1DIWA

The hc fragment of tetanus toxin complexed with galactose
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNEESEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium tetani
molecule keywords TETANUS TOXIN HC
total genus 110
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1diwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1diwA02
2DREA 3VUOA 1SLTA 1ULEA 4LBNA 4FPGA 1ENQA 3FLRA 4OWJA 4ITCA 3VKFC 2Z42A 2BEAA 4Q8LA 1TWEA 4DENA 4Q9PA 4RA0A 1RY7A 2R1BA 1MS5A 4WBCA 5KXBA 5F9TA 2FDBM 3R4SA 1V6IA 1JT4A 2ERFA 5F8YA 1AXMA 2D6PA 3FBYA 1AX0A 2PHFA 1W6PA 1BLAA 1PZ9A 1ULFA 1FNZA 2AYHA 3CA4A 4XFUA 5B2HA 3H6RB 1BXHA 1CPNA 1MD6A 2B7YA 4QD2B 2MC2A 1LOFA 4JQ0A 4II0A 1IS3A 4YM3A 4QALA 3V64A 2UWBA 1DIWA 4LBQB 2A71A 3O44A 4P0LA 1GICA 1LU2A 3O0WA 2D22A 5BXRA 1C1LA 1CONA 4ZKTB 2ZHNA 5KXCA 1LHWA 1Q8QA 4D0ZA 5EYXA 4NO4A 1JTCA 2WLQA 2P37A 1JT3A 4LBQA 5BQUA 1JYCA 3AP4A 1N3PA 3IPVB 1V6MA 3AP7A 2YZ4A 2ET2A 2VLCA 4EFPA 2RQ9A 2DYCA 4DEPA 1XHBA 2A3XA 4GKYA 5DZGA 3AJZA 2ZABA 3SH4A 4ZLBB 3I2AA 1FNYA 1NXD1 4BMBA 3IPVA 5F8SA 4P0JA 1LCLA 3PHZA 3DGTA 4J23B 3L2YA 4WVVA 4OUJA 3RMXA 5GAQA 1LHOA 3USUB 3QCWA 3B9UA 2AAIB 3HOMA 5D62A 1WUVA 1SCSA 3OGFA 2NVHA 4GWMA 2D1ZA 4H55A 2P3IA 4DPNA 3WG4A 2KI6B 4R9BA 4YZ4A 1JUIA 4KC3A 5JOYA 2GDFA 3UJ4A 3LCPA 1ISXA 4GA9A 4X39A 1SFYA 2H0BA 1RMLA 3Q7WA 3WHUA 2ZGSA 4XFSA 1YXWA 4UW6A 3SITA 1GNHA 5H9RA 1F31A 4YLZA 5DZEA 3UDAA 4K1YA 3WDTA 4ISQA 2PHTA 5DUWA 3BAHA 2F2FA 1GZCA 3WO4A 2F8XC 4Y20B 3O4AA 2D3SA 4LO7C 3T8SA 3BOPA 1UPSA 5IK4A 4JAWA 2W39A 2ESUA 5JDBA 4ZFYB 2C9AA 4PQ9A 3WZ1A 3WMVA 4FQ4A 2ZHKA 3UJQA 1JW6A 3OGGA 1V6LA 1LGCA 4XHXA 6I1BA 1WBAA 4Y20A 4YGBA 5HCBA 2D7RA 4XKIA 1XG6A 4XXPA 2D6OX 1FATA 2ZA9A 4XYXA 2IWTB 4XBNA 2GN3A 2D3RA 5FZZA 1YBIA 2YROA 1ISVA 2JDZA 4IQPA 1IILA 1N1TA 1AF9A 4C1XA 4YFZA 3Q9OA 1AVAC 5IK8A 5HPZA 2ZGUA 1A3KA 1HWOB 1UL9A 3BRDA 1Z0HA 4LO1A 4M3CF 4DS0A 4HL0A 1TFMB 3VEQA 1AXYA 3WOGA 1Q04A 2PHRA 3UJ0A 1K5VA 1GZ9A 1FMMS 3OJVA 4LO2A 5DUYA 5FNXA 1NZKA 2RHPA 4YZ2A 2WBCA 2ARXA 4EKXB 3ZC8A 2GO2A 2EIGA 1O4YA 5BOWA 4G6JA 2HWAA 4M01A 1FWUA 1Q8VA 1GYKA 2ERMA 1LEDA 5IT6A 2XOAA 5F5QA 3FJ9A 2ZACA 1DGLA 2CYFA 5EG6C 2ZGPA 1LOFC 5DG1A 5JVVA 3TB0A 4LBQD 1KDMA 3LSEA 1G9AA 2AH2A 2GZBA 1W6MB 2ZAAA 3QLQA 3RTJB 1WCSA 1SLBA 5GALA 1LEMA 3UK9A 3IAGC 1L2HA 4QKRA 1UAIA 1W6OB 1FGAA 4YGEA 5BQUC 1Q8OA 2WSVA 1W6MA 3RMYA 1HDKA 4QBCA 1YTOA 2EAKA 1SBEA 3VSFA 3GALA 3WVJA 3F62B 3T1MA 3NBNA 4R9DA 2FO1A 1LTEA 2G4IA 3AXDA 3VKOA 3ZYRA 1RITA 2DTWA 1JBCA 4U2AA 4WVWA 4DQAA 3SISA 1TWMA 1SR4A 1MS8A 2OUJA 4C1WA 3CA0A 1JN2P 4FPYA 3UJOA 1BJQA 3FUOA 1YO8A 3OJBA 1APNA 2EXKA 2A3YA 3NBEA 4EFRA 1V6UA 1W0PA 2ZHMA 1SLLA 2V73A 5DXDA 1EYLA 1SCRA 2YMZA 2ZGNA 2EF6A 31BIA 3I4IA 1KRIA 2P23A 3WDUA 3O5SA 2VW2A 1VALA 2DUOA 1HCDA 1FWVA 2DUPA 1GSLA 1CVNA 1MC9A 1C4RA 2WRYA 5L73A 1U0AA 4XIOA 1QNWA 2F2FC 1W6QA 1UZYA 3A21A 3PUBA 3P53A 3LSDA 1D0HA 1ISWA 3FJHA 1PUMB 2YXSA 1WW7A 1FV3A 1IJTA 1MS4A 1WBFA 3ATGA 3O12A 5IUQA 3OBTA 1YIFA 5GLUA 3U4XA 4DCKC 1MS9A 4R9CA 2JKBA 3PG0A 2AFGA 2C5DA 2ZZJA 4R6UB 2GN7A 2A6XA 3ASIA 4OWKA 3FJAA 2DRYA 1S0DA 3IM0A 4XHBA 2VU9A 1E0OA 3BIWE 1IOAA 1V6OA 1WLCA 1OQLB 1S0IA 1CPMA 3D6EA 3FJIA 4FGFA 1S1AA 3SH3A 3H0OA 4Q1PA 3CA1A 4XJAA 1ULGA 2RG9B 4LO1C 1PC8B 4XBQA 3RG0A 2VW0A 1QNYA 3AZXA 1H9PA 1C57A 4LO2C 4D69A 4F34A 1UMZA 1IOBA 1M16A 1V6XA 5KXEA 4TYSA 4L4HA 4UW3A 3CRHA 4ZFWB 3S8KA 5DZFA 4J2XA 2ZGQA 4BMEA 4YZ3A 4GKXA 4JKQA 2ZBJA 4CTEA 2P3JA 2SBAA 3OY8A 2R1DA 3WLUA 3WUCA 2AGSA 4J2KA 2ARBA 3BA7A 5JOWA 5JMCA 2IHOA 2KH2A 1N4KA 3VSZA 3FLPA 2DV9A 5F8WA 5H9QA 4YW5A 3OYWA 4LBKA 4KEJA 4I4PA 3PVEA 1WW6A 2OW4A 2DU0A 3FUQA 1DHKB 1QGLA 2ZGOA 4K20A 1FYUA 4M00A 1MS0A 2GMPA 2Q3NB 2QYIB 4FOQA 1PWAA 3WINA 1BLDA 5BXTA 2DTYA 3ZSLA 3A0NA 4BLJA 1HWMB 1BFFA 3NV4A 1KDKA 4XJ8A 3KMVA 1DFQA 4ATEA 2D6MA 1YRZA 4LO3A 2UUSA 4Z9WB 3FJFA 3V0BB 3WV6A 2A70A 1IT0A 2PELA 4YM0A 2PHWA 3E8LC 5T55A 1AJKA 1S0JA 2ZGMA 5T5LA 3H6RA 4IY8A 2ZGTA 4YG0A 5E8AA 4PF5A 1S0EA 1RINA 1DJSB 1G7YA 3WA1A 3AXEA 2LIEA 4GOYA 2D23A 5GLZA 4XXAA 5HCFA 1H30A 1ENSA 1Q03A 4M3CE 4FPEA 2AQZA 2LTNA 2NMNA 1TTUA 3POWA 3ZXLA 1JYIA 4LO8B 3NWKA 1LULA 5I1BA 2D6KA 3ZVXA 2D7FA 5E89A 1CQ9A 3AYEA 1Y7BA 1HCEA 3ILFA 3UD9A 1GZWB 3AZWA 1JQZA 1N1SA 3B3QE 1JHNA 4FVVA 3FJCA 3JU9A 3CA6A 1LOAA 4LO0A 2HZ9A 1OKQA 1GANA 1N3OA 2VSEA 5CNAA 4H9WA 4Z8BA 3EF2A 2E4MA 1HIBA 4I4SA 3AYDA 1GZWA 2P2KA 4Y1ZA 5DG2A 4I6IA 1TEIA 4M3CB 4NOTA 2OVUA 2R0FA 1DYKA 3RRDA 3WUDA 2E7TA 1AFCA 3HR9A 3IKWA 3CQAA 3USUA 3VT1A 3Q7YA 1DZCA 4LBLA 4XIKA 4M3CA 1G8WA 3LLPA 4BLIA 2VXRA 5T50A 1ULCA 1SBDA 21BIA 1Q8PA 2NN8A 3JRRA 4G9MA 4DFSA 5BVPI 2ZMLA 3VKLA 3GNEA 4WV8A 4HJJA 3S8JA 1AXKA 3ZXEA 4Q26A 4IONA 3CU1B 4CRQA 3WDYA 3FJEA 3KM5A 3M3QA 5T52A 3V65A 4I4XA 5F90A 5GLWA 1BYHA 1H9WA 1A78A 1GGPB 2BEBA 4IHZA 1CN1A 5SV8A 3VKNA 1Q8SA 4ZBVB 2ZGKA 2DVDA 3PJQA 1V6VA 9ILBA 1WW5A 2NYYA 3OPZA 5CA6A 2MIBA 2Z49A 1ONAA 1QDCA 1P63A 1F5FA 2R0HA 4Q8KA 2A6VA 3V0AB 4I7IA 1MS1A 3INAA 1LOEA 2KI4A 5E24E 4F83A 1Q1UA 4D0TA 2QN4A 5GZFA 2K4AB 3A23A 1KITA 2WSUA 2AUYA 3M3EA 1GLHA 5DUUA 5CAZA 4OW4A 3JUUA 2BQPA 2W52A 2W68A 3BAVA 3H6SE 1V6KA 1V6JA 1R1ZA 3O0XA 5GLVA 2CWMA 4SLIA 1BFCA 3WINC 3WG1A 3B01A 2E6VA 4USPA 2NP0A 1PUUB 1NLSA 1G82A 2Q9XA 4BOWA 1BZWA 3HBWA 3O4BA 1W3FA 4OEFA 3M3CA 4LO3C 2YUGA 1XQNA 4ZXKA 5JOXA 5FZYA 4ASMB 1FAYA 1N47A 1N1YA 1SBFA 1W3AA 2ZQOA 3FJKA 4HR6C 5GM0A 1QOOA 1R8NA 3AYAA 5CBLA 3CA5A 2Y9FA 1I1BA 1VAVA 4JKXB 2GALA 1QF3A 1QQKA 3CAHA 4AGRA 4QD2C 4JC1A 1V6WA 5GJ6A 5GZEA 3Q7XA 3MEPA 3HMYA 1Q56A 1GV9A 1VIWB 5JLVA 1AXZA 2Y9WC 5GLTA 4K21A 2YY1A 3RQ0A 1G9DA 3BAOA 4ENDA 3N7JA 2UWCA 4I4QA 3SNMA 1SLAA 1HKDA 3N36A 1UZZA 2VUAA 3MW3A 1J1TA 2DURA 2LALA 2A7AA 1FMZA 1W6OA 1EVTA 1MACA 4USOA 3ZPYA 5IK5A 3F1RA 5T5PA 4Q9GA 4YG3A 2JJ6A 3N7MA 4LO0C 4HANA 4FPOB 4AYUA 1TOOA 4GP0A 1WD3A 3AYCA 1YYNA 3WDXA 4AVVA 5EHAA 3CA3A 1CVSA 1HKNA 4LBJA 4AWDA 2K43A 4A7YA 2FFVA 3D4KA 1HWNB 1WD4A 3O4CA 3MPPG 1GBGA 3SH5A 2EALA 1QKQA 2WQZC 3V79C 1LOGA 4FPFA 2UURA 3AJ5A 1IS6A 2D20A 2JD4A 1II4A 3BADA 4Y1YA 1BKZA 3VV1A 4AGVA 4JRAA 4I1EA 3RS6A 4Y22B 1ILR1 4I96A 1VLNA 4ATFA 3P6IA 4XOGA 4IY9A 4KEKA 3IIRA 1CIWA 4YGDA 1MR5A 3AP9A 1AVUA 4AN6A 3A22A 3R4UA 1T4QA 1JY0A 8I1BA 2P34A 1AVWB 1MS3A 3FJDA 1LECA 1WW4A 3D7WB 4YFWA 2BFHA 3TC2A 4QO3A 3UL2A 4R9AA 4J2YA 2RSTA 4XTPA 2CWSA 3VT0A 1ULDA 1ISYA 2HYKA 1XZZA 4A7KA 1LGBA 4FP2A 1AJOA 2EXIA 3ENRA 1CE7B 3OJ2A 5EYYA 3ILRA 1FX5A 3QR5A 4TLPA 3AZVA 3POSA 1XYFA 4I4YA 4Y1XA 5DUVA 2KKIA 4P14A 1LGNA 1V00A 5EWSA 2WT2A 3WO3A 4X38A 3FGMA 5FREA 2DU1A 4LBMA 4XZPA 3O3QA 3NBCA 4EFQA 4BQ1A 1KQRA 3T2TA 1OQ1A 2HW9A 3C9ZA 1HQWA 4LO7B 4PCRA 2PHUA 1IRPA 5FZUA 4FP3A 4Q1RA 4QKSA 3AKFA 4CJMA 4TZDA 1RG8A 4YW3A 1ABRB 4IZEA 2VXTI 1QOTA 2A6WA 1UX6A 1C1FA 3WG3A 3VWCA 5BYNA 2ZGLA 4XJUA 2MLLB 2WJSA 4WZFA 1HLCA 3O4DA 5H9PA 2ZMNA 4AVTA 4XJWA 1JXNA 2A75A 4P9WA 2E7QA 3IMNA 3BAUA 1IKQA 2A5ZA 5LK5A 4I8MA 1IS5A 1KJLA 2A3WA 3M1HA 2D24A 3W58A 3ZXFA 4K1ZA 2WT0A 2ZGRA 3TAYA 2D6LX 2AXMA 4XDQA 3ZXDA 2EXJA 4FOYA 4YM1A 1W6PB 4PC4A 1URXA 4YZ5A 1CR7A 5T5JA 2TEPA 1R8OA 1G9BA 3OBRA 1SR4C 1S0CA 1DQ6A 2HWMA 3SLIA 1LOBA 4XTMA 1VCLA 3C2UA 3HALA 4AGGA 3O49A 4JPZA 3WDWA 3AFKA 4FPCA 3AJ6A 3B9CA 1EPWA 2NZ9A 5GZGA 4XJ9A 3BAGA 3MW2A 1YI7A 3JUTA 3AJYA 2FFUA 5FNWA 4U36A 3V0BA 1SLCA 1RZOB 1CESA 1FN0A 3FLTA 3QYDA 2DVBA 4XMIA 3KQRA 4L4IA 2Y9GA 1Z78A 4P0KA 3W59A 1W0OA 5G00A 4HA2A 4P9YA 4ZFUB 2VSAA 4P6AA 1LENA 1I3HA 1DQ1A 3ZXJA 1WLWA 2NTDA 3N7LA 3WG2A 1FV2A 3BAQA 4MYEA 4L8QA 4FQZA 1DZDA 3ZYPA 1DBNA 2AENA 4I0YA 3LTQA 3A07A 5BP5A 4GALA 2JE7A 4RL7A 5DVHA 1W6NB 1DFCA 4DRVA 1DQ5A 1A8DA 3A4UA 3ZSMA 2Q5TA 1QDOA 3WCRA 5DUXA 3K1XA 4XFTA 2A6ZA 4YW4A 4I4UA 5E88A 1S0FA 1AX1A 4Y1UA 1W6NA 4GP3A 3PVOA 4YOLA 3M3OA 3UD8A 3CRGA 1QOSA 2UU8A 4JP0A 3P6JA 3AP5A 1KJRA 1TIEA 1JLYA 2A6YA 4OEEA 1IKPA 1G9FA 1DLLA 5GZDA 3BA4A 1LOCA 1GKBA 1X50A 4H04A 2DVAA 1UKGA 3O4OA 3IN9A 2D43A 2E51A 1PZ7A 2D3PA 3FFZA 3A0KA 2YV8A 3NJ5A 1AZDA 3N3HA 2ZQNA 1BARA 1NUNA 2SLIA 3AK0A 3NV1A 1F9KA 3AH1A 2DVGA 3D5OA 1OFSA 2WT1A 5JOZA 4G6MA 1CJPA 4Q27A 4KEIA 1QXMA 2GMEA 4ZGRB 1BA7A 5BXPA 1BFBA 2D7IA 3R05A 3OJMA 2KM2A 3N0KA 2X2SA 1S0GA 2FHRA 4FPJA 2DRZA 1G9CA 3V0AA 2L5XA 1JOJA 1O4ZA 4Q91A 1DZQA 4IZXA 2ES3A 1LU1A 2XB6C 5IK7A 4OEGA 2CNAA 2K8RA 4QC4A 4BM8A 4OZXA 1LHNA 3N7KA 2D44A 41BIA 3UD7A 3FJBA 3ZX7A 2JECA 2AREA 3RSJA 1AX2A 1IS4A 3BODA 4JCKA 4XBLA 2VH9A 4D8HA 4ISRA 1Z4SA 4PBOA 4GAIA 4DRRA 3O5WB 3BRFA 1J0SA 2E53A 2GNDA 4I4OA 1D2SA 1IRAX 1KNMA 3NBDA 1UN1A 3B00A 5H9SA 2NM1A 4ZOTA 2X2TA 3IM5A 1DQGA 1AVXB 2EXHA 3WNXA 3FJ8A 2AR6A 1HQLA 4Y26A 3WCSA 4BPZA 1MZ5A 1AVBA 3APBA 2VW1A 4QBVA 3BA5A 2P3KA 2CTVA 1EV2A 3ZSJA 3FJJA 2I2SA 2ZHLA 3AKGA 2DS0A 3AH2A 5DSSB 3T1LA 7I1BA 4CZSA 3WO2A 1DYPA 2GNTA 1IHKA 3O0VA 4X37A 2M49A 2PHXA 4YW2A 3HN1A 2V5YA 5BXSA 3PVNA 2DUQA 1QU0A 1MZ6A 2CL2A 4I4RA 4GWNA 4GXLA 1ITBA 2FGFA 2XG3A 4ZA3B 5D61A 4OWLA 1DQ4A 1HWPB 5BP5C 2E4MC 2KLLA 1V6NA 5DZUA 1DQ0A 1QMJA 1FQ9A 4YGCA 3AKIA 4EB2B 2WKKA 4A7ZA 4J2SA 5GZCA 1WBLA 3DUIA 4XE9A 3POKA 2GNBA 4LBOA 4EEEB 1N1VA 4GOVA 3WMUA 1LJ7A 1MVEA 4G1RA 2ZKNA 2JE9A 4I1BA 1I1EA 4FPLA 2VY0A 5CB7A 3AX4A 2R16A 3I29B 1G86A 3WHTA 4YW1A 1VAMA 4W65A 5HCAA 3AZYA 3AZZA 2J3PA 1BFGA 2OUHA 3WDVA 1B09A 4XJZA 1K5UA 3ZXKA 1JLXA 2WNEA 1N3QA 1W6QB 4Y1VA 3PMEA 4X3AA 3M2MA 2R9KB 2NMOA 1BASA 2D6NA 3CRIA 4Y22A 1JT7A 2Z48A 4YZ1A 1W3GA 3POYA 1RIRA 4FPHA 4Y24A 4P9XA 2W08A 5EXOA 3VT2A 3AP6A 2FMDA 3ZXGA 4PBPA 3W9TA 1TP0A 1LHUA 3BTAA 3NV3A 3ILNA 4YG6A 1S0LA 2ENRA 1ZA4A 4YM2A 2UWAA 1MVQA 3MW4A 4FOVA 3MALA 1T9FA 1DQOA 4XILA 4I37A 3BX1C 5T5OA 3ILAA 4I30A 1PZZA 4Q2FA 2P39A 1WLDA 4I3NA 3AKHA 5FRAA 5EC5A 4FPKA 2I1BA 4UW4A 4UW5A 5T54A 3IM7A 2ZR1B 1LHVA 4G9NA 1GNZA 1ISZA 3I8TA 3SNVA 3N35A 3B69A 1BQPA 1SZ6B 2CY6A 3HSMA 2LIQA 5KXDA 1WBCA 3ZC9A 3I2XA 1ENRA 2R49A 4I4VA 1JT5A 3AH4A 1ZM1A 3H6QA 2DWRA 3RTIB 3OY8B 1ONKB 1S0BA 4KBBA 3CNAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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