4N4GA

Crystal structure of the bromo-pwwp of the mouse zinc finger mynd-type containing 11 isoform alpha
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
213
structure length
209
Chain Sequence
NKQEMGTYLRFIVSRMKERAIDGKDSKHPMYRRLVHSAVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNVHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWKSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title ZMYND11 links histone H3.3K36me3 to transcription elongation and tumour suppression
pubmed doi rcsb
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
molecule tags Transcription
source organism Mus musculus
total genus 63
structure length 209
sequence length 213
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4n4gA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4n4gA02
5D0CA 5IN1A 4NQMA 4NR7A 3LJWA 4CURA 4N4FA 5IAYA 5E9VA 5I89A 5CQTA 4UYDA 2DIQA 1WUMA 4LYIA 5F2PA 2WACA 4PL6A 4NXJA 5FFYA 3OYEA 4NR4A 5D3TA 3JVJA 2M0OA 4LRGA 4X34A 1JM4B 3OYGA 5E73A 5H1VA 2LSPB 2OO1A 4BW2A 5I80A 2I7KA 4XY9A 2E7NA 5E9YA 4LZ2A 4EDUA 2D9EA 2DVRA 2PQWA 5DFDA 5ENGA 5CFWA 4KCXA 4PS5A 3FEOA 3OYJA 4UYHA 2RNXA 5D3HA 4BE1A 4A4GA 4BW1A 4MR5A 5KE2A 4ZC9A 4UYFA 2LCCA 3Q1JA 4F3IA 3MUKA 5ENHA 4CUPA 4YBTA 1WJSA 5BT5A 5L98A 1OZ3A 4IUTA 4NYWA 3OS0A 5H85A 4E7HA 2RHZA 3LXJA 2DVSA 5HRXA 5EPBA 5F3AA 5FE4A 5FE8A 4A9HA 2X35A 3JVKA 4HXNA 4UIYA 5D3NA 5CY9A 3LQJA 5FH7A 5L8TA 4TS8A 4CLBA 4A4FA 3LX7A 3U5OA 3P8HA 3PMIA 4YYNA 4X2IA 4E7LA 2D82A 5CUBA 4QSUA 4NR8A 5F62A 4NR6A 5FE3A 5C8GA 2RJDA 2X4WA 4NRBA 4HCZA 3QZSA 4IR6A 4LYSA 3L2QA 4NS5A 4YADA 3O37A 2YEKA 3M9QA 5DKCA 3UVXA 2R58A 3OYFA 3DB4A 5LJ1A 5IGNA 3U5JA 5HJCA 4AKNA 3OYCA 3OYLA 4RVRA 3Q2EA 5FDZA 4QEVA 3MEUA 4LZRA 4XUAA 2R0VA 2RNYA 3MB4A 2YDWA 5CGPA 4CL9A 3DB3A 5F60A 5CQ6A 5AD2A 5CUGA 4LZSA 2RHUA 5FE5A 2DVVA 4BACA 3OS1A 1RI0A 2QQRA 2RS9B 4C5EA 4QSXA 4C5HA 5CQ8A 5E74A 1XNIA 4A9NA 4PKLA 5EM3A 4QEWA 4YYHA 4QQDA 3OYAA 1ZS5A 2RJFA 2M16A 5D6WA 3P1EA 3FKMX 4IOQA 4O75A 5II2A 3MXFA 4A4EA 5L96A 4NQNA 5CQ4A 2F6NA 3AQAA 2N9GA 5E3DA 3DLMA 5EWDA 3ME9A 3QIIA 5HFRA 3CEYA 4QR4A 5A7CA 3MB3A 1G5VA 4NR5A 5E3GA 4Z6HA 5F5ZA 3SVGA 3U5MA 5F1LA 3QZTA 1OYXA 1WJRA 4O77A 2NLUA 4A9KA 2DVQA 4A9JA 2EQJA 5ETBA 4QR3A 4LD6A 4TU6A 2G3RA 4FU6A 3L2WA 4MR4A 5A5RA 5F1HA 5D3PA 3O34A 2E3KA 3OYBA 3H6ZA 3UV4A 5EP7A 3PMTA 2GRCA 3MEWA 5LKTA 5KH6A 1F68A 5EWCA 5D25A 4QUUA 5DYUA 5CQ3A 5FB1A 3I3JA 4YABA 2BIVA 3NTHA 5A81A 4Z02A 5KTUA 5L97A 3O33A 5DW2A 2YYNA 4TT2A 5I7YA 4UIXA 3E9FA 5EA1A 1KHCA 5KO4A 4IKFA 4NYVA 5C89A 2DAQA 4YC9A 5F63A 3JVLA 4IR3A 5D3RA 5FG4A 4PLLA 5KU3A 4YYGA 3G0JA 5DKHA 2YELA 5EI4A 5DFCA 3UVDA 5CUCA 5CQ7A 5FE9A 3OYKA 5E7DA 5D24A 4QNSA 3S3MA 2B8AA 3NTIA 3LH0A 2I8NA 5H1TA 2X4XA 4C66A 4TQNA 5LKZA 5DYCA 4HXKA 4O70A 2NXBA 2K3YA 4BDZA 4WHUA 4WHWA 3UW9A 4O74A 4UIZA 3ZEHA 3ONIA 5J0DA 4ZTFA 3LGLA 5FH8A 5C4QA 3RCWA 5ENIA 4BW3A 5IGKA 2QQSA 2M1HA 4Y03A 5DYAA 4PCIA 2D9TA 5DFBA 4N4HA 4A9IA 5A5PA 3U5PA 4KV1A 5CQAA 1N27A 4HXLA 4YATA 5CP5A 5EK9A 3UV2A 2DWWA 2KTBB 4MR3A 5I7XA 5HRVA 4QY4A 4QYDA 4J1PA 2CKKA 2JZ2A 3OMGA 4NUCA 4O76A 4YAXA 4CUSA 5FE2A 4HBWA 4YYIA 2BUDA 4QZSA 4YBSA 4HXOA 4TU4A 5EICA 5KCOA 5COIA 5HLSA 4CFKA 4Q0NA 3U5NA 3L2RA 5ENFA 5A5OA 5EPSA 4N4IA 3OYIA 3UT1A 4QEUA 5FBXA 2RO0A 5C6SA 3L42A 3META 4YH4A 3NTKA 3FC3A 3AADA 4N3WA 5FROA 4NUDA 3U5KA 3QKJA 4IOOA 4MEQA 4UIWA 5I83A 3L2UA 5EWVA 4ZQLA 3JVMA 4QC1A 4A9OA 5J39A 5I40A 4YYKA 4O7CA 5HRWA 3P5OA 2R5AA 3C4SA 1WUGA 1E6IA 4J0SA 4LDFA 5FG6A 2RHXA 2HQEA 2HQXA 4UIVA 2RO1A 2RFJA 5CUEA 4TZ8A 5IBNA 4N4GA 1EQFA 5C7NA 2L85A 4YK0A 5DYXA 5FFVA 5TCMA 5I29A 2MWPA 3PFSA 5D6YA 4PCEA 4A9LA 4QYLA 4QBMA 5FE7A 4NYXA 4FL6A 5A5QA 3OB9A 2F6JA 5FRNA 3D7CA 2RNWA 5CRMA 4E7IA 3MQMA 5CIUA 3HMEA 3S92A 1OZ2A 5A82A 3MP1A 3F70A 3DAIA 4IUQA 5JI8A 5JWMA 4NR9A 5E9IA 4XUBA 3E9GA 3QJ6A 5A5SA 2XK0A 3KUFA 5D6XA 4O7FA 3EAEA 5K29A 3P8DA 5AMEA 4QSPA 5LJ2A 4TYLA 3OY9A 4YBMA 4QSTA 3TLPA 2VYTA 4UYEA 4J3IA 4Z6IA 5DLXA 4Z93A 3NXBA 5A85A 4O7EA 4QSWA 4PLIA 2LRQA 5LUUA 4QB3A 4QSVA 4ZTJA 5KTWA 4A9EA 3LYIA 5FG5A 4Q5WA 4Q0OA 5E9KA 4IUVA 4E96A 5EVAA 4QUTA 5G4RA 2RJEA 3ASKA 1X0JA 1WJQA 4UITA 5BT4A 2E5QA 2RHYA 1WGSA 4DONA 2F5KA 2L5EA 4YY4A 5DY7A 4CRIA 4MR6A 3LGFA 4NRAA 5D26A 3DWYA 1OI1A 4II1A 4B9WA 5II1A 2GFUA 4QSRA 5EV9A 4HXMA 5HEMA 3H8ZA 4O71A 5AD3A 2RHIA 5HQ5A 4O7AA 5IG6A 4XY8A 5IIDA 2DKWA 3OMCA 5EGUA 2R57A 4KV4A 4OVAA 5CU8A 4QC3A 4LC2A 2EKOA 5ACYA 4BE0A 5KCHA 4MEPA 5G4SA 2X4YA 5LVRA 4XYAA 5CQ5A 5CZGA 4ZW1A 2R10A 5C85A 3LLRA 4J0RA 5D3JA 5DBMA 4PTBA 2LVMA 4A4HA 2WP1A 3SD4A 2R0SA 1MHNA 2YQDA 3MULA 1N72A 4HXRA 2BKDN 4QW2A 4HXPA 4GPJA 4YYDA 5CUAA 3LQHA 4Z1SA 3PNWC 3SVFA 5EQ1A 1H3ZA 4HBYA 4A9FA 3S91A 3K2JA 5A5NA 4TT6A 3IU5A 3OYHA 5HELA 5BT3A 5D3SA 4TT4A 5EU1A 2YRVA 2IG0A 2OUOA 5DW1A 3UVYA 5F61A 4BJXA 5DX4A 3P1DA 5H1UA 2XDPA 4CUQA 1SSFA 2RI3A 4C5GA 5AMFA 3L2VA 3LQIA 5FH6A 4QQ6A 2L3RA 5DKDA 2L84A 4IR4A 2MJVB 5EWWA 2RI5A 4HBVA 5FB0A 4C67A 3IU6A 5I88A 4O78A 2EQMA 3OS2A 3S3OA 5M9OA 3HMHA 5ENBA 4QSSA 5F25A 5CPEA 5E9LA 5C0MA 5D7XA 5TB6A 4MENA 4O72A 5IGMA 2GFAA 5FRMA 5L99A 3UWNA 4QSQA 2L8DA 2R0YA 5FE6A 4TTEA 5CRZA 2RI2A 3FLGA 4QQGA 5J26A 4TZ2A 5HFQA 4E7JA 2RI7A 3OA6A 5IGLA 4OGIA 5D3LA 2R5MA 2O4XB 5HM0A 4QR5A 4MEOA 3QZVA 4OGJA 4ALGA 3FDRA 5HQ7A 4LYWA 5ENCA 4GY5A 2OSSA 2WP2A 3SVHA 3MEVA 4UYGA 3OYNA 3P1FA 3OYDA 3GG3A 4NUEA 3OQ5A 2LTOA 3S6WA 4E7KA 5ETDA 4YY6A 4UIUA 5LKXA 5HENA 5ENJA 2G4AA 2DIGA 2LDMA 5I1QA 1JSPB 2EQKA 4A9MA 5EWHA 5E0RA 2DATA 4IUUA 3BDLA 4B9XA 2YEMA 5DLZA 4PY6A 5HCLA 4QVZA 5FE1A 4YYMA 4RG2A 3O35A 2H60A 5FFWA 4NRCA 2L89A 4YYJA 3MO8A 2E7OA 4IUPA 5LKUA 4L59A 4IR5A 5E9MA 3Q2FA 4CFLA 3S3NA 5LJ0A 2MWOA 4O7BA 3UV5A 4CUUA 3P1CA 3OYMA 4IORA 3O8VA 5I86A 2P0KA 4HXSA 2K3XA 4BE2A 5CUDA 4BDYA 2EQUA 3MP8A 4UYFB 5ENEA 4BHWA 2FHDA 2EFIA 5A83A 4CUTA 2GF7A 3O36A 4HBXA 5FE0A 4WIVA 4YH3A 3U5LA 5KE3A 5CTLA 5C87A 3MP6A 4IURA 4BW4A 4OUFA 2FSAA 3ZYUA 5F36A 5L8UA 4FLPA 4BD3A 5HQ6A 5LVQA 2E6NA 3QBYA 5CS8A 3HMFA 2O4XA 4UC4A 5KHMA 3UVWA 5KTXA 3GOXA 3G0LA 4Z1QA 3MEAA 4ALHA 2RJCA 4LR6A 4C5IA 5EPRA 2JTFA 5EISA 2YW5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IN1A 4NQMA 3LJWA 3JCMg 5CQTA 1OPKA 1WUMA 2JTEA 5IT9E 3LH5A 5FFYA 1M3AA 4NR4A 5A0LA 5D3TA 4JPBW 3OW2A 1IRXA 5H1VA 4F7UE 4X1VA 4A4KA 1NPRA 4KH1B 5GAMf 4JS5A 4M78A 2E7NA 4C8QG 1XJWB 2D0QB 4PJOE 4TVRA 2DYIA 1PD0A 4KRTA 5D3HA 3OSVA 4BW1A 4MR5A 1MNEA 1NG2A 3MHXA 4ZC9A 3H41A 4UYFA 2LCCA 2RK2A 1YJ9Q 1D0ZA 3JB9H 3V8LA 1ZSGA 1K1ZA 4XU2A 4XTZA 3VS4A 2LP5A 4E47A 4M7DC 1RAIB 5LJ5f 2DERA 4PJOD 4NYWA 4E7HA 1YJNA 2CT3A 3UF4A 1VQPA 4FW2A 3VUZA 4UIYA 5GAMd 5CY9A 5FH7A 4TS8A 2CP0A 4CLBA 1ZQ1A 3M0UA 3EFOA 2OTJA 4E7LA 4DBFA 2CP2A 4NR8A 1HYOA 4NR6A 2E3IA 3HFNA 3M0SA 4NRBA 2ENMA 3I5SA 1AHJB 1LCKA 2ZZDA 4JRPA 1SHGA 3VYHB 3UVXA 3OYFA 1ZUUA 2JUFA 5IGNA 1YHQA 3E2UA 1PD1A 2KR3A 3OYCA 1PM3A 3Q2EA 5FDZA 3MEUA 2PVGB 3I5RA 5GMKm 2WSFE 4LZRA 2R0VA 5KYWB 5FU7C 5CGPA 3JB9D 1V1CA 1G3TA 4J9GA 4LZSA 5FE5A 2DVVA 1MV3A 4D8KA 1VQ6Q 2DKGA 1KQ2A 2QQRA 3NPFA 3RKWA 2FYKA 4QSXA 3CMEQ 5E74A 4A9NA 1TG0A 3CBPA 4QQDA 1ZS5A 1FMVA 3VUBA 1RUWA 5D6WA 4IOQA 3FKMX 4M77E 3CXCP 5L96A 4GLKA 1WX6A 2F6NA 2D8JA 3CC2Q 2HL5C 3DLMA 3ME9A 4M7DG 1R0BG 3QG1A 3MB3A 4NR5A 5F5ZA 2YLCA 2KYMA 1UGPB 4M77B 4AG1C 4O77A 1VOMA 1IO6A 4QT7A 3M5AA 3L2WA 4M77D 3BY7A 4CC4B 2BE9B 1WYXA 1SKUB 1UECA 2ZPBB 4C0ZA 5D25A 1ZBXA 4J6YA 5DYUA 1N8RU 5CQ3A 2KT1A 2RA2A 5A81A 1UHFA 2JJ9A 3CCMT 4Z02A 4OMOA 2JM9A 1M1KU 2CS7A 5FU6B 2DJZA 5KYWA 2QG9B 1PSEA 4OB0B 1KHCA 5KO4A 3UA6A 4IKFA 1ZUYA 4BY6B 5GMKe 4NYVA 1Q82R 5LJ5g 4ME7A 3UVDA 5CQ7A 4MMKA 4F14A 2B8AA 2FRYA 3ER0A 2I8NA 5H1TA 1M2VB 4C66A 1Q81C 4TQNA 4LN2A 4WCIA 3VU3C 5HY6A 2NXBA 4WHWA 3ZEHA 1PRLC 3CC4A 2DVEA 3RKXA 1JJ2S 3JCMV 1YJNQ 1VQPQ 4BW3A 5IGKA 2LJ1A 4M75B 2E41A 2M1HA 2D9TA 3JCMc 1QMCA 5HK0A 4N4HA 4KV1A 1T0HA 2OTJQ 1AVZC 1WA7A 2VKNA 4HXLA 2VXEA 3I55T 2FO0A 2KRNA 4JJDA 2DWWA 1QVGP 4QYDA 2AZVA 3OMGA 1ZHIA 2K2VA 4HBWA 2LQNA 4TU4A 1YHQQ 2BTTA 5GANg 4Q0NA 3HPWA 5ENFA 4N4IA 1D0XA 1VQMQ 4MMLA 3UT1A 4QEUA 2MF2A 1UGQB 1YITQ 5C6SA 3META 3H0IA 4YH4A 2CYZB 1BCMA 1SG5A 5GMKj 4NUDA 2KGTA 1M2VA 1K8AC 4C92F 3M54A 4UIWA 5I83A 3M4GA 2HCKA 1UB4A 3PVQA 2EPDA 5I40A 4YYKA 3HL8A 5HRWA 2AIRB 2R5AA 4N0AA 5GJWB 1NEGA 5CQXA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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