1DIWA

The hc fragment of tetanus toxin complexed with galactose
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNEESEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TETANUS TOXIN HC
molecule tags Toxin
source organism Clostridium tetani
total genus 110
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1diwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1diwA02
1FNYA 1W6MB 1UL9A 3PVOA 4GAFA 2VXTI 4YW5A 1M2TB 3QCWA 1MS9A 1Y7BA 3AKFA 2P3KA 2VH9A 3ZYRA 1FAYA 5D61A 1YRZA 3IAGC 2WSVA 2UURA 3BRGC 1BFCA 2DVDA 3ZXEA 4PQ9A 5GZFA 2A6XA 1EPWA 3RMXA 4DENA 3MW4A 1LGNA 4G9MA 3PHZA 4FP2A 2A3WA 2DVGA 3ILAA 2ZHNA 1DYKA 1LECA 2D6OX 2WT2A 1ISWA 3RG0A 1MZ6A 3UL2A 1C4RA 2XB6C 4FQ4A 1V6WA 3WG3A 2WSUA 3OJVA 2PELA 3IN9A 4YGCA 1QOTA 1LOBA 4JPZA 4ZFYB 4XYXA 4H04A 4DPNA 4G6JA 4YZ1A 4JC1A 2J3PA 5FNXA 1XZZA 2D3PA 3M3QA 4G9NA 1LODA 2EAKA 2D6NA 5KXCA 3I29B 4GWNA 4JRAA 2PHWA 4XE9A 1KJRA 5JOXA 4AGGA 1DQOA 4FOWA 2HW9A 2LALA 5LK5A 4YM1A 4I96A 3VKNA 2EXHA 4L4HA 1TIEA 1Q56A 3WA1A 5BXPA 4AYUA 2AQZA 5FRAA 3LTQA 2VU9A 2DUOA 2Q5TA 4C1XA 1BLDA 1GZWB 1PZ7A 4FPLA 3BAUA 4R6UB 2D6LX 1RZOB 3M3OA 4TLPA 3CU1B 4I4XA 3L2YA 2LTNA 4FPCA 1HWOB 5T5JA 4XFSA 3POSA 4QBCA 3SH4A 1CN1A 1HQLA 2AUYA 1EVTA 4QO3A 2ZGQA 2P34A 1LJ7A 3VSZA 1F31A 3QR5A 2KKIA 1LGCA 3V0AA 1LOEA 2DRYA 1EV2A 2GN7A 1Z2VA 2R49A 1RG8A 1BA7A 3AP5A 4EFQA 3B00A 3UJ4A 3W58A 4FPKA 1SFYA 1KDKA 3UDAA 4GP0A 2GMPA 1Z78A 3CA1A 1NLSA 3A22A 4PF5A 1Q8PA 2X2SA 1SCRA 4KBBA 3S8KA 2W39A 5HCFA 2DU0A 1MS3A 2VSEA 3ZX7A 5KXEA 2E51A 1V6MA 4LBMA 3SNVA 4I3NA 4D8HA 1YXWA 4M3CF 1LESA 3H6RA 6I1BA 4L4IA 1D0HA 2DV9A 1CQ9A 4LO2A 2VW2A 2EXKA 1GZCA 3AP6A 1RY7A 2QYIB 1SR4A 3NJ5A 1HWPB 4WV8A 1LULA 3AFKA 4PC4A 3BX1C 4FPHA 1FWVA 2NVHA 5GLVA 4P9YA 1LHNA 3USUB 3WZ1A 2RHPA 1DQ6A 3B01A 1AXYA 3A0KA 2ZABA 5GLUA 2ZHLA 3CAHA 4XXPA 1M16A 2FFUA 4FOQA 4LO1C 1S0LA 3INAA 3OYWA 3ASIA 3OBRA 1AF9A 1ZM1A 1DQGA 1JT7A 1UZYA 5JMCA 3W59A 1AXZA 1CR7A 1O4ZA 2ERFA 3DGTA 4Q9GA 1LOCA 1FX5A 4XHXA 2DREA 3CA5A 1W0PA 2RSTA 4R9BA 4EKXB 4NO4A 1R8OA 1W6MA 1AVBA 4DEPA 3V64A 4RL7A 4XJZA 2PHTA 1DQ2A 4Y20B 1N47A 2NP0A 3IM0A 1JLYA 3O44A 1DZCA 5GLWA 3FJEA 1YF8B 1XHBA 1LTEA 3WDVA 2FDBM 3VT1A 2UU8A 2Z48A 1OKQA 2WLQA 2SBAA 4XMIA 1RITA 3KM5A 4YZ5A 1S0IA 4BMBA 1DIWA 1QNWA 2NN8A 4X39A 3Q7XA 4DS0A 2RQ9A 1H30A 3VT0A 1G8WA 5IK4A 4TZDA 4XIOA 2WJSA 4BOWA 5BQUA 4ZOTA 1MS1A 4D0TA 4DCKC 3O49A 1LOFC 1S0GA 4NOTA 3WOGA 4QD2B 3V0BB 2D6KA 2V73A 4K1ZA 3O4OA 3WDTA 4YW1A 1SLTA 3HR9A 3N36A 2NZ9A 4FPJA 2R1BA 4R9CA 1DFCA 2CNAA 4DQAA 4IZXA 2ZMNA 1DZQA 3W9TA 1VIWB 1AXKA 1FNZA 1DFQA 4Q27A 3WDWA 4I4VA 4JP0A 1JLXA 2UWCA 4UW6A 2MLLB 4YZ2A 2YV8A 3IM5A 3T8SA 3FJHA 4J2KA 4I30A 2LIQA 1T9FA 3AP4A 3PVEA 1IHKA 2Y9WC 2EXJA 4Y1YA 4BMEA 4I4QA 4I4OA 4YZ3A 2PHRA 4YM2A 4FPEA 2ZKNA 3VT2A 2FGFA 2B7YA 3TAYA 1V6NA 4D0ZA 1YI7A 4LO3A 1GZWA 1UZZA 4XTPA 2CYFA 1LENA 1GSLA 2I2SA 5BP5C 2ZMKA 4X37A 5DUWA 3O4AA 2P3JA 1HCEA 3VUOA 1N3PA 1IS3A 4W65A 1BQPA 9ILBA 3AZVA 3WMUA 3IIRA 4QALA 1LHUA 1LU1A 4QD2C 5FZYA 5GZCA 3VKOA 4GWMA 1AVUA 2Q9XA 4IYBA 2Y9FA 1S0BA 3HALA 2E6VA 4H9WA 5F9TA 1BFGA 1KNMA 5DZEA 1QU0A 5CB7A 1HWMB 2LIEA 3Q7WA 1N1SA 2JDZA 4ZLBB 5JLVA 1ISZA 5FREA 3V79C 3LSDA 4YZ4A 4A7ZA 1PZ9A 4YW2A 2EIGA 1PZ8A 2CTVA 4A7KA 1WLDA 5E8AA 2PHFA 2AREA 5EG6C 4OEEA 1V6JA 5BXSA 3FJBA 1N1TA 1ULCA 2WNEA 1YTOA 2UUSA 5GALA 3IM7A 1HQWA 3B9CA 1LOAA 2GZBA 5GM0A 4BM8A 3NV1A 3BTAA 4Y1VA 2VW1A 2EF6A 1U0AA 2R0FA 1MS0A 2NYYA 3UK9A 1JYIA 3IKWA 1QOOA 5H9RA 3E8LC 1JOJA 2R0HA 3D7WB 3AH1A 3POWA 3USUA 4QKRA 1LOFA 1F9KA 1MD6A 5E88A 2NMOA 1HWNB 2D43A 4ATEA 4QC4A 1R1ZA 2CL2A 2P39A 3WUDA 4F34A 3WCRA 3RRDA 5CAZA 3F1RA 1MS8A 3ZC8A 5H9QA 3AH2A 4PCRA 4XILA 4EB2B 4ZGRB 4ZXKA 2WT0A 5CBLA 3P6JA 1S0JA 3CA6A 2D7IA 2ZBJA 3VKMA 2EXIA 3T1MA 3WO3A 5JOWA 5JDBA 1H9PA 1SACA 5T5LA 3BB2A 4LBNA 4J2SA 2A71A 3FJKA 2FFVA 3RTJB 3O0XA 4RA0A 4JKXB 2DURA 2A3YA 3NBCA 3IM6A 4YW4A 1AVWB 1BXHA 1A78A 3LCPA 4JAWA 1S0DA 1NZKA 3GALA 3N7MA 3RQ0A 3AYCA 3AJZA 2F8XC 5IK7A 3B9UA 5EXOA 3V0BA 4OEGA 4M3CB 2A5ZA 1CIWA 2D23A 1BASA 3ZXLA 2YROA 1MZ5A 5IUQA 4I4PA 1FYUA 4LBKA 4J2XA 1N3OA 3OY8B 3OPZA 1TOOA 5T52A 2YXSA 4ZFUB 3FJ8A 1UN1A 1JN2P 2ES3A 1QGLA 3R4SA 1SLCA 5E89A 5T5PA 1YYNA 3NV2A 2A6YA 4WVVA 4GKYA 1W3AA 1FMZA 4FGFA 4P0LA 2UWAA 4ASMB 4FPOB 1HIBA 1YBIA 2ARBA 4P9XA 4TYSA 3OJ2A 4EFPA 4CJMA 5EYYA 3HOMA 5BXTA 3BAGA 1BARA 2WKKA 1X50A 3U4XA 4I4UA 1AXMA 4CZSA 3BODA 3PVNA 2K4AB 1S0EA 3FLRA 1BFFA 3HSMA 1IS4A 2ZGSA 1GLHA 4XBNA 3HN1A 4Y26A 2DU1A 3ZYPA 3AKGA 1G82A 4Q9PA 5CNAA 4GOYA 5T54A 3AZXA 5JOZA 2H0BA 3H6SE 1ENQA 2NTDA 4Q1RA 4XFTA 3ILFA 3FJFA 4WBCA 1J0SA 3M2MA 3FLTA 1DQ5A 1O4YA 3ZXFA 4HJJA 3O12A 3AZWA 3WINC 3FFZA 4QKSA 2BEAA 1AX2A 3AP7A 4MYEA 1QQLA 4YLZA 2ZGNA 2D6PA 4I4RA 2XOAA 3QYDA 2ZAAA 4I4SA 5H9PA 3POKA 4XIKA 1YIFA 4OEFA 4XBQA 5DZUA 4LO0C 4EFRA 4AGRA 1IILA 2W08A 1MR5A 1XG6A 5DXDA 2JKBA 2YY1A 2BEBA 1ABRB 4P14A 4DRVA 1WBCA 2D3RA 1WD3A 1VAMA 4Q26A 1AX1A 3D5OA 5EYXA 4C1WA 4X3AA 2KM2A 3IPVB 3N7KA 3AXDA 4Y1ZA 3K1XA 3PJQA 3A07A 1QKQA 1DYPA 3WDXA 2DTYA 3AK0A 5L73A 1G9FA 2F2FC 1BYHA 4HL0A 1HCDA 1CONA 1BJQA 4UW4A 1V6IA 3C2UA 3SH3A 2A6ZA 1G9CA 3BIWE 1W6QB 1I3HA 1UPSA 2ZA9A 3I2AA 2GNMA 3MPPG 4YFZA 1IRAX 3FJIA 3NWKA 21BIA 1WLCA 1OQ1A 1AX0A 5JOYA 2WT1A 4Y24A 1ISVA 4IONA 3OBTA 5DSSB 5IK8A 3ZXDA 4XJ8A 1DQ1A 3IMNA 2AENA 4USOA 4Q91A 1ULGA 2ZACA 2K43A 4GA9A 3JRRA 1QMJA 3FLPA 4Q2FA 1WW7A 1Q8QA 2ZGLA 2OW4A 4Q8KA 5GZGA 31BIA 4D69A 3D4KA 3SH5A 1ENSA 4L8QA 2GMEA 2E4MC 1W6NB 1IKPA 1IS5A 1EYLA 1S0FA 3ILNA 4FQZA 4YGEA 4KEJA 3AJ5A 1V6OA 3MW2A 5T50A 1Z4SA 2Y9GA 2TEPA 1BFBA 2UWBA 1ONAA 2R16A 4ZA3B 1SLBA 2GNTA 4M3CE 3AZYA 4M3CA 2IHOA 3CA3A 1FWUA 3BA4A 2WBCA 3FJCA 5H9SA 1OFSA 1JXNA 3AJ6A 4KC3A 2WQZC 3FJ9A 2DRZA 3BAVA 4Y1UA 2ZGOA 1ULDA 4XZPA 1RIRA 3OY8A 4XHBA 4P6AA 4PBPA 5JVVA 1G7YA 1ITBA 4AN6A 2JE9A 4FPGA 5IK5A 5BYNA 1TFMB 3WINA 1CJPA 3WCSA 3CQAA 2DVAA 3PG0A 5GLTA 1URXA 2AYHA 1XYFA 4Z8SB 5F8WA 3FBYA 2D7FA 2ET2A 3AX4A 4J23B 3WNXA 5T55A 1CVNA 1Q1UA 2VSAA 3H6QA 4LO0A 4AWDA 5EWSA 3KMVA 1PWAA 1GGPB 3M3EA 3KQRA 3ENRA 1G9AA 2GDFA 3B3QE 5F8SA 4AVVA 2ERMA 2JE7A 2KI6B 2Q3NB 4II0A 3A4UA 1W6PB 2BQPA 3WG1A 2A6VA 1OQLB 1MC9A 1IS6A 4DFSA 3AZZA 4XJWA 3ZPYA 5F5QA 1PUUB 3CRGA 3S8JA 4LO1A 2A75A 2E7QA 1ULFA 4AVSA 2F2FA 2ARXA 1I1BA 3I4IA 1GNZA 4IY8A 3VSFA 2OUJA 3UD8A 2A70A 1FATA 1MS4A 4GXLA 1AVXB 1E0OA 2M49A 1LEMA 3BRFA 1GV9A 4A7YA 3O0WA 5HCBA 5HPZA 2GALA 2E53A 5F8YA 3FUQA 1LCLA 5DZFA 1L2HA 3C9ZA 3TB0A 2YZ4A 4YM3A 2ZQNA 7I1BA 1CVSA 4OWLA 4XJUA 3F62B 4ENDA 4M01A 5DG2A 1JBCA 4AVTA 8I1BA 1AFCA 1WBLA 3BA5A 1MACA 2DWRA 1VCLA 1LHVA 1TTUA 3UJ0A 1V6UA 4I8MA 1WCSA 1ENRA 2P23A 1C1LA 2KLLA 4IY9A 3M1HA 2W68A 4YGDA 3UJQA 2Y9XE 3O5SA 3IPVA 1R8NA 4LO8B 3O5WB 4YG3A 1LOGA 1QF3A 3FJDA 5IT6A 3Q7YA 4U36A 3QLQA 4FOVA 5E24E 1Q03A 4XMAA 4M00A 1GICA 1QQKA 4XJ9A 5GJ6A 4ZBVB 4YFWA 4I4YA 3WLUA 5BXRA 1G86A 4OW4A 5T5OA 4FVVA 3WDUA 1W6QA 4G6MA 1YO8A 1V6XA 1LGBA 5FNWA 2ENRA 5D62A 1HKNA 1S1AA 2MIBA 3A0NA 4AN7B 4Y20A 1TEIA 1CPNA 2D3SA 3WHUA 2IWTB 1BLAA 4IZEA 2XG3A 2HWMA 3NV4A 1BZWA 3WUCA 3MW3A 1PC8B 3H0OA 1CESA 4LBLA 4LO2C 4K20A 2CY6A 1N1YA 4ISRA 3V65A 3VKFC 1V00A 1SR4C 4HA2A 2P3IA 5BP5A 4GKXA 4ZFWB 3FUOA 2FO1A 4X38A 1RMLA 1IT0A 1W6NA 3M3CA 4R9DA 3SISA 4AGVA 1UMZA 2AAIB 4KEKA 3BA7A 3OGFA 1SBFA 2ZR1B 2ZHMA 4ITCA 3UD9A 4XTMA 4Q8LA 4SLIA 1JT3A 4PBOA 4JQ0A 4UW5A 3WMVA 1JHNA 1UKGA 1C57A 1WW5A 3OJMA 4R9AA 4EEEB 4I1BA 3ILRA 3MALA 5F90A 3WG4A 4WVWA 1W3GA 1KITA 1AJOA 1D2SA 1ILR1 2ZQOA 4P9WA 1QDOA 1SBDA 2D6MA 3WHTA 2D24A 4YGBA 4P0JA 1SLAA 1MS5A 1DQ4A 2DTWA 4LO7B 3O3QA 2DYCA 2JJ6A 4LBOA 1W0OA 5SV8A 2VLCA 2ESUA 2QN4A 1A3KA 41BIA 4U2AA 3T1LA 4ATFA 2NM1A 1TP0A 3Q9OA 3JUTA 5BQUC 5BOWA 2AXMA 2AFGA 5EHAA 3I2XA 2VW0A 3R4UA 1WBFA 1VAVA 1K5UA 2A6WA 2DVFA 4K1YA 1WW4A 5KXDA 3WV6A 2DUQA 4OWJA 1QXMA 2DVBA 2I1BA 4Z9WB 4I37A 1CE7B 4I1EA 1GBGA 2AR6A 4K21A 1IJTA 1W6PA 5AVAA 3RTIB 4YW3A 5DUXA 5EC5A 1N4KA 1H9WA 2V5YA 2P37A 4F83A 4HR6C 3CRHA 1KDMA 3FJAA 5GZDA 1DZDA 4I0YA 2JECA 1UAIA 2D1ZA 3OGGA 4IHZA 4XFUA 2AGSA 3APBA 1DQ0A 3HBWA 4XDQA 1W6OB 1LU2A 5DG1A 2ZGPA 2C5DA 4CRQA 4LBQB 2GNDA 4LO7C 3HMYA 3T2TA 1C1FA 2KI4A 1GKBA 3WO2A 5HCAA 2G4IA 2DUPA 1IOAA 3BOPA 4I7IA 4LO3C 2A3XA 4Y22B 1F5FA 1AVAC 2ZGRA 3AH4A 4FPYA 1QDCA 1Z0HA 2W52A 3WO4A 2DS0A 1JTCA 1FGAA 1KQRA 2HWAA 1WW6A 1PUMB 3RS6A 3CNAA 1A8DA 3BAHA 3VEQA 1Q04A 5FZZA 3JU9A 1QOSA 4CTEA 5GZEA 1RINA 3EF2A 3ZSKA 4I2SA 3TC2A 1IOBA 4YOLA 2Z49A 1JQZA 4QBVA 1Q8OA 3AKIA 1T4QA 1ULEA 3BAOA 1FV3A 1ISXA 2L5XA 3NV3A 1KJLA 3BRDA 1AZDA 3AXEA 4GAIA 1FN0A 3SITA 1IRPA 2RG9B 2GNBA 4P0KA 1ONKB 3BADA 2CWSA 2C9AA 4H55A 2JD4A 1V6LA 1WD4A 5FZUA 2VUAA 5GLZA 2R1DA 4BLJA 4YG6A 4USPA 2VY0A 4YG0A 3ZXGA 3SNMA 1NXD1 4LBQD 3O4CA 4XBLA 3N0KA 1SLLA 4G1RA 3AYEA 3A21A 2PHXA 3FJJA 1VLNA 5BVPI 3OJBA 2Z42A 3WDYA 1FQ9A 3ZSMA 1JY0A 1AJKA 1V6VA 2KH2A 1JW6A 1WUVA 4GALA 1S0CA 3NBDA 1II4A 3N3HA 3POYA 3FGMA 5DUYA 3LLPA 1MVEA 4JCKA 1G9DA 5DVHA 1N3QA 2FHRA 1WLWA 1SCSA 2X2TA 4JKQA 5KXBA 3ZXKA 4IQPA 2BFHA 1GYKA 1KRIA 3A23A 1N1VA 1GZ9A 3AJYA 2VXRA 2OUHA 2K8RA 4DRRA 3ZSJA 1CPMA 3P6IA 3CA0A 4I6IA 2R9KB 3AYAA 2YUGA 3ATGA 1J1TA 2P2KA 2D7RA 3ZVXA 4FP3A 4BLIA 2ZGKA 3AYDA 1V6KA 4XKIA 3DUIA 2PHUA 4Y1XA 1TWEA 1SLIA 2ZZJA 5DUVA 1MVQA 1WBAA 1B09A 2GO2A 1DGLA 1ZA4A 1JT5A 3WG2A 4HANA 4XJAA 4UW3A 1XQNA 1W3FA 3UD7A 4BQ1A 1HKDA 3P53A 3GNEA 1TWMA 2HZ9A 1HDKA 3ZXJA 3SLIA 5D63A 2ZHKA 1Q8VA 3V0AB 1APNA 1QNYA 3O4BA 2WRYA 1HLCA 1LEDA 2HYKA 2ZGUA 1PZZA 1K5VA 5DUUA 3PMEA 3VKLA 3AKHA 3WVJA 3BAQA 1SBEA 2ZGMA 3B69A 1JYCA 1DBNA 2GN3A 3R05A 4XOGA 1LHWA 3RSJA 4ISQA 1NUNA 4LBJA 3ZC9A 3N7JA 4GOVA 1DHKB 1DLLA 2E7TA 3UJOA 4XXAA 3VWCA 1BKZA 1JT4A 3N35A 2D20A 4WZFA 2AH2A 1W6OA 5CA6A 3NBEA 3N7LA 3D6EA 4ZKTB 3H6RB 2NMNA 3I8TA 1LHOA 4LBQA 3JUUA 5G00A 2GMMA 3RMYA 2ZGTA 4KEIA 1I1EA 5GAQA 2OVUA 5I1BA 1JUIA 4Y22A 1Q8SA 5DZGA 2FMDA 5B2HA 2SLIA 3MEPA 3PUBA 4J2YA 3O4DA 2D22A 2A7AA 3O0VA 4GP3A 4YM0A 3ZSLA 3CRIA 4OUJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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