3VEOA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz in complex with carbamoyl phosphate
Total Genus 198
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
198
sequence length
571
structure length
571
Chain Sequence
HMRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERLTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTKDLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
total genus 198
structure length 571
sequence length 571
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veoA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veoA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3veoA03
2EWSA 5ELZA 4CZJA 2P9NA 4BG9A 4BR5A 4CJ7A 1E4GT 3LM2A 2QXLA 3O8MA 4H0XB 4PKHA 4CBWA 1OKJA 3ZEUA 1Y64A 5BPMA 3W3DA 3ZX2A 3QMLA 4WQ4A 4FOIA 3A8YA 3H46O 1IJJA 3SK3A 4NB4A 1GLEG 2A42A 3VTHA 2Q0RA 2Q1NA 4FWNA 2GELA 5FPEA 3CIPA 3R9PA 4A62A 2QM1A 1YUWA 5AQRA 1KAZA 4FWPA 2P9NB 5AQVA 1BA1A 3LM9A 3UB5A 2VWBA 3ENHA 3WUHA 4H03B 3ZEUB 3LDNA 4CZMA 2HF3A 3TTDA 2FSKA 4PL8A 3HZ6A 2ASMA 3ATUA 1XUPO 5E84A 1ZC6A 4BR7A 5JLHA 1DEJA 4WQ4C 3TTCA 3F9MA 3LDPA 3P4IA 4BG8A 3FZMA 4BRHA 3UKUA 3FZLA 1Z05A 2J4RA 1S3XA 4HWIA 3O6WA 1SQKA 5KQ8A 1J6ZA 1BU6O 3I8BA 3R6MA 2A41A 3WXJA 3O1BA 4FPBA 4IJAA 2D0PA 2GWJA 3H3OB 4B1WB 3C0BA 4YDUA 1NLVA 2KHOA 3AARA 3OHRA 2QWRA 4GNIA 4JHDA 3WXIA 3TPQA 1KAXA 3EKUA 2E1ZA 4CBUA 3S41A 2D1KA 1XQSC 3GOIA 5AQHA 3SMPA 3A5OC 3EKSA 4BRKA 5AQUA 3UKUB 3ULEA 1XC3A 3VOVA 2Q31A 3VESA 4BR0A 3DJCA 3G25A 1T6CA 4B9QA 3ZX0A 1NBWA 2F9TA 3AAPA 4FSVA 2NLXA 4M7XA 4M63C 2AA4A 3VF6A 1NGDA 3MCPA 4XH1A 3U9ZA 3EO3A 4CBXA 2IVNA 4BROA 3LDLA 4CZGA 2OANA 3DXKA 4O8KA 5BRHA 2A3ZA 4JHDB 4H0YB 4WQ5C 5AQQA 1WUAA 1HX1A 3J8AA 2GUPA 4BR9A 1NGEA 2P9IA 4H0OA 5AR0A 3BF1A 1HKBA 3CJ7A 3ULEB 4O5FA 3D7EO 5EY4A 4H0TB 5AZIA 4DHYA 1GLBG 3WQTA 2AP1A 5ADXH 1MDUB 3CETA 2QW9A 1SAZA 2V7YA 3VF4A 2FXUA 3H6EA 3VEYA 3R8EA 3JXUA 2VCPA 3DXKB 1NM1A 1ZBSA 4B1ZA 3VETA 4BQZA 1DGKN 2I7NA 4FWOA 2F9WA 4PKIA 3VEZA 1TUYA 4DQ8A 4BRCA 5KPZA 1S22A 1HKGA 1KXPA 4BREA 3CQXA 4C23A 2P9IB 5F2RA 4FWQA 3FZHA 3DXMB 5AQGA 4F9OA 3I33A 4H5TA 3HBTA 5EVZA 5AZIB 1GLFO 2I7PA 2A40A 5KQDA 5AQOA 1MWKA 3H45C 1Q18A 1C0GA 3HTVA 4Y0WA 2YJFA 2E2OA 3WT0A 2YHWA 4BVOA 3U8XA 1QQMA 3IMXA 3VPZA 1NGJA 1E4FT 3KZBA 3CJ1A 1NGAA 1LOTB 1HPMA 4NO7A 3WEEA 2CGKA 2QWLA 3ENOA 1ATNA 1MWMA 5TKYA 3O4WA 1ZXOA 4BQLA 2GEMA 1BDGA 3H3NO 3AY9A 4BC4A 5AQJA 2YCHA 3O5BA 4IJNA 4BRAA 4XEIA 2CH5A 4CZFA 1K8KA 3FE1A 1NGHA 3CERA 4BC5A 2NRHA 3A5MC 3ZX3A 4CZHA 2FF6A 3SMSA 4XH4A 2P9UA 2E1YA 3WEEB 1U6ZA 4CZKA 3MK6A 5BRDA 3TU5A 3L6QA 2DPNA 4BC2A 3M6GA 5AFUH 1GLLO 4I6MA 4JAXA 4WQ5A 1LCUA 3L4IA 2QWOA 3QB0A 4FO0A 1NGIA 1QZ5A 1BWFO 3IUCA 5BPNA 3C7NA 3FR0A 5F0XA 4E1JA 1X3NA 2V7ZA 2YJEA 4HTLA 4EHTA 4B1YB 1P8ZA 3LL3A 4FL9A 1BUPA 1K8KB 1YAGA 3QDKA 1RGIA 2IVOA 4Z94A 1V4SA 3HI0A 5AQTA 4BGBA 4H0PA 5KPTA 4BRDA 2NZTA 1GLDG 2UYTA 1QQNA 2ZGZA 4JN4A 4MLHA 5AQWA 5JLFA 2P9UB 3VGMA 4FWRA 3M1FA 1GLAG 3FZFA 1V4TA 4FWKA 1NGGA 5AQPA 4I6MB 1YXQA 3CI5A 3CJCA 3EL2A 3C7NB 2E2QA 4MO5A 4BRIA 3IDHA 3JS6A 4LC9B 4BRGA 3LDQA 3FZKA 5AQMA 5AQXA 4A61A 3FGUA 5FPNA 1BA0A 4EIAA 1NWKA 2E2NA 5B8HA 4BC3A 2HMPA 4J8FA 2FSJA 1WOQA 4CZEA 1MA9B 1TUUA 3CJAA 2HF4A 3U4LA 4L3QA 4CZLA 1H1VA 3RSEA 4CI6A 2V51B 3VEXA 4CD1A 3WQUA 1BG3A 2PAVA 3A5LC 4RWTA 1GLJO 5AQYA 1D4XA 3MN9A 1QQOA 4K25A 1X9JA 2QWMA 3U9DA 4K41A 1QZ6A 2A5XA 4AM7A 2YHXA 5ADXA 4BR2A 4ISGA 3QICA 1YVNA 2P9KA 3EN9A 3UKRA 4BRNA 3RSEB 4CZIA 3GDQA 4PKGA 2D0OA 4IXCA 5AQIA 5JMVA 3ID8A 5AQZA 1BO5O 2QWNA 3QBWA 2BUPA 1HKCA 5AQNA 1Z6RA 4QS7A 2GTDA 3HM8A 1HLUA 2GWKA 4M7YA 3KHYA 4BRLA 3VEWA 4B1VA 4K42A 2P9KB 2ZWHA 3CJ9A 4JNEA 3VEOA 3UKRB 3B8AX 4B1UB 5F1XA 1NGBA 3VGLA 1HJOA 2A6AA 3QFUA 3SJHA 2P9PA 3M3ZA 4EHUA 5FPDA 4H5WA 1ATRA 5BR9A 4RCHA 5EX5A 5E26A 5BN8A 4BVPA 3D2EA 2E20A 3CHWA 2FF3B 1ESVA 4MLEA 3VEVA 3BEXA 4ISFA 1GLCG 4IWVA 5FPMA 1NGFA 1T44A 4CD3A 1T6DA 2W41A 3VENA 3AAQA 2ZF5O 5AQKA 1RDWX 3VGKA 3HSCA 3TSPA 1HUXA 2ASPA 2ITMA 2ZGYA 3O1WA 3D2FA 1JCEA 1U2VA 2P9LA 3O08A 5BREA 2IIRA 5I9EB 2CGLA 3MN6A 4FWLA 2CGJA 1TYQA 5AQSA 5KPRA 2P9PB 4FPAA 4H5NA 3QFPA 4JD2A 4XH5A 3BF3A 4H5VA 4QS8A 4BRQA 5AFUA 1BOTO 4GY2B 1X3MA 1NGCA 2H3GX 2CH6A 3BUZB 3D2EB 1QHAA 1C0FA 4WYBA 5BN9A 1RFQA 5BRFA 5BPLA 2VYPA 3MN5A 1ATSA 1JCFA 4BRFA 3TSQA 2ASOA 2FLOA 2D4WA 3FFKB 2QWQA 4BR4A 3ZETA 4EAHD 1R59O 3GL1A 3WXKA 2HOEA 3MN7A 2WUSA 3D2FB 3VF2A 1U2VB 1NMDA 2P9LB 1SZ2A 4RTFD 4AM6A 1G99A 1TYQB 2E2PA 2PBDA 3ATVA 4A2BA 4ISEA 3H1VX 4BRMA 4H0VB 4JD2B 3BP8A 4KBOA 5LJVA 3WXLA 3CJBA 2YHYA 3KVGA 3SLCA 5AZJA 3GG4A 2Q0UA 3TSUA 4IZ9A 3CQYA 3DWLA 2P9SA 5AQFA 3UE5A 5LJWA 1CZAN 3GBTA 3FLCO 4FWSA 2Q2RA 2W40A 5LY3A 3ZETB 4DB3A 4K43A 4DCHA 5EOYA 5JICA 3MDQA 4IO8A 2BTFA 4FWMA 3W0LA 2YI1A 3GE1A 4A2AA 2Q36A 3L0QA 3QBXA 3A5NC 3DAWA 1EQYA 4B1XB 4QS9A 3EZWA 4BGAA 1DKGD 4PL7A 3O80A 3DXMA 4YDUC 5AQLA 1IG8A 3A0IX 4FOEA 5CE3A 2IVPA 2Q97A 5AZJB 4BRPA 1JCGA 3LDOA 2P9SB 3MMVA 5EXWA 1KAYA 2FSNA 2E88A 4H5RA 2V52B 2E8AA 3TTFA 4MO4A 3H1QA 4EFHA 3VERA 3IFRA 2QWPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PHTX 3NF8A 1HR0K 2EWSA 1YTUA 1E4GT 1S6PA 4A5AA 1RBTA 3ZEUA 3W3DA 3ZX2A 4HUFA 1KFSA 3QMLA 3I0RA 1QE1A 4FOIA 4LY7A 3A8YA 1SL2A 3H46O 3CMAN 1VRUA 3UIQA 2AJQA 2G8FA 1NG9A 3A2FA 5LMNK 1GLEG 2FC0A 3LAMA 5C2FA 4KHUA 4FWNA 3C6AA 2HW3A 4O4GA 1I94K 2G8KA 3AVFA 3ZLJA 1I39A 2QM1A 2YNHA 1YUWA 5AQRA 1D9DA 1TKTA 2RKIA 4DQSA 2VWKA 3DOLA 3UB5A 2VWBA 4O5BA 4JEPA 3ZEUB 1BI4A 3LZIA 3JAMO 3I0SA 4KTZA 2F8TA 3ZT0A 4PL8A 1P90A 3HZ6A 2ASMA 4DR4K 3K58A 1DTTA 5E84A 4DR2K 4FM2A 4BR7A 2EX3A 5CZ2A 3OS2A 2HNDA 3FZMA 4NYNA 1YJ9N 3FZLA 2J4RA 3E9OA 4HWIA 2X6NA 4A57A 3MEEA 1J6ZA 3HYFA 5IWAK 3I8BA 2ZJPL 3KD5E 1BI4B 1S5JA 1NOZA 2GWJA 3SCXA 4M3YA 3MEGA 4YDUA 4FJ9A 2KQ2A 1Q7YO 1WN7A 2QWRA 4JHDA 3WXIA 4LH5A 3TPQA 3EKUA 2E1ZA 4AHUA 2GBZA 3GOIA 3D45A 3TABA 3SMPA 4BRKA 2X78A 4DSLA 1T8EA 3HVTA 3VESA 3SUNA 3G25A 1T6CA 4YOVA 3CCEN 4LD0A 4RW7A 2ITGA 3ZT1A 3CM6A 4M42A 3EO3A 2PYJA 3MCAB 4JI5K 1D9FA 4JHDB 4H0YB 4WQ5C 5AQQA 2GUPA 1RTHA 3RR8A 2VGMA 4PQUA 4GKJK 2P9IA 4DG1A 3S3MA 4H0TB 1N34K 2O8FA 1JXBA 3C6TA 4CF2A 3SAHA 2VG7A 3THYA 4GMJB 4OLBA 3VTIA 2FXUA 3SUOA 2HVHA 1ZYQA 4FJHA 3L3VA 3RWUA 4N47A 4KB0A 4M3UA 2KTQA 2KZZA 4DQ8A 5KPZA 1UWBA 4QOZB 2P9IB 4GV3A 3NHGA 1HYSA 3F9KA 2HBKA 5GADP 2O8FB 2I7PA 3MAQA 5AQOA 2PFUA 3THYB 1CLQA 3HTVA 4Y0WA 2YJFA 4CGJA 2E2OA 2HHHK 2YHWA 4BVOA 3OTOK 2QTDA 1HNVA 4CJVA 5JS2A 4CHPA 1LOTB 3QEWA 1T3VA 3LP0A 4P6PA 4JKDA 3ENOA 4E1MA 3K5NA 1DTQA 2KFNA 4LF8K 4FLTA 3Q7BA 3O4WA 4LSNA 2UUCK 4DTPA 1ZXOA 4DTMA 1BDGA 3RMBA 4JI2K 4IJNA 2WTUA 1D5AA 4H4MA 4CZFA 1K8KA 4DU1A 1IEZA 2FF6A 3H08A 1RBVA 4CFDA 5SWMA 3LP2A 3DLEA 3SMSA 3J7YP 1JL1A 4JKGA 3AVHA 5BRDA 4DQPA 1ASUA 2PY5A 3WNFA 3OYLA 2DPNA 4DF8A 1VQNN 2P5GA 1RT7A 1GLLO 2QWOA 4FO0A 5BPNA 2O4IA 3AA4A 3C7NA 4J2AA 3P39A 4CJTA 1TK8A 1FKOA 3AGKA 4EP4A 1P8ZA 4FL9A 4EZ6A 1K8KB 4CVNE 4Z94A 4JYAK 4BGBA 4DQQA 4RW4A 5KPTA 1VQMN 1GLDG 2ZGZA 4E3SA 3M1FA 4JKGB 5FDLA 1GLAG 4CJPA 1YHQN 1V4TA 1B92A 3VA0A 4DTSA 1BISA 4HVJA 3AO2A 3C7NB 4MO5A 4BRIA 4YHHK 3IDHA 2QK9A 3FZKA 2HHVA 4M3TA 1T7PA 3C94A 4CF0A 1L3SA 3DYAA 3I55N 2HMPA 4OPJA 1TAQA 3V9ZA 4CZEA 1TUUA 2YKNA 3AVBA 4JKHA 3TAMA 4CZLA 1H1VA 1BGXT 3L2VA 4E1NA 2DY4A 4CD1A 3J7AP 1XNRK 1RT4A 2WONA 1BG3A 4HHTA 3A5LC 3IRXA 2OPQA 4RW8A 3MN9A 3K9KA 3R1XA 1BHLA 3DLBA 3U9DA 5GINA 2A5XA 1S72N 4AM7A 1SKRA 2UU9K 5ADXA 1K6YA 4FW2A 4BR2A 3NF9A 2P9KA 4B9SA 1QQCA 4DR3K 3UKRA 2HNYA 1A5WA 4E1BA 4ID5A 2G8WA 1X9MA 2OTLN 5AQIA 4IXCA 3RTVA 1BO5O 1VSKA 2NUBA 2QWNA 3L4QA 2BUPA 3JSMA 1HKCA 4C8LA 4HTUA 1Z6RA 4LSLA 1RBRA 2XY6A 3HM8A 4LFAK 1HLUA 1YJWN 4BRLA 3T3FA 5C0YA 1NK7A 4EZ9A 3CCMN 4CGIA 2ZD1A 2P9KB 4DTRA 4CK2A 1JLBA 1R0AA 3PX0A 3J7ZO 3UKRB 5JVHL 4B1UB 4MQ3A 5F1XA 1NGBA 3QETA 3QFUA 3M3ZA 3AO5A 2HHSA 3QINA 4KFBA 5FPDA 3MGZA 4YFUA 3KD1E 1N6QA 3E01A 5BN8A 1NNEA 4AILC 4JK7A 1VQ6N 4CJ4A 3VEVA 4MLEA 4DMNA 4IWVA 2F4VK 1NGFA 4Q0BA 1RDWX 3HSCA 2W6KA 4CJ3A 2ASPA 1EWRA 3EE9A 4XIUA 5M1PA 4DS5A 1TYQA 3HPHA 3AVMA 1XHZA 1BCOA 4DSIA 3BF3A 1WB9A 3PO5A 5AFUA 4GY2B 3C95A 1X3MA 2DFEA 4DWIA 3V81A 4IEIA 5I42A 4WYBA 4QCLA 1ATSA 2D4WA 4DSFA 2QWQA 1WSGA 1B9DA 3TAFA 3VF2A 3NMUA 4AM6A 1JCUA 1TYQB 3ZT3A 3KLHA 3QIOA 1KTQA 4IFYA 2YHYA 4YOYA 3KVGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3QEI A;  5B8H A;  5K14 A;  2FSJ A;  4KI6 A;  3L2Q A;  3HOS A;  4L3Q A;  1X9S A;  4YOT A;  2BAN A;  5M1K A;  5JS1 A;  1UA1 A;  3HXM A;  1NJI O;  5C25 A;  4FLZ A;  1CZB A;  3KIO A;  1GLJ O;  5AQY A;  4CJE A;  5AJ3 K;  1QQO A;  4L8R B;  2QWM A;  3NAE A;  4Z4H A;  4K41 A;  2YHX A;  4DTJ A;  1S1U A;  4KV8 A;  4RG8 A;  2F8S A;  1RNH A;  1W97 L;  1YVN A;  3H07 A;  5D3G A;  4LFB K;  3ZSZ A;  3ZSX A;  4ZTJ A;  2FBX A;  3SPY A;  1J53 A;  1TV6 A;  5C2D A;  3NE6 A;  4JRP A;  2D0C A;  2JLE A;  4PKG A;  1SUQ A;  3O9R A;  5AQZ A;  1NMN A;  3ID8 A;  3QBW A;  4DR1 K;  3IAY A;  2HB5 A;  3SBT A;  1JLQ A;  4IG0 A;  5M1Q A;  1J9A A;  1RT1 A;  2BDP A;  4BE2 A;  5M1F A;  1Q9Y A;  3VQ4 A;  5GIO A;  3KLG A;  3G4S N;  5JVG L;  4O8U A;  3VEO A;  1QVG M;  4CIF A;  1QVF M;  1RT2 A;  1G57 A;  3G10 A;  2P9P A;  3ZSY A;  3LPT A;  4EHU A;  4H5W A;  4BY9 C;  4R5P A;  5EX5 A;  5E26 A;  1U47 A;  1JLG A;  3OBY A;  4FK2 A;  1S1V A;  3D2E A;  2E20 A;  1SV5 A;  1ESV A;  5FPM A;  3M8P A;  1T44 A;  1WBD A;  3VEN A;  2E4L A;  2ZF5 O;  3SJJ A;  4LF9 K;  3AVK A;  1WNS A;  3TSP A;  4DV3 K;  1ZBL A;  1HUX A;  3VQ5 A;  2ITM A;  2ZGY A;  1N36 K;  1VQ4 N;  1U2V A;  1BCM A;  2IIR A;  1N33 K;  1O13 A;  2CGL A;  1KVC A;  2YKM A;  3M8R A;  5AQS A;  5KPR A;  2P9P B;  2HMI A;  4CFC A;  3QFP A;  3NH0 A;  4OPK A;  4JD2 A;  4XH5 A;  4H5V A;  4Q5V A;  4BRQ A;  5LMU K;  4ID1 A;  3D2E B;  3VQB A;  2HHT A;  1U48 A;  5BN9 A;  1K7J A;  5FRM A;  1S1X A;  3V6D A;  4JK8 A;  1JCF A;  2ASO A;  3Q7C A;  1N32 K;  4DFP A;  4KPY A;  4EAH D;  4KH6 A;  3MN7 A;  5HL7 L;  4FJN A;  1U2V B;  1SZ2 A;  4PA1 A;  3TI0 A;  1G99 A;  1S9G A;  4TSX A;  3OYJ A;  4J2E A;  3ATV A;  3SYZ A;  3ENB A;  4ISE A;  1YI2 N;  1JXE A;  3AO1 A;  4JD2 B;  3BP8 A;  4KBO A;  5E41 A;  4JI6 K;  5GAH P;  4FJJ A;  4BWM A;  4IZ9 A;  1REV A;  5HRN A;  5AQF A;  4WE1 A;  5LJW A;  1CZA N;  4Z4C A;  1HRH A;  4P6C A;  3FLC O;  4FWS A;  4CEC A;  4M3W A;  4K43 A;  3LQU A;  4CGG A;  4FWM A;  4A2A A;  1LWE A;  1FJG K;  3OYK A;  2G8I A;  4B1X B;  4BGA A;  3AA2 A;  3HPG A;  3NVM A;  3O80 A;  2VQE K; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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