1A8DA

Tetanus toxin c fragment
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
452
structure length
452
Chain Sequence
MKNLDCWVDNEEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.61 Angstrom Structure of the Tetanus Toxin Ganglioside Binding Region: Solved by MAD and Mir Phase Combination
pubmed rcsb
molecule keywords TETANUS NEUROTOXIN
molecule tags Neurotoxin
source organism Clostridium tetani
total genus 113
structure length 452
sequence length 452
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1998-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1a8dA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1a8dA02
4TLPA 4RL7A 1QU0A 4PF5A 3D4KA 3NBCA 2I2SA 3WHUA 1KJRA 1VLNA 3RG0A 2ZGSA 2A75A 1RG8A 3B9UA 3OYWA 4FQZA 1J1TA 4JKQA 1WW5A 1W6OA 3FJKA 2AQZA 1GNZA 4DPNA 3FJEA 1LOBA 2ESUA 5DUWA 2ZQOA 3VV1A 3AP7A 1QMJA 2P3KA 4I4QA 1AVXB 1AX0A 3WG1A 2ERMA 4GOYA 1JT3A 3C9ZA 4UW3A 2GNTA 3WNXA 1IJTA 4J2KA 1WBFA 4JP0A 2ZQNA 2FHRA 1LEDA 2DTWA 5CBLA 3A07A 2E4MA 3ZXEA 2NYYA 1GZWA 1BASA 1BFCA 4QD2C 4H55A 1LENA 2IHOA 1JYIA 1QOOA 3NBNA 1O4ZA 2AGSA 5BP5C 1F9KA 2BEAA 2LALA 1HLCA 3FJCA 3SH4A 4QKSA 4FOVA 4UW6A 2DV9A 4TZDA 1V6VA 3JUUA 2RQ9A 3KMVA 1VALA 1SR4C 4GKYA 3OJBA 1QDCA 2ZAAA 2ET2A 1JTCA 1XZZA 4XBLA 2WBCA 4XMAA 4ZKTB 1GICA 1ISVA 4JRAA 1CVNA 5JVVA 3U4XA 1GGPB 4IY8A 4QD2B 4L4HA 2ENRA 5JOXA 4M3CA 1LOCA 5T50A 2VXTI 3WCSA 4CRQA 2WRYA 1Z2VA 3UD7A 1HQWA 4P0LA 4A7ZA 3VT1A 4QC4A 3MW3A 3BA4A 2G4IA 5KXBA 1QDOA 2IWTB 4JKXB 4KEJA 3OBTA 3O49A 5DZGA 2FMDA 5FRAA 3PG0A 5DVHA 2VH9A 1IS3A 5D61A 3AFKA 1I1EA 2D23A 2R9KB 5FNXA 2HWAA 4Y20A 1BLDA 2TEPA 4YZ4A 4AVVA 1APNA 4YZ2A 2PHWA 1SBFA 4LBJA 4F83A 4CZSA 4D0TA 3V0AA 2A3YA 4JC1A 2WLQA 3IM5A 3HN1A 1AVUA 4I1BA 2VU9A 3WA1A 1V6LA 1QGLA 5DZEA 1YRZA 5GZFA 1SLBA 2Q5TA 4Y1VA 3E8LC 4FP2A 3CRIA 4YG0A 3O4OA 5DUXA 4OZXA 4P9WA 2MC2A 4GKXA 4FOQA 1F5FA 2P34A 1KDKA 2DURA 1HKDA 3HOMA 4I6IA 2AH2A 2YV8A 2X2SA 1AF9A 4EB2B 1K5UA 2D3SA 3QLQA 4ZA3B 3AZVA 3ZXDA 1BJQA 3WDVA 3WV6A 2D6PA 3FLTA 3AJ5A 1G9BA 3DGTA 2LTNA 1PUUB 5FZZA 2UWCA 4YM3A 3I8TA 3CA0A 2PHUA 5DG2A 3FGMA 4JQ0A 3AYDA 2I1BA 4Q8LA 3CA1A 1IKPA 3USUB 1JW6A 5KXDA 2R0HA 2D22A 5AVAA 4XJ8A 3WDTA 2KKIA 2RG9B 1LESA 3RQ0A 1ULDA 1PUMB 3RMYA 2A6YA 4LBQD 4U36A 1CJPA 5HCFA 4LBNA 5GZCA 4R6UB 5IT6A 3WG3A 2YROA 3AP6A 3WOGA 4I4PA 4I0YA 5BYNA 1IOBA 1QNYA 5JOYA 4X37A 3AKFA 4YM2A 1JLXA 3PVOA 2WNEA 2A6VA 2D6NA 1DJSB 2BQPA 4ZLBB 3AKHA 4HL0A 1ISZA 2VXRA 4LBQA 1S0IA 3A22A 1QXMA 3LLPA 1ULFA 2WQZC 2F8XC 4USOA 1RY7A 3O0VA 31BIA 4M00A 5T5JA 3VT0A 3N35A 1MS0A 2JE9A 4IYBA 2Q3NB 2A6WA 4QALA 1NZKA 1XQNA 5T5LA 4NOTA 1GZCA 4KC3A 1QQKA 2E53A 3WO4A 2GNBA 3BIWE 2Y9WC 4H9WA 3SNVA 5T55A 4Z8BA 1AVBA 1LOAA 1XG6A 1UX6A 2WT0A 3RMXA 3Q7XA 3AYAA 3P6IA 1Q8PA 3BRFA 2D3RA 1N1VA 3CRHA 4XTMA 4KEIA 2F2FA 1S0LA 4Q2FA 4YGBA 3UJOA 4G1RA 1MZ6A 1JN2P 1UN1A 1VAMA 4YZ5A 1VAVA 1S0JA 2DUQA 3A0NA 3ASIA 1RZOB 3KM5A 1W3FA 2ZABA 2VUAA 1C1LA 5DUUA 3ZXFA 3M2MA 4IZXA 3PVNA 4ASMB 4YW1A 5HCBA 1EV2A 3TB0A 4TYSA 2WSUA 1MACA 4WZFA 1YF8B 2LIQA 2RHPA 1V6OA 3GALA 3ZYPA 4YW3A 1V6NA 2UURA 1BFFA 4ZFYB 3OY8A 1RMLA 1B09A 1W3GA 1DZDA 1TOOA 4Q9PA 1QKQA 3M3EA 4AN6A 4DFSA 5T54A 3WDXA 1W6MB 1HDKA 1CVSA 1ENQA 3ZSLA 4Q91A 1N3OA 1N1SA 1AX2A 1UZZA 3P6JA 2D6OX 4LO0C 4Q1RA 2OW4A 4ZXKA 1GNHA 5FREA 2PHRA 1D2SA 1DHKB 3PHZA 4C1XA 5JOZA 1T4QA 3BRGC 3CA3A 4I37A 1DBNA 1FV3A 1HWPB 4FP3A 4ZOTA 2GNDA 2D7FA 3ZC8A 1HQLA 3UK9A 2V5YA 4YM0A 2ARBA 3NBEA 2GALA 2A7AA 2XB6C 5GLVA 5BVPI 4AYUA 3O4CA 4J2SA 2WJSA 4G6JA 1DYPA 2ZKNA 3MW2A 4I4VA 3VEQA 1SACA 1LTEA 5T5PA 1JXNA 3VKMA 1W6NB 2P23A 4FPCA 1LOFA 1WBLA 3ZVXA 2D1ZA 4Y1XA 4YZ1A 4BOWA 5BXPA 4XBNA 1D0HA 1LHOA 1GYKA 5GLTA 3IIRA 3D5OA 5HPZA 1DZCA 1WD3A 2SBAA 2GDFA 4DRRA 3B3QE 3F1RA 1OQLB 3D7WB 2AR6A 3FFZA 1MR5A 2D44A 2GNMA 3DUIA 3WVJA 3AYCA 5E24E 4M3CE 2VY0A 4BMBA 1DQ4A 3ATGA 1K5VA 1JYCA 1BARA 2HYKA 1R8OA 1DIWA 1FNYA 1Q56A 2VSEA 4FPHA 3T2TA 2UWBA 1IRAX 4DQAA 2R0FA 3IN9A 3WLUA 4LO1A 2DVAA 1V6KA 4AN7B 3CA6A 2DREA 2ZGTA 1TWMA 1W6PB 3NJ5A 4XJWA 4XJZA 2NN8A 3QR5A 3SLIA 3P53A 1AX1A 3T8SA 3CNAA 1WW6A 5F9TA 3O0WA 5GZGA 1N1YA 4I4YA 5IK5A 4FPFA 4QO3A 3ZSJA 2E4MC 4P9XA 1KRIA 2DVFA 2NP0A 4XOGA 1W6OB 1FGAA 2WKKA 2ZGUA 5HCAA 3N3HA 3O44A 4ENDA 1N4KA 3VWCA 4J2XA 2CYFA 4XDQA 2W68A 4HR6C 2ES3A 3N7KA 4UW4A 4P6AA 3H6RA 3BODA 3BX1C 4GAFA 2EXIA 4BQ1A 3MEPA 4XFSA 4EEEB 3B69A 3HR9A 1MZ5A 4LO8B 2QN4A 1G9DA 2YMZA 4P0KA 4IHZA 4DCKC 1R8NA 4MYEA 1Z0HA 2K4AB 1UL9A 4IQPA 2RSTA 1V6UA 4XKIA 3R4UA 2ZBJA 5EWSA 3I29B 1GZWB 1MS5A 5IK7A 1A78A 1BZWA 4BLJA 5BXRA 2H0BA 2PHTA 2AUYA 2ZGMA 3FJDA 3ZC9A 5H9RA 5GLUA 2A70A 4XXAA 5D63A 1FV2A 4ZGRB 7I1BA 1II4A 2JD4A 3BB2A 2UUSA 4Q27A 1HIBA 3RSJA 1VCLA 4C1WA 3V65A 2KM2A 4W65A 3WDYA 3CRGA 1FX5A 2FFVA 4USPA 3C2UA 3QCWA 4SLIA 2Y9FA 4OW4A 3N36A 1LOEA 1WBCA 5F8WA 3QYDA 4XBQA 1AVAC 4YG3A 2P37A 3WUDA 2ZA9A 4FOYA 1G9CA 1G8WA 4ZFUB 1SLLA 3O5WB 4EKXB 1AZDA 2E7TA 3JRRA 3L2YA 1CPNA 3O4DA 3HMYA 2PELA 3ZXKA 2D6MA 3ZSMA 3RRDA 3IKWA 4Z8SB 1MS9A 41BIA 3VSZA 1W0PA 1IS6A 4H04A 4GXLA 2Y9GA 1BKZA 4Y20B 1IKQA 4Y1ZA 3T1LA 3FJ8A 4ATEA 3CA5A 1LOGA 3V0AB 1CE7B 5BQUA 3IAGC 3UD9A 4YOLA 5DSSB 4GA9A 2M49A 3OJ2A 1NXD1 4XFTA 5KXEA 1V6XA 1W6QB 4OEFA 1ZM1A 2FO1A 2AREA 4U2AA 2KI4A 3USUA 1DFCA 1TFMB 4EFPA 2KLLA 1TIEA 4AGRA 3SH3A 3CQAA 1WLCA 3OJMA 2VW0A 2WT1A 4ATFA 4Q8KA 3MALA 5FZUA 4K21A 1SLCA 1MVEA 1FYUA 1GKBA 1CIWA 2JKBA 5EXOA 1J0SA 1WUVA 3N7LA 4Y22A 1AXMA 1WLDA 2W52A 3BRDA 4YGEA 4K1ZA 3N7MA 2JDZA 1V6MA 5FZYA 2FFUA 4BMEA 3IPVB 2Z48A 1BLAA 2AYHA 1SFYA 2WT2A 1N1TA 1TWEA 1GSLA 3POSA 3A23A 2D6LX 5DUYA 3FBYA 3RTJB 3HSMA 3I2AA 4FPGA 4I96A 3M3QA 2DYCA 2CNAA 2D24A 4L8QA 3JUTA 1EPWA 3SITA 4QBVA 4KEKA 5BXTA 3WCRA 1JY0A 5FNWA 3CA4A 1ISXA 1WBAA 2VSAA 4DRVA 1FMMS 4LO7C 1DGLA 3AP9A 1SBEA 1DQOA 1SCSA 3H6SE 3CU1B 1WW7A 1RITA 4P9YA 1G9AA 3R05A 1H30A 4LBQB 1AFCA 2GMEA 1O4YA 4FPKA 3FJHA 3POYA 1ITBA 3FJBA 2KI6B 1W3AA 4LO3A 4II0A 3I4IA 4XJAA 2ERFA 2F2FC 3ZPYA 2YZ4A 3B00A 4XILA 3LSEA 2NVHA 1DQ5A 4DS0A 3V0BA 3V79C 5GZDA 3ZX7A 1Z4SA 2A71A 3OGGA 1FWVA 1DYKA 3S8JA 1KQRA 3AH4A 4GALA 4FPLA 1Q8OA 5DZUA 1JT4A 2EAKA 2ZMKA 4FPOB 2ARXA 5E8AA 3BOPA 4K1YA 3BTAA 4R9BA 1FATA 3FJIA 2JE7A 2ZGLA 4FPEA 2B7YA 3AZXA 1ABRB 1V6IA 1C57A 1SLIA 2QYIB 2EXHA 2HZ9A 2K43A 4CJMA 2A6ZA 1KDMA 5I1BA 1YBIA 4GP3A 5CAZA 2NTDA 4I3NA 1CQ9A 4OWJA 4JPZA 4Y1UA 3ILNA 2DUPA 1JBCA 3UD8A 1N3PA 4X3AA 1CPMA 2JECA 4I1EA 3AKGA 1IRPA 4GWMA 3INAA 3WO2A 4OEGA 2WSVA 1S1AA 5GM0A 1GV9A 2Z42A 1E0OA 5JDBA 1IS4A 4FVVA 3ZXJA 3OY8B 2ZACA 1WCSA 4LO2A 1LU1A 4DENA 3H6QA 2XG3A 1V6JA 3BA5A 1JT5A 2PHXA 4YM1A 5H9SA 1GBGA 4PCRA 3OPZA 3A0KA 4BPZA 5BXSA 3O5SA 1ENSA 2NZ9A 3PMEA 3SNMA 1I1BA 3APBA 2D43A 4Q1PA 3BAOA 1LJ7A 1LOFC 3O12A 1G86A 3O4BA 5GLZA 3OGFA 1QOSA 1JLYA 1NUNA 1P63A 3D6EA 5KXCA 5D62A 4F34A 4I4UA 1LEMA 4IY9A 4YW4A 5F8YA 21BIA 3I2XA 4ITCA 3Q7YA 1UMZA 3WINA 4GAIA 2E6VA 4XTPA 3VKLA 1PC8B 3LCPA 1TEIA 1QF3A 5GJ6A 1XHBA 3AH2A 1AXYA 4I8MA 2Y9XE 2ZGNA 2ZHKA 2KH2A 3UL2A 3BAQA 1Y7BA 4J2YA 3EF2A 1QNWA 2A3XA 4Q9GA 1V6WA 4AGVA 3VUOA 2XOAA 5EYYA 1BXHA 2DUOA 1QOTA 5H9PA 3IM7A 2R1BA 2OVUA 1TTUA 4PBPA 3AJZA 3AYEA 2PHFA 4LO1C 1I3HA 3NV1A 3WMUA 2CWMA 2P2KA 2E7QA 1Q04A 5CB7A 1LHNA 1MS4A 3AK0A 1H9WA 1HWOB 4I4RA 1ISWA 3WUCA 5DG1A 3NBDA 4R9AA 4Q26A 4G6MA 1OQ1A 4ZFWB 2CL2A 4D8HA 5BOWA 2NMNA 1PZZA 3HALA 3O0XA 2D3PA 4G9MA 2UWAA 1ILR1 3OYWB 1DQ0A 3FLPA 1LU2A 1LGNA 4I4XA 2MIBA 3UJ0A 3N7JA 5G00A 1CR7A 4Y1YA 1JUIA 4IONA 1DQ6A 3ILFA 1MD6A 2GN3A 1L2HA 1VIWB 4FPJA 1BYHA 1UKGA 2ZZJA 3BA7A 4XE9A 1Z78A 3JU9A 4GOVA 4PC4A 2ZGOA 1ISYA 3FJJA 4XFUA 2EALA 1XYFA 1BA7A 1ULEA 2NMOA 1GLHA 1HWNB 3M3OA 2ZGQA 4OWLA 4JCKA 4A7KA 3BAVA 4M01A 1T9FA 3AZWA 4I7IA 1S0GA 2C9AA 4G9NA 3H6RB 2ZHLA 1AXZA 1FN0A 4AWDA 2R16A 1EYLA 3AKIA 4YFZA 3LTQA 3NWKA 3R4SA 3ZXLA 4NO4A 4RA0A 6I1BA 4J23B 1DQ2A 5BP5A 4XXPA 3POKA 3T1MA 2BEBA 1JT7A 3FUOA 4AGGA 2Z49A 1NLSA 2P3IA 1YTOA 1ULGA 4ISQA 1SR4A 3W58A 1FNZA 3AZYA 4YGCA 2YUGA 1ONAA 1AXKA 1SLTA 4XHXA 1IT0A 3B9CA 2GN7A 4X38A 3VKOA 2DRZA 4D69A 4AVSA 3OJVA 1SBDA 4M3CB 1LGBA 5IK8A 1MC9A 4XJ9A 3UDAA 3WDWA 2VLCA 1IHKA 1UAIA 5EYXA 1GANA 1YI7A 3UJ4A 1IOAA 3PJQA 4GP0A 4DEPA 1KITA 4KBBA 5GLWA 1C1FA 3Q7WA 1S0DA 5CNAA 3V64A 3VSFA 2D6KA 3FUQA 1PZ7A 4R9CA 3SISA 3ILRA 1LCLA 3W59A 1Q03A 1HWMB 5BQUC 3ZSKA 4EFQA 2EF6A 3VKNA 1MS1A 4OEEA 1W6QA 3W9TA 1S0EA 1ZA4A 1YIFA 5T5OA 3RS6A 1BQPA 5JMCA 5H9QA 1R1ZA 4I30A 2V73A 4I4SA 3AP4A 4PBOA 4HJJA 1DLLA 2OUHA 1HCDA 1GZ9A 4GWNA 3UJQA 3PUBA 3O3QA 3LSDA 1A3KA 1X50A 2CTVA 5GAQA 1PZ8A 1AJOA 4X39A 2DRYA 1RIRA 3WDUA 2JJ6A 2EXJA 1FQ9A 2VW1A 3WG2A 2DWRA 1G82A 3IPVA 1U0AA 3NV3A 1Q1UA 2FDBM 1LGCA 2C5DA 1A8DA 5E89A 1LODA 1YYNA 5IUQA 3O4AA 2W39A 3AP5A 4I2SA 1M16A 3MW4A 1Q8VA 4FQ4A 4JAWA 3F62B 1LHUA 2CY6A 3ZYRA 4K20A 3BADA 3WZ1A 2D7IA 2EXKA 1OKQA 3AX4A 1S0CA 4Y22B 1HCEA 3AZZA 3WMVA 1TP0A 3OBRA 3HBWA 5F8SA 2P3JA 2D7RA 5EG6C 2L5XA 1CN1A 4YLZA 1LHWA 3GNEA 2LIEA 2YY1A 1G7YA 2DTYA 2Q9XA 4QBCA 1F31A 2CWSA 4LBMA 4YZ3A 2ZMLA 2HW9A 4LO3C 2J3PA 1PWAA 2GZBA 5GALA 1MS8A 1LULA 3AXDA 2A5ZA 3SH5A 4XJUA 2ZMNA 4XMIA 5LK5A 1UPSA 4R9DA 1UZYA 1BFBA 4BM8A 1KNMA 3FJAA 1LECA 4BLIA 1WW4A 3WG4A 1FMZA 2ZHNA 3AH1A 2DU1A 2GMPA 2DVGA 1W0OA 2DVBA 2AAIB 3TAYA 4LO7B 3M3CA 3FLRA 1LHVA 3RTIB 2SLIA 5CA6A 4YW2A 3A4UA 1MS3A 1N47A 2DS0A 1S0BA 3FJFA 4WVWA 2E51A 4PQ9A 4Y26A 1ULCA 5GZEA 1JOJA 3V0BB 1JQZA 4AVTA 1G9FA 3PVEA 4LBKA 4LBLA 3KQRA 2R49A 2UU8A 1W6MA 5IK4A 5B2HA 3NV4A 1ONKB 1CESA 3B01A 5DXDA 2P39A 3ILAA 4XIOA 4Z9WB 4FGFA 1DZQA 2K8RA 2YXSA 4P14A 2NM1A 3MPPG 2MLLB 3VT2A 5DUVA 2GMMA 4D0ZA 2ZGKA 4FOWA 4OWKA 4CTEA 2HWMA 4ISRA 2A3WA 4LO2C 2D20A 9ILBA 4OUJA 4HANA 2ZGPA 4IZEA 2FGFA 1RINA 1YXWA 5JOWA 3IM6A 2A6XA 3M1HA 5JLVA 3AJYA 4YG6A 4WV8A 1KJLA 1SCRA 2GO2A 4P0JA 4YW5A 4I4OA 5SV8A 3Q9OA 4YGDA 1URXA 2ZR1B 1C4RA 1PZ9A 1H9PA 2ZGRA 3AXEA 4WVVA 4LO0A 4ZBVB 2VW2A 2AFGA 1OFSA 1MVQA 3VKFC 1EVTA 1JHNA 3NV2A 1W6NA 2ZHMA 3A21A 3H0OA 4EFRA 4M3CF 1DQGA 3K1XA 3TC2A 1N3QA 1HKNA 8I1BA 1SLAA 1CONA 4FPYA 2R1DA 2W08A 1V00A 3WHTA 4L4IA 2AENA 3WINC 4A7YA 3IMNA 1Q8QA 1IILA 2EIGA 1M2TB 4Y24A 5L73A 3BAUA 5EC5A 4XZPA 1AVWB 5E88A 4XYXA 5EHAA 4QKRA 1WLWA 4XIKA 3CAHA 5F90A 1BFGA 3ENRA 3WO3A 3BAHA 3AJ6A 5F5QA 3ZXGA 2DU0A 3N0KA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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