3VEZA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz k443a variant in complex with atp, adp and carbamoyl phosphate
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
566
structure length
566
Chain Sequence
MRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERFTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVADREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
total genus 187
structure length 566
sequence length 566
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vezA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vezA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vezA03
4CZKA 5E26A 1MA9B 5BR9A 3L6QA 3QFUA 3ZEUB 3UKUB 1NGGA 3TSQA 2W40A 5AZJA 3M1FA 5AFUA 2ASOA 1C0GA 1NGJA 2UYTA 4B1UB 5AR0A 3S41A 3P4IA 1JCEA 4PKHA 4BR0A 5JLHA 1E4FT 2Q97A 4B1WB 4CD1A 3VF4A 2E2QA 3H6EA 3A5MC 3FFKB 3ID8A 4HWIA 4IJAA 2P9NA 1NGAA 2Q1NA 1BOTO 4ISEA 4CZJA 4IJNA 3LDLA 5AQNA 2Q36A 2YHYA 5AQPA 2CGJA 3UE5A 1WUAA 1DGKN 1T6CA 1ZXOA 2FSKA 4WQ4A 5KPTA 2ZF5O 3C0BA 5AQYA 4AM7A 5KQDA 4BGBA 3RSEA 2QWPA 4CZFA 1T44A 4FL9A 2P9UA 3EKSA 2FSJA 1HX1A 1U6ZA 5AQLA 3LDNA 4WQ5C 3QBXA 3ULEB 4XEIA 3VGLA 2CGLA 3DXMB 2V7ZA 4I6MA 4L3QA 5B8HA 3CHWA 3MDQA 4QS8A 1BU6O 4BR5A 3CJBA 2PBDA 1ZBSA 3QICA 5AQXA 2ZGZA 4H0OA 3L0QA 1QZ6A 1NGFA 4GNIA 3O4WA 2E1YA 3FLCO 3VF2A 5AQIA 4H5VA 4BRDA 4M7YA 4LC9B 4BRNA 4DQ8A 3BF1A 4CZHA 1S22A 2VYPA 3O08A 3U9ZA 3W3DA 3TTFA 2A41A 3MN6A 4NO7A 4RCHA 2BTFA 5BPMA 1GLDG 3FZHA 1ATNA 5BRDA 2F9TA 3H3OB 4WQ5A 4CZMA 3IUCA 3H45C 4QS7A 3GL1A 4KBOA 1BWFO 4FWPA 4MLEA 1TYQA 1GLFO 4FPAA 1BA0A 3SMSA 3VF6A 3A5LC 2BUPA 1S3XA 4FWKA 1GLBG 3ATUA 5AQOA 4DCHA 2P9IB 3ATVA 3TTCA 4BG9A 2ITMA 4EFHA 4H0VB 1ESVA 2I7NA 1BA1A 5AQJA 4FSVA 1ATRA 3ENHA 3QBWA 4RWTA 1U2VB 2IVOA 1EQYA 2A40A 3AARA 5TKYA 3MN5A 3EN9A 4K25A 2ASMA 5AQWA 1HKCA 3VEWA 1ZC6A 3BEXA 2IVPA 1MWKA 2E2PA 5KPZA 4JHDA 3DJCA 4FWSA 3M6GA 4BROA 5BRFA 3DXKB 3O80A 4FPBA 4C23A 3H1QA 3MMVA 4CD3A 2P9KB 3JS6A 4CJ7A 1X3NA 4BRHA 1Z05A 2FF3B 5E84A 3IDHA 4B1VA 5JICA 1K8KB 3A0IX 4IO8A 3VESA 4B9QA 3CETA 1NGEA 3VGKA 5BPLA 4JN4A 3O1BA 1XC3A 2A3ZA 2V52B 5AZIA 3FZKA 3VEYA 5EY4A 2E88A 4Y0WA 2GTDA 4CZEA 3AAQA 4CBWA 4YDUC 3FR0A 3MK6A 5AZJB 5ADXH 3ZEUA 5ELZA 1NM1A 2YHXA 3UKUA 2P9SB 1HJOA 2FSNA 3F9MA 3GBTA 4H0PA 1BUPA 3IFRA 4BRPA 2E1ZA 1NGHA 1YXQA 4IWVA 1KAXA 3LDQA 2FF6A 1HPMA 3OHRA 2P9NB 4CBUA 5LJVA 2A5XA 3QB0A 5F2RA 1GLEG 4BRGA 1YAGA 2V51B 3FZLA 2NZTA 3VPZA 2Q0RA 5FPNA 1GLCG 1QQOA 2QM1A 1GLJO 3TPQA 3LM9A 5ADXA 2FXUA 3DWLA 5BREA 4BC5A 4FWOA 4BVOA 4BR9A 1D4XA 3WEEA 4BG8A 4JAXA 1GLLO 2QWLA 3HBTA 2P9UB 1BO5O 2W41A 1JCFA 5AQHA 3SK3A 4I6MB 3D2EA 4YDUA 3ULEA 3DXMA 3BUZB 3EL2A 4A2AA 3SJHA 1BDGA 2YHWA 3W0LA 1DKGD 3B8AX 3DAWA 5AQMA 3WXKA 3UB5A 5FPDA 2VCPA 1HLUA 3KHYA 1QHAA 1QZ5A 3AY9A 3R6MA 2F9WA 3H3NO 5AQTA 1DEJA 3QFPA 2GEMA 2D4WA 1SQKA 3LDOA 5BRHA 3VOVA 2P9LA 2GELA 1CZAN 2D1KA 4EHUA 1NWKA 5AQKA 2HOEA 2GWKA 4M7XA 3WUHA 1E4GT 4XH1A 3VEOA 3A5NC 3EKUA 3EO3A 3QMLA 3CIPA 2AP1A 3SMPA 3ZETB 4BQZA 2D0OA 1NBWA 1TUUA 4EAHD 3CJAA 3J8AA 3WT0A 3FZMA 3KZBA 4HTLA 1V4SA 2PAVA 3C7NA 3TU5A 2KHOA 5CE3A 3ENOA 2YJEA 5KQ8A 3A8YA 2EWSA 2Q0UA 4MLHA 2P9PB 4JD2B 5AQQA 3UKRA 2QWOA 5LY3A 2OANA 1X9JA 4H5TA 1T6DA 4JNEA 3ZX3A 5BN9A 4FWRA 4Z94A 4BRMA 3TTDA 3ZX2A 2Q31A 3HM8A 4FWNA 1TUYA 1U2VA 3D2FB 2E2NA 2NRHA 3HTVA 4XH5A 1Q18A 4BRQA 3VEVA 2E2OA 1IJJA 1P8ZA 4FWMA 4BRIA 3CJ9A 3CJ7A 4BC2A 3DXKA 5AQFA 4BR2A 5EVZA 4PL7A 2P9KA 5BN8A 2YI1A 3ZX0A 4M63C 5LJWA 3GG4A 3L4IA 3WXIA 1BG3A 1NGCA 2J4RA 1RFQA 1K8KA 1YUWA 2QWMA 3BF3A 4H0YB 1OKJA 1NGIA 5FPMA 4BRCA 1ATSA 3U8XA 1KAZA 1QQNA 5EXWA 4QS9A 4BRLA 3VTHA 4E1JA 4FWLA 3HSCA 1R59O 4H5RA 3VEZA 4NB4A 4CBXA 3MN7A 1NGDA 4O8KA 2ZWHA 3U4LA 2P9SA 5AQVA 3AAPA 1V4TA 3TSPA 3HZ6A 1NMDA 2HF4A 2E8AA 3O1WA 4J8FA 1RGIA 3R9PA 2QWRA 2V7YA 4BC3A 1IG8A 3SLCA 4MO4A 4IXCA 4CI6A 1HKGA 1J6ZA 3A5OC 3WXJA 3H1VX 4BC4A 3RSEB 1SZ2A 4BR7A 2CH6A 4DB3A 4FOIA 4K43A 3LM2A 1WOQA 4WYBA 4H03B 3WEEB 4BQLA 3MN9A 1HUXA 4FOEA 1H1VA 2H3GX 3CI5A 5EX5A 4F9OA 3D2EB 4IZ9A 1Z6RA 2ASPA 4A2BA 2DPNA 4BRAA 1KAYA 3M3ZA 4FWQA 2A42A 2IVNA 2QXLA 4B1YB 4GY2B 1MDUB 5FPEA 4XH4A 2WUSA 3O5BA 2QWNA 2E20A 3FGUA 3GOIA 5I9EB 4ISGA 3H46O 4PKIA 2QWQA 4H0TB 4B1ZA 3LDPA 3VENA 2NLXA 3CJ1A 2P9LB 2VWBA 4A62A 3FZFA 1XUPO 4BREA 3IMXA 4A61A 1G99A 3VETA 1NGBA 4B1XB 4FO0A 3QDKA 5AQGA 4K42A 1X3MA 1NLVA 1TYQB 2Q2RA 4BVPA 2GUPA 4MO5A 3WQUA 3U9DA 3ZETA 1YVNA 5KPRA 3HI0A 3CJCA 3R8EA 4EIAA 3I33A 1LCUA 2IIRA 3C7NB 4ISFA 3LL3A 3JXUA 3CQXA 2P9IA 3G25A 4O5FA 5EOYA 2HMPA 1QQMA 1MWMA 2I7PA 5AQZA 4RTFD 1C0FA 2CH5A 2CGKA 3BP8A 3UKRB 3VEXA 2YCHA 2P9PA 4JD2A 4BRKA 4CZGA 2A6AA 3FE1A 3D7EO 4BR4A 3CQYA 4H0XB 3VERA 3TSUA 3GE1A 3KVGA 4CZLA 5AQSA 4AM6A 3WQTA 3WXLA 1RDWX 3O8MA 2GWJA 4JHDB 3MCPA 2FLOA 4H5NA 4EHTA 2D0PA 4BRFA 5JMVA 5F1XA 5F0XA 1GLAG 1XQSC 2HF3A 5JLFA 3D2FA 3EZWA 5AFUH 5BPNA 3CERA 4PKGA 4H5WA 1HKBA 2ZGYA 4K41A 1LOTB 4PL8A 1Y64A 3GDQA 2QW9A 4WQ4C 5AQRA 2YJFA 4BGAA 1KXPA 1JCGA 1SAZA 3O6WA 5AQUA 4DHYA 5AZIB 3VGMA 4CZIA 2AA4A 3I8BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YX6A 4ILJA 4JK9A 3C65A 3L6QA 1KLNA 3D6RA 2BE2A 5AFUA 4CHZA 1C0GA 3CC2N 1ZBUA 5J2NA 1VQNN 4B1UB 3S41A 5JLHA 3K2PA 4CD1A 4CF1A 4JI7K 4DF8A 4JI0K 1BOTO 4JS4A 4CIFA 3DRPA 1C0MA 4PQUA 4B3MK 2VWKA 5D3GA 1VQKN 3UE5A 4P6DA 1ZXOA 2FSKA 1IBMK 5KQDA 2P1JA 3QLHA 3RMBA 4CZFA 2P9UA 3EKSA 1HX1A 2DY4A 3LDNA 5B8HA 2HHHK 3THWB 3DXMB 4I6MA 3AV9A 4CESA 3L2VA 1EWRA 4BR5A 3CJBA 1VHXA 3CCMN 3K57A 4OPAA 1N5YA 3QICA 5KRTA 3LZJA 4RW7A 3O4WA 3NF8A 4B3RK 4NYFA 2EHGA 1HJRA 3T1AA 3I0RA 5AQIA 3M5RA 3V9UA 4DTUA 4IOAL 4CJEA 4CGIA 4DF4A 3BF1A 4IOXA 4CJPA 2EX3A 2VYPA 4CEZA 2IDOA 2VGNA 3AA3A 4FJXA 1VSIA 4CK3A 3MN6A 3KLGA 4NO7A 2HNYA 4O44A 3FFIA 4BY9C 1HNXK 3H3OB 2HMIA 3KD1E 1RBUA 2BANA 1SV5A 5FDLA 4FWKA 1KK9A 3OYKA 4BE0A 5K14A 4DCHA 2PFUA 4PHTX 1ASVA 3ZYYX 4FK2A 3MCAB 4AHUA 5IWAK 4JKEA 4FYDA 4H0VB 2OTLN 3QINA 3RRGA 4FSVA 2BH1A 1IO2A 2IVOA 4O55A 1IBLK 3MN5A 3EN9A 2ASMA 5AQWA 1MWKA 2E2PA 2ZQBA 1ASUA 3SUQA 3DJCA 1WSEA 3OS2A 4FPBA 4FJ8A 4CD3A 1TK0A 4WFNL 3V9XA 4HCCA 3ZSRA 4BRHA 4RG8A 3U3YA 1PVYA 1G15A 3QEPA 3IDHA 4ELTA 5GINA 3ZT3A 2ZJRL 4IO8A 2ZD1A 3VESA 4B9QA 3V9SA 1RNHA 3ZSWA 3LDSA 4KPYA 5BPLA 4JV5K 2Z1JA 2V52B 1BIUA 5AZIA 3VEYA 4CJSA 1YJ9N 2RKIA 3MWTA 1Z26A 4IEIA 1W97L 2YNIA 1NJYA 1S1TA 5AZJB 2YHXA 2P9SB 2FSNA 2VG6A 3IFRA 2I5JA 3KTQA 4DSJA 3K9KA 3BGRA 4OPKA 4FJNA 3AVMA 3ZT1A 4ZTJA 1GLEG 3O3GA 3VQ5A 4DLEA 2V51B 2RISA 3RMCA 4N47A 2NZTA 3KIOA 2Q0RA 1NU0A 2YHAA 5FPNA 1QQOA 5E41A 4DTRA 4DFPA 3WEEA 3M8RA 3K58A 3HBTA 1YJWN 3THWA 3DXMA 3O9QA 1BDGA 1W9HA 2NNWA 1W2BM 4Q0BA 3DAWA 3UB5A 1NOZA 3L8BA 3KWGA 4OX9K 1YF5L 2F9WA 1GOAA 3EY1A 4GKKK 5AQTA 1J9AA 5M1NA 3LWLA 1SQKA 5BRHA 4YOTA 3HO1A 3T7ZA 1N6QA 2D1KA 2O8FB 2E6LA 4O4GA 1NWKA 4HUEA 4DTJA 5AQKA 1XHZA 1TKXA 4KI4A 2GWKA 4M7XA 1SL2A 2AP1A 1WN7A 3SMPA 3SYZA 1TUUA 3BY5A 3WNFA 1JLGA 4CEOA 5JS1A 3FZMA 1FK9A 4CJQA 2PAVA 1BI4B 4M3WA 3T69A 1IKYA 2P9PB 3CCLN 1HPZA 2UXBK 1UA0A 1OVYA 3T1YK 2G8UA 4IOCL 1WAFA 4H5TA 1T6DA 2NRZA 4FLUA 3ZX3A 2KZMA 4C8KA 1JL1A 3ID6A 1RT5A 2D5RA 4FZYA 2QKBA 4XH5A 2NRHA 4DWIA 1M1KO 3DRRA 3P39A 4A5AA 1TGOA 3MEDA 4BRQA 1K9MO 3ASMA 1SKSA 3CC7N 4PUOA 2ITGA 4M41A 2OZSA 4M63C 3WXIA 1VQ9N 4CHPA 1HYSA 1GOBA 2XY5A 3THVA 1KRPA 1JLFA 3G4SN 1A5VA 4IFEA 3IS9A 3KWIA 4QS9A 3U6FA 4BRLA 2RHKA 1R59O 3DI6A 3CMAN 4M3UA 1NGDA 3ZSXA 3K5NA 1Q9XA 2ATQA 2P9SA 5AQVA 2HB5A 3AAPA 3SQ0A 2HHXA 4M45A 3WNEA 1CXUA 1EKEA 3O1WA 4J8FA 4FJGA 1K49A 5C15A 1JLBA 2R7YA 4P8EA 2YNFA 5H1SQ 1REVA 4CI6A 4E89A 1NKEA 4DTPA 2G8VA 3SAHA 3RSEB 1SZ2A 3UIQA 2QXFA 3AO5A 3THXB 3CCQN 1KQSM 4M3TA 4CIGA 3OS1A 3HOSA 3LM2A 1WOQA 2XO7A 4H03B 1DTQA 4R5PA 1EWQA 5TKWA 3OYIA 2D0CA 3NMUA 1HUXA 3OYJA 4HVJA 4LFBK 2X74A 4DS5A 3D2EB 1Z6RA 3G0ZA 2VQEK 3KJVA 1IKVA 1HNVA 4KH5A 2YNHA 3P1GA 1TV6A 1JKHA 3O3FA 4A57A 3CCJN 3ITHA 5SZTA 3O5BA 2XY7A 2QWNA 3FGUA 5I9EB 4ISGA 1LAWA 3ZSYA 2O8DB 1RDAA 2QWQA 2A1RA 5A2QO 1JXEA 4H0TB 4DSFA 3MECA 3L2RA 2HHTA 4KHWA 4KHNA 4K0KK 1P90A 3IAYA 4A62A 1LV5A 3DLRA 4B9VA 2O8FA 2LSNA 4FJMA 1WSHA 4JKDA 1RBTA 2WFBA 3AGKA 4BVPA 4MO5A 2O8EA 1BHLA 3U9DA 3TI0A 1IG9A 3DM2A 4EIAA 1LCUA 4ISFA 4CJVA 3IKMA 4F3TA 2P9IA 4O5FA 5EOYA 5FLXO 4JRQA 1WB9A 1S6PA 3ZT2A 3OYHA 1NOYA 3PLAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4CZK A;  5E26 A;  1MA9 B;  5BR9 A;  3L6Q A;  3QFU A;  3ZEU B;  3UKU B;  1NGG A;  3TSQ A;  2W40 A;  5AZJ A;  3M1F A;  5AFU A;  2ASO A;  1C0G A;  1NGJ A;  2UYT A;  4B1U B;  5AR0 A;  3S41 A;  3P4I A;  1JCE A;  4PKH A;  4BR0 A;  5JLH A;  1E4F T;  2Q97 A;  4B1W B;  4CD1 A;  3VF4 A;  2E2Q A;  3H6E A;  3A5M C;  3FFK B;  3ID8 A;  4HWI A;  4IJA A;  2P9N A;  1NGA A;  2Q1N A;  1BOT O;  4ISE A;  4CZJ A;  4IJN A;  3LDL A;  5AQN A;  2Q36 A;  2YHY A;  5AQP A;  2CGJ A;  3UE5 A;  1WUA A;  1DGK N;  1T6C A;  1ZXO A;  2FSK A;  4WQ4 A;  5KPT A;  2ZF5 O;  3C0B A;  5AQY A;  4AM7 A;  5KQD A;  4BGB A;  3RSE A;  2QWP A;  4CZF A;  1T44 A;  4FL9 A;  2P9U A;  3EKS A;  2FSJ A;  1HX1 A;  1U6Z A;  5AQL A;  3LDN A;  4WQ5 C;  3QBX A;  3ULE B;  4XEI A;  3VGL A;  2CGL A;  3DXM B;  2V7Z A;  4I6M A;  4L3Q A;  5B8H A;  3CHW A;  3MDQ A;  4QS8 A;  1BU6 O;  4BR5 A;  3CJB A;  2PBD A;  1ZBS A;  3QIC A;  5AQX A;  2ZGZ A;  4H0O A;  3L0Q A;  1QZ6 A;  1NGF A;  4GNI A;  3O4W A;  2E1Y A;  3FLC O;  3VF2 A;  5AQI A;  4H5V A;  4BRD A;  4M7Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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