1AF9 | Genus

Total Genus 110

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	110
sequence length	441
structure length	441
Chain Sequence	EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structure of the receptor binding fragment HC of tetanus neurotoxin. pubmed doi rcsb
molecule keywords	TETANUS NEUROTOXIN
molecule tags	Clostridial neurotoxin
source organism	Clostridium tetani
total genus	110
structure length	441
sequence length	441
ec nomenclature	ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date	1997-03-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07951	Toxin_R_bind_C	Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	1af9A01
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	1af9A02

3LTQA 2BEBA 3OGGA 4JRAA 3NV3A 4BOWA 5BVPI 1Q03A 5T5OA 1SFYA 1W6NA 1ITBA 2UWCA 3VV1A 1SLIA 1NXD1 4AVSA 4USPA 3CAHA 3FGMA 1DFCA 3IN9A 3ZXEA 4J2SA 2YY1A 2AFGA 1CIWA 1MD6A 2YZ4A 4LBMA 3HBWA 4ZKTB 1JQZA 4AN7B 1AVXB 4JKQA 3WO2A 4GAFA 2HWMA 4P14A 1GNZA 1JYIA 4I4RA 4YZ4A 2W52A 3A21A 3UD9A 3IKWA 1R8OA 2KH2A 1DZDA 5LK5A 1VCLA 4ATEA 1LOFC 1Q8SA 4Z8SB 3O4CA 1I1BA 4FOYA 1GSLA 1G86A 3N35A 3VT2A 3F1RA 1SLAA 2ZMNA 2ZQNA 1IRPA 3SNMA 1D0HA 4UW5A 4LO3C 1RZOB 3QR5A 3JUTA 5EXOA 4UW6A 5DZFA 4Q1RA 3WG2A 1LHNA 5E8AA 1BFBA 2FHRA 1W3AA 3OGFA 3ZC9A 2AYHA 1OKQA 1ISVA 2ZACA 2YXSA 4JC1A 3ZSMA 1WCSA 1SLBA 2A3XA 3IM0A 1HDKA 1Q8OA 3WDVA 4XOGA 1AXYA 1LODA 5FZYA 1UKGA 5DG1A 5E24E 1YXWA 5EYXA 5T55A 1QDCA 1FYUA 1W6NB 2NYYA 3O3QA 3D4KA 2PHUA 2CNAA 3A0KA 1ABRB 3BRGC 3UJOA 4G6JA 1CPMA 4WZFA 4LBOA 1CE7B 1VAMA 3UJQA 4TYSA 1WBFA 2ESUA 1G82A 4FQZA 3I29B 3T1LA 4X39A 2VW1A 2KM2A 5JOZA 4PC4A 4I8MA 2OUJA 5BP5C 3WOGA 3AP4A 3N7LA 1FN0A 3WV6A 1FAYA 1BFGA 3PG0A 2DV9A 4QBCA 4QKSA 2UU8A 1Q8QA 1VLNA 3LCPA 2NTDA 1FV3A 3GALA 1QOOA 5HCBA 2A6VA 3I2XA 3ZXKA 1HWNB 4LO1A 2JJ6A 4QC4A 1RY7A 3H6RA 4K1ZA 2DVAA 2D6NA 3BRDA 5F8YA 3W59A 1IKPA 1QGLA 2WLQA 1SCSA 1KITA 2A6XA 3BB2A 1AX0A 5DUWA 4BLJA 4R6UB 1QNWA 3ZSKA 3VSZA 3AH1A 4J2KA 2ZMKA 4QBVA 3ZXDA 2SBAA 3EF2A 2JE7A 3B3QE 4ISQA 2WT2A 4GALA 4I4XA 5GZGA 5FNXA 1C1LA 2D6KA 4YZ1A 4TZDA 3BX1C 1BXHA 2CY6A 4OZXA 3N7JA 2GDFA 2VXTI 5DUVA 1VALA 2K8RA 4DQAA 1WD4A 2ZGPA 1QMJA 4XFUA 4JPZA 2VXRA 2D3RA 3V0AA 1JLYA 4MYEA 1GZWA 4YG0A 2H0BA 1YYNA 3OBTA 4R9AA 1QU0A 3BA4A 1JT7A 2WJSA 3UD7A 4IY8A 4XE9A 4WVVA 3CA0A 1A8DA 1WW7A 2PHXA 1FMZA 4AYUA 4XJZA 1R1ZA 2AREA 1FQ9A 3N7MA 2ZQOA 1K5VA 1H9PA 4XJWA 2ERFA 5IK5A 2ZGMA 3BAUA 2EIGA 4PBPA 4YOLA 2D7IA 2P23A 4C1WA 2DUPA 4I96A 3B00A 1S0LA 3USUA 3T8SA 3WDYA 3H6RB 3PVEA 1D2SA 4LBQA 2FO1A 1TWEA 4BMBA 1QQKA 2M49A 4Y22A 1MS1A 3VKFC 1B09A 3BODA 4EFQA 1WLDA 4I4YA 4G9NA 1TOOA 3SITA 4D69A 1F9KA 4OWJA 1TEIA 1AX1A 3IPVA 5JOXA 3POWA 1KQRA 1AJOA 3O5SA 3ZXLA 1ONAA 4IONA 3WDWA 3IAGC 5H9PA 2AGSA 1TIEA 4F34A 3HMYA 5EYYA 4ZOTA 4I37A 4EFRA 3NBEA 4P0LA 1IS5A 4YFZA 1KNMA 3UD8A 1A3KA 1GV9A 3O4AA 3V0AB 4XIOA 1GZWB 2PHRA 5BXRA 5CAZA 2DREA 2KKIA 4FOVA 1YBIA 1YTOA 3NBCA 4JCKA 2ZHMA 3UJ4A 4FPFA 1DJSB 1TFMB 3PVOA 3ATGA 4BQ1A 1LGCA 4A7KA 5GAQA 4FPCA 3N3HA 5KXEA 5E88A 3NWKA 3AZXA 4PCRA 2KI6B 3H6QA 1YI7A 1L2HA 1S0CA 4YG6A 1HQLA 1SLLA 4Y1VA 5HCAA 2UWAA 4Q26A 4Y26A 1BQPA 1IS6A 4Y1ZA 4JQ0A 3JUUA 4K21A 5EG6C 3USUB 1N4KA 3FFZA 2GNBA 2A70A 2PHTA 4LBQB 4Y22B 4CRQA 1G8WA 4Q9PA 4A7YA 5GLWA 2ZGNA 1S0GA 3Q9OA 4XJ9A 4X37A 1HWMB 3UDAA 4BLIA 1G7YA 3Q7WA 1XQNA 3AYAA 3ZSLA 3A22A 1FWUA 1V6LA 3IPVB 2ERMA 2K43A 2QN4A 2P2KA 2P37A 1N3QA 2DTWA 4I1EA 2DWRA 2I2SA 1AJKA 3FJDA 1Y7BA 1YF8B 2F2FA 1W6PA 5BXTA 1ULCA 4I4PA 3PVNA 5IUQA 1ENSA 3DGTA 1LOCA 1XHBA 5GZEA 1F5FA 5IK4A 4M3CA 2ZA9A 1AVAC 1MS0A 1IKQA 1S0FA 2GALA 3HN1A 4P6AA 2VSEA 1P63A 1AXKA 2D44A 1ZA4A 4YG3A 3VEQA 1JTCA 4KEJA 2CYFA 3O12A 1UMZA 1LOBA 1W3GA 3VT0A 4CJMA 4QD2B 4ENDA 5BXPA 1MS3A 4YW3A 1ONKB 2Y9WC 3BADA 5F8SA 1LOGA 3BOPA 1Z78A 1LHVA 2WSUA 4YGCA 4P0JA 4XJUA 4XJ8A 1JYCA 5GM0A 3FJBA 1PZZA 4YM0A 1SBFA 3AJ6A 1IS4A 1UZZA 3R4SA 4P9XA 2FGFA 3WDTA 3KMVA 2JE9A 3MW2A 3AKFA 4LO1C 1LECA 5FREA 3A07A 4J2XA 2X2SA 4AVTA 1O4ZA 1LHUA 3QCWA 5D63A 5DUYA 1JXNA 4Y1XA 4I4OA 1SLTA 1DGLA 1WUVA 2NMOA 1K5UA 2A6YA 1WD3A 4XBLA 3Q7YA 3O0XA 4II0A 1O4YA 1BARA 4I30A 1EYLA 5BXSA 2NM1A 2ZBJA 3OYWB 1CVNA 1G9DA 4YW1A 2IHOA 4FPLA 3NV4A 2Z49A 3BAGA 1W6PB 1W3FA 4XFTA 4FPOB 1ULFA 1LESA 3ZXJA 2CWMA 2ZHKA 3MW3A 3A0NA 4GOYA 2DYCA 1ZM1A 3SLIA 1SBEA 4I7IA 3WLUA 3CRIA 4M3CB 1QNYA 3P6IA 4L4IA 1S0BA 5DZEA 4YM3A 1WBCA 4I4UA 3AYEA 2D43A 4IQPA 3IM5A 4I4QA 2GNDA 2K4AB 4I1BA 1RINA 2AENA 5CBLA 4YGEA 2EAKA 1MVQA 1BZWA 1DLLA 1Z0HA 4I4SA 4D0TA 3CA4A 5D62A 3D5OA 1MC9A 5GZDA 1DQ5A 5BOWA 5JOYA 4XILA 3POSA 1QOTA 5CB7A 1N3OA 5GJ6A 4K1YA 4LO7C 4FPHA 1V6XA 1JUIA 3FJKA 4GKYA 4I6IA 4GP0A 3AJZA 4YW4A 4IY9A 3CA5A 3ZVXA 1MZ5A 1WW5A 1MS9A 1W6QA 2D24A 4Q2FA 2G4IA 2P39A 2D7FA 4R9BA 4XDQA 3VKLA 1AX2A 2CL2A 2HYKA 1N1TA 2OVUA 2OUHA 4OEEA 2W08A 3AZWA 4XMIA 5FZUA 2D6LX 1Q8PA 1Q56A 4Q8KA 5T5LA 1V00A 4G9MA 2E4MA 3HALA 5BQUC 4HR6C 2XOAA 1UZYA 3T1MA 3ASIA 2EF6A 1Q1UA 3FJHA 1NLSA 1CR7A 5SV8A 2EXJA 2B7YA 2ZKNA 2FMDA 2NP0A 2WT0A 2YV8A 4RA0A 1HWPB 2GNTA 4H9WA 1W6MA 4I2SA 1IILA 5GLTA 1N1YA 1C1FA 1RIRA 5T54A 1ULEA 3BAQA 1NZKA 1BYHA 2GN7A 2NVHA 3HOMA 4AGGA 3MEPA 1HKNA 4X38A 4QD2C 3A4UA 3WUCA 4ZA3B 1YIFA 1QXMA 2HW9A 2FDBM 2DU1A 2VUAA 3WG1A 1S1AA 4GKXA 4JAWA 3B01A 2D1ZA 3SISA 1H9WA 4OW4A 1URXA 1KRIA 4EFPA 1EPWA 2V5YA 5EWSA 4G1RA 4XJAA 1DHKB 1ULGA 1UX6A 4KC3A 1AVUA 3M3QA 4LO0C 1W0OA 1DIWA 2QYIB 1N1SA 4FOWA 4LBQD 3FJAA 3N7KA 4ZLBB 1WLCA 5JVVA 2UUSA 3E8LC 3VKOA 4PQ9A 3HSMA 2WT1A 4P9WA 1HCDA 1V6WA 2D23A 2R1BA 2F2FC 3M3OA 3OJMA 3WMUA 1RITA 2DUQA 5H9RA 3I8TA 3APBA 1GKBA 5DSSB 3V0BA 4NOTA 1BJQA 3AFKA 4LO2C 5F5QA 1LOEA 4M3CF 4AVVA 1W6MB 1CN1A 4DS0A 4AGVA 3IM6A 5FZZA 1SR4A 1WBLA 2GMMA 2VU9A 1S0IA 2RHPA 1DQ1A 1ISXA 4OEFA 5FNWA 3V64A 3RSJA 3N36A 2J3PA 5DZGA 1GLHA 1XG6A 3LLPA 2KI4A 5F9TA 4XTMA 3PUBA 1J1TA 1DQ0A 1WW4A 2P34A 1UAIA 3VKMA 3O0VA 3OJVA 4DRVA 2GMEA 1SZ6B 1QQLA 2FFUA 4YM1A 2LTNA 2WRYA 1TP0A 1G9FA 2E7TA 2ZGRA 2ZGQA 3TAYA 3O49A 5CA6A 4CZSA 1LU1A 3MALA 5T5PA 1MVEA 4TLPA 2DVBA 1CVSA 2UURA 3WINC 5JMCA 3BTAA 3FUOA 4XIKA 5BQUA 2XB6C 5KXCA 1PZ7A 1XYFA 3BRFA 2P3IA 4I4VA 3KM5A 3VKNA 2D20A 2Y9GA 2R0FA 1S0JA 5I1BA 1SBDA 5CNAA 3AYDA 3AP9A 1JOJA 3WO3A 3PMEA 1CQ9A 4Q1PA 2EALA 2ZR1B 1AF9A 1LGBA 4USOA 3RQ0A 3INAA 5F8WA 3CA6A 2WBCA 5GZFA 4XZPA 1PZ9A 4J23B 3O4BA 4EB2B 3FJ9A 5JOWA 4YFWA 3AK0A 1LHOA 2GZBA 3AH2A 2RSTA 4XFSA 5F90A 1UN1A 1M2TB 1V6VA 1II4A 3FJJA 3POKA 4Y24A 3OPZA 3RS6A 2KLLA 3SH4A 3A23A 3UK9A 4LO7B 4ZFWB 3CRHA 2LIQA 1KDKA 1HQWA 3IIRA 1GZCA 3IMNA 5EC5A 3QYDA 3OJ2A 3QLQA 4GWNA 1LOAA 1JT4A 4YGDA 4LO0A 3HR9A 2A6ZA 1PZ8A 4DFSA 1DBNA 3WHTA 3SH3A 4DPNA 3O4OA 1V6JA 1WW6A 1ISWA 1ENQA 3BAVA 2ZGUA 3W9TA 3AP5A 4ASMB 3VT1A 2VW2A 2GNMA 4FGFA 3PJQA 4YW5A 3WO4A 2ZHLA 1BFFA 1NUNA 4ZBVB 2AH2A 1ENRA 4F83A 2ZGKA 3AKIA 3JRRA 5FRAA 4ZFUB 1CONA 3VSFA 4KEIA 4QKRA 3V65A 2R1DA 3POYA 3M1HA 1WLWA 4W65A 4LO2A 4QO3A 1G9CA 3O4DA 4M01A 4YLZA 7I1BA 2E4MC 1LTEA 4GA9A 3ENRA 5GZCA 4FOQA 2GO2A 3WUDA 3IM7A 1LEMA 5IT6A 31BIA 2EXKA 1DQ2A 5HCFA 1QDOA 1H30A 2GN3A 2DUOA 1V6IA 3R05A 4Y1YA 4FPKA 5BYNA 4I0YA 2ET2A 3AJ5A 4J2YA 4BPZA 5JDBA 2A75A 2MC2A 4FP3A 2JD4A 1GICA 1W0PA 4XYXA 4OWLA 3T2TA 3WG3A 3RMYA 4LBNA 5IK8A 3CNAA 2XG3A 3WINA 2DRZA 3P6JA 5EHAA 1MS5A 4GP3A 4XXPA 4GOVA 2AAIB 2VSAA 3B9CA 4NO4A 1HWOB 1RMLA 2PELA 4BMEA 3NJ5A 3FJFA 3AXEA 1LULA 1Z4SA 2TEPA 1OQLB 4JKXB 1G9BA 2AUYA 4IZEA 3R4UA 2Z42A 3CA1A 4HJJA 4GWMA 1TTUA 1DYKA 1AZDA 5L73A 2E7QA 2ARXA 4K20A 3P53A 2R16A 3NBDA 3ZC8A 1QKQA 5GLVA 2DVDA 3S8KA 2JECA 2D6OX 2LIEA 3NV1A 1GNHA 4R9DA 1GGPB 2Z48A 1MS8A 3D7WB 3TC2A 4AGRA 1AVBA 3KQRA 4X3AA 3ZXFA 1DQGA 3MW4A 2IWTB 2Q9XA 1OQ1A 2MLLB 3CU1B 5GALA 2NZ9A 4C1XA 1SR4C 3OJBA 3MPPG 3ILAA 1N1VA 1MACA 2RG9B 1T4QA 2GMPA 4FP2A 4Q27A 4HL0A 1KJRA 5AVAA 3B69A 1I3HA 3AZYA 4L4HA 4AWDA 3JU9A 3UL2A 4YM2A 3N0KA 2BFHA 2I1BA 1FNZA 1T9FA 4ZXKA 4EKXB 4ZGRB 4OEGA 1ULDA 4A7ZA 3AP6A 4L8QA 1GANA 3WA1A 4XTPA 3BA7A 1AFCA 2W39A 4ISRA 3LSEA 1GYKA 2CTVA 1Q04A 2A6WA 2C5DA 4FPYA 2A5ZA 4IZXA 5DUXA 3F62B 1BLDA 1LU2A 9ILBA 2D22A 1CPNA 4P9YA 1IOBA 3SNVA 41BIA 1VAVA 3NBNA 1JN2P 1BASA 1V6NA 3SH5A 3VWCA 5B2HA 3L2YA 2VLCA 1Z2VA 3O0WA 5GLUA 4Z8BA 3S8JA 3WMVA 4FPEA 1FMMS 2ES3A 2ZGTA 4YW2A 1V6MA 4DRRA 4M00A 3GNEA 4XHXA 1YO8A 1AXZA 4UW4A 1IRAX 4UW3A 2ENRA 3WG4A 4XBNA 3C2UA 3ILFA 4YZ5A 3FJIA 4G6MA 2YUGA 2A3YA 4XKIA 5D61A 1Q8VA 2JDZA 5H9QA 5T5JA 1IOAA 1FGAA 1C4RA 3ZYPA 4FPJA 1PWAA 3WVJA 3AX4A 5KXBA 2ZZJA 1CJPA 4IYBA 1AXMA 2DTYA 2AXMA 1JY0A 1MZ6A 4H04A 1PC8B 1BLAA 2VY0A 2WKKA 3BAOA 5DZUA 3AKGA 1CESA 1U0AA 4PF5A 2ZMLA 2HWAA 2PHFA 3NV2A 4DCKC 3M3EA 1EV2A 2Y9XE 3D6EA 4DEPA 2RQ9A 4HA2A 2R0HA 1W6QB 4OUJA 3CRGA 3RRDA 1HCEA 1S0EA 2HZ9A 3ZX7A 4LO8B 4M3CE 21BIA 2EXIA 1DFQA 2D6PA 2EXHA 3BA5A 1LJ7A 3V79C 5JLVA 5DXDA 3VUOA 3O5WB 2MIBA 1QOSA 3ZYRA 1KDMA 2W68A 1QF3A 2ZABA 1DQ6A 3OY8A 2P3JA 1V6OA 1DZCA 3BIWE 3RTIB 2R49A 3LSDA 5T52A 4XHBA 2ZHNA 1DQOA 1GZ9A 3Q7XA 3WDUA 1XZZA 5H9SA 5DUUA 3FBYA 4PBOA 2Q5TA 1FWVA 2D7RA 1J0SA 2ARBA 1LOFA 4LBLA 1LENA 3O44A 2A3WA 1LGNA 1VIWB 4CTEA 2V73A 3BAHA 4KBBA 1A78A 1FX5A 1G9AA 3DUIA 2ZGLA 3W58A 2YROA 4LO3A 1SLCA 3WHUA 1UPSA 3RG0A 1HIBA 1ISZA 1AVWB 4I3NA 3AYCA 1LCLA 4U36A 1DZQA 3H0OA 1DQ4A 1EVTA 2X2TA 4D0ZA 3FJ8A 8I1BA 4RL7A 2E53A 2DVGA 2BEAA 2E51A 1FNYA 1OFSA 4ZFYB 3PHZA 1LHWA 1W6OA 3FJCA 1F31A 2E6VA 4GAIA 3AP7A 3H6SE 4R9CA 1SACA 2CWSA 2AQZA 1M16A 4Q91A 4XBQA 4H55A 1V6UA 3U4XA 3AXDA 4JP0A 1N47A 3K1XA 4ATFA 1KJLA 4P0KA 4WV8A 4Y20A 3AH4A 2WNEA 4SLIA 2YMZA 5GLZA 4HANA 4OWKA 1ISYA 2P3KA 2NMNA 4LBKA 3OY8B 2JKBA 3I4IA 1IT0A 4D8HA 3ILNA 3V0BB 2OW4A 2VW0A 4FVVA 1JHNA 4U2AA 4Z9WB 4Q9GA 5BP5A 5DVHA 2D3SA 1PUMB 5E89A 1MS4A 2FFVA 1IS3A 1S0DA 3CA3A 3M2MA 2DU0A 2DURA 1YRZA 4QALA 3CQAA 3C9ZA 1RG8A 4FPGA 2AR6A 4BM8A 3B9UA 3RTJB 1IHKA 4Y1UA 1PUUB 1MR5A 1JBCA 5IK7A 3AZZA 3I2AA 4WVWA 1C57A 3WZ1A 5HPZA 2F8XC 3WCSA 2LALA 1JW6A 3FUQA 2VH9A 1W6OB 3ZXGA 2A7AA 4YZ3A 3M3CA 1I1EA 3WCRA 2NN8A 1FATA 1HLCA 3AZVA 2UWBA 1V6KA 1DYPA 1X50A 4EEEB 2ZAAA 3RMXA 2WQZC 3ZPYA 4XXAA 3OYWA 1R8NA 1APNA 5T50A 4Y20B 4FQ4A 1BFCA 1JT3A 2DS0A 4YZ2A 1BA7A 3ILRA 5G00A 1HKDA 3UJ0A 1UL9A 4DENA 1E0OA 4WBCA 1IJTA 2DRYA 1FV2A 1LEDA 4XMAA 2C9AA 3ZSJA 2L5XA 2ZGSA 2D3PA 3FLTA 3FJEA 2BQPA 3AJYA 1N3PA 1BKZA 2R9KB 5DG2A 3OBRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1AF9A

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