1DLLA

The hc fragement of tetanus toxin complexed with lactose
Total Genus 114
50100150200250300350400020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
50100150200250300350400400300200100
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
source organism Clostridium tetani
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TETANUS TOXIN
total genus 114
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1dllA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1dllA02
1ULDA 1LOGA 5DUVA 2WJSA 1NZKA 5KXDA 3SLIA 2LIQA 2D24A 1GNHA 3APBA 2JE7A 2D44A 4FP3A 3OYWA 1G9AA 2PHTA 1W3FA 4OWLA 5IT6A 2AR6A 1PZZA 4LO2A 3N36A 3I2AA 4LO7C 4USPA 1PWAA 4P0LA 4I6IA 2X2SA 1LHUA 4I30A 5GZFA 5H9SA 2R1BA 2IHOA 1LOFC 4P14A 2A3YA 4LO1A 1ISYA 4I96A 1DHKB 3N7LA 1PC8B 6I1BA 3M2MA 5JVVA 4GA9A 2DS0A 1HCDA 1KNMA 3ZYPA 1SBFA 4FPGA 4AVVA 3WG2A 5D63A 2LTNA 4YGEA 1DQ6A 3FUQA 3O0WA 3WINA 2GN7A 1DFCA 3POSA 4KEJA 3A07A 4PC4A 2Q5TA 3WHUA 1N1YA 1WUVA 4FQZA 2P3IA 3FJ9A 2GNBA 2Z42A 1WD4A 1I3HA 3N7MA 4LO0C 2VU9A 1VLNA 1LHNA 4JPZA 3CRHA 4FPOB 4P9YA 4FPHA 1BA7A 4TYSA 5IK5A 4ATFA 2YXSA 5EYXA 2AENA 2W68A 2V5YA 3HOMA 2EALA 1UPSA 2DUQA 3ZX7A 1BARA 1LTEA 3M3OA 3RMXA 3FJJA 4U2AA 1OKQA 1GZWA 3AYCA 2UURA 2VXTI 3OJVA 4IONA 1S0DA 3P6IA 5T5PA 3ZXEA 3SNMA 21BIA 2F8XC 2D6LX 1GLHA 4DQAA 3K1XA 1AVUA 3IN9A 2SBAA 4EFPA 2WRYA 1LESA 1BLDA 4Q91A 2ZGNA 3H6QA 5CAZA 5BXSA 1SBDA 4UW5A 3SNVA 2PHXA 3AZWA 2XOAA 4R9BA 3I4IA 1W0OA 4FPLA 4FPEA 1AXKA 1V6LA 4GOYA 1QGLA 4PF5A 4EFQA 3L2YA 3SH3A 1A8DA 4XJ9A 1UZYA 1JT4A 1DZDA 1SR4C 2EXIA 3F1RA 2BFHA 2CYFA 4D0ZA 2EF6A 2NVHA 3WZ1A 4LBQA 2A70A 2EXJA 3ZXFA 1DQ1A 4A7YA 1Z0HA 4F83A 1W0PA 2WT1A 4Q9PA 3E8LC 1PUUB 1JT5A 1FNYA 1Q8OA 4FPYA 4QKRA 4YM1A 1VCLA 3FJDA 2F2FA 3OJ2A 2E51A 3D5OA 3FLTA 1XG6A 4IZXA 3S8KA 3CRGA 5EG6C 4YW1A 2HZ9A 4OW4A 1V6OA 2ERMA 1SLBA 1S1AA 2ZACA 2GMMA 3H6RA 4YGCA 4LBLA 4P9WA 1ULEA 1Q1UA 3WG4A 1UZZA 5H9RA 3R4SA 3BAOA 3UL2A 1JHNA 3ZSJA 4FQ4A 5AVAA 4AN7B 3AKGA 1LCLA 1TFMB 1IOAA 4GOVA 1BYHA 3WA1A 4Y1ZA 1QF3A 2Z48A 3W9TA 4YW3A 1DQ0A 1KRIA 9ILBA 2D7RA 3ILRA 4G6MA 2ZMKA 1WBCA 2P2KA 3I2XA 1W6OB 3O44A 1F31A 1FGAA 4Q9GA 4Z8BA 1CVSA 5BYNA 5DZUA 2YMZA 1AJOA 1IS4A 1SACA 3BAQA 1RZOB 3AP5A 4OWKA 5JOYA 1QQKA 3KM5A 4GAFA 3ZXDA 4YW2A 1WW6A 1BZWA 3AP7A 1UL9A 1GGPB 4YGDA 4I8MA 2AREA 1SR4A 3NBDA 4Y20B 5DG1A 5T54A 4R6UB 2NTDA 4QALA 3V0AB 1JY0A 1JT7A 4Y1UA 5BXTA 3O5SA 4WVVA 1WCSA 4BQ1A 1JYIA 4P0JA 5T55A 1WLCA 4HJJA 1IT0A 3OGGA 3AJZA 3FGMA 1FATA 4LO8B 3VT0A 2NMNA 3KQRA 4TZDA 1ULFA 4QC4A 4YW4A 1BKZA 3O4AA 4MYEA 4DCKC 3WCRA 1AFCA 2WSVA 1S0BA 1V6UA 3N7JA 4L4IA 2CWMA 1ISWA 1GZWB 4DENA 4YZ5A 3MW4A 2GO2A 1HKDA 5IK4A 3BX1C 1W6NA 3M3QA 1TTUA 3KMVA 4EB2B 4WV8A 3SH4A 3R4UA 3AH1A 5CB7A 5IK7A 2AUYA 2DTWA 3PHZA 3FJKA 1C4RA 4XILA 1EPWA 1LODA 1RIRA 2J3PA 1LGBA 2PHRA 4QO3A 1QMJA 2KI6B 2D3SA 4X39A 1HCEA 4QKSA 1FN0A 3AJ5A 3UJ0A 3HSMA 4RL7A 5F5QA 4ASMB 4I4XA 5GZGA 1W6PB 4UW3A 3TAYA 4ZA3B 3VSZA 2ZHNA 4AWDA 4LBQB 4XZPA 4LO2C 4OUJA 3UD7A 2WSUA 5FZZA 1OQLB 1BASA 1CONA 2JKBA 2D6PA 1R8NA 1MR5A 3AXEA 2NP0A 4YG3A 4LO1C 4UW4A 3BRGC 1IKPA 2B7YA 1TEIA 1MVQA 4X38A 4BM8A 3WG1A 3WOGA 3IM5A 5BOWA 4YG6A 4D69A 1AX0A 1LHWA 4Q26A 2D6KA 3ZXLA 4GAIA 5GALA 3WINC 2VW2A 4GWNA 1V00A 4AGVA 3AZXA 2D43A 2FDBM 2P39A 8I1BA 3H6RB 7I1BA 3OY8B 2A3WA 3CA0A 5JLVA 4I2SA 4LO3A 2CTVA 4DRVA 2RSTA 4II0A 1W6MB 2R16A 1GBGA 1JOJA 4XTPA 2E53A 3U4XA 2KM2A 3D4KA 2BEBA 3AH2A 4GKXA 2IWTB 2FFVA 3VKFC 2R0FA 4WVWA 1HQWA 1QDCA 3BODA 3O4OA 5DUYA 3WDWA 1ISXA 1JTCA 4BOWA 4XMAA 4ZLBB 1O4YA 4R9AA 2ZABA 3HBWA 3QR5A 1UAIA 2VSEA 3WDXA 3BA4A 2JECA 3USUB 3M3EA 3VT2A 1MS4A 1JYCA 3AP4A 2XB6C 3BAVA 1FAYA 3UD9A 3A4UA 2Y9XE 1JXNA 1LOEA 4IZEA 4CZSA 2ARBA 2Q3NB 3O3QA 3B3QE 1W6OA 5D62A 3FJCA 2FFUA 4QD2B 4RA0A 1MS8A 3AX4A 1GICA 3BA5A 5LK5A 5FNXA 2FMDA 3I8TA 5EYYA 1V6XA 3PUBA 1YI7A 2KLLA 3O5WB 3RG0A 1SLCA 1N3PA 4CRQA 4Q1PA 5GJ6A 1TOOA 2D7IA 1RY7A 1CESA 3O4CA 3OPZA 2K8RA 1DLLA 1WBFA 3V65A 4XJZA 3Q7YA 1S0CA 3UD8A 4HL0A 4GP3A 3SITA 1L2HA 5SV8A 1MZ6A 3GNEA 3PMEA 1A78A 2ZHLA 3FLRA 4K1ZA 4JKXB 4Y20A 4R9CA 4P9XA 2D6NA 1MS0A 4XBQA 4YM3A 3VKNA 3V0AA 1DYKA 2F2FC 3C9ZA 4JP0A 4I3NA 4G1RA 2ZGKA 1FNZA 1FMMS 1M2TB 1MZ5A 1W6NB 4Y26A 3W59A 5IK8A 3AFKA 3FLPA 4L4HA 1HKNA 3AZYA 4I37A 2AYHA 5JOWA 5GLZA 1Q56A 3D7WB 3HR9A 4YZ3A 3OJMA 3RSJA 4IY8A 2A6ZA 1Q03A 2Q9XA 4YM0A 2G4IA 3W58A 4XHBA 1G8WA 4XYXA 1O4ZA 2ZAAA 1KDKA 3FJBA 1AVXB 4L8QA 3VV1A 5F8WA 1WW4A 2VH9A 1FQ9A 5DXDA 1LENA 5EXOA 1TP0A 3UDAA 3WO4A 1T9FA 3CNAA 4FPFA 3RRDA 5E89A 5G00A 1BFCA 1WW7A 3IKWA 1Q8PA 4Y1YA 3MW2A 4HA2A 1LGCA 2UU8A 1MC9A 1JQZA 1LU1A 1YRZA 2MIBA 4FOQA 5DSSB 2WKKA 1MS3A 3PG0A 5I1BA 3A0KA 3NV1A 1HLCA 1AXZA 4U36A 5BP5A 3WDUA 3T2TA 3A23A 1TWEA 5HCAA 1W6PA 2FHRA 2A71A 1Q8VA 1SZ6B 4Y1VA 4W65A 3TC2A 4QD2C 3POYA 2LALA 3B01A 4XHXA 1JBCA 4YZ1A 4BMBA 5KXCA 4GALA 1N1VA 2Y9WC 3AP9A 1W6QB 5B2HA 5IUQA 3AH4A 5EWSA 3B9UA 1AVAC 1XQNA 3RQ0A 2RHPA 5JOZA 3FJ8A 4J23B 1S0IA 1YF8B 1NUNA 2ZGOA 2EIGA 2D6OX 2DRYA 3AYDA 2CY6A 3T1MA 1DQGA 2DUOA 4C1WA 2GNTA 3NBEA 5DG2A 4XBNA 3O0XA 2D22A 3FFZA 1LEDA 3EF2A 2NM1A 1IRAX 1AX2A 2LIEA 5FZUA 1DQ4A 3OY8A 5EC5A 1G86A 4CTEA 4K21A 4G9NA 5T5OA 1W6MA 1QXMA 4ENDA 2ZR1B 4EKXB 2OUHA 1D2SA 1RINA 2W52A 4AGRA 4ZGRB 5JDBA 3AJ6A 3AKIA 4DFSA 1C57A 2R9KB 4JC1A 5CBLA 3Q9OA 4BMEA 4JQ0A 1GYKA 1AVBA 1GSLA 3JUUA 1MVEA 1BXHA 3ZSMA 4XJWA 2DVAA 2DURA 1RITA 2ZHKA 4J2YA 4LBJA 4LBNA 4ITCA 2K4AB 1PZ8A 2DV9A 1F5FA 3USUA 4I4YA 1CVNA 1LJ7A 1WD3A 1DZQA 4LBMA 1PUMB 4LBQD 3WO3A 1BFGA 3I29B 3FBYA 3INAA 3O0VA 4UW6A 1Q8QA 2ZKNA 4Y22B 1FMZA 1CPNA 3D6EA 1P63A 3OJBA 4XE9A 3NBNA 2JD4A 1QOSA 4AN6A 2ZGRA 3NWKA 5GZEA 4I4RA 4I4PA 4J2SA 4FPKA 2JJ6A 3FJIA 4XFSA 1G9FA 1MS9A 1S0FA 4JRAA 3V79C 3V0BB 3WUDA 1W3GA 1YO8A 2HWAA 5D61A 1ZM1A 1Q8SA 5F8SA 4FPJA 5CNAA 4LO3C 5GLTA 1CQ9A 2A6XA 2WNEA 4GWMA 5FRAA 2DTYA 4YZ2A 1UKGA 1SLTA 5F9TA 1ZA4A 5FREA 1ONKB 1QU0A 1LHOA 4Z9WB 3BAGA 1MACA 2SLIA 3NV3A 1DFQA 4OEEA 4DEPA 4I7IA 2I1BA 1HDKA 3O4BA 2BQPA 2OW4A 1V6IA 1C1LA 3CU1B 1RMLA 3IIRA 2A5ZA 1HWNB 1XYFA 2P23A 1YXWA 3JUTA 2FO1A 4BPZA 1AZDA 2D20A 2ET2A 2VXRA 2D3PA 5DZFA 3BADA 5DUXA 3AXDA 2MC2A 1FV2A 4FP2A 1J1TA 1TWMA 1H9WA 4XDQA 1YYNA 3WUCA 3DGTA 5JOXA 2NZ9A 2DYCA 1II4A 3WNXA 1NXD1 2WQZC 2ZGLA 2WLQA 4CJMA 5F8YA 1SCSA 1AVWB 2GALA 3GALA 1ENQA 3AK0A 41BIA 3BRDA 2TEPA 1AX1A 3VUOA 4OWJA 3IPVB 2C9AA 4JKQA 3ENRA 3HN1A 1IS3A 4PBPA 1WBLA 3NJ5A 1E0OA 2GNMA 3RTJB 3POWA 1CE7B 1AJKA 2CL2A 4M3CA 3OBTA 4WZFA 1H30A 3AZZA 3O12A 5FZYA 2A3XA 2A6WA 1LOCA 2EXHA 1ABRB 1VAVA 3LCPA 3JU9A 1OQ1A 3MALA 1EV2A 4C1XA 1ULGA 1S0GA 3AZVA 2XG3A 1I1EA 2NYYA 2AFGA 1W6QA 2KH2A 1JW6A 3IM6A 5JMCA 2UWAA 2DU1A 1FWVA 1Z78A 4BLJA 1AXMA 4GKYA 4A7KA 1BLAA 5HCBA 5E24E 3CQAA 5GLUA 3ILFA 4YG0A 4F34A 3DUIA 2AH2A 2R0HA 4AGGA 1FYUA 4D0TA 2DVDA 2PHUA 4AVSA 4YGBA 4KBBA 4I4UA 4J2XA 1DZCA 3S8JA 2VW0A 4BLIA 3IM7A 4NO4A 1V6JA 3R05A 4PBOA 2HYKA 1LULA 1HQLA 1BJQA 4OEFA 3P53A 2ZBJA 4ZFYB 2P37A 1HIBA 2HWMA 1YBIA 4XJAA 2ES3A 4X3AA 1KQRA 2GNDA 4OZXA 1HWOB 1SFYA 2JDZA 1K5UA 5HPZA 1LU2A 3VKOA 1FV3A 5F90A 2GN3A 3LLPA 5BP5C 3H6SE 3ILAA 3FJFA 4P6AA 2PHWA 2P3JA 3WLUA 4XXPA 2YROA 4LBOA 3PVOA 1QNYA 1SBEA 3FJHA 5T5JA 1ISVA 2GMEA 1JN2P 2CNAA 3O4DA 3V64A 4Y22A 1N1SA 3SISA 1JLXA 4Q2FA 3LSEA 2X2TA 3WDVA 3LTQA 2PELA 3QCWA 4YLZA 2M49A 1UN1A 2E7TA 4M00A 1IHKA 2ARXA 5BVPI 1VAMA 2D7FA 2W08A 2ZGQA 1SLIA 4Y24A 2AXMA 3V0BA 2DUPA 1GNZA 3UJQA 1GANA 4IYBA 1KITA 3HMYA 1HWPB 2NMOA 2ZGUA 1JLYA 1MD6A 1D0HA 3VKLA 4XFUA 5E8AA 2BEAA 1GZ9A 3IAGC 4YM2A 2YZ4A 3CA6A 3FJEA 3UJOA 3VSFA 4M3CF 5DZGA 3BAHA 4GP0A 3AYEA 5KXEA 2ZQNA 4ISQA 3ZXKA 3AYAA 1DJSB 1WW5A 1KJRA 1CPMA 2DRZA 1QKQA 4ZFUB 4JCKA 3AJYA 4OEGA 2DREA 3RTIB 2EXKA 2P3KA 1Z4SA 5GLVA 2ERFA 5HCFA 2I2SA 2UUSA 4Q1RA 4J2KA 1JUIA 3UK9A 3BOPA 3FJAA 4G9MA 3H0OA 2WBCA 5BXRA 4M3CB 4XTMA 4AVTA 1SLLA 2DVFA 2VUAA 3CA4A 3ZC9A 5GZCA 2Y9GA 3A0NA 4Q8LA 2AGSA 4M01A 2AAIB 5H9QA 2RQ9A 2Z49A 2ZGMA 4NOTA 1G9DA 5DUWA 5GAQA 4K20A 3IPVA 1V6VA 4FVVA 3Q7WA 1BFFA 2Y9FA 1SLAA 4EEEB 3AP6A 4Y1XA 5GZDA 1LOFA 3WMUA 5CA6A 4Z8SB 1ULCA 4PQ9A 2D6MA 1Q04A 1X50A 3OBRA 4G6JA 3WVJA 4KEIA 3Q7XA 1CJPA 2ZGTA 4DS0A 2GMPA 4WBCA 1XZZA 1F9KA 1BQPA 1K5VA 3MPPG 5T52A 4XIOA 4FOWA 1Z2VA 1WLWA 1DBNA 4XIKA 2C5DA 5BQUC 5DZEA 4JAWA 1N1TA 4PCRA 3BTAA 4QBVA 1ONAA 5T50A 1DQ2A 3QLQA 3A22A 1KDMA 1HWMB 2YUGA 3ZSLA 4LO0A 3BB2A 4EFRA 1VALA 1FX5A 2DVGA 1QQLA 3CAHA 2RG9B 1BFBA 2VW1A 2AQZA 1XHBA 1G9BA 2ENRA 4I4OA 1B09A 1H9PA 3PJQA 2FGFA 4XFTA 1LEMA 3N7KA 3ZPYA 5GLWA 2GDFA 3BA7A 2ZHMA 1Y7BA 1DQ5A 1V6WA 3T1LA 5GM0A 3WMVA 2YY1A 5DVHA 3JRRA 3OYWB 3ZXJA 4HANA 2A6VA 4IY9A 2QYIB 4FOYA 3BAUA 4YOLA 1LGNA 4I4SA 1FWUA 2ZGSA 2CWSA 1U0AA 4I0YA 1G9CA 4HR6C 4ZOTA 3WDYA 2D1ZA 1W3AA 1QOTA 3WG3A 2KI4A 1OFSA 1G7YA 3F62B 5FNWA 4I1EA 1ITBA 5KXBA 2P34A 3LSDA 3PVEA 3B00A 1JT3A 4KEKA 3B69A 2GZBA 1QNWA 4DRRA 1DYPA 4IHZA 3C2UA 2YV8A 4YFZA 3PVNA 3ASIA 4SLIA 3WDTA 4H9WA 1ISZA 2VY0A 3O49A 5T5LA 1VIWB 3RS6A 3CA5A 2E4MC 4ZFWB 3QYDA 1KJLA 2D23A 4XJUA 1C1FA 1PZ7A 4Q27A 3ZSKA 1J0SA 1TIEA 1CIWA 4H04A 4K1YA 3AKHA 4H55A 2E6VA 1PZ9A 4DPNA 1LOBA 4ISRA 1S0EA 3N3HA 5BQUA 3T8SA 3BRFA 2A7AA 3ATGA 3CA3A 1AF9A 1ENSA 3VT1A 4GXLA 3NV4A 4FPCA 1EYLA 1UMZA 2UWBA 4USOA 1QDOA 1N4KA 1IS5A 1GZCA 4X37A 1ENRA 1IRPA 1N3OA 2MLLB 2OUJA 3NBCA 3M1HA 4XMIA 3BIWE 4ZKTB 4D8HA 1MS5A 5BXPA 3SH5A 5H9PA 1GKBA 2NN8A 1CN1A 3ILNA 1IKQA 3RMYA 3TB0A 1LOAA 2JE9A 2DWRA 3CRIA 4TLPA 3IMNA 2R49A 2A6YA 5DUUA 2DVBA 2R1DA 3HALA 1DQOA 1NLSA 1G82A 3OGFA 1R8OA 2L5XA 4FOVA 1APNA 1QOOA 1M16A 1I1BA 3VWCA 2WT2A 4AYUA 3WV6A 4LO7B 1LHVA 1LECA 4FGFA 4XJ8A 2A75A 1V6KA 3POKA 3A21A 1GV9A 3WHTA 1YTOA 2KKIA 2ZA9A 3VEQA 2QN4A 1UX6A 31BIA 1IS6A 3UJ4A 3P6JA 4XKIA 1ILR1 2ZMNA 1EVTA 2OVUA 4P0KA 3ZXGA 4A7ZA 4YFWA 2E7QA 1SCRA 4XXAA 2D3RA 1R1ZA 5EHAA 3AKFA 1DIWA 1IILA 1IOBA 3M3CA 3WCSA 2EAKA 1WBAA 2ZZJA 1IJTA 2UWCA 1S0LA 2H0BA 4KC3A 2E4MA 2V73A 5E88A 3ZC8A 3WO2A 2VSAA 2ZMLA 3ZVXA 4ZXKA 4I4QA 1MS1A 2ZQOA 1RG8A 1T4QA 5L73A 4XBLA 4XOGA 3N0KA 3FUOA 1V6NA 4IQPA 4LBKA 3ZYRA 2ZGPA 4YW5A 2WT0A 3B9CA 1CR7A 1N3QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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