1AF9 | Genus

Total Genus 110

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	110
sequence length	441
structure length	441
Chain Sequence	EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structure of the receptor binding fragment HC of tetanus neurotoxin. pubmed doi rcsb
molecule keywords	TETANUS NEUROTOXIN
molecule tags	Clostridial neurotoxin
source organism	Clostridium tetani
total genus	110
structure length	441
sequence length	441
ec nomenclature	ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date	1997-03-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07951	Toxin_R_bind_C	Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	1af9A01
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	1af9A02

2PHTA 4UW4A 5IK7A 2YY1A 4X37A 3FJ8A 1LU2A 2ET2A 4GOYA 2ZMLA 2R9KB 3ZXGA 4BMEA 3AYEA 4DRRA 5DVHA 3Q7XA 1LOEA 2WT1A 3AKGA 3UJQA 4HJJA 2DU1A 1LU1A 3CA6A 2A3XA 1FMZA 3WMVA 5H9RA 2RSTA 3B9UA 1MS0A 1HWNB 3BIWE 4IZXA 1LECA 4LBLA 4GAIA 2JKBA 5BP5C 1Q8SA 3AH1A 4LBMA 3WINA 1CQ9A 1VALA 1IT0A 5EYYA 4GXLA 3AKFA 1H9PA 4Y1VA 5JOXA 3I8TA 4FPLA 1UZZA 1WBCA 4P9XA 3VSFA 5F90A 1MZ5A 1JW6A 4Z9WB 4K20A 4GKYA 1AFCA 2A6ZA 3MPPG 3F1RA 1JYIA 1BQPA 2C5DA 1EYLA 1JTCA 4R9CA 1SCRA 1QNYA 5EC5A 2VH9A 2D22A 1YXWA 3RQ0A 3W59A 4I4OA 1CPMA 3IMNA 2YUGA 1IHKA 5FZYA 4AN6A 3CU1B 4ZBVB 3OPZA 4BPZA 2K8RA 1XZZA 4EFRA 1V6MA 3OYWB 2GNMA 3VT0A 1G8WA 2WKKA 4M3CA 1Q04A 1BFFA 1V6JA 2NMNA 2DTWA 2XOAA 4AGRA 4I4VA 2ZGKA 3U4XA 1IILA 1YIFA 2AYHA 4XZPA 1CESA 5JMCA 4XTMA 4I7IA 3F62B 3O4BA 1A3KA 2FHRA 1FNYA 4XBNA 4JKXB 3H0OA 1MS9A 4Y1XA 1F5FA 3K1XA 1LESA 1Q03A 1LOFC 3CRGA 1DLLA 3WMUA 1ITBA 2P2KA 1KDKA 4JPZA 3ZSKA 5HCBA 5G00A 4QD2B 4QKSA 1WD4A 3WCRA 2XG3A 4DS0A 5DUYA 5BQUA 3AXDA 4G1RA 1WLCA 2ARBA 1ZA4A 3R4SA 1GZWA 1AX0A 2DVAA 2W39A 2MLLB 1G9CA 3O4DA 4I0YA 1N1TA 1HWOB 7I1BA 4I1EA 1AXKA 1JBCA 3N35A 4QALA 2E4MC 3A0NA 1SBDA 1LOCA 2EIGA 4KEJA 1II4A 2XB6C 2QN4A 3AJZA 4J2KA 4R9AA 4YGCA 2A3WA 4FOYA 2SBAA 4K1YA 1V6UA 3WO3A 2JDZA 4D0ZA 1JT5A 4LO0A 3HALA 1S1AA 2DUPA 4GOVA 2Y9GA 1H9WA 3R4UA 4IONA 3N7MA 3AKIA 1MS1A 1AF9A 2EXIA 3BRGC 3ZXFA 5LK5A 1LENA 2Y9FA 4FPFA 1SCSA 1MS5A 4P6AA 2WT0A 1LHUA 1W6MA 3WUDA 4X3AA 1LCLA 4YGEA 2M49A 2LALA 5FREA 3V0BA 2GO2A 3WUCA 3NBCA 4GAFA 5T54A 4JRAA 1FAYA 5BYNA 3ZXKA 1AZDA 1XQNA 1Q8QA 4YZ5A 4WV8A 3ZC8A 3ASIA 2GNTA 1LOGA 3AZZA 6I1BA 4AGGA 3O4OA 1UN1A 2W52A 2CTVA 2R1DA 1WLDA 1AXYA 5DZUA 3O49A 2GN7A 1W6NB 4YG6A 1ISVA 1JQZA 3ZXEA 1J1TA 4DQAA 5GZFA 4FPCA 1UL9A 4USPA 2D20A 4H55A 3V64A 5BXTA 3BA7A 5IK5A 1W6QA 1KJRA 4QD2C 1DQ0A 1PZZA 4YOLA 2E7QA 1HDKA 1W0OA 1RY7A 5KXBA 3AZWA 2ZGPA 5T5PA 3WDTA 4R9BA 1HLCA 2WSUA 2KM2A 1VLNA 4TLPA 3V0AB 1KJLA 5DUVA 31BIA 4I8MA 1GKBA 2ZMKA 4BLIA 3AK0A 1QGLA 1DHKB 2P3KA 3APBA 1T4QA 4XIKA 4IZEA 1RZOB 2R0HA 2ENRA 2GMEA 1T9FA 1WW6A 3SH3A 2ZHNA 1MS3A 1UKGA 3BAOA 1ONKB 4XTPA 2OUJA 1BFCA 2UWCA 2R1BA 1LHNA 2WJSA 4FPKA 3NV1A 3I2XA 2UWBA 5DG2A 3IN9A 1AVWB 3O0XA 2ZZJA 1DFQA 2F8XC 2ERFA 4XBLA 1JN2P 5JOYA 1CVNA 2NYYA 4UW6A 3FJEA 1IS4A 2FO1A 2X2TA 3VEQA 1HQLA 3WG3A 1JYCA 1N3PA 2UU8A 2ZHKA 4FPYA 2NTDA 2VY0A 4YFWA 1S0LA 4XFSA 4ENDA 2VW1A 3ZC9A 4ZOTA 1URXA 3CNAA 5KXEA 3NV4A 3WHUA 3HBWA 1BASA 4EFPA 3OY8B 3FFZA 1BARA 1QXMA 1AXZA 4PCRA 3BOPA 4XDQA 3MW2A 3USUB 2EALA 1GANA 3IIRA 3MW4A 4ISQA 3BAVA 1LHVA 3T8SA 2ZHMA 2ZGQA 41BIA 2GMMA 3T1LA 3AJ5A 1TTUA 1FQ9A 3FJFA 5DZGA 1SLAA 4FPJA 4ISRA 3M3QA 3O4CA 4ITCA 2EXHA 1GSLA 4AVTA 3FJHA 3VT1A 4IYBA 1ENSA 3T2TA 5GALA 5CAZA 3VKLA 2Q3NB 2CWSA 2A6WA 4WZFA 3BODA 3WOGA 3CQAA 4H04A 3SH5A 1TIEA 3JRRA 5E88A 2BFHA 1SZ6B 4G6MA 2DUQA 1FATA 5FRAA 1DQ1A 4CTEA 4NOTA 2D3PA 3OBTA 3BAGA 1FGAA 3IM7A 2Y9XE 2RQ9A 4FOWA 1IJTA 4XJ9A 3UD7A 5JVVA 2F2FC 4USOA 3OJVA 4U36A 1DZQA 3NWKA 3PHZA 3OGFA 4PBOA 2HWMA 5D63A 1ISZA 4OWLA 4XILA 21BIA 4I4PA 3VSZA 3H6QA 4AYUA 2D6NA 4A7ZA 5DG1A 4LO3C 1M2TB 1UZYA 3RMYA 1CONA 1CN1A 2DVBA 2WBCA 3P53A 2D7IA 1UPSA 1W6OA 3AFKA 2LIQA 4R9DA 2VUAA 5AVAA 3HR9A 1A8DA 2UUSA 3PG0A 2PHUA 4WVVA 2KI4A 2P23A 1NUNA 1TEIA 3LTQA 1MVQA 4GALA 1N1VA 2AAIB 1S0CA 1LHWA 4XBQA 1KQRA 4Q9GA 1AVAC 3PJQA 2DV9A 3SNVA 4KEKA 4OEEA 3CA1A 2D6LX 4M3CE 3AJ6A 1MZ6A 2R49A 2A71A 2CL2A 5GAQA 5GLVA 1UAIA 1P63A 2JECA 3B01A 4ZXKA 4P0JA 3ILRA 1QQLA 3AP7A 4WVWA 2ZBJA 1XHBA 1ISYA 1LEDA 5T5LA 2PHXA 4D69A 4LO1C 3SH4A 2A70A 3WNXA 4M00A 3IM5A 9ILBA 1IOBA 2W68A 4ZFWB 3FGMA 1IRAX 2E53A 1LODA 1FWVA 5F8WA 3Q7WA 1SFYA 3JUUA 1YI7A 1LGCA 4DCKC 4LBKA 1I3HA 2GNBA 1Q56A 1LOFA 1BYHA 3WV6A 3ZVXA 4YGBA 1FV3A 2JJ6A 4FP2A 1CIWA 2ZABA 1SBFA 1VAMA 3PVEA 2DS0A 1K5UA 1H30A 1AJKA 2A3YA 5E8AA 3FJCA 2GALA 4DEPA 4DENA 5CBLA 3H6RA 4Y22B 1LGNA 3FJIA 1JOJA 5EHAA 4AN7B 4YFZA 2I2SA 3QLQA 3NJ5A 3S8KA 1Q1UA 2J3PA 4U2AA 2E4MA 3AP9A 2AREA 3R05A 3AX4A 3DUIA 4HA2A 5HCFA 3ZSMA 1VCLA 4OEFA 3D4KA 1DFCA 2VW0A 1D2SA 2VW2A 4FOVA 3CRHA 1GZWB 3VUOA 1I1EA 2WT2A 3FJBA 3CA0A 2D7FA 3ENRA 2GZBA 2X2SA 1ULDA 1R8NA 3QR5A 4I2SA 3BAHA 3N7LA 2P3JA 1DQ4A 5T52A 1JY0A 5JOWA 3OJMA 4XJUA 5H9QA 3LCPA 4Q27A 3ILAA 4EB2B 4I4RA 3A4UA 2ZQNA 4I1BA 1W6PA 3D7WB 3FJ9A 1LGBA 1N47A 4BOWA 5CA6A 4LBJA 1GBGA 1SR4A 2HYKA 1WD3A 3FJKA 1DIWA 1QOTA 3NBNA 3NV2A 2DTYA 3CRIA 2R0FA 1SLLA 3O12A 3CAHA 4I4UA 4YW3A 4LBQA 4UW5A 3KQRA 3FJJA 2D1ZA 4HL0A 1G82A 3D6EA 1SLIA 1W6MB 3I4IA 3QYDA 3V0BB 1RITA 1NLSA 2VU9A 1ENRA 4YM0A 5DUWA 5GLUA 3NBDA 3BX1C 4OZXA 1GYKA 1BA7A 3FLPA 4KC3A 3IKWA 3FJDA 4Q1RA 4FPHA 4XE9A 5DSSB 4XIOA 2E7TA 2D24A 5H9PA 2JD4A 2AFGA 3O5WB 3C9ZA 1MACA 4LBQD 4MYEA 2JE7A 2MC2A 3POYA 1CR7A 4QO3A 3ZYRA 2DU0A 3FJAA 4P0KA 5IT6A 3FBYA 3B9CA 3PVOA 1HWPB 2V5YA 4ZLBB 4IY9A 3AZYA 3BAUA 2DUOA 2KI6B 1GZ9A 3O0WA 3BADA 1YRZA 1HCDA 1FMMS 2D7RA 2Z48A 3LSDA 3VV1A 4IY8A 3BB2A 1IRPA 1PZ9A 5DXDA 2JE9A 4Q1PA 4Q9PA 2DURA 3E8LC 1MVEA 4HANA 2YROA 3WDVA 2ES3A 2FDBM 2AXMA 4LBOA 3WHTA 4SLIA 4LO0C 5DZEA 2FFVA 1RMLA 4YM2A 3P6IA 2AH2A 2IHOA 4K1ZA 2A6VA 4LO7B 1KDMA 3WO4A 4DFSA 1FV2A 1OKQA 4M3CF 3IPVA 2Z42A 4TYSA 5DUUA 3RG0A 4OUJA 1C4RA 4YGDA 1AX2A 2DRYA 1OFSA 3WLUA 1S0EA 1JT3A 1IKQA 3SITA 2A7AA 5SV8A 4C1XA 4FPOB 4F83A 2NM1A 5FNWA 5BOWA 3ZYPA 1QNWA 2E6VA 1YTOA 3AH2A 3AP6A 4OWJA 3DGTA 4D8HA 1AX1A 4C1WA 5BXRA 2E51A 4I6IA 1HIBA 3LLPA 1V6WA 2LTNA 2ZHLA 1SBEA 2DVDA 4FOQA 1BFGA 1YBIA 1C1LA 1A78A 1HKDA 2TEPA 2UURA 4XFUA 1IOAA 2A5ZA 3H6SE 1GICA 2CWMA 2OW4A 3UK9A 3V0AA 3M1HA 1FYUA 1YO8A 1ULFA 1QDCA 3ATGA 3N3HA 4Y20A 4AVVA 4Q91A 2CYFA 3PVNA 2F2FA 1WLWA 2VXRA 2PHRA 1HKNA 5E24E 3AH4A 2NVHA 3AKHA 4EKXB 1LULA 2H0BA 1IS6A 2I1BA 1SLBA 3UL2A 4EFQA 3IM6A 5GLWA 4YW5A 4XJWA 4FVVA 4PQ9A 3ZSJA 4I37A 1AJOA 2D6KA 1JT7A 1G9BA 3AYCA 1APNA 1G9FA 4G9NA 1WW4A 2OUHA 4ASMB 5BXSA 5F9TA 3WZ1A 2AQZA 2ERMA 4BLJA 4BMBA 2P3IA 3CA3A 4LO7C 3RTJB 3INAA 1KITA 1DQ6A 1N1SA 5EXOA 2WRYA 3BA4A 2DRZA 1ILR1 1BLDA 3UD8A 2A75A 2VSAA 4AGVA 1PZ8A 2OVUA 3Q9OA 1Y7BA 1IS3A 4L8QA 1Q8OA 5JDBA 3A22A 1AVBA 3W58A 2GMPA 3MW3A 5GLTA 1SLCA 2NZ9A 5T55A 1M16A 4LO1A 3ZX7A 3PUBA 3O4AA 2A6XA 3B69A 5T50A 4YZ1A 1K5VA 4JKQA 5BP5A 3ILNA 4YM1A 1G9DA 1TWEA 1QU0A 1HCEA 1DYKA 1G86A 4P9WA 2D6OX 4GP3A 1N1YA 4LO2C 3I2AA 3CA5A 4I4YA 1MS4A 4YZ2A 4K21A 3B00A 5GZGA 4J2XA 1Z4SA 2Q5TA 5DZFA 5FNXA 4IQPA 4ATFA 1PUUB 3V65A 2D23A 2D3SA 5F5QA 1X50A 3SNMA 1LEMA 4EEEB 2AUYA 1DQ5A 3S8JA 4G9MA 3A23A 1JLYA 4XMIA 1JHNA 4J2SA 3O3QA 3RSJA 3H6RB 3M3CA 1W3AA 4LBNA 2ZGRA 2EF6A 5GZEA 2BEBA 4Y26A 1TFMB 4XJAA 1SLTA 4BQ1A 3AP5A 5F8SA 1ENQA 3TB0A 1FWUA 1RINA 2D3RA 3WDXA 4BM8A 4FGFA 2Q9XA 1ISXA 4M3CB 4OWKA 4IHZA 3A21A 4I4XA 1XYFA 5BXPA 2ZAAA 4UW3A 2DYCA 2P39A 2D43A 2VXTI 1V6LA 3FLRA 1WW5A 1NZKA 3QCWA 5IK8A 2EXJA 3FUOA 3POWA 2DVGA 4FPGA 1EPWA 3LSEA 1LHOA 2HZ9A 1GNHA 1JLXA 1N3QA 1QOSA 2ZQOA 1W6PB 2ZGMA 2NP0A 2ARXA 3HSMA 3BA5A 4Z8SB 4ZFUB 3P6JA 1J0SA 3BRDA 2FGFA 8I1BA 4Q2FA 1CJPA 3I29B 1BJQA 3POSA 3N36A 2Z49A 4I4QA 4XFTA 5JLVA 1YYNA 3VKNA 1L2HA 5EG6C 1QOOA 4LBQB 3O44A 2KKIA 1PUMB 5T5JA 4I30A 1ZM1A 5GLZA 4W65A 5KXDA 1O4YA 4JQ0A 5EWSA 4ZFYB 1ISWA 3WINC 2RG9B 2C9AA 3Q7YA 2AENA 1IS5A 4JAWA 5GM0A 1BFBA 1S0BA 4AWDA 2YXSA 5D61A 1UMZA 1DBNA 2AGSA 5BVPI 4RA0A 1QF3A 5F8YA 4Y22A 1MS8A 2ZGLA 3AP4A 3MALA 4CZSA 2ZGUA 2Y9WC 3WO2A 1Z78A 3N7KA 1ULEA 1UX6A 4YM3A 4NO4A 4CRQA 3WDYA 1AXMA 3UJ4A 3ZSLA 3OJ2A 1QKQA 2EAKA 4XKIA 3JU9A 4FPEA 3OYWA 1QQKA 4HR6C 3AZVA 3CA4A 1HWMB 3HMYA 1DYPA 2GDFA 2ZA9A 5B2HA 4PBPA 2P34A 2K4AB 3WG4A 3RMXA 1V6NA 3GNEA 1ABRB 4KBBA 4WBCA 2DVFA 1W3GA 4XJ8A 3HN1A 3B3QE 2BEAA 4I96A 1MC9A 1DZCA 1C1FA 1D0HA 3POKA 3IM0A 1YF8B 3VKFC 4JC1A 1JT4A 4A7YA 1FNZA 3RTIB 3N7JA 3A07A 2D6PA 1LTEA 2ZR1B 3WG2A 1ONAA 4J2YA 2EXKA 3TAYA 4YW1A 4ATEA 4FQZA 3ZPYA 4ZA3B 1N3OA 1I1BA 1TOOA 4L4HA 3WCSA 3OJBA 4QBVA 1RIRA 2CNAA 1W6QB 2GN3A 1DQ2A 1NXD1 5EYXA 1SR4C 2BQPA 2DWRA 2A6YA 1C57A 4D0TA 3ZXDA 5BQUC 1V00A 2GNDA 2FFUA 2ZGNA 5I1BA 4YG3A 2YMZA 2HWAA 4L4IA 1GNZA 3FLTA 3BAQA 2ZGSA 3UJOA 2B7YA 5GJ6A 3IPVB 1LJ7A 3AXEA 4G6JA 4JP0A 1OQ1A 4GKXA 2PHWA 1Z2VA 4ZKTB 1AVXB 2KLLA 1F9KA 1GZCA 2ZGOA 1W0PA 1TP0A 2VLCA 3AZXA 2ZACA 4AVSA 1GV9A 4P0LA 3SLIA 1VAVA 3EF2A 3WDUA 4Z8BA 2LIEA 1V6VA 5CNAA 4YG0A 4I3NA 1S0GA 1Q8PA 3T1MA 4XOGA 5L73A 2IWTB 5HCAA 5IK4A 3N0KA 4JCKA 4TZDA 3C2UA 4XYXA 1KRIA 1FX5A 2FMDA 2L5XA 3JUTA 4P9YA 3ZXLA 4Q8LA 1B09A 2G4IA 4YLZA 3ZXJA 1DZDA 4Y1UA 1R1ZA 1DGLA 1W6NA 5T5OA 3KMVA 4Y20B 3RS6A 1S0IA 1PZ7A 4FQ4A 3VT2A 2WLQA 3AYAA 4YZ3A 1IKPA 3NBEA 4PF5A 4YW2A 5GZCA 4DPNA 5DUXA 3O0VA 4Q8KA 2ZKNA 3M3OA 3OBRA 4YZ4A 2NMOA 2V73A 5HPZA 2ESUA 2WNEA 4OEGA 3HOMA 1GGPB 4GWNA 1BZWA 4XMAA 3UD9A 1BKZA 2AR6A 4QBCA 1E0OA 2YV8A 3UJ0A 4GA9A 1G7YA 4XXPA 2W08A 5GZDA 1DJSB 4R6UB 1LOBA 3PMEA 3L2YA 4XJZA 4Q26A 1S0DA 1V6OA 1XG6A 1PC8B 1WBLA 1CE7B 2SLIA 3MEPA 1MD6A 4QKRA 1R8OA 4KEIA 3AYDA 3O5SA 3FUQA 3KM5A 1RG8A 2D6MA 1ULGA 3A0KA 1JXNA 3OGGA 1N4KA 4X39A 4LO3A 1F31A 1S0JA 5IUQA 1FN0A 1QMJA 5E89A 1O4ZA 4PC4A 3AJYA 3VKOA 3D5OA 3BTAA 4P14A 1WBAA 4Y1ZA 1S0FA 2WQZC 3WDWA 2HW9A 3VWCA 4YW4A 5KXCA 3BRFA 1Q8VA 3WG1A 4RL7A 2UWAA 4XXAA 2VSEA 4M01A 1WCSA 4LO2A 3IAGC 1VIWB 2CY6A 2KH2A 5D62A 2PELA 2R16A 3OY8A 4DRVA 1BLAA 3TC2A 1W6OB 1HQWA 1ULCA 3WA1A 3USUA 1DQOA 1WW7A 2K43A 4OW4A 1V6KA 4ZGRB 4FP3A 3RRDA 5H9SA 2MIBA 4J23B 3M2MA 4I4SA 4GWMA 4Y1YA 1AVUA 2DREA 4XHXA 3SISA 5FZUA 4II0A 1JUIA 3ILFA 3V79C 3UDAA 3VKMA 4F34A 5CB7A 1DQGA 5FZZA 4H9WA 2YZ4A 3M3EA 3GALA 1V6IA 1PWAA 1G9AA 2QYIB 2RHPA 1EV2A 1CPNA 4QC4A 1V6XA 4X38A 1QDOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1AF9A

Total Genus

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