1DIWA

The hc fragment of tetanus toxin complexed with galactose
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNEESEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium tetani
molecule keywords TETANUS TOXIN HC
total genus 110
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1diwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1diwA02
4G9NA 4I4UA 2Q9XA 1JLXA 3D5OA 3MALA 2DVDA 3N7JA 4C1XA 3NV3A 2M49A 3ZVXA 5T50A 3C2UA 3IM7A 2EXIA 1FWUA 2LIEA 5DVHA 2JECA 1BFCA 4K1ZA 2ZR1B 3NV4A 4YG3A 4DENA 2Y9FA 2P3IA 4HANA 2AXMA 4IHZA 2ZHNA 2EXHA 1YF8B 1V6NA 2DUOA 2A3WA 1Q1UA 3POSA 5DSSB 2EF6A 5DUWA 3NBCA 4JC1A 1UMZA 4WVWA 1FATA 3WDWA 2VSAA 1LU1A 1JT3A 3O5WB 5EG6C 1URXA 2ZGPA 8I1BA 4AVVA 4J2YA 2VU9A 3I8TA 1BQPA 4Y20A 1S0IA 3AJZA 1YI7A 1RG8A 4XE9A 1HWNB 1JT7A 2E4MC 2D7RA 2E53A 1N1YA 5F8WA 4YFWA 5GLUA 4QC4A 1DQ6A 3WG4A 4HJJA 3WHTA 2Q3NB 1XYFA 5BXTA 3OJBA 2VW0A 3BADA 1NXD1 4L8QA 3A21A 4I1BA 3D7WB 4HR6C 1MD6A 1NUNA 3FJ8A 1V6OA 1SLTA 5BQUC 3L2YA 4NO4A 4JAWA 2AUYA 4ZLBB 3O4DA 5D62A 3ZPYA 2K4AB 1UAIA 1BFBA 4OEFA 4OWJA 4EFQA 1LHNA 5CA6A 1FGAA 1BYHA 5AVAA 2F2FC 4Y22A 5T5PA 3A23A 1Q03A 3RTJB 4XIOA 2CTVA 1HLCA 3AYCA 1LGCA 3FJDA 2Z42A 2A6ZA 3BTAA 4LBNA 3BODA 3UJQA 3AZVA 5JVVA 2I2SA 4IZXA 1CPNA 2ZHKA 1ENSA 4YG0A 3VWCA 3UJ0A 2QN4A 5L73A 3IPVB 1JW6A 1Z0HA 1YXWA 1GZWB 3WMUA 5GZCA 2VH9A 3T1MA 1G9AA 5FRAA 3ZXEA 1WW7A 2YMZA 1GKBA 4MYEA 5GLTA 2PHWA 3ATGA 2GNBA 4F83A 3TC2A 5JMCA 1IKQA 3FFZA 1AXMA 4LBKA 2A6WA 3LLPA 1C1LA 3CRGA 3T1LA 4Q27A 3WDYA 3VUOA 3SH3A 4IONA 1LCLA 1WUVA 4DPNA 4P0JA 3WUCA 1S0FA 3O0XA 3UD9A 3ZXDA 4R9BA 3WLUA 1X50A 1K5UA 3VT2A 1MVQA 2MC2A 1QNYA 2W68A 2D3PA 1EV2A 5HPZA 4Q1RA 3V65A 1PUMB 1S1AA 2Z48A 5GLWA 3VT1A 2ZGOA 3SITA 2D6PA 3BAHA 5IUQA 4Q2FA 1DYKA 1W0PA 3CRHA 1N3PA 3A4UA 1I1EA 3RS6A 2KM2A 1EPWA 2EXJA 4I6IA 1LOAA 5DXDA 2JD4A 2DVBA 1W6PB 3N36A 5GLVA 4LBMA 2GDFA 1LOBA 4QALA 4XKIA 3WINC 4XJ8A 1PZ8A 2KH2A 4GA9A 2YV8A 2RG9B 5BP5A 2R1DA 3IAGC 1J0SA 1XHBA 2LIQA 5DZUA 3O4OA 5HCBA 1MC9A 4RA0A 2C9AA 2NM1A 1KRIA 5T55A 2WRYA 1W6MB 1MS1A 2D6NA 1LECA 1R1ZA 1D0HA 4YGDA 3SLIA 3SNVA 3FJEA 3BRFA 5GALA 1QKQA 5D63A 1CR7A 1BARA 3AH4A 1H9WA 3CA5A 3KQRA 4I4VA 3V0BB 3O0WA 3KMVA 1VCLA 3QCWA 1IRPA 2VW2A 5E24E 4FOVA 5E8AA 5DZGA 4AVTA 4K1YA 2E6VA 3VKNA 1S0LA 1YTOA 1T4QA 4DQAA 1OKQA 3GALA 1DIWA 5F5QA 3HN1A 4HA2A 1GGPB 3NBDA 1DFQA 2D6MA 2FO1A 5FZUA 3FJJA 3AZXA 1AXYA 2A71A 3JUUA 5E88A 1GZ9A 3T2TA 2YUGA 4XJZA 1SLLA 2VXTI 2GN7A 1AVAC 1GNHA 2VW1A 3ZX7A 1H9PA 1GYKA 2P34A 3FUQA 3AX4A 1MS4A 4J2SA 2GNDA 4X39A 1WCSA 1FWVA 1ULDA 2BQPA 3V0AA 4GOVA 4FP2A 1BLAA 5DUVA 4AN7B 3VKMA 1DQGA 3HBWA 4Z8SB 2B7YA 5CAZA 1F9KA 3PVNA 2JE7A 4QKSA 3AYAA 5I1BA 2OVUA 1CESA 4M3CA 4TYSA 1HQWA 5DZEA 4DRVA 2D3SA 1KQRA 4XJ9A 3P6JA 5BOWA 4LO3C 4I4SA 3OJMA 3OGGA 4XBLA 1AVUA 4P0LA 3HOMA 3QLQA 1FX5A 2A70A 3AFKA 2ZQNA 4DCKC 1FMZA 4QD2B 2HWAA 2KI6B 1TWMA 2A5ZA 3RQ0A 1JQZA 2ZMKA 2ZKNA 5DUUA 4CZSA 2IHOA 1G9CA 1BFGA 5GJ6A 1VLNA 2ZZJA 1ULCA 1WBAA 2G4IA 4GKXA 3SNMA 3PVOA 1W6NA 4ISQA 1MS0A 1A78A 3WCRA 1IOBA 4W65A 1I3HA 2DU0A 3AP9A 1HKNA 1JY0A 4YM2A 5BQUA 1IKPA 5GZDA 4EKXB 1QMJA 1GZCA 1HIBA 1V6IA 2DTYA 4G9MA 4YZ3A 3EF2A 5F8SA 1QXMA 1MR5A 4Q9PA 2ZGUA 2UWBA 2QYIB 2ZGKA 3UK9A 2KKIA 2GMEA 4Y26A 2F2FA 3NBNA 2X2TA 3RSJA 1BKZA 5FZYA 5DUXA 2ZGRA 1J1TA 1KJRA 2DUPA 3VKOA 1Q8OA 1GICA 1HWMB 5DZFA 1N1SA 2DTWA 1JTCA 4LO1C 2ZGNA 2YXSA 1ISZA 3O44A 2V73A 1WD4A 1M16A 3IMNA 4YZ4A 3O4CA 1A8DA 2ARXA 4OZXA 4YZ5A 2OW4A 3GNEA 2P39A 4JKQA 1IOAA 5G00A 4XOGA 4C1WA 2D24A 3UJOA 4I1EA 3PMEA 3FUOA 31BIA 4LO7C 3AKFA 4CRQA 4FPGA 1N3QA 4YW1A 4U36A 3POWA 1N3OA 4XJWA 3C9ZA 3AP6A 1EVTA 4LBQD 2WT1A 2R0FA 1SR4C 3ZXGA 2D6LX 4YZ1A 2D1ZA 4Q91A 1LGBA 2AH2A 2C5DA 4EB2B 1JYIA 2R9KB 4P9XA 3UDAA 3B9UA 4I3NA 4ZOTA 5FZZA 1RMLA 3CA0A 5T5JA 2CWSA 4LO2A 4Q9GA 4XXAA 2D3RA 3ZYPA 3APBA 4XFUA 3AP4A 4Q8KA 3ILRA 2DU1A 3N7KA 3WG1A 3OJ2A 3Q7YA 3T8SA 3WG2A 2VXRA 2PHUA 1JN2P 2P3KA 4ASMB 1WLWA 4L4IA 5KXDA 1LOEA 2ES3A 1JYCA 2BEBA 1UPSA 1DHKB 3BIWE 1RIRA 3N7LA 3PVEA 4XZPA 4YW3A 3WINA 1CIWA 4P0KA 4Y20B 5CNAA 5FREA 4YGCA 1O4YA 3O4AA 1DZCA 1V6JA 1LU2A 2RQ9A 1LESA 2JJ6A 5IT6A 4LO0A 2K8RA 1T9FA 5JOWA 3V64A 4FPKA 6I1BA 2XB6C 5KXBA 2R49A 4F34A 3JRRA 2JKBA 2PHXA 4D0TA 2JDZA 1DQ5A 1LOCA 3LSEA 1A3KA 2GALA 3O3QA 4TZDA 1HCDA 4L4HA 4H04A 2E7QA 2SLIA 4AGRA 4U2AA 3FJHA 1WLDA 4KEIA 4HL0A 2FFVA 3WO4A 4Y22B 1ITBA 1HKDA 2LALA 1UN1A 1F31A 1HWOB 4YW2A 2WBCA 3MW4A 4I0YA 3ZC8A 3P53A 3ASIA 1LJ7A 4Z8BA 3H6RA 1MS3A 1HDKA 3ZSLA 2PHTA 2UUSA 1II4A 1AX2A 1C1FA 4UW5A 3AYEA 1QGLA 5H9RA 1MS8A 2WT2A 1ISVA 1MZ5A 4X38A 1BASA 2W52A 2DREA 4KBBA 3A0KA 3RMYA 4GWMA 1DLLA 3HMYA 4FPEA 3IN9A 1XZZA 3FBYA 4G6MA 1VALA 4YFZA 1N4KA 4WZFA 1SBFA 1LODA 3POYA 2AGSA 1AX0A 1ULGA 4QBCA 5F90A 4J2XA 4YGEA 3JU9A 4LBQA 4I4XA 3H0OA 3OYWA 1KITA 1CONA 1SACA 2ZACA 4I37A 3NV1A 4XHBA 1P63A 4BMEA 3M1HA 3KM5A 1W6QA 1SLCA 4LO3A 4JQ0A 2ERFA 4PF5A 1S0EA 4DS0A 1ISYA 2BEAA 5GLZA 4KEJA 1FMMS 3ZXKA 1GV9A 1W0OA 3W58A 2BFHA 1QQLA 3I29B 2FHRA 1V6VA 3H6QA 4JPZA 2W08A 3FJKA 2D6KA 9ILBA 3WG3A 2CYFA 2D43A 4FPOB 4FGFA 1K5VA 2HZ9A 2P3JA 1W3FA 2AYHA 3V79C 1TP0A 2CL2A 1BZWA 1APNA 1QU0A 2ZGLA 1GNZA 3A0NA 2IWTB 2GMMA 4IY9A 3ZC9A 4SLIA 3AZYA 1WW5A 4AWDA 3A07A 3JUTA 1C4RA 3WMVA 5JDBA 5CBLA 5IK7A 1AXZA 2HYKA 2A6YA 1G8WA 3AYDA 1R8NA 2VUAA 1AX1A 1SLIA 2K43A 1SCSA 3POKA 1KDKA 5EYYA 3O4BA 1IRAX 1BA7A 4FPLA 4M01A 1ENRA 1DQ0A 4FOWA 2E51A 2Y9XE 1LEMA 3ZSMA 4YZ2A 5H9PA 2AR6A 2NVHA 2HWMA 1JT4A 4D0ZA 4FOYA 2LTNA 2UURA 4I96A 4R9AA 4BPZA 4FPFA 1DQ2A 5JOXA 1ILR1 3WNXA 4ITCA 2R16A 2DVFA 3N35A 2NN8A 1IS6A 3O0VA 4DFSA 3BA5A 5T5OA 4ZXKA 4R6UB 4ENDA 1S0BA 5HCFA 2ZHLA 4JCKA 3VSZA 1WBLA 4OWKA 3K1XA 2L5XA 4BQ1A 1Y7BA 3ILAA 1LGNA 5GZFA 4I30A 3LCPA 4Q8LA 1V6UA 5IK5A 3V0AB 3AH1A 4OUJA 2PELA 1VIWB 1TEIA 2D7IA 3BAQA 3R05A 4LBJA 4A7YA 1DGLA 1JT5A 4BM8A 3QYDA 2UWCA 2P37A 4OW4A 5GZGA 3VKFC 3M3CA 2DRYA 2TEPA 4FPYA 3IM5A 4R9CA 3NBEA 1AJKA 5CB7A 3HALA 1CVSA 3AJ6A 3D4KA 4M3CB 3WA1A 4P9WA 4YW4A 5SV8A 3B9CA 4PBOA 2A6XA 1QQKA 3AXDA 4IY8A 2E4MA 3BRDA 1WW4A 4LBLA 1W6OA 3B3QE 3FJ9A 4IZEA 3IM0A 2Z49A 2AFGA 4A7KA 1XG6A 1Q8PA 4A7ZA 5FNWA 5JOZA 2A3XA 1UZZA 1LHVA 1V6LA 1PC8B 1IS5A 3ILNA 3CA6A 1TFMB 1SLAA 4I4RA 5T54A 3ENRA 3F62B 2Q5TA 4Y1ZA 1TWEA 3NJ5A 4AYUA 2R0HA 2GO2A 4XBQA 3N0KA 1AJOA 3WUDA 2DS0A 1W6NB 1DYPA 1Q56A 1ZA4A 4K21A 2R1BA 2MIBA 2RSTA 1IT0A 1RY7A 4P14A 1QDOA 3WHUA 4ZFWB 2F8XC 3WDUA 5BXPA 1E0OA 2DYCA 3CNAA 3USUA 3AP5A 4M00A 4IYBA 3AKIA 4TLPA 4IQPA 4Y1VA 3DGTA 3UD8A 4H9WA 2W39A 1V6KA 4X37A 1HCEA 2ET2A 5BVPI 4XJAA 1LULA 5HCAA 3VV1A 3QR5A 4PBPA 4NOTA 1W3AA 3OBTA 4XIKA 5FNXA 3OY8A 2YZ4A 5DUYA 1VAMA 1AVWB 3CRIA 3WCSA 2UWAA 3VEQA 4RL7A 4DRRA 1NZKA 1DFCA 4LBOA 1QF3A 4QO3A 1JOJA 3R4UA 5JLVA 3Q7XA 1LOGA 1QOSA 4BMBA 2J3PA 4AGVA 1ONKB 3RRDA 3N3HA 2FDBM 1V6MA 1UZYA 4YG6A 4EEEB 3O5SA 1GLHA 3CA1A 2KI4A 5KXEA 4XFTA 4JKXB 2ZAAA 3M3EA 1DBNA 2YY1A 1IHKA 3CA3A 2ENRA 2AREA 2AQZA 1V6WA 4YGBA 2X2SA 1WLCA 4I2SA 3I2XA 4M3CF 4ISRA 2A75A 3ZSKA 4LO8B 5BXRA 2MLLB 3HSMA 5IK8A 1BLDA 2ZA9A 4J23B 1G9FA 3MEPA 1JXNA 2GNTA 2ZMNA 3Q7WA 3AK0A 2HW9A 2DRZA 1O4ZA 1DQOA 1ISXA 1ULEA 2ZQOA 5EHAA 4QD2C 2VSEA 1N1VA 1IJTA 1FNYA 3ZYRA 3RMXA 4Y1UA 4AN6A 3AJ5A 1ENQA 2FMDA 3TB0A 2V5YA 1Q8SA 2VLCA 3A22A 1S0GA 4EFPA 4KC3A 3BB2A 4UW3A 3WDXA 4I7IA 4AVSA 1RINA 4JRAA 3OPZA 4X3AA 3SH5A 2A7AA 2ARBA 2OUJA 4XMAA 1QOTA 5T52A 4KEKA 3AXEA 4GP3A 3RTIB 1EYLA 4GALA 3E8LC 3R4SA 1LHUA 5GAQA 1F5FA 3OBRA 3M2MA 5EXOA 1KDMA 1SBDA 4ZA3B 3IM6A 1R8OA 3ZSJA 3BA7A 2XOAA 2Y9GA 2DVAA 1KJLA 1DQ1A 4Q1PA 1IS3A 1JUIA 2NP0A 4GXLA 1LENA 3I2AA 1RITA 1QNWA 2VY0A 4XFSA 1GBGA 1GANA 1TIEA 4I4QA 2EXKA 2A6VA 4YW5A 1FYUA 2WSVA 2FFUA 1LHOA 4I4OA 3BAUA 1PWAA 3FJFA 5E89A 1JHNA 1FV2A 3ZXLA 1MS9A 4Y1XA 4D8HA 2ZHMA 3B00A 3O49A 3FJAA 5GM0A 1ULFA 1OQLB 1LHWA 3IPVA 1GZWA 1U0AA 3FLPA 4FP3A 1LOFC 2D6OX 4ZBVB 3Q9OA 1B09A 2ZABA 4YM3A 4OEGA 4Q26A 1V6XA 3FJIA 2GZBA 1SLBA 2PHFA 3IKWA 2DWRA 1CVNA 4I4PA 4XJUA 3IIRA 3B01A 4XHXA 3AKHA 2WJSA 3BX1C 3H6RB 2ERMA 3BA4A 5EC5A 4BOWA 4XXPA 1AFCA 4I4YA 2OUHA 3AJYA 2YROA 1G82A 4FQ4A 2I1BA 1AVXB 21BIA 3WO3A 3VSFA 2SBAA 1QDCA 1FN0A 1ZM1A 1DQ4A 1G7YA 3SH4A 1L2HA 1MZ6A 3FLRA 4OWLA 3TAYA 3AH2A 4ZGRB 4YLZA 3WZ1A 3WDVA 4Z9WB 2E7TA 2ZMLA 1ABRB 4LBQB 1MVEA 4XTMA 1C57A 1PZZA 5T5LA 3FJCA 3OYWB 4YM0A 2CNAA 2WLQA 1M2TB 2NMOA 3PHZA 1W3GA 2D7FA 2NMNA 1WD3A 4WV8A 1W6PA 4P9YA 4WVVA 3ZXJA 4LO2C 4R9DA 4FVVA 2GN3A 1W6QB 2ZGMA 5JOYA 4FQZA 3MW3A 4CJMA 1Q8QA 3NV2A 4M3CE 3VKLA 1YBIA 1HWPB 4GKYA 3P6IA 1CE7B 1W6MA 1Z78A 4Y24A 4DEPA 2WNEA 1BXHA 3PJQA 3AKGA 1FNZA 3FGMA 3MW2A 3LTQA 4FPCA 2D44A 3V0BA 5DG2A 3FJBA 3UJ4A 5DG1A 2DUQA 4YM1A 4LO0C 2DVGA 4FPHA 1FAYA 3U4XA 3MPPG 3FLTA 4GAIA 1S0CA 4QBVA 1IS4A 2ZGSA 2NTDA 4UW4A 4G6JA 2H0BA 2NYYA 3AP7A 3VT0A 4PCRA 1FV3A 3WO2A 4XTPA 1Q04A 1SFYA 1DZQA 1SZ6B 5B2HA 5H9QA 1ONAA 4ZFYB 3NWKA 2GMPA 1YIFA 1Z4SA 4K20A 2D23A 3PG0A 2EALA 1PZ9A 1CQ9A 4LO1A 1G9DA 5F9TA 4BLIA 3ILFA 1UKGA 1LTEA 1VAVA 1BFFA 4GP0A 2AAIB 2D20A 1AZDA 2WSUA 4EFRA 2FGFA 2Y9WC 3WV6A 3OJVA 2GNMA 2WKKA 3F1RA 4G1RA 5LK5A 1UX6A 5GZEA 4USOA 4XYXA 4AGGA 1CN1A 4Y1YA 3M3OA 4XILA 2DURA 1SCRA 1DJSB 4USPA 3CU1B 4UW6A 3I4IA 3AZZA 4J2KA 3UL2A 1NLSA 2CY6A 4ZKTB 4OEEA 1AVBA 1S0JA 2P2KA 5F8YA 2AENA 1CPMA 4P6AA 4GWNA 2ESUA 3RG0A 5KXCA 2A3YA 1SR4A 1N47A 1JLYA 4LO7B 1OFSA 1JBCA 3N7MA 1UL9A 4I8MA 3HR9A 5BXSA 2XG3A 2CWMA 1IILA 4JP0A 4YOLA 3S8KA 1WBCA 2P23A 1AF9A 4D69A 1WBFA 1QOOA 2ZGTA 3LSDA 1KNMA 4ATEA 3CQAA 4CTEA 4H55A 1RZOB 3CAHA 3W9TA 3BRGC 1AXKA 1H30A 4GAFA 2JE9A 1G9BA 1G86A 1ISWA 5D61A 5BP5C 1PUUB 4QKRA 3H6SE 2WQZC 2EIGA 1W6OB 1XQNA 5EWSA 2WT0A 4XDQA 3UD7A 3D6EA 1D2SA 2D22A 1N1TA 3BAOA 1V00A 1TTUA 4ZFUB 2UU8A 5H9SA 2ZGQA 2EAKA 3BAGA 1GSLA 4PC4A 4XMIA 2DV9A 1SBEA 3PUBA 1MACA 3WOGA 3DUIA 1YO8A 2PHRA 3WVJA 1OQ1A 1WW6A 1YYNA 1Q8VA 1MS5A 5BYNA 1CJPA 1BJQA 3BAVA 2RHPA 1I1BA 3USUB 1PZ7A 3ZXFA 1YRZA 2ZBJA 3B69A 2KLLA 4WBCA 7I1BA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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