4NS5A

Crystal structure of human bs69 bromo-zinc finger-pwwp
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
209
structure length
185
Chain Sequence
QEMGTYLRFIVSRMKEVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNIHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human BS69 Bromo-ZnF-PWWP reveals its role in H3K36me3 nucleosome binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Homo sapiens
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
total genus 66
structure length 185
sequence length 209
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ns5A01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4ns5A02
4MEOA 4NR6A 5CUCA 4MR5A 3OYLA 3O8VA 2YW5A 2R58A 2OO1A 3U5MA 4CUQA 4NR7A 4LZRA 5D3NA 4CLBA 2D82A 2L85A 5A85A 4LR6A 4NUCA 4IOOA 4QNSA 1KHCA 4XY8A 2RI2A 2LSPB 4KCXA 4MR4A 5CQAA 4NUDA 5EWDA 5HQ5A 3AQAA 2LRQA 3MQMA 4QSUA 4TU4A 3JVLA 4TU6A 5FFYA 2DVSA 5D26A 4N3WA 5C89A 5IGMA 4QC1A 3JVMA 4O7AA 2BKDN 4X34A 5DW2A 4DONA 4QQ6A 4J0SA 4NYVA 5I7YA 2RO0A 4UIVA 3ZEHA 4QSWA 1OZ2A 3MUKA 5DFCA 2BUDA 4BDZA 3UVXA 3L2QA 4QUTA 5EP7A 5C6SA 2R0SA 5IN1A 3OYHA 4NQMA 3OMCA 5FE6A 2M0OA 2R0VA 5EQ1A 5HLSA 2YRVA 4PLLA 4PS5A 5D7XA 4E96A 1SSFA 3HMHA 3O37A 4A4GA 5EPSA 4B9XA 4NR9A 5D3JA 5EISA 5KCOA 1MHNA 3AADA 3O36A 4QR5A 4BE1A 4FL6A 4J3IA 5AMEA 3S6WA 4OGJA 5FE7A 3LGLA 5JWMA 5TCMA 4ALGA 5EK9A 5A5NA 5CUBA 4CFLA 4Z02A 3KUFA 3OS0A 5EI4A 3QZSA 5FB0A 4PY6A 4IUQA 4QEWA 5F36A 2R5MA 1WUGA 4YK0A 3FDRA 4IUUA 4UIXA 5II1A 5ETBA 4YYJA 4ZTJA 5HFRA 2RJCA 4FU6A 2MWOA 2XDPA 5E3GA 5E9LA 2H60A 4ZTFA 2EFIA 3NTHA 5LJ1A 4O7FA 3OYGA 4TT6A 2O4XA 5KH6A 5II2A 1OYXA 2E3KA 1JM4B 5HRWA 4EDUA 4QYDA 4N4FA 2OSSA 5LKUA 5HELA 5A81A 4N4HA 3UVDA 2RJDA 4QW2A 5EGUA 4IORA 5FB1A 5CZGA 5AD3A 4O78A 3OS2A 5IGLA 5C85A 5KTXA 5D0CA 4UYFA 5F62A 3C4SA 4IUTA 5KU3A 5KE2A 5CFWA 4UYGA 4O72A 2E7OA 2YEKA 4TZ2A 2L89A 4YABA 5EPRA 2LVMA 5D24A 4CL9A 2QQSA 4E7JA 4Q5WA 4XUBA 3P1CA 3Q1JA 3MP8A 4ZW1A 1WUMA 4C5EA 3M9QA 2M16A 5EU1A 5I7XA 5FDZA 4QSPA 4BDYA 4IKFA 4LC2A 4Q0OA 2I7KA 2RFJA 2DIQA 5ENJA 4CUUA 5EPBA 4O76A 5DLXA 4A4FA 3ASKA 4IR4A 4E7HA 4YYNA 4Z6IA 5I88A 1WJQA 5CTLA 4YY4A 3OB9A 3L2UA 2WP2A 4O7BA 4MR3A 3LH0A 4C66A 4PKLA 3DB3A 5D6YA 5IG6A 4YYKA 5A5RA 4BHWA 3NTKA 5EM3A 3DAIA 2D9EA 4CURA 4HXLA 5DYAA 5M9OA 4E7LA 5E73A 2F5KA 3MO8A 5ENFA 4ZC9A 2R57A 3PMIA 5EVAA 4IUVA 5FG5A 3DWYA 3NTIA 3FC3A 3RCWA 5CQ8A 4BW1A 4QY4A 3H8ZA 3OYCA 2GRCA 4HBWA 2BIVA 4O75A 5C87A 2X4YA 5H85A 2VYTA 5AMFA 3UT1A 5KE3A 2FSAA 5FE2A 5FE1A 5CQTA 5HFQA 3LLRA 4O7CA 5FH7A 2RJEA 3OYNA 4NR4A 2CKKA 2HQEA 5CP5A 5CY9A 4UITA 5D3PA 4NUEA 5DBMA 5DY7A 5LVQA 4HCZA 5EWHA 5A5SA 4UC4A 2L5EA 4A9EA 2NXBA 5ENGA 5KTWA 2RI3A 5FRNA 3OYFA 2JZ2A 5DW1A 5DYCA 3UV5A 4QZSA 3U5LA 2WACA 3UWNA 5IGKA 4BW3A 5LKTA 2F6NA 4KV4A 5L99A 4F3IA 5HRXA 2EQKA 3CEYA 4A4HA 4YH3A 5HENA 3MXFA 2DVQA 5E0RA 5F1LA 5L98A 5A83A 5FE9A 5DYXA 2L84A 2KTBB 2DVRA 3OA6A 5E9YA 4C67A 4HBYA 4O74A 5F60A 4HXKA 5JI8A 1WJSA 5DFDA 4TTEA 3ONIA 5F2PA 4YY6A 3MB4A 4HBVA 4IR6A 5IBNA 3P8HA 5I29A 2X4WA 3MP6A 4UYDA 4NR8A 4N4GA 4YYGA 4BACA 3UVWA 5BT3A 5LJ0A 5FH8A 4OGIA 4A9NA 4N4IA 4YYHA 4BJXA 5D6WA 4PCEA 2E7NA 4X2IA 2XK0A 1F68A 3GOXA 4YBSA 5HJCA 3MP1A 5A7CA 3LXJA 5DYUA 4BW4A 1WGSA 2EQJA 2L8DA 5CQ5A 4Z1QA 3MEWA 3OQ5A 2JTFA 3PMTA 4J1PA 5DX4A 2YQDA 3P8DA 3U5PA 2RO1A 2OUOA 4BW2A 2R10A 5EA1A 5FBXA 3LJWA 3S3OA 2YELA 3JVJA 2I8NA 2DWWA 1JSPB 3OS1A 5LUUA 5F63A 4Q0NA 5C4QA 5COIA 4LRGA 2RNXA 2RHZA 4O7EA 5CQ7A 4LZ2A 5KO4A 4NYWA 2EKOA 4QYLA 4HXSA 3LX7A 5C0MA 4BE0A 4Y03A 5HCLA 2LDMA 4FLPA 5D3SA 5G4SA 1WJRA 3QIIA 2RI5A 3I3JA 2IG0A 5FROA 4NS5A 4CRIA 3TLPA 5A5QA 4UIZA 3P5OA 5EWVA 5ENHA 4WHUA 3QKJA 5KHMA 5DKDA 3LGFA 2EQUA 5I80A 4GPJA 1G5VA 3P1DA 5L97A 4CUPA 4A9IA 5J0DA 5FE0A 5CUDA 2DAQA 2NLUA 3MEVA 4MEQA 4UYEA 5IGNA 4LYSA 3UVYA 5I40A 3EAEA 5CUEA 3BDLA 4HXPA 3LQIA 2DVVA 3LYIA 3DB4A 5E9KA 4YADA 5ETDA 4O71A 5E7DA 5EICA 5D3RA 4PTBA 2P0KA 4QSVA 5FE3A 4CUTA 5IAYA 3UW9A 3L2RA 4IUPA 4E7KA 4A4EA 4IOQA 4BE2A 4YBTA 5FE4A 5I89A 4ZQLA 3P1FA 4HXRA 3Q2EA 5L8UA 2LTOA 5AD2A 3U5OA 5HQ6A 4IR5A 5A5PA 4GY5A 5CUAA 4J0RA 4NR5A 2MWPA 3E9GA 3FEOA 1EQFA 4NXJA 5KTUA 4PL6A 2F6JA 5L8TA 5KCHA 5D3HA 4UYHA 3ME9A 4A9JA 2R5AA 5E9MA 4QVZA 3SVHA 4UIUA 3E9FA 4HXNA 4TT2A 4A9HA 2L3RA 4QQDA 2RI7A 5LKXA 4A9LA 5L96A 2X35A 5EV9A 4NRCA 4O77A 2RHUA 2QQRA 3O35A 2X4XA 3L2VA 5FE8A 4C5HA 5C7NA 4QSSA 2LCCA 2RHIA 4QQGA 4LYWA 2GFAA 3S92A 4YC9A 4HXOA 2E5QA 2HQXA 3OMGA 3O33A 4LDFA 5J26A 5LVRA 4NRBA 5BT4A 5ACYA 4NQNA 2R0YA 2YYNA 5HM0A 2FHDA 5ENCA 4UIWA 4O70A 5FH6A 4XY9A 4QSXA 4QEVA 4TS8A 2GFUA 3OYDA 3L42A 4XYAA 4YH4A 3IU6A 5C8GA 4YATA 2RS9B 3OYJA 1H3ZA 4QUUA 5CRZA 4QSRA 5H1VA 4Z6HA 3FLGA 3P1EA 5CQ3A 2PQWA 5CIUA 3SD4A 5ENBA 5F5ZA 1OZ3A 2DATA 5BT5A 5CUGA 4LZSA 2G4AA 5TB6A 2B8AA 3QBYA 3OYIA 5CQ4A 3SVGA 4YAXA 3QZTA 4YYIA 2D9TA 2RNYA 4PCIA 4QC3A 3S3MA 3K2JA 4UIYA 5LKZA 4HXMA 4MR6A 1ZS5A 2RJFA 5CRMA 3OY9A 3MULA 4MEPA 3QZVA 4QR3A 4L59A 5CU8A 5D3LA 5ENIA 5G4RA 2M1HA 5H1TA 4QBMA 4II1A 1N27A 2DIGA 3Q2FA 5LJ2A 3OYEA 3OYAA 2E6NA 5DKCA 4QSTA 5D25A 3MB3A 1E6IA 3U5KA 5E74A 3OYKA 5HRVA 5A5OA 4QEUA 5F3AA 5DLZA 2O4XB 4BD3A 5EWWA 3PNWC 4E7IA 5J39A 3D7CA 5F25A 4LYIA 3META 3JVKA 5E9IA 4ALHA 5FG4A 3UV2A 2GF7A 5CQ6A 5DFBA 3DLMA 5F1HA 2EQMA 3H6ZA 3QJ6A 5D3TA 3F70A 5H1UA 4Z1SA 5FE5A 4XUAA 3SVFA 2N9GA 2MJVB 3G0LA 5CPEA 5HEMA 2WP1A 4UYFB 5I86A 4CUSA 4RVRA 5FRMA 4OVAA 3OYBA 3HMEA 4YBMA 3G0JA 3LQHA 4MENA 2RNWA 3HMFA 4AKNA 3PFSA 4C5GA 3S3NA 4A9FA 2G3RA 1RI0A 5E9VA 3NXBA 4B9WA 3LQJA 1OI1A 2YEMA 5CS8A 4QB3A 4IURA 4C5IA 3O34A 4NRAA 4TT4A 4A9MA 3GG3A 5A82A 5FG6A 1XNIA 5D6XA 3UV4A 4WHWA 2RHXA 2RHYA 2K3XA 5K29A 3U5JA 4PLIA 5FFWA 5EWCA 3IU5A 3MEUA 4LD6A 4A9OA 3ZYUA 4YYDA 5IIDA 4Z93A 4NYXA 5I83A 2K3YA 3L2WA 1N72A 5I1QA 4OUFA 4YYMA 4A9KA 5FFVA 5HQ7A 4KV1A 4QR4A 5ENEA 4IR3A 4TZ8A 5CGPA 5E3DA 4RG2A 3OYMA 4TYLA 1X0JA 3S91A 2YDWA 4TQNA 3U5NA 3FKMX 5F61A 2DKWA 3MEAA 4CFKA 4HBXA 4WIVA 4QSQA 5DKHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CUCA 3CCMQ 3OYLA 2YW5A 4RTWA 2R58A 2OO1A 3CPWA 4C92E 3M59A 3QXEB 4JPBW 4LR6A 2RM4A 1WDXA 1X2KA 3DLLA 4MR4A 3EFOB 1Y0MA 2X4JA 3CCVT 3MQMA 4QT7A 4QSUA 4TU6A 5FFYA 4Y91A 4FYVB 1UB4A 4QC1A 1WYXA 3OYYA 2RB6A 2O9SA 4O7AA 4J9BA 4X34A 5DW2A 3I9QA 4A4KA 2HL3A 1OZ2A 2BUDA 1BYMA 1UGRB 3I5SA 5IN1A 2ABLA 1SEMA 4J9CA 5FW9A 4F7UE 2QYZA 4NQMA 3OMCA 2O2OA 5EQ1A 3G71A 4M77G 4PLLA 5IXFA 4E47A 2X51A 3HMHA 3O37A 4A4GA 2DZCA 5EPSA 1BKBA 4NR9A 1M30A 3V8KA 1MGQA 1MHNA 3G71Q 1WX6A 1BI2A 1M1KC 4BE1A 2BE7D 2FB7A 3RMSA 3JCMf 1AZGB 3S6WA 3JCMh 4OGJA 4Z88A 2A7YA 2KE9A 1LCKA 2ED1A 1Q82C 1VQ6T 5FWBA 1U06A 4CFLA 1PRMC 1VQOT 3QZSA 3VS5A 5CK9A 1BBZA 4IUQA 5F36A 3FDRA 2CT4A 1QP3A 4UIXA 2LJ3A 1YIJA 1PKSA 5II1A 4YYJA 1M2VB 3WXMB 4ZTJA 4FU6A 2MWOA 4OB0B 3QZ9B 4WCIA 2XDBA 4OB2B 4JLGA 5GMKl 2NWMA 1NYFA 2J05A 1YIJQ 1YCSB 2O4XA 1E7OA 1JM4B 2CSIA 2P0QA 4PNOA 4PFPA 4QYDA 3OSVA 1OU8A 4NL2A 5GAMd 4LE9A 5GANd 3UVDA 4IORA 5AD3A 4O78A 4M75D 3OS2A 5IGLA 5D0CA 4ME7A 2KSSA 4J9GA 1YJWA 2E7OA 3EHQA 2L89A 4YABA 5EPRA 1Q86C 2EYWA 2ENMA 4ZGEB 1YJNA 1VQ8A 2KVQG 4FIBA 1VQNA 1YJWQ 2FPDA 4JZ3A 3CMAT 4Q5WA 3EG9A 4XUBA 1SKUB 1UGSB 4J9HA 2KRSA 3M9QA 4XAXB 1VQ8Q 1VUBA 5GJWB 4A63B 1VQNQ 4BDYA 2KY9A 3JB9G 4Q0OA 2HSEB 2GBQA 2RFJA 3EG2A 4PJOA 5DLXA 4A53A 1AEYA 4IR4A 2EYYA 2HDAA 4E7HA 1X6OA 3OB9A 5CKDA 4MR3A 3M53A 1WNLA 4JS5A 4PJNA 1KFZA 4QKUA 5EM3A 2EJ9A 2XU8A 5M9OA 4LDWA 4E7LA 1BCOA 4IIMA 4C8QD 2CP3A 5EVAA 4HCCA 2J6KA 2CDTA 3NTIA 1SRMA 2ZPIB 3EG0A 3RKYA 1Q82R 4QY4A 3OYCA 2GRCA 1E6HA 3GBQA 3QSUA 3CPFA 4HKEA 5C87A 2X4YA 2CP5A 1K1ZA 5H85A 5L8RE 5HFQA 5EG2A 5FH7A 2C0OA 1YJ9A 3CC2A 4UITA 1ZSGA 5A5SA 2RI3A 2JZ2A 2CUDA 1YJ9Q 4QZSA 2WACA 4BW3A 5LKTA 4KV4A 3QJYA 4F3IA 4OMPA 5GJVB 1SF9A 4ELYC 5E0RA 4MZPA 4PJOF 4J7FA 4KRTA 4M7DD 1JU5C 3OA6A 5E9YA 4HBYA 2K4YA 1R0BG 4Z8AA 3RDVA 3QUIA 4M78A 3ONIA 1Q86R 3V7SA 4HBVA 1M9SA 2E6ZA 2ESWA 2X4WA 3P8HA 4HXJA 4AFUC 2A37A 4CC4B 3JCMg 2DXUA 1TTHB 3QO3A 4RTXA 5LJ0A 4LUEA 4N4IA 2BTTA 4C8QB 1M2VA 4PCEA 1YN8A 2E7NA 1N8RC 1F68A 5HJCA 3JCMP 3MP1A 2FG0A 4BW4A 3I55T 3OQ5A 2JTFA 2WSFE 1G3WA 2GTJA 4BW2A 4DEYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5EWC A;  3IU5 A;  3MEU A;  4LD6 A;  4A9O A;  3ZYU A;  4YYD A;  5IID A;  4Z93 A;  4NYX A;  5I83 A;  2K3Y A;  3L2W A;  1N72 A;  5I1Q A;  4OUF A;  4YYM A;  4A9K A;  5FFV A;  5HQ7 A;  4KV1 A;  4QR4 A;  5ENE A;  4IR3 A;  4TZ8 A;  5CGP A;  5E3D A;  4RG2 A;  3OYM A;  4TYL A;  1X0J A;  3S91 A;  2YDW A;  4TQN A;  3U5N A;  3FKM X;  5F61 A;  2DKW A;  3MEA A;  4CFK A;  4HBX A;  4WIV A;  4QSQ A;  5DKH A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 5CUC A;  3CCM Q;  3OYL A;  2YW5 A;  4RTW A;  2R58 A;  2OO1 A;  3CPW A;  4C92 E;  3M59 A;  3QXE B;  4JPB W;  4LR6 A;  2RM4 A;  1WDX A;  1X2K A;  3DLL A;  4MR4 A;  3EFO B;  1Y0M A;  2X4J A;  3CCV T;  3MQM A;  4QT7 A;  4QSU A;  4TU6 A;  5FFY A;  4Y91 A;  4FYV B;  1UB4 A;  4QC1 A;  1WYX A;  3OYY A;  2RB6 A;  2O9S A;  4O7A A;  4J9B A;  4X34 A;  5DW2 A;  3I9Q A;  4A4K A;  2HL3 A;  1OZ2 A;  2BUD A;  1BYM A;  1UGR B;  3I5S A;  5IN1 A;  2ABL A;  1SEM A;  4J9C A;  5FW9 A;  4F7U E;  2QYZ A;  4NQM A;  3OMC A;  2O2O A;  5EQ1 A;  3G71 A;  4M77 G;  4PLL A;  5IXF A;  4E47 A;  2X51 A;  3HMH A;  3O37 A;  4A4G A;  2DZC A;  5EPS A;  1BKB A;  4NR9 A;  1M30 A;  3V8K A;  1MGQ A;  1MHN A;  3G71 Q;  1WX6 A;  1BI2 A;  1M1K C;  4BE1 A;  2BE7 D;  2FB7 A;  3RMS A;  3JCM f;  1AZG B;  3S6W A;  3JCM h;  4OGJ A;  4Z88 A;  2A7Y A;  2KE9 A;  1LCK A;  2ED1 A;  1Q82 C;  1VQ6 T;  5FWB A;  1U06 A;  4CFL A;  1PRM C;  1VQO T;  3QZS A;  3VS5 A;  5CK9 A;  1BBZ A;  4IUQ A;  5F36 A;  3FDR A;  2CT4 A;  1QP3 A;  4UIX A;  2LJ3 A;  1YIJ A; 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