3E4RA

Crystal structure of the alkanesulfonate binding protein (ssua) from the phytopathogenic bacteria xanthomonas axonopodis pv. citri bound to hepes
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
AAEPAQLRIGYQKAVSSLVLAKQHRLLEQRFPRTKITWVEFPAGPQLLEALNVGSIDLGGAGDIPPLFAQAAGADLLYVGWVPPTPKAETILVPSKSALRTVADLKGKRIAFQKGSSAHNLLLRVLAKSGLSMRDITPLYLSPANARAAFAAGQVDAWAIWDPWYSALTLDGSARLLANGEGLGLTGGFFLSSRRYATAWGPFVQQVMGTLNQADGLLERDRAGSIKTLAQVSGLPPAVVERTLAHRPPASVQPLSAQVIKAQQATADLFYAQRLLPKRVLVAPAVWRAPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the alkanesulfonate binding protein (SsuA) from the phytopathogenic bacteria Xanthomonas axonopodis pv. citri bound to HEPES
rcsb
molecule keywords Nitrate transport protein
molecule tags Transport protein
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
total genus 98
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09084 NMT1 NMT1/THI5 like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.450 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Helicase, Ruva Protein; domain 3 3e4rA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e4rA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e4rA02
4IO3A 1ANFA 5AA4B 5KCJB 4RK2A 1SQYA 4ND9A 4JWOA 1OVBA 4X1DA 1MQJA 2ABHA 3SKPA 3KG2A 2GRVA 2G93A 4KD5A 5A5XA 5L9MA 5I2NB 5JTYB 2DE4A 3O6HA 4JWXA 4NF4A 1FTMA 3TCGA 4ZZAA 1UIVA 1D3KA 2HXWA 3IB2A 3G7WA 1B4ZA 1FCKA 3H06B 1AL3A 4AQ4A 3IX1A 2KLFA 2OBGA 5EYFA 4GRKA 1N84A 3RTWB 2F7CA 4DZ1A 3RLFE 3K2DA 3OD7A 4H0WA 3K6VA 4ZEFA 1I6BA 2H99A 4NWCA 2O1LA 3V5AA 4H8IA 2O51A 4I9DA 4F22A 4LQ2A 1IZ1A 4FORA 4G68B 1USYH 4QF9A 1NMUA 2HZLA 1FQEA 3VVDA 3QIMA 2E1SA 3O66A 1SDXA 1IQ7A 3EHTA 5AA1A 1POY1 1ZKBA 1NFTA 4DLDA 2V3UA 4IO4A 1RYXA 2ZNSA 1M5CA 2ZXTA 2ALUA 3OEMA 1N3XA 2RC9A 1UTBB 3O6GA 4BDOA 1US5A 4UACA 2XD2A 1UTHB 4ELPA 2I0CA 2VGQA 4YB6A 2V3QA 4TQUQ 4NWDA 1Y3QA 4QRZA 2UVGA 1ZIUA 2W7YA 1Y1ZA 4XKRA 3Q27A 1B32A 3C36A 3LSWA 5L9OA 1YAEA 5H8SA 1XOCA 3CG3A 4ZEIA 3VV5A 1GTKA 2DWIA 4OETA 5FTIA 3CRBA 1Y3NA 3SETA 4OERA 4FJPA 3CIJA 2PBWA 1N0TA 1BLFA 2PT2A 1II5A 3K6XA 1DMBA 4OFJA 5IAIA 2R6GE 4F19A 3MVWA 1URSA 3UIFA 2DSFA 4BDNA 2PYYA 1LB8A 4RYAA 3V89B 2X7PA 1JW4A 3IB1A 1R1NA 4GIZA 3G3JA 3S9MC 4GXSB 1SYHA 4JB7A 3ECRA 3TTRA 4ZDMA 3CFZA 3R7XA 2F7AA 3FGSA 1NH8A 2OCUA 2DYXA 4PFUA 2OLBA 4NEDA 4O3CA 3ZKKA 5I56B 4HCWA 4FIMA 3VLWA 1H3DA 3GZGA 2YJPA 1XS5A 5TP9B 5H8QB 2F78A 2I0BA 1A7LA 3H6TA 2AL4A 3RPWA 2HEUA 4LP2B 2I4BA 4U1ZA 1YCJA 3OO6A 2GHBA 3O2AA 2HCAA 3Q26A 2Y7PA 3TZAA 3UA8A 1R6ZA 2BJJX 1MDP1 3KN7A 4LATA 2CMOA 4P11A 5ELVA 1FTOA 4LZ8A 5B7DA 2ZYMA 1VFDA 1UIUA 1O7TA 1GVCA 3HN0A 4WEPA 5TU0A 4EDPA 1AMFA 1MY4A 2UVHA 4IGRA 2M8CA 1RYOA 4X9TA 1H45A 4YICA 3MAMA 4MBPA 4EQ9A 2Q89A 2H9BA 4BDQA 2D21A 4R6KA 3ZSFA 3D4CA 5K2XA 4H5FA 3IOVA 3MW0A 2OK2A 5HM4B 4DDDA 1JETA 3A3UA 5AA4A 5KCJA 3MBPA 4KFQA 5I59B 1UQWA 2DP8A 4EF1A 1H76A 4RY1A 3DP6A 4XKQA 5CMCA 3RTFB 3PPRA 5AE4A 1SI0A 2QSXA 3BBRA 5I2NA 1TWYA 5JTYA 1YPNA 1N3WA 4F3PA 3VE1B 1Y4CA 2H5YA 1M5FA 1TXFA 4YAHX 3MP6A 3MZ1A 3SEXA 3TEPA 4GXAA 4QFPA 5FHNA 3FASA 1PB9A 3A3CA 3PUZE 1LAGE 4IY5A 3U1OA 3HO7A 3PD8A 2ZMBA 2Z8FA 1ZU0A 4OHNA 1N7XA 4THIA 1SVXB 2V93A 2XXPA 1JVXA 3QK6A 4X1BA 5AA2B 1A40A 4OFOA 1B2HA 3VXBA 1DPEA 1Y4TA 1JEVA 1MH3A 2HZKA 4NF8A 1M5BA 1PC3A 1IXGA 3SDFA 1NL5A 4OXVA 4OMBA 4Z7EA 4TLLB 3T9VA 2VHAA 1MDQA 2B3BA 3TFLA 2ONSA 4TOZA 1S50A 1D9YA 4OYVA 4G68A 3VDFA 2ZNTA 3QXMA 2F97A 1BIYA 1MG1A 2QL3A 1LGBC 3RN8A 5JEIA 3V83A 1Q35A 4PETA 4KCDA 1B6HA 4OTEA 4O3AA 4ELQA 4MFIA 5K2YA 2AYSA 3K1NA 2DWJA 4OFLA 1UTBA 2Y7IA 2Q2CA 3IJOB 1EZOA 5L9SA 3RNNA 1B3EA 2H98A 3T93B 4U2RA 4F39A 1LAHE 1OQHA 3O28A 5CC2A 4GOTA 1H44A 1Y1MA 1ZMGA 4I1DA 4OZ9A 4C1TA 4IO7A 4MLQA 3T66A 5ICTA 3PU5A 4KCCA 4KYSA 1MM7A 4F1VA 4G4PA 4PP0A 2DWHA 4FECA 3U72A 4YKIA 2VOZA 2YPNA 1LAXA 2DVZA 3KSXA 4RJZA 5DYHA 1FQFA 1SYIA 3U8QA 5J1DA 2AIXA 2DQVA 4KQPA 5DVIA 1MPBA 2O6AA 3OELA 1FQAA 2I48A 4OESA 4EQBA 4ESXA 2XHDA 5AA2D 2XXTA 3RY3A 1P99A 1MRPA 2Q8JA 1B46A 3RGYA 3JV9A 1DSNA 3HHFA 3SEYA 1FTKA 5L8DA 3MP8A 4LZ5A 2XXRA 1NNPA 3UP9A 3TUSA 1TT1A 2VD2A 3UN6A 5I56A 5TP9A 1FQCA 5M2VA 4KPTA 5H8QA 2DOJA 1MQHA 4I62A 1AOVA 2I58A 3C4MA 4DCYA 3TCHA 3PMVA 4R9FA 4PQJA 4NF8B 5F1QA 4F3BA 2DWAA 1JQFA 1MPDA 1QUJA 3C33A 4HCYA 4NF6B 1DTZA 3TAJA 1FTLA 3K4UA 2X7QA 4UA8A 2QPQA 3IOTA 3U93A 4F3GA 4EUOA 1A8FA 3T9HB 1EZPA 4YKKA 2Q9TA 2RC7A 4IO2A 1HSLA 4DXUA 4BLAA 2GFEA 3ZKLA 3Q25A 2HAVA 4PFYA 5DEXA 3H6VA 4OWDA 3FVGA 2V3TA 3LR1A 2XXXA 4G8HA 3JZJA 2Y7WA 5ITPA 2F5XA 3EQ1A 4P0GA 4JDFA 5I59A 3KSJA 2QS1A 3W9VA 3HPIA 3EF7A 3LSFB 1B5HA 4POWA 4EXLA 2P0SA 1MXYA 3MVZA 2QRYA 2RF1A 2XX9A 3QYTA 1ATGA 5TPAB 1N76A 3O97A 4EF2A 2FYIA 1MH4A 3WAEA 4XKNA 3V8XB 4RK9A 3VLUA 3TTLA 3FJGA 1H43A 1ZLQA 3HSTA 2ONKE 3FJ7A 1QJMA 3PPOA 3DP4A 2ONRA 2VD3A 5AA2A 1MXXA 2RCAA 3A09A 2Y7KA 1B40A 3DM0A 1P1UA 3R6UA 3L6HA 1XVYA 3S2VA 3K1MA 4KHZE 2PX1A 4XTCQ 3QUFA 1URDA 3B6TA 4JXIA 3Q29A 2UVIA 1PEBA 5ITOA 1VE4A 1Q1KA 1XHYA 3SEWA 2PMSA 1SW1A 2GH9A 4GVOA 1B1HA 4XKPA 4FATA 4OQOA 1B0LA 1DOTA 1B9JA 4YKPA 1LBBA 3WAFA 3EHUA 3S9EA 3HV1A 2F35A 1AH5A 2O7IA 4U23A 5I58B 1LCFA 3W15C 2DXRA 2DS9A 1R9QA 5CBRA 2RINA 1SBPA 2YLNA 4FE8A 5FHOA 2XXHA 3IJXB 1B0HA 3KN3A 2NWJA 3P7IA 4ISUA 1LFHA 3H6UA 5HBCA 4LONB 4F1UA 4N07A 2RCBA 5ICQA 1OQGA 3BFUA 3ILTB 5I2KB 1WVJA 2FNCA 4WKMA 3D4GA 1WODA 5I57B 3EHSA 3MPKA 3VLVA 4H8JA 4U22A 1D4NA 5H8FB 2FA7A 5CBSA 1YTVA 2I6EA 3FXQA 3F11A 3K02A 3T9UA 1BP5A 4ZZEA 2IEEA 2PT1A 2E0SA 2XXYA 2I4CA 5EHSA 1A55A 5DEXB 2HFBA 2A5SA 1SI1A 4F1YA 3OXNA 1XVXA 2NOOA 1Z7NE 2UXAA 4DXBA 5DVJA 4NMYA 3C34A 3ILUB 2HAUA 4M1VA 4C0RA 1FW0A 3CSGA 3DP8A 3N5LA 3LBSA 1BTJA 1PDAA 2GHAA 3MPLA 3S9LC 3KOTA 2REJA 2A5TB 1B4HA 2ANJA 4IGTA 1LFGA 1USYE 1B05A 2XD3A 1A99A 3FD3A 2V25A 4OENA 4U21A 4AB6A 2O68A 3I3VA 1CE2A 4F2OA 1PBQA 3TDJA 2OJTA 4XIGQ 3TQWA 3CVGA 2ZNUA 1ELJA 4ZS9A 4Q5TA 1ZBMA 2ESNA 4MH5A 3CR9A 4YB7A 4QSDA 4M4GA 4L17A 3RT8A 3FZVA 1Y3PA 3ZS6A 1MPCA 1OMPA 3KBRA 4F29A 3KN8A 3O9PA 4X48A 4NF6A 1RKMA 3EPEA 1TFDA 2R9JA 1QW0A 4R73A 1NNKA 5CM6A 4DXCA 4C1UA 4ZEKA 2QS4A 1B3HA 2HQ0A 4FEDA 3B7DA 1BKAA 1B5JA 3KJTA 5H8HB 3DLNA 1JW5A 2QS2A 3FV2A 1FQDA 2Z22A 2O84X 1D9VA 3M3KA 3FXRA 4IO5A 2R71A 4BDLA 4HS7A 4BDMA 1P1NA 3E9XA 4R6HA 2RKMA 3H03A 2VP1A 3PMWA 3MVXA 3T96B 3M3LA 3G3GA 3W9WA 4AB5A 3UK4A 3MZBA 4MLVA 1XC1A 1J1NA 1MXUA 4H65A 2X26A 1OIBA 3AXFA 1VFEA 3H4ZA 1SW4A 3EN3A 3MUQA 1I6QA 3SERA 5TPAA 4YMAA 1MXWA 4RXLA 2Q2AA 2NVUB 1LBCA 4JWYA 1A54A 2PVUA 1MY1A 1VR5A 3TTMA 1MS7A 4WXJA 3RUMA 2XXWA 2QJEA 2XXIA 2OZZA 4G8MA 4U4XA 3E13X 5EHMA 2DE2A 4QSCA 2WKYA 3H3GA 3OENA 3S9NC 3FXUA 3IO4A 3KEIA 4PFTA 4ELRA 4R6YA 3TODA 3LSLA 3O29A 4P0IA 1SW2A 1IXCA 5BWJA 3IK6B 3QSLA 2ZYOA 3H7MA 2O7UA 3IO6A 3T22A 1NH7A 1PBPA 4MF3A 3HHGA 3PUYE 4QFNA 1DPPA 3PUXE 3IORA 4PE5B 3MJNA 4ZEBA 4R9GA 1S7YA 3RT6B 5I58A 3PUVE 2QMWA 1MY0A 3PV0E 3THIA 4OVJA 2I3WA 1IEJA 4POXA 1AIVA 4O3BA 1CB6A 3CG1A 2H4IA 5CMBA 3K6UA 3FV1A 2Y7RA 3C32A 1B1XA 4EXKA 1HSJA 1XT8A 5IKBA 4ELOA 3B6QA 1QUKA 3O6IA 1QKAA 1B7UA 4E0XA 4HTGA 2I3VA 4GL8A 5I2KA 3UORA 2D5WA 2O69A 2G29A 2XXQA 1DTGA 4IY6A 4JSDA 2ZYKA 4R72A 4RPOA 5I57A 4RA1A 1NNTA 2DXYA 4LA9A 1KWHA 2Z8EA 3N94A 2UYEA 5KZTA 5H8FA 1B52A 1JVYA 3G3IA 3U92A 5DTBA 3BKIB 3C35A 3PPPA 1P1WA 2Y84A 2THIA 1WDNA 1MM6A 1TFAA 3H6WA 3TELA 2DVCA 3OO7A 5KDTB 4DE8A 1M5EA 4OEUA 1LB9A 4F18A 1IXHA 3SEVA 3VFJA 1ZJLA 2DE3A 1LFIA 4IB2A 1OLCA 1NKXA 1B58A 4QFKA 3L6GA 1L5TA 2QS3A 3LC8A 3MVYA 3G3KA 2B65A 2P1SA 4QFOA 2A5TA 4R2FA 2AL5A 1P1OA 3K00A 4H1XA 1MQGA 3MP1A 1B3GA 3SEUA 4NF5B 3MC2A 4G77A 4DCXA 4H5GA 4GFRA 3UGWA 5F7VA 4R75A 1EH3A 4G2ZA 3VVEA 2IA4A 2XXVA 1ZTYA 3DELB 3FJMA 1LSTA 3C31A 4FEBA 2RC8A 3LUYA 1B3LA 4FAJA 1PB7A 4KYDA 4WEDA 3Q28A 4GQOA 2B3FA 3OSQA 3FVOA 4Z0IA 1I69A 1MQDA 2H25A 3K0VA 5H8NA 5CRYA 4LUBA 4Q30B 1F9BA 5A5XB 1IITA 4E0WA 4PFWA 4NE4A 5H8HA 2F7BA 4NF4B 4JSOA 4LQ5A 5CMKA 1A8EA 3I6VA 1EU8A 1PB8A 3PD9A 2Q88A 5I84A 2O1MA 1B51A 4U4SA 3PUWE 5JK4A 4H6DA 4R2BA 3FVKA 3S4UA 1MQIA 4ZECA 3RQTA 1N04A 1O63A 3JYRA 3C9HA 5FHMA 3FATA 5CI5A 5FTHA 2REGA 4ECFA 4GWOA 1B7ZA 4LVQA 3KFMA 1Z7ME 1FTJA 3TCFA 2D3IA 4YZZA 3M3FA 3I5OA 4KYEA 5LOMA 3GXAA 3OEKA 2Z8DA 3TTKA 4YU0A 1Y9UA 3E4RA 2OWSA 4EQ7A 5AA3A 1POTA 1MXZA 1QUIA 1QVSA 2F6GA 4R74A 5ISUA 4YB5A 4ESWA 4ZEDA 2V84A 4F31B 2F34A 1Y20A 3CI8A 1MY3A 1FQBA 3K6WA 1US4A 3N6UA 3KOSA 4GL0A 1MY2A 1OVTA 4ONYA 3OSRA 4BDRA 1NNFA 4QSEA 3OO9A 3SESA 1B5IA 3CFXA 3K01A 3R26A 1O64A 3KJ7A 1IUDA 4U1OA 3VVFA 3FUZA 4G8NA 4YKJA 1S9TA 2XX8A 2Z23A 3IL1B 3LSXA 3K1PA 4TLMB 3ONMA 3IOWA 1LCTA 3N26A 5HPQA 1URGA 1GR2A 1SD3A 2UYFA 1JEUA 4H67A 1IXIA 3IAZA 3E3KA 3TKDA 1M5DA 5CMMA 3CSBA 1HSEA 1N7WA 3TMGA 4RNSA 4RPNA 2F8DA 1P1QA 3HCQA 2NXOA 3OMBA 1B3FA 3IR1A 3FVNA 3KZGA 4GF8A 3PGFA 4IO6A 3TQLA 5H8NB 2LAOA 4GLIA 2I49A 3IOUA 3QAXA 4K3FA 5B70A 3OOAA 2ZYNA 3G3FA 3CFLA 4I8CA 1B7HA 4F2QA 1T0KA 3OO8A 3KGCA 5DVFA 3U94A 3B6WA 3PPNA 1IIWA 2P2AA 4N6PA 3PMXA 2QMXA 3MWBA 1VSOA 5KDTA 2F36A 4GD5A 3MQ9A 1JW1A 4YMBA 3VXCA 4HW8A 3PPQA 4QFLA 4XXUA 4OEVA 1OLAA 3GBBA 2XXUA 2XX7A 3GBAA 3FIRA 3TTNA 4Q8RA 1GV8A 1UTHA 1LLSA 1JNFA 3G3HA 4G68C 4KR5A 4Q0CA 2CZLA 2NUVA 3TYHA 4NF5A 3BFTA 1I6AA 1LAFE 4ZE9A 2OWTA 1QKBA 1EZ9A 4QHQA 1R9LA 5BUUA 1MXVA 4F3SA 4N13A 3N6TA 3QUJA 4JBZA 3TPAA 3MZ9A 3GLBA 1GGGA 4ZE8A 3IB0A 1QULA 2F6PA 3M8UA 4KI0E 4NTLA 4DIGA 2UVJA 4LZ7A 5DT6A 3USDA 3ODBA 3T9XB 1SW5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LBYA 1D9QA 4IO3A 1DGHB 4RKUF 1ANFA 1FBPA 1GLNA 5AA4B 2L7HA 5KCJB 3KDSE 4B3SM 4Y28F 3L25A 4N15A 4RK2A 4AI6A 1SXJA 1SQYA 2WEFA 4GWYA 4ND9A 4JWOA 3T15A 1OVBA 4X1DA 1MQJA 2ABHA 3SKPA 4OVQA 4G4NA 1XWIA 1L8QA 3KG2A 2KHHA 2GRVA 2G93A 1WHCA 4KD5A 5A5XA 2ZZXA 5L9MA 3ZC7B 4IBGA 3FUUA 5I2NB 5JTYB 1KA1A 4ANRA 3WHKA 1ZMUA 3QYEA 4BBAA 2DE4A 3GPYA 2C9OA 2XWKA 3O6HA 4JWXA 4NF4A 4GWZA 1FTMA 4MIJA 1VEJA 4GX3A 3NWLA 3TCGA 3VDPA 4ZZAA 4QXDA 2BNKA 1UIVA 1D3KA 2HXWA 3IB2A 4LRTA 3FD9A 3G7WA 1B4ZA 2DWNA 3BXWA 1FCKA 4NGUA 3H06B 2DENA 1AL3A 4AQ4A 4LZZA 3IX1A 2KLFA 3OTOM 4LFBM 2OBGA 5EYFA 2KR0A 3A45A 1T3TA 1HR0M 4GRKA 1N84A 5EQ7A 4P1LA 3RTWB 4PDGA 2F7CA 2OX3A 4X64M 3IFAA 2EJSA 3SYLA 4DZ1A 3RLFE 3PXGA 3K2LA 3BOSA 2WSEF 4LF8M 3K2DA 3OD7A 4H0WA 2Y20A 3K6VA 3MYUA 4ZEFA 5EQ8A 3SAUA 3U60A 5ESYA 2LHGA 4LZJA 2C98A 1IMFA 2YQZA 5FTJA 4GWUA 1I6BA 2H99A 4NWCA 2O1LA 4IBJA 1ZAEA 4S12A 1FPJA 2W82A 3V5AA 3F92A 4H8IA 2O51A 3H4JA 4I9DA 4F22A 4LQ2A 2HPGA 4NL4H 1IZ1A 4FORA 4G68B 1USYH 2Z8YM 4AS4A 4QF9A 1NMUA 3M0EA 2D7HA 1Q3BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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