4NS5A

Crystal structure of human bs69 bromo-zinc finger-pwwp
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
209
structure length
185
Chain Sequence
QEMGTYLRFIVSRMKEVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNIHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human BS69 Bromo-ZnF-PWWP reveals its role in H3K36me3 nucleosome binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
molecule tags Transcription regulator
source organism Homo sapiens
total genus 66
structure length 185
sequence length 209
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ns5A01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4ns5A02
4QBMA 5KTUA 4XUAA 3OYDA 5A5RA 3H6ZA 2VYTA 5CQ5A 4QSSA 5FH8A 3MB3A 1WUGA 2DWWA 3DWYA 3JVLA 5D24A 2MWPA 5KCHA 5A81A 3L42A 1N27A 4QEVA 2R0VA 4QSQA 1SSFA 3QIIA 4NUDA 4O76A 5C8GA 3PNWC 3FLGA 4J1PA 2YEKA 4NR7A 4E7HA 5HENA 5I86A 5HCLA 1MHNA 4IORA 4ZQLA 4E7LA 2K3YA 4CL9A 4TU4A 4YH3A 3Q2EA 5EV9A 3E9FA 3U5NA 5D3LA 4YBSA 4PCEA 3MB4A 1F68A 4TT2A 5DKDA 5FFYA 2R0SA 4WIVA 1JM4B 4XYAA 4QC1A 5FG5A 3MEAA 1G5VA 4O70A 4PLLA 4E7KA 3S3MA 4C5HA 4QSVA 4TU6A 4A9EA 2O4XA 5D6WA 5II1A 3UVWA 4O72A 4LDFA 3I3JA 2L89A 3H8ZA 5DKCA 3UT1A 5IIDA 5EI4A 3U5OA 4YYMA 4QNSA 5A85A 4LYIA 4QEWA 4LRGA 4UIZA 4HXLA 3U5MA 5EPBA 5LJ2A 5HQ6A 3OYHA 3PMTA 3SD4A 2EQMA 2I7KA 5CUBA 3MEWA 3MULA 2RJDA 4IUTA 5DLXA 5E3GA 4HBXA 4L59A 3L2UA 5E9YA 2EQJA 3MXFA 2RJEA 5FG4A 2QQSA 1WJRA 5TB6A 2GFAA 2L3RA 5FBXA 4ZC9A 4OGJA 2RI3A 5ENFA 2M0OA 4Z02A 2YRVA 5C4QA 3LGLA 1WUMA 3OY9A 2JZ2A 4QYDA 4ZTJA 4LZRA 5CPEA 3NTKA 4MR5A 3ONIA 2RS9B 4C5IA 4WHUA 5A82A 4QUTA 5G4SA 5I7YA 4F3IA 5HRWA 5D7XA 5F1LA 5ENBA 4QQGA 2YEMA 4QYLA 5E9VA 4HXRA 3UWNA 4IKFA 2R10A 3OYFA 4KCXA 4UIYA 3OYGA 3ASKA 2D82A 4N4HA 5ENCA 5A5PA 5LJ1A 4CUTA 5I7XA 4BW2A 2X4WA 4MR6A 5EWWA 4A9MA 4NR8A 2FHDA 2P0KA 4XY9A 5D3SA 2F6NA 4CUQA 4BW4A 5EWCA 3KUFA 3OYBA 5FROA 2RFJA 4PTBA 5F2PA 2RJCA 4GY5A 4CRIA 4ZTFA 2RJFA 5DYCA 5EM3A 4OVAA 4MR4A 4AKNA 2YQDA 4A9FA 4Q0OA 2G3RA 2GFUA 5LVQA 4QZSA 4YAXA 2WACA 2FSAA 4QSTA 3P1DA 5CTLA 5FB0A 5A5SA 4N3WA 5DFDA 5L98A 3M9QA 5KTXA 5IN1A 4A4FA 2BKDN 4CFLA 4YYIA 2L5EA 5DY7A 4QR4A 4A9IA 4NR4A 3EAEA 3LGFA 1OZ3A 5IAYA 5KTWA 4BACA 4TTEA 1WJQA 3MUKA 5EISA 2F5KA 4NR6A 4QY4A 5I1QA 3LYIA 3JVJA 5EPRA 4O77A 3GG3A 4MEOA 4LR6A 2M1HA 3OA6A 3OYLA 5FRNA 5LKTA 5EGUA 4MR3A 3OYEA 4HCZA 4DONA 3S3OA 2RI2A 4A4HA 3OYIA 4QSPA 3LQIA 5A5OA 5C0MA 5BT3A 3BDLA 5F36A 4A9HA 4CFKA 5ENGA 2K3XA 4QR3A 4YYHA 1N72A 4XY8A 5D6YA 2WP1A 5HELA 5C85A 5EWHA 3E9GA 1EQFA 5KO4A 5COIA 5L97A 5EWVA 4TYLA 3JVKA 3FEOA 5FH6A 4CUUA 5K29A 5D0CA 5KCOA 5DFBA 5FE5A 5D6XA 4YC9A 3P1EA 4C66A 4X2IA 5ETBA 2GRCA 4TZ2A 4B9XA 2M16A 4NYVA 4O71A 4ALHA 2XDPA 3O34A 5LKUA 5CUEA 5I80A 4HXPA 5HQ5A 5F25A 5CUGA 2LRQA 3P1FA 2DIQA 5D26A 4HBVA 3U5JA 2PQWA 3O8VA 3LLRA 5CQ8A 3O33A 3META 5EPSA 5LVRA 3L2RA 5J26A 4O75A 2RHUA 4LC2A 2DVQA 3NTIA 5CP5A 2L85A 5E9MA 5F3AA 2BIVA 5DBMA 5FB1A 5FE4A 1RI0A 3OMGA 4LZSA 3SVFA 4Z6IA 5E9IA 2YELA 5FDZA 5IGNA 5FFVA 4NRAA 4EDUA 5HM0A 4QUUA 3LXJA 4LZ2A 5EQ1A 5HFRA 4A4EA 3U5LA 2OSSA 2X4YA 3LQHA 4HBYA 2MJVB 4E7JA 3IU6A 5F60A 3MP6A 4HXOA 4IOOA 2X35A 4ALGA 5A7CA 3CEYA 5CQ7A 4Z1QA 4GPJA 4YYNA 3QKJA 3DAIA 4YBMA 5JI8A 5F61A 5CUDA 4OGIA 4C67A 4UYDA 5EU1A 4UIVA 5A83A 2L8DA 3MQMA 4IUPA 3IU5A 5DYUA 5M9OA 3ZEHA 2E6NA 4MENA 4NS5A 4TZ8A 2LVMA 3OYJA 5CUAA 1H3ZA 5F62A 2BUDA 5C6SA 4J0RA 5E0RA 4N4FA 4NR5A 5ENHA 5AD3A 4UYHA 5IG6A 4UIUA 4UC4A 4CLBA 4QC3A 2HQEA 5J39A 2CKKA 5I29A 2LDMA 4PKLA 3OYNA 4MEQA 2R5AA 3QZVA 5FH7A 4YY4A 3SVGA 4O7FA 2DVVA 4MEPA 5CRZA 5KHMA 5FRMA 4BE2A 2X4XA 5FE6A 4N4GA 4WHWA 2DATA 5ETDA 4RVRA 5CQAA 3MP8A 4O7CA 5FG6A 1ZS5A 4YYGA 2QQRA 3LQJA 3MO8A 5H85A 5BT5A 2EQUA 5KE2A 3QJ6A 4PCIA 3O37A 5DYAA 5J0DA 4KV4A 4IR5A 3OYAA 4QSXA 2E3KA 4HXNA 5DLZA 2L84A 5CQ4A 2XK0A 5FE2A 4ZW1A 5KU3A 5CQ6A 4PS5A 2GF7A 4PL6A 4NXJA 5CUCA 5BT4A 4BE1A 4NQNA 3OQ5A 5E3DA 3RCWA 4XUBA 4IR6A 5HFQA 5F5ZA 5FFWA 2R0YA 3MP1A 3UVDA 2YW5A 3UV5A 5FE3A 3FDRA 4NUEA 2D9TA 2RHXA 5CS8A 4UYFA 3F70A 5KE3A 5L8TA 2RO0A 3AADA 4PLIA 5A5NA 4C5GA 4Q5WA 5L96A 3Q2FA 5LKXA 5HQ7A 4YATA 2RNYA 3GOXA 4A9JA 4Y03A 5D3HA 2G4AA 3PFSA 4BD3A 4QB3A 1OZ2A 4IOQA 4UYGA 3O35A 5DW2A 3ZYUA 4IR4A 4YYJA 3MEUA 4IUQA 3UV4A 2LTOA 2I8NA 5DW1A 1E6IA 4IURA 3UV2A 4J3IA 5LKZA 3QZSA 3OYMA 2H60A 4BW3A 4QQDA 4LD6A 5HRVA 4TS8A 5L99A 3L2WA 1JSPB 5DKHA 5FE1A 3HMHA 4KV1A 5F1HA 4LYWA 5EWDA 5CZGA 1X0JA 2D9EA 4CUSA 5ENIA 1WJSA 4Z1SA 5HRXA 2OUOA 5E74A 3LJWA 4UIWA 5EA1A 1OI1A 5JWMA 5CQ3A 4NYWA 5CFWA 2E5QA 5FE9A 4C5EA 5I89A 5D3PA 3QBYA 5I88A 2WP2A 5CRMA 2YDWA 3NXBA 4TQNA 2DKWA 2RNXA 5ACYA 2OO1A 3DLMA 4E96A 3K2JA 5LJ0A 5HLSA 2HQXA 2E7OA 4YYKA 4NUCA 3Q1JA 4E7IA 4UYEA 4PY6A 2DVRA 3S91A 4IUUA 5I83A 4B9WA 4NRCA 4O7BA 4O7EA 2DIGA 4NRBA 3P8DA 4YADA 5E9KA 5II2A 4YY6A 3SVHA 4UYFB 4FU6A 3U5PA 3D7CA 5DFCA 5DX4A 4X34A 5FE0A 3OS2A 4UIXA 5IGLA 4BJXA 4O78A 4QEUA 3AQAA 4BDYA 4NYXA 4QSWA 2EQKA 4FLPA 5A5QA 4Z93A 3DB3A 3DB4A 3UW9A 3LH0A 4BE0A 5CY9A 4O74A 3QZTA 5H1TA 2RI5A 5EP7A 3S92A 4HXMA 2DVSA 3P8HA 4HXSA 5C87A 4IUVA 4LYSA 5E7DA 4BHWA 3C4SA 4QVZA 5CGPA 3UVXA 4NQMA 4BDZA 2LSPB 5LUUA 3L2VA 4YBTA 4QQ6A 2R57A 2IG0A 3OMCA 2EKOA 5E73A 4IR3A 4II1A 4YK0A 5DYXA 4OUFA 1XNIA 5IGMA 3JVMA 1WGSA 3P5OA 2RHIA 2F6JA 4Z6HA 1KHCA 3FC3A 2YYNA 3G0JA 2N9GA 4A9LA 5FE7A 2JTFA 4O7AA 5AMEA 3ME9A 4QSUA 5EVAA 2LCCA 4UITA 3TLPA 5ENEA 5D3TA 5HEMA 5IBNA 5C7NA 2RHYA 3OS0A 2RO1A 4J0SA 4HBWA 2EFIA 2RI7A 3PMIA 4YYDA 4BW1A 5C89A 3OB9A 3MEVA 5D3JA 4N4IA 3OYCA 4Q0NA 5KH6A 5D3RA 4A9OA 5FE8A 4QSRA 3UVYA 4QW2A 4CUPA 3OYKA 5EK9A 3HMEA 5TCMA 2MWOA 5HJCA 4TT4A 3U5KA 4FL6A 2O4XB 5D25A 3OS1A 5L8UA 5E9LA 4CURA 3S3NA 4TT6A 2RNWA 5IGKA 5D3NA 2B8AA 3NTHA 3G0LA 5ENJA 2DAQA 1OYXA 2RHZA 4YABA 4A9KA 4A4GA 4YH4A 2NLUA 4NR9A 5AD2A 3HMFA 5H1VA 2KTBB 3FKMX 2R5MA 2E7NA 4HXKA 4RG2A 5CIUA 3LX7A 2NXBA 5EICA 5AMFA 2R58A 5G4RA 3O36A 5H1UA 5I40A 5CU8A 3S6WA 5F63A 3L2QA 4QR5A 3P1CA 4A9NA 5CQTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1W2BA 4QBMA 1YIJA 8AT1B 3JB9J 5CQ5A 3MB3A 4VUBA 1VQ5Q 3JVLA 3DWYA 2P84A 4A4KA 2PUOB 4OMFB 4QEVA 3QIIA 4O76A 3PNWC 3VKIA 3JCMd 4NR7A 1DJ7B 3QDRB 1CKBA 1NEBA 4HA8A 1WHJA 2DILA 4C0GA 2AKLA 3PE0A 4M4ZA 5HCLA 4ZQLA 2A36A 2RF0A 2K3YA 1G8XA 2LCLA 5EV9A 4QVDA 5D3LA 4PCEA 3CCRT 1F68A 5DKDA 3BW1A 2OAWA 2X3WD 3HRTA 3M59A 8ATCB 4QC1A 2QQAA 2KR3A 1KC8U 4O70A 2K2MA 1WHLA 4E7KA 2QXFA 4ZGEB 1VUBA 2JS0A 3PVQA 4A9EA 2XIDA 2YUQA 4OMOA 3VKGA 4JZ4A 2DA9A 4V2SA 4J5YA 4F7UA 3OSVA 5IIDA 3I5RA 4YYMA 3RMQA 2HEQA 5A85A 3RKWA 4QEWA 2GQIA 2X3XD 4LDYA 1YBYA 1BIBA 3M0QA 2LC4A 2I7KA 1KQSS 3MULA 1AOJA 4M77E 1SF9A 4HBXA 2EQJA 5GAOm 3QZ9B 1K0XA 3QO3A 5GAOl 4OP0A 4J6WA 2EIFA 4OGJA 4X9DA 1QCOA 2M0OA 5C4QA 3VUZA 2E5KA 1H641 4ATOA 2JZ2A 4RTXA 4LZRA 5CPEA 3NTKA 3ONIA 4OB0B 4WHUA 3CCST 4QUTA 1KQ2A 5KYNA 1ZSZC 5E9VA 2JXBA 1TXQA 3OYFA 1ZQ1A 5FWBA 5ENCA 1QP3A 2KMTA 1P92A 4CUQA 4BW4A 5EWCA 4JLGA 4PTBA 3GBQA 3QXEB 5IH2A 5EM3A 4OVAA 2RMOA 2PTKA 4M75C 1VQOT 4A9FA 2G3RA 2FSAA 5IN1A 5L98A 3M9QA 2LZ6B 4YYIA 2LNHB 2RM4A 4QR4A 1VQ7T 5IAYA 5KTWA 4BACA 4TTEA 3MUKA 4NR6A 4QY4A 2LX9A 5IXBA 1NLOC 4C92F 3H41A 3EHQA 4MEOA 4Y91A 1UJYA 3PVLA 3CCUQ 4R0KA 5EGUA 1QLYA 1ZUYA 3S3OA 1YITA 4A54A 2KRSA 5FLXE 5GAMg 1BI3A 1Q82U 5C0MA 2P4TA 3BDLA 3R6OA 4A9HA 1AHJB 2QEXQ 1JO8A 1N72A 1A0NB 3OW2S 3EFRA 5CO7A 2WP1A 2CP2A 5EG2A 5EWHA 3QUIA 3E9GA 1UECA 2ZPFB 1AWOA 4RG8A 3FEOA 5FH6A 1GCQA 4CUUA 3CCLA 5CQYA 5DFBA 4YC9A 1QVGS 3QZ5B 1SEMA 4B9XA 1R77A 3EGDA 2XDPA 2O88A 3O34A 1IB8A 4R56A 3ER0A 5HQ5A 1GXIE 1VQ8Q 4FT4A 3G4SQ 2DIQA 2PQWA 3LLRA 1JXMA 2P4RA 5LVRA 4F17A 1Q81U 4DQ2A 4M7DD 2YLBA 2YLCA 5F3AA 2BIVA 5DBMA 4JRIA 4JS5A 1WXUA 5KYUB 4LZSA 3SVFA 3R6NA 5IGNA 1KQSP 1I81A 4LNPA 4NRAA 5LJ5j 5HFRA 5EQ1A 4A4EA 1YJWQ 2OSSA 2X4YA 1RAEB 4HVWA 1VQPT 4Y92A 3IU6A 1JQQA 2X35A 1ZLMA 4AKGA 4Z1QA 2ENMA 3QHSA 2KDSA 4YBMA 3CCQT 3QWXX 1Q7YU 2OTLQ 5CUDA 4M7AG 4UYDA 4EMKA 4AFZC 4F16A 1V76A 4CC7A 4IUPA 5M9OA 3CMAA 3VS2A 3G6EQ 1MMNA 4TZ8A 1FX7A 1LOJA 3A98A 1ZSGA 4O5VA 1K73U 5C6SA 4KGVB 4N4FA 2E4HA 1ZA1B 1UUEA 2A0FB 2DRKA 5FU7C 4BI4A 3NHNA 4OMMA 4CLBA 3SEMA 2RQVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4TT6 A;  2RNW A;  5IGK A;  5D3N A;  2B8A A;  3NTH A;  3G0L A;  5ENJ A;  2DAQ A;  1OYX A;  2RHZ A;  4YAB A;  4A9K A;  4A4G A;  4YH4 A;  2NLU A;  4NR9 A;  5AD2 A;  3HMF A;  5H1V A;  2KTB B;  3FKM X;  2R5M A;  2E7N A;  4HXK A;  4RG2 A;  5CIU A;  3LX7 A;  2NXB A;  5EIC A;  5AMF A;  2R58 A;  5G4R A;  3O36 A;  5H1U A;  5I40 A;  5CU8 A;  3S6W A;  5F63 A;  3L2Q A;  4QR5 A;  3P1C A;  4A9N A;  5CQT A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1SG5 A;  2IPO B;  2MIO A;  1PG5 B;  1M8V A;  1YJN T;  5HRX A;  3CCL Q;  2E65 A;  2COW A;  4C0F A;  2JNG A;  2E5Q A;  1OX8 A;  2JJ9 A;  4C5E A;  5D3P A;  3QBY A;  5CRM A;  2I2L A;  1PWT A;  3NXB A;  2DNU A;  2EYZ A;  2HSE B;  2RNX A;  5ACY A;  4M77 D;  4MZT A;  1D0X A;  1KQ1 A;  2YDL A;  5HLS A;  2GTJ A;  2L3Q A;  3JV3 A;  4YYK A;  5GAN j;  1MGQ A;  1WIE A;  1VQN Q;  4IUU A;  5CKB A;  1GL5 A;  4YAD A;  4PJN A;  5E9K A;  1WZO A;  3CD6 A;  5DFC A;  4RCC A;  1JJ2 P;  2CP3 A;  1I5L A;  2X9H A;  2OTL A;  3V7C A;  4XTY A;  4JJN K;  4XTV A;  4Z93 A;  1PM3 A;  1BK2 A;  3LH5 A;  3UW9 A;  4BE0 A;  1KIK A;  5CY9 A;  4O74 A;  2EGC A;  3VRZ A;  1AWW A;  3ZFJ A;  5H1T A;  4C8Q A;  2RI5 A;  2L5Q A;  5EP7 A;  4HXM A;  2LCS A;  5C87 A;  1BU1 A;  4FIB A;  4JLI A;  1GRI A;  4BDZ A;  4OB3 B;  5IHI A;  4C0D C;  4YBT A;  4QQ6 A;  5GAN h;  4EMG A;  3OMC A;  1AZG B;  1GCQ C;  3M56 A;  4RTY A;  2W10 A;  3CMA Q;  4OUF A;  1PD1 A;  2EVR A;  1WGS A;  4XQ3 A;  2XD0 A;  3P5O A;  1T3S A;  5FU7 B;  3CCM A;  1KHC A;  2F2X A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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