The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
227
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structure length |
227
|
Chain Sequence |
LVSITDLQGRILYANDNFCAVSRYGREELVGQDHRIVNSGYHGKAYIRDMWRTISRGNIWQGEFCNRRKDGTRYWVDSTIVPLMDNAGKPRQYISIRRDITAQKEAEAQLARLKQAMDANSEMILLTDRAGRIIYANPALCRFSGMAEGELLGQSPSILDSPLADQETLAAMQEALQAGQPWSGRLLNRRRTGPAPHDAEDYWAEISTTPIHTDGNGLVGYVQIQHD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Structure of the Redox Sensor Domain of Methylococcus capsulatus (Bath) MmoS.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Flavoprotein
|
source organism |
Methylococcus capsulatus
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molecule keywords |
Sensor protein
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total genus |
57
|
structure length |
227
|
sequence length |
227
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ec nomenclature |
ec
2.7.13.3: Histidine kinase. |
pdb deposition date | 2008-10-15 |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Up-down Bundle | Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces | Single helix bin | ||
Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Beta-Lactamase | ||
Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Beta-Lactamase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1T1C A; 1S66 L; 5DKK A; 3ULF A; 3D72 A; 4EES A; 3IN6 A; 5F5Y A; 2V1A A; 1OTE A; 4JGQ A; 3NOP C; 4R6L A; 2OWH A; 3LUQ A; 2PR6 A; 5KIZ A; 3LYX A; 2KX6 A; 4NXF A; 3UMD A; 4HI4 A; 4YWZ A; 4HQA A; 3H7W A; 1KOU A; 4F3L B; 3MJQ A; 2CMN A; 5HDD A; 1UWN X; 1UWP X; 4EXO A; 1P0Z A; 4GW9 A; 3O6Q A; 4HH3 A; 1LT0 A; 3MFX A; 3IBR A; 1ZME C; 2I9V A; 5DJT A; 2GJ3 A; 5AVF A; 4PKY A; 1XJ2 A; 3GDI A; 1XJ6 A; 3RTY A; 2L0W A; 4KQD A; 4H6J A; 1OTB A; 2BAS A; 5DKL A; 3VE4 A; 2HV1 A; 5HWT A; 4KUO A; 3E4P A; 2A24 A; 2QJ5 A; 1LL8 A; 4K08 A; 1OTI A; 4XT2 A; 3LIF A; 1DP8 A; 1XFN A; 1N9O A; 4I38 A; 4HOI A; 1LSX A; 3K3C A; 1LSW A; 2QHK A; 2D02 A; 4GS9 A; 3UB7 A; 3A0R A; 4LRY C; 4I3A A; 3F1N B; 3F1O B; 4L9G A; 3LI9 A; 2VV8 A; 3NHQ A; 1S1Z A; 4JGO A; 2EA9 A; 4LRZ E; 5HZH A; 4DJ2 A; 4HP9 A; 4NXB A; 1DP9 A; 3MQQ A; 4L9E A; 2WKP A; 4BBU A; 5G4Y A; 2OOL A; 3H25 A; 2VLG A; 5HWW A; 1T1A A; 4JGP A; 3H82 A; 3A0V A; 4HNB A; 2V9A A; 4LPZ A; 3EEH A; 4I5S A; 1WA9 A; 4WN5 A; 3UE6 A; 1OJ5 A; 2P10 A; 5I5L A; 4F3L A; 5F68 A; 1V9Y A; 2YKF A; 3FC7 A; 1T18 A; 4KUK A; 2J80 A; 2V0W A; 3IS2 A; 3VE3 A; 1T19 A; 5A8B A; 2PHY A; 3C8C A; 1S67 L; 2R78 A; 5G4Z A; 2JHE A; 4HHD A; 4MN6 A; 2QKP A; 1FDO A; 4EEU A; 2WKR A; 1GSW A; 4HY8 A; 5HD5 A; 2L4R A; 3ICY A; 1LSV A; 5F69 A; 4I3J A; 2Z6C A; 4BBV A; 4I39 A; 5J3W A; 4NXG A; 1G28 A; 4BBT A; 3PHY A; 3UB9 A; 4EET B; 4HP4 A; 3ZQ5 A; 1T1B A; 3LIC A; 1EW0 A; 3BY9 A; 4R38 A; 3H7W B; 1OJG A; 3OLO A; 3P7N A; 4E04 A; 3GEC A; 3UB6 A; 3H9W A; 4NXE A; 2VV6 A; 1OTA A; 3NOU C; 5TBM B; 1N9N A; 3LIA A; 4HH2 A; 1X0O A; 3F1N A; 2B02 A; 4I3I A; 1DRM A; 3HJI A; 3CAX A; 5IS1 A; 1AJY A; 5J7E A; 3F1P A; 4WUJ A; 1F98 A; 4JGR A; 1VB6 A; 3NOT C; 1UGU A; 2M1C A; 3UB8 A; 3T50 A; 3G6O A; 2QJ7 A; 3UME A; 1ODV A; 1WMK A; 2A24 B; 2YKH A; 3C2W A; 3E4O A; 3LID A; 5IU1 A; 4XT2 B; 2W0N A; 1V9Z A; 4LLO B; 4R3A A; 4WLA A; 5HSQ A; 4GS9 B; 5HWV A; 4PKY G; 4EQ1 A; 1D7E A; 1D06 A; 4GHI B; 4L9F A; 3PYP A; 4GCZ A; 3EWK A; 1BYW A; 4RQ9 A; 1MZU A; 2G8Y A; 4EEP A; 2PDR A; 2P7J A; 1N9L A; 5HDC A; 2JN7 A; 3MXQ A; 2L1M A; 3CWF A; 3H82 B; 5F6A A; 4MN5 A; 5EFW A; 2V0U A; 3LIE A; 2PYP A; 3BY8 A; 3IS2 B; 2D01 A; 1TS0 A; 3MQO A; 4M4X A; 5HDS A; 2K7S A; 1TS7 A; 5TBM A; 2PD8 A; 4HJ4 A; 1P97 A; 2OWJ A; 2INW A; 3BWL A; 3A0S A; 1DP6 A; 1JNU A; 1XFQ A; 2ZBB A; 4LRX C; 1OT9 A; 1GSX A; 1FDI A; 1S4R A; 2ZOI A; 1OTD A; 3E4Q A; 3LI8 A; 2ZOH A; 3F1O A; 3MR0 A; 2W27 A; 3NJA A; 2H28 A; 3B33 A; 4DJ3 A; 2WKQ A; 3VOL A; 1S1Y A; 1XJ3 A; 4HJ6 A; 5AVE A; 2QWS A; 2Z6D A; 2KDK A; 1S4S A; 1TS6 A; 1GSV A; 4H6J B; 3SW1 A; 1OT6 A; 5HD3 A; 3FG8 A; 4EER A; 2VEA A; 1NWZ A; 2VV7 A; 3LIB A; 1TS8 A; 3HJK A; 4HIA A; 5DJU A; 2PD7 A; 1XJ4 A; 1Y28 A; 4GHI A; 2PYR A; 3K3D A; 4HJ3 A; 2PR5 A; 1F9I A; 4R70 A; 3KX0 X; 3RH8 B; 4WF0 A; 5J4E A; 4B9O A; 4EW7 A; 3CLO A; 3F1P B; 4WL9 A; 1OMI A; 2V1B A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4C7N B; 1VQ4 P; 3M9B A; 3TK1 A; 4WEK A; 1N4O A; 2Q7C A; 1T1C A; 1S66 L; 5DKK A; 3A3F A; 3GLM A; 5L8R J; 1ESU A; 3PJS K; 3ZG0 A; 4D6T D; 4OGQ C; 3CG5 A; 4X1L A; 1ZLL A; 4OP5 A; 4K0W A; 2R32 A; 4M3L A; 3LR0 A; 4ZJ1 A; 5HAI A; 1TD5 A; 4GNU A; 3TSG A; 5H2F E; 5CTM A; 1YLJ A; 2R44 A; 3N7W A; 3LGO A; 1DEE G; 4AQR D; 2RKL A; 4FH2 A; 2JKF A; 2K37 A; 1FR1 A; 3R7W B; 1LI9 A; 1M1J C; 1QLE D; 3LUQ A; 3RFB A; 1YIT P; 5KIZ A; 2XF3 A; 3LW5 H; 1YLT A; 3VP4 A; 1FJK A; 2IFN A; 3IXB A; 2P9V A; 1MWU A; 1FDM A; 2I72 A; 4GJ4 A; 3TF5 A; 2E76 C; 5HDD A; 1UWN X; 3B5N D; 1S2E A; 2AXT H; 1JWV A; 2W3E A; 3L71 G; 4ZDX A; 2VGK A; 2NUT C; 3HD7 C; 1M90 Q; 4RKU J; 3B47 A; 3IX8 A; 3S22 A; 3PH0 A; 4OWF A; 2KLV A; 2PT7 A; 5AVY B; 4S2J A; 3CCQ P; 2HP6 A; 2P1J A; 1ZME C; 2B9B A; 4OVN F; 4UQI S; 2XEP A; 1EDK A; 5DTK A; 2I9V A; 1ZRT E; 4LC1 A; 2WKH A; 3SWK A; 4IVK A; 4PKY A; 3M2J A; 1XJ2 A; 1W8Q A; 4ZKP A; 3QNB A; 5GLC A; 1VEU B; 3AGE A; 4GZB A; 3CXH D; 1NOH A; 2ZC7 A; 1HD8 A; 1TDG A; 3V2P A; 1SQB D; 4KQD A; 3T97 B; 1Z56 A; 1SQV G; 2IX7 C; 3EEA A; 2BAS A; 1FS0 E; 3L71 E; 3N4I A; 2ZC3 B; 1KQL A; 3ZG7 B; 3UE1 A; 2Y2J A; 1CEG A; 1ACF A; 2IZ0 A; 1H89 A; 2Q5U A; 3BM6 A; 2W3H A; 1IFD A; 1IFN A; 1URQ C; 4L75 A; 1OW8 A; 1NHL A; 1H8Y A; 3BAS A; 2EX6 A; 1LL8 A; 1K4F A; 3G71 P; 1N7S B; 4JPM A; 3SWF A; 4F94 A; 4WY4 B; 3OBF A; 1PP9 D; 3R4Y A; 3CPW O; 4PD4 D; 2OAP 1; 2IA2 A; 1G2C A; 3PBQ A; 2W83 C; 1JY3 O; 1KN7 A; 3A3E A; 3ZVW A; 1P84 I; 2L91 A; 3CCV P; 3PBR A; 1AWI A; 2NZ2 A; 1BTL A; 1ZC2 A; 4I38 A; 1NTM K; 2XZR A; 2HP5 A; 1SQV E; 4GOD A; 1TEM A; 3GVB A; 1EZV I; 1XGI A; 4DOJ A; 4MBH A; 1A02 F; 1HVV A; 1JY2 O; 1W2B O; 1LTG C; 1NRJ A; 4QHC A; 4KZ7 A; 4GS9 A; 3MQ0 A; 4R4S A; 1VF5 B; 2W1T B; 3WRT A; 1YAX A; 4WEL A; 4N78 E; 4I3A A; 3L71 J; 1YHQ P; 1SS1 A; 3F1N B; 1YJW P; 3F1O B; 4L9G A; 3AGD A; 5CGS A; 2YXQ B; 2VV8 A; 3Q81 A; 3DAV A; 2UV0 E; 1G68 A; 1S1Z A; 3HBR A; 3BAT A; 1W7F A; 4LRZ E; 2JKV A; 4LLH A; 4DJ2 A; 1JO5 A; 3OCL A; 3HLC A; 1RF1 B; 2JEE A; 5CXW A; 2E74 D; 2WKP A; 4BBU A; 2OOL A; 3PAE A; 2E42 A; 1S3J A; 1PW8 A; 5IHV A; 3BVH A; 1T1A A; 4N3Y B; 2VGL M; 3P8C E; 4LPZ A; 3AGF A; 4JF5 A; 3EEH A; 1SQV J; 1WA9 A; 5GTI H; 4JXS A; 4QD4 A; 4WMC D; 3G35 A; 2QEX P; 3QP6 A; 1PFI A; 3PBN A; 5F68 A; 1OW7 A; 2J80 A; 4NG2 A; 2V0W A; 3HLW A; 3PXP A; 3VE3 A; 2XSS A; 5M19 A; 1K73 Q; 5HAQ A; 1ZXG A; 4E3M A; 1RGY A; 4NPF X; 2K2N A; 4X1M A; 1Q2N A; 3TGU D; 3C8C A; 2C9N Y; 3NIA A; 4BMW A; 5EV0 A; 3TW8 A; 3L72 D; 3Q82 A; 2A06 D; 2XR0 A; 5GLD A; 3BYD A; 1IO4 A; 4U0X A; 3FV7 A; 1JMM A; 1VEU A; 3G31 A; 5EE8 A; 1LT9 B; 3KSI A; 2W6J H; 2WKR A; 3F89 A; 4OOY A; 2QJK C; 3AEE C; 1JEK A; 5CBO A; 2W1R A; 4E3J A; 1IK7 A; 4IVI A; 2ZT9 B; 3P09 A; 4I3J A; 3TYY A; 4ZMD A; 3PR6 A; 4N92 A; 4CQH A; 1AA0 A; 2Z6C A; 4NEE D; 4JLF A; 3GF3 A; 5J3W A; 1H88 A; 4AUW A; 3TG9 A; 3D71 A; 1NJI Q; 4Z9Q A; 3GHG B; 3ZQ5 A; 4JXW A; 2NPS D; 2CPB A; 1YMX A; 3KZI E; 1L0F A; 4UA9 A; 4RX2 A; 2O01 J; 4CLC A; 2BEQ D; 5CCG C; 2JKT M; 3OLO A; 2FY8 A; 1YPR A; 4OGQ B; 1DH3 A; 5AW9 B; 3P7N A; 1KB9 E; 2YO3 A; 1VQQ A; 3IF6 C; 4Y28 J; 2Y2L A; 2KS1 B; 4NXE A; 3MFD A; 4R4L A; 3I7J A; 2AEM A; 3BRM A; 3UDF A; 1VQP P; 4FTX A; 3M91 A; 2QJY B; 1P9R A; 2KP8 A; 2WVR A; 2W1T A; 2N1T A; 1M1J B; 1BLC A; 3P01 A; 5BU5 A; 4PJ0 E; 2B02 A; 3F1N A; 2E8J A; 1QME A; 3S7P A; 1T3J A; 2W8Z A; 1KYO E; 4DF6 A; 2JO1 A; 2O9C A; 2X02 A; 2XD1 A; 1QL1 A; 1RH5 B; 2KNC A; 5J7E A; 1FQG A; 3Q5P A; 5EOO A; 2E76 B; 2XNX A; 3G3Z A; 1KV4 A; 2V2F F; 4WUJ A; 1PWD A; 1RF1 A; 2M5A A; 4JF4 A; 4L76 A; 3VP2 A; 1JVJ A; 3S4R A; 4H13 C; 4JF7 A; 3HUS B; 3ZFZ A; 2J5U A; 2BTF P; 4X68 A; 1L0N D; 2PFX A; 3C2W A; 4D60 A; 1X9V A; 2JWD A; 2JR8 A; 3FWL A; 4WEJ A; 4A5R A; 2WSF H; 3NMD A; 1K38 A; 2A45 I; 2Y2N A; 2ZQ7 A; 3LR5 A; 4X56 A; 1EXJ A; 1ES5 A; 4XT2 B; 2IWC A; 4H0L C; 2WZZ A; 4MLL A; 1Y54 A; 3OA7 A; 2PU2 A; 1IZN B; 3GMA A; 3CWB D; 4DCK A; 1GK6 A; 4WLA A; 3V50 A; 4EUZ A; 1SFC B; 4EQ1 A; 2RN0 A; 4GOF A; 3V39 A; 2W6A A; 1D06 A; 2ZMF A; 4L9F A; 1FZA A; 3G2Z A; 5L07 A; 3OC2 A; 3UPP A; 3VP3 A; 1BYW A; 2OYH A; 3BCC D; 2QE7 H; 4RQ9 A; 2QRX A; 3UE3 A; 1LT9 A; 2H0T A; 2VA0 A; 3PBO A; 2O99 A; 5E2G A; 2P7J A; 4Y99 B; 2JN7 A; 1LWU C; 2HP9 A; 5FAS A; 1NKZ B; 4U3F D; 1XA7 A; 2EX2 A; 1MY8 A; 2Y91 A; 5EM0 A; 4R4R A; 3WS2 A; 2HPC B; 2WPS A; 2PAV P; 4KZ6 A; 1YI2 P; 1RE4 C; 1NTZ K; 2AEF A; 2XLN A; 4RX3 A; 2I8D A; 4ME4 A; 2V0U A; 3F5H A; 5F1G A; 4IED A; 4DXB A; 3L73 G; 2XRN A; 2BCC D; 3CXH E; 5MC7 A; 4PV1 B; 1RQU A; 1PGO A; 1EXI A; 3E98 A; 4ZBE A; 5H2F H; 4C75 A; 1OFC X; 4GDB A; 1NYH A; 3AEA C; 1PZQ A; 3MQO A; 2HJ9 C; 3WWX A; 1RF0 C; 4GD8 A; 2V4H A; 2JP3 A; 4G3K A; 4ZJ2 A; 2P04 A; 2PD8 A; 1HH0 A; 3AE8 C; 1NXY A; 4HJ4 A; 3WS5 A; 1N7L A; 2Y4A A; 4EBL A; 2Y2G A; 4GIF A; 2OWJ A; 1KQS O; 4X25 A; 1L0G A; 5A93 A; 1KIL B; 1TU3 F; 2DRW A; 3C5A A; 4Y15 A; 4DE1 A; 3VV4 A; 4E6X A; 3L73 E; 1OT9 A; 2JBF A; 1LT1 A; 2FBW C; 1MWT A; 2ZOI A; 2WGV A; 2Y2K A; 1OTD A; 2OV5 A; 1YYC A; 1FOS F; 3C30 A; 5AQA A; 1ZP0 C; 1K57 A; 3CI9 A; 2IBZ G; 4I1L A; 3B33 A; 3ITA A; 3VOL A; 3AED C; 2LB9 A; 3BFC A; 1JM0 A; 1UIX A; 3HUS A; 3AEB C; 4ARZ A; 2HDU A; 5EM1 A; 4X69 A; 1A02 J; 4R3B A; 1IKG A; 4H6J B; 1HBW A; 4EIJ A; 5M18 A; 3QHY A; 3SWY A; 1NVO A; 2OYI A; 2RH0 A; 1YLP A; 3D3O A; 1XKZ A; 1J1D B; 3FKW A; 3H32 B; 2ZMA A; 1R5S A; 1NWZ A; 1Q81 Q; 1I2W A; 1J1E B; 3CCS P; 3U2A A; 1YQ4 C; 3L73 J; 4IHQ A; 5CMZ A; 3GG2 A; 5AQ9 A; 2HG5 D; 2IBZ E; 3HJK A; 1SFC A; 1K6R A; 1XJ4 A; 3V3S A; 2PYR A; 3Q2Y A; 4S2K A; 1GHP A; 5EVI B; 2O9B A; 5APV A; 4IFD K; 3E2K A; 3KX0 X; 2PP6 A; 1EDJ A; 2OLV A; 2PBY A; 2XDM A; 2XU6 A; 3E2L A; 5AVZ B; 3MKE A; 4ETZ A; 3KYZ A; 3KYE A; 3ZG9 B; 2OYO A; 2V1B A; 1P84 D; 4BRY B; 3FXE A; 3AE5 C; 4N6J A; 3W2Z A; 5GLB A; 3N6I A; 4E3O A; 1CEF A; 1W2E A; 4IBR A; 1Y47 A; 1GDT A; 3D4F A; 3LY3 A; 4EES A; 2I1J A; 3CHW P; 1CI9 A; 3LCE A; 2KSE A; 1OTE A; 3HLE A; 3NOP C; 4WB4 A; 3LY4 A; 5AW3 B; 5TIS E; 1JWZ A; 4R3J A; 4KG5 A; 2IWB A; 4R6L A; 2FKW B; 1UII A; 1NTZ G; 5FQM A; 4HYT B; 2PR6 A; 1G5U A; 2C5W B; 1IFI A; 1KQF B; 2J3T D; 3MKF A; 1C3B A; 4HI4 A; 4YWZ A; 2L5G B; 1AVO A; 3PLN A; 2OTJ P; 3H7W A; 4H13 B; 5E79 E; 5E43 A; 4EXO A; 3ZDM A; 4OH8 B; 4XA4 A; 2EXB A; 4CLC C; 1KIL A; 2XH9 A; 3H1H D; 2YIU B; 2OSU A; 1BCC G; 3A3Y B; 2D2C D; 1LT0 A; 4HH3 A; 3TE8 A; 3C7U A; 3L72 J; 2BEZ F; 3KO6 A; 2HJE A; 2ZVN B; 1HTZ A; 3M9Q A; 4S2N A; 1NTZ E; 3CCL P; 2P67 A; 1CSB A; 5AVF A; 2O01 H; 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