1DFQA

The hc fragment of tetanus toxin complexed with sialic acid
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
source organism Clostridium tetani
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TETANUS TOXIN HC
total genus 109
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1dfqA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1dfqA02
2LALA 3NV4A 1JOJA 2WT2A 5GLUA 4K1ZA 2AR6A 1GNHA 4XTPA 3UL2A 4H9WA 1ABRB 4I4OA 1W3FA 3CRHA 2BEBA 1KJRA 3FJBA 2C5DA 4YG3A 5T5LA 3SITA 1ULDA 3O4BA 3T1LA 1ZM1A 1NZKA 1V6WA 4KEKA 4BM8A 1JT7A 5FZZA 2DURA 2D7IA 4Y1UA 5IT6A 3ZVXA 3WOGA 5AVAA 2NMOA 4XJWA 3OYWA 3NWKA 2ZR1B 1CE7B 1CESA 1Z4SA 3B01A 4USPA 3SNMA 4I96A 1O4ZA 2Q5TA 1ISYA 4XFSA 4G9MA 5BXSA 3BRGC 1FQ9A 3BA7A 4Q9GA 5CA6A 3V0BA 4DENA 1C1LA 4GAFA 2GN3A 3IPVB 3CQAA 4XXPA 3ZXDA 5E89A 4BQ1A 1QKQA 5L73A 2RQ9A 1AVAC 3HOMA 3JU9A 3BA4A 3CA1A 7I1BA 3POKA 5T50A 5H9RA 3PVNA 3AJ5A 4Y26A 4SLIA 1MVEA 3BA5A 3NV1A 1SZ6B 4GP3A 2GNMA 3PMEA 1H30A 2AXMA 1TEIA 1EV2A 1AVWB 2P37A 3D6EA 2ZA9A 4IYBA 1UKGA 3VUOA 2ZGRA 1LOFA 5D61A 2ZGSA 1W6NB 2X2SA 2F8XC 1LECA 4DS0A 2ZHLA 1FATA 1AJOA 4ISRA 1QOSA 4Q26A 4BLJA 4Q8LA 4LO2C 4M3CA 2EXJA 1CVNA 3OPZA 1B09A 3M3EA 4A7KA 4BMEA 1IS3A 1KDKA 1DQGA 3FJDA 4P14A 4J2XA 2ZGKA 3H6QA 2K8RA 4ATFA 4H55A 3RMYA 2A6XA 2UWCA 2CL2A 5IK4A 4OEGA 4KEIA 1ONKB 3H6RB 4PC4A 4HL0A 1XQNA 3USUB 3IN9A 2Q3NB 2A7AA 1ULEA 1WD3A 4ZBVB 2RG9B 1SBFA 4M3CF 1JYCA 4P9WA 3HMYA 3MW3A 3WG3A 2V73A 4DRRA 5F8WA 2CWMA 5T5OA 2D7RA 4LBLA 4YG6A 4Z8BA 4JC1A 1W6QB 3CAHA 4JKXB 4QKRA 4YW1A 1FN0A 2VW0A 1SLTA 1MS8A 1SLLA 1DQ5A 4ZKTB 1IJTA 5BQUA 5FZUA 1ITBA 3PG0A 3VEQA 5GLTA 4I4RA 2Y9WC 4JKQA 1MD6A 4D8HA 1JXNA 3WUCA 4J2KA 1MS4A 3VV1A 3Q7XA 1YI7A 2XOAA 2NVHA 2EXHA 2R49A 1W6PA 4ZFWB 4YGCA 2D6PA 5JOWA 5CBLA 3APBA 3N0KA 2DU0A 4XBNA 3WVJA 4IZXA 5F90A 4D0TA 4FPEA 3ENRA 2W68A 3B3QE 2VU9A 3MEPA 3FJEA 1PC8B 3NBEA 4Q2FA 3ATGA 1J1TA 1N1SA 1N1TA 3O4DA 2GDFA 4BLIA 2Y9GA 1G8WA 1OKQA 5E88A 1JTCA 3V64A 3V0AB 2QN4A 4XTMA 1IHKA 1TP0A 2CY6A 2GNDA 3ZC9A 2ZQNA 5FREA 2JE9A 1BASA 2VH9A 3B9CA 1N1YA 1QU0A 1S0GA 4YW2A 1V6IA 3POWA 4I3NA 1H9PA 3CRGA 1T4QA 3VT2A 3NBDA 5DZEA 3BX1C 5CAZA 3MALA 4UW6A 3NBNA 3AJZA 4HJJA 4AYUA 2Z48A 3IM0A 4AWDA 2IWTB 3C9ZA 3JUUA 2WSVA 3AZXA 1CVSA 3AP6A 2ZGPA 1TWEA 1JW6A 3AP5A 41BIA 1YF8B 1HCDA 5JOXA 5F9TA 2BFHA 3RTIB 5LK5A 4WBCA 4JP0A 2JDZA 3WO3A 1LGCA 3WDVA 1V6KA 3T8SA 2CNAA 3PVEA 2AQZA 4XIOA 3WDTA 2ZHNA 2UWBA 3VWCA 2EF6A 2YY1A 1GGPB 1BQPA 5BYNA 5GZFA 5T5PA 5BOWA 2NM1A 3WLUA 3HN1A 2RHPA 4FOVA 1IS4A 4LBKA 5BP5C 2DVBA 1W0PA 1V6OA 1LTEA 4IQPA 2P3KA 1TIEA 5CB7A 3WMVA 5KXBA 2DUPA 3OY8A 1TFMB 1IOBA 1BFBA 5GJ6A 3JUTA 4OZXA 5GZCA 4QC4A 3ZX7A 3OBRA 4TYSA 4Z8SB 1GNZA 5DZGA 6I1BA 2W52A 1DJSB 2OUHA 4BOWA 3WINC 3OBTA 3AX4A 4FP2A 4Q9PA 1PZ9A 3AZYA 5KXDA 1S0JA 1KQRA 1ENQA 1GZWB 3O5WB 3IPVA 3BADA 4USOA 4YW3A 3QR5A 4FPFA 5T5JA 2E53A 1XYFA 3ZPYA 3FLRA 4CJMA 2D6KA 1SBDA 3FBYA 5F5QA 2Y9FA 3ILAA 3FUOA 3TC2A 4GXLA 3M3QA 2YV8A 3WA1A 3RRDA 1HCEA 3CA5A 1FMMS 5DZFA 2JJ6A 2E4MC 2D20A 3BODA 5H9PA 5EHAA 3UJ4A 1DGLA 1KDMA 3BAOA 4ZOTA 4DRVA 1W6NA 3L2YA 1KNMA 1CN1A 4I4YA 4FPJA 3BAVA 1Y7BA 4FPCA 1R8NA 4A7ZA 4UW3A 4CRQA 4YZ1A 3AKIA 2ZMLA 2IHOA 1JLXA 2ZQOA 4DPNA 1N1VA 2UURA 1VCLA 2NZ9A 2LTNA 4YFZA 5JOZA 3BRFA 3RG0A 4XHXA 2WSUA 2PHWA 1RITA 5KXEA 1KRIA 1AX1A 4CTEA 4XBLA 5F8SA 4CZSA 1AX2A 3IM5A 4YM2A 3H6RA 3USUA 4R9AA 3I8TA 5BXTA 1QMJA 3INAA 4LO0A 3N7KA 1ISZA 3VKFC 1GZ9A 1YYNA 3CA4A 3IAGC 2GNTA 4M00A 3ZSLA 4EB2B 5GZGA 3BAGA 4ATEA 3VT0A 3CA6A 3FJAA 1W6QA 4GKXA 1DFCA 1Q8SA 3AP9A 4ZFYB 5JMCA 4Y24A 1PZ7A 3ZXGA 2PHRA 1QNYA 2FO1A 1HKNA 4EKXB 1YRZA 2DVDA 5SV8A 3WZ1A 5EXOA 2WLQA 4YGEA 1MC9A 4Y22A 1QXMA 3WDUA 1FNZA 1OFSA 2G4IA 3WG1A 4AN7B 1FWUA 1SLIA 3AJYA 3R05A 4J2SA 4FVVA 1ONAA 2KKIA 1SCRA 1OQLB 1GLHA 1BARA 1Q04A 4FPKA 2NTDA 1PUMB 5E8AA 2DYCA 1SBEA 1SLAA 2ESUA 2I1BA 2ERFA 1UZYA 1N47A 2UUSA 1QF3A 4FPOB 3V65A 1U0AA 1V6NA 5EG6C 3V0AA 4XJAA 2NMNA 4GALA 3OY8B 2QYIB 4I4QA 2E6VA 4LO2A 1LOCA 1I3HA 2NYYA 3KQRA 4NO4A 4BMBA 1BA7A 4YZ3A 1YBIA 5T55A 2UU8A 1UN1A 1A78A 4I4UA 1WLCA 4LO1C 1DQ6A 1MZ5A 3VKNA 3BTAA 3BB2A 1VLNA 2YXSA 4ZFUB 1YXWA 4YZ5A 3AZZA 3O0WA 3WCSA 3AFKA 1I1BA 3AXEA 1OQ1A 1LU1A 1LOEA 2AUYA 4Q1RA 4QD2C 3WNXA 1DFQA 1V6LA 2WBCA 1V00A 1LHNA 2VW2A 1IOAA 5JLVA 4K1YA 3N3HA 1ISWA 1RINA 1RG8A 1LJ7A 1LEMA 1WLDA 5HCFA 3NV2A 4XFTA 5FNXA 2R9KB 4XJ9A 4Y20B 1Q1UA 1MR5A 4PQ9A 2NP0A 4OEEA 3BRDA 3A22A 1P63A 3IKWA 4JRAA 2AREA 1LHWA 2DVGA 1JYIA 2ZACA 1FYUA 4LBQB 2ZAAA 4R6UB 3FUQA 3ZXFA 1WW4A 4XKIA 1MVQA 1AVUA 4G6MA 2K43A 4AVSA 4FP3A 3QLQA 4R9DA 2MLLB 4GOVA 2LIQA 4EEEB 1LEDA 1JUIA 1Q03A 2DUQA 4ASMB 2A70A 5GAQA 2FFVA 2BQPA 1G9FA 3HSMA 1GZWA 4P9XA 4RA0A 4XFUA 5B2HA 9ILBA 4YG0A 2FMDA 2A71A 2R0HA 1APNA 3AZWA 1HQLA 1DYKA 2CTVA 1SACA 4AVVA 3T1MA 5EC5A 4FQ4A 3FFZA 1S0FA 4AVTA 3CRIA 3FJHA 1ZA4A 1TTUA 4JPZA 3UD9A 1T9FA 1PZ8A 1Q8OA 1HWNB 1V6XA 3FJJA 1BZWA 1FV3A 4Z9WB 4DFSA 4F83A 1QDCA 4Y22B 3WHTA 2X2TA 2MIBA 1RMLA 2D6LX 4LO8B 1IILA 3SNVA 3S8JA 1TWMA 3AH2A 1FAYA 1N4KA 5EYYA 2ZKNA 4RL7A 4I30A 1J0SA 2Z49A 4I1EA 1LHOA 1G9BA 3A07A 1AX0A 3AYEA 1FMZA 4ZA3B 1N3OA 1EPWA 4X39A 1JQZA 2L5XA 2PHTA 4KEJA 1ENSA 3DGTA 4FGFA 4XYXA 4FPLA 3Q9OA 4I8MA 2GMMA 1QQKA 3W59A 2ZGQA 3VSFA 5FZYA 5BP5A 1AXKA 3O12A 3Q7WA 2GNBA 1S0CA 1MS5A 5I1BA 1V6UA 1XHBA 1EYLA 3I4IA 3UJ0A 2ZMNA 1SLCA 2R1BA 4AGVA 2TEPA 4YW4A 3UJQA 3WDYA 1M16A 3RTJB 1G7YA 1I1EA 3POSA 3O5SA 1BXHA 4P9YA 4TZDA 4KBBA 4U36A 3WINA 3FLPA 2WKKA 2AAIB 5GALA 1FNYA 1BKZA 2YUGA 1V6VA 3BIWE 1WBAA 3IIRA 3VT1A 1D2SA 4AN6A 1CPMA 4LO3A 5BQUC 3BAUA 2H0BA 4K21A 2CWSA 4YLZA 1QOTA 3FJFA 3OJ2A 3RQ0A 3ZSKA 1E0OA 1WD4A 3ILRA 1IRAX 1DYPA 2KH2A 3WDWA 5T52A 4Q91A 5DUXA 1Q56A 2E4MA 3ZXLA 1URXA 3D7WB 5E24E 2DUOA 1D0HA 4PCRA 3FGMA 1YO8A 1GBGA 2PHXA 2D44A 2GZBA 1VAMA 4FQZA 2ERMA 3ILFA 1WBLA 2D1ZA 1O4YA 5BXPA 31BIA 3BOPA 2KI4A 1BJQA 2EXIA 3WG4A 3POYA 1Z2VA 5DUUA 4I37A 1LOAA 1MS9A 3WO2A 4YFWA 1QQLA 4DQAA 1K5UA 1WW6A 2E7QA 2DRZA 3ZSMA 1LULA 3LCPA 1LOBA 1QDOA 4G9NA 5GZEA 1H9WA 3WV6A 1K5VA 1FV2A 1LHUA 5D62A 1VIWB 1S0BA 4Y1ZA 4YOLA 1NXD1 4EFRA 4P0JA 4C1WA 2VUAA 5EYXA 4I0YA 1IRPA 4XIKA 2OW4A 3VKOA 1LCLA 2DREA 2V5YA 1S0LA 2VLCA 1AJKA 2HZ9A 5EWSA 2M49A 1HIBA 4JAWA 4UW4A 3N36A 4OEFA 4Y20A 2P23A 3A21A 1LENA 2DV9A 2EAKA 2PELA 4XHBA 1DIWA 3A4UA 4QALA 4YW5A 2VSAA 3AKFA 4LBJA 1G82A 4EFPA 1IKQA 5DZUA 3WMUA 4P0LA 4HA2A 4LBQA 1WW7A 5DUWA 5IK8A 3IM7A 3K1XA 3O4OA 3AKGA 4TLPA 1F5FA 1SLBA 2P2KA 3CNAA 3AP4A 1W6MB 1GSLA 2KM2A 1Z78A 2VSEA 3DUIA 3ZYRA 1WBFA 4ISQA 4X3AA 5KXCA 4P6AA 5T54A 2WRYA 5BXRA 1Q8QA 2DVAA 1KITA 2ZGMA 3P6JA 1WUVA 1SR4C 1PUUB 2D7FA 2FDBM 4XJ8A 1CQ9A 4Y1YA 4L4IA 1UPSA 2A3YA 2VY0A 4G6JA 1FX5A 1W6OB 4DCKC 5CNAA 3FJKA 2WQZC 3U4XA 3HR9A 4XOGA 4Q8KA 5JOYA 3UD8A 3B9UA 2P39A 4QBVA 1HWOB 1BYHA 1HKDA 3OJVA 1RY7A 1GICA 2SLIA 1MZ6A 3I2AA 3AZVA 1N3QA 5GZDA 2ZBJA 4FOYA 2D3SA 1BFCA 2F2FC 1C4RA 2ZGNA 5DG2A 1FGAA 1UZZA 3H0OA 4ZGRB 2C9AA 1AFCA 4YM0A 4YM1A 2DS0A 3RMXA 4ZLBB 4XXAA 1DBNA 3BAQA 2P34A 4UW5A 1AVBA 3SH3A 1BFGA 1W3GA 4QKSA 2WNEA 5G00A 4YZ4A 4FOWA 5DSSB 1JHNA 2ZGTA 4FPGA 3CA0A 2GMPA 1II4A 3EF2A 3C2UA 2CYFA 3AH4A 1C57A 1Q8PA 2A6VA 1ULFA 3OGFA 2D6NA 2WJSA 2OUJA 4OWLA 1GYKA 4GAIA 4L4HA 4I2SA 8I1BA 2AGSA 3OJBA 3F62B 4LO0C 2ARBA 4M01A 5FRAA 2MC2A 3O4AA 5IK5A 2W08A 1CJPA 4FPHA 3F1RA 4II0A 4QO3A 3T2TA 1W3AA 4IHZA 3BAHA 4OW4A 2JE7A 2OVUA 4IONA 1MACA 5DUYA 3N35A 4PF5A 2VXTI 4LBNA 3I2XA 1IKPA 4LBMA 1AVXB 1QGLA 2P3IA 3GALA 3H6SE 3UD7A 1LODA 3A23A 1ILR1 1MS3A 4GKYA 1NUNA 3GNEA 4XJZA 1S0EA 3D5OA 4I4VA 4GWNA 1EVTA 4M3CE 4XILA 1DZQA 1M2TB 2AFGA 1HLCA 4JQ0A 2A6WA 3AKHA 5FNWA 2AYHA 4Q1PA 1YTOA 4I4PA 3M3CA 1C1FA 2ZGOA 4ITCA 3N7LA 3B00A 2R0FA 3QYDA 3KMVA 4C1XA 3LTQA 1F9KA 3IM6A 4D0ZA 3MPPG 2PHFA 1IT0A 1QNWA 1ISXA 2D3RA 4MYEA 1GV9A 4AGRA 3AYDA 4ZXKA 3LSDA 21BIA 1BLAA 1V6JA 2E7TA 2R16A 2ZABA 1HQWA 3Q7YA 1JT5A 4OWKA 4XZPA 3AYCA 4XMIA 1AF9A 4XJUA 1VAVA 2ZZJA 1JBCA 1DQ2A 2E51A 3SH4A 4Q27A 1DLLA 2D6MA 1S0DA 4IY8A 4OWJA 2EXKA 3B69A 3N7MA 3ILNA 2EIGA 4X37A 2WT0A 3FJ8A 1ULCA 3R4SA 2ARXA 3O49A 3VKLA 1LHVA 1ULGA 4AGGA 3KM5A 4QD2B 1R1ZA 1X50A 4NOTA 1G9DA 1AZDA 2A3XA 1DQ4A 1JT3A 5H9QA 3NJ5A 1LOFC 2FGFA 3LLPA 4DEPA 5DUVA 4GOYA 4I4SA 2ZHKA 4PBOA 1W0OA 4HR6C 2BEAA 3M3OA 1VALA 2XB6C 4ENDA 2KI6B 1A8DA 2DU1A 2ES3A 1W6MA 4IZEA 1F31A 3TAYA 2GMEA 3A0KA 2Z42A 2D43A 3HALA 2DWRA 3NV3A 2RSTA 2ENRA 3D4KA 5JDBA 2ZMKA 4XMAA 4GP0A 3IMNA 2DVFA 3AH1A 4YM3A 4PBPA 4R9CA 3W9TA 5DVHA 3RSJA 4L8QA 2K4AB 4Y1VA 3OYWB 4R9BA 2JECA 2Q9XA 4YZ2A 1UMZA 1W6OA 2EALA 4U2AA 2PHUA 3OGGA 4I6IA 4XBQA 2ZHMA 1DZCA 2R1DA 2DTWA 4HANA 5DG1A 2FFUA 3FJIA 2D23A 3V0BB 5HCBA 4WVWA 2YROA 5H9SA 3QCWA 2GN7A 2ZGLA 4EFQA 4WV8A 5GLWA 4OUJA 2HYKA 1G9CA 3SISA 4F34A 5GLVA 2WT1A 2LIEA 3ZSJA 3JRRA 3V79C 4GWMA 3PUBA 1WCSA 3W58A 3P6IA 4YGBA 3WUDA 5IUQA 2B7YA 1XZZA 4P0KA 1DQ1A 3FJ9A 1SFYA 1PZZA 1L2HA 2SBAA 3MW4A 4K20A 5GLZA 2D6OX 3UK9A 1AXMA 5D63A 1R8OA 1GZCA 2A3WA 1N3PA 4LO7C 1G9AA 4J2YA 4KC3A 2D22A 2DTYA 3WG2A 1ISVA 4M3CB 1Z0HA 3WCRA 3VKMA 3O4CA 2VXRA 3E8LC 1HDKA 5DXDA 3AK0A 4LBQD 3WHUA 1AXYA 3OJMA 5BVPI 3RS6A 2GO2A 3ZXJA 2A75A 1IS6A 1DQOA 4I1BA 3A0NA 2YMZA 1SR4A 2D3PA 3R4UA 3PHZA 3SLIA 3S8KA 1WLWA 3O0XA 3O44A 1JT4A 5HPZA 3MW2A 4XE9A 1UAIA 1PWAA 1S1AA 3AYAA 2HW9A 3AJ6A 2J3PA 3M2MA 5F8YA 2FHRA 2AH2A 4LO3C 1CR7A 1UL9A 2KLLA 1WW5A 2GALA 2A6ZA 4I7IA 3VSZA 1UX6A 1LU2A 2ZGUA 3M1HA 4YGDA 3WDXA 1DQ0A 2ET2A 3AXDA 1RZOB 3ZYPA 5HCAA 3UJOA 3ASIA 3PJQA 3N7JA 2Y9XE 1Q8VA 2XG3A 2JKBA 2A5ZA 1BFFA 4D69A 2W39A 1LESA 1QOOA 1MS1A 1FWVA 3WO4A 4WZFA 4XDQA 1CPNA 2F2FA 4H04A 3FLTA 3SH5A 4LBOA 1W6PB 1HWPB 3HBWA 4G1RA 1WBCA 3FJCA 2AENA 1LGNA 3O0VA 1RIRA 3ZXKA 1GKBA 1GANA 4QBCA 5JVVA 4IY9A 3ZC8A 1JY0A 2HWMA 2P3JA 2NN8A 1CIWA 2D24A 1MS0A 1S0IA 4Y1XA 1LGBA 3LSEA 3O3QA 1SCSA 2A6YA 1BLDA 4A7YA 4LO7B 1KJLA 1YIFA 4JCKA 4X38A 4FOQA 3NBCA 3I29B 4LO1A 1G86A 2HWAA 1CONA 3TB0A 5IK7A 1HWMB 3PVOA 1IS5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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