4NS5A

Crystal structure of human bs69 bromo-zinc finger-pwwp
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
209
structure length
185
Chain Sequence
QEMGTYLRFIVSRMKEVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNIHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human BS69 Bromo-ZnF-PWWP reveals its role in H3K36me3 nucleosome binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Homo sapiens
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
total genus 66
structure length 185
sequence length 209
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ns5A01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4ns5A02
5IGMA 4NYWA 5ENIA 5D25A 4O7AA 4C5EA 3L2VA 4XYAA 1N72A 4O78A 5FH6A 4YYGA 4A9HA 5DYCA 2DVQA 5ACYA 4CRIA 4NRCA 2X4WA 3OYMA 3Q2EA 4IOOA 2M16A 4CUTA 4HXSA 4YBSA 5FE8A 3P8HA 4YATA 4WHWA 5L8UA 5CQ5A 2EQJA 5AMFA 4BW3A 4IR6A 4TU4A 3S3OA 4Z02A 3O33A 3P1EA 4LYSA 5EA1A 3GOXA 4QR5A 4NR7A 3OYJA 4O77A 4HBYA 5DW2A 5D0CA 3OYLA 5L97A 4UIYA 4QQGA 2RO1A 5FH8A 2RI2A 4O75A 3UVXA 4CUQA 4QEVA 4N4HA 2RFJA 4L59A 5ENGA 3OQ5A 4Z1QA 3S3NA 4QUUA 5KCHA 1G5VA 5D6YA 3OYAA 5D3PA 3MQMA 3L2QA 5FBXA 5IGKA 5F1HA 4PL6A 2RI3A 5I80A 5FFWA 5F1LA 5HM0A 5FROA 2YYNA 5F5ZA 4CFKA 3U5JA 3G0JA 4ZTJA 5BT5A 3OA6A 3RCWA 5DKCA 5FE9A 2X35A 2G4AA 5BT4A 4QSRA 3L2WA 3LJWA 5EWCA 5LKTA 5G4RA 4Q0OA 2X4XA 3QJ6A 4UYHA 2RJFA 5LKUA 4PCEA 2FHDA 4PTBA 3DWYA 3GG3A 2F6JA 4FLPA 4IR3A 5CUCA 3AADA 3U5NA 5C0MA 5A5PA 3BDLA 4C67A 5D6WA 5AD2A 4E7JA 4BDYA 4YYDA 5J0DA 4FU6A 5I89A 2R0SA 2RHZA 3U5LA 3ONIA 5I40A 4QBMA 2R57A 5EV9A 5DW1A 3S92A 5DY7A 4LYIA 5CQ8A 5C4QA 5HELA 5CGPA 2E7NA 5D26A 4EDUA 4KV4A 1OZ3A 5F63A 2L5EA 5DKHA 2BKDN 5E9LA 3LXJA 2KTBB 5LVRA 3LH0A 3OYCA 4TZ2A 5FFYA 4TQNA 4CL9A 5FE1A 5DFBA 4DONA 1WJQA 3MULA 3ZYUA 5E73A 5FB1A 2OUOA 4QY4A 4UYGA 2P0KA 4IKFA 4C5HA 5IGLA 2HQXA 2RJEA 3OYGA 5LUUA 3M9QA 5ENHA 2HQEA 4IOQA 5HJCA 3OB9A 4X34A 4O76A 2DKWA 2QQRA 4IUTA 3MP6A 4QVZA 2LSPB 5M9OA 2R5AA 1OI1A 4X2IA 5L98A 5A85A 1N27A 3LQHA 3FDRA 2M1HA 5CQTA 4QSPA 4QR3A 5IGNA 2VYTA 4KV1A 5IG6A 2OO1A 2RNXA 4NQNA 4J3IA 5E0RA 2GFAA 2NLUA 3U5MA 1H3ZA 2BUDA 1XNIA 5IN1A 5HQ7A 5D24A 1E6IA 2F5KA 4LRGA 4YYMA 5E74A 5ETDA 4MR5A 4YAXA 5CFWA 5C8GA 3ME9A 5J26A 4E7IA 4YH4A 2RHXA 4Z1SA 4HBVA 4OUFA 5FE2A 5I7YA 4FL6A 3OY9A 2E5QA 3JVMA 5D7XA 5BT3A 5EISA 3OYKA 5IAYA 5A83A 3HMHA 1RI0A 3K2JA 4QSSA 4HXKA 5CUEA 4CFLA 5E3DA 2LRQA 3MP1A 2D82A 4QQ6A 1WJSA 4ZQLA 5EQ1A 5G4SA 2EKOA 3HMFA 4XY9A 5EVAA 3C4SA 3IU5A 2RI7A 4PLIA 3H8ZA 3LQIA 5KO4A 3DB3A 2D9EA 1WUGA 2FSAA 4J0SA 3MP8A 4NYVA 3O8VA 3DLMA 2E6NA 3D7CA 4N4GA 4O7FA 5FDZA 4O7EA 3L2UA 4OGJA 2R5MA 4TS8A 4MR4A 3FC3A 5LVQA 2XDPA 4NYXA 5D3TA 4HXMA 4N4FA 5HLSA 4A4HA 4HXNA 5F60A 5DKDA 4QSWA 5E9YA 3SVGA 4A9KA 4NR8A 3O35A 2PQWA 5LKXA 4GPJA 4CUSA 5FRMA 5A82A 1JSPB 2LVMA 4BW4A 4O70A 2L3RA 5D3SA 4BD3A 5F2PA 4UYFB 2MJVB 4N3WA 4LDFA 3S3MA 5ETBA 5E9MA 5II2A 4UYDA 5ENJA 3P1FA 4QYLA 4MEOA 2JTFA 2WACA 4IORA 5HRVA 4TT4A 5C6SA 3QIIA 5CZGA 2L84A 5DLXA 5CQ3A 1F68A 4ZC9A 4YY6A 3F70A 4C5GA 5LJ1A 2RNYA 2RJDA 2R58A 4GY5A 4QSXA 4YYNA 2L85A 2DIQA 2H60A 3P5OA 5DLZA 3U5OA 2LTOA 5DYAA 4RVRA 4PLLA 5FG5A 2EQMA 2O4XA 5CP5A 4A9OA 5AMEA 5L99A 4QR4A 2N9GA 4A9NA 5I86A 3PNWC 4IUVA 4UIUA 5DX4A 4YYJA 5KE2A 5CTLA 4CUUA 2B8AA 4O74A 5EK9A 2M0OA 4LYWA 4YY4A 3NTKA 2YEMA 4QNSA 4CURA 2DWWA 3Q2FA 4QEWA 2I7KA 4NR5A 2GRCA 3MO8A 2R0YA 2EFIA 4MEQA 5EWDA 4F3IA 3LGFA 3DB4A 4KCXA 2CKKA 3KUFA 4BHWA 2RJCA 4C66A 5HCLA 5D3RA 5FRNA 2RHYA 4PKLA 5HQ6A 3SVFA 2JZ2A 5K29A 5EGUA 4QW2A 3LQJA 5HRXA 2EQUA 3PMIA 1OYXA 2I8NA 4Q5WA 3JVKA 5C85A 3SD4A 4E7KA 3U5KA 4OGIA 2LCCA 4B9WA 5A5SA 5F25A 2E7OA 4MENA 1MHNA 5EPBA 4MR6A 2OSSA 5FE4A 2D9TA 4ZTFA 3UV5A 4QC1A 5EPRA 5EM3A 5KE3A 4MEPA 2RNWA 4NR6A 3MUKA 5L8TA 5LKZA 5E9IA 5D3LA 4BE1A 3NXBA 4QSVA 5I7XA 4BE0A 5FB0A 3QKJA 1X0JA 4NRBA 4RG2A 5AD3A 4HXRA 4LC2A 3E9FA 4O71A 4TT2A 4B9XA 5CQ4A 5H1TA 3FKMX 4TT6A 5DYUA 5H85A 4CLBA 4QC3A 4A4FA 5E9KA 2K3YA 4IUQA 3I3JA 3O34A 4QB3A 4A9JA 2NXBA 3L2RA 3U5PA 4PY6A 4A9FA 5CQ7A 3L42A 3QZSA 5JWMA 4YBTA 4ALGA 4YC9A 3ZEHA 5F36A 5A81A 3P1CA 4TZ8A 3O37A 5CUBA 3LX7A 5FE3A 4E96A 2DAQA 4A4EA 3MEWA 5DFDA 3LLRA 3OS2A 5FG4A 4PS5A 4PCIA 3UW9A 5CQ6A 4BW2A 4O7CA 4AKNA 4UC4A 4A9IA 3O36A 5F3AA 5FE5A 5FE7A 3MXFA 3UV2A 5HQ5A 4WHUA 4NR9A 4BDZA 5D6XA 4QSQA 2YEKA 3DAIA 4QSTA 2MWPA 3PMTA 2R10A 3MEVA 5JI8A 4IUUA 2R0VA 4LR6A 4UYEA 5D3HA 3NTHA 2GF7A 4NUEA 5E3GA 5CRZA 4UIVA 3QZTA 4CUPA 5KU3A 4QUTA 2QQSA 4NUDA 5E7DA 5FFVA 5A5OA 4E7LA 3MEUA 2RS9B 2MWOA 5F62A 4Z6HA 2DATA 3AQAA 4YK0A 3OYDA 5EPSA 5E9VA 2BIVA 4YYHA 5KCOA 4HBWA 4Z93A 2RHIA 4HXOA 5EWWA 4YBMA 4HCZA 4N4IA 3MB4A 5EWVA 3OMGA 5I88A 5C87A 4NUCA 3CEYA 5HENA 5CPEA 5FH7A 3OS0A 4XUBA 4BACA 2YQDA 4TTEA 5CRMA 5ENFA 4A9EA 4TU6A 2RHUA 5HEMA 3S6WA 3QBYA 3OYNA 3SVHA 5KTXA 4LZSA 4HBXA 4WIVA 1JM4B 2YELA 5IIDA 2WP2A 1EQFA 3META 3OYIA 4XY8A 4UIWA 3UVDA 3JVJA 3OYEA 3QZVA 4IUPA 5II1A 5HRWA 4LZRA 4NR4A 4UIZA 5EWHA 5I29A 3OMCA 1WGSA 4QYDA 4II1A 3ASKA 4BW1A 4A9MA 2RO0A 3UWNA 3OYFA 5H1VA 4YYKA 4NS5A 5TB6A 4NXJA 5DYXA 3MEAA 2G3RA 5EI4A 3UVYA 5EICA 5CQAA 2DIGA 2K3XA 3MB3A 3P8DA 4OVAA 2X4YA 4QQDA 2YDWA 5H1UA 5KHMA 4QEUA 4ZW1A 5KTUA 3OYBA 3EAEA 5I1QA 2YW5A 2XK0A 4A4GA 4BJXA 2YRVA 5LJ0A 4O72A 2DVSA 1OZ2A 4YABA 3TLPA 5DBMA 2L8DA 2WP1A 4J0RA 5EP7A 5CY9A 5A5QA 4UITA 4IURA 4IR5A 5CIUA 4A9LA 5D3NA 5ENEA 3LYIA 4NRAA 5FE6A 5COIA 4YADA 5FG6A 1KHCA 4Q0NA 2DVVA 3FEOA 4YYIA 4XUAA 4J1PA 1WUMA 4BE2A 5CUDA 3NTIA 3UVWA 2L89A 3E9GA 2F6NA 4QSUA 5KH6A 5J39A 3Q1JA 4MR3A 2DVRA 1ZS5A 2O4XB 4UIXA 3S91A 5L96A 5I83A 4E7HA 5C89A 4QZSA 1SSFA 3G0LA 5HFQA 3UT1A 3P1DA 5A5NA 3H6ZA 5C7NA 4YH3A 5HFRA 4HXLA 5CU8A 1WJRA 3FLGA 5EU1A 5CS8A 4LD6A 5KTWA 4HXPA 2IG0A 4C5IA 5F61A 4ALHA 2E3KA 3IU6A 3LGLA 2EQKA 4Y03A 2LDMA 4IR4A 4NQMA 4Z6IA 2GFUA 5CUAA 5IBNA 2RI5A 3OS1A 5LJ2A 3OYHA 3JVLA 4LZ2A 5A5RA 3UV4A 5FE0A 5CUGA 3HMEA 4O7BA 4TYLA 5ENCA 5ENBA 4UYFA 5A7CA 5D3JA 5TCMA 3PFSA 5DFCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M78E 5GAN7 5ENIA 4O7AA 4KUIA 1E7OA 4XYAA 1N72A 5FH6A 3U23A 2DYBA 2DJZA 4P5NA 4CRIA 4NRCA 1FMVA 3HRUA 1MV0B 5FU7C 3A8GB 5A0LA 2EQJA 1NEGA 3S3OA 3P1EA 4QR5A 2KVQG 1NLOC 4HBYA 2GCXA 4QKUA 1KC8U 1QVFA 1QCOA 1LJOA 1D09B 4AFZC 1YITA 2RO1A 4CC2A 1M1FA 4FCYA 3AHUA 1Q81U 4QEVA 5CKBA 5ENGA 1VUBA 4Z1QA 1YN8A 2LQKA 3EFRA 4CC3A 4EMGA 3S3NA 1K1ZA 3CCJT 5D3PA 3MQMA 3RIRA 5IGKA 1G3TA 1BCMA 2ZPBB 2HBWA 1BCOA 1FMWA 2HKQB 3CBMA 3REBB 3IQLA 2ZAEA 5FROA 1RL2A 3G0JA 1U5SA 1F1BB 3V7SA 3OA6A 3RCWA 5FE9A 3JCMW 4HVUA 5BT4A 3QUIA 4NL3A 2EYQA 3CPWP 3QDRB 5G4RA 4TVRA 2AZVA 4Q0OA 1CKBA 4KH1B 4F04B 1WX6A 2E65A 3AADA 5C0MA 2AK5A 1WHMA 2RPNA 1W2BA 4C67A 2PUOB 2DBKA 5J0DA 4FU6A 5I89A 1QCNA 2RHZA 5I40A 2B86A 5EV9A 2DL4A 3G6ET 2CS7A 4M7AF 5GAOr 5HELA 5CGPA 3D1BA 1W6XA 2YXYA 4KV4A 1B34B 2DPPB 1E6GA 2YLBA 2L5EA 2KYBA 3CD6T 1Y0MA 2KNBB 4E7ZA 4KUDK 3PIOA 3OYCA 5KYYA 5FFYA 4TQNA 4CL9A 5FE1A 4PJOF 2YUNA 1WJQA 3P8BB 3MULA 4C8QE 3ZYUA 2MMPA 2JVVA 5GMKh 4C5HA 4JJNK 1ZX6A 3M9QA 2HQEA 4OGCA 2YUPA 2DKWA 1WQWA 4N0AC 1GXIE 4X9CA 4NL2A 3OW2S 2LT1A 1WDXA 2QA4T 2A36A 2CUDA 2M1HA 4QR3A 1WZOA 3ERRA 4JJBA 5IG6A 3G71A 2HL5C 2XDDA 1H3HA 1RLPC 3MCAB 2L2PA 2EPDA 5KYUA 2JT4A 5IN1A 4EMHA 5D24A 1E6IA 4YYMA 4M75C 3WXMB 1YWPA 5ETDA 4YAXA 5CFWA 3QZ5B 3BW1A 4AKHA 2JMAA 1SRLA 3VUZA 1NJIC 2C0TA 2CGHA 2RHXA 1PNJA 1OX8A 4HBVA 5I7YA 4M77B 2CUBA 5D7UA 3JVMA 3GLXA 5EISA 1QVGP 5IAYA 5A83A 2OTJA 1EIFA 3HMHA 2DRKA 1Y96A 4GBQA 4QSSA 4AMCA 5GAN6 4CFLA 4BB7A 3VS1A 4GLMA 2D8JA 2O9SA 2D82A 1O75A 2EKOA 4ZQLA 5EQ1A 5G4SA 4XY9A 5IHIA 5HY6A 3UATA 1MMAA 1AEYA 1UJYA 1VQ4Q 2KAFA 2DF6A 1ZUKA 2COWA 3SFMA 4F7UG 1ZSGA 2LNVA 2RQRA 4N4GA 3JB9F 1UHFA 2XKOC 2GGRA 2R5MA 4MR4A 1VQ7Q 5FU6C 3J80E 2XDPA 4NYXA 4N4FA 5HLSA 2YDLA 5F60A 4QSWA 3I35A 5E9YA 3SVGA 4A9KA 4GPJA 5A82A 4BW4A 4O70A 2DILA 2L3RA 5F2PA 1R0CB 4Z8AA 4N3WA 1DJ7B 4LDFA 4UYDA 2JTFA 4MEOA 3CCQT 1AHJB 3MPUB 3RESA 4TT4A 3QIIA 4BY6B 1HSQA 1TH7A 5DM7R 5DLXA 2K79A 1OOTA 4FIBA 3GP8A 2R58A 4GY5A 2L85A 3UPUA 1BYMA 1D3BB 4PLLA 1SHFA 1GBQA 1X27A 3OBYA 5AMEA 1ARKA 2QAZA 5I86A 3QG1A 3PNWC 1V76A 4IUVA 4ZGDB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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