4N4HA

Crystal structure of the bromo-pwwp of the mouse zinc finger mynd-type containing 11 isoform alpha in complex with histone h3.1k36me3
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
209
structure length
188
Chain Sequence
QEMGTYLRFIVSRMKERAIDLVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGAASAQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNVHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title ZMYND11 links histone H3.3K36me3 to transcription elongation and tumour suppression
pubmed doi rcsb
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
molecule tags Transcription
source organism Mus musculus
total genus 66
structure length 188
sequence length 209
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4n4hA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4n4hA02
4UIYA 5FE3A 3S3OA 4PKLA 3FEOA 5J39A 4NR8A 3U5KA 4LZRA 4WHUA 5FG5A 4UYHA 5C85A 5CQ7A 3UW9A 4A4HA 4XUAA 5DFDA 3G0LA 5D6XA 4J0RA 4ALGA 2WACA 5D3SA 3MEAA 3OB9A 4YK0A 4IOQA 4QC1A 3NXBA 4UYEA 5EA1A 3U5LA 5LJ0A 2F5KA 4J3IA 5CQ5A 5L97A 2KTBB 5CPEA 3LH0A 4J0SA 3M9QA 5A5RA 1OZ2A 4Z1QA 5D7XA 1WGSA 3MP6A 2GRCA 4BHWA 4HXLA 5EGUA 4C5EA 5D24A 4NR4A 4OUFA 4LZSA 2DVRA 2RS9B 4IR3A 4O77A 5A81A 3O34A 4UYFA 5CZGA 3JVJA 3DB3A 3F70A 4A4GA 4Q0NA 5I83A 4A9OA 4E7IA 3GOXA 4N3WA 4DONA 3DAIA 2M1HA 5FG4A 3OYLA 4HBWA 5CY9A 5TCMA 2LTOA 3UVXA 4A4FA 2D9TA 4HBXA 4YYKA 5CUEA 3QZTA 2BIVA 4UIZA 2NLUA 2EQKA 5DLXA 5CRZA 4MR4A 2X35A 5E3DA 5LVQA 1JM4B 3OMCA 4ZQLA 2R10A 5D3JA 2RNYA 4KV1A 3NTIA 2E7OA 2M16A 5H1VA 5BT5A 3JVMA 2HQEA 5E74A 2DVVA 2L5EA 3IU6A 5FFYA 5KU3A 3META 2JZ2A 2LRQA 4FL6A 4O7CA 4YH4A 4RG2A 4QEVA 2RHUA 5CGPA 5EWDA 3SVFA 4IOOA 4NUEA 4YYDA 5HM0A 3OYBA 2L84A 5FE6A 4QYDA 5E9KA 5DYUA 2RNXA 5ACYA 4PLIA 3ZEHA 5F5ZA 4BE0A 3MP8A 3S91A 4QQGA 4Z6IA 2DIGA 4HCZA 2RO0A 2GFAA 3UT1A 5HQ6A 5CUBA 5C7NA 2YW5A 3CEYA 3QZVA 5D3LA 5LKXA 2I8NA 4GPJA 4HXRA 5FH7A 4O71A 5LJ2A 4IUUA 3S6WA 5FH8A 2R57A 5CUCA 1WJQA 2LDMA 4QSXA 5HENA 3OYMA 4NYXA 5FE9A 5FE2A 5E7DA 5H1UA 3OY9A 4OGJA 2K3XA 1E6IA 4Y03A 3OS2A 1RI0A 4NUCA 2DAQA 5I29A 2NXBA 2H60A 5HRVA 4NR7A 4HBYA 5I86A 4IORA 4UYDA 2JTFA 4RVRA 4QUUA 4UYGA 5HQ7A 4BD3A 1JSPB 3AQAA 3JVKA 3NTKA 5I40A 5KH6A 5IIDA 4B9WA 4YH3A 4CUPA 1WUMA 4IUTA 3OQ5A 2RNWA 3P1DA 4QSTA 4YBTA 4A4EA 4QSSA 4YBSA 5KO4A 4OGIA 4QSPA 5FBXA 2QQSA 2E3KA 5E0RA 3H6ZA 4NS5A 2R0VA 5A5NA 4O7AA 3DLMA 3FKMX 4UC4A 3OYIA 3OA6A 3P8DA 5ETDA 5TB6A 5FG6A 3U5MA 5CQAA 2YEKA 5EI4A 3U5OA 4O7EA 3P1FA 5HFQA 5LKZA 5E9VA 1OZ3A 4PY6A 4HXNA 4BJXA 4WIVA 5F36A 5D25A 5F25A 3MEWA 3MULA 4X34A 4YYMA 4MEPA 4QSVA 4TS8A 2DIQA 5IN1A 4QSRA 5C4QA 5FH6A 5A5OA 4N4HA 4A9EA 5DW2A 4N4FA 5CP5A 5EP7A 2L3RA 5KCHA 1WJSA 4TZ8A 3FC3A 2DWWA 4QSUA 4E7HA 4HBVA 4HXPA 2K3YA 3UWNA 5EPSA 4IUVA 4NR5A 4BDZA 4TT4A 4C67A 4NQNA 3S92A 3ZYUA 4Z93A 4QC3A 4O7BA 5EICA 4QY4A 4LZ2A 3HMFA 4HXOA 3O37A 2F6NA 4WHWA 5CRMA 2G3RA 4YY6A 2R0SA 3P8HA 2RI7A 4CUUA 4PTBA 5A5SA 4Z6HA 5AMFA 5C87A 4IR5A 4BW2A 4X2IA 5FE1A 3UV4A 3ME9A 3P5OA 1G5VA 3LGFA 3MXFA 3H8ZA 4E7KA 5ENIA 2R58A 2EQJA 5FRMA 4YAXA 2F6JA 4AKNA 2O4XA 5EISA 5DKDA 2EKOA 4KCXA 4XY8A 3UV2A 3OYCA 4UYFB 4CUSA 2FSAA 5A5QA 2WP2A 2OUOA 2RHXA 4CRIA 1X0JA 4TTEA 4YC9A 3ONIA 3Q2EA 5I89A 3OMGA 4J1PA 2YRVA 4MR6A 5F3AA 1WUGA 2DVSA 5M9OA 2LCCA 5D26A 4UIVA 5EPRA 2VYTA 5J26A 4MEOA 5CQTA 5HJCA 3LYIA 2CKKA 2FHDA 5E9YA 4BW3A 2RJDA 4N4GA 3UVDA 2L85A 4YYNA 4MR3A 4LRGA 5FE7A 3MEUA 3OYGA 4QBMA 4QW2A 3E9FA 5DLZA 2RJEA 4YY4A 3MUKA 4CFKA 1XNIA 3SVHA 2RFJA 2I7KA 5F61A 5FFVA 5L8TA 4BDYA 3Q1JA 5ENGA 5F63A 4UIWA 3OYNA 5J0DA 4YYHA 5CUAA 5I7YA 3QBYA 5L99A 3LLRA 2GFUA 3LQJA 4ZC9A 2DATA 3PFSA 5CUGA 3MO8A 4HXKA 5F62A 4TZ2A 2E5QA 2E6NA 2RO1A 4NR6A 4CUQA 3P1EA 2X4YA 4E96A 4QUTA 5CIUA 4QVZA 2B8AA 5EWVA 3SVGA 2GF7A 1ZS5A 3D7CA 5BT4A 2LVMA 4MEQA 5IGKA 4BW1A 4NUDA 5KE2A 3OYKA 5FDZA 2YEMA 4QSWA 4NRBA 5AMEA 3MEVA 4LD6A 5IAYA 4YYJA 3L2VA 2X4WA 3MB4A 5H85A 2X4XA 5C6SA 5D6WA 5AD3A 3MP1A 5KTWA 4PLLA 4E7LA 3KUFA 4NXJA 2IG0A 5HEMA 5D6YA 3G0JA 5E9LA 5KHMA 4IR6A 2DKWA 5ENFA 1OI1A 5HQ5A 4YATA 1H3ZA 4O70A 2BUDA 4QZSA 4LYIA 3OYEA 4ALHA 5CU8A 5DBMA 4IUPA 4O78A 3L42A 3O36A 2BKDN 2R5MA 4E7JA 4LYWA 3DB4A 2MJVB 5C8GA 1N27A 4CL9A 4HXMA 3S3NA 5D3PA 4MENA 5DX4A 2MWPA 4A9LA 4NR9A 5II1A 5FB0A 1KHCA 4Q5WA 4QNSA 3AADA 2XK0A 5JI8A 4XY9A 4C66A 2RI5A 4II1A 5FB1A 4YYIA 5DKHA 5A83A 5EWCA 3OYHA 5EVAA 3LQHA 4CUTA 5IGNA 5IBNA 4XYAA 5HRXA 4EDUA 5D3HA 4A9NA 2L8DA 5CQ4A 2HQXA 4CFLA 5D3NA 3K2JA 4Q0OA 4QYLA 3S3MA 2QQRA 5EV9A 4IKFA 2DVQA 4QR5A 5LKUA 5CQ3A 4F3IA 5LJ1A 4OVAA 5L8UA 4FU6A 5LVRA 2M0OA 2E7NA 5IGLA 2OSSA 4NRAA 3EAEA 2RI3A 5HLSA 3PNWC 5EU1A 4LC2A 4TQNA 2WP1A 5A5PA 4PCEA 3MB3A 5A85A 1WJRA 2EFIA 5FFWA 5ENCA 4C5GA 4ZTFA 2P0KA 1F68A 5KCOA 4NYVA 5ENHA 5L98A 3DWYA 3PMTA 4QQ6A 4NRCA 2RHIA 4UIUA 5FE5A 3NTHA 2O4XB 3U5NA 5DYAA 4QR3A 5DFCA 3O33A 5CQ6A 4QSQA 5I1QA 3O35A 5D0CA 5DKCA 5CS8A 4O7FA 2YELA 4B9XA 4BE2A 2D82A 4BACA 3C4SA 4IUQA 4O76A 5F60A 3HMEA 5AD2A 5FE4A 5II2A 2YYNA 1N72A 3QIIA 5E3GA 4QEUA 5HFRA 2RJFA 2OO1A 3QKJA 5FRNA 4YADA 3LX7A 5HELA 5KTXA 4NYWA 2RHZA 5ENJA 3ASKA 4L59A 2R5AA 4BW4A 2L89A 2RI2A 2EQMA 2PQWA 2YDWA 5CQ8A 4GY5A 4QEWA 5FROA 4LDFA 4N4IA 5CTLA 5E9IA 5EM3A 5F2PA 4FLPA 3LQIA 3JVLA 4HXSA 5G4SA 5G4RA 3L2UA 3LJWA 5LKTA 5DYXA 4TYLA 5FE8A 5KTUA 4TT2A 4O74A 4PS5A 4XUBA 2RHYA 3UVWA 4BE1A 5IG6A 5ENEA 4YBMA 5EK9A 5COIA 3OS0A 4YYGA 5CFWA 5DYCA 5EPBA 5EQ1A 2RJCA 3BDLA 3E9GA 5HRWA 5F1HA 5IGMA 4UITA 4A9MA 4A9HA 1MHNA 3QJ6A 5L96A 4A9IA 5ETBA 4A9KA 4A9FA 5D3TA 3OYFA 4UIXA 3IU5A 5H1TA 2MWOA 4C5HA 2EQUA 5DFBA 5KE3A 2LSPB 4KV4A 4Z02A 5CUDA 4CLBA 5FE0A 5A7CA 4MR5A 2N9GA 5HCLA 3PMIA 5C89A 2D9EA 3QZSA 5LUUA 4TU6A 4LYSA 3FDRA 5JWMA 4PL6A 4YABA 3OS1A 5EWHA 3O8VA 3L2WA 5DY7A 3UV5A 3RCWA 4PCIA 2G4AA 4QB3A 5ENBA 3OYJA 3L2QA 3MQMA 5E73A 5I7XA 3UVYA 3FLGA 3SD4A 4ZW1A 4NQMA 4O72A 4ZTJA 2XDPA 3U5JA 5EWWA 5DW1A 3L2RA 5D3RA 4TU4A 1OYXA 3Q2FA 4TT6A 5I88A 3OYAA 4IURA 2R0YA 3P1CA 4CURA 3OYDA 3TLPA 5C0MA 1EQFA 3I3JA 5K29A 3LGLA 4Z1SA 5F1LA 4C5IA 4LR6A 1SSFA 4QQDA 3GG3A 5I80A 4IR4A 4O75A 3U5PA 3LXJA 5A82A 3HMHA 2YQDA 5E9MA 4A9JA 5BT3A 4QR4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TREA 3NFCA 3REBB 1GCQA 2PTKA 2K9GA 4RTTA 3CC2T 1QP2A 4M75B 2KY9A 3VUBA 4UYHA 2K2MA 3BFMA 4MMKA 4A4HA 4C8QG 4XUAA 2LCSA 5D6XA 3M0PA 5D3SA 4M7AB 2YLBA 4YK0A 1M2VA 4N0AC 4QC1A 1MMAA 3NXBA 5EA1A 1KSWA 5LJ0A 3QPHA 3V8KA 2MIOA 4AFUC 1I0CA 5CPEA 1GFCA 3LH0A 4WF2A 1OZ2A 4Z1QA 3EFOA 1EIFA 2VWFA 2YHTA 1WGSA 1PD0A 4C5EA 1QQJA 2ENMA 1NG2A 4OMMA 4OUFA 1PRMC 4ZGDB 5A81A 1E6HA 4F7UB 1ZKRA 2F1LA 1O9SA 1YNZA 3F70A 4Q0NA 1XOVA 3I55T 4LD9K 5FG4A 2IPOB 4JJNK 1ZUUA 1RAAB 3UVXA 2D9TA 4YYKA 2D1XA 3QZ9B 1YJWT 2X9HA 3QZTA 2NLUA 4UIZA 5GMKi 2D8JA 4O6JA 4MZPA 1YI2A 1VQKT 2X35A 4ATOA 1Y96A 5E3DA 2RQWA 3RERA 4ZQLA 3TVTA 3NTIA 2E7OA 2DRKA 1ABOA 1D09B 1MMGA 5H1VA 5E74A 2DK3A 3GIBA 1I5LA 1JQQA 4QEVA 2VUBA 1V29B 1NPRA 4IOOA 4NUEA 4CC7A 3OYBA 2L84A 9ATCB 1K8AC 3S91A 1TH7A 1WXBA 2WSEE 4HCZA 2CS7A 4M78B 4AKIA 2KYBA 5C7NA 3CEYA 8ATCB 5D3LA 5LKXA 3HFNA 3L2ZA 5CQXA 5FH7A 1HYOA 5LJ2A 2QG9B 5HENA 3OYMA 5FE2A 2RA2A 2VGMA 2JOYA 1BI1A 4NUCA 2DAQA 2JUFA 2MOXA 4MZMA 2A08A 4OB3B 5AYFA 4HBYA 3VS3A 4M77C 2AIRB 1Q81C 1OX9A 1FWZA 3M53A 4D8KA 2CT4A 1AHJB 1WA7A 5IIDA 4B9WA 1N8RU 2RNWA 3CXCA 1K4US 5LL6S 4A4EA 1UHCA 3ZFJA 2EYXA 2AKKA 2EYWA 1TS9A 4P5NA 4HVWA 3DLMA 1X01A 3P8DA 1UGRB 5FU7C 3JB9J 1YBYA 5FG6A 3VRZA 2FO0A 4JRPA 3LWHA 1YI2Q 5HFQA 5LKZA 1D1CA 3A8LB 3QHSA 4CI0C 2C06A 1WPYA 3HL8A 3QZ5B 1PKSA 1VA7A 4M75C 2E4HA 5GMKj 5GMKl 3CCVA 5C4QA 3VS1A 4FW1A 4LUDA 5A5OA 4N4HA 3JB9D 4N4FA 5CP5A 4M7AC 4TZ8A 3FC3A 1ZLMA 2KT1A 4QSUA 2XG8D 4LDVA 2QEXA 1GBQA 4HXPA 2RQTA 3UWNA 3I56A 3ZYUA 4QC3A 5GANd 2GGRA 2KXCA 5CRMA 2G3RA 4YY6A 1G3SA 3FRNA 4QVCA 3GPLA 3GP8A 4DOVA 1G5VA 1OULA 1WFWA 3LGFA 3H8ZA 3EFOB 5ENIA 3EGDA 2R58A 2EQJA 3X28B 2F6JA 2LT1A 5EISA 2LCLA 2O9VA 1B07A 3UV2A 2IIMA 5GMKm 1JRIA 2WP2A 3M0SA 4CRIA 1ARKA 1M90R 1UJYA 3FIFA 2GBQA 2EW3A 1N8RR 1PKTA 5F3AA 1IHVA 2DVSA 3TCJA 2LCCA 3VRYA 2VYTA 1Y96B 7AT1B 3VKGA 3LYIA 4XU1A 4ELYC 5GAMj 2RJDA 3UVDA 2KYMA 4MR3A 3OYGA 3JCMf 1JJ2S 4M77F 4QW2A 1Z9QA 4M78C 1GRIA 4L6V5 4YY4A 1A0NB 4JS4A 1U06A 5F63A 1VQOT 1JU5C 2DYBA 3SDZA 2CH4W 3QYGB 1EZZB 2GFUA 2K5LA 3CCVQ 1VUBA 3MO8A 3EHQA 4JUVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4O72 A;  4ZTJ A;  2XDP A;  3U5J A;  5EWW A;  5DW1 A;  3L2R A;  5D3R A;  4TU4 A;  1OYX A;  3Q2F A;  4TT6 A;  5I88 A;  3OYA A;  4IUR A;  2R0Y A;  3P1C A;  4CUR A;  3OYD A;  3TLP A;  5C0M A;  1EQF A;  3I3J A;  5K29 A;  3LGL A;  4Z1S A;  5F1L A;  4C5I A;  4LR6 A;  1SSF A;  4QQD A;  3GG3 A;  5I80 A;  4IR4 A;  4O75 A;  3U5P A;  3LXJ A;  5A82 A;  3HMH A;  2YQD A;  5E9M A;  4A9J A;  5BT3 A;  4QR4 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TRE A;  3NFC A;  3REB B;  1GCQ A;  2PTK A;  2K9G A;  4RTT A;  3CC2 T;  1QP2 A;  4M75 B;  2KY9 A;  3VUB A;  4UYH A;  2K2M A;  3BFM A;  4MMK A;  4A4H A;  4C8Q G;  4XUA A;  2LCS A;  5D6X A;  3M0P A;  5D3S A;  4M7A B;  2YLB A;  4YK0 A;  1M2V A;  4N0A C;  4QC1 A;  1MMA A;  3NXB A;  5EA1 A;  1KSW A;  5LJ0 A;  3QPH A;  3V8K A;  2MIO A;  4AFU C;  1I0C A;  5CPE A;  1GFC A;  3LH0 A;  4WF2 A;  1OZ2 A;  4Z1Q A;  3EFO A;  1EIF A;  2VWF A;  2YHT A;  1WGS A;  1PD0 A;  4C5E A;  1QQJ A;  2ENM A;  1NG2 A;  4OMM A;  4OUF A;  1PRM C;  4ZGD B;  5A81 A;  1E6H A;  4F7U B;  1ZKR A;  2F1L A;  1O9S A;  1YNZ A;  3F70 A;  4Q0N A;  1XOV A;  3I55 T;  4LD9 K;  5FG4 A;  2IPO B;  4JJN K;  1ZUU A;  1RAA B;  3UVX A;  2D9T A;  4YYK A;  2D1X A;  3QZ9 B;  1YJW T;  2X9H A;  3QZT A;  2NLU A;  4UIZ A;  5GMK i;  2D8J A;  4O6J A;  4MZP A;  1YI2 A;  1VQK T;  2X35 A;  4ATO A;  1Y96 A;  5E3D A;  2RQW A;  3RER A;  4ZQL A;  3TVT A;  3NTI A;  2E7O A;  2DRK A;  1ABO A;  1D09 B;  1MMG A;  5H1V A;  5E74 A;  2DK3 A;  3GIB A;  1I5L A;  1JQQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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