4NS5A

Crystal structure of human bs69 bromo-zinc finger-pwwp
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
209
structure length
185
Chain Sequence
QEMGTYLRFIVSRMKEVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNIHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human BS69 Bromo-ZnF-PWWP reveals its role in H3K36me3 nucleosome binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
molecule tags Transcription regulator
source organism Homo sapiens
total genus 66
structure length 185
sequence length 209
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ns5A01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4ns5A02
2L5EA 2L84A 5CQAA 3IU6A 4PCEA 4A9JA 4A9IA 3OS1A 3H6ZA 3LLRA 4TT4A 5HCLA 5FE1A 4TZ2A 2GRCA 4QYLA 2R0VA 3IU5A 4O72A 5CQ8A 2D9TA 2E5QA 3S3MA 3O35A 2L89A 2R5AA 4BE2A 3U5MA 2K3YA 5D3PA 4QY4A 2BKDN 5EK9A 5FH6A 3SVFA 4PS5A 3NTKA 3EAEA 4HXKA 4OVAA 1SSFA 4A4HA 3QKJA 5CUCA 4CUUA 4NXJA 5CZGA 5E9IA 5CQ7A 5D3RA 2RHYA 4N4GA 5C4QA 4QQ6A 4UC4A 3JVJA 4QR4A 4QZSA 4A9HA 2RJFA 5IGKA 1OYXA 5A5NA 2IG0A 4PLLA 5F62A 5LJ0A 2LDMA 1OZ2A 4Q5WA 4Z93A 2EFIA 5II2A 5I80A 3MEWA 5D6XA 3PNWC 4MENA 4PCIA 5DLZA 5ENHA 2FHDA 4IUPA 4UYFA 2XDPA 2OSSA 3L2WA 4MR6A 5LVQA 2H60A 2E3KA 4E7LA 3ONIA 4UIWA 4A9KA 2DIQA 3QZVA 4TYLA 5HRWA 3OB9A 5CQ5A 5DFBA 3OYDA 4Z1QA 4QC1A 4RVRA 3S6WA 4UYDA 1WJQA 4TT6A 4NR4A 5K29A 3O36A 5I7XA 4TZ8A 5FE4A 3MP8A 5CGPA 3OYBA 4CUTA 3DB4A 5ENBA 3ZYUA 2CKKA 1WUMA 3MEVA 5ENFA 5I83A 2NLUA 3OYNA 3QBYA 5CQ4A 3U5OA 4NR6A 4LYWA 4O7AA 5DKCA 5ENCA 2DVVA 5C89A 2QQRA 3MP6A 4DONA 3F70A 4XUAA 5EWVA 3LXJA 4CURA 4HBVA 5HM0A 4FU6A 5L99A 4II1A 2PQWA 4IUUA 5FRNA 2RHIA 5A7CA 2LRQA 3HMEA 3OYKA 5HENA 5C6SA 4A9EA 1WJSA 4CRIA 4YC9A 5CRMA 4NUEA 4WHUA 3Q1JA 5CQ6A 5DKHA 4LC2A 4N4FA 4XY9A 5DYAA 5FFVA 4CFKA 3S3NA 4HXOA 4KV4A 5IAYA 2OUOA 5DYXA 4QSQA 4QW2A 3META 4YBTA 3U5JA 4QSRA 5FFWA 4L59A 2LCCA 5HEMA 4HBXA 5D3NA 3O33A 2QQSA 4LDFA 2G3RA 3UWNA 3UVXA 4BW2A 4HXRA 5EICA 5A5PA 3MEAA 5CUGA 4YK0A 2I8NA 4BW1A 2YW5A 3AQAA 5LVRA 4IOQA 4PKLA 5KE2A 5CQ3A 5EPRA 5ACYA 5KTXA 3O37A 3GG3A 3MB4A 4A4EA 5FROA 5DFDA 5CQTA 4QSWA 4MR3A 4QSTA 4C5HA 1F68A 4IOOA 4A9LA 5L8UA 2NXBA 5F63A 5HFRA 2LSPB 1ZS5A 2RI7A 3OYCA 4YYJA 5FE2A 2X4XA 4MEQA 3OYIA 3LYIA 5C8GA 5IBNA 4CUQA 4BE0A 5HQ6A 4MR5A 5H1VA 5D3LA 5E3GA 2M0OA 4O78A 4BD3A 3JVMA 2EQJA 5A5RA 5DW1A 4QUUA 5A85A 4O70A 3OYAA 4YYIA 3DB3A 5JWMA 4Z6HA 5ENGA 4C5EA 2EQKA 4NUDA 4QC3A 5LKUA 5HJCA 2RFJA 4NRCA 4HXMA 4HXPA 4OUFA 1E6IA 4TTEA 4ALGA 4Q0OA 5EI4A 2RHZA 2E7NA 5H1UA 3NTIA 4IURA 3FKMX 5KHMA 5D3JA 3LJWA 5A5OA 5I29A 2L3RA 2RI3A 2JTFA 5LKXA 3M9QA 5DFCA 3P1EA 5EM3A 5IGLA 4QQGA 4A4FA 5I7YA 3DLMA 1KHCA 5AMFA 5ETBA 3C4SA 4XY8A 4YYNA 3P1DA 3MEUA 4QQDA 2RI2A 4UYFB 2GFUA 4QBMA 5J39A 5DKDA 2R5MA 1WJRA 5D6WA 4YATA 5HQ7A 4J0RA 3L2QA 2O4XA 2GF7A 2R0SA 5EGUA 2G4AA 5I88A 5F1HA 3S92A 4HXNA 5EV9A 5BT3A 5FE7A 4PTBA 5E9YA 3CEYA 5L8TA 3FLGA 3SVHA 3UVWA 4BE1A 5FE8A 4ZTFA 5EP7A 3MO8A 2VYTA 5FE3A 4PLIA 5D24A 2X4WA 5EWCA 2RNWA 4UIUA 5CS8A 4RG2A 3E9FA 4PL6A 2HQXA 4B9WA 4ZTJA 4YY4A 5F25A 5AD2A 4NR8A 5HQ5A 5H1TA 4CL9A 4NR7A 3BDLA 2YQDA 1WGSA 2RHXA 3OS2A 5FB0A 4QR3A 4LRGA 4ZW1A 2KTBB 5FBXA 5DYUA 2RO0A 2E6NA 3OMGA 4BDZA 2K3XA 4ZQLA 5KTWA 4UYEA 3PMTA 4LYSA 4QUTA 4XUBA 1MHNA 1EQFA 5H85A 5F1LA 3UV2A 4TU4A 5EQ1A 2DAQA 5HRVA 5CIUA 1JM4B 5IIDA 5TCMA 2JZ2A 5KCHA 3MULA 4MR4A 4O74A 5FRMA 2R10A 5EISA 4YADA 2L8DA 4QB3A 5E74A 3L2VA 4A9NA 2LVMA 5E9KA 2RJCA 4YY6A 5J26A 4E7HA 5E3DA 2E7OA 4O7CA 5L98A 5L97A 4Z02A 5AD3A 4ZC9A 2DATA 5FB1A 5CU8A 3QIIA 2B8AA 3PFSA 5M9OA 4C66A 4GY5A 5LUUA 5FE5A 4A9OA 5COIA 3SD4A 2OO1A 4FL6A 5F5ZA 4BACA 4XYAA 3UW9A 5IN1A 4QSUA 1OZ3A 2EQUA 5CUBA 5EU1A 5D3TA 5HLSA 5BT5A 5KCOA 3FC3A 5KO4A 3UV4A 5I40A 3OYEA 3Q2FA 4YYMA 5TB6A 4Z1SA 5CTLA 4YBMA 5FG6A 3MUKA 2WP2A 4QVZA 4IR4A 4NRBA 5G4SA 5LJ1A 3P8HA 4TT2A 3LQIA 4WIVA 4IORA 4QYDA 2D82A 4QSXA 5KE3A 4UIZA 3L42A 4HBYA 2DVRA 4N3WA 4YYGA 1OI1A 5EPSA 3H8ZA 2YDWA 4CUPA 2MJVB 4HBWA 5II1A 2F6JA 4Z6IA 2X4YA 5KTUA 5FFYA 5ETDA 5FE6A 5FG4A 4E96A 3U5PA 4IR3A 3E9GA 2GFAA 5DW2A 2YYNA 3OYHA 3U5KA 2M1HA 3Q2EA 2EQMA 3LQJA 4O76A 3LGLA 4N4IA 4QR5A 4BJXA 5D0CA 3UVYA 5CPEA 4C5GA 5DX4A 4QSPA 4QSVA 4PY6A 5EWWA 5DYCA 4A4GA 4C5IA 2R58A 5EVAA 3L2UA 2YEMA 4X34A 4LZ2A 4CUSA 2O4XB 3HMHA 4LZSA 5A82A 3NTHA 3ZEHA 2YEKA 3OMCA 5E73A 4O75A 4A9MA 2RNXA 3DWYA 2DKWA 4BW4A 3UV5A 1G5VA 2YELA 2R57A 4E7KA 5EPBA 5LJ2A 2RJEA 3P5OA 4YH3A 4J3IA 5EA1A 2F5KA 5FH7A 5ENIA 4O7BA 4NS5A 4YAXA 4YABA 2X35A 3FDRA 1JSPB 2BUDA 2MWOA 5FG5A 3L2RA 2N9GA 5J0DA 5E7DA 5E9VA 3OQ5A 4OGJA 5F2PA 4LD6A 5E9LA 3MB3A 4YYKA 2DVSA 2RJDA 5A5QA 5E9MA 4Q0NA 3S91A 3JVKA 3FEOA 5D3SA 5CUDA 4O7EA 2L85A 2FSAA 4UITA 5KH6A 1X0JA 4TS8A 3OYGA 3DAIA 5KU3A 4F3IA 3P8DA 4FLPA 4GPJA 5LKTA 3QJ6A 5A81A 5A83A 4J1PA 5CRZA 5CUAA 3OYMA 4IR6A 3GOXA 3PMIA 4LZRA 5DY7A 2YRVA 3I3JA 3OYJA 3TLPA 5F60A 4KV1A 4TQNA 2XK0A 4BW3A 5CP5A 4J0SA 2WP1A 5G4RA 3S3OA 5I1QA 4IUTA 5FE9A 2RS9B 1XNIA 3ME9A 2WACA 3P1CA 1N72A 3KUFA 5C85A 4BDYA 5D26A 5AMEA 4A9FA 4QNSA 4WHWA 4AKNA 3HMFA 5I86A 4QEUA 5DBMA 2DVQA 3MP1A 3OYLA 4NR5A 5EWDA 3OS0A 5CY9A 3OA6A 4NR9A 5IGNA 4HXSA 5BT4A 2RHUA 4N4HA 4UYHA 1WUGA 4HXLA 4O77A 5EWHA 3MQMA 4LYIA 4QEWA 5ENEA 4C67A 4B9XA 4NQNA 2F6NA 5F3AA 4X2IA 4UIVA 4NUCA 3G0LA 5C0MA 4NQMA 2RNYA 3NXBA 4O71A 4HCZA 5LKZA 5HFQA 5CFWA 5FDZA 3O8VA 3RCWA 4BHWA 3QZTA 4CFLA 2BIVA 5A5SA 5ENJA 2P0KA 2MWPA 3U5LA 4NYXA 4UYGA 4YYHA 2EKOA 2DWWA 5D25A 5F61A 4KCXA 4MEOA 4IKFA 4QSSA 4QEVA 4UIYA 3O34A 4O7FA 4TU6A 5DLXA 3UT1A 5I89A 4ALHA 3QZSA 4NRAA 5D7XA 4EDUA 3JVLA 4Y03A 4IR5A 3SVGA 2RO1A 3MXFA 2RI5A 5HELA 2I7KA 4NYWA 2M16A 4CLBA 5FE0A 3G0JA 4E7JA 3P1FA 5FH8A 5IGMA 2HQEA 2R0YA 4YH4A 5D6YA 2DIGA 4OGIA 3ASKA 4YYDA 4NYVA 5C7NA 5F36A 4UIXA 3LH0A 5L96A 5D3HA 4E7IA 1N27A 4MEPA 4YBSA 5IG6A 3K2JA 3UVDA 5HRXA 3LGFA 3U5NA 2LTOA 1RI0A 5CUEA 4IUVA 3OYFA 1H3ZA 2D9EA 3D7CA 5C87A 5JI8A 3LQHA 3OY9A 4IUQA 3AADA 3LX7A 4LR6A 5E0RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2L84A 3IU6A 1VQ9Q 3CCSQ 1VQKT 3OS1A 3H6ZA 4TT4A 5HCLA 4TZ2A 2GRCA 2E5QA 4O72A 1GCQC 1M1GA 2L89A 2DA9A 2PVGB 3OW2S 1C1AA 2K3YA 5D3PA 4QY4A 4DBRA 1OULA 2V8JA 2GBQA 4OVAA 3V7RA 1FXXA 3QSUA 2A08A 4NXJA 4XU2A 4N4GA 3CCVQ 2LC4A 4Y28E 1ZHIA 2IG0A 2JTEA 5LJ0A 4M78C 4Z93A 5II2A 2JM9A 3MEWA 1I0CA 5DLZA 3JSCA 3G6EQ 5DLQE 2OSSA 1M1FA 5LVQA 2H60A 1VQPQ 3G7ZA 3QDFA 3SWNB 1S72Q 4A9KA 2CZ0B 5DFBA 3OYDA 4Z1QA 1UDLA 2EYYA 4UYDA 1WJQA 3CPFA 1VQ5A 5K29A 4TZ8A 2RN8A 4RTXA 4CUTA 3X24B 1PHTA 1BIBA 4E6RA 2YUQA 1OX9A 4LD9K 1UEBA 1HXDA 5LJ5d 3M57A 5DKCA 5ENCA 4DONA 3I55A 3EG2A 4N0AC 4HBVA 2GTOA 2LMJA 2RHIA 1LJOA 1YWOA 1SPKA 4A9EA 4CRIA 3HFNA 5GANe 5I22A 3S3NA 4ANJA 5DYAA 1AHJB 2HBPA 4HCKA 2FZGB 4KV4A 1UB4A 1UJ0A 2JW4A 5DYXA 1PRLC 3THKA 4QW2A 2KBTA 3KFVA 3CC4T 3JCMJ 4YBTA 5FFWA 4J7FA 1H641 4M75E 1SF9A 3OSSC 5HEMA 4KUIA 1WDXA 1YITQ 3CXCA 4JS5A 3UWNA 5GANf 1AVZC 4M7AB 3J81E 3BFMA 4M78G 3PVLA 2EAYA 4AFZC 4OMQA 2I8NA 1N5ZA 3AQAA 5LVRA 2CZ6B 3TCJA 3CCRA 4A4EA 1AWWA 1Q95G 5FU6C 2F69A 4C5HA 3JCMb 4IOOA 1M8MA 5L8UA 3NMZC 3CXCS 2RI7A 3EFOB 5FE2A 3A8OB 2X4XA 4JS4A 5LL6S 1VQ6A 2IPOB 5I2MA 4E7SA 3FJ5A 3RUXA 4BE0A 4MR5A 2FG0A 5E3GA 2M0OA 4O78A 5DW1A 4QUUA 5A85A 1AD5A 1FWZA 5GAOp 3OYAA 4MMLA 1VIEA 3IQLA 5ENGA 3M55A 4NUDA 4PFZA 2RF0A 2DXCA 4NRCA 4HXMA 4HXPA 3VKHA 6AT1B 4Q0OA 3BE3A 2EYWA 3NTIA 2YT6A 1ABOA 4M77E 4XTUA 1VQMT 5A5OA 5HKCA 2OAUA 5LKXA 3M9QA 5DFCA 5IGLA 3JAME 2AKKA 2DEUA 1KHCA 1VQKQ 2QDYB 5AMFA 5ETBA 4MMKA 2HL5C 3P1DA 2RI2A 1PUOA 2MAMA 2Y4YA 1DJ7B 4CI0C 2R5MA 4HCBA 5D6WA 4YATA 2R0SA 1M30A 2RH2A 2CP2A 1BCOA 8AT1B 1X2KA 1RADB 1WYXA 3M5AA 5GAOr 5GAOl 1YI2A 2F2VA 2NWMA 4BE1A 4FSSA 8ATCB 4DA4A 5D24A 5EWCA 1UTIA 2A28A 2P4RA 4PL6A 2HQXA 1M9SA 4YY4A 4GLKA 4MDXA 5HQ5A 2FPDA 1KD1R 3CC7A 4NR7A 2XIDA 3BDLA 2YQDA 4BI3A 3OS2A 3QZ5B 4AKGA 2GQVA 5DYUA 3NGPA 2HSEB 1NE8A 3OMGA 3VUZA 1Q86C 4UYEA 4ZN1A 4QUTA 1MHNA 2HNIA 1V29B 2HL3A 2CH4A 2HCKA 1Q86U 1TUDA 4FYWB 1UUEA 1RAHB 1WHMA 5LJ3d 1X69A 2R10A 2EW3A 4RKUE 5E74A 4C0DB 1YJNT 2RK2A 5GAN3 2E7OA 1VQ6T 5CKEA 4DEXA 2K5LA 2DX1A 5L98A 4C92A 2DATA 4EIKA 2AKLA 1M3AA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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