3VEZA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz k443a variant in complex with atp, adp and carbamoyl phosphate
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
566
structure length
566
Chain Sequence
MRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERFTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVADREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
molecule tags Transferase
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
total genus 187
structure length 566
sequence length 566
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vezA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vezA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vezA03
3A8YA 3H1QA 4FWQA 4NB4A 4BRAA 4E1JA 1TUYA 3O5BA 4B1XB 3WXLA 2AA4A 5LY3A 3WT0A 3H46O 3VPZA 1QZ5A 5BRDA 3BUZB 2FSJA 3WQTA 4H0OA 2E2PA 2Q1NA 4H5RA 1ZXOA 2V7ZA 3U9ZA 3CERA 5EX5A 5AQPA 4FPAA 4BC5A 4CBUA 4A2AA 2QWOA 5AQYA 4I6MB 3I33A 5BN9A 3FZFA 4CZMA 4FWOA 1QQNA 4I6MA 3RSEB 4B1UB 1NGGA 4H0YB 3MN5A 4O5FA 3RSEA 2P9PB 4XH4A 2P9UA 4FSVA 3UKRB 3UB5A 2P9PA 1KAYA 1RGIA 5AQUA 1XUPO 1TYQB 3VF4A 2P9KB 2W41A 3TTCA 3C7NA 3TSUA 1TYQA 2QM1A 2QWPA 5FPNA 3ULEB 3WXKA 1NMDA 1J6ZA 2J4RA 4LC9B 4B1ZA 1NGFA 4BRLA 4H5WA 5AQLA 4H0PA 1EQYA 4EFHA 2GUPA 3OHRA 3R9PA 4CZGA 5KPTA 3M3ZA 2E2NA 1HPMA 3DAWA 4K43A 3IFRA 4PKGA 1T6DA 1NGEA 2IVOA 4JHDB 4CI6A 5LJWA 3GG4A 1BU6O 3CI5A 4JHDA 4WQ5A 3GDQA 3O08A 4YDUA 3AAQA 3VOVA 3VTHA 3HZ6A 3VENA 4ISFA 5TKYA 5KPRA 3GL1A 3CIPA 3W3DA 5F1XA 3FFKB 5KQ8A 4JAXA 5KPZA 2ZF5O 4WQ4C 4BC2A 1X9JA 1GLBG 5FPMA 4IZ9A 5AQSA 2A6AA 4XH5A 4MO5A 3LDLA 1ESVA 4QS8A 2WUSA 3D2FB 5AQNA 2NRHA 4BRCA 5AQHA 3S41A 1C0GA 4BRNA 2D0OA 3VEOA 2YHWA 2CGLA 2Q36A 5CE3A 3QICA 4IWVA 2P9NA 4XEIA 3MN6A 5EXWA 1CZAN 2ZWHA 1GLDG 4BR0A 1NWKA 2W40A 4BRDA 4BG9A 1XC3A 4RTFD 4KBOA 3U8XA 5AZJB 1NGDA 1BA1A 3QMLA 3R8EA 4CBWA 2E1ZA 3MN9A 1QQMA 1S22A 3BF3A 2AP1A 2ASPA 2A41A 3WXJA 4H03B 4JNEA 5BREA 4HTLA 4H0TB 1QZ6A 4IJAA 5AQZA 5AQVA 4FWPA 3VEWA 1SZ2A 2YJEA 1NGCA 3O1WA 3LDNA 3VEYA 4BRHA 4MLHA 1LOTB 4HWIA 1GLFO 3IDHA 5BRHA 4GNIA 2ZGZA 3EN9A 4PKHA 3ATVA 3JXUA 3J8AA 4JN4A 4JD2A 2QWQA 4IJNA 4DQ8A 2QXLA 5AQTA 3ID8A 1Y64A 3EKUA 2E1YA 4K42A 5AR0A 3WQUA 3VF2A 3FZMA 2E8AA 3LDOA 4B9QA 4H5TA 3TTFA 3P4IA 1U2VB 4FOEA 1U2VA 4FPBA 3VESA 5B8HA 3ZEUB 3F9MA 4A2BA 5I9EB 4AM7A 3CJ1A 3QBWA 3ZEUA 2V7YA 3AY9A 1NGJA 2I7NA 3AAPA 4EHTA 3CJCA 2D4WA 4WQ4A 4BR5A 1MWMA 1U6ZA 3MDQA 4PL8A 4BR7A 3UKRA 2I7PA 1P8ZA 1GLEG 3D7EO 2GWJA 2P9KA 4BR9A 1BOTO 2PBDA 4M7XA 2F9TA 5JICA 2VCPA 4FWRA 3ULEA 3WUHA 2D1KA 1Z6RA 4MLEA 2HF4A 3BF1A 4BREA 3HTVA 2IVNA 3MCPA 2DPNA 3O4WA 3EL2A 3QFUA 4IXCA 2EWSA 3BP8A 4L3QA 1E4FT 3DWLA 4GY2B 1ATSA 1NGIA 1GLJO 5AQGA 1Z05A 3G25A 3H6EA 3SJHA 1BO5O 5EY4A 3CJBA 1JCFA 2P9IB 2FF3B 4M63C 5AQWA 3GE1A 4A62A 1GLCG 4EHUA 1DKGD 2E88A 1QQOA 1G99A 4H0XB 5BPNA 3D2FA 1ATNA 1SQKA 4ISGA 4K41A 3A0IX 3ZX3A 1SAZA 4FO0A 2ZGYA 4CJ7A 3DXKB 1BUPA 2QWRA 4EIAA 3MK6A 5BPMA 2HF3A 1ATRA 3UKUB 3DXMB 1YVNA 3VEZA 1ZBSA 3KHYA 1JCGA 3DXMA 3FLCO 4CBXA 5AZJA 1R59O 1NBWA 3LDPA 2D0PA 4BC3A 4MO4A 2E2QA 3VF6A 2P9LB 5BN8A 3MN7A 4B1VA 2E2OA 3VEXA 1WOQA 2OANA 4FWSA 2QWMA 5JMVA 5AQKA 4BR2A 1E4GT 2KHOA 2VYPA 2QWNA 3L0QA 1BA0A 3GBTA 4F9OA 4B1YB 4BC4A 3B8AX 4H0VB 4BGAA 4PL7A 3ENOA 5KQDA 3LM2A 3EZWA 2P9SB 3O80A 3IUCA 4CZLA 2GTDA 3SLCA 1K8KB 4FWLA 3UE5A 1KAXA 2YJFA 2A42A 4PKIA 1HUXA 1YAGA 2Q2RA 4BRKA 3FZHA 1QHAA 2ITMA 1BG3A 1KAZA 3H45C 4Z94A 3U9DA 4CZFA 1ZC6A 3R6MA 1DEJA 1BDGA 2BTFA 4BROA 2FXUA 3FE1A 4M7YA 1C0FA 3SK3A 5F2RA 3D2EB 1MWKA 3D2EA 3M6GA 5AFUH 3VERA 1WUAA 2NZTA 3VETA 1HJOA 5JLHA 4FWMA 3TPQA 4BVOA 3M1FA 4BVPA 2FSKA 2A40A 5AFUA 3TU5A 3HM8A 4RCHA 1X3MA 4IO8A 3A5LC 3W0LA 2GELA 3QBXA 3ZETB 4CZEA 3VGKA 3TSQA 2Q97A 3ZETA 4K25A 2A3ZA 2HOEA 1HKBA 1YXQA 4BRQA 2YI1A 3H3NO 1GLLO 3CHWA 4NO7A 2CH5A 1HKGA 4Y0WA 1X3NA 5ADXH 5LJVA 2YHXA 4QS7A 1IJJA 2PAVA 3CQYA 3KZBA 2Q0RA 1YUWA 1Q18A 4H5VA 3AARA 5ADXA 3FZLA 4EAHD 2P9UB 3L6QA 5FPEA 2UYTA 3LM9A 3C7NB 1BWFO 4FOIA 5AQIA 2YHYA 1NGBA 4FWKA 3QDKA 2IVPA 2HMPA 3QFPA 3SMSA 1H1VA 2BUPA 3CJ9A 1NGAA 2F9WA 3ZX0A 3O1BA 1HLUA 4A61A 3KVGA 3GOIA 1DGKN 2Q31A 2NLXA 2V51B 2ASOA 2GWKA 2QW9A 4C23A 3A5NC 1XQSC 2QWLA 4DB3A 3I8BA 2P9IA 4BGBA 1TUUA 4BRPA 2GEMA 3TSPA 3CQXA 4QS9A 5AQQA 3A5OC 1V4TA 3ENHA 4CD1A 1HKCA 5EVZA 4BQZA 5AQOA 3HBTA 1NM1A 5E26A 4CZKA 3H3OB 1GLAG 1NGHA 5AQXA 2IIRA 3DXKA 4DHYA 5JLFA 1S3XA 3QB0A 4BRFA 5AQFA 1HX1A 3UKUA 3ZX2A 3IMXA 1OKJA 3FGUA 4BQLA 1T6CA 1KXPA 3U4LA 5AQMA 3TTDA 3FZKA 3A5MC 3L4IA 2H3GX 2P9NB 2P9LA 3C0BA 4BR4A 1T44A 4H5NA 3VEVA 2Q0UA 4FL9A 3VGLA 3JS6A 5BR9A 4CD3A 2A5XA 3FR0A 1NLVA 1MDUB 5FPDA 4WQ5C 4YDUC 1RDWX 4BRMA 1D4XA 4WYBA 2CGKA 2P9SA 3LL3A 1K8KA 5AZIB 4RWTA 3EKSA 4XH1A 5BRFA 3O6WA 5AZIA 2CGJA 4CZJA 1IG8A 3CJ7A 4FWNA 5AQJA 2ASMA 2E20A 2FSNA 5ELZA 4B1WB 2YCHA 4O8KA 5BPLA 4ISEA 5EOYA 3VGMA 1V4SA 1RFQA 4BRIA 3BEXA 3WEEB 3EO3A 3ATUA 2CH6A 4DCHA 3WEEA 3O8MA 3DJCA 3LDQA 3HI0A 3HSCA 5F0XA 1LCUA 4AM6A 4BG8A 1JCEA 1MA9B 2V52B 2VWBA 3MMVA 3CETA 4CZIA 2FF6A 2FLOA 4J8FA 4BRGA 5E84A 3H1VX 3WXIA 4JD2B 5AQRA 4CZHA 3CJAA 3SMPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A8YA 5GIPA 1VSEA 4KFBA 1NK9A 4M3ZA 4ILJA 4DUZK 5M1NA 2VG6A 2PFUA 5BRDA 2HMIA 4KHPK 2V7ZA 1LW2A 3CCMN 4FLTA 4A2AA 4LF5K 5AQYA 4CJWA 3ZYYX 1WBBA 4J2DA 3FZFA 4P8EA 1QQNA 3K0SA 3OYAA 1NGGA 4H0YB 4O5FA 3TWHA 2P9PA 4NXMK 2DFFA 2P9KB 2UUAK 2QM1A 2QWPA 1RDAA 4CGJA 3AA2A 3E1YA 1NGFA 1T3VA 4RW9A 4QOZB 2KTQA 1EQYA 1SS6A 3I55N 3M3ZA 4BWJA 3SNNA 2ETJA 4K43A 3LWLA 1BIZA 4RW8A 4FFJA 4YOUA 2IVOA 5IWAK 1JKHA 4WQ5A 4YDUA 3HZ6A 4FK4A 4ISFA 5KPRA 4CEAA 2ZJQL 5HRNA 5KQ8A 5KPZA 5KRSA 1X9JA 1TK0A 3KD5E 3JSMA 3K2PA 5AQSA 2G8KA 4QS8A 1VQON 1O1WA 5J1EA 4M3RA 3D2FB 5AQNA 3THYB 3TARA 2CGLA 4AHTA 3QICA 4CGDA 2P9NA 1DT9A 3T1AA 3LRJA 1CZAN 3LPTA 4DV2K 4BR0A 4IKFA 3ZSZA 2W40A 4BG9A 4OPAA 2O8EA 3VQ9A 5C10A 1BA1A 5KGWA 3AV9A 1FKOA 4PY5A 3QINA 3AVGA 2IS3A 4FJXA 1YI2N 3QESA 3P5JA 2AP1A 5E41A 4YNQA 4OPJA 4JNEA 4Z4EA 1QZ6A 4DF8A 1RTDA 3VEWA 3SCXA 3R3LA 4DG1A 2NRXA 4F3TA 4DFJA 1K9MO 4BRHA 3P31A 4CEBA 5BRHA 2P5OA 2KZMA 1ZBHA 2HSTA 2X6SA 4FLXA 2HHQA 1X9SA 3J8AA 1RBTA 4IDHA 4JD2A 3V6DA 4IJNA 3PSFA 4B9NA 3M5RA 1IKVA 4Q0BA 2E1YA 5AR0A 1WSGA 2Z1GA 2HBLA 2E8AA 4B9TA 2HBMA 4H5TA 3LAKA 4JKCA 2KFZA 3NFAA 4FOEA 1U2VA 3AVLA 4A2BA 5I9EB 4CGFA 4AM7A 4I7FA 4PQUA 3NAEA 3LAMA 2QEXN 2QA4N 3VA3A 1BIUA 1Y97A 2VGMA 2HHVA 5CYQA 1U6ZA 1HRUA 3MDQA 5J2QA 3CMEN 1DTTA 1RILA 4BR9A 1BOTO 2PBDA 4N47A 4M7XA 1VQMN 3WUHA 1JLQA 5LL6Z 3ULEA 3PUFA 3TAEA 1QS4A 2HHWA 1W7AA 4MDAA 2HF4A 1GOBA 3BF1A 1CXQA 4BREA 3O4WA 4KH5A 4IXCA 2EWSA 4AF1A 4ZTFA 5C42A 3AVBA 4DV3K 2YV0X 1E4FT 1S1TA 1RDDA 4C1NK 3P38A 2O4IA 1RDUA 5AQGA 4AQYK 4DQSA 3SJHA 1R0AA 1BHLA 4CHQA 2DTUA 2FF3B 3MEEA 5AQWA 1HNXK 1RBRA 1DKGD 5BPNA 3TAMA 2VQFK 2X78A 4JK8A 1B9DA 2NRRA 4CJ7A 1K6YA 3DXKB 4FLVA 1LW0A 1YJNN 2QWRA 3MK6A 4DTMA 4HHTA 4P6PA 2Y1JA 3J7ZO 3MXIA 4Z4CA 2DFEA 1R59O 2HHTA 1E3MA 1NBWA 3P1GA 2KKZA 3LZJA 1QSSA 3HO1A 2E2OA 1EKEA 5AQKA 1VQNN 4BDYA 4C8KA 2ZQBA 1RT1A 2QWNA 3MAQA 1NMNA 1XHZA 3GBTA 1JL2A 4PL7A 3ENOA 4EZ9A 1L3VA 3LM2A 4FW1A 2P9SB 4YY3K 4CZLA 3SLCA 4JKBA 2GV9A 3T19A 1KAXA 2YNIA 1HUXA 4JI8K 3ZSOA 2F96A 4Z94A 1KAZA 2OCEA 5GINA 4ELVA 3R6MA 2YHBA 1F21A 2FXUA 3PX0A 1NK6A 3M8PA 1KCFA 4IFEA 1WAFA 2HNYA 4FWMA 3V1OA 2O8DB 3O9SA 1VAZA 3HOTA 3TAPA 3K59A 3HM8A 4RCHA 1X3MA 5C2FA 4IO8A 3O3GA 4H4MA 4A57A 3VN5A 2RPIA 3RRHA 2FBTA 3QBXA 4CJ5A 1HR0K 3KLFA 5KI6A 2W6KA 4U67L 2Q97A 3ZETA 1WLJA 3PX4A 1A5VA 2OZMA 3CHWA 2CH5A 3E9LA 4RW6A 3RR8A 1UWBA 1X3NA 4GVMA 4FZZA 3KD1E 1T7PA 4ELUA 3V4IA 2QKBA 5ADXA 4B9UA 2O8CA 3OA9A 4C8OA 1WSHA 5KRTA 5FRNA 1RBSA 3BGRA 4CJKA 3LM9A 4CIGA 2QXFA 4OPKA 3F5TA 4E19A 3C7NB 1G15A 4FOIA 2OTJN 3QFPA 3ITHA 1UA1A 3DM2A 4I14A 3MWTA 2NRVA 2RN2A 2NLXA 3ZT2A 3A5NC 1XQSC 2QWLA 4FJMA 3QEVA 3AVIA 1TUUA 3OYIA 1VSFA 1NOZA 3TSPA 1ASWA 4BRPA 4QS9A 1NJYA 4DSIA 1TKXA 1RCHA 1NJWA 3SUNA 1XNQK 5EVZA 5M1QA 4DWIA 4PUOA 5AQOA 3HBTA 1NM1A 5E26A 3VA0A 4JKGA 5GAEP 4J2BA 3H3OB 3BZCA 3ZSWA 4TSXA 1KXPA 4OVLA 5AQMA 3U4LA 4EP5A 2H3GX 2P9LA 5JVHL 4Z0UA 3OTOK 3SQ0A 3NGIA 3MECA 1TV6A 1T44A 3VEVA 4KHSA 4FVMA 4HCBA 4P8JA 3FR0A 2NRZA 4JKEA 4XIUA 5FPDA 2UXCK 4ILGB 2CGKA 1T8EA 3QLHA 5AZIB 4XH1A 4B9MA 3O6WA 2CGJA 4CZJA 3CJ7A 4PHTX 2ASMA 2E20A 4B1WB 4O8KA 2NRWA 4FW2A 2EX3A 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 2Q1N A;  4CHZ A;  4FYD A;  4H5R A;  2JLE A;  4DSL A;  1XNR K;  3CER A;  3CC7 N;  1ZBU A;  2Z1H A;  1G58 A;  1C6V A;  3EYZ A;  2KZZ A;  3HXM A;  3I33 A;  5CZ2 A;  4CZM A;  4I6M A;  4B3S K;  3RSE A;  2P9P B;  4XH4 A;  3UKR B;  2YNH A;  2W41 A;  3TTC A;  4DV7 K;  3C7N A;  1TYQ A;  4OX9 K;  2BGG A;  2D0C A;  2VWJ A;  1YJ9 N;  5FPN A;  1BCM A;  1NMD A;  1VSJ A;  2J4R A;  5JS2 A;  3OYL A;  4DR7 K;  2O8B B;  4YHH K;  3NGY A;  4H5W A;  3KLH A;  3NE6 A;  4H0P A;  1XMQ K;  1M1K O;  1VQ4 N;  1IV0 A;  4CGG A;  1HQE A;  3NF8 A;  5KPT A;  4B8C A;  1QSY A;  1HPM A;  4DTO A;  3IFR A;  1T6D A;  1VSK A;  4JHD A;  3CI5 A;  3O08 A;  4GW6 A;  3AAQ A;  3SQ2 A;  1WAJ A;  3OJU A;  4IBN A;  4W5O A;  3H07 A;  4FZX C;  4NYF A;  2KQ2 A;  3FFK B;  4FJL A;  5HL7 L;  3VQE A;  2B6A A;  2BDP A;  2A6A A;  4XH5 A;  4MO5 A;  4AIL C;  4W5N A;  2ZJR L;  5AQH A;  3S41 A;  1C0G A;  2D0O A;  3VEO A;  3G10 A;  2Q36 A;  4XEI A;  3QEW A;  4B3M K;  4I9L A;  1XC3 A;  2O8E B;  4P77 A;  1NKB A;  1KC8 O;  1TL3 A;  3U8X A;  2BH1 A;  3E66 A; 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 4F9O A;  4B1Y B;  3B8A X;  4H0V B;  5KQD A;  1P90 A;  4AHC A;  1K8K B;  3PO5 A;  2YJF A;  4PKI A;  2HVH A;  4E7H A;  3HPH A;  1VQ8 N;  1KFS A;  4CJ4 A;  3FZH A;  4BDZ A;  3NHG A;  3KK1 A;  4Z4G A;  3DYA A;  1C0U A;  3VMF B;  3KK7 A;  4CZF A;  1DEJ A;  1BDG A;  2RE2 A;  4M7Y A;  1C0F A;  4CEE A;  3OYC A;  3SK3 A;  1QVG M;  1MWK A;  3L2U A;  3VET A;  4YOV A;  3DRS A;  2PZS A;  3TPQ A;  1GOA A;  3M1F A;  4BVP A;  4CK1 A;  3I0R A;  1YT3 A;  3AO5 A;  5A2Q O;  4KTQ A;  3PIP L;  5FRO A;  4E7I A;  3S3O A;  3MXM A;  3ZET B;  3NCI A;  4CZE A;  3VGK A;  1J9A A;  4K25 A;  4CJU A;  2I5J A;  3AO2 A;  1HKB A;  2YI1 A;  3AA3 A;  3H3N O;  4LH5 A;  4JS5 A;  4M45 A;  4E0D A;  1HKG A;  3RMB A;  1Q81 O;  5LMU K;  3OYG A;  5LJV A;  3OYJ A;  4QS7 A;  1FK9 A;  4YOR A;  4FJ5 A;  4FJ8 A;  2PAV A;  4FVU A;  3CQY A;  1HRH A;  1YUW A;  2Q0R A;  4FM1 A;  3AAR A;  3L7V A;  4HUG A;  4IEI A;  2P9U B;  2GBZ A;  3C65 A;  5FPE A;  1ZYQ A;  3AA5 X;  3OYF A;  2VG5 A;  3MX2 A;  3RR7 A;  5AQI A;  2G8H A;  4ID1 A;  4AHS A;  1NGB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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