1A8DA

Tetanus toxin c fragment
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
452
structure length
452
Chain Sequence
MKNLDCWVDNEEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.61 Angstrom Structure of the Tetanus Toxin Ganglioside Binding Region: Solved by MAD and Mir Phase Combination
pubmed rcsb
molecule keywords TETANUS NEUROTOXIN
molecule tags Neurotoxin
source organism Clostridium tetani
total genus 113
structure length 452
sequence length 452
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1998-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1a8dA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1a8dA02
1W6QB 2DYCA 4OWKA 2EF6A 4LO3A 1GYKA 3MW2A 1TWMA 1KITA 3N35A 1BLAA 4QBVA 1KJLA 2ZGUA 4AN7B 3V79C 2P3IA 4XIOA 1UPSA 1S0BA 1FN0A 4Y1UA 4GA9A 4OWJA 2R0HA 1JW6A 2PHXA 4J2XA 1LHNA 1MS3A 3MW4A 1EYLA 3VT1A 5DUVA 4R9AA 4LO8B 1QQLA 4I37A 1AJKA 2D3SA 4ATEA 1G9DA 2ZZJA 3AKHA 5CB7A 4OWLA 2ZGMA 4F34A 5EHAA 1DHKB 1V6JA 4L4HA 4DENA 1FNZA 4YGCA 4BMEA 1GSLA 1SBEA 2J3PA 1Q03A 3IPVA 1CONA 3R4UA 4YW4A 1KNMA 1W3AA 4LO2C 3V0BA 2A3YA 1FV2A 3HN1A 3I2AA 4HA2A 1S0JA 3AKGA 2HWAA 2EAKA 1FMZA 2Y9WC 4QKRA 3ZSKA 5GLZA 4XTMA 2D6KA 3WG2A 1FX5A 4WZFA 3POKA 1S0LA 3JRRA 3WG1A 5B2HA 4XTPA 4YW5A 1Q8PA 2DURA 2UWBA 4LO0C 2V73A 2G4IA 2WLQA 1MACA 3OJVA 2OUHA 21BIA 1GNZA 2VXTI 1JN2P 1AX1A 4SLIA 3IMNA 3AH4A 3B3QE 4DPNA 4X38A 1YTOA 4DCKC 1ULFA 1S1AA 1ENRA 2E7QA 4H9WA 4PF5A 5DZEA 1LECA 1M2TB 3VT0A 4JP0A 2EXKA 2D7FA 1N1VA 1IILA 3O4CA 3FJ8A 4QALA 3SNMA 4IZEA 4D0TA 3Q7YA 1I3HA 1W0PA 4EB2B 3A0KA 5E8AA 4KEKA 4YW3A 3N7KA 4Y1XA 5F90A 1XZZA 3ILFA 3RQ0A 1J0SA 3AXDA 3ZXFA 1SR4A 3BX1C 2A70A 5D61A 4M3CE 3A0NA 1LOAA 4I96A 1ISVA 1DZDA 2FGFA 1QDOA 1WUVA 4A7ZA 1HWPB 1MVQA 2CYFA 3V65A 5EC5A 4IHZA 4I8MA 1W6MB 3H6RB 4L8QA 1DIWA 4ASMB 2AGSA 3OGFA 3BA5A 1Q8SA 3VEQA 5IT6A 2EXHA 4ENDA 3FJ9A 3MALA 3QCWA 2R1DA 4ZBVB 2X2TA 1D2SA 1MD6A 5HPZA 2ARBA 2E53A 3VWCA 4BQ1A 4J2SA 3ZXKA 5DZUA 4R9CA 5GAQA 3POYA 4CJMA 1PUMB 5DUYA 2P34A 4TLPA 4AYUA 1JT5A 1FGAA 4C1XA 1N4KA 1ONKB 1FV3A 4XMAA 3WNXA 4Y24A 3FLPA 1UZYA 1V6KA 1W0OA 1IS6A 3N7LA 3O4DA 3WZ1A 3AYCA 3V0AA 5E89A 2PHFA 3AJ5A 2AENA 3IKWA 3PHZA 4KEIA 3VT2A 1WBLA 1EVTA 3ILAA 2OVUA 5IUQA 5KXCA 4ZKTB 1DZQA 3S8KA 3OBTA 1IOBA 5BXTA 1WCSA 5GLTA 1AZDA 2YMZA 1RZOB 4Z8BA 1Q8QA 3PUBA 9ILBA 1WLDA 4BM8A 3JUUA 4YZ5A 2A6YA 3RG0A 3BAUA 3VKMA 1W6PA 1ULGA 3I2XA 4EFQA 1DFCA 1LULA 2DVDA 2GMMA 2KM2A 3PVOA 1A3KA 3O4OA 3ZSLA 4YM1A 2A5ZA 2ZHLA 2ZHNA 2DVBA 4FOWA 4AVSA 2Z42A 3I29B 4H55A 1GZCA 2D3RA 3ZSMA 1MS1A 1HDKA 1SCRA 2MLLB 4XBLA 1X50A 3NJ5A 1V6MA 1LHUA 3FJDA 3WCRA 3CRHA 5BQUA 5FREA 2DV9A 3FJKA 4G9NA 4LO1A 1ISWA 1HKDA 4XJ8A 3ZSJA 3A22A 2BQPA 1LEDA 1QKQA 1SLCA 4M3CB 3EF2A 1K5VA 2ES3A 3GNEA 1JXNA 1M16A 3KMVA 1Q1UA 3TB0A 4GAFA 3PMEA 2JE9A 5HCAA 1UMZA 2JJ6A 3CA1A 5GALA 5IK5A 4GXLA 1H9WA 4GOYA 5GZDA 3ZYRA 4A7KA 2JD4A 4R9BA 4QD2C 2P2KA 4XJUA 4Y22A 3AJYA 5E24E 1Q56A 1V6VA 3IM6A 1UAIA 2ZGNA 5T54A 3USUB 1ILR1 1AJOA 2DRYA 2VLCA 2D44A 4GP3A 1I1EA 3LCPA 1W3FA 4P0JA 1ISZA 2NYYA 1CN1A 3HSMA 3BAVA 2K8RA 1DJSB 3BAGA 2NMOA 4D69A 3MPPG 1N1TA 3H6SE 1YBIA 2E4MC 3O5SA 3O5WB 1CVNA 2NM1A 1QNYA 1MS8A 3CNAA 1OQLB 3AH2A 2HWMA 3M1HA 3FUOA 4ZOTA 4JRAA 4P14A 1AVXB 3ASIA 1G9AA 1DLLA 1HCDA 1CPNA 3B69A 4AVTA 4OEFA 1EV2A 5BP5C 1FAYA 4YGBA 2GO2A 2D6OX 1JLYA 4YOLA 1V6OA 3M3CA 3IM0A 2GN3A 1ZA4A 1YRZA 5H9RA 3UJ4A 1MS9A 8I1BA 5FRAA 2EXIA 4BLIA 2JECA 2PHTA 4K1YA 2GDFA 2D7RA 2BEAA 2ZACA 2UWCA 3CU1B 2C5DA 4FPYA 3POSA 3AP9A 4YG3A 2D22A 3IM5A 3Q9OA 3WMUA 3T2TA 4OW4A 1CE7B 2DVGA 1YIFA 3SITA 5FNXA 3QLQA 3PG0A 1GZWA 1I1BA 2ZHKA 2Q3NB 5SV8A 1JYIA 1QDCA 1F31A 1LOEA 2MIBA 2D3PA 3ATGA 4JAWA 1CQ9A 1G8WA 3F62B 3WCSA 3WV6A 4XE9A 1LOFA 3A23A 2VY0A 2V5YA 2GMEA 4I3NA 1IJTA 1WD3A 5F9TA 1URXA 4FPFA 5KXEA 3NV2A 4P9WA 1W6OA 1QOSA 1Z78A 2YV8A 3N7MA 4J2KA 4YZ4A 2HZ9A 2YXSA 4ATFA 1DYPA 4RA0A 2OW4A 4AGRA 3S8JA 4TZDA 3WDYA 4I0YA 1SFYA 1JOJA 2B7YA 2PHRA 2JDZA 1FYUA 1IT0A 4DEPA 5DXDA 3CA0A 2GN7A 4XILA 3MEPA 4Y20A 5BXPA 1GNHA 1YF8B 4DFSA 2ZQNA 3NBEA 1SLTA 3WDWA 5CNAA 3VV1A 4XZPA 4LO2A 4GOVA 1WLWA 1DQ4A 3K1XA 4X37A 4XYXA 5DZGA 5KXDA 2WJSA 2PELA 2RHPA 5JVVA 2IHOA 3D7WB 4PQ9A 1JYCA 3JUTA 5FZYA 2DS0A 3UD7A 1KDMA 5BOWA 1H9PA 3OYWA 5IK8A 2DREA 3ZXDA 1DQOA 1VCLA 4Y1YA 3DUIA 3IPVB 2SLIA 4AN6A 4P0KA 1R8NA 2P37A 1NUNA 3AP7A 2ZKNA 3V0BB 1OKQA 2GMPA 4PC4A 1SACA 4U2AA 4Q8KA 3WOGA 4LO0A 3ZC8A 5T5PA 2ZGSA 5EG6C 1OFSA 5GZGA 3B01A 2Q5TA 3W59A 1BZWA 4HL0A 2EIGA 4AWDA 4USOA 3AP6A 3UJQA 2CY6A 5H9SA 2VUAA 2D6PA 3B9CA 3FJHA 2E6VA 1ENSA 1GANA 4OEGA 1RY7A 2AFGA 1IRAX 1ISYA 1DBNA 1MZ6A 2YY1A 1BFCA 2E7TA 4LO7B 2P39A 4UW4A 1XHBA 5GZFA 4ZXKA 4FQ4A 1N3PA 1GKBA 1ISXA 1P63A 3P6JA 1NXD1 3O3QA 4FOVA 3ZXJA 1WBCA 1FNYA 1WBAA 5HCFA 4HANA 2ZMNA 5CBLA 4ITCA 5IK4A 5GZEA 2LIQA 3D5OA 4DRRA 2CWSA 1MS0A 3BOPA 2D6NA 3M2MA 2ET2A 2ERMA 4X3AA 1S0IA 2XG3A 1FQ9A 3SLIA 1LOGA 1O4ZA 4G1RA 2CL2A 4I4VA 3NV3A 5F8SA 31BIA 2ZGKA 2XB6C 1GLHA 2DTYA 1Z4SA 3A4UA 1C1LA 4FPLA 1ENQA 5T5LA 3AH1A 1GGPB 3WUCA 3ILRA 1LTEA 1JT3A 2GNTA 3BAHA 3OBRA 1AXKA 4YG6A 1Q04A 1WW4A 1LHVA 2A71A 3RSJA 2QN4A 4I4XA 5GJ6A 2NN8A 4AGGA 3VKFC 2WNEA 3MW3A 4NOTA 4DRVA 1QOTA 3POWA 2GALA 5JOXA 5DG2A 5L73A 2VSAA 2UWAA 4XMIA 3AK0A 2W08A 4QBCA 1T9FA 2D20A 2RG9B 2L5XA 4XXAA 1LCLA 4XDQA 1XYFA 3OJBA 1HWOB 3VSFA 5JOYA 3M3OA 2NVHA 3UL2A 5DZFA 1BJQA 1WW6A 4M00A 1F9KA 1AX0A 1LENA 1WBFA 1BYHA 3H6QA 4FGFA 5DVHA 1HIBA 3TC2A 1BLDA 2ZGLA 4FP2A 3LSDA 4I30A 4I4QA 3AX4A 4Y1VA 4Q1RA 1KJRA 2ARXA 3VKLA 1WLCA 2Z49A 5DUUA 2A6VA 2F2FC 1ABRB 3V0AB 3Q7WA 1PZ8A 3BIWE 2W52A 1V6LA 3AFKA 2CWMA 1DQGA 1JBCA 4XBNA 3SH5A 2CTVA 1QQKA 2VXRA 5JMCA 3A21A 3TAYA 3ZVXA 4I4UA 3BAOA 3FJIA 5BXSA 1TEIA 4LBNA 1IKQA 1QNWA 2JKBA 1VAVA 1S0DA 4AVVA 1N1SA 2NZ9A 2R1BA 3WO4A 1WW7A 5JOWA 1AFCA 1LU1A 2ZGRA 1W6NA 5T5JA 2FFVA 1S0CA 4U36A 1AXMA 1BASA 5F8YA 3D6EA 4EEEB 1W6PB 5F8WA 1B09A 1IS5A 2H0BA 1LHOA 2NMNA 1IS4A 1G9CA 1RINA 2ZMKA 1SBDA 1O4YA 1KRIA 1T4QA 3HMYA 4OEEA 2ERFA 1Y7BA 3BAQA 4M01A 1FWUA 2ESUA 4JCKA 2KKIA 4LBMA 2VW2A 2Z48A 4FPEA 3WINA 3AKIA 5GZCA 2UURA 3T8SA 2YROA 2D6LX 3B9UA 4FOYA 2WQZC 4GKXA 1N1YA 1CVSA 1LODA 4XIKA 3UD9A 4BPZA 3L2YA 3WINC 3AZWA 3BRGC 2I1BA 1AVAC 4YGEA 4L4IA 3OY8A 3ZYPA 2WRYA 1IS3A 4YZ3A 2HYKA 1W3GA 4LBQA 5F5QA 5JOZA 1DQ1A 4KBBA 1JUIA 4K21A 1HWNB 1MZ5A 3PVNA 2HW9A 3U4XA 2ZBJA 4R9DA 3O0VA 4R6UB 1QF3A 1BFGA 1R8OA 3O12A 4YGDA 4Y22B 2ZAAA 4P0LA 2A6XA 3VUOA 2NTDA 2E4MA 4UW3A 2ENRA 5AVAA 1SLLA 3SNVA 5GLUA 5DSSB 2W39A 1AXZA 3BRFA 3W9TA 4TYSA 1FMMS 3WA1A 1UZZA 3R4SA 1SZ6B 2LIEA 2ZA9A 1QU0A 2KLLA 1ZM1A 5BP5A 3BA4A 3KM5A 4GP0A 4ZA3B 1PUUB 2CNAA 2NP0A 1J1TA 1VALA 2VSEA 1HKNA 3O0XA 4D8HA 5T52A 4Y1ZA 1BXHA 3ENRA 4XFTA 1LGBA 1IHKA 4I4PA 4FPHA 1UKGA 4IY9A 5D62A 3E8LC 1PC8B 3AYEA 4XFSA 4Q9GA 3BODA 3C9ZA 1LGNA 1G82A 4YFWA 1V6UA 1BQPA 1V6WA 3ZC9A 2ZGQA 2DU1A 1HWMB 2BEBA 2MC2A 3CA3A 1VAMA 1DYKA 3FJCA 1S0FA 4WVVA 1LGCA 1V00A 2ZQOA 3AZYA 3ZXLA 4YZ1A 5G00A 1BARA 5GM0A 3RMYA 1D0HA 1RG8A 1GZ9A 2FHRA 4LBKA 4F83A 1DQ6A 1LHWA 3FBYA 1SCSA 3QR5A 4Q8LA 3AJ6A 2P3KA 4NO4A 4YM3A 1MR5A 3OPZA 1GZWB 4A7YA 2WT2A 3WLUA 2ZMLA 4YM0A 3NBDA 3PJQA 1LESA 1BFFA 4G6MA 1W6QA 4WVWA 4I4OA 3BA7A 4Z9WB 5EWSA 2P23A 1G86A 3M3QA 4G6JA 3BRDA 1LJ7A 4FPKA 2D7IA 3P53A 4Y26A 1FWVA 2D1ZA 4BLJA 2Q9XA 2YZ4A 1JY0A 1YO8A 3O44A 2KI4A 3NBCA 2DVFA 1RMLA 3WMVA 3NWKA 1KQRA 5I1BA 3IM7A 1VIWB 1W6OB 2UUSA 1PWAA 4DQAA 4IONA 1SBFA 2K43A 3AP4A 4LO3C 3QYDA 2SBAA 1U0AA 2ZGOA 3W58A 1RITA 6I1BA 3FLRA 4YW2A 3ZX7A 3O4BA 5JLVA 3R05A 1IKPA 2I2SA 4YZ2A 2WBCA 4Y20B 1HCEA 5LK5A 5BVPI 1NZKA 3HR9A 3O0WA 2X2SA 2EALA 3APBA 4XOGA 4EFPA 2PHWA 1JHNA 3O4AA 2ZABA 1II4A 3LSEA 4LBOA 4FOQA 4XXPA 2VH9A 3UJ0A 5H9QA 2R0FA 4D0ZA 5JDBA 1QGLA 4GALA 3WHTA 4I1EA 3OYWB 1G9FA 2ZGTA 3LTQA 3IAGC 4IY8A 5KXBA 3PVEA 1GBGA 2A6ZA 2A7AA 2AH2A 3F1RA 2AUYA 41BIA 2AAIB 4DS0A 1DQ5A 1JTCA 2DUQA 2F8XC 1S0EA 1MC9A 4MYEA 4HR6C 4GWMA 2Y9FA 4CZSA 3D4KA 5HCBA 3I8TA 4ZFUB 1BKZA 3T1LA 4BOWA 4UW6A 3O49A 4LO7C 1SLAA 1YXWA 1KDKA 1QOOA 1JLXA 1YYNA 1E0OA 3FJJA 4FPGA 1LOBA 4IQPA 1WD4A 1UN1A 3RTJB 2D24A 1V6NA 3V64A 3FJBA 4USPA 5DG1A 1TTUA 4FP3A 4ZFWB 4I4SA 1Q8OA 2DU0A 1V6IA 5EYXA 3WUDA 3NV4A 4C1WA 2FFUA 5CA6A 3CAHA 5FNWA 2LTNA 1W6MA 1SLBA 3H6RA 2BFHA 2KH2A 4XJ9A 4II0A 3RRDA 3BTAA 3P6IA 3UDAA 1AX2A 4ZGRB 4Q9PA 4YG0A 1SR4C 3INAA 1A78A 1IRPA 1JT7A 2D43A 1TOOA 1N3OA 3AP5A 4FVVA 4WBCA 4IYBA 4XHXA 2AYHA 2DTWA 5CAZA 4OUJA 4WV8A 5BXRA 2DRZA 4Q2FA 3UJOA 3BADA 4P9YA 1G7YA 3N7JA 2GNBA 5H9PA 1Z0HA 7I1BA 2A3WA 2ZHMA 3UD8A 3SISA 1AVWB 4ZFYB 4YM2A 2A6WA 2JE7A 4Q27A 1ULCA 2AQZA 4I4YA 4QKSA 2DUOA 4XKIA 2R49A 4JPZA 4I4RA 2ZGPA 1XG6A 1S0GA 2FMDA 1AVUA 2RSTA 3CQAA 4XHBA 2F2FA 1BA7A 3SH4A 2DVAA 4H04A 1MS5A 2WKKA 4I7IA 1ONAA 3AYAA 3NV1A 5T5OA 5EXOA 4GAIA 1XQNA 2WSVA 2R9KB 3I4IA 1GV9A 3AKFA 3IN9A 1K5UA 1CPMA 2GNDA 4YFZA 3OGGA 3HOMA 1CJPA 3BB2A 2RQ9A 1UX6A 4I1BA 4GWNA 2LALA 4QO3A 3JU9A 4P9XA 4P6AA 2C9AA 1CR7A 3WDVA 3DGTA 1OQ1A 3AYDA 1C4RA 1TWEA 4G9MA 2AREA 5BYNA 1Z2VA 1BFBA 2KI6B 3WO3A 4UW5A 3OJ2A 4AGVA 3N0KA 3B00A 3FJFA 3ILNA 2QYIB 3T1MA 1W6NB 2WT1A 3HALA 1TP0A 4YLZA 1MVEA 3WDUA 1F5FA 1HLCA 4M3CA 2FO1A 1UL9A 5T50A 4JKXB 1H30A 4KC3A 1LEMA 3WHUA 4M3CF 1TIEA 3FUQA 4JC1A 2D6MA 2Y9XE 4ISRA 3FFZA 4LBQD 1N3QA 3ZPYA 1SLIA 4PBPA 5BQUC 3VSZA 4LO1C 2P3JA 3RS6A 3CA5A 1CESA 1DGLA 3CA4A 3OJMA 3SH3A 4FPJA 3HBWA 3WO2A 1YI7A 4W65A 3USUA 1QXMA 1HQLA 2WT0A 2EXJA 4GKYA 1DZCA 4QD2B 4K1ZA 1LU2A 3FLTA 3RMXA 2YUGA 1MS4A 3C2UA 3NBNA 2DWRA 1AVBA 3VKNA 2AR6A 4KEJA 3OY8B 5T55A 3AXEA 1EPWA 4PBOA 4YW1A 1GICA 4LBQB 4EFRA 3KQRA 3M3EA 2WSUA 2GNMA 4ISQA 4LBJA 1RIRA 4QC4A 2A75A 4XBQA 1JT4A 4IZXA 1FATA 4JQ0A 3AZVA 1L2HA 4PCRA 3CA6A 4XFUA 4RL7A 1LOCA 1PZ9A 4CTEA 2TEPA 3FJEA 1C57A 3VKOA 2OUJA 1APNA 4I6IA 3N3HA 5IK7A 4I2SA 5DUXA 2D23A 1R1ZA 5EYYA 2IWTB 4ZLBB 1G9BA 5GLWA 4FQZA 3AZXA 4OZXA 4EKXB 1QMJA 3A07A 3UK9A 1A8DA 2AXMA 2GZBA 5FZZA 3WDXA 1PZ7A 2E51A 1CIWA 4JKQA 4Q26A 4XJWA 4CRQA 3ZXGA 1VLNA 2XOAA 1N47A 2PHUA 1DFQA 3RTIB 3CRIA 4LBLA 2Y9GA 1HQWA 4BMBA 1DQ2A 5DUWA 3IIRA 3H0OA 1AXYA 5E88A 2FDBM 4XJZA 1C1FA 3GALA 2W68A 1IOAA 3WDTA 4Z8SB 4Q91A 3ZXEA 4K20A 4XJAA 3FJAA 3AJZA 1ULEA 1V6XA 4X39A 2DUPA 5FZUA 2R16A 4FPOB 3AZZA 3LLPA 2VW0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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