4N4IA

Crystal structure of the bromo-pwwp of the mouse zinc finger mynd-type containing 11 isoform alpha in complex with histone h3.3k36me3
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
211
structure length
192
Chain Sequence
NKQEMGTYLRFIVSRMKERAIDLVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGAASAQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNVHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title ZMYND11 links histone H3.3K36me3 to transcription elongation and tumour suppression
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Mus musculus
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
total genus 65
structure length 192
sequence length 211
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4n4iA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4n4iA02
4ZW1A 5HRXA 2G3RA 3JVMA 4Z1QA 3MUKA 4QSTA 1WGSA 4QSPA 3O36A 4C5EA 5F25A 4NR8A 4QUUA 4O7AA 4QC3A 4PLIA 4TS8A 3AADA 4J0RA 3FEOA 3L42A 5I7XA 4II1A 4QSRA 1JM4B 3LJWA 4NR6A 5D3JA 3OYJA 4GPJA 4X2IA 3MEAA 2JZ2A 4PCEA 4TZ2A 4WHWA 4PCIA 5D3RA 5D24A 4TU4A 5EI4A 5FE0A 2RO0A 2NXBA 5I7YA 4LRGA 5H1UA 4CFLA 5IGKA 2FSAA 5J26A 2DVSA 4QR4A 4QB3A 4A4FA 5DFBA 5IG6A 5EV9A 3UVYA 3SVHA 4O74A 5ETBA 1E6IA 4LYWA 5DW1A 5LJ1A 3TLPA 5KE2A 4CL9A 4C5IA 5KO4A 5EVAA 2L89A 3OYCA 4DONA 4N3WA 4UIVA 2RHUA 5TCMA 5I40A 2LCCA 2RI3A 2XDPA 5I89A 4QSXA 5D0CA 5A85A 1MHNA 2RFJA 3SVFA 2DAQA 4MR3A 3MEUA 4NR5A 4IURA 4FL6A 5DX4A 5IGLA 4CUTA 3UVXA 3S6WA 4CUPA 5EK9A 5CY9A 5CS8A 5KHMA 3PMIA 5L8TA 5EISA 3NTKA 2DATA 5E9IA 5IGMA 5A5RA 3UWNA 3G0JA 5D3HA 4BW1A 2RI5A 1WJRA 5CUAA 5EU1A 3IU5A 4MEPA 4TZ8A 5CRMA 5FFVA 5KTXA 3FLGA 3MO8A 3G0LA 3MXFA 4YATA 5A5PA 5JWMA 5A5SA 3LX7A 4EDUA 4O7EA 4UYEA 4YYMA 4RG2A 5EGUA 5E7DA 3S92A 2VYTA 5DY7A 4UITA 2EQMA 2JTFA 2RJFA 3OYLA 4F3IA 2RHYA 4YYJA 4HXOA 2BIVA 4TT4A 1EQFA 3LQIA 5IGNA 2R58A 5ETDA 4QW2A 2E7OA 4O77A 3MB4A 3GG3A 5FG4A 2YELA 4YH3A 4HBVA 3U5MA 3S3NA 2N9GA 4O76A 5CRZA 4QY4A 4YYNA 3UW9A 4HXKA 3P1FA 4HBYA 4NR4A 4MEOA 4KV4A 4YYIA 2K3YA 3UV5A 5ENGA 4OVAA 3Q2FA 5E3DA 5C8GA 5FE7A 5D6WA 4C5HA 4UYFA 5LVQA 3QZTA 4NRBA 5HELA 4A9HA 4PY6A 4E7LA 3OMGA 5F2PA 5DLZA 5E73A 5EWCA 5J0DA 1OZ3A 4YBMA 4A9NA 1WJQA 2L3RA 4YABA 2DVQA 4C66A 5BT5A 4ZTFA 3O37A 5DKDA 5DKCA 4XYAA 3SVGA 2LVMA 2EQUA 4XY8A 5C0MA 4QSQA 5IIDA 4N4GA 3H8ZA 3C4SA 5FB1A 5LKTA 4MR6A 5IN1A 4BW4A 2E3KA 4Z6HA 4O71A 3OYAA 4HXSA 4NXJA 4IUUA 5DBMA 3UT1A 4LZ2A 4O7FA 3D7CA 2OSSA 5DYXA 2MJVB 4HXLA 5ENEA 5F1LA 5I80A 3OS2A 4ALGA 5L99A 5JI8A 2R0VA 2M0OA 4C5GA 3P8HA 4TT6A 3ONIA 5LUUA 3QZSA 4YADA 4YYGA 2P0KA 3O8VA 3OYMA 1ZS5A 2O4XB 5AMEA 3IU6A 5G4RA 2R0YA 3P5OA 5D3TA 4CUSA 4O78A 3LGFA 4ZTJA 3U5PA 2RJDA 4QQ6A 5DYCA 4XUBA 3GOXA 1XNIA 5DFCA 5FE2A 5FBXA 4IR4A 2F5KA 3MP6A 5C6SA 4PLLA 5CUGA 3H6ZA 4UYDA 4WIVA 2L84A 2WP1A 1SSFA 4UIWA 5CPEA 3LH0A 3DAIA 2OUOA 2CKKA 2WACA 4NR9A 5H1VA 4A4HA 5E9VA 2L5EA 4Z1SA 3JVKA 2NLUA 3OS1A 4J3IA 2RO1A 3FC3A 4NRAA 2R5AA 4HBWA 3LGLA 4QSVA 5KE3A 3OYKA 5H1TA 3L2RA 4O7CA 5A81A 3P1DA 3AQAA 5ENHA 4YC9A 3MP8A 4BJXA 3OYIA 4YAXA 3I3JA 5HQ5A 3M9QA 5DW2A 2DKWA 2I7KA 2B8AA 5F62A 2G4AA 4IUPA 4A9EA 5DYAA 4QC1A 4QSWA 3S3MA 4LD6A 4N4IA 3P1CA 4CUQA 2E6NA 5E0RA 5FROA 4QSUA 5LJ2A 3QBYA 2RJEA 4B9WA 3HMEA 4XY9A 4YBSA 5G4SA 4C67A 2RNYA 5II1A 4CUUA 3CEYA 5FFYA 5CQ7A 5HEMA 5LKUA 3E9FA 3O34A 2RS9B 2YRVA 4N4FA 2I8NA 3OYNA 5CZGA 2DIGA 2E7NA 4HXRA 5DLXA 2HQEA 5D3SA 4B9XA 3LLRA 5EQ1A 4NYWA 4FLPA 2DWWA 5KTUA 5L96A 1H3ZA 5C4QA 2E5QA 5EICA 4LYIA 3ZEHA 4IUQA 5AD3A 4MR5A 5ENJA 5COIA 4QEVA 3OYBA 4QYDA 5A5QA 2L8DA 2RHXA 5ENFA 4IUTA 4MENA 5FH7A 2LDMA 5A7CA 5HQ6A 5ACYA 4O75A 4TTEA 5F60A 5CFWA 5C89A 3U5NA 3Q2EA 2GF7A 3DB4A 4LDFA 3LQJA 5EM3A 4A9MA 5CUDA 5KH6A 3JVJA 4CRIA 3QKJA 4QQGA 4UYGA 5D25A 3LQHA 4Z93A 1OI1A 4NR7A 4NUDA 4BHWA 4MR4A 4E96A 3S91A 5EWHA 5FFWA 2DIQA 4Q0OA 5D7XA 3HMHA 5D6YA 2QQRA 3U5LA 5CTLA 4QEWA 3DLMA 5EWVA 3UV4A 3HMFA 5M9OA 5HENA 3P1EA 5BT4A 4WHUA 5F36A 4QQDA 4PTBA 5CQ4A 3O35A 2OO1A 3PMTA 2EKOA 5AMFA 4PKLA 4J0SA 4IORA 5KU3A 4NYVA 5HLSA 4UIUA 5I83A 5E9YA 1OZ2A 4A4EA 5EP7A 4UYHA 4GY5A 2RJCA 5CQAA 2PQWA 4NS5A 5CUCA 3UV2A 4NUEA 5DKHA 4BACA 3OB9A 4QR5A 3OY9A 4PS5A 4QZSA 5ENBA 4HXMA 2EFIA 2RNXA 1JSPB 5KTWA 2D9EA 3S3OA 4A9JA 5E74A 5FH8A 2K3XA 5H85A 3QJ6A 5CQTA 3QIIA 5F1HA 3OYFA 4J1PA 5C87A 2X4XA 4TU6A 5FB0A 3OQ5A 4NQNA 5TB6A 4QR3A 4AKNA 5HFRA 4OGIA 5EPSA 4UIZA 5KCHA 2BKDN 2X4WA 2R57A 4E7KA 5FE9A 4E7IA 5A82A 5F63A 4A4GA 2WP2A 4UYFB 4YYKA 2R0SA 4QEUA 4NQMA 4YY6A 3ME9A 3NXBA 2BUDA 5A5OA 2M16A 3ASKA 3ZYUA 2FHDA 2LSPB 2X4YA 2D82A 3L2VA 4YK0A 5CUEA 5FE3A 2RI7A 5L97A 5CP5A 5HCLA 5ENIA 5C85A 2MWOA 3EAEA 5J39A 3MEWA 5CQ6A 5F5ZA 3RCWA 5LKXA 5FRNA 2R5MA 5HJCA 5F3AA 4QSSA 4LZSA 4CFKA 3L2WA 4BDZA 5EWDA 3NTHA 5CU8A 2QQSA 3OYEA 4A9FA 3DB3A 5LVRA 5D3PA 3O33A 3LYIA 2H60A 3JVLA 5E9MA 4YYDA 1RI0A 3MULA 2GRCA 1X0JA 5HQ7A 5L98A 1N72A 4Q0NA 3NTIA 4IOOA 5D3LA 4O72A 5HM0A 2X35A 4BD3A 5II2A 5EPBA 5DYUA 4MEQA 3U5JA 5FE5A 2YEMA 3UVDA 2EQJA 5D3NA 4A9LA 4HBXA 5FG6A 4A9IA 5I86A 5KCOA 4QBMA 5IAYA 4IR3A 2RHIA 1G5VA 5DFDA 5AD2A 4Z02A 4ZQLA 4O7BA 3U5KA 2LRQA 2M1HA 3OYHA 3Q1JA 4UIXA 2RI2A 4O70A 5CUBA 2RNWA 3U5OA 5FE8A 2GFUA 2IG0A 3LXJA 4CURA 2HQXA 5EWWA 3L2QA 5D26A 5IBNA 5ENCA 4BE1A 4YBTA 4HXPA 5CQ3A 5CGPA 4TYLA 4HXNA 4NYXA 4BW3A 4L59A 4OUFA 3UVWA 4TT2A 5D6XA 2DVVA 4IOQA 4PL6A 4BE0A 2GFAA 4Q5WA 4TQNA 2YYNA 4BW2A 3F70A 3P8DA 5F61A 3K2JA 4KV1A 1F68A 5CIUA 4NRCA 5I88A 4E7HA 4YH4A 4E7JA 5LJ0A 5FE1A 4OGJA 4QVZA 2R10A 1WUGA 4ALHA 3PFSA 5BT3A 4LYSA 2LTOA 2MWPA 3OA6A 3MB3A 4IUVA 2YEKA 3BDLA 5HRWA 4NUCA 1N27A 4BE2A 3FKMX 5I1QA 4IR6A 5EA1A 5HFQA 3OMCA 2O4XA 4Z6IA 4ZC9A 5E9KA 5HRVA 5E3GA 5EPRA 5C7NA 4YY4A 5E9LA 5FE6A 5FDZA 5CQ5A 3PNWC 3OYGA 5L8UA 4BDYA 2F6NA 5A83A 1KHCA 4KCXA 4Y03A 4XUAA 3MP1A 4QUTA 2L85A 2EQKA 3META 5LKZA 1WUMA 4IR5A 5CQ8A 4QYLA 3E9GA 2D9TA 3DWYA 4UC4A 2YW5A 4A9KA 5FRMA 3OYDA 3OS0A 2KTBB 2DVRA 2RHZA 5FH6A 3MQMA 4HCZA 5FE4A 4X34A 4IKFA 5K29A 5FG5A 4YYHA 4A9OA 3L2UA 4N4HA 4CLBA 1OYXA 3MEVA 4RVRA 4LR6A 4UIYA 2XK0A 5A5NA 3FDRA 2YQDA 3KUFA 2YDWA 3QZVA 3SD4A 4QNSA 1WJSA 4LZRA 4LC2A 4FU6A 5I29A 2F6JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZW1A 4BI3A 3CXCA 2QYZA 3MUKA 2CP7A 4QSPA 4RTXA 2DERA 1YJWQ 2EYXA 4TS8A 4C8QC 3AADA 3L42A 4DOVA 5FU7B 5GAOr 4QSRA 4JLIA 1JEGA 5D3JA 1MNDA 1YI2A 4GPJA 4X2IA 3CC7T 3MEAA 3EFRA 5GAOm 2JMAA 5D24A 4TU4A 2AT1B 3THKA 4C92A 1YIJQ 5GAN5 1XJWB 2CP3A 3QDFA 2OTJA 4BUGA 1AWWA 4C0ZA 1WHHA 1XTDA 2H3JA 1GXIE 3SVHA 4O74A 3CBOA 1GRIA 5LJ1A 4AI6A 2K79A 4CL9A 5KO4A 3BDUA 2BZXA 1VQNT 5GMKe 2DL5A 2EIFA 1IGQA 2RHUA 5TCMA 3I55Q 2E6ZA 3JCMf 2RPNA 4WCIA 5A85A 2RFJA 3GNGA 4NR5A 2DPPB 1M90R 5KYWB 1KFZA 1D3BA 1VQMA 5CS8A 4LE9A 4Z89A 5EISA 3DLLA 3TU4K 2DATA 3UWNA 1A0NB 3G0JA 2F1LA 1VQKA 2ZPGB 1O9SA 4MEPA 3P8BB 3FLGA 5FFVA 5KTXA 2ZAEA 2QEXT 3EG3A 5JWMA 5A5PA 3LX7A 1ZBJA 4Y91A 2M0YA 2VYTA 4UITA 2RJFA 3CD6T 4M75B 2M9UA 3SWNA 2DVJA 3M0UA 1ZSGA 3CCST 3VS3A 4O77A 3MB4A 1GBRA 1JXOA 2YELA 2PVGB 2EGAA 2LT1A 4GLMA 3I9QA 1NLOC 1ABQA 5CCAA 6AT1B 3I5RA 3A5ZB 1D0ZA 4NR4A 1Y57A 3CC7A 3JCMJ 2Z0WA 4LDWA 3EH1A 4RCCA 3Q2FA 5E3DA 5CQXA 4AT1B 4M7AA 1BCMA 3M0PA 2E65A 3HKSA 2KSSA 4EMHA 4E7LA 1ZUUA 3OMGA 5F2PA 5DLZA 1BK2A 2GBQA 2QA4T 5J0DA 1YHQQ 1R77A 4YBMA 4A9NA 3QDRB 3HFOA 1WJQA 4M7DB 1VQ8A 2DVQA 1RADB 2LX7A 5DKDA 5DKCA 1VQ5Q 2DZ9A 2EYYA 2KE9A 3EGXB 3CCQQ 2CH4A 5LKTA 4MR6A 1SHGA 3SHWA 1JBMA 4Z6HA 4MZTA 4O71A 3CMAT 5DBMA 4LZ2A 5DYXA 2OSSA 4VUBA 3UF4A 5I80A 3OS2A 4ALGA 5L99A 5JI8A 1AD5A 4HCCA 4R0KA 4MMKA 1ACMB 1QVFP 1S72A 5GAN7 2KDSA 2HSEB 3SB2A 1M1GA 2GCXA 1SSHA 2X9HA 5I2MA 1HJDA 1M8MA 4N0AC 4QQ6A 2QEXA 2E10A 5KYUB 4XUBA 5FBXA 2ZPEB 4PLLA 4EMKB 3H6ZA 4WIVA 2L84A 2WP1A 5GJVB 1ZX6A 2AK5A 3DAIA 5GAOq 5LJ5h 4NR9A 5H1VA 5E9VA 3JVKA 1MUZA 3GNFB 4AMCA 4ZN3A 1Y7XA 4NRAA 3EFSA 2HDAA 3L2RA 3PVQA 1QVPA 4O7CA 3X28B 4RTVA 5IHNA 5ENHA 4YC9A 2ENMA 3M9QA 5DW2A 2DKWA 2I7KA 2EJFA 2G4AA 2XI9A 2D0NA 4F04B 2ZPHB 2QA4A 3VKIA 2MK5A 4N4IA 3P1CA 2E6NA 5E0RA 2P4TA 5FROA 5LJ3g 3J80E 3QBYA 2NUZA 5FWBA 2VXFA 2VWFA 2HBWA 4C67A 2RNYA 5II1A 3CEYA 1ZLMA 1PWTA 2QGFB 1IREB 2JOYA 2I8NA 3OYNA 5CZGA 1E6GA 1K8AC 3A8MB 5GAOp 1D0XA 5D3SA 4J9CA 4C92B 1WZOA 4FLPA 2CT3A 2C0IA 2ZPFB 3VYGA 5COIA 4MR5A 5ENJA 2DXBA 3GF5A 2CS7A 4A4KA 4QYDA 2KBTA 3VKGA 3VS0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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