4NS5A

Crystal structure of human bs69 bromo-zinc finger-pwwp
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
209
structure length
185
Chain Sequence
QEMGTYLRFIVSRMKEVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNIHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human BS69 Bromo-ZnF-PWWP reveals its role in H3K36me3 nucleosome binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
molecule tags Transcription regulator
source organism Homo sapiens
total genus 66
structure length 185
sequence length 209
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ns5A01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4ns5A02
4LZSA 5G4RA 2CKKA 4UIWA 4BD3A 2X4WA 5EA1A 5KTWA 5J39A 5CU8A 4YBTA 4NR9A 4LR6A 1XNIA 2PQWA 4HXLA 5EWVA 2R0YA 4OGIA 5F60A 1EQFA 4C5HA 5KO4A 3U5JA 4BDZA 3OYDA 3S92A 2XK0A 3ASKA 5F1HA 4O7EA 3NTIA 4O77A 4B9XA 3L2QA 5A5NA 3U5LA 2HQEA 2I7KA 5C87A 4XYAA 5EPBA 2FSAA 2RS9B 5F3AA 5D3PA 3DB4A 5I88A 4XUBA 4O7AA 5F1LA 3PNWC 3PMTA 3AADA 4QSVA 5D3RA 2D9TA 4NXJA 4LYIA 4BW4A 2K3YA 2LTOA 2I8NA 3QJ6A 4Y03A 3U5OA 1F68A 5E9IA 3PMIA 5E7DA 3IU5A 2RHIA 3C4SA 5C89A 2X4YA 4Z6IA 4QQDA 3JVMA 2R5AA 5E73A 4MR3A 3ZYUA 4YAXA 1WUGA 4HBXA 5FE0A 4CFKA 5BT3A 5KTXA 5FRMA 3QIIA 4O70A 5II1A 5M9OA 3OYFA 2DVQA 5ENFA 5H1TA 3GOXA 3HMEA 2H60A 3OYNA 2F6NA 5FFWA 3JVLA 5L8UA 1ZS5A 5FRNA 4Q0OA 5FBXA 2RHXA 5EU1A 4MR6A 4QC1A 4QZSA 4QR5A 5EWWA 4Z02A 4ALGA 4UYEA 2OUOA 3MULA 3L2VA 3FC3A 3DWYA 4TYLA 5DYUA 4YBMA 3P8HA 4E7HA 2RJCA 4CUUA 5FE5A 4A9IA 4YYDA 4O7FA 2K3XA 5CY9A 2O4XB 3G0JA 4PTBA 2DKWA 4QSXA 3O8VA 5DW1A 4YYMA 4HBVA 2KTBB 4XY9A 5D7XA 4YY4A 5IN1A 5IGLA 5KE3A 4J1PA 3GG3A 4YH4A 4O7BA 2RFJA 5EWDA 4CUPA 2VYTA 5C0MA 5FH7A 2OO1A 3DAIA 2D82A 1OZ2A 1X0JA 4A9JA 4NR6A 5CQ6A 4OGJA 4J0SA 4IOOA 4C5GA 2L8DA 3L2UA 5DKCA 1H3ZA 5ENJA 3U5KA 2NLUA 3MEWA 3U5PA 5A5SA 5KCOA 4MR4A 2WP1A 4HXKA 5E9VA 5F25A 3UW9A 5IGMA 4UYFB 4ZQLA 3M9QA 3SVFA 4IUQA 3LJWA 4WHWA 4A9NA 3OS1A 4QEVA 4Z1SA 5EP7A 5CS8A 2QQRA 4HBYA 4QSQA 2M16A 3OB9A 3P1DA 4RVRA 4UIVA 4N4HA 5D6XA 4BW3A 1N27A 4FL6A 5EGUA 4CUQA 3O35A 5FB1A 3FKMX 2RJDA 5ENGA 4GY5A 4NUEA 5FH6A 4EDUA 4UIXA 4Z93A 4A9LA 4YATA 1RI0A 4PLIA 2MWPA 3TLPA 5II2A 2L89A 5FE7A 5EV9A 2IG0A 3E9FA 4YC9A 5HRVA 4YADA 4WIVA 5COIA 4B9WA 2MJVB 4YYJA 1E6IA 3ONIA 5EM3A 2M1HA 5IG6A 2FHDA 5CRZA 5FE4A 5CRMA 5HEMA 2RJFA 4CURA 5C6SA 4QSUA 4QVZA 2YEMA 5HQ7A 3MP8A 2GFAA 5ETDA 5LKUA 5E9KA 4QBMA 5FDZA 4CUTA 3OS2A 5FH8A 4Q0NA 5ENIA 3P5OA 5IGNA 3UT1A 4A4HA 4E7JA 2E7NA 3MB4A 4TU6A 5LUUA 3NTKA 4NYXA 4LRGA 5FFVA 4YY6A 2GF7A 4BE0A 4IOQA 2YRVA 4HCZA 5FG4A 5CQ8A 3S3MA 4OUFA 4CUSA 5L97A 4MEQA 4YYHA 3SVHA 4PKLA 4MEPA 1OI1A 5BT4A 4CL9A 2LVMA 3HMFA 5E3GA 2EKOA 4NS5A 4UYGA 1KHCA 5EPSA 5HLSA 3OYKA 3JVKA 4HXNA 4CLBA 5KHMA 3O36A 3LX7A 2O4XA 5ETBA 5EWHA 4NR8A 5H85A 3H6ZA 3UVDA 3OYHA 5HRXA 3ZEHA 3QKJA 5I83A 4TT4A 5DW2A 5J0DA 5E74A 4HXOA 5FE6A 5I1QA 3LGFA 5I80A 5I89A 1JSPB 4E7IA 2BKDN 4QSSA 3I3JA 5DYCA 5E9YA 4J3IA 3FDRA 5DBMA 5FE2A 5HM0A 3OA6A 5BT5A 5EI4A 5I40A 5FB0A 2LDMA 5E0RA 5C7NA 5D24A 4A9KA 5CIUA 4A4EA 3LQHA 5JI8A 4O72A 5D3TA 5D3SA 2R58A 4MENA 3MXFA 4TU4A 3MEUA 4UIUA 5D3LA 5D6WA 3IU6A 5EK9A 4IUVA 2RO1A 4QW2A 2EQUA 4MEOA 4HXSA 4UYFA 4NUCA 4C67A 4BE2A 3P1FA 5F62A 2R0VA 5HCLA 4O7CA 4TTEA 5LVRA 5TB6A 4C5IA 5F36A 5CUDA 2RNYA 5L96A 5AMFA 3MUKA 4Q5WA 4A4GA 4NR4A 4QQGA 3UWNA 3META 4IR3A 5LKXA 4QQ6A 2F6JA 4BDYA 5DX4A 5I86A 4QEUA 5D3HA 4L59A 4QUTA 3MP6A 2BUDA 4TT2A 4O78A 3D7CA 2WACA 5A81A 4FLPA 5K29A 5LJ2A 4LYWA 4YK0A 4IUPA 5H1UA 5IIDA 3O37A 4QSWA 5CTLA 5HFRA 3LLRA 5A83A 5DFCA 5ENBA 4NRCA 5IBNA 5DYXA 3K2JA 2DVSA 2DAQA 2BIVA 5FE3A 4O71A 5A5QA 3FEOA 5HENA 2NXBA 2L84A 5D6YA 5F63A 4N4FA 4YH3A 2OSSA 3OS0A 4QUUA 2G3RA 4N4GA 3OYJA 2YDWA 3QZSA 4QSPA 3BDLA 3UVYA 3H8ZA 4PY6A 4QYDA 2EFIA 2E5QA 3F70A 5D0CA 2DWWA 5CUCA 3Q1JA 5AD2A 5EVAA 5AD3A 3DB3A 4IUUA 3QZTA 5CP5A 5E3DA 2R5MA 5HELA 4BACA 4YYIA 4IORA 2B8AA 5E9MA 5DKHA 5HFQA 5A5PA 3O34A 5D25A 5H1VA 3RCWA 3FLGA 4IKFA 4IR4A 1JM4B 5ENHA 2RI2A 4A9FA 3NTHA 4QC3A 3QZVA 5LJ0A 3L2WA 2RI5A 4QY4A 3AQAA 5CPEA 4XUAA 4A9MA 2RHZA 5L8TA 5LVQA 3LGLA 2DIGA 2RO0A 4C5EA 5LJ1A 5HQ5A 4IUTA 4BW2A 5DFDA 2L5EA 5DLXA 5DFBA 5FE1A 5D3NA 3UVXA 4CFLA 4X2IA 5CQAA 5F61A 3OYAA 5LKTA 2DIQA 5CFWA 5IGKA 5A82A 2DATA 3PFSA 5C85A 4UIYA 4ALHA 5CQ3A 5A5OA 4O76A 5L99A 2M0OA 2QQSA 3UV2A 4NYVA 4X34A 4KV1A 2X4XA 4HBWA 4LZ2A 4C66A 2D9EA 2F5KA 2JZ2A 3OYBA 4QR3A 5FFYA 5EISA 5C8GA 3EAEA 4KCXA 4UIZA 4N4IA 4N3WA 5ENEA 1WJSA 4IURA 4ZC9A 4NRAA 5A85A 4YYKA 3Q2FA 4BHWA 5A7CA 3OMGA 5FE9A 2RJEA 2RNWA 5KTUA 5DKDA 2HQXA 5HQ6A 3OYGA 4NRBA 2G4AA 4BE1A 3HMHA 5FROA 5DLZA 4LYSA 4NR7A 2JTFA 3S6WA 3MP1A 1N72A 5DYAA 3MQMA 5IAYA 4LZRA 4J0RA 1WGSA 3O33A 2XDPA 5F5ZA 2RNXA 4YABA 4OVAA 5JWMA 4UYHA 4UYDA 5EWCA 2N9GA 4NQNA 4DONA 4LDFA 5CQTA 1OZ3A 3UV5A 2RI7A 5E9LA 5D3JA 4XY8A 3LQJA 3P8DA 4A4FA 5FE8A 2YW5A 5I29A 2EQMA 3LXJA 4ZTJA 2X35A 4TQNA 5FG5A 2YYNA 5J26A 2R0SA 4O74A 4NR5A 4PL6A 5C4QA 2MWOA 3NXBA 4ZTFA 3E9GA 5CZGA 4UC4A 3SD4A 1G5VA 4YYGA 3MEAA 4UITA 5CUEA 4QSTA 4PS5A 3L2RA 4RG2A 4LC2A 4O75A 3G0LA 2EQJA 5AMEA 3Q2EA 5G4SA 1MHNA 4FU6A 5KE2A 2GRCA 5CUGA 4MR5A 3OYIA 2DVRA 4TZ2A 2WP2A 4E96A 4QYLA 3L42A 5CQ7A 5ACYA 2LRQA 2L85A 4IR5A 4GPJA 4Z1QA 2E7OA 4BW1A 3U5NA 5TCMA 5L98A 3S91A 5I7YA 5D26A 4A9OA 5FG6A 4IR6A 4TZ8A 4WHUA 2R10A 4HXPA 1WJQA 4PCEA 3LH0A 3OYMA 3UVWA 3U5MA 3OYEA 4PCIA 5CQ5A 3UV4A 3ME9A 4PLLA 5I7XA 2RI3A 4BJXA 5A5RA 3S3NA 4HXRA 2R57A 2E3KA 2YQDA 5EPRA 2RHUA 4Z6HA 4A9EA 5CUBA 2LCCA 5HJCA 3CEYA 5HRWA 4QNSA 3LQIA 4YBSA 4YYNA 5EQ1A 3JVJA 5EICA 1WUMA 4QSRA 3MB3A 4QR4A 2RHYA 4HXMA 3OYCA 2YELA 3OQ5A 5KCHA 5F2PA 1SSFA 4QEWA 5LKZA 4A9HA 3DLMA 3MO8A 3QBYA 3MEVA 4II1A 5CQ4A 4E7LA 3KUFA 4NUDA 3OMCA 5KU3A 3SVGA 4F3IA 3P1EA 5CUAA 5KH6A 4KV4A 5DY7A 2YEKA 4NQMA 1OYXA 5ENCA 5CGPA 4NYWA 1WJRA 2DVVA 3LYIA 3OYLA 2E6NA 4ZW1A 3S3OA 4QB3A 2LSPB 4TT6A 4TS8A 2GFUA 2L3RA 2P0KA 4E7KA 2EQKA 4AKNA 4LD6A 3P1CA 4CRIA 3OY9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LZSA 5G4RA 1BCMA 4BD3A 5J39A 1RAEB 1XNIA 1VQLT 2OI3A 3CCQT 2KY9A 2MF2A 3ASKA 2KRMA 4O7EA 3L2QA 1U8RA 3U5LA 4C0ZA 4ME7A 4Y92A 5C87A 4XYAA 4EMGA 2FSAA 1NLPC 3MKDA 3PMTA 1HD3A 2MCNA 3A8OB 3HSBA 4AI6A 2IVWA 4OB3B 2KQWA 5GAMf 4ATOA 4OGEA 4Y91A 2RHIA 1CSKA 2X4YA 2FRWA 4HCKA 1NYGA 2LT1A 2EYQA 2R5AA 1EZZB 4J9BA 4HBXA 2RK2A 1AZGB 5M9OA 5ENFA 3GOXA 1QKWA 3OYNA 2F6NA 5FFWA 1ZSZC 5FU7B 2RHXA 2EW3A 4QZSA 1PSFA 2DNUA 4Z02A 2O9SA 1D1AA 4AFQC 2P84A 1B07A 3CCET 5LJ3e 1VQNQ 1EFNA 5FE5A 2D8HA 4CI0C 2LCLA 4O7FA 3BDUA 5CY9A 1KK7A 1VYTA 3G0JA 3CMAA 4MZMA 2DKWA 4QSXA 4LDVA 2KK4A 5DW1A 1M2VA 4XY9A 1B34A 4YY4A 1WNLA 1WFWA 1I5OB 2JW4A 4E6RA 1Q7YC 4O7BA 3QWYA 4CUPA 1P92A 3WXMB 2DRMA 1KJWA 2D82A 3R6OA 1OZ2A 4WF2A 4ZGDB 2QA4Q 4DOVA 3JCMQ 3J81E 2CT3A 5CQ6A 2QQBA 3M0PA 1KC8U 2LP5A 3QWXX 1KD1R 2XMFA 4FSXA 5DKCA 2Y4XA 1H3ZA 2NLUA 3MEWA 5KCOA 3JB9F 2V8IA 2QTVA 3HHTB 1UGRB 1UGSB 4XTZA 4ZGJB 4HVVA 1QWFA 4ZQLA 1ZSZB 1KQ2A 2H3EB 1DJ7B 4XQ3A 3LWHA 1TTHB 2KRSA 4HBYA 1NG2A 2FPEA 3H0FA 4KGVB 4RVRA 4UIVA 2XU8A 5EGUA 5D7UA 5FB1A 2DERA 2F2WA 5GMKe 5FH6A 4Z93A 4A9LA 3FJ5A 1RI0A 4PJOC 5II2A 4CC7A 3E9FA 4DBRA 5LJ5j 4JS4A 4B9WA 2MJVB 5IG6A 2FHDA 5CKEA 2QEXQ 2YRDA 1KG1A 1AVZC 2YEMA 3JCMJ 1RADB 5LKUA 1ZBXA 4QBMA 4CUTA 2Y4YA 3C0CA 5DM7R 2DMOA 3UT1A 3MB4A 2DETA 2E64A 5FFVA 4YY6A 2GF7A 2XIDA 3M0SA 4BE0A 4IOQA 5FG4A 2CP5A 4PJOG 3SVHA 5BT4A 4JZ3A 4F7UF 4XTYA 3CCLA 1WPYA 5EPSA 1VQ6T 5KHMA 1RAGB 3REBB 2EGEA 1PSEA 3H6ZA 5GAMj 4AG2C 4OMOA 5DW2A 5A0GA 5FE6A 2D1XA 5I80A 5I89A 4E7IA 4DQ2A 2BKDN 2LZ6B 3INZA 2JMCA 1KQSA 2YLBA 1WDXA 4KGZB 5LJ3g 5DBMA 4RKUE 3EG9A 5D24A 4A9KA 4A4KA 3LQHA 4J9FA 5D3TA 5D3SA 3X28B 1HJDA 4TU4A 4OMQA 5GAOm 4PJJA 1GBRA 4HA8A 4BE2A 3P1FA 2C0OA 5LVRA 2CSIA 2RMOA 2B86A 1I8FA 5L96A 1TUGB 3GNGA 1IGQA 4A4GA 1Q82C 3META 1ZUUA 5LKXA 1K9MU 2I2LA 1Q95G 1SHFA 3TSWA 4KBMB 2KT8A 2HD0A 4L59A 1AWOA 4QUTA 4C92F 3MP6A 2BUDA 4TT2A 3D7CA 2HDAA 1VQKQ 4PFZA 4FLPA 4D8KA 5K29A 4LDUA 2W10A 2LQNA 5H1UA 2DKGA 1PKTA 2DYIA 1YI2T 3AHUA 4QSWA 3QHSA 3LLRA 5A83A 4J7FA 2DYBA 1QKXA 5DYXA 2YXYA 3M0TA 4O71A 5A5QA 1O75A 1ZA2B 4M77E 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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