The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
73
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sequence length |
270
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structure length |
232
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Chain Sequence |
GSHMSSGMSAKELCENDDLATSLVLDPYLGFQTHKMNTRQEELKEVIERFKKDEHLEKAFKCLTSLNKNKMQEKLFKEHVFIYLRMFATDSGFEILPCNRYSSEQNGAKIVATKEWKRNDKIELLVGCIAELSEIEENMLLRHGENDFSVMYSTRKNCAQLWLGPAAFINHDCRPNCKFVSTGRDTACVKALRDIEPGEEISCYYGDGFFGENNEFCECYTCERRGTGAFKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A Novel Route to Product Specificity in the Suv4-20 Family of Histone H4K20 Methyltransferases.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE SUV420H1
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| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
73
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| structure length |
232
|
| sequence length |
270
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
2.1.1.43: Histone-lysine N-methyltransferase. |
| pdb deposition date | 2013-06-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00856 | SET | SET domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Arc Repressor Mutant, subunit A | ||
| Mainly Beta | Beta Complex | Beta-clip-like | SET domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5F5E A; 5T0M A; 5ARG A; 3TG4 A; 1N6C A; 3RIB A; 3OXF A; 3SW9 A; 3S7D A; 5KJK A; 5TH7 A; 3TG5 A; 3SWC A; 2IGQ A; 4I51 A; 3KMT A; 4YPE A; 4JLG A; 4QEN A; 3FPD A; 3S7F A; 4YNP A; 3S7B A; 1XQH A; 4IJ8 A; 2O8J A; 3M56 A; 1PEG A; 3F9Z A; 3DB5 A; 4NVQ A; 4QEP A; 3M59 A; 3IHX A; 5EX3 A; 3F9X A; 3OXG A; 2W5Z A; 5LSZ A; 3M58 A; 3RQ4 A; 5F59 A; 3QWV A; 5CCL A; 3RU0 A; 3M55 A; 2W5Y A; 3CBO A; 3M57 A; 3S7J A; 2BQZ A; 5F6K C; 5JJ0 A; 3CBP A; 3KMA A; 3MO5 A; 3KMJ A; 3M54 A; 4J8O A; 5KJL A; 4O30 A; 4LDG A; 1MUF A; 3QWW A; 5KJM A; 5HI7 A; 2QPW A; 3RJW A; 5LSX A; 2RFI A; 3MEK A; 5AYF A; 3BO5 A; 1MT6 A; 4O6F A; 3PDN A; 4J7I A; 2JV0 A; 2G46 A; 4YPA A; 3EP0 A; 4E47 A; 4MI0 A; 2R3A A; 4YPU A; 5KJN A; 5CPR B; 3RAY A; 1N6A A; 5JIY A; 3VV0 A; 4WUY A; 3MO2 A; 2F69 A; 4J7F A; 4IJD A; 4MI5 A; 4Z4P A; 4J83 A; 4YND A; 1O9S A; 3MO0 A; 4AU7 A; 5CCM A; 3S8P A; 3VUZ A; 5HQ8 A; 5JHN A; 3F9W A; 3K5K A; 1ML9 A; 5TTF A; 3OPE A; 3N71 A; 1H3I A; 3DAL A; 3OS5 A; 3F9Y A; 1MVH A; 5TEG A; 5ARF A; 5EX0 A; 4C1Q A; 5JIN A; 3HNA A; 3OXL A; 3QWP A; 3CBM A; 4QEO A; 4RZ0 A; 5EG2 A; 3M53 A; 1ZKK A; 5T5G A; 4H12 A; 1MVX A; 4NJ5 A; 5T0K A; 4JDS A; 4FMU A; 5F6L A; 4BUP A; 3OOI A; 4YNM A; 1N3J A; 3M5A A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4KN4 X; 3QU6 A; 3BRO A; 1IZ1 A; 1JUS A; 4P9F A; 1A04 A; 2K9N A; 1FY7 A; 4NQW A; 3S3N A; 2QQ9 A; 1X1A A; 1W7P A; 2QBY A; 4IQ4 A; 2L9S A; 3LSP A; 1FOY A; 1UEL B; 1YW7 A; 4A5M A; 4MTD A; 4I51 A; 1X3Z B; 2MC3 A; 2PFB A; 3CF2 A; 4ZZD A; 1KU9 A; 1P6R A; 2EBI A; 3FK6 A; 3KP4 A; 4N9H A; 3EUH A; 3WTY C; 2M3A A; 4CXF A; 1NK3 P; 2BY1 A; 2H8R A; 3M8F A; 3IHX A; 3ZR8 X; 2JUG A; 1BM9 A; 3PNT A; 2LFB A; 1SFO J; 5AON A; 2VQH A; 1WFX A; 3CUO A; 1T08 B; 3KZI C; 1RKT A; 1JXS A; 1YTY A; 2W5Z A; 5HNF A; 1QHG A; 2COB A; 3OYL A; 2CQQ A; 1ZQ3 P; 3K70 D; 4B44 A; 3OYK A; 4RM2 A; 2F4I A; 3BZK A; 1GXP A; 3ZCO A; 1V5G A; 2F5F A; 3E5Q A; 1ZYR F; 2QCO A; 2CW7 A; 1YYV A; 4HOB A; 3JAM Z; 1LUJ B; 5LRR A; 3OSF A; 4N4N B; 2PMU A; 3CJT B; 4P1W A; 4P5O A; 2K9S A; 2IXS A; 3ZQL A; 1L3L A; 1ZK8 A; 1LFU P; 2NNY A; 2X48 A; 1MUF A; 1Y56 A; 3CC2 I; 3A0H C; 3D5S C; 2FU4 A; 3F8N A; 5JHU A; 4QPQ A; 5GTI C; 1P4W A; 4IEJ A; 3DFG A; 2EZK A; 3D5R C; 3EDP A; 1R1U A; 2K40 A; 1MDM A; 1RUO A; 4UUT A; 5A2Q K; 2P5L C; 4UNO A; 3V42 A; 3A2K A; 2EV5 A; 3MQ0 A; 1ACI A; 1R71 A; 4E47 A; 3LST A; 3F8C A; 5FKL A; 3SXY A; 3RAY A; 1QPI A; 2DQR A; 3ASO H; 4L5J A; 2LTP A; 3OR1 C; 1QO0 D; 4NHJ A; 2FQ3 A; 3JRI A; 3PSI A; 3MO0 A; 4J00 A; 2DA7 A; 1Y1V J; 1IRX A; 5CVV A; 2HYJ A; 2R5Z B; 4HNU A; 2MLG A; 4R8H A; 3BTJ A; 4G8X A; 5LGN A; 3LSG A; 3M7G A; 1KU2 A; 2M0C A; 4U87 A; 3AAF A; 1Y1W J; 1ON1 A; 2RQQ A; 2DFI A; 2AQE A; 4BHB A; 4A93 J; 2UZK A; 5C4X J; 1MBF A; 4G7H F; 2XV4 S; 2V9K A; 4Y4R A; 4B3X A; 3G73 A; 4A3I J; 2A07 F; 2RV8 A; 1ZKK A; 2CYY A; 1MVX A; 5E1W A; 1D5Y A; 1P2F A; 2E7X A; 3DPL C; 5K7H A; 2W82 A; 4FCY A; 4S04 A; 3OWT A; 2V1X A; 3RKY A; 1I50 J; 2Q0O A; 3QPT A; 4DW6 A; 2IVM A; 1UJ8 A; 5FGM A; 2UXX A; 2JPC A; 4ZTF A; 5F5E A; 1IDZ A; 4XSZ F; 1D0Z A; 5HLT A; 5F27 A; 5GAG J; 1W36 D; 4CZZ A; 1W0U A; 2AS5 F; 2VBZ A; 5LLQ A; 4V2G A; 2BY0 A; 5TH7 A; 3L2Q A; 3TG5 A; 2O3F A; 2CMP A; 4N4O B; 4I02 A; 4JLG A; 2HOA A; 1MMN A; 4KNY A; 5JVG F; 2FQ4 A; 3SDG A; 3FPD A; 1TW2 A; 4MTE A; 4D0P A; 2L7F P; 3AFH A; 3CF5 F; 2E2H J; 4XN3 A; 2VBY A; 4ABZ A; 2G0E A; 3OOP A; 3PL8 A; 2IT0 A; 4XIC A; 1X4O A; 2YX4 A; 2OTL I; 3ZMD A; 1EKE A; 3BR2 A; 1UMQ A; 1T98 A; 4CYC A; 4XN0 A; 2GA1 A; 5FKM A; 2K9Q A; 2KIQ A; 3PO3 J; 4LOC A; 3RSN A; 3GCM A; 4F55 A; 1WWX A; 3BC8 A; 4XRS G; 1KU3 A; 2YSR A; 2V1D A; 3HOT A; 1YIT I; 3SJM A; 2X6O A; 1MBG A; 1Y6I A; 5F6K C; 1Z6T A; 2LOO A; 4M3G A; 5DD4 A; 2ZJR F; 1XCB A; 2IAI A; 2VT3 A; 3ABT A; 4C3J J; 1QPM A; 3RPQ A; 3GBG A; 2FSW A; 5HI7 A; 3S1Q J; 1W1W E; 2X6W A; 4HF2 A; 5HLI A; 3CCE I; 2RC4 A; 4GCV A; 1RET A; 3BG7 A; 2CUJ A; 2DJI A; 1OQY A; 2ZFW A; 2A6T A; 5IP9 J; 4IRI A; 1OCO H; 2CUZ A; 4JBA A; 1S7O A; 1UFM A; 2HDD A; 1K78 B; 3VSK A; 2R3A A; 2LKS A; 1AHD P; 4LFU A; 5JLX A; 4Y17 A; 5LD2 C; 2VOO A; 2MA3 A; 4MFE A; 2HR3 A; 5J6X A; 1SD7 A; 1ZRE A; 2P5V A; 3MVP A; 5IP7 J; 4O5V A; 3RPU A; 1WVR A; 4UB6 C; 3S2W A; 3HBL A; 3TOB A; 1FYL A; 4LLL A; 1FOW A; 5M3M J; 2MBF A; 2NOJ B; 5GAD J; 1IXS B; 3CP2 A; 3K4K A; 2DXI A; 2H8W A; 5TTF A; 1ITY A; 3N71 A; 2ZXJ A; 4A0X A; 1H3I A; 5CKT A; 2KQR A; 4K2E A; 5EF6 A; 4C1Q A; 2RAE A; 2EFQ A; 2XAS A; 5EEA A; 1HKS A; 3QWP A; 4AIJ A; 2K4J A; 3F0C A; 3PFY A; 1O7F A; 3I56 I; 1W5C C; 1PUE E; 3LWF A; 1RPW A; 3A01 A; 5EG2 A; 1K83 J; 3M53 A; 1RIO H; 2F48 A; 5E1X A; 3MWM A; 2CQX A; 3H9G A; 3SYT A; 1SVM A; 1R58 A; 4XMY A; 1LDD A; 3W3C A; 3GFI A; 4A6D A; 4BYY A; 1OYW A; 2EA4 A; 1KQ0 A; 4EJO A; 5F1J A; 3W2A A; 1WH5 A; 3CMY A; 1TNS A; 4DGW B; 1ZH5 A; 1BA5 A; 1V55 H; 5IP6 A; 1FYK A; 2IS2 A; 2HKO A; 4C30 A; 1BN5 A; 5ICE A; 5JHF A; 5M5Y J; 2KIU A; 1UAA A; 2LR8 A; 4EMS A; 1R9T J; 2LH9 A; 1RI7 A; 2Y69 H; 3H92 A; 3WHC A; 4D7N A; 2R7X A; 1LEA A; 2HXI A; 2XHK A; 1E3O C; 1K79 A; 4PK4 A; 4QEP A; 2HVR A; 1Y8Q B; 2M9H A; 2QQA A; 2VPL A; 3CES A; 2DMP A; 4WXD A; 5TIS C; 4EGY A; 3OIO A; 1F5T A; 4FQG A; 2M8G X; 4KIG A; 1DP3 A; 2PG4 A; 4ESJ A; 5BNG A; 3P5J A; 4XNF A; 5LSZ A; 2DLL A; 2Y30 A; 3M58 A; 4ZZL A; 2W24 A; 1HCR A; 2EJR A; 2YR2 A; 3QOD A; 3RQ4 A; 5HLG A; 3ABU A; 2MG4 A; 3GZN B; 3NEU A; 3ULQ B; 1U78 A; 2AXL A; 1MBE A; 2R7F A; 3CBP A; 2J5O A; 2JQ7 A; 2KKO A; 2X1E A; 1MND A; 5DD8 A; 1O3Q A; 3EET A; 3CCV I; 5LGT A; 3F6O A; 3SZT A; 3H9J A; 2WA0 A; 2Q2E B; 3K4J A; 3LAJ A; 1ON2 A; 1RC9 A; 3TKY A; 2QSH X; 5K7Z A; 4U0W A; 3DKW A; 2R7V A; 4TV7 A; 3SFI A; 3DKY A; 1E3H A; 3RJP A; 1D8K A; 3F23 A; 2H6B A; 1IC8 A; 3I64 A; 1WSU A; 3GVA A; 1OR7 A; 2XDV A; 1XGN A; 3CCS I; 3NWS A; 1Z7L A; 2GA2 A; 2X4H A; 2LBF B; 3QQA A; 2CSO A; 3ABK H; 1ZG3 A; 5KNL A; 3VEP A; 4ZYA A; 4ZJZ A; 5JIY A; 2MD5 A; 2ESN A; 4YND A; 3HRT A; 2V4J C; 4HV5 A; 5E20 A; 3OYG A; 2BXZ A; 3FXR A; 3FZV A; 4GGG A; 3M3Y J; 4PUS A; 4CGZ A; 2X1C A; 4LGW A; 2EQR A; 1GV5 A; 4EQQ A; 4IQJ A; 1WHU A; 1AKH A; 1YS6 A; 2K02 A; 2EZI A; 1B9N A; 4IHY A; 5CLS A; 1OCC H; 3BJ6 A; 4W1U A; 1C0W A; 4Y33 A; 1PVE A; 3C2G A; 4IRG A; 3DQV C; 1POG A; 3VYT B; 2A6H F; 3ESW B; 5T0K A; 1WH7 A; 4KIS A; 1OKR A; 4A3J J; 3H35 A; 3HSE A; 2J5P A; 3EYY A; 1DGW Y; 2OPT A; 1N6C A; 1E3P A; 2CFO A; 2EV6 A; 3CCY A; 5EG0 A; 3OS0 A; 4PJL A; 5ARG A; 3K10 A; 2EPF A; 4M6X A; 3LA2 A; 3I5U A; 4PJN A; 3HG9 A; 5B3S H; 1ZGJ A; 3I53 A; 2STW A; 5FO5 A; 5F1R A; 3NAR A; 1Y39 A; 5EEG A; 3LQR A; 5C3E J; 4JQF A; 4LB5 A; 4IPA A; 2YU9 J; 4BJ6 C; 3Q9V A; 4RB0 A; 3PJR A; 1AU7 A; 5E3L A; 1ZHF A; 4E7Z A; 5GTH C; 2EZH A; 2E2I J; 1G2H A; 2CQ7 A; 1R1V A; 2BYV E; 5EZH A; 2K9L A; 1ETQ A; 2M7B A; 1X1B A; 2JRT A; 1B59 A; 2A5Y B; 5L3F A; 2RVC A; 2ZSI B; 2EH3 A; 2F2E A; 2FBH A; 2JA2 A; 4BY7 J; 3OS1 A; 3UNG C; 2OQG A; 3CP8 A; 1UZC A; 2DDB A; 1P4X A; 4E7L A; 1BL0 A; 3LSH A; 2QLZ A; 4CHU A; 3VYR B; 2QKM B; 3J7A Y; 4HDU A; 1YJ9 I; 1N75 A; 3HM5 A; 1SFE A; 3WGH A; 5CQE A; 3GYH X; 1FYM A; 4IX7 A; 2GAU A; 3JTH A; 2R7D A; 3QPL A; 2OD5 A; 1HKQ A; 5ERI A; 3BR6 A; 2H6C A; 4PGG A; 4QWQ A; 4UVB A; 1JTX A; 3QWW A; 2STT A; 4BH9 A; 3RJW A; 2V7F A; 1TQI A; 1LE8 A; 1SVO A; 1Z9C A; 5EGO A; 3ZQG A; 4BBR J; 3VWB A; 3IH2 A; 2PJR A; 3KZY A; 3CZ6 A; 2W1O A; 3RYR A; 2XGE A; 4KJZ A; 2R7R A; 3PDN A; 1EV7 A; 2PX9 A; 2EIK H; 4IO9 F; 2XGC A; 3CDH A; 4KIT B; 2KIF A; 4EGZ A; 2IEK A; 3KEO A; 1EH7 A; 4ENJ A; 3TO9 A; 5EDN A; 2DBB A; 2AQF A; 3MO2 A; 4Z4P A; 4BEH B; 4BS9 A; 1PP7 U; 2UWM A; 1F43 A; 2V6C A; 3IC7 A; 1YIO A; 5FRO A; 3VUZ A; 3FBN B; 5D4S A; 1FWZ A; 3VDX A; 1Z1D A; 5LEJ A; 2BXY A; 3IV5 A; 1VF9 A; 3NRV A; 4OIN F; 5EX0 A; 2QQ8 A; 5DM6 F; 2CQN A; 1LFP A; 1R5G A; 1SFX A; 2L4M A; 5DS9 A; 4M9Z A; 2QEX I; 3U2R A; 1ZR4 A; 2RN7 A; 2QVO A; 4XL9 A; 4Y7N J; 1MBK A; 2V1N A; 1MH3 A; 5H6R A; 5L3C A; 4AD9 A; 4O6J A; 1VI0 A; 2HQA A; 2FMY A; 4AVZ A; 1R49 A; 3RKX A; 2R92 J; 2MAB A; 2OBP A; 2JJ7 A; 3JCU C; 4ESB A; 4E7I A; 4DJA A; 2AHQ A; 4XOR A; 3FKI J; 2I10 A; 2FX0 A; 3OS2 A; 2XF7 A; 1ETO A; 2E1C A; 1SEU A; 3S3O A; 1QZY A; 3E3V A; 1XPX A; 4PCQ A; 4BL0 B; 5KJK A; 3S15 J; 2JT1 A; 1R7J A; 2DT5 A; 2IGQ A; 4EV0 A; 2L9R A; 1NG7 A; 2ZB9 A; 3HJE A; 2ECB A; 4WK8 F; 4OIR F; 1G4D A; 1DP7 P; 1YFH A; 1PJR A; 4M9S A; 1D1B A; 3A03 A; 5D6E A; 2QUF A; 3D0S A; 2ZJP F; 3ECO A; 1GVJ A; 4XRM A; 1WJE A; 4NDL A; 3IRQ A; 2KIS A; 5J1Y A; 2L7M P; 4ON0 A; 3G1M A; 3CDI A; 3GTK J; 3WU2 C; 2WAD A; 4BQA A; 4M73 A; 4IXA A; 4ZYE A; 4XLE A; 1BC8 C; 1T56 A; 2XKP A; 2LKP A; 5BQT A; 3QYF A; 3ZMT A; 1LB2 A; 4GDF A; 1KYW A; 3FBI B; 5IOZ A; 2W5Y A; 3GTO J; 1MSE C; 2L0K A; 1KU7 A; 4XLC A; 2R0Q C; 2KRF A; 2NNN A; 4CCK A; 1MMD A; 2G7U A; 1I6H J; 3PUB A; 2IS1 A; 2X51 A; 3DEE A; 5IPA A; 3PNV A; 1G6N A; 3T1B A; 2IA1 A; 2QGU A; 4M6V A; 1XMK A; 1IG7 A; 2JA8 J; 1QHH D; 2I8D A; 3T0Y A; 2R7W A; 1MBJ A; 1TTY A; 1MT6 A; 2VPR A; 3K1P A; 4IHV A; 2L9N A; 3BZC A; 1ERD A; 5GPA A; 2LMD A; 3J7Z I; 1RZ4 A; 2WY7 Q; 5CVI A; 1TT5 B; 2VKH A; 2AO9 A; 4NQW B; 3FXK A; 1VQ5 I; 2F69 A; 2ZCW A; 1W7P B; 2Z3Y A; 3R0J A; 1ZRC A; 1OCZ H; 4AU7 A; 2QBY B; 3SQN A; 3P7N A; 3HPH A; 1WQ2 A; 3FXU A; 3K69 A; 5LFA A; 4Q48 A; 1XSX A; 2BY3 A; 3HOS A; 1T33 A; 4OAY A; 1YOV B; 3K4L A; 2VXD A; 2HOE A; 4AID A; 4RLQ A; 1AA7 A; 2DA2 A; 4H4K C; 1GXQ A; 4UHT A; 3E6B A; 4M72 A; 3VB2 A; 3W6V A; 5TEG A; 3HOW J; 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