4NS5A

Crystal structure of human bs69 bromo-zinc finger-pwwp
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
209
structure length
185
Chain Sequence
QEMGTYLRFIVSRMKEVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNIHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transcription regulator
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of human BS69 Bromo-ZnF-PWWP reveals its role in H3K36me3 nucleosome binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
total genus 66
structure length 185
sequence length 209
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ns5A01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4ns5A02
5IBNA 5D3LA 3U5PA 2MJVB 4ZQLA 5FB0A 3LGLA 4A9FA 5DFBA 4QR3A 3U5LA 5L96A 5EQ1A 3ZEHA 3MEAA 2RI2A 5FG5A 4IURA 2L3RA 3PNWC 3P8DA 3OY9A 5C8GA 4YYJA 2KTBB 3DWYA 2R0SA 4HBWA 5TB6A 5D3RA 4O76A 5DYXA 2G4AA 5HLSA 3Q2EA 4HXPA 3OS1A 4MR6A 1X0JA 2L5EA 4J1PA 2EQKA 3OYHA 5EPSA 4KV4A 5A5RA 3S92A 3AQAA 5D3TA 5C85A 4PCIA 4HXOA 2JTFA 4BW1A 4UIVA 5L99A 5FE9A 4C5IA 4IUVA 5F1HA 5I86A 3UVYA 4QZSA 5A5NA 5FFVA 4Q0OA 2B8AA 4N4HA 3SD4A 4A4FA 2R5MA 3OYGA 3SVHA 5ENHA 1E6IA 3O33A 4IR3A 5CQ6A 3UVDA 1WGSA 1OI1A 4O7FA 3JVMA 3OYIA 3S3OA 3G0JA 5CP5A 4IOOA 5EPBA 2G3RA 2M1HA 5FG6A 4B9WA 4QB3A 4NUDA 2F6JA 3MB4A 4A9MA 2GRCA 3FLGA 4BE2A 3OYDA 5A82A 2XK0A 3E9GA 4XY8A 2HQXA 1MHNA 2H60A 4UYDA 5A7CA 2XDPA 4II1A 5EI4A 5ENGA 2DVRA 4NR6A 2DVSA 5D25A 5HELA 2D9EA 5FE7A 5CQTA 4XUAA 5I89A 3KUFA 3LX7A 5L8UA 4E7HA 4TQNA 5FE8A 4Z1SA 1N72A 5F25A 5FFYA 5L97A 4PS5A 5D3PA 5A81A 4RVRA 4YABA 2BKDN 4O74A 4NS5A 4BJXA 4CUSA 5KTXA 3OS2A 5HQ7A 5DKDA 1WUGA 2WP2A 4TT4A 3UWNA 5KTWA 1OYXA 3O8VA 3LQJA 2YRVA 5EGUA 4YYNA 5CY9A 4NYVA 5CUEA 5F36A 5DLZA 2QQSA 4BW2A 5M9OA 4LZRA 5FDZA 5I40A 2GF7A 3OMCA 4LR6A 3LJWA 2YQDA 5A83A 4A9HA 4YADA 5I83A 3MP8A 4E96A 4Q0NA 3OB9A 3OYAA 3EAEA 3OA6A 4MR5A 5E7DA 4N4IA 5FH8A 4QSVA 4YYIA 2RNWA 5HRXA 5CQ8A 4YBMA 5FE3A 5ENIA 5FE6A 5IGKA 2M0OA 4NR7A 2RO1A 5EP7A 2WP1A 4QYDA 4NQNA 4YYKA 4A4GA 4MEQA 5EU1A 4HXNA 5CFWA 3ME9A 4UYEA 5A5SA 5J0DA 3MO8A 4HXRA 2RJDA 3H6ZA 4QQGA 2WACA 4KV1A 4LYWA 4HXKA 2L89A 4IKFA 3UT1A 5D6XA 3QIIA 2HQEA 5C0MA 4QR4A 3L2QA 3O36A 2EFIA 4QSTA 4IUPA 5D3JA 4YYMA 4BD3A 5EWVA 1G5VA 4ALGA 2F5KA 5F2PA 3O37A 3UV2A 2DATA 2RFJA 5E9LA 4NRBA 4UYFB 2GFUA 2RHIA 3LYIA 4BE1A 4Z93A 2VYTA 4Z1QA 5BT3A 3P1CA 4QUUA 4UC4A 4QSPA 3LQHA 4XYAA 5DKCA 2F6NA 4CRIA 3P1DA 4LRGA 4UIXA 4NYXA 5IGMA 3FC3A 5I7XA 5JI8A 4TU4A 2E5QA 4CUTA 4CUPA 5KH6A 4IR5A 5E9VA 4QQDA 4QY4A 5G4SA 4C66A 5ENBA 3QZVA 4UYHA 5EVAA 3P8HA 2RHXA 3QZTA 5IGNA 4E7LA 3OYCA 4O7BA 4OVAA 4A4HA 4Z6HA 5EK9A 4A9NA 3S91A 5IN1A 5DW1A 4QSWA 5EA1A 4C5EA 5KE2A 2BUDA 2N9GA 4LYSA 4ZTFA 5FE0A 4QSXA 4TYLA 2E7OA 4Y03A 4A9EA 5KO4A 4BE0A 2R0YA 5FG4A 4YBSA 3L2VA 4YY4A 3S3MA 4LZ2A 5C89A 3L2UA 4A9IA 4QC1A 3PFSA 4YAXA 4ALHA 4MENA 5LKXA 5LKZA 4PKLA 5EM3A 4CUQA 5LJ1A 2L8DA 3O34A 5CRMA 4OUFA 5CQ5A 5ENJA 5I1QA 4X34A 3C4SA 3LGFA 4NQMA 3NTKA 3GOXA 5H1VA 2LCCA 2L84A 3P1EA 4IR4A 1WUMA 3FKMX 4LDFA 5EPRA 4YYDA 2DIGA 3QJ6A 3QBYA 3MULA 4WHWA 3IU5A 4AKNA 3MUKA 5KHMA 5E73A 4E7IA 3UVWA 2LTOA 4QEVA 5TCMA 2GFAA 3S3NA 4LD6A 5II2A 3OYMA 5D7XA 2NXBA 3MB3A 4WHUA 5LKUA 1WJSA 2M16A 4QR5A 5D6YA 4NUEA 2RI3A 4QSQA 5CUGA 3OQ5A 2YELA 5EISA 4ZC9A 3OYFA 4L59A 2YEMA 4CUUA 3LH0A 4ZTJA 4YH3A 4IOQA 3ONIA 3JVLA 3MP6A 5FE5A 4CLBA 1WJQA 3L2WA 5C4QA 4HBYA 3ASKA 4UITA 5FBXA 4J0RA 1XNIA 2X4YA 5HQ5A 4RG2A 5FE4A 2YYNA 3U5OA 2I8NA 4PCEA 2DWWA 5LJ0A 2R5AA 2DVVA 5COIA 2OSSA 5FH7A 5EWDA 5H85A 5KU3A 2BIVA 2FHDA 4IUTA 4C5GA 5L8TA 4HBXA 4TT2A 5D24A 4TZ2A 5IIDA 4C5HA 3QKJA 2MWPA 5ETBA 5HRWA 4BACA 5FRNA 4MEOA 4FL6A 3D7CA 5F60A 4TS8A 4OGIA 4YBTA 2P0KA 5C6SA 5CQAA 5HENA 5C87A 3OMGA 3QZSA 2RHZA 5E9MA 3DB3A 4QW2A 4O75A 5D6WA 4NUCA 5ACYA 5DFCA 4DONA 4PL6A 4J3IA 5CUDA 5G4RA 2EQJA 4YATA 4OGJA 4UIUA 1RI0A 3IU6A 3HMEA 2EQUA 5DLXA 5D3SA 3UV5A 1EQFA 5CUCA 1N27A 2RHUA 4J0SA 3FEOA 5IAYA 5F1LA 4LZSA 4YYHA 5KCOA 3NTHA 5AMEA 5HRVA 3G0LA 2D82A 4TU6A 5AMFA 4TT6A 5FFWA 5HFQA 2RI7A 4KCXA 4QEWA 3MEVA 3I3JA 5DYCA 5FROA 5DW2A 2DIQA 2RI5A 5CQ7A 3SVGA 5DY7A 5FRMA 4E7KA 4MR4A 2X4XA 4O77A 1F68A 5BT4A 5E3GA 2OO1A 5ETDA 2EQMA 3S6WA 4O7CA 2RS9B 3OS0A 2RJCA 4O71A 2RNYA 1WJRA 5F3AA 5LVRA 4UIWA 2RJEA 4B9XA 4YK0A 3MP1A 5IGLA 4O7EA 2DAQA 5EWWA 4PLIA 4QC3A 4QYLA 5H1TA 5FH6A 5EV9A 3HMFA 5DX4A 2DVQA 3U5NA 5CUAA 4UYGA 5D3HA 5E3DA 3U5KA 4CFKA 5JWMA 4QSSA 5DBMA 5L98A 5A5QA 2R10A 5A5PA 5EICA 5CGPA 2YDWA 2LRQA 2RHYA 3LLRA 1OZ3A 4A9JA 2O4XA 4Q5WA 5KTUA 5K29A 4BW4A 5HFRA 4CL9A 2LDMA 4ZW1A 2K3YA 1OZ2A 4IORA 2R57A 5E9IA 4MEPA 5II1A 5LKTA 2O4XB 5IG6A 3OYNA 5EWCA 5LJ2A 5HEMA 4TTEA 4QBMA 3FDRA 5CU8A 5HQ6A 4LYIA 2CKKA 3RCWA 3GG3A 3DB4A 4O70A 5CPEA 3F70A 4YH4A 4NRAA 5E9YA 4XUBA 3LQIA 4UIYA 3NTIA 3UVXA 4F3IA 3NXBA 2LSPB 5I29A 3O35A 3MXFA 4QVZA 5KE3A 4A4EA 2RNXA 3ZYUA 4YYGA 3JVKA 3OYBA 1ZS5A 3OYLA 3P1FA 4CFLA 4QSRA 4WIVA 4NR4A 2D9TA 2R58A 2R0VA 3H8ZA 2X35A 5KCHA 2YW5A 5HCLA 4GY5A 5DFDA 4X2IA 4N3WA 4GPJA 4NXJA 4IR6A 4N4GA 3L42A 5CQ3A 2I7KA 4O7AA 5BT5A 4A9KA 2MWOA 4N4FA 2RO0A 4Z02A 4BW3A 4QUTA 2RJFA 5AD2A 3PMTA 5FE2A 4A9LA 5ENFA 4CURA 5HJCA 3Q1JA 5C7NA 2L85A 5ENCA 5AD3A 2E7NA 5F61A 4O78A 5CS8A 5I7YA 1SSFA 4NYWA 5FB1A 3MEUA 5A5OA 5EWHA 4HBVA 5FE1A 5A85A 2QQRA 5I80A 4HXLA 4XY9A 2IG0A 3BDLA 5I88A 5H1UA 4O72A 3DAIA 4E7JA 4BDYA 4PLLA 4NR9A 2FSAA 2JZ2A 4LC2A 4YY6A 4Z6IA 1H3ZA 4HXMA 2EKOA 4IUQA 5CUBA 5D26A 3LXJA 3META 3P5OA 3Q2FA 3UW9A 5LUUA 5J26A 5J39A 5CRZA 4QQ6A 4FU6A 3OYEA 3JVJA 5D0CA 2E6NA 5E9KA 5ENEA 1JSPB 3MEWA 3PMIA 3L2RA 5LVQA 4MR3A 5F62A 4YC9A 4PY6A 3AADA 3CEYA 3M9QA 2DKWA 5CQ4A 5CIUA 3TLPA 5DKHA 4NR5A 4QEUA 5DYAA 4EDUA 2X4WA 4QNSA 3OYKA 4FLPA 5HM0A 2YEKA 5E0RA 3K2JA 5E74A 5F63A 4C67A 5CTLA 2OUOA 3HMHA 4BHWA 4BDZA 4NR8A 4HCZA 3E9FA 2K3XA 1JM4B 2E3KA 3OYJA 4QSUA 1KHCA 2LVMA 4IUUA 3MQMA 5D3NA 4PTBA 4UIZA 3DLMA 4TZ8A 4A9OA 3U5JA 5CZGA 5DYUA 2NLUA 4UYFA 2PQWA 3U5MA 3SVFA 5F5ZA 4NRCA 4HXSA 3UV4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IBNA 1KQ1A 5D3LA 4ZQLA 2DBKA 2IVWA 4QR3A 2A7YA 3GNFB 4DBFA 1BKBA 3VYHB 1R0BG 1T3LA 3J80E 1YITQ 3HSBA 2RI2A 1BI3A 5FG5A 3PNWC 3P8DA 1YJWQ 2F5TX 5CQXA 3SDZA 1H8KA 5TB6A 1NM7A 1Z9QA 3VUZA 2G4AA 5HLSA 4M75D 3OS1A 2L5EA 2EJFA 4GLKA 3JCMJ 5GAN7 4JJBA 4ELYC 3VKIA 5GANj 1U8RA 2K6DA 5I86A 3UVYA 2Y4XA 4QZSA 4ATOA 5GANe 5FU7C 1SSHA 3M5AA 3PGGA 2YRDA 2R5MA 4NL2A 4ORZA 4PJOF 3QJYA 1WGSA 3JVMA 3OYIA 5CP5A 2DRMA 3GBQA 1YJWA 2M1HA 1UHCA 4B9WA 1KC8C 4XTVA 2F6JA 3MB4A 5GMKj 4BE2A 3RERA 4XY8A 1YIJQ 1QQJA 5GJVB 5ENGA 3I5SA 2JS2A 3M55A 1YWPA 5D25A 2D9EA 2RQVA 1YHQA 1SHGA 2D6FA 4XUAA 3VS6A 2MI6A 1W1FA 1N72A 2KE9A 1GL5A 1WX6A 5GAMh 3EG9A 4BJXA 2JNGA 5HQ7A 5DKDA 1WUGA 5GAMg 2FZKB 1OYXA 3O8VA 2DL4A 5EGUA 1RL2A 4YYNA 4NYVA 4M75G 3JCMW 2E70A 2QQSA 4LZRA 5FDZA 5I40A 2KXDA 3H0HA 1YIJA 3LJWA 3CBPA 2FPDA 3V7RA 3X25B 3OB9A 2ABLA 5LJ3h 3EAEA 3OA6A 5IXBA 1NYFA 3CC2Q 4QSVA 5HRXA 2RNWA 2LX9A 4OMNA 5ENIA 1QCOA 4V2SA 5EP7A 4C8QA 2RF0A 2RQTA 4NQNA 4YYKA 1VQ4T 2CZ6B 5EU1A 3ME9A 5A5SA 1M3CA 1VQ5T 1V29B 1AEYA 2FYKA 2EYZA 5D6XA 4QR4A 3L2QA 4IUPA 5CVIA 3QUIA 1VQ8T 1G5VA 2K2MA 3G7ZA 2O9SA 2OTJA 4A63B 4J83A 4NRBA 4UYFB 1N8RC 5FU6B 2HZYA 2F69A 3P1CA 2L2PA 2G6FX 5DKCA 2CP2A 2OI3A 2EWNA 3P1DA 2JM8A 5I7XA 1UGVA 1M2VA 4CUPA 2XICA 2EYQA 1VQ6T 5E9VA 4E6RA 5LL6S 3A5ZB 4GBQA 3RKXA 3QZVA 4LNPA 5EVAA 3HRTA 2RHXA 5IGNA 1RACB 2JW4A 1AD5A 1PCXA 1MMAA 2CZ0B 1WI7A 2L0AA 2RA2A 4HKEA 4Z6HA 4D8DA 3S91A 5IN1A 5KE2A 4M78C 2BUDA 4KH1B 2F2XA 1QVFS 2MMPA 1X6BA 4AG2C 2E7OA 4Y03A 4A9EA 1VYTA 4KRTA 4LUDA 3CC4A 3L2VA 4YY4A 5GAMf 2JJ9A 3L2UA 3EG0A 1YNZA 3X26B 4ELZC 4CUQA 1VYVA 3O34A 5CRMA 2B86A 4OUFA 5ENJA 5I1QA 4X34A 1P92A 3GOXA 3HRUA 2LCCA 3P1EA 1I81A 4IR4A 2DEQA 1V76A 4FCYA 1FX7A 2LTOA 3I56T 2GFAA 3S3NA 1EIFA 4LD6A 1WZOA 2CP3A 1Q81U 2XHCA 3D1DA 2O31A 4O6JA 3QO3A 2KVQG 1H641 3HKSA 2RI3A 4JZ4A 4QSQA 1U5SA 5CUGA 3OYFA 5EISA 5KYUA 3P8BB 2KR3A 2JTEA 4CUUA 3LH0A 4ZTJA 3CCEQ 4IOQA 4R56A 3ONIA 3JV3A 4EPCA 1YCYA 4DOVA 3E1SA 4J7IA 3L2WA 1NE8A 3CD6A 3ASKA 2A36A 4MZPA 1WPYA 4J6WA 5IT9E 5LJ0A 2R5AA 2K4YA 1VQNT 2DERA 3TQ7P 5EWDA 4C92B 2FHDA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3OYK A;  4FLP A;  5HM0 A;  2YEK A;  5E0R A;  3K2J A;  5E74 A;  5F63 A;  4C67 A;  5CTL A;  2OUO A;  3HMH A;  4BHW A;  4BDZ A;  4NR8 A;  4HCZ A;  3E9F A;  2K3X A;  1JM4 B;  2E3K A;  3OYJ A;  4QSU A;  1KHC A;  2LVM A;  4IUU A;  3MQM A;  5D3N A;  4PTB A;  4UIZ A;  3DLM A;  4TZ8 A;  4A9O A;  3U5J A;  5CZG A;  5DYU A;  2NLU A;  4UYF A;  2PQW A;  3U5M A;  3SVF A;  5F5Z A;  4NRC A;  4HXS A;  3UV4 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 5IBN A;  1KQ1 A;  5D3L A;  4ZQL A;  2DBK A;  2IVW A;  4QR3 A;  2A7Y A;  3GNF B;  4DBF A;  1BKB A;  3VYH B;  1R0B G;  1T3L A;  3J80 E;  1YIT Q;  3HSB A;  2RI2 A;  1BI3 A;  5FG5 A;  3PNW C;  3P8D A;  1YJW Q;  2F5T X;  5CQX A;  3SDZ A;  1H8K A;  5TB6 A;  1NM7 A;  1Z9Q A;  3VUZ A;  2G4A A;  5HLS A;  4M75 D;  3OS1 A;  2L5E A;  2EJF A;  4GLK A;  3JCM J;  5GAN 7;  4JJB A;  4ELY C;  3VKI A;  5GAN j;  1U8R A;  2K6D A;  5I86 A;  3UVY A;  2Y4X A;  4QZS A;  4ATO A;  5GAN e;  5FU7 C;  1SSH A;  3M5A A;  3PGG A;  2YRD A;  2R5M A;  4NL2 A;  4ORZ A;  4PJO F;  3QJY A;  1WGS A;  3JVM A;  3OYI A;  5CP5 A;  2DRM A;  3GBQ A;  1YJW A;  2M1H A;  1UHC A;  4B9W A;  1KC8 C;  4XTV A;  2F6J A;  3MB4 A;  5GMK j;  4BE2 A;  3RER A;  4XY8 A;  1YIJ Q;  1QQJ A;  5GJV B;  5ENG A;  3I5S A;  2JS2 A;  3M55 A;  1YWP A;  5D25 A;  2D9E A;  2RQV A;  1YHQ A;  1SHG A;  2D6F A;  4XUA A;  3VS6 A;  2MI6 A;  1W1F A;  1N72 A;  2KE9 A;  1GL5 A;  1WX6 A;  5GAM h;  3EG9 A;  4BJX A;  2JNG A;  5HQ7 A;  5DKD A;  1WUG A;  5GAM g;  2FZK B;  1OYX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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