4ILGB

Crystal structure of aar2p in complex with the prp8p rnaseh and jab1/mpn domains
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
252
structure length
252
Chain Sequence
AMNSSNYAELFNNDIKLFVDDTNVYRVTVHKTFEGNVATKAINGCIFTLNPKTGHLFLKIIHTSVWAGQKRLSQLAKWKTAEEVSALVRSLPKEEQPKQIIVTRKAMLDPLEVHMLDFPNIAIRPTELRLPFSAAMSIDKLSDVVMKATEPQMVLFNIYDDWLDRISSYTAFSRLTLLLRALKTNEESAKMILLSDPTITIKSYHLWPSFTDEQWITIESQMRDLILTEYGRKYNVNISALTQTEIKDIILG
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for dual roles of Aar2p in U5 snRNP assembly.
pubmed doi rcsb
molecule keywords A1 cistron-splicing factor AAR2
molecule tags Splicing
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 84
structure length 252
sequence length 252
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.80.40 Mainly Alpha Up-down Bundle Acyl-CoA Binding Protein Acyl-CoA Binding Protein 4ilgB02
3.30.420.230 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ilgB01
3E66A 4ILJA 3SBGA 4JKHA 4JKFA 4JKBA 3E9OA 4JK8A 4JKCA 4JK9A 4JKDA 3E9LA 3SBTA 4JKAA 4ILHA 4JKEA 4ILGB 4JK7A 4JKGB 3ENBA 3E9PA 4JKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EHUA 1HX1A 1QQCA 5KQDA 2ZM6K 4LF7K 4B3SK 3MCPA 1TKZA 4DR1K 3SCXA 1CXUA 3GDQA 4DR5K 5AQXA 3DRSA 1RT6A 1NOZA 3SV3A 4CGFA 4PKIA 5AQYA 3SZ2A 3TR8A 3TTFA 1NGAA 3ZLJA 3ZT2A 1WLJA 5CHIA 1TL1A 3L2RA 3V1OA 3VPZA 2RE2A 4GNIA 3J8AA 3NGIA 3DOLA 4IG0A 1IKVA 1D4XA 1CZ9A 2YHYA 4DFMA 1NGEA 3M6GA 3J7AP 5I42A 4H0TB 3TU5A 2W40A 2D1KA 1VSDA 3IDHA 4CVNE 5AR0A 4OPHA 5JVGL 4Z4FA 2HBLA 4FLZA 3EEQA 4RCHA 4GV6A 4DQRA 4F3TA 2YJEA 1RTJA 1S3XA 2B6AA 3L4QA 3PX0A 4E3SA 4H0XB 1R59O 1B92A 4DV0K 5C0YA 3NVMA 1Q18A 1I3AA 4C8LA 1JKHA 2PY5A 1VQLN 2FXUA 3BZKA 4PL7A 4HUEA 2QXFA 4CF9A 1YTUA 3AVAA 1NKBA 1FW6A 4FZXC 2KZMA 4CEEA 2Q0UA 3CERA 4DR3K 2HVHA 1TAUA 1RFQA 2E5LK 3SUPA 2WH5A 2E6LA 1ASVA 2UYTA 4W5OA 3VERA 3HI0A 4CGIA 2HHSA 4IOCL 3RTVA 3B8AX 3MAQA 2YKMA 4YDUA 3O4WA 4CGHA 1HRHA 2D10A 3DLBA 5CZ2A 2J0JA 3L3VA 1I39A 3WNFA 3KD1E 1WBDA 4CJQA 2NLXA 2VQFK 3LP0A 4N5SA 2QA4N 3JS6A 1IBKK 4OLAA 1ATNA 3SPZA 1TGOA 1Q82O 5CY4A 1T7PA 4Y1DA 1K9MO 3X23A 4FPAA 4B9MA 2DTUA 3WXJA 1NGGA 3O5BA 1D9DA 3AVGA 1BISA 1G15A 2A1RA 1KFSA 3ZT3A 1CXQA 4RTFD 2IC3A 3PSFA 3MXIA 3BGRA 3KLGA 3H1VX 4WYBA 1HPZA 1Y64A 5BRDA 2UU9K 3T1AA 4HVJA 2BDPA 1OH8A 3VQEA 1XNRK 4E1JA 1VQ8N 4BROA 4M7XA 1ZBHA 4ID1A 1ZYQA 4J8FA 1EO1A 1IO2A 3G10A 4DTPA 1QHTA 4EAHD 4DFPA 3U7DA 4LF6K 1IV0A 5AQHA 1I94K 4E89A 3CQ8A 5TKWA 4HCBA 3ZSYA 4PHTX 4CJWA 1TK0A 3ZSWA 4FK4A 4KI4A 3M1FA 4DTJA 4AHCA 2J4RA 1JLEA 1EWQA 2HRJA 1O1WA 1GOCA 2ASOA 3HM9A 1FXXA 4CEQA 4CJLA 3ISNC 4BR0A 1REVA 2IIRA 1YJWN 3N4PA 1EQYA 4DUZK 1H4RA 1RTIA 3CCMN 3LP1A 4QS9A 4KHQA 4DFJA 2R82A 3CCJN 2D0BA 1HQEA 4MQ3A 2P9IB 5AZIA 1U6ZA 4PA1A 4BQZA 1GOAA 4FJ8A 4CEOA 3SJJA 4DSKA 2OTJN 1BWFO 4G9ZA 3OBWA 2PFUA 2PBDA 3KK7A 1W9HA 4I9QA 5BPMA 1YTAA 3KD5E 3NF6A 2V52B 3VF2A 4JI7K 2PAVA 2QEXN 3QNOA 5E41A 1X3MA 4V19S 5AZIB 4OKKA 4FJMA 3UKRA 2ZE2A 3ENHA 5F1XA 3NAEA 2I1JA 3DOKA 1J6ZA 3MXMA 2HNZA 4MLHA 2J0KA 4IJAA 5C24A 5M1NA 3B6PA 3M3ZA 5ADXH 2H3GX 4FJXA 5J2PA 3TAEA 3IAYA 4E7JA 4FJGA 4CJ5A 4E7HA 4B8CA 3GL1A 4LFAK 4HDQA 2RKIA 1M90O 1IBLK 4F3OA 4RW6A 1VSKA 2FDQA 3ZSXA 1T03A 4OO1J 4K8ZA 2OPQA 3F5TA 2G8UA 1GG3A 3QO9A 2OCEA 1EP4A 2Q1NA 3U6FA 4CHOA 1L3UA 4CD1A 4DV7K 4CZHA 1VSJA 3QETA 1HMVA 2IVOA 4CECA 1E4GT 4WE1A 4Z4EA 2HHVA 3CQYA 1RDAA 2QWOA 3TWHA 2HE7A 3ZSVA 1ZC6A 3DRPA 3VQCA 5KRTA 3KKSA 4DF8A 4CHPA 5LMNK 3GG4A 5K14A 1TUYA 2NRHA 3S3NA 3V81A 4HDOA 3G9WA 1U47A 4A5AA 1NGIA 1JXBA 3CCEN 4H5WA 3AA3A 2D0CA 3D7EO 2W42A 2YVCA 2BUPA 4AHUA 4E7LA 5IJMA 1DTTA 3RMCA 3SAHA 3CYMA 1UAXA 4HTUA 1VHXA 2CGJA 3BZCA 3ITHA 3CJBA 3JYTA 2P1JA 5FPNA 5C10A 3SNNA 3K59A 3A0IX 4F7GA 2ZJPL 3VETA 5E84A 3AGKA 3AVJA 4FL9A 3TI0A 4WQ4C 4KH5A 3CPWM 3PZDA 4DV6K 4F9OA 4LC9B 3O4NA 2OA8A 3DLEA 1KRPA 2D5RA 2WUSA 3HXMA 4ELTA 3O1WA 4GW6A 4ICLA 3IVFA 3UB5A 4CGGA 1VBGA 4HCCA 1N6QA 4H0OA 2FLOA 3F73A 2Q2RA 3SQ4A 1UA1A 2IVPA 1IH7A 1A5VA 1VRTA 2O8CA 3HOSA 4ZRJA 4WF9L 1HYZA 2P9PA 4HTLA 3R3LA 4KHNA 4BVOA 4NYFA 3LWMA 2ZJRL 1RBRA 3M5RA 3AU5A 1RCHA 3SV4A 1JCGA 1BI4B 1NOYA 3EKSA 4JKGB 3D6RA 4FWRA 4YOYA 3AVFA 1SQKA 3J7ZO 2CQUA 1WSIA 5M1KA 4CHZA 4IFEA 4RWTA 1YVNA 2E1ZA 4EHTA 4B3TK 1CLQA 4LF4K 3AY9A 3OY9A 4M3RA 5FRMA 3MXJA 4BDYA 2W41A 1YIJN 4BGBA 4LH5A 1YF5L 1E5WA 1RT2A 3I0SA 2IGIA 4AHSA 2QWLA 5GIPA 5AZJA 1Q9YA 4J2DA 4ZTFA 4BE0A 3G25A 5KI6A 2FBYA 3FLCO 2UXCK 1QQMA 5J2MA 2P9KA 1EF1A 2DFFA 3NMUA 1JLBA 1X1PA 1RT5A 2BH1A 3RR8A 2EMSA 4BRNA 4BRFA 3SMPA 1NGDA 3PY8A 5AZJB 1KBLA 2NRWA 5AQMA 1TYQB 4CGJA 1U49A 4ZTJA 1S1TA 2FBXA 2YNGA 4YOUA 1IG9A 2HMPA 1RBUA 3K0SA 4PKHA 4OPKA 3IFRA 1VQ9N 3MEGA 2P9KB 4FWNA 1NK0A 4GKKK 4LF9K 1FKOA 2ASMA 3NHGA 1EX4A 4ISGA 2ABDA 4FOEA 3OS0A 1U2VA 4ELUA 4NCBA 2P5OA 3LDNA 2KQ2A 2ITMA 1QE1A 3U8ZA 4CF0A 1KXPA 3NF8A 1KSPA 4LSLA 3OYNA 1RDDA 2XY6A 3THXA 2YJFA 1C6VA 1XI1A 1HNIA 3RR7A 1UWBA 5BREA 4FJ9A 1NVLA 3DYAA 4QAGA 4OX9K 4DR4K 3MN5A 4LFBK 1U48A 2LSNA 1S22A 2W6KA 1N36K 5AQJA 2O4GA 5FPDA 1A5XA 4L8RB 3HP6A 2WONA 2EMTA 1C0TA 3AVLA 3THXB 1S9EA 2HSTA 4KTZA 2UUBK 4YY3K 4A2AA 3K5NA 2F4VK 3V9WA 5ADXA 3AA4A 2GV9A 4BC5A 1HKGA 4OPJA 3CCQN 2Q36A 2GUPA 3VEYA 4AILC 1QVFM 4KHYA 4JD2B 1GC7A 1C0MA 4RW7A 1LWCA 2A3ZA 1NJWA 1QSSA 4RG8A 1M1KO 3WNHA 3QB0A 1DLOA 2ITGA 4M7YA 3LAKA 1L3VA 1HJRA 4FVMA 3CIPA 2HHHK 3VQBA 2Z1HA 1ESVA 1Y19B 4FSVA 1JLCA 2VGMA 5T7BA 3CCSN 3Q7CA 1NG9A 1GC6A 4KAZA 1JJ2M 3SAFA 1HPMA 3CCUN 3DXKA 5GINA 5KRSA 3U4LA 1JL2A 1BQMA 1IKWA 1BOTO 3OYMA 4MDBA 2E2OA 4ILHA 1VQMN 1SGHA 1YAGA 3TAFA 4N47A 1XC3A 4FJ7A 1T3VA 3WNGA 3SYZA 1L3SA 4ELVA 2CH6A 4YOVA 3QFUA 4DV2K 4ISEA 3EZ5A 4DR7K 4GMJB 3W3DA 3VGMA 1TVRA 4DQPA 4FK2A 3DXMB 3DXKB 3VQAA 1NGBA 2P9NA 2IAJA 3P4IA 3VOVA 4DTXA 3TTCA 4CHYA 4DTNA 1VQON 4F4KA 3QFPA 4J2BA 1BIZA 1VK0A 2FSJA 1EWRA 3TSUA 3R9PA 1GLDG 1K8KA 2JGUA 3CETA 4CBWA 3D0PA 1JCEA 1MIXA 4X65K 4FJJA 2Q97A 4IFYA 4BR4A 2X0SA 5JS1A 4FO0A 4K42A 4U7BA 1LV5A 3HBTA 3SUQA 5M1FA 1K8KB 2AP1A 3HVRA 1N33K 1Z05A 2WTUA 3R1XA 4RW9A 3BY5A 4BRAA 3NFAA 1NGJA 3C6AA 3KZBA 4LF5K 1S72N 3A5MC 4KHWA 1Z6RA 3T19A 1YJ9N 5J2QA 3BUZB 3QEIA 4NXNK 1SKSA 4UY8O 5AQQA 1KC7A 3NF7A 5FPEA 3AO3A 4CK2A 5KPZA 3VMFB 1K6YA 4L3QA 1MWMA 1XHXA 1VBHA 2X6SA 4NB4A 4CZKA 2QM1A 3ZSOA 1D8YA 3G4SN 3VEWA 3OYHA 4KHSA 5CR4A 4R5PA 3VESA 2VG6A 5FPMA 3O9QA 2VG5A 3SUNA 1O13A 1DT9A 5DMRA 1DIKA 3CFPA 2DIKA 4NLCA 3TPQA 4YFUA 3FZFA 3NCIA 3WNEA 1XMQK 3O80A 3J80O 5J2NA 1VQKN 2HHUA 2YHXA 4CESA 4CZIA 4DSJA 3VGLA 3LZJA 3MX5A 4BRKA 4DTRA 5FRNA 2OPRA 1S1UA 4BR5A 4DTMA 4DV1K 2I7PA 1VQ7N 4H0YB 3WUHA 3FZHA 4KI6A 3ZX2A 3T1YK 3SUOA 4FWQA 2B4JA 4Y1CA 3C0BA 3K5OA 5EU7A 1TUUA 1EXQA 1RDBA 3K9KA 3MN9A 4OLBA 3E9PA 3FLVA 3IUCA 1QS4A 4IJNA 4KB0A 2HVIA 4H5VA 3E66A 3P5JA 3FZKA 4AHTA 3HT3A 3RRHA 5JVLA 2JLEA 1BUPA 2G8WA 4EZ6A 1JLAA 1OH6A 4KH6A 4WFAL 1IJJA 4BY9C 2OTLN 3VEVA 1MU2A 3VA0A 1KQSM 4HWIA 1QZ5A 3L2UA 3QICA 1EETA 4B9TA 4OPAA 1S1XA 2QKKA 5DM7L 4ILJA 4CFCA 1XMOK 4KV8A 5CE3A 2E2PA 1S6QA 3V6DA 4MO5A 4KPYA 3MX2A 2RHKA 4FVUA 3I56N 4JKEA 2FBTA 3THVA 1ITGA 3RMBA 1ATRA 3A2FA 4KB1A 1GGOA 1C1AA 3IRXA 4OKJA 4E7IA 5M1OA 3RVCA 2I1KA 3AAPA 4KREA 3OYAA 4KKOA 4DV4K 3OA9A 4HHTA 3VQ6A 1YUWA 3KLIA 1MDUB 2GEMA 1VQ4N 4CFAA 2YI1A 3T3FA 5KTQA 2P9IA 4CD3A 3SQ1A 3NE6A 1SV5A 4FZYA 4IOAL 4CBXA 3O3HA 5KQ8A 4XH5A 2I7NA 3IG1A 4NY0A 4DKWA 1NKCA 4BRLA 1YHQN 3QEVA 1KD1O 2EHGA 2G8HA 2YX6A 3WEEA 3FGUA 3W0LA 4EIAA 1JCFA 1HNZK 1Y97A 3HPGA 4M41A 4CFDA 4JK8A 4KTWA 3SAGA 1NK4A 3DJCA 1VQNN 3QERA 2UXBK 1N8RO 1OH5A 1FK9A 1QSYA 4C1NK 2ATQA 4FWLA 3BINA 3L4IA 3ULDA 3UKUA 2X78A 3C94A 3CJ1A 3WEEB 4B9SA 1D9FA 4CIEA 4FJHA 2HHWA 2AJQA 2F96A 3QIPA 4PKGA 1LWEA 1VSHA 2WOMA 4Z4GA 4FK0A 3VN5A 2Q0RA 4CEBA 3TAPA 3RSEA 2Y1JA 1RILA 2O8EB 2YNFA 1HQUA 1TAQA 5JS2A 4IDKA 3UKUB 3VEOA 3G0ZA 3KTQA 3EKUA 1U04A 3AA5X 2G8VA 1JXEA 2E2NA 1Q8IA 3OJUA 1HKCA 1YVUA 2E4LA 2YNHA 5C12A 4C8KA 3HVTA 3RSEB 4B9VA 1RT7A 1C0FA 2BANA 3D45A 3NF9A 4JI1K 3MCAB 3T69A 4CJ4A 1MK7B 3GOIA 1X9SA 1BDGA 3LPUA 2YHBA 4JN4A 3LAMA 4NCAA 4RW4A 4DFKA 3MN7A 1SS6A 1GLJO 2D4WA 4DSEA 3VQ9A 1X9WA 1VSIA 4DV5K 3T1HK 3CG7A 4J2EA 3OYBA 3V9UA 2ZGZA 1W2BM 3OS1A 3S3MA 1B9DA 3J7YP 3I8DA 4IEIA 3CI5A 3C95A 3SQ2A 4K25A 4A5BA 3O08A 3K58A 1WB9A 1HNWK 4BR2A 5BR8K 4NYNA 1DEJA 4YOWA 3CCRN 2YKNA 5KPTA 4MFBA 3V9ZA 4FLYA 3LDOA 3VTHA 1Q81O 3HOTA 2HBJA 5FLXO 4O0JA 3AVKA 1A5WA 2VG7A 4JHDA 4LY7A 4BRMA 3PO5A 1FKPA 4F2RA 5DK5A 4JK7A 3N4QA 1Q86O 3HK2A 3ZDTA 3OYDA 3QIJA 5BN8A 3U8XA 3THWA 1TK8A 1NLVA 2ZWHA 3KLHA 2KW4A 3AVMA 4DLEA 2KHOA 4JHDB 3SI6A 4U67L 4IWVA 3M8SA 2D0OA 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4YOXA 2VGNA 1ASUA 2HF4A 3NH1A 1QZ6A 1QTMA 3PUFA 1VQPN 4DUYK 4IG3A 2NRTA 3QEXA 3TABA 3OBYA 3O9UA 4WQ5C 3HTVA 1SZ2A 1S6PA 3MWTA 4IFVA 1VSLA 3AV9A 1VQ5N 4XH4A 1HB6A 2KZZA 1GLCG 3O3GA 4FJNA 2YHAA 4JI6K 4BWMA 1QQNA 5CYMA 1SL1A 3LM2A 4CE9A 1XHZA 4JD2A 2P9LA 5AQKA 3PLAA 4Z4IA 4ZHRA 3VA3A 3HYFA 3KWGA 4JKBA 5SZTA 4O5BA 4E7KA 5AQOA 3VQ5A 3ZEUA 3MEDA 4Q0BA 4O4GA 3HPOA 4CJ7A 1ACAA 3ATUA 2HF3A 2XO7A 3I8BA 4HUFA 2DPNA 4CJTA 4C1NI 2P9LB 3D2EB 1RTDA 1QSLA 1XUPO 1KAZA 1WAJA 3IKMA 4B3MK 3HPHA 4CJPA 4CZFA 2HBKA 3ZEUB 2IDOA 1YXQA 3UE5A 1WSEA 1ZBFA 3H46O 1X9MA 3ZX0A 3AO5A 1WSGA 1BIUA 1GLLO 5JICA 4CZMA 1NMDA 2A1SA 3K5LA 3DXMA 3AAQA 4JAXA 4H03B 4IDHA 3CJ7A 4FWPA 1UOCA 3CJAA 1HJOA 4X66K 2RF2A 5BPLA 5HOOA 3VQQA 4M3UA 3L6QA 3ULEB 4FWMA 1Z26A 5JMVA 2O8FA 1CZAN 3R6MA 3ID6A 3TSPA 3G6EN 2GTDA 3MWPA 2JWLA 4B8AB 1RT4A 1J5OA 2ETJA 1HLUA 1Q9XA 3EO3A 3ENOA 5AQPA 2HOEA 2IVNA 4YOTA 2FJ9A 4DQQA 1LW2A 3DWLA 4I9LA 1SKRA 4DU4A 4M3YA 5AQWA 4B9UA 4O55A 3I33A 5H1SQ 2WBNA 3EY1A 2XY5A 2O8FB 4C8NA 1ZXOA 1HUXA 1NNEA 4B1WB 3CCVN 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 3E66 A;  4ILJ A;  3SBG A;  4JKH A;  4JKF A;  4JKB A;  3E9O A;  4JK8 A;  4JKC A;  4JK9 A;  4JKD A;  3E9L A;  3SBT A;  4JKA A;  4ILH A;  4JKE A;  4ILG B;  4JK7 A;  4JKG B;  3ENB A;  3E9P A;  4JKG A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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