3E4RA

Crystal structure of the alkanesulfonate binding protein (ssua) from the phytopathogenic bacteria xanthomonas axonopodis pv. citri bound to hepes
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
AAEPAQLRIGYQKAVSSLVLAKQHRLLEQRFPRTKITWVEFPAGPQLLEALNVGSIDLGGAGDIPPLFAQAAGADLLYVGWVPPTPKAETILVPSKSALRTVADLKGKRIAFQKGSSAHNLLLRVLAKSGLSMRDITPLYLSPANARAAFAAGQVDAWAIWDPWYSALTLDGSARLLANGEGLGLTGGFFLSSRRYATAWGPFVQQVMGTLNQADGLLERDRAGSIKTLAQVSGLPPAVVERTLAHRPPASVQPLSAQVIKAQQATADLFYAQRLLPKRVLVAPAVWRAPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the alkanesulfonate binding protein (SsuA) from the phytopathogenic bacteria Xanthomonas axonopodis pv. citri bound to HEPES
rcsb
molecule keywords Nitrate transport protein
molecule tags Transport protein
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
total genus 98
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09084 NMT1 NMT1/THI5 like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.450 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Helicase, Ruva Protein; domain 3 3e4rA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e4rA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e4rA02
1LCFA 4R6HA 4DCXA 4FIMA 4BDRA 5TPAA 1EZOA 4KCCA 1MPBA 4IO5A 2QS4A 2Z8FA 1B7UA 5I56B 3KN8A 4R9GA 3K0VA 5DVJA 2E1SA 3CIJA 3HHGA 4KHZE 3ECRA 5L9OA 4F3GA 3LSWA 3CG1A 4I9DA 5TU0A 4GWOA 3M3KA 4OESA 4X1DA 1FQAA 2OWSA 3FV1A 3KJ7A 5HPQA 1EZPA 3OELA 1EU8A 4QF9A 4LZ5A 1SI0A 4F2QA 2HAUA 2ZYNA 1H44A 2D21A 1CB6A 3TTNA 3E13X 4MH5A 4TQUQ 3TCGA 4XKPA 3SEVA 3GZGA 1NFTA 3PMWA 4XKNA 4KI0E 4EQ7A 1IEJA 4ZEFA 2GFEA 4YKPA 4U2RA 1MQDA 3IK6B 3MP8A 1EH3A 2RINA 1VFDA 1UQWA 1Y1MA 4JWYA 1MPDA 3FASA 3HV1A 5JTYA 3CFXA 3FVNA 1GV8A 4GVOA 2PT2A 4PFTA 3C34A 2ZXTA 4POXA 1GR2A 1JEVA 5J1DA 5TP9A 1MXUA 1N7WA 1HSLA 3GBAA 2ONKE 1R1NA 3LBSA 3SETA 2O1LA 3A3CA 3ONMA 1O64A 4RYAA 3IB1A 1B0LA 1B3GA 3FIRA 4LONB 1N76A 1Q35A 1BKAA 4DLDA 5AA1A 5HM4B 4OENA 4F1VA 3UGWA 3K6XA 2R6GE 2I3VA 2KLFA 3THIA 1B51A 1B5JA 3PD9A 1NNTA 5TPAB 1R9QA 2AL4A 4OXVA 3TEPA 1B6HA 5A5XA 3O6HA 1DPPA 5AE4A 4MBPA 2ALUA 3OO6A 2QMXA 1XVXA 3M8UA 4OQOA 1NNFA 3RT6B 3JYRA 3CRBA 3EHTA 3PUWE 2Q2AA 2QS2A 4HTGA 3UK4A 4KD5A 1GVCA 3TFLA 1B1HA 1B46A 4AB5A 1IZ1A 1FQCA 3IJOB 1QULA 1HSJA 4PFYA 3RY3A 3K1PA 4E0WA 1XHYA 2PVUA 3D4GA 4UACA 2DWJA 3CFZA 1DTGA 1H3DA 2ZNTA 4ELPA 5CM6A 4E0XA 4IGTA 3RUMA 5H8NA 5KZTA 4U22A 4F1YA 4JWOA 4OTEA 4EQ9A 3O6GA 1Y9UA 3K4UA 2UVHA 4YB7A 3ODBA 3CR9A 3O28A 4YU0A 1LFGA 4KPTA 2DOJA 2H98A 2W7YA 1IITA 3MW0A 2Q88A 1PB9A 4ZEDA 3B6QA 4H8IA 5TP9B 3TKDA 3FV2A 5CBRA 3MJNA 4HCWA 1FW0A 2P2AA 4MF3A 4OFOA 4X9TA 1PDAA 4QSCA 3U72A 2CZLA 3GBBA 2AL5A 3PPPA 4EDPA 4L17A 4N07A 1PB8A 2P0SA 1B4HA 4H5GA 3ZS6A 1AL3A 1Z7NE 1RKMA 3CFLA 2NXOA 4ZE8A 5EYFA 1MH3A 3I5OA 3TQLA 3N26A 4IO7A 3BBRA 4H1XA 4Q0CA 3RTWB 3UN6A 1IXGA 2V3QA 4P0IA 2ABHA 1N3XA 1LBBA 3DP6A 1US4A 3DLNA 1B4ZA 4ELRA 2LAOA 5H8QB 3G3KA 1QUKA 3E9XA 3T96B 4MLQA 2I58A 3OO7A 2D5WA 3EPEA 1ELJA 5A5XB 4KCDA 3GLBA 4DDDA 4G77A 4HW8A 3IOTA 1LAGE 3ZKKA 1J1NA 4GL8A 1B58A 3QXMA 4Q5TA 1B05A 4GFRA 4DIGA 1ZIUA 4JDFA 3DM0A 2XXYA 4ZS9A 3U94A 2IEEA 4TLLB 2A5TB 1AH5A 3C36A 1LFIA 2HAVA 2DP8A 4ZECA 5BWJA 5JK4A 2XXWA 3B6TA 4RJZA 3MPLA 1RYXA 3CVGA 1YAEA 3DELB 4LUBA 2V84A 2Y84A 3L6HA 1FQEA 3PUYE 2UYEA 1POTA 4ZE9A 4F3SA 4OERA 2Y7WA 4UA8A 3OENA 3OXNA 1LGBC 3KSXA 2O69A 3OSRA 3UIFA 3I6VA 2ESNA 3JZJA 1R9LA 1M5FA 2ZMBA 1ZBMA 4JBZA 4XIGQ 1MXXA 2Z8EA 3MAMA 2ONRA 3IOWA 4F1UA 1SW2A 2DWIA 2F7CA 4N13A 4JWXA 2Q89A 3ILTB 1IXHA 3RGYA 2ZYKA 1XT8A 3Q26A 2UVIA 3Q27A 1N7XA 2F36A 1A99A 3PUZE 4ZZAA 3U1OA 1NNPA 1N84A 4X1BA 5ELVA 4RNSA 3IB0A 3T66A 3EN3A 2HZKA 1AIVA 1M5DA 1USYE 2E0SA 4WKMA 5AA3A 3EF7A 2RKMA 2ANJA 5CBSA 4DE8A 3TCHA 3AXFA 4MLVA 1SVXB 1LBCA 2XHDA 3K02A 3O2AA 2UYFA 5AA2D 3QUFA 1QW0A 4C1TA 5I2KA 1JW1A 2PT1A 1B3HA 4HCYA 1JETA 4JXIA 1OIBA 3BKIB 3MP6A 5ICTA 3U8QA 4F3BA 4ZEBA 4U4XA 3ZKLA 4NF8A 3T93B 4U23A 4GF8A 4PQJA 2DVZA 3C4MA 4LA9A 3VE1B 3ZSFA 1Y3NA 2Z22A 5HBCA 1JEUA 1SYHA 3RNNA 3SEYA 3D4CA 1QUIA 1UTBA 2NVUB 3H3GA 3N5LA 2DWHA 3K1MA 5EHSA 3U93A 5L8DA 1MDQA 1MRPA 4PFUA 1H45A 2F78A 3O66A 4IY6A 3TUSA 5F1QA 1NMUA 2B3FA 3K6VA 2F5XA 4PE5B 4G2ZA 3SEWA 4ESWA 2DXRA 3MUQA 4H67A 4LZ8A 2UVJA 2Q2CA 3TCFA 1O7TA 2ONSA 1B5HA 3K2DA 2XXQA 4O3AA 2A5SA 2I6EA 1N04A 4IGRA 4TOZA 2XXTA 4F2OA 4F29A 4GIZA 1BP5A 3MPKA 4YKIA 3OD7A 4R6YA 3UA8A 5H8FB 5M2VA 4KYSA 5CMBA 4FECA 4DXBA 2RCAA 2Y7KA 3LC8A 5L9SA 3QIMA 4R2BA 1T0KA 2DE3A 1USYH 4N6PA 4NWDA 3TQWA 3LR1A 3H6TA 3GXAA 2O68A 4ZEIA 2OWTA 1ATGA 2I4CA 2OLBA 2I3WA 3MZ1A 1JNFA 3KSJA 2Z23A 4ISUA 3TTMA 1MQGA 5IKBA 4QFOA 1EZ9A 1LB9A 4HS7A 1IUDA 3V5AA 5I2KB 1B7HA 4KFQA 4JSDA 1LSTA 5I84A 5H8QA 3KEIA 1DSNA 4LZ7A 4IY5A 2FYIA 3C33A 1TWYA 2QSXA 4LVQA 2B65A 1B3FA 4NF8B 5JEIA 2FNCA 1Z7ME 1NH8A 3B6WA 3S9NC 3H03A 1PBQA 3S9EA 3FVGA 4OEUA 4GLIA 1F9BA 3K6UA 2O7IA 1SI1A 5EHMA 4R72A 2QL3A 2UXAA 3U92A 1UTBB 1DTZA 3S2VA 1Y1ZA 3TMGA 3TDJA 1N0TA 3PPQA 4K3FA 3MZBA 4LQ5A 3TAJA 4WXJA 2A5TA 2THIA 2VD3A 4MFIA 1OLCA 3QUJA 3FZVA 3MQ9A 4DZ1A 4FE8A 4DCYA 1B0HA 1P1WA 3OOAA 4ZZEA 5L9MA 1M5EA 5FHOA 3RTFB 4XKQA 1O63A 3UORA 5CC2A 2F8DA 3K1NA 3O97A 1MS7A 1A8EA 3IX1A 5K2YA 3RLFE 4KQPA 4G8MA 3QYTA 1I69A 3HPIA 4PFWA 3IOUA 4GL0A 4FATA 3G3IA 4KYEA 2HCAA 3T9VA 3TTKA 2UVGA 3FATA 3SESA 1UIUA 3T22A 4F3PA 1MXVA 3W9WA 1B1XA 5CRYA 2ZYMA 3VVFA 1R6ZA 2Q8JA 3W9VA 3BFTA 1VFEA 1FQFA 3EHSA 4OFJA 4QRZA 4IO4A 2RC7A 4QFKA 4I1DA 1XC1A 1FQBA 3OEKA 2OCUA 1ZKBA 3PUVE 3TTRA 4RK9A 2DWAA 1WODA 3H7MA 2I0BA 1TFAA 3S4UA 5FTHA 4EXKA 5I2NB 1JVYA 4U1OA 3A3UA 3N6TA 4OVJA 4I62A 5CI5A 3G3GA 2DS9A 1OVTA 2XXXA 3H4ZA 2OBGA 1L5TA 1MM6A 3SDFA 4ZEKA 1Y20A 4P0GA 5ITPA 1S50A 3KJTA 3R6UA 3K00A 3Q25A 3CG3A 3C9HA 2DE4A 2F6PA 3E4RA 4YKJA 5IAIA 1A8FA 2QS3A 4GQOA 3MVYA 4GD5A 4R75A 2XD3A 3RT8A 1D9YA 1ZJLA 3IAZA 1FTJA 4IO6A 3WAEA 4R73A 2XXPA 1A7LA 1FTKA 4KR5A 2HZLA 1XS5A 3IL1B 2PYYA 4NWCA 1POY1 3PV0E 2XXUA 1BLFA 3TODA 3MVZA 4YMAA 4EUOA 1OQGA 3PUXE 4RPOA 3VLWA 3PMXA 5I59A 1DOTA 2OJTA 4O3CA 3N94A 3T9UA 1JQFA 5DVFA 2VGQA 5KDTA 3FJMA 4G68C 1MDP1 2XXVA 1CE2A 5I57A 1MY2A 3RQTA 1NH7A 2RCBA 2F34A 4IO3A 1MXZA 3FXUA 1OLAA 1QVSA 4H65A 4XKRA 2I4BA 4NF6A 4BLAA 5AA2A 3P7IA 1FTMA 4JSOA 3UP9A 3N6UA 4R6KA 4WEPA 3SERA 3SEUA 3HO7A 1B2HA 1MXYA 3M3FA 4Z0IA 5FTIA 5B70A 2G29A 5K2XA 2DXYA 2PMSA 1B3LA 3H6UA 2DYXA 5H8FA 3H06B 4ONYA 2F6GA 1Y4TA 1KWHA 1MQJA 5KCJA 5DYHA 4F31B 3O9PA 1MY0A 3FXRA 2M8CA 3H6WA 4C1UA 3SEXA 2WKYA 4QFPA 1LLSA 2DQVA 5CMMA 2O1MA 1LCTA 4RA1A 1ZMGA 2G93A 2RC8A 2HEUA 2O51A 4IB2A 3KN3A 1SW5A 4EF2A 3HCQA 3IO6A 1IXIA 1GTKA 1TXFA 3OSQA 1MY1A 4QSEA 2R9JA 1P99A 1QKAA 2NOOA 1WVJA 5CMKA 3CI8A 3ILUB 5H8HB 4QHQA 1B5IA 1P1UA 1JW5A 1HSEA 3PPNA 1RYOA 1IXCA 3C31A 2V25A 2R71A 2F7BA 1YCJA 4YAHX 2XX8A 4R74A 1NNKA 3KOSA 3FJGA 3R26A 4OWDA 5I59B 2H4IA 4M1VA 4LATA 4ND9A 2VOZA 4FEDA 1FCKA 2V3UA 5ICQA 4YKKA 1P1QA 3KOTA 5KDTB 4RXLA 1ZTYA 2YJPA 3G3JA 5I57B 4H8JA 2I49A 4NF5A 3MZ9A 2F97A 4QSDA 4IO2A 4DXCA 4TLMB 1A55A 2RF1A 4NF6B 5DVIA 1Q1KA 1VSOA 2YLNA 5AA2B 4PP0A 5FHMA 2NUVA 2HQ0A 4GRKA 3TYHA 2Y7PA 2GH9A 5I58B 1P1OA 4ECFA 1MXWA 3JV9A 2REJA 4THIA 4FJPA 4ESXA 4ELOA 3K01A 2FA7A 3G3FA 1URDA 2AIXA 2Q9TA 1B3EA 3KG2A 4Q8RA 5AA4A 3T9XB 3C32A 1D4NA 4LP2B 4BDQA 1SYIA 4JB7A 5DTBA 2GHAA 1B52A 2REGA 3EQ1A 3MVWA 4P11A 3LSFB 3HN0A 1Y3PA 5KCJB 1B32A 3FD3A 1AMFA 4DXUA 3KGCA 1I6QA 3VVDA 3FXQA 4LQ2A 2XX9A 3E3KA 1SW1A 3PPOA 4EQBA 3SKPA 3VV5A 1Y3QA 1MY4A 4X48A 4G4PA 3F11A 4G68B 4XTCQ 5I2NA 3DP4A 3O6IA 1N3WA 4F39A 2IA4A 4XXUA 3CSGA 1LB8A 1D3KA 3S9LC 2X26A 2ZNUA 1H43A 3IB2A 3PGFA 4YB6A 2D3IA 2I48A 2XXIA 3LUYA 3OO8A 2XXRA 4R2FA 4R9FA 1QKBA 2QMWA 4BDNA 1B40A 3RN8A 1ANFA 4NEDA 5DEXA 1UTHA 3IOVA 4RY1A 3FJ7A 1FTOA 2XX7A 3A09A 3KFMA 4NF5B 1JVXA 1SDXA 2GRVA 4FAJA 5BUUA 1A54A 4NE4A 2QPQA 2QJEA 1I6BA 2VP1A 3MP1A 4KYDA 1DPEA 3PU5A 4GXAA 1MQIA 2DVCA 3RPWA 3USDA 4H5FA 2CMOA 4EXLA 2NWJA 2I0CA 2DE2A 2HFBA 4AB6A 3CSBA 4GOTA 5JTYB 2BJJX 3QAXA 5AA4B 4FEBA 1FTLA 5ITOA 4U1ZA 1URSA 4ELQA 2HXWA 1ZU0A 1SW4A 4RPNA 3IORA 5DT6A 1FQDA 1VR5A 3TTLA 1SD3A 4OHNA 1MG1A 3L6GA 1SQYA 4OMBA 1JW4A 4OETA 1LAXA 3MBPA 4EF1A 3T9HB 5FHNA 4U4SA 5F7VA 1I6AA 2O84X 3W15C 4WEDA 3FVKA 4O3BA 2H25A 1M5BA 3VVEA 2OK2A 3KZGA 3VDFA 4I8CA 4F19A 3O29A 5H8SA 1TFDA 1VE4A 2QRYA 5ISUA 4C0RA 4BDMA 1LAFE 3PPRA 4FORA 2O6AA 2H9BA 1B9JA 3MWBA 1ZLQA 3I3VA 4NF4A 3M3LA 1UTHB 5DEXB 1PBPA 2H5YA 4BDLA 1BIYA 4OFLA 1NKXA 1OMPA 3OMBA 3MVXA 1AOVA 2QS1A 1URGA 3FGSA 4M4GA 2XD2A 3Q29A 1PEBA 3HHFA 3VLVA 4YB5A 3K6WA 3V83A 2RC9A 2Y7IA 5H8HA 4YMBA 4U21A 2V3TA 3QSLA 1BTJA 4NMYA 1B7ZA 4QFLA 3TPAA 3B7DA 3EHUA 1LAHE 1PC3A 2PX1A 3G7WA 2X7QA 1PB7A 3IO4A 5I56A 4AQ4A 2ZYOA 3KBRA 3LSXA 4Q30B 2YPNA 1H76A 1DMBA 4OYVA 3QK6A 5H8NB 1SBPA 4OZ9A 2B3BA 4F22A 1GGGA 4PETA 2Y7RA 2O7UA 4H0WA 3PMVA 1M5CA 1OQHA 2OZZA 2Z8DA 1D9VA 3KN7A 5B7DA 1QJMA 4F18A 1WDNA 1IQ7A 3BFUA 1LFHA 2XXHA 3IR1A 1MQHA 2X7PA 5I58A 3FUZA 4GXSB 1S7YA 3VXBA 1US5A 2H99A 3VLUA 1YPNA 1MY3A 3OO9A 1NL5A 3R7XA 2VHAA 4QFNA 3VXCA 2GHBA 3S9MC 4NTLA 3TZAA 1UIVA 4Z7EA 1YTVA 3H6VA 3WAFA 4POWA 1A40A 3V89B 3OEMA 1P1NA 2F7AA 1II5A 2V93A 3DP8A 2P1SA 3IJXB 1S9TA 1TT1A 4G8HA 5LOMA 3G3HA 4G8NA 4OEVA 4NF4B 3VFJA 4RK2A 2DSFA 3FVOA 1MPCA 3MC2A 5CMCA 4BDOA 1XVYA 4G68A 1OVBA 3HSTA 2ZNSA 1QUJA 2F35A 1Y4CA 3C35A 3PD8A 4YZZA 3Q28A 4H6DA 3TELA 4ZDMA 1IIWA 1XOCA 4YICA 2AYSA 2PBWA 3V8XB 1MM7A 2VD2A 3LSLA 1MH4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LCFA 4R6HA 4PCDA 3QYBA 4DCXA 1GL7A 4FIMA 2ZTDA 3UK6A 4BDRA 5TPAA 2UUAM 2JNHA 3FRHA 1EZOA 3BOSA 4KCCA 1MPBA 4IO5A 4O94A 2QS4A 2Z8FA 1B7UA 1G4AE 4N17A 5I56B 3KN8A 3LQQA 4R9GA 4AKGA 1R6BX 4RF0A 4AW4A 4RF1A 3K0VA 2E1SA 5DVJA 2L7HA 3CIJA 3HHGA 4KHZE 3ECRA 4DV0M 5L9OA 1QVRA 4JVDA 4F3GA 3RFWA 5I7IA 3KVWA 3U6CA 4JI0M 3CG1A 3LSWA 4I9DA 3HU2A 5TU0A 4GWOA 3JAMS 2CZHA 3M3KA 4OESA 4X1DA 1EE8A 1FPGA 3V76A 1FQAA 1DGGA 3THGA 4NN3A 2OWSA 3FV1A 3KJ7A 5HPQA 1EZPA 3OELA 1EU8A 4QF9A 4LZ5A 4NXNM 1SI0A 4F2QA 2HAUA 2UXDM 1P3QQ 2L2DA 2RRUA 4NRVA 1H44A 2DWZB 1CB6A 2D21A 2ZYNA 3E13X 4MH5A 4LFCM 4TQUQ 4XF5A 3TCGA 3TTNA 4XFEA 4XKPA 3DZDA 3SEVA 2JUJA 3GZGA 4P17A 4HL4A 1NFTA 3PMWA 2Z7JA 4XKNA 2OPFA 1IBMM 4KI0E 4EQ7A 1IEJA 1CUKA 2JZ0A 4L6V6 4ZEFA 3J7AS 1PRBA 3M6AA 3VK8A 4ZPXA 2ZZXA 2Y20A 2GFEA 1BK4A 4YKPA 4U2RA 1RDZA 2HWJA 5EQ7A 3E46A 1MQDA 3IK6B 3MP8A 4OU7A 1EH3A 2RINA 1VFDA 3MMPA 4DR4M 1UQWA 1Y1MA 4JWYA 1MPDA 3FASA 3FTDA 1R4GA 3HV1A 2R65A 5JTYA 3CFXA 3FVNA 1GV8A 4GVOA 2PT2A 4MJOA 4PFTA 2K9DA 3C34A 4XGIA 1I94M 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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