4I9LA

Crystal structure of the d714a mutant of rb69 dna polymerase
Total Genus 308
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
308
sequence length
903
structure length
903
Chain Sequence
MKEFYLTVEQIGDSIFERYIDSNGRERTREVEYKPSLFAHCPESQATKYFDIYGKPCTRKLFANMRDASQWIKRMEDIGLEALGMDDFKLAYLSDTYNYEIKYDHTKIRVANFDIEVTSPDGFPEPSQAKHPIDAITHYDSIDDRFYVFDLLNSPYGNVEEWSIEIAAKLQEQGGDEVPSEIIDKIIYMPFDNEKELLMEYLNFWQQKTPVILTGWNVESFAIPYVYNRIKNIFGESTAKRLSPHRKTRVKVIENMYGSREIITLFGISVLDYIDLYKKFSFTNQPSYSLDYISEFELNVGKLKYDGPISKLRESNHQRYISYNIIAVYRVLQIDAKRQFINLSLDMGYYAKIQIQSVFSPIKTWDAIIFNSLKEQNKVIPQGRSHPVQPYPGAFVKEPIPNRYKYVMSFDLTSLYPSIIRQVNISPETIAGTFKVAPLHDYINAVAERPSDVYSCSPNGMMYYKDRDGVVPTEITKVFNQRKEHKGYMLAAQRNGEIIKEALHNPNLSVDEPLDVDYRFDFSDEIKEKIKKLSAKSLNEMLFRAQRTEVAGMTAQINRKLLINSLYGALGNVWFRYYDLRNATAITTFGQMALQWIERKVNEYLNEVCGTEGEAFVLYGDTDSIYVSADKIIDKVGESKFRDTNHWVDFLDKFARERMEPAIDRGFREMCEYMNNKQHLMFMDREAIAGPPLGSKGIGGFWTGKKRYALNVWAMEGTRYAEPKLKIMGLETQKSSTPKAVQKALKECIRRMLQEGEESLQEYFKEFEKEFRQLNYISIASVSSANNIAKYDVGGFPGPKCPFHIRGILTYNRAIKGNIDAPQVVEGEKVYVLPLREGNPFGDKCIAWPSGTEITDLIKDDVLHWMDYTVLLEKTFIKPLEGFTSAAKLDYEKKASLFDMFDF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A Remote Palm Domain Residue of RB69 DNA Polymerase Is Critical for Enzyme Activity and Influences the Conformation of the Active Site.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase, transferase
source organism Enterobacteria phage rb69
molecule keywords DNA polymerase
total genus 308
structure length 903
sequence length 903
ec nomenclature ec 2.7.7.7: DNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2012-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00136 DNA_pol_B DNA polymerase family B
A PF03104 DNA_pol_B_exo1 DNA polymerase family B, exonuclease domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1280.300 Mainly Alpha Up-down Bundle Monooxygenase Monooxygenase 4i9lA05
3.30.342.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich DNA Polymerase; Chain A, domain 1 DNA Polymerase, chain B, domain 1 4i9lA01
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4i9lA02
3.40.1820.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Ribonuclease H-like motif DnaQ-like 3'-5' exonuclease 4i9lA06
3.90.1600.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Palm domain of DNA polymerase Palm domain of DNA polymerase 4i9lA03
4I9LA 1B9FA 4JS4A 4F4KA 4FJ8A 4Y1CA 3LPTA 1D5AA 1KVCA 4CEQA 2HHTA 5FROA 4FYDA 4OKKA 3K5OA 4K8XA 3P1GA 3K58A 3DLHA 4HCBA 3AO3A 1TV6A 1WSJA 4CJ5A 1CZ9A 3KLGA 1L3SA 3SV3A 4B9VA 4M3UA 3S3OA 1KRPA 3DLGA 4CERA 4KFBA 4DF8A 3DLKA 3OVNA 4CJFA 1UA1A 1QSSA 5FRMA 4IDKA 3LWLA 1U45A 1T05A 3PO5A 2FBVA 4AHRA 2KTQA 1RTHA 2O4GA 2HNZA 1KLMA 3NF7A 5SWMA 5I3UA 1RBRA 1VSKA 2OPRA 1HYZA 1D8YA 3V9UA 2X74A 3RRGA 3B6PA 4DFKA 4I9QA 1KVAA 1W0HA 3OYDA 3AVHA 4H8KA 3ZT1A 4NYNA 4CHZA 5KTQA 4CJ4A 3RMDA 4CEOA 4DSFA 1XI1A 3OYBA 3LAMA 1HNVA 5CZ1A 2F96A 3DRPA 4CJLA 4FK4A 4HUFA 2KFNA 1RBVA 4L8RB 1L5UA 2HMIA 1K6YA 5JS2A 3KKSA 3O3HA 3OYMA 3AVBA 3O3FA 4DSLA 1KVBA 2D0AA 4OGEA 3T1AA 3OYGA 3V9XA 1NJZA 1RT6A 3L2WA 4DLEA 1ITGA 4J2EA 3B6OA 4IG0A 1A5WA 1HQUA 3KKRA 4AHSA 4CGIA 4HUEA 1D9FA 1U49A 3LP1A 4F3OA 4FJHA 3PY8A 4W5RA 1J54A 2Z1JA 4CFDA 4B3OA 1WSHA 4CK1A 4CEZA 1RBUA 4ICLA 4FJ7A 5C25A 3RTVA 1RTIA 1WSGA 3NGZA 1L3TA 2IDOA 2HHXA 4IBNA 2VG7A 4B8AB 4DFPA 3LDSA 1RT2A 2FBXA 4M41A 4PUOA 1TAUA 1BQNA 1VK0A 2YKMA 3HT3A 4E3SA 1JLAA 3NAEA 1L3VA 3CFOA 3SI6A 3DOKA 3ZSXA 4DF4A 4NCGA 5KRTA 3DMJA 3ZSRA 3BGRA 3TAQA 4CEAA 1HYVA 1N5YA 1T8EA 3MEDA 4OLBA 1NJYA 4CGJA 4DFJA 3TAEA 3TAPA 4H4MA 4CEEA 1VSDA 2Z1IA 1NJXA 5SZTA 4KB1A 4FCYA 1XHZA 1C0TA 1SL0A 4EP4A 2HHWA 1ASWA 1S1XA 3AO4A 1RTDA 4DWIA 2YNFA 4QOZB 1KTQA 1MU2A 1S1UA 3C95A 4FJLA 2FBTA 1F21A 1FKPA 3KTQA 3P83D 3M8PA 2XHBA 1RBSA 4B08A 3L2QA 1QS4A 4GVMA 3VQDA 3ZT2A 3QEWA 3AVIA 1C0UA 1J5OA 3F9KA 3AO5A 1JLBA 3VQQA 5HLFA 3QLHA 3NGIA 3CG7A 2RPIA 3HVRA 3QEXA 1HPZA 5KGXA 1JXEA 3K57A 3VA3A 3FFIA 4BDPA 4OLAA 2X6NA 3L3VA 5T7BA 1QTMA 3OYJA 1S1TA 3DLEA 4C8LA 4DG1A 4KKOA 4DQPA 2GV9A 4J2DA 3HL8A 3MEGA 2IS3A 3HK2A 3DRRA 3C94A 4OKJA 4RG8A 4B8CA 3OYNA 3HP6A 1I39A 4DTJA 2RKIA 3OJUA 1TGOA 2G8HA 2YNIA 5FRNA 3NF8A 2VG6A 1RDDA 4GMJB 4LD0A 3TANA 2ATQA 5HRPA 3JSMA 2HHUA 4OJRA 2EX3A 2VWKA 3NE6A 3WNEA 2X6SA 4QCLA 2ZD1A 3LP3A 4Z4IA 3NCIA 3LP0A 3PUFA 3TAMA 4CESA 4FLWA 1I3AA 2B6AA 3OYIA 1IG9A 4E1MA 3KK3A 3K59A 4KTZA 3TARA 4KREA 1NKBA 3UIQA 4KHUA 3RMBA 4RW4A 4CECA 2A1RA 4KB0A 1BI4A 1U47A 4CF0A 2RF2A 2HHSA 3ISNC 4FM0A 4B9LA 3D0PA 2IOCA 2HB5A 1HMVA 2G8IA 1EXQA 4GW6A 4DMNA 4F2RA 4HCCA 4R5PA 1Z25A 3IRXA 2AJQA 4NCBA 3AA2A 3SQ4A 1S9GA 3S9HA 1EETA 2ETJA 1WSIA 3DI6A 3HP9A 3T19A 4ELUA 4FW2A 1ZYQA 4FVMA 3ZT3A 3O3GA 3G0ZA 2Q3SA 1N6QA 1JLCA 3LZJA 4I2QA 3LAKA 3TAGA 1RILA 2IAJA 3SV4A 2E6LA 3M8QA 3SPZA 1SV5A 4B9MA 3SNNA 1LAWA 4CJRA 2R7YA 4EZ9A 3OS1A 4FJ5A 2A1SA 1RT3A 1S6QA 4LH5A 4LSNA 3HPGA 5J2PA 1D9DA 2P51A 2G8VA 2OYQA 3KD1E 1JL2A 4FLXA 1VSFA 2X78A 4BACA 1UA0A 4M3TA 2E4LA 4CF8A 4CHPA 3LPUA 3PV8A 1CXQA 1RT5A 4CIEA 2XRIA 4CJWA 4N56A 4DQIA 1DLOA 4FJNA 2HVHA 1S1VA 3KJVA 4IFYA 2QKKA 4Q5VA 2QXFA 3PX4A 2YHBA 3IAYA 1BIZA 1UAXA 4FZZA 2D0CA 2E6MA 4DQQA 3SUPA 2P1JA 3ZSWA 3SPYA 1TK8A 1ZBUA 2VG5A 3O4QA 3V1QA 1U04A 2KW4A 4DS5A 3L2VA 4IG3A 2F8SA 4B9TA 1ZBLA 4BDZA 1VSLA 5HROA 4DTRA 4ZTFA 3SQ0A 4DS4A 1CXUA 2B4JA 3G10A 3NGYA 3M8SA 3THVA 4Q0BA 1IO2A 4KRFA 3KLIA 4CGHA 1WAJA 3JYTA 3V9SA 4E7KA 4O44A 4CF2A 1S5JA 3L8BA 5EU7A 1UWBA 2YHAA 3HVTA 4I2PA 3V9WA 1YTUA 3RMCA 1JLFA 4LSLA 2KFZA 4FK2A 4FZXC 2EHGA 3ZSVA 3P5JA 4Y1DA 3V1RA 4CJPA 3QNNA 2ZE2A 5JS1A 2GUIA 3SUNA 3HM9A 4I7FA 2IC3A 4PY5A 3LANA 4BDYA 1KLNA 1O1WA 3QEPA 4F8RA 4KHQA 2HW3A 1QE1A 4HVJA 2PZSA 4CJEA 3QIOA 3K5MA 3V9ZA 3RMAA 3EZ5A 3C6TA 1S1WA 2YNGA 4KHSA 2PYLA 2PY5A 1KFSA 1BCOA 1LV5A 1RT1A 1VSIA 1X9SA 3EYZA 4FM1A 3OYHA 2FBYA 4NYFA 1VSMA 4JRPA 1TKXA 4C8MA 3L2RA 2ZQBA 3VQ6A 4KV8A 4BE0A 4CJQA 4PWDA 3AVGA 4KHNA 4DSJA 2HNDA 3V81A 4B9UA 1QSLA 1BGXT 1TKTA 1S9EA 1REVA 4O55A 4KO0A 4FLUA 3ZSYA 4M42A 4CGGA 4E7IA 1NK7A 3H08A 4AHVA 4IKFA 1A5VA 4DTUA 3IS9A 1RNHA 3NH2A 3WNGA 1SKSA 1EP4A 3QETA 3KLFA 2P5OA 3HXMA 1UOCA 3VQ9A 3ULDA 4E7JA 1TK5A 4E89A 1NK0A 4KI4A 1HNIA 2DFFA 4AHTA 4J2AA 3AVJA 5C42A 3DYAA 4M3ZA 1J9AA 5J2QA 1NJWA 2G8KA 4CFCA 4W5QA 1ASVA 4JRQA 1NK8A 3KIOA 4N41A 3TABA 4N5SA 1U4BA 4J2BA 5KGWA 1NK6A 4KTQA 1BQMA 3QIPA 4EP5A 2OPSA 4ZTJA 4FW1A 3MAQA 2DTUA 4OGCA 3TI0A 3V6DA 1TK0A 1TKZA 3TAFA 1BHLA 4RW9A 2I5JA 1IKVA 2LSNA 1W9HA 2ITGA 4PA1A 3ZT0A 1LW2A 4NCAA 3HJFA 3VQ4A 3S3NA 3VN5A 5E41A 1JL1A 1YTAA 3RWUA 3SQ1A 1DTTA 1BIUA 3D45A 3VQ5A 3VQPA 1RDCA 4CF9A 3OYEA 4FJGA 1NOZA 4H4OA 2OPPA 1DTQA 1NK9A 4FJMA 1RBTA 2QK9A 3V4IA 3DLBA 4LY7A 1VRTA 4M3RA 3SJJA 3DRSA 1BL3A 4DTPA 1GOBA 1ZBFA 1YVUA 2BGGA 2IGIA 1CLQA 3DM2A 1JLEA 1TL1A 3CM6A 4CEFA 1NKEA 1NKCA 4DSKA 4AILC 1VRUA 4OPKA 3V1OA 2YNHA 3QESA 3BDPA 1LW0A 4C8OA 3HYFA 1KCFA 4MQ3A 3K2PA 3OYAA 3U3GA 4JS5A 1HYSA 4UQGA 2OZSA 3C6UA 4ID5A 4KI6A 1BI4B 4RW7A 4AHCA 1NOYA 1C6VA 1XWLA 1FKOA 3HPOA 3QERA 3MXJA 4FM2A 4O0JA 4CEBA 1B92A 2XY5A 4AH9A 4PQUA 5HRRA 3AA3A 3DLRA 3MXMA 4E19A 1VSJA 1Q9YA 4OKEA 3KD5E 3AO2A 2OPQA 3AVFA 1A5XA 1HQEA 3VQCA 1LWEA 4Z4CA 1QSYA 4CGDA 4IFVA 1LWCA 5CYQA 5FDLA 3VA0A 5KI6A 1GOAA 3ZCMA 4CFBA 3OYLA 1JKHA 4CHQA 3CFPA 4KAZA 1ZBHA 3I8DA 3VQ8A 3VQBA 2O4IA 4DU1A 4FZYA 4M3XA 4YFUA 2OZMA 3LP2A 4CHOA 1XHXA 3KK1A 1Y97A 1KFDA 2XY7A 4CIGA 3NF9A 1FXXA 4CHNA 3VQ7A 1JXBA 3OYCA 4G1QA 4E7HA 3SYZA 1J53A 2JLEA 1NK4A 1SL1A 4EZ6A 1SL2A 1HRHA 1KSPA 3OS2A 5CY4A 3QEIA 1WNSA 3OJSA 4FJJA 4Z0UA 4BE1A 4C8KA 3VQAA 4E1NA 4FJXA 5D3GA 4BWJA 4KHYA 4FLYA 2DFEA 3ALYA 3CFRA 3QINA 1RCHA 1BCMA 1JLGA 4B9NA 3M8RA 1EX4A 1S6PA 3I0SA 3AV9A 4HHTA 4K8ZA 1C0MA 1HJRA 5CZ2A 2OA8A 4XIUA 4FXDA 2XO7A 1C1AA 2FC0A 1TAQA 3LWMA 4HTUA 4RW8A 4DTOA 4KPYA 1RT4A 3NHGA 1ASUA 4B9SA 3RR8A 3VQEA 3HSTB 1IKXA 3U3YA 1WSFA 4BWMA 3AA4A 2Z1GA 4CJUA 5HBMA 3CQ8A 1C1CA 2KQ2A 1SKWA 4DTNA 3AO1A 3IG1A 4DLGA 5I42A 4W5TA 2Y1JA 4CCHA 3QO9A 4CHYA 1VSHA 1RTJA 4F2SA 2WOMA 4BE2A 4FJ9A 3HPHA 1T7PA 1BISA 4M3WA 4TSXA 4DU3A 3WNHA 5K14A 3PX0A 1R0AA 3ASMA 4DQRA 4DTMA 3TR8A 1T03A 1TKDA 2BDPA 2DY4A 2G8FA 4FLZA 2HNYA 3OS0A 3F73A 5HRNA 1RT7A 1X9MA 3ZSOA 3NBPA 3HO1A 1WSEA 2BANA 3EY1A 1JLQA 3K5LA 4E7LA 3T3FA 3E01A 4AHUA 4CGFA 4DQSA 1SKRA 4DSIA 4FLVA 3ZT4A 4CF1A 1SUQA 2KZZA 3I0RA 4CK2A 4OPJA 3U6FA 2D0BA 2P5GA 1NK5A 3ITHA 1C1BA 4LH4A 4FJKA 1LWFA 1GOCA 2VWJA 2HHQA 3SUQA 3QNOA 4W5OA 3NFAA 2Y1IA 2F8TA 4ID1A 2B5JA 3MEEA 1WN7A 4CIFA 4N76A 2WONA 3KLEA 4JLHA 4Z4GA 4O0IA 1RDBA 1YT3A 5DMRA 3NDKA 4ZHRA 3OYFA 3L2UA 5CYMA 1TL3A 2G8WA 4OVLA 3LZIA 3PX6A 3S3MA 1WLJA 4CEDA 3MECA 3AVCA 4RW6A 4HUGA 4W5NA 2DFHA 3AVLA 2YV0X 4DU4A 2BE2A 3CM5A 4CFAA 1X9WA 5J1EA 1TVRA 3RR7A 3AVMA 3AA5X 2D5RA 4ELTA 2YKNA 1XC9A 4CJTA 3DOLA 3SCXA 1Z26A 4CJ3A 4DTSA 3PO4A 4Z4EA 4CJVA 3KK2A 2HHVA 2W42A 3AVKA 3WNFA 4DFMA 2GBZA 5HRSA 3MXIA 2G8UA 4FK0A 3OYKA 2XY8A 3CYMA 4QAGA 3KLHA 4DSEA 4N47A 3NF6A 1WAFA 4M3YA 1RDAA 3LALA 3O4NA 1Q8IA 4FJIA 5C24A 3ZSZA 4CK3A 3K5NA 4WE1A 2Z1HA 4E0DA 2KZMA 1IKYA 5KRSA 3AVNA 3NH0A 4C8NA 1LAVA 3SZ2A 1EKEA 1X1PA 1QHTA 5DK5A 4FLTA 3SUOA 1VSEA 4CJSA 2PYJA 3AVAA 4Z4HA 3QEVA 2HVIA 3TWHA 5HP1A 1B9DA 5J2NA 4ELVA 5J2MA 4CJKA 4Z4FA 1ZBIA 2XY6A 1U48A 4KTWA 2RN2A 4CE9A 3L3UA 1G15A 1QQCA 3NH1A 3SQ2A 1L3UA 2NUBA 1FK9A 4YNQA 3OY9A 1CZBA 3RRHA 1Q9XA 4M45A 4DTXA 3ZSQA 3A2FA 4MFBA 4O4GA 2QKBA 4O5BA 4KHWA 4F3TA 1IH7A 2JGUA 1IKWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JS4A 3O9QA 2QA4N 4O8KA 4CEQA 3THWA 1T6DA 3K58A 3DLHA 1GLFO 4YHHK 3KLGA 4B9VA 4M3UA 4JKFA 1KRPA 4DF8A 4KFBA 3O6WA 3MK6A 2FBVA 1RTHA 2O4GA 3CJ9A 1DT9A 2O8FB 2P1MB 2OPRA 5BREA 3V9UA 3E4YA 4U67L 2ZJPL 2PFVA 1OVYA 4I9QA 3MN7A 5KTQA 4CJ4A 2P9LB 4CEOA 1E4FT 4XEIA 2WFBA 2F96A 5AZIB 4BRGA 5H1SQ 3T1HK 4L8RB 4IEEA 1OVQA 1GLLO 4DSLA 1KVBA 1NJZA 3T1AA 3E9LA 3L2WA 4CGIA 4HUEA 1I94K 3P4IA 4F3OA 3H46O 4HWIA 1HLUA 2Z1JA 4CFDA 5C25A 3GG4A 1WSGA 3CC4N 3HBTA 5M1FA 1HNZK 4DFPA 3LDSA 5AQGA 1TAUA 3THXB 1DGKN 3J8AA 5LJWA 4WFNL 3SI6A 2HBLA 4DF4A 3DMJA 3CQXA 3TAQA 4K43A 3MEDA 4CGJA 3TAPA 4YOXA 3AO4A 4BG8A 3C95A 4FJLA 2FBTA 4AM6A 4IOAL 2E2QA 3KTQA 3P83D 4B08A 2HMPA 4WYBA 1QS4A 3AO5A 2ASMA 3NGIA 4NO7A 5KGXA 3VA3A 3FFIA 4OLAA 3P39A 5T7BA 4C8LA 3FFKB 1DKGD 3HM8A 4RG8A 1D4XA 3OHRA 3OYNA 2RKIA 4DTJA 3NF8A 1KC8O 2O8CB 4LD0A 2ATQA 3BEXA 2EX3A 3NE6A 4MDAA 2X6SA 2ZD1A 2OVPB 3LP0A 3PUFA 4Z4IA 3OYIA 3K59A 1XL3C 1NKBA 4CECA 3KK7A 2A1RA 1U47A 2HSTA 3MN5A 4FM0A 3MCPA 2D1KA 1JJ2M 3VTHA 3DWLA 1XU3E 4DMNA 1Z25A 4NCBA 3SQ4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4JS4 A;  3O9Q A;  2QA4 N;  4O8K A;  4CEQ A;  3THW A;  1T6D A;  3K58 A;  3DLH A;  1GLF O;  4YHH K;  3KLG A;  4B9V A;  4M3U A;  4JKF A;  1KRP A;  4DF8 A;  4KFB A;  3O6W A;  3MK6 A;  2FBV A;  1RTH A;  2O4G A;  3CJ9 A;  1DT9 A;  2O8F B;  2P1M B;  2OPR A;  5BRE A;  3V9U A;  3E4Y A;  4U67 L;  2ZJP L;  2PFV A;  1OVY A;  4I9Q A;  3MN7 A;  5KTQ A;  4CJ4 A;  2P9L B;  4CEO A;  1E4F T;  4XEI A;  2WFB A;  2F96 A;  5AZI B;  4BRG A;  5H1S Q;  3T1H K;  4L8R B;  4IEE A;  1OVQ A;  1GLL O;  4DSL A;  1KVB A;  1NJZ A;  3T1A A;  3E9L A;  3L2W A;  4CGI A;  4HUE A;  1I94 K;  3P4I A;  4F3O A;  3H46 O;  4HWI A;  1HLU A;  2Z1J A;  4CFD A;  5C25 A;  3GG4 A;  1WSG A;  3CC4 N;  3HBT A;  5M1F A;  1HNZ K;  4DFP A;  3LDS A;  5AQG A;  1TAU A;  3THX B;  1DGK N;  3J8A A;  5LJW A;  4WFN L;  3SI6 A;  2HBL A;  4DF4 A;  3DMJ A;  3CQX A;  3TAQ A;  4K43 A;  3MED A;  4CGJ A;  3TAP A;  4YOX A;  3AO4 A;  4BG8 A;  3C95 A;  4FJL A;  2FBT A;  4AM6 A;  4IOA L;  2E2Q A;  3KTQ A;  3P83 D;  4B08 A;  2HMP A;  4WYB A;  1QS4 A;  3AO5 A;  2ASM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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