3VEZA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz k443a variant in complex with atp, adp and carbamoyl phosphate
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
566
structure length
566
Chain Sequence
MRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERFTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVADREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
molecule tags Transferase
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
total genus 187
structure length 566
sequence length 566
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vezA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vezA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vezA03
3CJ9A 4BC3A 5AFUH 5JLFA 3RSEB 5ADXH 4CZGA 1LCUA 4MO5A 3MN7A 2FSNA 3C0BA 4NB4A 2YJFA 4H0YB 5F2RA 5AZJB 4CZFA 3MCPA 5B8HA 3FZFA 2QWPA 3ULEA 4BRHA 4CD3A 4ISEA 3KZBA 3L6QA 3S41A 4FPBA 3JXUA 2VYPA 3BEXA 3SK3A 5LY3A 3D2EA 3FFKB 3G25A 2E1ZA 4BR9A 2P9LA 2E2OA 4F9OA 3MK6A 4BROA 3L0QA 3MN9A 4IO8A 2P9UB 3IMXA 1S3XA 1X3MA 1NGBA 4B1YB 3FZMA 3QFUA 4JHDA 4CZHA 1YAGA 4CZKA 3DAWA 3ZX0A 3WXLA 1QHAA 3FGUA 3WXKA 4BRNA 5AQNA 2QM1A 3W0LA 1BA0A 1MA9B 5AQXA 2W41A 3EZWA 3GDQA 4JD2A 4M7YA 3D7EO 4MO4A 4BVPA 4BRAA 2P9KA 2QW9A 2WUSA 3VPZA 2A42A 3VOVA 3BP8A 2J4RA 2QWMA 3U9ZA 5AQPA 5I9EB 3UKRB 4EFHA 4PKGA 2P9IB 3WEEA 2GWJA 3O80A 2IVPA 3LDNA 4FWNA 2A6AA 1NGHA 4EHUA 2YCHA 4MLHA 1K8KB 2CGKA 3CJAA 2YHYA 3C7NB 4BGBA 5BRHA 3TU5A 4M63C 1Z05A 2A5XA 3SMSA 3DWLA 3R6MA 1YXQA 2BTFA 3LM2A 3CJ7A 4FWLA 1QZ6A 4WQ4A 1WUAA 3AARA 1YUWA 2ZGZA 3VF6A 3CJ1A 4Y0WA 5ELZA 4B1VA 1JCFA 2H3GX 3P4IA 4H5RA 3VEVA 3H6EA 3TTCA 3AAPA 4H5TA 3ZX3A 3QBXA 5JLHA 5FPEA 2D0OA 2Q1NA 3FZKA 5EX5A 3ZETA 3CETA 2D4WA 3KVGA 2ASPA 1G99A 4B1WB 2P9NB 1KAXA 4K42A 4FWQA 5AQUA 2CGJA 4K25A 4BQZA 1X9JA 3QMLA 1V4TA 3M6GA 2FF6A 5E84A 3H1QA 4QS7A 3ZEUA 2P9SA 3VGLA 4BQLA 2VCPA 1ZC6A 3WQTA 1U2VB 3LL3A 4IXCA 3VEWA 3EKUA 5AQQA 1T6CA 3F9MA 4BR2A 5EXWA 3DJCA 2AA4A 2D1KA 4FSVA 1MWKA 3QDKA 3VF4A 3VERA 3FZHA 5FPDA 2GWKA 5AQSA 3CJCA 2F9WA 3RSEA 4M7XA 3TPQA 1DEJA 3GE1A 5AQYA 4BRQA 3GOIA 3FLCO 5EY4A 4A61A 4BRMA 3O4WA 1BU6O 1U6ZA 3DXKB 1QQNA 3TSUA 1NGDA 5FPNA 1RFQA 2A40A 2P9PB 1MWMA 3H1VX 3HM8A 5BN9A 4XH5A 1XQSC 5AQTA 1E4GT 2NRHA 4B1UB 2ITMA 1ESVA 3BUZB 5JICA 4BREA 3VGKA 3W3DA 1NWKA 1NGCA 2E88A 5F1XA 2P9UA 3ID8A 3I8BA 2NZTA 1IJJA 5AQZA 5CE3A 3VEYA 4FWSA 5AQGA 4B1ZA 3FR0A 3SMPA 5E26A 3GBTA 3CQYA 5BRFA 1GLLO 3ULEB 2OANA 3VEOA 2YHWA 2ZGYA 2D0PA 4H0XB 4K43A 4WQ4C 1SQKA 4H5NA 3EN9A 1HX1A 3UKUB 5F0XA 4I6MA 3D2FB 1LOTB 3M1FA 2CGLA 3FE1A 1WOQA 1DGKN 4PL7A 2QWOA 4L3QA 1RDWX 3UE5A 2IVOA 2Q0RA 3H46O 2Q2RA 3HTVA 4FWRA 4LC9B 3R9PA 3WT0A 3CIPA 3A5OC 2I7PA 2GELA 1HUXA 5AQWA 4H0VB 2P9IA 1HJOA 3O5BA 4J8FA 4A2BA 5BREA 3H3OB 4B9QA 1Y64A 4XH4A 2E20A 3U9DA 1KAYA 3WUHA 1K8KA 4DHYA 3ATUA 3C7NA 4BVOA 5ADXA 1OKJA 2E2NA 2ASOA 2E1YA 4FPAA 4CBWA 1QZ5A 4DQ8A 1KAZA 4CBUA 4ISGA 1XUPO 3A8YA 1BA1A 2P9KB 2V7ZA 4CBXA 5BRDA 1NMDA 3R8EA 4EAHD 1ATSA 3HBTA 5AZIB 1GLBG 3SJHA 2YI1A 2GTDA 5AQJA 1TYQB 4K41A 3A5LC 2EWSA 3CERA 1BWFO 3LDQA 1JCEA 3WEEB 3WQUA 2IIRA 3SLCA 3AY9A 2P9NA 4H0OA 1BOTO 1BG3A 1D4XA 1NBWA 5AQFA 3EO3A 4AM6A 3TTDA 1GLEG 5EVZA 4H5VA 3U4LA 1ATNA 3A5NC 3O6WA 5LJVA 3L4IA 3VF2A 4BC2A 1RGIA 2DPNA 2V7YA 4CZJA 4FWPA 5AQHA 2HMPA 1TUYA 1U2VA 3VESA 4RTFD 2FF3B 3B8AX 2I7NA 3BF1A 3DXMB 2V51B 3ENHA 3VETA 4A2AA 4A62A 1MDUB 3O8MA 4XH1A 4BR4A 4RWTA 3TSQA 1SAZA 4IWVA 4RCHA 2FLOA 2AP1A 2HOEA 1BDGA 4FL9A 3HSCA 3H3NO 2FSKA 2ASMA 2ZWHA 1HKGA 4FWKA 2CH6A 5AZJA 4QS8A 1ATRA 5KPRA 2Q0UA 3DXKA 4JN4A 4DCHA 5AQOA 2QWNA 2P9PA 4CD1A 2A3ZA 5EOYA 4C23A 3OHRA 4FWMA 2QWRA 4O5FA 5AQLA 4BRGA 4Z94A 3BF3A 1QQOA 1BUPA 3VTHA 3TTFA 2F9TA 5AR0A 4NO7A 1C0GA 3QBWA 4PKIA 1R59O 5KPZA 4FWOA 1E4FT 1X3NA 1DKGD 1GLDG 3ENOA 3GG4A 4BRDA 1V4SA 4H5WA 5TKYA 2GUPA 1JCGA 2E8AA 4JAXA 1EQYA 4YDUA 2GEMA 5AQRA 3FZLA 3UKUA 4HTLA 1SZ2A 4BG8A 3O1BA 3MDQA 3D2FA 2ZF5O 1IG8A 3O08A 2HF3A 3D2EB 4BRIA 4CZEA 5LJWA 2P9LB 5BN8A 3O1WA 3MN6A 1CZAN 3TSPA 1Q18A 1NLVA 3IFRA 3QFPA 4JHDB 4BRCA 1HLUA 3UKRA 2Q36A 3JS6A 2IVNA 2FXUA 2VWBA 4O8KA 4AM7A 4E1JA 4FO0A 3LM9A 2PAVA 4WQ5A 5AFUA 1NGIA 4BRPA 2KHOA 4EHTA 1NGAA 3LDPA 2HF4A 3MMVA 4I6MB 4DB3A 2V52B 3LDLA 2CH5A 4H0TB 3VEXA 3WXJA 4JD2B 5FPMA 3EL2A 1TUUA 5AZIA 1NM1A 2FSJA 4CI6A 2YJEA 5KQ8A 2PBDA 1TYQA 4BGAA 3EKSA 1P8ZA 4QS9A 4CZMA 2BUPA 4PKHA 1ZBSA 3A0IX 1GLAG 3VGMA 4GNIA 1YVNA 4BC5A 4CJ7A 1GLCG 3QB0A 3GL1A 5AQKA 5AQVA 1S22A 1NGGA 2A41A 1GLJO 4CZLA 4GY2B 4WYBA 5AQIA 3AAQA 5AQMA 3MN5A 3IUCA 1H1VA 1HKCA 3ZX2A 1HPMA 2E2PA 4XEIA 1Z6RA 3CI5A 2QXLA 3HI0A 5KQDA 3A5MC 4PL8A 2Q31A 4IJAA 5BPNA 1C0FA 3KHYA 3IDHA 4IZ9A 2UYTA 4FOIA 4B1XB 3H45C 1NGEA 4BRKA 2QWQA 3WXIA 2YHXA 3M3ZA 3DXMA 3ATVA 3LDOA 4YDUC 3J8AA 4BRLA 3ZETB 4EIAA 5KPTA 1GLFO 4KBOA 2W40A 5JMVA 4FOEA 5BPLA 3CHWA 3HZ6A 4H0PA 3UB5A 1ZXOA 4BC4A 3I33A 1T6DA 2Q97A 1J6ZA 4ISFA 1HKBA 4H03B 2NLXA 3VEZA 3U8XA 4BR7A 5BPMA 1NGJA 3CQXA 4BR0A 4BRFA 1XC3A 3ZEUB 4CZIA 2P9SB 5BR9A 3QICA 4BG9A 4BR5A 2E2QA 2QWLA 4HWIA 3VENA 1NGFA 1QQMA 4JNEA 1KXPA 3CJBA 4IJNA 4MLEA 4WQ5C 1BO5O 1T44A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GUIA 5JLFA 3MEGA 4CGIA 4KAZA 5C15A 4KHQA 1TKZA 3U3YA 4FM2A 3JAMO 4ILGB 4MO5A 3MN7A 2FSNA 5FRMA 1VQ5N 2YJFA 4OX9K 4KTQA 4CZFA 3TAQA 3FZFA 2QWPA 3ULEA 4HUGA 3S41A 4OKJA 3P31A 1KLNA 4BE0A 2VYPA 3AO5A 2O8DB 1C1CA 3SK3A 3D2EA 2E1ZA 1HYSA 2BH1A 4FK4A 2X78A 1S1VA 4IOXA 3HYFA 4OKEA 4F9OA 2Z1JA 4BROA 3L0QA 4IO8A 4Z0UA 4NCBA 1X3MA 3QIOA 4B1YB 1JLCA 1RT1A 4JHDA 4M3TA 1YAGA 4CZKA 2F8SA 3MWPA 3IAYA 3FGUA 3LDSA 2G8WA 4WFNL 5AQXA 4CF2A 1BISA 3CD6N 1J53A 4C1NK 1WB9A 2RKIA 1TKSA 3QEIA 4BVPA 4WE1A 3THWB 1YIJN 5GIOA 3SQ1A 2Z1HA 3VN5A 1VK0A 2J4RA 4AHRA 1S9GA 3U9ZA 5AQPA 1JLGA 1JL1A 3V1RA 4G1QA 3L2VA 2ZQBA 2D5RA 2UXBK 3O80A 1ILYA 2IVPA 3LDNA 4FWNA 2OYQA 1G57A 2CGKA 3CJAA 3TU5A 4JLHA 1Z05A 4M63C 3T69A 4KI6A 2HHQA 4W5TA 3C95A 4CHYA 2YNFA 3MEDA 4BDZA 3WNGA 1PVWA 3AO3A 3VQDA 3CJ7A 2HHSA 4WQ4A 1WUAA 4IKFA 3E9LA 4BY9C 5C24A 4FCYA 3CJ1A 3VEVA 4G9ZA 1HYVA 3TTCA 3RTVA 4GV3A 2D0OA 4P77A 1W9HA 1FXXA 3KVGA 5GIPA 5GAHP 4IOAL 3G4SN 4FM0A 3KLHA 1EWRA 4DSJA 1TGOA 2CGJA 3MK5A 3TARA 3HP6A 5E84A 3TI0A 4PHTX 3P5JA 4NXMK 1YT3A 1IH7A 2VCPA 3WQTA 4IFEA 3VEWA 1EXQA 4CEFA 4PA1A 2ZD1A 1HNXK 3K0SA 1BIZA 1L3TA 5EXWA 3VF4A 4CK3A 3OS1A 2W42A 1YTAA 3CC4N 4FK0A 3CJCA 4JKFA 3THYB 1T03A 3K59A 4FJGA 4FZYA 3MECA 3PY8A 5KI6A 3SAHA 3HJFA 3AVGA 3FLCO 4CK2A 5JS2A 1M1KO 4BRMA 3QEWA 1BU6O 3T3FA 3J7YP 1TK8A 1RFQA 1WSJA 1YJWN 4YHHK 2ZJPL 2O8DA 1K4PA 4M3RA 4B1UB 4DQSA 1VQ8N 3D45A 1ESVA 5JICA 1TL1A 1C0MA 1NWKA 1NGCA 5TKWA 1Y97A 3S9HA 3I8BA 4DR7K 3NF6A 5CE3A 2DY4A 3FR0A 5E26A 3QEVA 1QE1A 3CQYA 3P83D 4CEDA 5BRFA 3V9UA 2OANA 3SAGA 4MQ3A 3VQEA 4K43A 4M3UA 1KRPA 3UKUB 2WOMA 2OZMA 4DSLA 3CYMA 3HL8A 3CFPA 4C8MA 3AGRA 1WOQA 1HYZA 1J54A 3THWA 4F2SA 3CC7N 2KKZA 3BY5A 4F3TA 3R9PA 3HTVA 1W2BM 2VGNA 2VWJA 4I14A 1RBSA 1HUXA 5DM7L 1HJOA 4DKWA 1DTTA 2I5JA 3PX6A 1Y64A 4OGEA 4C8OA 3U9DA 1YF5L 3WUHA 1VSDA 3ATUA 4BVOA 3ENBA 2ASOA 4B8CA 4DQ8A 2KFNA 4CBUA 3V9WA 4ISGA 5HBMA 3A8YA 3N4QA 5KGWA 2P9KB 5BRDA 3R8EA 5AZIB 1C6VA 2EHGA 2P1JA 1L5UA 2GTDA 3DLEA 1TYQB 1BWFO 3QERA 3SQ2A 2UUCK 3SUQA 4WFAL 3ASMA 4JS5A 3U6FA 1KFSA 4Q0BA 1RT3A 3AY9A 4YOYA 2YKMA 5C2FA 2F96A 2WFBA 1D4XA 5AQFA 4EP5A 1GLEG 4M3XA 3THXB 3L4QA 3AVBA 1R0AA 5J1EA 4O4GA 3A5NC 3O6WA 5DK5A 4CZJA 1RGIA 2DPNA 2XY5A 4CFAA 4FWPA 5AQHA 2HMPA 3SV3A 1ZBHA 1TUYA 1UAXA 2I7NA 1LAWA 4KHPK 3BF1A 2PFUA 1N6QA 3DXMB 2V51B 4YOTA 4NXNK 4OO1J 3V6DA 3VQ4A 4CE9A 4XH1A 4FJKA 4BR4A 3TSQA 2WC9A 3SV4A 3THYA 3HM9A 5LMNK 2HOEA 3OBYA 3OJSA 3QIPA 3VQ9A 5AZJA 4OJRA 4QS8A 4B9NA 1ATRA 5KPRA 2Q0UA 3HPHA 4P6CA 2XRIA 3CCEN 4CJFA 4Q5VA 1L3UA 2F8TA 1J5EK 1QVFM 4O5FA 1IKXA 1OH7A 3BF3A 1BUPA 4HUEA 3VTIA 2F9TA 3NF9A 1C0GA 4OPAA 4ELTA 4CEQA 5KPZA 4FW2A 1X3NA 4OVLA 3KK2A 1DKGD 4KHYA 3VQCA 3ENOA 1IEZA 4W5QA 2GUPA 1X9MA 4DG1A 4N56A 1KK9A 4YNQA 1B9FA 3ZSQA 3LPTA 3H07A 3FZLA 3HVTA 3CG7A 3UKUA 3O1BA 3LRJA 4BE1A 3L2UA 3CM6A 2HMIA 3C6HA 1CLQA 3AA5X 4CZEA 1K73O 1VQKN 4DR5K 1QSSA 1Q18A 1TV6A 2P51A 3IFRA 4C8KA 3V9XA 3WXMB 3AJEA 5GAGP 3EYZA 3DMJA 2VWBA 3ZT2A 4Z4EA 4GKKK 1RT7A 5HOOA 4WFBL 4BRPA 3ZYYX 5JVHL 3MMVA 1LWCA 3MEEA 1NNEA 2CH5A 1G58A 3LALA 3WXJA 4JD2B 4YOXA 3KK7A 3EE8A 2FBYA 5AZIA 4KI4A 1N32K 2PBDA 1TYQA 4JKEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2GUI A;  5JLF A;  3MEG A;  4CGI A;  4KAZ A;  5C15 A;  4KHQ A;  1TKZ A;  3U3Y A;  4FM2 A;  3JAM O;  4ILG B;  4MO5 A;  3MN7 A;  2FSN A;  5FRM A;  1VQ5 N;  2YJF A;  4OX9 K;  4KTQ A;  4CZF A;  3TAQ A;  3FZF A;  2QWP A;  3ULE A;  4HUG A;  3S41 A;  4OKJ A;  3P31 A;  1KLN A;  4BE0 A;  2VYP A;  3AO5 A;  2O8D B;  1C1C A;  3SK3 A;  3D2E A;  2E1Z A;  1HYS A;  2BH1 A;  4FK4 A;  2X78 A;  1S1V A;  4IOX A;  3HYF A;  4OKE A;  4F9O A;  2Z1J A;  4BRO A;  3L0Q A;  4IO8 A;  4Z0U A;  4NCB A;  1X3M A;  3QIO A;  4B1Y B;  1JLC A;  1RT1 A;  4JHD A;  4M3T A;  1YAG A;  4CZK A;  2F8S A;  3MWP A;  3IAY A;  3FGU A;  3LDS A;  2G8W A;  4WFN L;  5AQX A;  4CF2 A;  1BIS A;  3CD6 N;  1J53 A;  4C1N K;  1WB9 A;  2RKI A;  1TKS A;  3QEI A;  4BVP A;  4WE1 A;  3THW B;  1YIJ N;  5GIO A;  3SQ1 A;  2Z1H A;  3VN5 A;  1VK0 A;  2J4R A;  4AHR A;  1S9G A;  3U9Z A;  5AQP A;  1JLG A;  1JL1 A;  3V1R A;  4G1Q A;  3L2V A;  2ZQB A;  2D5R A;  2UXB K;  3O80 A;  1ILY A;  2IVP A;  3LDN A;  4FWN A;  2OYQ A;  1G57 A;  2CGK A;  3CJA A;  3TU5 A;  4JLH A; 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 3UB5 A;  1KVC A;  3I33 A;  4WCE L;  2Q97 A;  1RTD A;  1X9W A;  4JI2 K;  2HHW A;  1VSE A;  1C0U A;  2FC0 A;  1HKB A;  4B9U A;  3OVN A;  3U8X A;  3VEZ A;  3CPW M;  4AIL C;  1SUQ A;  1WSI A;  3CQX A;  4BR0 A;  5AJ3 K;  4BRF A;  2G8H A;  1CXQ A;  4N76 A;  4Z4I A;  1TL3 A;  2E2Q A;  3VEN A;  3NBP A;  4FM1 A;  1QQM A;  3RR7 A;  1T7P A;  3NGY A;  4LY7 A;  1JLF A;  3AGK A;  3CJB A;  4MLE A;  3LAK A;  2RIU A;  3U3G A;  1SKW A;  4BC3 A;  4X65 K;  4F3O A;  3RSE B;  2A1S A;  2HW3 A;  4CZG A;  3B6O A;  1LCU A;  4F8R A;  3VQ6 A;  3ALY A;  5F2R A;  5AZJ B;  3MCP A;  4DLE A;  4BRH A;  4W5O A;  4ISE A;  2UUA K;  2HBM A;  1VSM A;  4FPB A;  3T1H K;  3JXU A;  4OPH A;  3TAM A;  3G25 A;  4DFK A;  1ZYQ A;  3AVL A;  3BDP A;  1Z26 A;  2E2O A;  2BDP A;  4H4M A;  3KLE A;  3NE6 A;  3MN9 A;  2NRW A;  2P5G A;  3FZM A;  3LS6 A;  2QEX N;  3NDK A;  4CZH A;  3DAW A;  1RTI A;  1BQN A;  1U45 A;  1J9A A;  1VSK A;  2ETJ A;  1RDB A;  4BRN A;  4HTU A;  1GOB A;  2OPS A;  4NLB A;  5DMR A;  2QM1 A;  3W0L A;  2G8V A;  1BA0 A;  4CJP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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