4N4GA

Crystal structure of the bromo-pwwp of the mouse zinc finger mynd-type containing 11 isoform alpha
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
213
structure length
209
Chain Sequence
NKQEMGTYLRFIVSRMKERAIDGKDSKHPMYRRLVHSAVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNVHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWKSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title ZMYND11 links histone H3.3K36me3 to transcription elongation and tumour suppression
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Mus musculus
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
total genus 63
structure length 209
sequence length 213
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4n4gA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4n4gA02
3OYEA 2RI7A 5HQ6A 4NYWA 2RJEA 5F5ZA 3OYBA 5FE2A 4QZSA 3P1CA 3P8DA 4E7JA 5CPEA 5A83A 4J0RA 4CL9A 3SVFA 2YEMA 4A9LA 2GF7A 3UVWA 3GG3A 4QNSA 4HXRA 1F68A 4Y03A 2FHDA 4UIVA 5D3NA 2DVRA 5DKCA 5FFYA 3IU5A 2M1HA 4NYXA 5A5NA 5LJ1A 2YW5A 5EA1A 3Q2FA 1XNIA 2IG0A 4NR5A 4A9JA 5C0MA 4MR5A 4UIWA 4N4GA 1RI0A 2DIQA 4BE1A 4PKLA 3MP8A 4XY9A 1EQFA 4O78A 5L96A 5DY7A 4QC3A 4ZTFA 4QYDA 2YELA 3HMFA 3JVLA 2E5QA 4YATA 4QC1A 5F62A 2GFUA 5F25A 5D3LA 4A9IA 1OI1A 3QZSA 3QZVA 3OYMA 2R0VA 5JI8A 4NQMA 4ZC9A 3O37A 5HFRA 3LLRA 3L2WA 5C89A 5FG5A 2OO1A 3MP6A 4BDYA 5CS8A 5LKXA 4NR8A 4A9FA 2XK0A 4YYMA 4B9XA 3U5OA 3NTKA 4QUTA 5CUGA 5FFVA 4ALHA 3ASKA 2YDWA 2DVSA 4DONA 4HXMA 4LYSA 1OYXA 5E9IA 4LZSA 4O74A 5CUDA 5LJ2A 5KCOA 1WUMA 5DYXA 5A5PA 2F5KA 4NRCA 4UYFB 5I29A 4X34A 5D3TA 5FRMA 5C6SA 3AQAA 2DVQA 4ALGA 5I7YA 4Z02A 4O71A 5EP7A 4Z93A 4CUPA 5KTWA 4HXLA 2MJVB 4IR5A 3CEYA 5KO4A 2EQUA 2HQXA 5IGKA 5LKTA 3HMHA 5EI4A 4A9KA 3BDLA 5DW2A 3P8HA 4HCZA 3H8ZA 4LD6A 5E9LA 4TT4A 4PLLA 3UVXA 3DLMA 3SD4A 3U5LA 3Q2EA 1WJRA 2EKOA 3GOXA 2E7OA 5CQ5A 4QUUA 5CRMA 3LQIA 3FEOA 2R5MA 4MEQA 5FE5A 2JTFA 3MB3A 5I7XA 5A85A 5CQ4A 5HJCA 1G5VA 2LDMA 4HBXA 5C85A 5F36A 2F6JA 3PMTA 4MEPA 4YYDA 5IIDA 5EWCA 4QSVA 3G0JA 3MULA 5D26A 5A82A 5LVRA 2YRVA 3S3MA 2D82A 4MR4A 4IUQA 3LGLA 4IR6A 5FH6A 5HM0A 3QZTA 5D3SA 2RHYA 3C4SA 5FB0A 4A4GA 5HFQA 4C5HA 5JWMA 1WGSA 5CY9A 4E7IA 5FE7A 3SVHA 4TT2A 4PY6A 2L89A 4CUUA 4QSTA 2HQEA 2L84A 3DAIA 4A9OA 5A5OA 4FU6A 3JVJA 4C67A 2RHUA 5FBXA 4CFKA 1H3ZA 5H1TA 2FSAA 4HBWA 3OB9A 3PNWC 5E3GA 4C5GA 4YYIA 4YBSA 5I40A 2EQJA 3UT1A 4QR3A 5ENFA 5HRXA 4YYJA 5CTLA 4YYKA 5I1QA 4OGJA 5FE3A 5ENEA 2RHIA 2WACA 5DYAA 3F70A 3QIIA 5D7XA 5CUCA 2GFAA 1N72A 4II1A 4PTBA 5CZGA 4GY5A 4NR9A 5AD2A 5CP5A 4BDZA 4QSQA 3FC3A 4A4HA 4NRAA 4O7CA 4YYNA 4PCEA 2F6NA 4UYGA 2H60A 5J39A 5AMEA 3O36A 5FG6A 5CUBA 5HELA 4RG2A 4TYLA 5HQ5A 4E7LA 4YYHA 5KTUA 4TZ2A 3P1FA 4NUDA 5COIA 5EWDA 2LSPB 5FG4A 5KTXA 5HEMA 5FRNA 5ENCA 3S6WA 4O75A 5DBMA 5ENGA 5FROA 4YK0A 5I88A 2EFIA 4LDFA 5L99A 1JM4B 5EPRA 2X4WA 3H6ZA 2X35A 5E9VA 4TT6A 4OUFA 4KV4A 4UIYA 5A81A 5DYCA 2RHXA 2RFJA 4Z6IA 4IUTA 3OY9A 3FDRA 3OMCA 5LUUA 5KHMA 3OMGA 5LVQA 4NXJA 4NUEA 4TS8A 3OYKA 2L8DA 2YYNA 3MUKA 4Q0OA 4WIVA 4YYGA 3L2VA 4BACA 3JVMA 4QQDA 3K2JA 1MHNA 4N4HA 5C87A 5FH8A 4BJXA 5BT5A 5FE9A 2RJCA 4EDUA 4J0SA 5A5QA 4LRGA 4J1PA 4O7BA 2WP1A 2R0YA 3LH0A 4CRIA 4F3IA 5IBNA 4A9HA 1KHCA 5CQ6A 5EICA 5EPBA 4QSXA 4O7EA 5DFDA 2BIVA 5F3AA 5EWHA 5E9MA 4CUSA 5KE2A 3UWNA 3LYIA 1X0JA 5D24A 4BW1A 4YH4A 4BD3A 5FFWA 4E96A 5E7DA 2E7NA 4YAXA 3UV4A 1WJSA 5E3DA 3O34A 4Z1QA 4X2IA 3LGFA 5F2PA 4UITA 2NLUA 5LKZA 5DLZA 2KTBB 3NTIA 2QQRA 5D3HA 2VYTA 5D6WA 4QB3A 5EWVA 2B8AA 4KCXA 2LRQA 4C5EA 2E3KA 4MR3A 3DB3A 2O4XB 4UIUA 5FDZA 4RVRA 5EPSA 2RJDA 5FE1A 3HMEA 4BHWA 2YEKA 2N9GA 5IG6A 4IURA 5F61A 4O76A 5D0CA 2RI3A 2EQKA 3UV2A 4B9WA 5IAYA 5G4RA 3O33A 5FE6A 5E0RA 3QBYA 4NR4A 5L98A 5HRWA 2D9TA 4QBMA 2DAQA 4NYVA 4XYAA 4YC9A 2LTOA 5EQ1A 3D7CA 4YBTA 4ZQLA 5F1HA 1N27A 2X4YA 4HBVA 2NXBA 3ZEHA 3P1EA 4IOQA 5IGNA 3O35A 2DIGA 4LYWA 5A5RA 4YY4A 4UYFA 4N3WA 2RI2A 5TCMA 4ZW1A 3P1DA 2L3RA 5EM3A 4C5IA 3S3OA 5EISA 5I80A 4Q5WA 3RCWA 4QSUA 5KU3A 3NXBA 4MEOA 5L8UA 5IGLA 4QSWA 2G3RA 3E9FA 4OVAA 2BKDN 2I7KA 4QR4A 5CQ3A 4BW4A 3OYHA 4MENA 2WP2A 4QEVA 5ETDA 5A7CA 3META 3DWYA 4FL6A 2XDPA 5I89A 3EAEA 4Z6HA 5CIUA 3OS2A 2CKKA 4YABA 2O4XA 5D6YA 3OYLA 4WHWA 5CQAA 2RS9B 2LVMA 2RNWA 5CQ7A 5E74A 4QQGA 2DKWA 5CQ8A 1JSPB 5D25A 4IOOA 3MEVA 3KUFA 1SSFA 4NR7A 5II2A 4J3IA 5I83A 4IKFA 5TB6A 4CUQA 3L42A 5I86A 2MWPA 5E9YA 4FLPA 2RHZA 5CUAA 4O70A 5DX4A 1WUGA 4LC2A 4QVZA 5HLSA 4QR5A 4N4FA 5DFCA 2L5EA 3UW9A 3L2RA 5K29A 3LXJA 5G4SA 4YADA 3OS1A 5ENIA 5EWWA 2R5AA 3AADA 5E9KA 5D3RA 4IUPA 5H85A 3OYAA 5CRZA 3LJWA 5EV9A 2RI5A 2RJFA 5FE0A 2I8NA 4QW2A 2RNYA 4HXOA 5FE4A 4CUTA 5J26A 4LR6A 4TQNA 4QEWA 3MO8A 5EK9A 5D3PA 5CQTA 4LZRA 5ENHA 5BT4A 4A4FA 3G0LA 5HQ7A 3ME9A 4HXNA 5FH7A 5ACYA 4GPJA 2GRCA 3Q1JA 4O7AA 3OQ5A 3DB4A 3LQHA 4N4IA 5AD3A 2D9EA 2R58A 4QQ6A 5DFBA 3TLPA 2BUDA 3OYGA 2EQMA 5IGMA 3OYDA 5C7NA 5E73A 3P5OA 4NR6A 4QSPA 2L85A 3U5MA 2K3YA 5M9OA 5J0DA 4AKNA 4UYDA 2LCCA 2RNXA 3U5NA 4YBMA 3QJ6A 5ENBA 4LYIA 3LQJA 4WHUA 5H1UA 5LKUA 4TU4A 4XY8A 5II1A 3OYFA 3NTHA 5FB1A 5H1VA 4NS5A 5A5SA 2OUOA 4Q0NA 2R0SA 4UC4A 2PQWA 4Z1SA 3OYIA 5FE8A 4YY6A 5HCLA 2MWOA 3S91A 5F1LA 3FLGA 4QYLA 5D3JA 3ONIA 4PS5A 3S3NA 4QSRA 2RO1A 3MEWA 3O8VA 1WJQA 5ETBA 5CUEA 4TTEA 4E7HA 2DVVA 4MR6A 5L8TA 4UIXA 4BW2A 4TZ8A 4NUCA 5CFWA 3U5PA 5CU8A 5DW1A 4C66A 4UYHA 1E6IA 2DWWA 4HXPA 3UVYA 3S92A 3U5JA 4L59A 4A9EA 2G4AA 1OZ2A 1OZ3A 4A4EA 3MQMA 2QQSA 5DKHA 5F60A 3JVKA 4PLIA 2E6NA 4XUBA 3L2QA 2JZ2A 3MEUA 3ZYUA 3SVGA 5C8GA 4O77A 4QSSA 4O7FA 5EGUA 4IUVA 3UVDA 5IN1A 5KH6A 5DLXA 4A9NA 4CLBA 5AMFA 2OSSA 3MEAA 4QEUA 2YQDA 2RO0A 4QY4A 3OYCA 4IORA 2P0KA 2R57A 3MP1A 3OA6A 4BE2A 4HXSA 4NQNA 5EU1A 3OYJA 5DKDA 2DATA 2M0OA 3UV5A 5HRVA 4KV1A 5HENA 5L97A 5C4QA 3LX7A 5ENJA 5CGPA 1ZS5A 4OGIA 4XUAA 4UYEA 4IR3A 4CURA 3M9QA 4BE0A 4TU6A 5EVAA 3PFSA 4HBYA 3OS0A 4NRBA 4IR4A 2M16A 3E9GA 3L2UA 4CFLA 5D6XA 5BT3A 4BW3A 5F63A 3PMIA 4LZ2A 2K3XA 5DYUA 4PL6A 3FKMX 3MXFA 4A9MA 4IUUA 4YH3A 2X4XA 4HXKA 3IU6A 4E7KA 4O72A 5LJ0A 2R10A 4UIZA 3OYNA 5KCHA 4PCIA 3U5KA 3I3JA 5KE3A 4ZTJA 3QKJA 3MB4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NYWA 4O6JA 4QZSA 2JW4A 4E7JA 1N9RA 4J0RA 1UTIA 2WSEE 4R55A 1FX7A 1RAIB 1UFFA 5FU6B 1TTHB 3JCMP 1D0YA 2RA2A 4UIVA 2DTOA 2DA9A 2YSQA 3EHQA 1N9SA 1X27A 2XDBA 2IVWA 1VQ6A 4A9JA 4MR5A 4BE1A 2A28A 4PKLA 1AWXA 4O78A 1EIFA 1Z9QA 1T3LA 4PJOE 2LNVA 1P92A 1HJDA 4E2FB 4PJOB 5F25A 5D3LA 1OI1A 4CC7A 2O2OA 4HVUA 1K9MU 2LT4A 1QCFA 4XQ3A 4NQMA 3JCMh 4HT8A 2QI2A 5LJ5f 3L2WA 3HHTB 3BFMA 5FG5A 2OO1A 1UGRB 2XK0A 4YYMA 4B9XA 2XD0A 1UB4A 5FFVA 5CUGA 4PKCC 3CCSA 4EMKB 1Q86C 1FWZA 4LYSA 2X3XD 5KCOA 4LZSA 5CUDA 2RN8A 1WYXA 2ROTA 3CCEA 3QHSA 4F7UG 3CXCP 2RB6A 2DVQA 3GF5A 4FSXA 5I7YA 1X6GA 4HXLA 2MJVB 1KQSA 2HQXA 4PJOG 5LKTA 5EI4A 4M7DF 3P8HA 4OP0A 5HCKA 3D1DA 3U5LA 3P8BB 5CQ5A 2AK5A 5CRMA 3LQIA 1ZSZA 3VUBA 5FE5A 3CCQT 4C0GA 4MDXA 2BE9B 5HJCA 5CKBA 2CUDA 4MEPA 4YYDA 3M54A 3G0JA 5D26A 4KUDK 5LVRA 3FRNA 2H3EB 4M78G 4M7AG 1WA7A 1IGQA 2RHYA 5FB0A 2VV5A 4JPBW 4XU1A 5JWMA 1WGSA 2LQ8A 5IXBA 1AOJA 4CUUA 5A5OA 3JVJA 1H3HA 1YI2T 2FSAA 1I4K1 2RQUA 2EQJA 1YWPA 4QR3A 1VQ8T 1IRXA 4PK4A 4YYJA 2RM4A 2KRMA 4M77D 4XTZA 1BCOA 1LNXA 1VQNT 5I11A 5ENEA 5D7XA 5CUCA 4PTBA 4XAXB 5AD2A 2WSCE 2CP5A 2NUTA 2A37A 4NRAA 2F6NA 2H60A 5J39A 4Z88A 3X26B 2EJGA 5I21A 2HBWA 3QO3A 3RR6A 3HP9A 2E3HA 3JCMJ 5HELA 2MOXA 4TYLA 5HQ5A 3SEMA 4E7LA 4YYHA 3HKSA 1RAHB 3GLXA 5COIA 3JCMf 3OW2P 4M77C 2A0FB 1M90R 3CD6A 2CP7A 2EJNA 5EWDA 5FG4A 2AKLA 5FRNA 2HAXA 5ENGA 4JJDA 3EH1A 4YK0A 5I88A 5KYUB 3LWIA 4LDFA 4HXJA 4TVRA 4F16A 2X35A 1UGSB 1C0MA 4TT6A 1NE8A 2RHXA 5DYCA 3TREA 2RFJA 5KHMA 2KT8A 3BE3A 3HFOA 5CAIA 1K0XA 4NXJA 1NYFA 3MCAB 5GMKe 2LQNA 1LCKA 3PVQA 2L8DA 3CC7Q 5CR2A 4WIVA 4YYGA 3L2VA 3JVMA 1HYOA 3K2JA 4N4HA 2EW3A 4A4KA 5FE9A 5BT5A 3CMAQ 1YHQQ 2RJCA 3EG9A 2M9UA 1RI9A 2SRCA 4J0SA 5A5QA 1W6XA 3ZBDA 2X51A 5GAMe 4M75E 3LH0A 2E12A 2DL3A 3M0PA 4AMCA 4M75B 1KHCA 2VUBA 1D3BA 1BK2A 5EICA 2JUFA 2AT1B 4O7EA 2LJ3A 3CPFA 9ATCB 2FZCB 1T0HA 1W1FA 4E96A 5E7DA 4YAXA 1WJSA 2V1RA 3NPFA 3C0CA 1JJ2P 4RTTA 3LGFA 1VYVA 1UJYA 2H8HA 4J83A 3ZL7C 1X43A 8AT1B 1VQ5Q 1D0XA 5D3HA 4QB3A 3VKHA 2C0IA 3M0SA 1AWJA 4OGCA 4KCXA 4GLKA 1QQJA 4C5EA 2E3KA 4MR3A 4K11A 4UIUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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