3UKRA 1D4XA 4FWMA 3SLCA 3ZX0A 3CQYA 2QWPA 2Q1NA 4BRFA 5KPRA 2ZGYA 4FOEA 3BF3A 5BN9A 3O6WA 2ZWHA 4E1JA 2H3GX 4JAXA 1ATNA 3ULEB 4FL9A 5AQVA 5FPDA 5EXWA 1TYQA 3O1BA 4BG9A 2HF4A 2ZGZA 3IMXA 2UYTA 1BWFO 1KAZA 4FWRA 3VERA 3VOVA 3DWLA 3DXKA 3FZFA 4BRMA 4H0VB 2NRHA 3VEOA 1HKBA 1GLFO 4BC5A 3FLCO 1YXQA 2P9NA 1TUYA 4RCHA 4ISGA 5LJVA 2P9UA 1HX1A 3MN9A 4BRCA 1RDWX 5AFUA 2BTFA 1E4FT 2FSNA 2IVPA 3QFUA 1WOQA 1XQSC 2GUPA 3AAPA 3QB0A 2FSKA 4FSVA 5ADXH 4WQ4A 4JD2A 3RSEB 3CIPA 4MLHA 1HLUA 2ASPA 3R6MA 4IO8A 4I6MB 1U6ZA 1GLLO 1QZ6A 4MO5A 3CHWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M3TA 1VAZA 5AZIB 4JKHA 1VSEA 2IVOA 1NWKA 2JWLA 1GLCG 1RDDA 1QQOA 1JXBA 2EX3A 2A40A 5SWMA 3AO5A 1BIUA 1Y64A 4Q5VA 3CCRN 2Z1HA 1KAXA 4DTUA 4CJ4A 3LZIA 4IO9L 2XRIA 1JLBA 1N5YA 1JXEA 1S5JA 2GV9A 1RILA 4CZKA 4FLVA 2NLXA 3ZT2A 3RMCA 3L2RA 3A5OC 3NBPA 3SQ2A 4PHTX 1BDGA 4E72A 1OVYA 4FLTA 2I7PA 4QOZB 3VGMA 1VQMN 1BO5O 4ZTFA 3R8EA 2HVHA 1WLJA 2LSNA 2WFBA 3CF5L 4DSJA 5JVHL 4MQ3A 3WEEB 1TVRA 1LWCA 3JSMA 4CFCA 3IKMA 3N4QA 3QINA 1KLNA 3IAYA 3K57A 4KB0A 3NCIA 2QXFA 3A8YA 3PY8A 3VQEA 4DG1A 1T3VA 4BREA 1DGKN 2A1RA 1EXQA 4A61A 2HBLA 4DQSA 3WT0A 4HUGA 4BG8A 3OY9A 1RBUA 4NCAA 1C0TA 3P39A 2IIRA 4FM0A 4OLAA 3H1QA 4ELUA 2A42A 3LDQA 3HM8A 4WCEL 3AVJA 3V9XA 2KKZA 5HROA 3HPHA 4CW7B 4IBNA 4IJNA 2B5JA 5C0YA 3HI0A 5LL6Z 1L3SA 1YT3A 4G9ZA 5GIPA 3AO1A 3LPTA 5T7BA 4FJXA 2F9WA 2VGNA 4FCYA 4BECA 3TAFA 3SBGA 4LF9K 3DI6A 4LF5K 4BR2A 1Q18A 3O8MA 4JNEA 4NB4A 4H0YB 1V4SA 3MDQA 3T69A 3NF6A 4B1XB 3K0SA 4E1NA 1ATRA 3NMUA 2DTUA 3H45C 5I9EB 1JL2A 4FLXA 4FM1A 2O8BA 4BRPA 4DR5K 4CF0A 3KLFA 5AQWA 5HRRA 1XUPO 3BP8A 1UAXA 1RNHA 4CZEA 2ZQBA 2UU9K 4XH4A 1KCFA 1VQ4N 3HOTA 2UUAK 2G8VA 3ALYA 4DU1A 2UXDK 4F8RA 1EQYA 3QIOA 5C2DA 4KBOA 4NCBA 3L2UA 3OS2A 3NF8A 3DMJA 1ZC6A 4JRPA 4LFAK 1C6VA 1NMDA 4M7YA 3D45A 3MEGA 4JHDB 2JGUA 3DLBA 1JL1A 4FZZA 1HNVA 1EKEA 3NF7A 4CHOA 2ZJRL 2IS3A 4WQ5A 2QTDA 4DV6K 2Q36A 2DPNA 1DTQA 1HYZA 2BE2A 4LH5A 4CBUA 1A5XA 3CD6N 3HT3A 4CEAA 2AA4A 1WSJA 1Q9YA 3WXJA 4JI5K 3F9KA 3ASMA 1SL1A 2D0BA 2W40A 4H4OA 1LWFA 2Q31A 2YHAA 1I39A 3R9PA 4YOYA 1LOTB 3VF2A 4GNIA 1QHTA 5F1XA 4W5RA 4DF4A 3AVNA 1VSDA 5F0XA 4DFPA 1NGHA 4CJUA 4DTNA 3CPEA 3AARA 1MWKA 4M3YA 5KTQA 2Q0UA 4PL8A 2E5LK 3OYJA 3ISNC 3TSQA 4CJWA 5MLCQ 2F8SA 2YHXA 4H0OA 4KTZA 3F9MA 4JRQA 4JHDA 2R7YA 5FPMA 3AVAA 2GWKA 3CCEN 3NH2A 4E7KA 2D0CA 3AVIA 2P9KA 1D9FA 3TTCA 4CJLA 5M1OA 3KLHA 1RTDA 2PFUA 3UKUA 1FKPA 1NJXA 1WN7A 3HP6A 3MCAB 4M41A 3NVKA 4PQUA 4AQYK 2YKMA 3DLRA 1SKSA 3D7EO 4JD2B 3WNEA 2HNZA 4FJJA 3PX4A 3CJ1A 3NF9A 4GY2B 2E6MA 4RW6A 3HVTA 4FJKA 4BQZA 3HSTB 1YJ9N 3MN5A 4JI6K 3AVCA 1ASVA 3DM2A 1MA9B 1Q9XA 4KB1A 3OBYA 3TWHA 3CCQN 3EN9A 4H0XB 4E7LA 5AQIA 1SKWA 3BF1A 4CK1A 3H3OB 4FJNA 2DFHA 4KTWA 4FK4A 3OYKA 3FZMA 4DQRA 4ILJA 3U4LA 2WTUA 4FWKA 3CC2N 4R79A 3ATVA 1Z6RA 5AZJB 3CCUN 2P9SA 4FWQA 3ENBA 3KD5E 2CGLA 1GLJO 4O5FA 3OYNA 1BA1A 3P4IA 4HHTA 1EO1A 4JI1K 3AA3A 4CZHA 4DLEA 1RT7A 3OVNA 3DLHA 3F5TA 4NLBA 2CH5A 2NRVA 2OTLN 2O8CA 3KLGA 2E2NA 3A5LC 5C42A 3OW2M 4KH6A 4AHCA 5AQOA 1I3AA 2RHKA 2WBNA 3ZYYX 2HOEA 3VA3A 4WYBA 4DU3A 4HCCA 1HPZA 2OZSA 3M8PA 1V4TA 4CGGA 5JVGL 1JLAA 3G0ZA 4JK8A 3O9TA 1S3XA 3SJJA 5FRNA 4DR3K 1HUXA 1T6DA 4BC2A 3LZJA 5DMRA 3LP1A 4M63C 4IFEA 4CBWA 2BANA 2B4JA 4JI4K 1HNXK 2FBVA 4IOAL 4FVUA 4GKKK 3GOIA 1HMVA 5LMNK 5HL7L 4JEPA 3AVFA 1VQ6N 1NM1A 4ISFA 3S3NA 2J4RA 2VWJA 3SQ0A 2HW3A 1NU0A 3S41A 4DB3A 3R1XA 2F96A 4Z4EA 4CFBA 5FPEA 2FF6A 3THVA 4O0IA 5I42A 3FGUA 5BRHA 4FJIA 4CGDA 1X9JA 3AVKA 2KFNA 4DQ8A 3LDLA 5CE3A 3ZSWA 4FJLA 1T44A 3LDNA 5KPZA 4IOCL 2ASOA 3M8SA 4K43A 3GDQA 4K8ZA 5CZ2A 4HVJA 1YJWN 5BRFA 1E4GT 2OYQA 1YVNA 4EZ9A 4FJ9A 2E2PA 5BREA 4DTMA 4B9NA 1MDUB 4BVPA 3ZT4A 3UKRA 5M1NA 3THYB 1D4XA 1TL3A 1SV5A 4B3RK 3SLCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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