1DLLA

The hc fragement of tetanus toxin complexed with lactose
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TETANUS TOXIN
molecule tags Toxin
source organism Clostridium tetani
total genus 114
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1dllA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1dllA02
2D7RA 3AZZA 2NMNA 4XMIA 3IM7A 2RHPA 2DURA 2D6OX 4HL0A 1MR5A 3D4KA 2D6LX 3ENRA 3I8TA 4J2YA 4FQ4A 1Q56A 1O4ZA 3O0XA 3FJCA 2A6YA 4Y24A 4YW1A 4ZGRB 4EEEB 1HWNB 2PHWA 1W3FA 2P37A 5DUYA 3ZSKA 2C9AA 2E4MA 4Q9GA 3IMNA 5HPZA 5GZDA 1LHVA 4LBQD 3RS6A 4LO7B 3OJVA 5FZUA 1V6VA 9ILBA 2C5DA 5GZGA 5KXCA 4RA0A 3AP7A 1UX6A 2AXMA 1OFSA 4I3NA 3OGGA 3S8KA 4AGVA 3FJAA 1KQRA 3I2AA 4G9NA 4BOWA 1QDOA 2GALA 3AYAA 1BFBA 2ZGPA 4I4PA 3ZYPA 4FOQA 1W6QB 2A71A 4FPOB 2XG3A 5JOZA 1LEDA 4HR6C 4FP3A 5H9SA 4OEFA 4UW5A 3A4UA 4C1WA 1VALA 4P14A 1MS8A 1LULA 2VXTI 3FJDA 4XIOA 2BFHA 3N3HA 5GZEA 2VW2A 1G7YA 4XBNA 2OUHA 1Q8VA 5GZCA 2WBCA 3BAVA 4USPA 2GNDA 1VCLA 3N7MA 2X2SA 2GNBA 1BFFA 1MS9A 3H6SE 2M49A 4PBPA 5E24E 2D20A 1BZWA 4LO2A 1BFGA 3HOMA 1AXMA 4FPJA 4DRVA 3B01A 4HA2A 2D7IA 3FJBA 3AKGA 1W0OA 2RG9B 3SH5A 5DZEA 4FPCA 1ULEA 5JLVA 1R8OA 3O0WA 4XILA 1WD3A 3CA3A 4XJUA 5EYYA 4XBQA 4YGDA 3OJMA 4GWMA 3AZYA 1P63A 3LTQA 2JJ6A 2Z42A 2F8XC 3AJ6A 3ZXJA 1GKBA 3NV2A 4L4IA 1FMMS 2DUPA 4OZXA 3V0BB 1HKDA 1JXNA 5F8SA 2ZMNA 4I30A 1H9WA 3OJBA 1AVAC 4I37A 3ZXLA 3AH1A 1ULFA 4BMBA 3W59A 4OWKA 1LENA 1LCLA 3ASIA 4NOTA 3PMEA 1GYKA 1AXKA 2GNTA 1XHBA 4KEKA 3ZXGA 1VAVA 1AXZA 2FFUA 4I7IA 1DFQA 4M00A 4Q1PA 4NO4A 1C1FA 3R4SA 3IIRA 1ISWA 3BODA 1PZ8A 3RTIB 5GLWA 3WUDA 3BIWE 3T1MA 1Q1UA 2Y9XE 3RRDA 5GLUA 3QYDA 1BASA 5B2HA 2D22A 4R9AA 1MC9A 3SH4A 5DVHA 4R6UB 1G9FA 3K1XA 4USOA 3VV1A 4JPZA 3OGFA 2XOAA 2CWSA 2AR6A 1VAMA 2CTVA 5F5QA 1ULDA 2Z49A 1PC8B 3JUUA 1GANA 4OUJA 1FX5A 2ZAAA 4FPGA 1U0AA 3AZVA 2A75A 2E4MC 4YM3A 1XYFA 4G9MA 4LBQA 3AX4A 3VWCA 2YV8A 1A78A 1SBEA 3HR9A 2KKIA 3AK0A 4Y22B 1LEMA 2XB6C 4J2SA 5T55A 4OW4A 3MW3A 4K21A 1K5UA 3D5OA 1YO8A 1N3OA 1JYIA 1I3HA 2ES3A 4SLIA 3WG2A 4M3CB 4F83A 4YW2A 5DG2A 2Q9XA 1V6MA 2DRZA 4Q2FA 4CRQA 3FFZA 3PG0A 1H9PA 3PJQA 2MLLB 4BLIA 1PZZA 4YFWA 4P9WA 1JOJA 4WZFA 4EB2B 4Y26A 1RITA 5IUQA 1Q03A 2ET2A 2V5YA 3BX1C 1N4KA 2VXRA 3CRHA 3TAYA 4ZFWB 1AJOA 2VUAA 5JDBA 3BAUA 3NBDA 1GSLA 3CAHA 1GNHA 3FJKA 3CA1A 4I4OA 3GNEA 3VKLA 2VW1A 5T5OA 1ENRA 3RG0A 2AGSA 3M2MA 4ISRA 4AN6A 3VSZA 2ZA9A 2EAKA 1SCSA 4D69A 1CESA 2DREA 5LK5A 4P9YA 1HKNA 3SNVA 1IRPA 4PF5A 3JUTA 2EF6A 5CAZA 3A0NA 5CBLA 4AN7B 3A0KA 3WDWA 3VKNA 4ZLBB 3T8SA 5HCAA 3VSFA 3AZWA 3SISA 1DZCA 4XKIA 2ZBJA 2VW0A 4X38A 1CONA 5CNAA 3OY8A 1SFYA 1LU1A 3AKHA 2R16A 3CU1B 5HCBA 1UL9A 2ZQOA 4XJAA 1YYNA 5FNXA 4HJJA 1V6JA 1CE7B 5T5LA 3SLIA 4PC4A 2Y9FA 3CRIA 3WHUA 5KXDA 2P2KA 3Q7XA 4L4HA 4GXLA 1V6OA 2OW4A 2YZ4A 1DQ1A 3WG4A 4GP3A 3SNMA 3AJ5A 4IY9A 2CL2A 4P0KA 2WLQA 3IAGC 1KNMA 1SZ6B 4FOVA 4FOYA 2ENRA 1Z2VA 1KRIA 1V6KA 2GZBA 1QGLA 4Q91A 3CA5A 3N0KA 5SV8A 5IK8A 3POKA 3VT1A 4FPEA 3ZSMA 3Q7WA 1GBGA 1Z4SA 4XE9A 4LBMA 4ZBVB 2NZ9A 4QALA 4DFSA 1Q8QA 1X50A 1ABRB 2AUYA 5JOWA 2VSAA 1QU0A 3AP6A 1RMLA 2EXHA 3AZXA 3MW4A 2R9KB 1GZWB 3V0AB 1BJQA 1LTEA 4EKXB 2J3PA 2WQZC 5BOWA 4KC3A 1MS0A 1Y7BA 1MVQA 4YM2A 4YZ5A 3USUA 4BM8A 4JP0A 4TYSA 1FWVA 1UMZA 1QOTA 1BXHA 4GAFA 4XMAA 4H04A 3AYCA 3T2TA 5GJ6A 4WBCA 4BMEA 4YW3A 1DYKA 1YTOA 4A7YA 4EFPA 21BIA 5D61A 1CQ9A 2A6WA 4W65A 3IM0A 1BYHA 4DPNA 4Y20A 2JE9A 3WDTA 3CA4A 4DENA 5L73A 4J2KA 1CIWA 4KEJA 1Q8PA 2GMMA 2BQPA 1SLAA 3T1LA 2D6KA 2P34A 3A21A 5IT6A 3BRGC 4Q8KA 4YZ1A 1LHUA 2PHTA 1FNYA 4I4VA 1AXYA 4Y1XA 1FMZA 3AFKA 1V6WA 1S0DA 3IPVB 3FJIA 4LO3A 3V64A 1MS5A 2P3IA 5DXDA 1C1LA 3IM6A 2ZHLA 1NUNA 4UW6A 3FJFA 3JU9A 3UJ0A 5FREA 4AGGA 3LSEA 1YF8B 2WSUA 2MC2A 1SLTA 2E7QA 1N3PA 5F8WA 2WKKA 1ENQA 3O5WB 3O44A 4I96A 4DCKC 1SBFA 4DS0A 1XG6A 1LOAA 2Q3NB 2OVUA 4M3CE 4AGRA 4ASMB 4P0JA 3WO3A 4JRAA 3O5SA 3ZXKA 1QXMA 1MZ5A 1V6XA 2AREA 1F31A 1ONKB 5BQUA 3AH2A 1MS4A 1S0EA 3N7LA 2VU9A 2E7TA 4P9XA 3FBYA 4IQPA 3MPPG 3VT2A 1AVXB 4RL7A 1QNWA 5JMCA 1M2TB 4R9DA 1SLLA 3UK9A 3Q9OA 1S0FA 2R1BA 2DYCA 4X3AA 2D44A 1T4QA 1SR4A 3ILRA 3VT0A 2A6VA 2TEPA 4J23B 5T5PA 2V73A 3OYWB 2GN7A 3HSMA 4MYEA 1W6QA 4JKXB 3N36A 3AKFA 3ZSLA 4Y1UA 1T9FA 4Q27A 1DQOA 5HCFA 5E8AA 2WT2A 2DVBA 3UD7A 4CTEA 1BKZA 3MEPA 2A6ZA 1QOSA 1SLBA 2EXKA 4Z8SB 4YGCA 1AFCA 4D8HA 4FPFA 3N7KA 5T52A 2LALA 3WUCA 1AZDA 5EHAA 5F90A 3H0OA 5FRAA 2OUJA 2GO2A 1DZDA 2GN3A 2JKBA 2ZMKA 2W52A 1V6NA 4R9BA 1G9DA 1EPWA 3WA1A 2D6MA 1DQ2A 1AF9A 2K4AB 2JDZA 4JC1A 1W0PA 1S0LA 4XJ8A 7I1BA 3BA4A 1RIRA 3WOGA 1EYLA 3IN9A 3FLRA 4XXAA 2G4IA 3WNXA 4K1YA 2AFGA 4IZXA 4A7KA 1LESA 3O0VA 1RINA 1N1SA 2AQZA 4XJWA 2GMEA 4PBOA 2DRYA 3ZXDA 2P3JA 1W6PB 1V6IA 3ZPYA 4ZOTA 4D0TA 2K8RA 1MS3A 3B69A 3FUQA 2VSEA 1FATA 1ZM1A 1JT5A 2VH9A 1J1TA 3AH4A 3WCRA 1WBCA 2ZGSA 2BEAA 1ISYA 4YOLA 2NM1A 1LECA 4OEGA 4M3CF 5G00A 4IHZA 1N1VA 4Y1YA 3VKOA 5IK7A 3FGMA 3W58A 1M16A 1JW6A 3H6RB 1FQ9A 3O4OA 1JLYA 2DVGA 1WLCA 4LO3C 1YI7A 3HN1A 5FZYA 2D7FA 3WDYA 4QD2C 4YGEA 2CY6A 1GZ9A 4FVVA 1C57A 2QYIB 2P23A 4ISQA 1MVEA 2NVHA 4FPHA 3PVEA 1GGPB 3B9CA 1HCDA 1W6MA 3WMUA 5DUWA 3RMXA 4QBVA 5CA6A 3M3CA 1CVSA 4YZ4A 4BQ1A 2PHFA 1CVNA 1LHWA 4OWJA 1WW7A 5GALA 1G9CA 1CN1A 4D0ZA 2AENA 4DQAA 5F8YA 3ATGA 3DGTA 5BQUC 4XHXA 1W6NB 1LOGA 4PCRA 5T50A 3WLUA 3WDVA 5I1BA 2JE7A 1EV2A 1PUMB 1WW6A 1TWMA 1E0OA 1GNZA 4I4XA 4LBQB 1FNZA 3KMVA 5DZFA 4XJZA 3PHZA 1JYCA 4AVSA 4WV8A 2YMZA 4ZXKA 4XTMA 4GOYA 4QKRA 1DGLA 4YZ2A 1ITBA 2ZACA 4ZA3B 4XYXA 1VIWB 4LO7C 1LGCA 4J2XA 2RQ9A 3TC2A 3AJZA 2YROA 1I1BA 1SR4C 2R49A 5DSSB 3O4CA 4JAWA 3INAA 4M3CA 3ILAA 2AH2A 4XJ9A 2D6NA 4XTPA 1WBLA 1TOOA 4XDQA 5H9PA 1MD6A 4JKQA 3TB0A 3SH3A 3BA5A 3AP4A 3I2XA 1JTCA 3BAGA 1ONAA 3O12A 3BTAA 1IKPA 1PWAA 3CNAA 1DYPA 1A8DA 3POSA 3VUOA 3AXDA 4IYBA 4I8MA 4I2SA 5BYNA 4WVVA 4G1RA 3PVNA 3OJ2A 5BXRA 2ZGUA 2VY0A 1DIWA 1AX2A 1CPNA 4HANA 4OEEA 4Q1RA 3POYA 3P53A 3ZXEA 3A23A 3U4XA 1LOFA 3ZC9A 2ZKNA 3AXEA 2BEBA 5E89A 2Y9GA 1Q04A 3WCSA 1DQ5A 1WLWA 2EIGA 4YLZA 3AP9A 3NBNA 2R0HA 1AJKA 1KJLA 4YZ3A 3WHTA 3LLPA 1IILA 1W6OA 4EFQA 4XIKA 4IONA 4Q9PA 3S8JA 3ZC8A 4F34A 4YG3A 1HWMB 3CA6A 1IKQA 4P0LA 2JD4A 3AP5A 2FDBM 4ZKTB 4LBLA 3C2UA 2UWAA 2WNEA 3AYEA 3WV6A 5EC5A 4G6MA 4Y1VA 4QC4A 2DUOA 1HWOB 1N1TA 1ULCA 2FFVA 4QO3A 2NMOA 3NV1A 1H30A 5FZZA 4DRRA 5AVAA 2Z48A 1QQKA 4GKYA 4K20A 3NJ5A 2D43A 4ZFUB 1FYUA 4YW5A 1RY7A 1SLIA 1WBFA 2F2FA 2DTYA 3BA7A 4BPZA 4I6IA 3V0AA 5BXSA 1IS5A 4R9CA 4AVTA 2UUSA 3ZXFA 1A3KA 3FJ9A 3AJYA 1URXA 1VLNA 5KXEA 3P6IA 3APBA 4I4SA 4GKXA 3N35A 2UURA 1FV2A 2PHXA 1EVTA 2MIBA 4UW4A 4LBNA 3O4AA 2W39A 3O4BA 1RZOB 1GICA 3HALA 2E6VA 3NBCA 4LO0A 1QMJA 3VKMA 1S0GA 1DQ6A 3BADA 4I4QA 5DUUA 4H9WA 1KDKA 4Y1ZA 2ERMA 3IPVA 1J0SA 2D3PA 1APNA 2NTDA 1LGNA 1PZ9A 3RTJB 3WDXA 4AWDA 4FPKA 1IOBA 3R05A 2ZGLA 2R1DA 2UU8A 2B7YA 1L2HA 1G9BA 1FV3A 2QN4A 1LOEA 1IS3A 1CPMA 1MZ6A 1LHNA 1JBCA 4FPYA 3I29B 3WO4A 2FHRA 6I1BA 3QLQA 2A3XA 2WT0A 2LTNA 1ZA4A 3BRDA 3M3QA 4U36A 4I0YA 3NV3A 4Z8BA 1II4A 3PVOA 3CA0A 3HMYA 1WCSA 3FLPA 1D0HA 4LO8B 4XFUA 4ATEA 1LOFC 3EF2A 1SBDA 4GWNA 3WINA 1O4YA 4Z9WB 2DU0A 3V79C 1BA7A 5JOXA 4BLJA 2DVDA 2ZR1B 1JT4A 3A07A 1NXD1 3UL2A 4H55A 1V6UA 1S0CA 5E88A 2A70A 3UDAA 1B09A 3SITA 4YGBA 2JECA 4AVVA 3WVJA 1ISZA 3WZ1A 2NYYA 2FO1A 4AYUA 2SBAA 3ILNA 1TWEA 1N1YA 3BRFA 3P6JA 1DFCA 1TFMB 3FJJA 3UD9A 2DV9A 1N47A 3DUIA 3OYWA 1DQGA 2ZHNA 1FN0A 1UAIA 3RQ0A 1JLXA 2CYFA 4M01A 3IM5A 2PHUA 4TLPA 1XQNA 1KITA 1G82A 4XOGA 1F5FA 1G86A 3ZSJA 4P6AA 1HCEA 4LO1A 3BB2A 1UZYA 4I4RA 3BAOA 4XHBA 4G6JA 8I1BA 1YIFA 2DUQA 1IRAX 1JT3A 5EG6C 1FWUA 2FGFA 3D6EA 4U2AA 3M3EA 2RSTA 4GAIA 3PUBA 1DQ4A 3Q7YA 4IZEA 4IY8A 1BLAA 2NP0A 2D3RA 2R0FA 2AAIB 5BP5C 5GAQA 1CJPA 3ILFA 1AVWB 2D24A 1HDKA 2F2FC 2YY1A 3F62B 3L2YA 5FNWA 2ZABA 1FAYA 3FJHA 1JUIA 3GALA 5D63A 1LHOA 1LGBA 2DTWA 2HW9A 5GLZA 2HWMA 1GV9A 2SLIA 2CNAA 4Q26A 2ARBA 4YG0A 4XFTA 5EYXA 1W6PA 5DUVA 3V0BA 3UD8A 2ERFA 4L8QA 2NN8A 3E8LC 3B00A 4X37A 2A3WA 1ILR1 2ZGTA 4ATFA 1W3AA 1LJ7A 3B3QE 1UN1A 2I2SA 4ITCA 4TZDA 2KH2A 4XFSA 1WLDA 3WO2A 3N7JA 2W68A 1TEIA 2WRYA 3IKWA 2EXIA 4YM0A 5JVVA 2GNMA 4QBCA 3WMVA 4LO0C 3QCWA 2A6XA 1Z78A 1HWPB 4ENDA 2EXJA 1SLCA 3H6RA 2PHRA 3R4UA 4X39A 3VEQA 1PUUB 1HQWA 2KM2A 3C9ZA 1BQPA 4XXPA 4YM1A 1RG8A 2P39A 2ZGQA 1LOBA 4JQ0A 1I1EA 1W6MB 5EXOA 4GOVA 3WG1A 1ISXA 5H9QA 3QR5A 4I4UA 4QKSA 1IJTA 1SCRA 5D62A 2AYHA 3KM5A 1F9KA 2ARXA 3RMYA 1AVUA 2ZMLA 1UKGA 4OWLA 2Y9WC 2W08A 1V6LA 2HZ9A 1QKQA 1UPSA 5DUXA 1CR7A 3CQAA 1W6NA 2D1ZA 5T54A 3FJEA 4FOWA 2ZHMA 4Y22A 1WD4A 3NBEA 4I1EA 1YRZA 5F9TA 3WINC 3UJQA 2ZGNA 3MW2A 3O49A 1DHKB 1Q8OA 31BIA 1QDCA 3OBRA 2ZHKA 1G9AA 3OPZA 2D6PA 1YXWA 3POWA 4CJMA 1TP0A 3JRRA 1QNYA 1HIBA 3NWKA 3ZYRA 2VLCA 1YBIA 2K43A 2DWRA 3CRGA 1IHKA 4GALA 4LBJA 2Q5TA 3NV4A 3UJOA 1XZZA 1TTUA 4GA9A 4K1ZA 1SACA 1TIEA 1K5VA 2UWCA 4PQ9A 3A22A 2YXSA 2EALA 3ZVXA 1IT0A 3HBWA 1V00A 4LBKA 4LO1C 2IWTB 1LOCA 4FGFA 1S0JA 4ZFYB 3FLTA 1BLDA 4I4YA 4JCKA 4KBBA 3B9UA 1AX1A 4YFZA 2I1BA 3BAQA 2FMDA 1GZCA 1JT7A 4WVWA 4YW4A 1JY0A 2IHOA 2E53A 1JHNA 3OY8B 5GM0A 3WDUA 4CZSA 1LU2A 2E51A 5BXTA 1IS6A 2A7AA 4C1XA 2HWAA 4LO2C 4FQZA 2YUGA 3RSJA 5IK4A 3ZX7A 2WSVA 2WJSA 1KJRA 1W6OB 2CWMA 5H9RA 1FGAA 1WW4A 1UZZA 3M3OA 2D3SA 2KI6B 1BFCA 2WT1A 3MALA 1R1ZA 1JN2P 1HLCA 5BVPI 4FPLA 3OBTA 3D7WB 1MACA 1LODA 4DEPA 1ULGA 3V65A 2DVFA 5GLVA 1S1AA 1C4RA 5DZGA 5GLTA 1QF3A 2HYKA 2ZZJA 3AKIA 3W9TA 1QOOA 2D23A 1AX0A 2GMPA 1WW5A 1QQLA 2X2TA 2DU1A 5EWSA 1S0IA 1DLLA 5CB7A 3FUOA 4UW3A 5KXBA 5BP5A 4YG6A 1MS1A 4I1BA 4XZPA 2A3YA 1DJSB 1AVBA 2DVAA 5IK5A 4KEIA 1NZKA 1GZWA 1ISVA 1OQLB 5DZUA 1PZ7A 1IOAA 3USUB 3AYDA 2LIEA 3O3QA 4FP2A 3UJ4A 2H0BA 4EFRA 1BARA 1N3QA 2ZGOA 1DBNA 5JOYA 41BIA 4Y20B 1KDMA 1IS4A 3BOPA 2ESUA 2KI4A 4GP0A 1DZQA 2ZQNA 2DS0A 2UWBA 1R8NA 1Q8SA 2A5ZA 4II0A 5BXPA 3BAHA 5GZFA 3I4IA 3WG3A 3F1RA 2ZGRA 4LBOA 1OQ1A 4A7ZA 1OKQA 1D2SA 1NLSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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