1A8DA

Tetanus toxin c fragment
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
452
structure length
452
Chain Sequence
MKNLDCWVDNEEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.61 Angstrom Structure of the Tetanus Toxin Ganglioside Binding Region: Solved by MAD and Mir Phase Combination
pubmed rcsb
molecule keywords TETANUS NEUROTOXIN
molecule tags Neurotoxin
source organism Clostridium tetani
total genus 113
structure length 452
sequence length 452
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1998-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1a8dA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1a8dA02
3AZYA 2C5DA 2ZGSA 1CPMA 2F2FC 4XYXA 2Y9WC 3OY8A 4GAFA 1BXHA 1F9KA 1LCLA 2E53A 4J2SA 1DLLA 9ILBA 3OY8B 2XOAA 4UW4A 3AYEA 3D7WB 1EV2A 1A78A 4OUJA 4YW1A 3NBCA 5DUVA 3A0KA 3OGGA 4ISRA 3I29B 3USUB 3VKLA 5CNAA 3WDXA 2ZA9A 3B3QE 4YW4A 5E8AA 3O4OA 4TYSA 5BVPI 1G9AA 3O4DA 1LHNA 1LOAA 1S0BA 1BYHA 2DU1A 4I6IA 1O4YA 4KEKA 3CAHA 3ENRA 4FPGA 1WBAA 3BA7A 1Q03A 1BASA 1JN2P 2VSAA 3BAOA 3B9CA 1ENQA 2ENRA 1ONKB 1UX6A 3BODA 4C1WA 1XZZA 3TC2A 1LGCA 3CA0A 4I2SA 4FOVA 3IN9A 31BIA 1IKQA 3O12A 4P0LA 3DUIA 3WDWA 3POKA 3WHTA 3HMYA 1UMZA 2Y9FA 1BLAA 1G86A 4FPFA 1HWMB 3LSEA 3NJ5A 5HCAA 4I4RA 3VSZA 2DVAA 3JUUA 3ATGA 2FFUA 4XJWA 2UWBA 2Z48A 2DUQA 3WUCA 2AUYA 4EB2B 5IUQA 3O49A 1ABRB 2ZGUA 1VAMA 4J23B 1PZ9A 3SH3A 3FJAA 3S8JA 3M3QA 1G82A 1GBGA 5GZCA 3PG0A 2IHOA 3VV1A 2EAKA 1KNMA 3Q7WA 4JRAA 4I1EA 3O3QA 5EWSA 2AFGA 2W08A 1BKZA 3MALA 4QO3A 3ZC9A 2RHPA 1GGPB 2NYYA 3AYDA 1RMLA 2D6NA 2GALA 4OEEA 2JDZA 3N7KA 4FQ4A 1SR4C 5GZDA 1AVAC 4AGRA 4IQPA 1BA7A 3WG3A 1AVXB 1FWVA 3CRHA 4XIKA 3RG0A 2DS0A 4PC4A 2KLLA 4I3NA 3O44A 2RG9B 3TAYA 3POYA 4QC4A 4HR6C 4Q27A 1GV9A 2VY0A 2D20A 1SCSA 3MW4A 3WOGA 2NP0A 2OUHA 1Q8PA 5BQUC 3H0OA 5H9QA 4G6JA 1JQZA 3SNMA 1A3KA 4XFUA 2DVDA 4XMAA 4XZPA 2ZQOA 3POSA 3IMNA 3ZXGA 1KJLA 1WUVA 2VW0A 4HA2A 3WUDA 3W58A 4FP3A 2R0HA 1QU0A 4LO1C 4WBCA 5BP5A 2ET2A 1JT5A 1Q56A 2P37A 3VUOA 4I4PA 5D62A 5GZGA 3RQ0A 3AP9A 2ZBJA 2NZ9A 1ISWA 4YGCA 4YZ3A 1AJKA 1T9FA 3ILNA 3O4BA 5JOXA 4NOTA 1JLYA 1MVEA 2P3JA 5DZFA 2FFVA 4BMEA 1JOJA 2ZKNA 1MACA 4Z9WB 4ZBVB 2A71A 2ZACA 3ZXJA 3OBRA 2G4IA 3AZZA 1DQ4A 1CPNA 3BAUA 1Z2VA 4JP0A 5FZZA 2DREA 2VW1A 1NLSA 2KM2A 3WDVA 3TB0A 2WLQA 2CYFA 2P23A 4PQ9A 1B09A 2PHWA 1LGNA 1MS3A 4LBMA 3AKHA 1N3OA 2CNAA 2ZGLA 4K1YA 1W3GA 1IOBA 4YM3A 4Q8LA 1CVSA 1JXNA 1V6OA 3B01A 1OFSA 1HCDA 1TWEA 4J2XA 4Y1XA 1IT0A 1DQ2A 4EEEB 2TEPA 3RS6A 2P3KA 1DYKA 5BYNA 3JUTA 3CU1B 1ISXA 2XB6C 3IIRA 5DG1A 4IZXA 1LHVA 5L73A 4EFRA 1H30A 1APNA 5EXOA 2RQ9A 4G6MA 4I7IA 2ESUA 1ZA4A 1HQLA 1Q1UA 4X38A 3WNXA 5FZUA 3WHUA 2EF6A 2C9AA 3V0BA 4DPNA 1VALA 4P9YA 1ULCA 1VIWB 4AVSA 1QDCA 5AVAA 4XKIA 5KXDA 1D0HA 3V0AA 1J1TA 5BXRA 2AGSA 2WQZC 4M01A 4Z8BA 4JAWA 2ZGOA 3GALA 2HWMA 1GYKA 4CRQA 1HLCA 3UL2A 3V0AB 2AYHA 4R9DA 2D7RA 2EXKA 4AYUA 3O5SA 3ZSKA 2DUPA 2D7IA 1WBFA 2E4MA 1TOOA 1ULFA 2K4AB 1LU1A 2QN4A 4ZOTA 4XE9A 4K21A 4XTPA 2DTWA 4PBPA 1PWAA 1VAVA 1FN0A 5E88A 4OW4A 3FJFA 5JVVA 2A3WA 5DZUA 3WV6A 1AZDA 3LTQA 3FJEA 4Y1UA 3R4UA 3WMUA 1AXYA 1OQLB 1MC9A 4I0YA 4LO3C 1GLHA 2VU9A 1AF9A 3ZXFA 4F83A 3ZYRA 4G1RA 1W3AA 3NV1A 3FJKA 1PUMB 1TEIA 4RL7A 2VLCA 4JCKA 4P14A 1SACA 2K43A 3PUBA 2NMNA 1K5UA 4FPEA 4JQ0A 2F8XC 3LLPA 1V6LA 2ZQNA 4R9BA 4Y1ZA 4TLPA 1QKQA 2NM1A 4FP2A 3WDYA 4I4XA 5T5PA 4QKRA 4PF5A 4GP0A 3I4IA 1UPSA 3AP4A 1QNYA 4I4VA 5SV8A 3WINA 3C2UA 3NV2A 4F34A 3UD8A 4JKXB 4IY9A 1H9PA 4Y22A 1FMMS 3NBEA 3AYAA 4KBBA 1HDKA 4ASMB 1AVBA 2EXHA 5IK8A 1LOFA 1SCRA 2P39A 1DQ6A 1MR5A 4H55A 2ZGTA 2ZGMA 4XHBA 1HWNB 4X39A 7I1BA 4D0ZA 2XG3A 4P0JA 3WG2A 3N7JA 2GMPA 2AH2A 1C4RA 1LU2A 5FRAA 4I8MA 1ITBA 2PHUA 3VKOA 4WZFA 1IKPA 3SITA 3QLQA 4AVVA 3IKWA 3V65A 1MS8A 4BLIA 5JOZA 2NVHA 3NV4A 1DBNA 4QBCA 4Y1YA 4FPKA 2MC2A 1GANA 4I1BA 1NZKA 1D2SA 3FUQA 1RZOB 5DG2A 2EXIA 1Y7BA 4USPA 4USOA 2JE7A 4LO2C 1I1BA 1SLCA 1FX5A 3V64A 1N3PA 3AP6A 1R8OA 1G9FA 1FV2A 3OJMA 1Z4SA 1X50A 4J2YA 4SLIA 4HL0A 4YW3A 1Q8OA 3MW3A 3VKNA 4OZXA 3FJHA 3INAA 4LBLA 4R6UB 2DYCA 5GJ6A 2NTDA 2ZGKA 3O0WA 2E7QA 2PHTA 5T55A 2BEBA 3O0XA 1P63A 4BMBA 3WMVA 1DIWA 1W3FA 4YM0A 2KKIA 1Z78A 4GOYA 1IS6A 1QOTA 2ZGNA 2GNBA 3MEPA 4DS0A 2JECA 3CA6A 4OEGA 3BRDA 3IM5A 4YFZA 3S8KA 1O4ZA 2SBAA 2LIEA 5D61A 2YROA 3WVJA 1BFCA 4YG3A 2R9KB 4KEIA 3ZPYA 3ASIA 1IS4A 3ZSLA 1M2TB 3AH2A 3FUOA 4XHXA 6I1BA 3B9UA 2GNTA 3CA3A 4XDQA 2GN3A 1S0EA 5F8YA 1WLCA 2ZHMA 3VKMA 1ULEA 2UURA 4BPZA 1PZZA 4LBKA 1F31A 4I30A 2BEAA 3ZC8A 2HYKA 2VXTI 4GP3A 1AX1A 1GNZA 5EC5A 5JDBA 4C1XA 3AK0A 1MS0A 4G9NA 1BZWA 4JKQA 1W6MA 4ITCA 3N0KA 3UJ4A 5JLVA 3VT1A 1QGLA 4Y20A 1KDKA 2I1BA 2MIBA 1L2HA 1CJPA 1JYIA 2LTNA 5H9RA 3RMYA 1SBEA 1LESA 4XOGA 1PUUB 5JOWA 2W52A 1YXWA 4LO7B 2AENA 1LECA 3KM5A 5JOYA 1UN1A 3BAHA 4DQAA 2YXSA 1SFYA 4EFPA 2D24A 3QR5A 2YMZA 1BARA 4D69A 2OW4A 2ZHLA 2BQPA 4YZ4A 4DENA 4QD2B 5DUYA 2D6LX 4L8QA 1JYCA 4FPJA 3HR9A 3N35A 3NBNA 1FQ9A 3RTJB 3VSFA 1BQPA 3ZSJA 1LOBA 4XMIA 4Z8SB 3IPVA 3GNEA 1WW7A 1URXA 4MYEA 3D4KA 2D22A 1SLIA 4FPOB 1W6PA 2WJSA 2Y9GA 1UZZA 4XJAA 3P53A 3A07A 4OWLA 3N7MA 5BXSA 4I4SA 3KMVA 3Q9OA 3IPVB 3CRIA 4OWKA 5GLZA 5FNXA 5BQUA 1IRPA 1U0AA 4BQ1A 5IK5A 4ZXKA 3RMXA 5BOWA 1W6PB 3PVEA 5LK5A 3FBYA 1FYUA 2EXJA 5BP5C 5E24E 3OJVA 5CA6A 1NUNA 4YM1A 4AGVA 3APBA 3CA1A 4DEPA 4KC3A 3FJ8A 2CL2A 1JT3A 1JTCA 3BRGC 1PZ7A 1JUIA 1QDOA 3CA4A 4LO1A 1ISVA 1HWPB 2OUJA 2MLLB 8I1BA 3T1LA 3O5WB 1UZYA 3M3CA 2D43A 2E51A 1V6JA 1MS5A 2WNEA 4D0TA 3WG4A 5FREA 2PELA 1GSLA 3AZXA 5T52A 2DTYA 2AQZA 1HKNA 5F5QA 3PVNA 1GZWA 1LHWA 1DJSB 3VEQA 1G7YA 4IZEA 4R9CA 1W6OA 5F90A 4ENDA 3FLPA 4GXLA 4M3CE 3FGMA 1WW4A 3WCRA 1V00A 1S0GA 3UK9A 1DQ0A 1UL9A 3UDAA 2WT2A 4PBOA 5GLWA 1S0DA 5BXTA 4UW5A 3C9ZA 3LCPA 4ATFA 1R1ZA 4FPLA 2HWAA 1Q8SA 4FVVA 3HOMA 4A7YA 2A6XA 5T5JA 1JT4A 4UW3A 3BRFA 3O0VA 2V73A 3ZX7A 1JBCA 1WBLA 3OYWA 1ONAA 2ZZJA 5HCBA 5DXDA 2AAIB 3W9TA 3AXDA 3BAQA 2CWSA 3OYWB 2SLIA 3V0BB 3SH4A 3BA4A 3PVOA 2M49A 1GICA 2ERFA 3H6RA 1QMJA 1CIWA 4HJJA 2VSEA 1DFCA 1IS5A 1BJQA 3SISA 2L5XA 2E4MC 3H6RB 1DZCA 1A8DA 5D63A 5CB7A 2BFHA 1BFBA 1UAIA 3WG1A 3POWA 4ZGRB 1DGLA 4A7ZA 3F1RA 1Q04A 1S0CA 4CJMA 2D6MA 5DUXA 3IM7A 2D3RA 1AXKA 1YTOA 1V6NA 3RSJA 2LALA 2A70A 3WLUA 5F9TA 3FJ9A 2JD4A 1V6MA 2P3IA 3AH1A 1HWOB 5IT6A 1DQ1A 3UD9A 1C57A 5FNWA 3W59A 2X2SA 3FJIA 3O4CA 3A21A 3B69A 1C1FA 1N1TA 2DUOA 5E89A 2WRYA 4LO0A 2H0BA 1V6UA 1S0FA 5EYXA 3O4AA 4XFTA 3VWCA 3D5OA 2ZGPA 1IRAX 4X37A 5CBLA 3KQRA 1N3QA 1G8WA 2UWAA 4DFSA 4YW5A 4ZKTB 1V6IA 3WO2A 2NN8A 1CVNA 4QALA 2J3PA 1UKGA 2OVUA 1HIBA 5EHAA 1IJTA 1VLNA 5EYYA 3BAGA 3IM6A 2A7AA 2DU0A 4YZ1A 4GWMA 1MS1A 1QOSA 3WINC 2R1DA 3WCSA 3CNAA 1LODA 4ZFUB 4Q1RA 4J2KA 2Z42A 3AXEA 1FV3A 3PJQA 4FOWA 2D6KA 1LOFC 4LBOA 4Y22B 1BFFA 3CQAA 4L4HA 2DVGA 4I96A 3A4UA 2YY1A 3CRGA 4LBQA 1ZM1A 3OPZA 3UD7A 1WLDA 1CE7B 3M2MA 4I4QA 4U36A 2DRZA 1HKDA 3BTAA 4XJUA 2VW2A 1IS3A 3QCWA 4LBQB 2KH2A 1G9DA 2D3PA 4ATEA 4L4IA 3T1MA 1SZ6B 4CZSA 1JLXA 1AX0A 1W6NA 2A6YA 1G9CA 5DZGA 2IWTB 2WSUA 5T5LA 5JMCA 2Q5TA 4WV8A 1W6NB 5GAQA 1DYPA 3BAVA 1ENSA 3Q7YA 1YBIA 3SLIA 1WD3A 2VUAA 3OJ2A 3ILAA 4JPZA 2R1BA 2CTVA 3UJOA 1FATA 4D8HA 4P9XA 2WSVA 1LOEA 1AXMA 4K1ZA 5HPZA 1S1AA 2A3YA 2E7TA 1G9BA 1K5VA 1N1SA 2F2FA 1S0IA 1EVTA 4FOQA 1V6KA 1N4KA 3FJDA 5EG6C 2R0FA 2GMMA 4P9WA 3USUA 1XYFA 2AXMA 4DCKC 1LEMA 4Q1PA 1ULGA 3NV3A 5F8SA 3BADA 2ZAAA 1RIRA 4Q8KA 1XG6A 1YO8A 4XIOA 3WO4A 1M16A 2DWRA 1DQ5A 3FLTA 4OWJA 4II0A 2YZ4A 1QF3A 2GZBA 3FLRA 2I2SA 3BIWE 1AVUA 4AGGA 3D6EA 3QYDA 2LIQA 1C1LA 4P0KA 3A22A 3V79C 1EPWA 4IONA 1XHBA 4GKYA 4WVWA 3AKGA 1BFGA 2DV9A 1KRIA 1AJOA 2AR6A 1AX2A 4I4YA 2ZGQA 2ZABA 4AVTA 2A6WA 1JY0A 4IY8A 1IHKA 5FZYA 5DSSB 3AJ5A 2YV8A 3L2YA 3R4SA 1Q8VA 1PZ8A 3RTIB 1JT7A 1CESA 1QOOA 1I3HA 4YG0A 1TP0A 3H6SE 4YFWA 5IK4A 1TIEA 2D3SA 3ZXKA 2ES3A 3AX4A 2ZHKA 4G9MA 3ZSMA 4ZLBB 3ZXDA 2JE9A 2DVFA 4DRRA 4YZ2A 3ZVXA 2X2TA 1V6XA 2EIGA 3UJQA 3K1XA 1TWMA 1CN1A 4A7KA 1FNYA 1QNWA 2FO1A 2QYIB 4ZA3B 1KJRA 5B2HA 5DUWA 2A3XA 4LO7C 3BX1C 4W65A 1GZ9A 4Y24A 1W6MB 5H9PA 4BM8A 4FGFA 1R8NA 4Y20B 1LOGA 1WCSA 1TFMB 4LBQD 1W6QA 1OQ1A 2WT0A 3AP7A 2FMDA 1SLTA 2GNDA 2W68A 1OKQA 1SR4A 4QD2C 1Q8QA 4PCRA 4I37A 3F62B 4GA9A 1DQOA 1MVQA 1N1VA 2GDFA 1ILR1 3WO3A 1W6QB 3RRDA 5KXEA 1VCLA 4GAIA 3R05A 1DFQA 4HANA 3FJBA 4YG6A 2KI6B 2ARXA 1CQ9A 1JW6A 3AKIA 3NBDA 1T4QA 4LO8B 4QKSA 3BB2A 5GLVA 4FPCA 5GM0A 2GNMA 4M00A 1LGBA 4XXPA 3P6JA 2ZMKA 2D44A 1WW5A 3M3EA 2Q9XA 3ILRA 3Q7XA 1MS9A 3UJ0A 1SBFA 1HQWA 1JHNA 1QXMA 2PHRA 4Q91A 3AZVA 2W39A 4M3CF 2ZMNA 1MS4A 2JKBA 1KDMA 4I4OA 1QQLA 4P6AA 3JU9A 3OJBA 4YGBA 3MW2A 2NMOA 1DQGA 1W0OA 1SLAA 1YRZA 1AXZA 3A0NA 4XTMA 1RITA 3FJJA 2AREA 4XJZA 3I2XA 3WDUA 1EYLA 2GN7A 2YUGA 3P6IA 1FWUA 1YF8B 4IYBA 1WLWA 1LULA 3N3HA 4YGEA 1QQKA 2A75A 4XILA 3VT2A 4XXAA 4GWNA 2E6VA 5GLTA 2KI4A 3ZXEA 1V6VA 1YYNA 3VKFC 1WW6A 3AJ6A 1GNHA 2CWMA 4QBVA 1AFCA 1S0LA 4U2AA 1MZ6A 3CA5A 5DUUA 1CONA 3OBTA 4Q9GA 2HW9A 4ZFWB 1II4A 4FOYA 5G00A 1GZWB 1ENRA 2VXRA 1W6OB 4FPHA 4KEJA 4XJ9A 2ZGRA 2DVBA 3EF2A 5H9SA 1SLBA 5IK7A 2WKKA 3N36A 1HCEA 1H9WA 2UUSA 4FQZA 1DHKB 4OEFA 2A5ZA 1ISZA 4M3CA 1FGAA 3AJZA 4YGDA 1LENA 2FGFA 1LTEA 1MD6A 1LJ7A 3AYCA 4M3CB 1E0OA 1GKBA 3HN1A 4X3AA 1ISYA 1N47A 1LEDA 2GMEA 5T50A 4Y26A 2ARBA 2GO2A 1ULDA 1Z0HA 2P34A 2EALA 2DRYA 1RY7A 4RA0A 4YZ5A 1AVWB 2ZMLA 3MPPG 1S0JA 2FDBM 3IM0A 5GALA 3AJYA 1LOCA 1KQRA 4YW2A 4BOWA 3FFZA 1FAYA 3T2TA 3BA5A 2FHRA 3PMEA 4TZDA 4FPYA 5DZEA 1I1EA 1MZ5A 1SBDA 4GALA 1V6WA 2DURA 2Y9XE 4GKXA 3ZYPA 4AWDA 1F5FA 3NWKA 5I1BA 4Q2FA 3M1HA 1WD4A 1TTUA 3M3OA 1LHUA 3ZXLA 2RSTA 2B7YA 2UU8A 2R49A 4WVVA 3T8SA 4XBQA 2Q3NB 4AN7B 2VH9A 5T54A 4ISQA 2UWCA 5T5OA 3OGFA 3FJCA 2PHXA 4GOVA 3AKFA 2D6OX 2A6ZA 4Y1VA 4LO0C 3WDTA 4LO3A 1YIFA 3B00A 5KXCA 2D23A 2D6PA 2V5YA 2P2KA 5F8WA 3HALA 4BLJA 4Q9PA 2HZ9A 3PHZA 4JC1A 4YM2A 5HCFA 2D7FA 4CTEA 4EKXB 5GZFA 3WA1A 2K8RA 3AZWA 2PHFA 3JRRA 4YLZA 4ZFYB 1FMZA 1DZDA 1RINA 5DVHA 4K20A 4XBLA 4XJ8A 3VT0A 3AFKA 4IHZA 1DZQA 1RG8A 3HSMA 4XFSA 4R9AA 4XBNA 3BOPA 3SNVA 3I2AA 3DGTA 1KITA 3N7LA 3HBWA 5GZEA 4H9WA 2D1ZA 3E8LC 1SLLA 3LSDA 2ZR1B 1XQNA 4H04A 1YI7A 1FNZA 2WT1A 3U4XA 1LHOA 21BIA 5CAZA 1GZCA 2A6VA 5KXBA 4DRVA 3H6QA 2ZHNA 4NO4A 1N1YA 3WZ1A 41BIA 3AH4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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