1FV3A

The hc fragment of tetanus toxin complexed with an analogue of its ganglioside receptor gt1b
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
451
structure length
451
Chain Sequence
KNLDCWVDNEEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The crystal structure of tetanus toxin Hc fragment complexed with a synthetic GT1b analogue suggests cross-linking between ganglioside receptors and the toxin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium tetani
molecule keywords TETANUS TOXIN HEAVY CHAIN
total genus 108
structure length 451
sequence length 451
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2000-09-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1fv3A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1fv3A02
4A7KA 2A71A 3WVJA 1ULDA 4CZSA 2D22A 1LOFC 1DQGA 3OJMA 3OJVA 1V6LA 3CRGA 1JBCA 5SV8A 2FMDA 3ZC8A 3O5WB 3VT2A 1V6OA 3H6QA 1IS6A 1HQWA 2VW0A 3VSFA 3AZXA 3O4OA 2VH9A 3Q7YA 4L4HA 4DCKC 2D6MA 3JU9A 3HALA 5BVPI 2WT2A 3O0WA 3UDAA 1Q8PA 3LSDA 1TEIA 2UWBA 3FUOA 1KDMA 4LBLA 3M3OA 5E88A 1S0LA 4Z9WB 3KQRA 4BPZA 5FZYA 1VIWB 1F31A 1BXHA 1S0DA 1MD6A 3N0KA 3N7JA 1AVUA 1Z2VA 3NV4A 1FN0A 4JKXB 1OKQA 1FMZA 2ZKNA 3MW2A 5JVVA 3BRDA 4YZ4A 1LOCA 3OBTA 1HKNA 5D62A 3RSJA 3M3CA 1TOOA 4YGBA 1PZ7A 2CTVA 5GZDA 1XQNA 2PHRA 2R1BA 1RY7A 3MALA 1D0HA 2P3JA 4QO3A 1QXMA 4OWKA 2A6YA 3V64A 5HCAA 9ILBA 3SISA 2VUAA 1QU0A 4XDQA 5IK8A 2DVAA 3WDYA 2VU9A 1WBLA 2EIGA 1AVAC 5DZEA 4LO0C 1AJOA 2ARBA 4I4OA 1HWMB 5H9RA 4ZOTA 4Y1VA 1FWVA 1BYHA 3OPZA 1JXNA 2NVHA 1SR4C 2NP0A 4LBQD 2EXIA 2PELA 3KM5A 4MYEA 1M2TB 4FPHA 2K8RA 3NBCA 3V0BB 1F5FA 4FPCA 4OEGA 1ONKB 5HPZA 4Y1XA 3UJQA 3WDXA 3WG4A 4R9BA 5JOWA 1ITBA 3D5OA 3CNAA 4BOWA 3B00A 4Z8SB 1IS4A 4ATFA 3B9UA 5EWSA 1UL9A 2ET2A 2AR6A 1JT3A 1IHKA 4F34A 1MS4A 1A3KA 1FWUA 2GO2A 5EXOA 3MW3A 3POWA 3WO4A 4OW4A 4FPFA 2R16A 2P3KA 1TTUA 5F9TA 2AFGA 3PUBA 1SLIA 1LOFA 1X50A 4FP2A 4YGDA 5AVAA 4AYUA 1W6MB 4OWJA 1FNZA 4ZFWB 1YIFA 1LEMA 1G86A 2AGSA 2MLLB 1WLWA 2EXHA 3FJHA 1V6XA 2D6KA 1FMMS 3CRHA 4I4XA 2VLCA 5FNWA 2DWRA 4I4VA 3S8JA 2Z42A 2E4MC 5GZCA 5GLUA 1JT7A 1MVEA 3WO2A 2DRZA 4D8HA 5KXBA 2C5DA 2MC2A 2LALA 1CVNA 2MIBA 4BQ1A 5T5LA 4FOWA 4XJ8A 2UWCA 4YLZA 2P37A 2NMNA 1LTEA 4M3CF 4M3CE 2E7QA 3BA4A 1BA7A 4J2XA 3BAOA 4LO8B 4DENA 2YV8A 3BRGC 2A70A 4KC3A 4Y1YA 2EF6A 2DVFA 2D7RA 1CN1A 3WNXA 4WVWA 2P2KA 3VV1A 1WLDA 1DIWA 1II4A 21BIA 3USUB 3TAYA 1G82A 4I7IA 1LOAA 2ZGSA 4IYBA 3AZZA 2ZGLA 5FRAA 2I1BA 3V0BA 1V6MA 3POYA 1Q56A 3HBWA 2CYFA 1QDOA 4FQZA 4LO3C 1AXZA 1FAYA 4LO0A 1V6NA 1KRIA 3VUOA 1KNMA 3AKGA 1DZCA 4G6JA 3AJ6A 1S0JA 2JD4A 1DHKB 3SH4A 4QBVA 4Q91A 4YM1A 1LODA 3C9ZA 2Y9FA 3CA4A 4ISRA 3POKA 3OJ2A 1AVXB 2WT0A 1SLBA 2PHFA 4X39A 3AP6A 3AKFA 4KEIA 4QD2C 5DVHA 1XZZA 2ARXA 1CPNA 1W6MA 2D3SA 3A22A 1LOEA 2ZGMA 1HDKA 4CRQA 5EG6C 3BB2A 5GLWA 3WMUA 2EXJA 1S0BA 2LIQA 1W3GA 3BAUA 4QKRA 1E0OA 1N47A 1DBNA 4AGRA 4LO1C 1G9FA 1HLCA 4QD2B 4EFPA 3CA5A 5CB7A 4USPA 1EVTA 4DEPA 1M16A 4XXAA 1MACA 4F83A 3T8SA 3C2UA 3WDVA 1QKQA 3WUCA 1EV2A 1JT4A 3B9CA 1HIBA 1LU1A 4M3CB 2E4MA 2ZAAA 1ILR1 1HCEA 1G9CA 1LEDA 3OGGA 4X3AA 3AFKA 2R0HA 1WBFA 5F5QA 3LLPA 2VW1A 5FZUA 1DLLA 4LBJA 4D0TA 5GZGA 3NV3A 3E8LC 3T1LA 1IILA 1HWNB 3USUA 4P9WA 4I4RA 5GM0A 2A3YA 3IAGC 4HJJA 4IZEA 5T5JA 4YOLA 2GN3A 5JOXA 4Q9PA 4XTMA 1W6NB 2WQZC 3V0AB 1ISWA 2AENA 4DPNA 1VAVA 5GZEA 1MZ5A 1JTCA 3A0KA 2B7YA 4WZFA 1IOBA 1IT0A 2Q3NB 1UX6A 2VY0A 1MVQA 1W6OB 1YO8A 2Q9XA 3VKLA 3A21A 3UD7A 2OUHA 1RITA 2ZGKA 1QMJA 5CBLA 4QALA 3BTAA 3ILFA 5DSSB 1EPWA 1MS9A 1Q03A 4LO3A 1DYPA 5BXTA 2ZGQA 5FZZA 4XJUA 3IPVA 3K1XA 1N3OA 5DUYA 2WSUA 2DV9A 4IY9A 3ZSJA 2VXTI 2PHXA 4A7YA 3MPPG 4EKXB 2J3PA 4XFSA 3BX1C 4ZFYB 1CQ9A 5DG2A 3CA0A 4ZGRB 1CR7A 2A3XA 4DS0A 1WD3A 2XOAA 2D43A 1SCRA 3BRFA 5B2HA 2QN4A 3AJ5A 2BEAA 1JUIA 1QQKA 2GDFA 5KXEA 3BOPA 2P23A 1IOAA 1HWOB 2KKIA 1QF3A 3IKWA 3O4BA 1VALA 2KH2A 2ERFA 1OQ1A 4R9CA 1MS0A 1LCLA 5GLTA 4U36A 4BLIA 1PC8B 3AZYA 1W3FA 4ENDA 1BLAA 1W6QA 5T5OA 2K4AB 2M49A 1BKZA 3R4SA 4XJAA 1QQLA 2EAKA 1MS8A 2AREA 2PHWA 5T52A 4Y1UA 4YZ2A 1PWAA 4HR6C 3N7KA 3BAGA 4P0LA 1DQ1A 3M1HA 1URXA 1CE7B 1DQOA 1MC9A 2DURA 2RG9B 5LK5A 4J23B 4BMBA 3WDTA 2D3RA 1F9KA 1W6OA 4WVVA 3NWKA 1ENSA 2A6XA 1R8OA 3B69A 2K43A 3N35A 1BARA 2P34A 4G6MA 5D61A 2E51A 4USOA 1N1YA 5KXDA 4Y22B 1P63A 4IZXA 3O3QA 1RZOB 1AXMA 2R9KB 5JOZA 1AX1A 2DYCA 1K5VA 2L5XA 3NV2A 2ZGRA 2WJSA 2W52A 1RMLA 4XFTA 2Y9GA 2A6ZA 2VSAA 3BA7A 3I2XA 2D44A 2FO1A 1S0EA 1LU2A 2W39A 1G8WA 1OQLB 5E8AA 3VT1A 1TWMA 4BLJA 4Q26A 5JOYA 1LGCA 5F8SA 5F8YA 2HYKA 2V73A 4XJ9A 4YW1A 5JMCA 1A8DA 4K21A 4XBQA 1JLXA 3TC2A 1JLYA 4GWNA 1OFSA 3I29B 4C1XA 4P14A 2ZGTA 4LBNA 1SLCA 2QYIB 2HWMA 2DVDA 4YFZA 3T2TA 3N3HA 2DTYA 3AP4A 3Q9OA 1XYFA 2IHOA 3ZX7A 1JYIA 3APBA 4Q8KA 1RIRA 4JAWA 1N3PA 5JLVA 1N1TA 1Z4SA 5DG1A 1WD4A 3BADA 2DUPA 4JRAA 3WINC 2D23A 3Q7WA 4OEEA 3WUDA 4I3NA 1W6PA 3SLIA 4FOYA 4AN6A 3B01A 3EF2A 1ENQA 3IM5A 4J2SA 2ZR1B 1RG8A 3ZXLA 3W59A 5CAZA 1DQ6A 5DUXA 1CVSA 5F8WA 1QDCA 3WG2A 2W08A 4C1WA 1QNWA 2WNEA 3WZ1A 2FDBM 1VLNA 4BMEA 2D6PA 2DUOA 3HOMA 4Y22A 3ZXEA 3WG1A 1SLLA 2NTDA 2DU1A 4LBKA 4KEKA 2AH2A 2PHTA 5I1BA 1IKPA 1DZDA 1BFCA 1LOGA 3D6EA 3ZXKA 4Q9GA 1W0OA 5L73A 2HWAA 2C9AA 3M2MA 3OYWB 3AP7A 1HKDA 4PC4A 5BOWA 3AZVA 3P6JA 1ISXA 3HSMA 3VKNA 4R9DA 1KJLA 1AXYA 2CY6A 4I1EA 3O4CA 1W0PA 4R6UB 3O0VA 1KITA 4HANA 3FJDA 1C1LA 3UJ0A 2ENRA 3WLUA 1LHOA 4IY8A 4PCRA 3VKMA 3WCRA 1CIWA 4Q8LA 1JW6A 1T9FA 1R8NA 3HN1A 1CPMA 2NZ9A 4HL0A 4K20A 3I8TA 4UW5A 5HCFA 1V6VA 4FPGA 4YG3A 1BFGA 3F1RA 4NOTA 1BLDA 1ISVA 1V6WA 4HA2A 31BIA 1BJQA 4PBOA 2ESUA 4IONA 4NO4A 3QCWA 4IHZA 4AWDA 2WKKA 1G9AA 3FJAA 3QLQA 1LJ7A 3A07A 1QGLA 2A6WA 4YZ5A 4I0YA 4Q1RA 2P39A 1QOSA 4KEJA 1IRAX 2ZABA 1JY0A 4IQPA 1Q04A 3AZWA 1WBCA 5BXPA 2I2SA 3IMNA 4X37A 2FFVA 5T54A 2DREA 3RMYA 1SCSA 4M01A 2HZ9A 1GBGA 1AFCA 4A7ZA 2D20A 3ILAA 5CNAA 1N1VA 5CA6A 3WINA 3CAHA 2ZBJA 3SNMA 4Y26A 2A75A 2DTWA 3AH2A 3RQ0A 3IPVB 3I2AA 1D2SA 1HQLA 2H0BA 3ASIA 4FVVA 1A78A 4ZFUB 4P0JA 3O44A 4GKYA 1AX0A 3OYWA 3MW4A 1S0FA 3AKIA 4GXLA 1WLCA 5E24E 4X38A 4GOYA 1S0CA 5FNXA 3F62B 4XBNA 3AYEA 1ABRB 1SBDA 3VKOA 1S0IA 2ZACA 4Y20B 2ZHNA 3N7MA 4I4QA 3VEQA 3OY8B 1KQRA 2ZHMA 3NBEA 5IUQA 1W6QB 3IM0A 5EYYA 5H9QA 3JRRA 1UAIA 4P9XA 4YW2A 1QOOA 1WW4A 3S8KA 4XYXA 3W58A 1UN1A 4Y1ZA 2DUQA 2RQ9A 3RTJB 1NZKA 4JKQA 4L4IA 1V6JA 3AYCA 4L8QA 1DGLA 2IWTB 4FPYA 1CESA 1GYKA 3IM6A 2YROA 2D7IA 1Q8SA 1NLSA 4RA0A 1GZWB 3AH1A 2GNBA 3R4UA 2GMEA 1GKBA 1FGAA 2JKBA 4ZXKA 1N4KA 1GNHA 2WT1A 1DFQA 1MZ6A 3ZXFA 1DZQA 5DUWA 3PVEA 3ZVXA 4DQAA 4K1ZA 4YW3A 3BAHA 2ZMKA 3O4AA 1W3AA 5GAQA 5T55A 3UJOA 1TFMB 5DXDA 1HCDA 4EB2B 2FFUA 1FX5A 3CA6A 3W9TA 3AYAA 3IM7A 2D6OX 5D63A 1XHBA 5BXSA 1G9DA 4XBLA 2D24A 1BASA 3POSA 5KXCA 2AAIB 2Z48A 3RRDA 3H6RB 4FPEA 3OGFA 1DYKA 4XMAA 4XILA 3QR5A 3WCSA 4ZBVB 5H9PA 1LGNA 1N3QA 2LTNA 1EYLA 1T4QA 4I4YA 1LHNA 1DQ5A 1MR5A 3AP5A 3FJ8A 4I6IA 1WW7A 4Y20A 2WRYA 1PZZA 2Q5TA 4G9MA 5IK7A 1UZZA 3FLPA 1VCLA 3OY8A 5E89A 3HR9A 3R05A 5EC5A 4XTPA 3CQAA 3FJKA 2V5YA 4WV8A 5DUVA 2ZGOA 5FREA 4G9NA 1NXD1 1H30A 1PZ9A 3PG0A 4P9YA 2F8XC 4FP3A 1JYCA 1AXKA 2PHUA 2JECA 5BP5C 3B3QE 1GZWA 2LIEA 3RMXA 2E53A 4YGEA 2DRYA 3KMVA 1GLHA 4KBBA 1H9WA 4TYSA 2GNDA 1C57A 2JDZA 3CA1A 3H0OA 1CJPA 3O0XA 1W6PB 3ZSLA 1YRZA 4XJZA 3AX4A 4FPOB 3FGMA 1IKQA 3CRIA 2ZMNA 2AXMA 2ZGPA 4GWMA 1RINA 1B09A 4K1YA 2ZGNA 2A6VA 4GA9A 4ZLBB 3NV1A 1LESA 1WUVA 4QBCA 2W68A 4BM8A 2R0FA 4TZDA 1N1SA 3PVOA 4XKIA 1MS3A 1UMZA 4GKXA 2ZQNA 3FJFA 4H55A 2CWMA 1ENRA 2P3IA 6I1BA 3WHTA 1GZCA 1DJSB 3RS6A 3H6SE 3UJ4A 2DU0A 2ZMLA 3BODA 1FV3A 1WBAA 3QYDA 4XIOA 3FJJA 3H6RA 3ZYPA 2KI4A 1WCSA 4I96A 1JQZA 3UD8A 3A0NA 1ISYA 5EHAA 4UW3A 1FATA 5T50A 1AVBA 3O12A 2UU8A 1VAMA 4XFUA 3D7WB 3ZXDA 1FV2A 4FPJA 3NBDA 3ZPYA 8I1BA 1GANA 2OVUA 2CL2A 2XG3A 1IJTA 4FPLA 41BIA 3HMYA 1LULA 3JUTA 4AVTA 3AK0A 7I1BA 3NJ5A 2NN8A 2A7AA 1UKGA 3PJQA 3AP9A 4ISQA 4DRVA 5BQUC 4LO7C 2GNTA 2GMMA 5GLVA 3UL2A 1KJRA 2BFHA 1UPSA 4YFWA 3FBYA 3A4UA 1APNA 2AUYA 1I1EA 3MEPA 3CU1B 2HW9A 2GMPA 1V6UA 2GN7A 2EALA 2YXSA 1K5UA 4UW6A 4LO7B 5BP5A 1CONA 2KM2A 1LOBA 4FPKA 3ZYRA 3WG3A 4JP0A 1GNZA 3PHZA 1AZDA 3N7LA 2X2SA 1JOJA 2UWAA 3IN9A 3AJYA 1YF8B 3VWCA 4XHBA 3SNVA 2NM1A 1I3HA 4LO2C 2A5ZA 3WO3A 4JQ0A 4XIKA 3FUQA 3RG0A 4YGCA 4XXPA 4G1RA 1PZ8A 1WW6A 5GALA 3M3EA 4GP3A 1ULCA 2TEPA 3U4XA 2YY1A 4WBCA 1SFYA 1U0AA 2NYYA 3FFZA 3FLRA 2D6NA 2XB6C 2YMZA 3FJEA 2F2FC 5F90A 1UZYA 3FJBA 4GOVA 4J2KA 2VXRA 3BA5A 4LBMA 4XMIA 1DQ0A 3VKFC 2JE7A 5GJ6A 4FGFA 4OWLA 2JE9A 1MS5A 1J0SA 4AVVA 2CNAA 1V00A 1DFCA 1TP0A 2WBCA 4FQ4A 4XJWA 1G9BA 1GICA 4ITCA 1C4RA 1BFFA 4CJMA 2ZHLA 1FYUA 1AX2A 3ZXGA 3ZXJA 1SBFA 5IK4A 3ATGA 1ULGA 1FQ9A 1Z0HA 4I4PA 3WOGA 2NMOA 4R9AA 4D0ZA 4I4SA 1BZWA 4Y24A 5DZGA 5HCBA 5DUUA 3ILNA 2ZA9A 3AXEA 4QKSA 4Z8BA 2DVGA 4Q1PA 4OEFA 4PBPA 3VT0A 2YUGA 2E7TA 5JDBA 4LBQB 4XHXA 3IIRA 1GGPB 2DS0A 2DVBA 5GZFA 4AVSA 1QNYA 1IRPA 1Y7BA 1O4ZA 1JHNA 5BQUA 4II0A 4QC4A 1ZM1A 2ZHKA 4ZA3B 4YG0A 1ULEA 4OUJA 3ENRA 3FJ9A 1S1AA 2GALA 1SR4A 4PQ9A 2D6LX 1BFBA 1H9PA 3NBNA 2A3WA 1GZ9A 3ZSMA 2FGFA 4GAFA 4H04A 1ISZA 1V6IA 1FNYA 1S0GA 4XE9A 5DZFA 1Q8VA 3DUIA 3OJBA 1LECA 3Q7XA 1NUNA 4J2YA 3TB0A 4P6AA 4GAIA 3WDUA 1Q8OA 3PMEA 1YXWA 4AGVA 3UK9A 4XOGA 4JC1A 1PUMB 4AGGA 2GNMA 4YW4A 2YZ4A 2D3PA 3P6IA 2OUJA 2VSEA 1Q8QA 4OZXA 5G00A 4LO2A 2G4IA 4LBOA 4D69A 4DRRA 3GNEA 1MS1A 1LHWA 3FLTA 1BQPA 3L2YA 3BAQA 5H9SA 1SLAA 4SLIA 1SBEA 2R1DA 1SACA 1V6KA 1TWEA 3OBRA 4RL7A 2F2FA 3DGTA 4JPZA 1WW5A 3BAVA 4Q27A 2UUSA 1GV9A 1JN2P 4EEEB 1J1TA 4M00A 3AKHA 3VSZA 1R1ZA 1G7YA 3A23A 3V79C 2UURA 4I4UA 2OW4A 2E6VA 4ASMB 5IT6A 3JUUA 3WMVA 4LBQA 1GSLA 2FHRA 4I2SA 2ZZJA 3SH5A 1LGBA 1QOTA 3SITA 2ERMA 3O5SA 1AVWB 1KDKA 5EYXA 1IS5A 1YYNA 2BQPA 3AYDA 4I37A 3I4IA 3GALA 1TIEA 3FJIA 4YZ3A 4YZ1A 4W65A 2R49A 2X2TA 1I1BA 4JCKA 2VW2A 1AJKA 3INAA 1LHUA 3P53A 2AYHA 4YG6A 2ES3A 1YBIA 4DFSA 1YI7A 5IK5A 4P0KA 2GZBA 5GLZA 3FJCA 2SLIA 1DQ2A 4CTEA 1O4YA 4ZKTB 3PVNA 2RSTA 3ZC9A 3CA3A 3AXDA 5BXRA 4I8MA 4U2AA 1C1FA 4FOQA 1XG6A 4PF5A 4GP0A 1AF9A 1Q1UA 2SBAA 2JJ6A 3BIWE 2D1ZA 3WV6A 3M3QA 4UW4A 1ZA4A 4AN7B 1Z78A 2CWSA 3N36A 2KLLA 1ONAA 3WHUA 2RHPA 3D4KA 3O49A 3SH3A 1HWPB 3RTIB 4EFRA 3V65A 3AJZA 3LTQA 5BYNA 1DQ4A 1SLTA 4YW5A 1LHVA 4XZPA 1SZ6B 2WLQA 4H9WA 4I30A 2KI6B 3WA1A 4ATEA 3ZSKA 4YM0A 2EXKA 1L2HA 4M3CA 4I1BA 4FOVA 4Q2FA 2D7FA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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