4N4IA

Crystal structure of the bromo-pwwp of the mouse zinc finger mynd-type containing 11 isoform alpha in complex with histone h3.3k36me3
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
211
structure length
192
Chain Sequence
NKQEMGTYLRFIVSRMKERAIDLVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGAASAQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNVHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title ZMYND11 links histone H3.3K36me3 to transcription elongation and tumour suppression
pubmed doi rcsb
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
molecule tags Transcription
source organism Mus musculus
total genus 65
structure length 192
sequence length 211
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4n4iA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4n4iA02
4TZ8A 5AD3A 3UVXA 4TT2A 5AMFA 2X4YA 3NTKA 5KCHA 5COIA 2GFAA 4NR7A 4E7JA 5C89A 3META 3CEYA 3O37A 4QY4A 4BDYA 5HFRA 5LUUA 4NXJA 5KTUA 4ZTJA 2RI7A 4O7BA 4XUAA 5A5QA 5A5RA 3LLRA 1N72A 1JM4B 1XNIA 4QC1A 5E9IA 2N9GA 3AADA 2DVVA 5AMEA 5F36A 5KU3A 4Z93A 2WP1A 3OYDA 3P1CA 5CUBA 2OSSA 5IBNA 3H6ZA 4CUQA 3OA6A 3O8VA 5FB1A 3PMTA 5DW2A 2RO0A 4CLBA 2DKWA 5DYAA 5FG5A 5E9MA 2DATA 5F62A 4QSSA 4Z6HA 3OMGA 4XUBA 4QQ6A 4C5GA 5L99A 3Q1JA 1WJQA 3OYAA 4E7IA 3MUKA 4XY9A 2MWOA 4PY6A 3DAIA 3MB3A 5DKHA 3ME9A 5EU1A 4QSPA 4HXSA 5CPEA 2D9EA 4QR4A 4CRIA 5IGKA 4QSUA 3NTHA 5ENHA 5CUGA 2HQXA 5L8TA 3QZTA 5ACYA 4N4IA 4IUQA 2R0SA 5C6SA 4UYDA 3LGLA 3JVJA 5KHMA 5DW1A 4LD6A 4CL9A 2RHZA 5LKUA 4KCXA 5D0CA 3KUFA 5D3RA 3SVGA 3S6WA 2RJEA 4O76A 4NUCA 5C4QA 3C4SA 3L42A 3L2WA 5ETDA 5FE8A 5FG6A 4YK0A 5CQ7A 5J0DA 3O33A 4A9FA 1EQFA 5L8UA 4BW3A 5I89A 3LJWA 2HQEA 4HBWA 2RI3A 4LZRA 5K29A 5DYUA 3P1FA 5EK9A 4A9EA 3OYGA 2YEKA 3OYMA 4HXKA 5KO4A 3OYBA 4CUPA 4GY5A 2CKKA 5DX4A 3SVHA 3IU5A 4KV1A 3IU6A 4IOOA 4J3IA 5EWWA 5IGNA 5FE3A 2E5QA 5D3PA 5IGMA 2XDPA 2FHDA 4YADA 3U5JA 3PNWC 2GRCA 3EAEA 4UC4A 3TLPA 4ALHA 4QSRA 1WUMA 5E9VA 4UIXA 5CUAA 4LYIA 4BW2A 4HBXA 3OYJA 5E3GA 5D7XA 5FBXA 2LCCA 5EA1A 5E9KA 2K3XA 4NS5A 5LVRA 1MHNA 4XYAA 3O35A 2DIQA 2YELA 2XK0A 3AQAA 4IR3A 5FROA 5CUEA 4PL6A 4Q5WA 4FLPA 4MENA 3OMCA 3UWNA 5M9OA 3E9FA 4TT4A 3E9GA 4CFLA 4BE2A 3LQJA 1KHCA 4KV4A 2QQRA 5ETBA 3OS1A 4YYJA 3OYEA 5I83A 2D9TA 2F5KA 2YQDA 4NR5A 3UV4A 2EQKA 4ZQLA 4O75A 5I29A 4C67A 4NR8A 2NLUA 3P8HA 2FSAA 3ASKA 5F25A 5A81A 4HXOA 3RCWA 4LYSA 3G0LA 3DB4A 3ONIA 3QKJA 2R0YA 5EPRA 4CUTA 5D3SA 3U5PA 4FU6A 4A4HA 3GOXA 5FH7A 5CQ5A 5EWVA 3P1EA 5E9YA 4O7FA 3H8ZA 2RHXA 5FG4A 3SVFA 1N27A 5FE0A 3UW9A 4BE1A 2R10A 2R5MA 2GF7A 5D26A 3BDLA 4IUUA 2L85A 2LTOA 2G3RA 4O77A 5A5PA 5H1TA 4HCZA 5HQ5A 4NUEA 2L3RA 5E9LA 2PQWA 3MXFA 2JTFA 2X35A 4PS5A 2YYNA 3JVLA 1WGSA 4IR4A 4Z6IA 4ZTFA 5LKXA 5HQ6A 2DVRA 5H1VA 2D82A 4YYMA 4XY8A 4LZSA 5F60A 5EPBA 4J0RA 2M0OA 5CY9A 4TU6A 1H3ZA 5ENCA 3LYIA 3OY9A 4OGJA 5AD2A 4OGIA 5HRVA 5II1A 5I7YA 1X0JA 5G4SA 5I80A 5F1HA 3S3OA 4PLLA 4EDUA 2YEMA 5E0RA 4F3IA 3U5OA 2QQSA 4TU4A 3MP8A 4BHWA 4YY6A 2M16A 1WUGA 3U5KA 3S91A 5EM3A 4YATA 3U5LA 2L8DA 2MJVB 3Q2EA 2L5EA 3LQHA 4QR5A 4BW1A 5CQTA 3P1DA 4HXLA 4LYWA 5IG6A 3GG3A 3UT1A 5D3JA 3FC3A 4UYHA 4LC2A 4E96A 4IURA 5H1UA 5F1LA 3HMEA 4Y03A 4ALGA 2RHYA 3HMFA 4MEPA 5FRMA 4QR3A 5CU8A 4X2IA 5A83A 3P8DA 5A5SA 5I88A 4CFKA 5A85A 5FE6A 5CQ4A 2E7NA 3MEVA 2RNYA 4TZ2A 3LGFA 4E7HA 2E3KA 4IR5A 3Q2FA 2WACA 3LQIA 4NYWA 2IG0A 3NTIA 4NQMA 4A9KA 2RNXA 5HJCA 4TYLA 5J39A 3OYFA 4IKFA 4BD3A 3OQ5A 4O78A 3MULA 4NQNA 4YYDA 3MEUA 4LRGA 5FH8A 4L59A 3S92A 3ZYUA 5A82A 2RI5A 3LXJA 4QSQA 2LVMA 4LZ2A 5BT4A 5D6XA 4TQNA 5C0MA 4Z02A 4A9IA 4E7LA 4QC3A 4WIVA 5DFBA 3JVKA 4YAXA 4N4HA 3NXBA 5EQ1A 5ENJA 5HCLA 3OYNA 4A4GA 5L96A 5L97A 5LKTA 4HBVA 5A5NA 5FE9A 4BE0A 2DVQA 5LJ2A 2DAQA 4QEVA 5CUDA 3OS2A 2DWWA 5FE5A 2EQUA 4CUUA 3MQMA 5ENGA 5HQ7A 5ENBA 5EGUA 2RHIA 3UVWA 5CQ6A 5D25A 1OZ3A 4BW4A 2L84A 5DLZA 5TCMA 4C5IA 5D3NA 5FFVA 4IORA 5C7NA 3G0JA 5A7CA 5DFDA 4QUUA 1ZS5A 5EPSA 3S3MA 2EFIA 5CS8A 4YYNA 4Q0OA 2YW5A 5LVQA 5C85A 2EKOA 4C5HA 4QYLA 5FH6A 5D6YA 3K2JA 4IR6A 5FFWA 4A9NA 5E73A 4UIWA 5H85A 5KTWA 5I7XA 4CURA 2WP2A 4A4EA 5IIDA 2YDWA 5F2PA 5I40A 4QSXA 2BKDN 2LRQA 4QSTA 2H60A 4MR4A 5CQ8A 4OVAA 2YRVA 5HLSA 4HXMA 2OUOA 2O4XA 5FE1A 3QIIA 4O7EA 4UIUA 3OS0A 3UV2A 2VYTA 4PCIA 5ENIA 5HRXA 5DKDA 5CZGA 4A9JA 2RJFA 3QJ6A 5CRZA 5D3HA 5I1QA 4YC9A 4LDFA 2EQMA 5ENFA 3L2QA 5F63A 1OZ2A 2R5AA 3LH0A 4BACA 1WJSA 4NYVA 3FDRA 2I8NA 2NXBA 3FEOA 4NUDA 4B9XA 4PTBA 4IUPA 4X34A 5EP7A 3O34A 4C66A 3MP6A 5E7DA 5CQAA 5EVAA 5CUCA 4ZW1A 4YBSA 4RVRA 5CFWA 3MEWA 4N4FA 4E7KA 4N4GA 4YYKA 3OYCA 5JI8A 3OYKA 5TB6A 5IN1A 5KE3A 4UYFA 4QUTA 5EISA 4NR6A 3ZEHA 2JZ2A 4BDZA 4NRBA 2I7KA 1OI1A 4HBYA 4QBMA 2F6NA 4A4FA 5F61A 5BT5A 3JVMA 5HENA 2BUDA 2BIVA 2M1HA 5G4RA 3QZSA 4YH3A 4HXNA 5CP5A 2L89A 5DKCA 3PFSA 3FKMX 4O72A 4LR6A 4TS8A 5EWCA 4IOQA 2F6JA 2E7OA 5HELA 3OYLA 5E74A 4UYGA 3DLMA 4QNSA 5KE2A 2RHUA 1E6IA 3P5OA 3UV5A 4CUSA 4UIZA 4C5EA 5L98A 4YABA 4AKNA 4Z1QA 5FE4A 5D24A 5II2A 5FFYA 3U5MA 1SSFA 5D3LA 3OYIA 4O7CA 4QB3A 2MWPA 2LDMA 5KH6A 5BT3A 3FLGA 4O7AA 2RFJA 5HFQA 1G5VA 4BJXA 3PMIA 4WHUA 5EWDA 3SD4A 3QBYA 2B8AA 4QEUA 4J0SA 4YBMA 2RNWA 3D7CA 5CTLA 5FE2A 4O71A 5FRNA 2EQJA 4YH4A 2O4XB 4B9WA 4QEWA 5A5OA 4PKLA 4QZSA 1JSPB 5LKZA 5ENEA 4YYGA 3OYHA 5DYXA 2X4WA 5CQ3A 4QSWA 5EICA 4UIYA 2OO1A 4NR4A 5DFCA 5IAYA 5LJ1A 3MP1A 4ZC9A 2R57A 4DONA 4QYDA 4IUTA 4II1A 4QVZA 4IUVA 5DYCA 4UIVA 2G4AA 4RG2A 5D6WA 5KCOA 4NRAA 2E6NA 2LSPB 5D3TA 4YYHA 3MEAA 2X4XA 4A9OA 2K3YA 2GFUA 2RI2A 5FDZA 4PCEA 4HXRA 4FL6A 5J26A 4A9MA 4A9LA 2RS9B 5CIUA 5I86A 3QZVA 4NRCA 5CRMA 5E3DA 4J1PA 5FB0A 1RI0A 4Z1SA 4UYFB 1WJRA 5HM0A 5C8GA 5EI4A 3DB3A 3HMHA 4UYEA 2DIGA 4QQGA 5DY7A 3UVYA 3L2RA 1OYXA 3F70A 4MR5A 5LJ0A 3LX7A 3MO8A 4QW2A 2DVSA 4GPJA 4TTEA 4MR6A 4WHWA 5HRWA 4TT6A 3DWYA 4NR9A 4YBTA 5F5ZA 5JWMA 3OB9A 4MEQA 3MB4A 4O74A 2RJCA 3O36A 4QQDA 4YY4A 3S3NA 5FE7A 2KTBB 5CGPA 5DBMA 4N3WA 5EWHA 1F68A 5KTXA 2RJDA 5EV9A 2RO1A 3UVDA 4Q0NA 4MR3A 4UITA 4YYIA 5C87A 4NYXA 5DLXA 4HXPA 4PLIA 4MEOA 2R58A 3L2VA 5HEMA 3U5NA 3I3JA 5IGLA 2P0KA 4O70A 5F3AA 4A9HA 3L2UA 3M9QA 2R0VA 4OUFA 4QSVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N0AA 1VQ8T 3JCMP 5AMFA 5KCHA 3CD6T 1BB9A 7AT1B 2GFAA 4NR7A 3VS1A 3META 2PVOB 3JB9H 1VQOA 4NXJA 2DF6A 4O7BA 2NWMA 4RTUA 2OTJQ 4XUAA 3JCMh 2F2XA 4JJDA 1JM4B 4VUBA 1VQLQ 3AADA 3CCQQ 2DVVA 1VQ5Q 2OTLT 1QCFA 2V8IA 3P1CA 5KYYA 4AKHA 4DBRA 5IBNA 5CQXA 4RTWA 1K8AC 1YITA 3EFOB 5FB1A 4M7DB 2RO0A 4CLBA 3CCUT 4QT7A 5DYAA 4Z6HA 1YI2T 4QSSA 2F2WA 4C5GA 2QTXA 3MUKA 1M1FA 4ELZC 2JUFA 1K9MU 1ZSGA 5EU1A 2C06A 3OSSC 4TVRA 2FRWA 1M5Q1 1VIEA 1UB4A 4M78B 2J05A 2QQBA 2LQKA 4KGZB 5CUGA 3OBYA 1OV3A 2KSSA 1G3WA 4XU0A 1OULA 3JB9G 1CKBA 4IUQA 1X69A 1BCMA 1NJIC 1ZKRA 2KEAA 2RQRA 5D3RA 2P4RA 3SVGA 3GPLA 2DPPB 4O76A 4NUCA 2L2PA 2YRCA 3CCMT 1GBRA 2ED1A 4E7SA 1SHGA 3CPWS 2CH4W 2HBPA 4WF2A 4BW3A 5I89A 3CXCA 2DBKA 4M7AA 2MMPA 3SDZA 1SSHA 1VQOT 4CUPA 4GY5A 1BYMA 5DX4A 3IU5A 2LQ8A 1O75A 4IOOA 4J3IA 2E5QA 5LJ3e 4YADA 3U5JA 1NJIU 1WQ7A 3EGXB 4MMKA 3PNWC 1MMDA 1FMWA 4A53A 3TLPA 9ATCB 4ALHA 3RERA 4HXJA 5E9VA 1MUZA 1M2VA 3VYGA 1M3CA 2Y90A 1BI1A 2O9SA 2FG0A 1VQ6Q 5EA1A 2K3XA 1MHNA 4XYAA 3V7SA 2XD0A 4M7DC 4IR3A 4Q5WA 4PFOA 2VGNA 3UWNA 5M9OA 3E9FA 1WDXA 3HKSA 2CP6A 1KHCA 2RF0A 4KV4A 3OYEA 5I83A 4DEXA 3CCVQ 1BK2A 1VA7A 4ZNXA 4ZQLA 2E64A 5I29A 4NR8A 3I5SA 3P8HA 4M78C 4JJBA 5HY6A 2FSAA 2NUPB 2ZPFB 3ASKA 5A81A 2DVEA 3ONIA 3CCEQ 5EPRA 4RUGA 4F7UF 2IIMA 1IREB 4O7FA 3H8ZA 5GAOl 1S72A 3BDLA 1SG5A 2G3RA 2JT4A 5A5PA 2CGHA 1X27A 4HCZA 2A0FB 1QVPA 2YYNA 5GANg 4RCCA 4IR4A 5LKXA 2D82A 4XY8A 5EPBA 4J0RA 3AT1B 1KJWA 1WX6A 1H3ZA 2IVWA 2K79A 3QG1A 4JRQA 3FRNA 5LJ5f 3GNFB 5I7YA 2F2VA 3QYHB 5G4SA 5CKEA 5I80A 3S3OA 5E0RA 2AHJB 1AOJA 1M2VB 3HFNA 3U5OA 1VQ7Q 1M90U 4BHWA 4LUEA 2LNHB 3S91A 1JRIA 4RTZA 2VVKA 2L8DA 1RAGB 1JXOA 3Q2EA 3THKA 2L5EA 5LJ5h 4LN2A 3JCMc 3OBWA 2KXCA 3UT1A 4LNPA 1BKBA 4Y03A 4ALGA 4LUDA 5FU6B 3FJPA 4ZN3A 5KYWA 4J8OA 5FRMA 5CU8A 1LJOA 1WHGA 5A5SA 2QA4Q 2OTJA 5I88A 4ATOA 5A85A 3CCQA 1VQ5A 1J3TA 3MEVA 4CC7A 2RNYA 5GMKl 3EG1A 2K5FA 3VKHA 1K73C 3CCRQ 3VS2A 2WACA 4M77D 3CCJT 1UTIA 3V7RA 1BIBA 4A9KA 5HJCA 5J39A 2O88A 4ZGJB 2AZSA 1YIJQ 3VS5A 1YHQT 1ZBXA 4O78A 4YYDA 4J7IA 4L59A 3RBBB 3S92A 2RI5A 1UUEA 3CPWP 1YJWQ 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2B8A A;  4QEU A;  4J0S A;  4YBM A;  2RNW A;  3D7C A;  5CTL A;  5FE2 A;  4O71 A;  5FRN A;  2EQJ A;  4YH4 A;  2O4X B;  4B9W A;  4QEW A;  5A5O A;  4PKL A;  4QZS A;  1JSP B;  5LKZ A;  5ENE A;  4YYG A;  3OYH A;  5DYX A;  2X4W A;  5CQ3 A;  4QSW A;  5EIC A;  4UIY A;  2OO1 A;  4NR4 A;  5DFC A;  5IAY A;  5LJ1 A;  3MP1 A;  4ZC9 A;  2R57 A;  4DON A;  4QYD A;  4IUT A;  4II1 A;  4QVZ A;  4IUV A;  5DYC A;  4UIV A;  2G4A A;  4RG2 A;  5D6W A;  5KCO A;  4NRA A;  2E6N A;  2LSP B;  5D3T A;  4YYH A;  3MEA A;  2X4X A;  4A9O A;  2K3Y A;  2GFU A;  2RI2 A;  5FDZ A;  4PCE A;  4HXR A;  4FL6 A;  5J26 A;  4A9M A;  4A9L A;  2RS9 B;  5CIU A;  5I86 A;  3QZV A;  4NRC A;  5CRM A;  5E3D A;  4J1P A;  5FB0 A;  1RI0 A;  4Z1S A;  4UYF B;  1WJR A;  5HM0 A;  5C8G A;  5EI4 A;  3DB3 A;  3HMH A;  4UYE A;  2DIG A;  4QQG A;  5DY7 A;  3UVY A;  3L2R A;  1OYX A;  3F70 A;  4MR5 A;  5LJ0 A;  3LX7 A;  3MO8 A;  4QW2 A;  2DVS A;  4GPJ A;  4TTE A;  4MR6 A;  4WHW A;  5HRW A;  4TT6 A;  3DWY A;  4NR9 A;  4YBT A;  5F5Z A;  5JWM A;  3OB9 A;  4MEQ A;  3MB4 A;  4O74 A;  2RJC A;  3O36 A;  4QQD A;  4YY4 A;  3S3N A;  5FE7 A;  2KTB B;  5CGP A;  5DBM A;  4N3W A;  5EWH A;  1F68 A;  5KTX A;  2RJD A;  5EV9 A;  2RO1 A;  3UVD A;  4Q0N A;  4MR3 A;  4UIT A;  4YYI A;  5C87 A;  4NYX A;  5DLX A;  4HXP A;  4PLI A;  4MEO A;  2R58 A;  3L2V A;  5HEM A;  3U5N A;  3I3J A;  5IGL A;  2P0K A;  4O70 A;  5F3A A;  4A9H A;  3L2U A;  3M9Q A;  2R0V A;  4OUF A;  4QSV A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4N0A A;  1VQ8 T;  3JCM P;  5AMF A;  5KCH A;  3CD6 T;  1BB9 A;  7AT1 B;  2GFA A;  4NR7 A;  3VS1 A;  3MET A;  2PVO B;  3JB9 H;  1VQO A;  4NXJ A;  2DF6 A;  4O7B A;  2NWM A;  4RTU A;  2OTJ Q;  4XUA A;  3JCM h;  2F2X A;  4JJD A;  1JM4 B;  4VUB A;  1VQL Q;  3AAD A;  3CCQ Q;  2DVV A;  1VQ5 Q;  2OTL T;  1QCF A;  2V8I A;  3P1C A;  5KYY A;  4AKH A;  4DBR A;  5IBN A;  5CQX A;  4RTW A;  1K8A C;  1YIT A;  3EFO B;  5FB1 A;  4M7D B;  2RO0 A;  4CLB A;  3CCU T;  4QT7 A;  5DYA A;  4Z6H A;  1YI2 T;  4QSS A;  2F2W A;  4C5G A;  2QTX A;  3MUK A;  1M1F A;  4ELZ C;  2JUF A;  1K9M U;  1ZSG A;  5EU1 A;  2C06 A;  3OSS C;  4TVR A;  2FRW A;  1M5Q 1;  1VIE A;  1UB4 A;  4M78 B;  2J05 A;  2QQB A;  2LQK A;  4KGZ B;  5CUG A;  3OBY A;  1OV3 A;  2KSS A;  1G3W A;  4XU0 A;  1OUL A;  3JB9 G;  1CKB A;  4IUQ A;  1X69 A;  1BCM A;  1NJI C;  1ZKR A;  2KEA A;  2RQR A;  5D3R A;  2P4R A;  3SVG A;  3GPL A;  2DPP B;  4O76 A;  4NUC A;  2L2P A;  2YRC A;  3CCM T;  1GBR A;  2ED1 A;  4E7S A;  1SHG A;  3CPW S;  2CH4 W;  2HBP A;  4WF2 A;  4BW3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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