1WD3A

Crystal structure of arabinofuranosidase
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMENNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of a family 54 alpha-L-arabinofuranosidase reveals a novel carbohydrate-binding module that can bind arabinose
pubmed doi rcsb
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
total genus 154
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2004-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wd3A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1wd3A02
4FPCA 2D6OX 2OVUA 5FREA 5FRAA 2YUGA 4YLZA 4WBCA 4YW1A 4IYBA 3OBRA 3WDWA 4XTPA 3NBDA 4R9AA 3H6RA 1ONKB 3WDUA 3NJ5A 3O3QA 2GO2A 3Q7XA 4FVVA 1DQGA 3BTAA 1ILR1 4KBBA 2DV9A 3BA4A 1J1TA 5BXPA 1ISVA 2D20A 2IWTB 5DXDA 5L73A 4C1XA 4R6UB 2H0BA 3CNAA 4XJZA 4J2YA 2KI6B 4XMIA 2UURA 1GICA 4USPA 3F62B 5GZDA 4Y22B 2ZGUA 4XE9A 1OQ1A 4I1BA 1R8OA 3FUQA 1XYFA 1SLIA 4FPFA 2F2FA 1ZA4A 2XG3A 9ILBA 2FO1A 5F9TA 1GBGA 1JBCA 1FNZA 2ZGQA 1N3PA 3RTIB 2CYFA 5GLTA 4P6AA 4I30A 1V6XA 1S0BA 1SR4A 3HR9A 3MPPG 4P9YA 3AKFA 3ZXGA 4WVVA 2R16A 3VKNA 1LOFC 3CA1A 2UWAA 4P14A 4AWDA 3C2UA 3T8SA 1ISZA 1HLCA 4YG3A 2SBAA 2FDBM 3V64A 5JOYA 4J2KA 4YGDA 4XFTA 4GWMA 1VALA 2ZZJA 2ZQNA 3CAHA 2DURA 4J23B 1JW6A 1B09A 2VW0A 3E8LC 1UKGA 3WG2A 4I4OA 3BIWE 5DZFA 2ENRA 2OUHA 3SNVA 3UDAA 4P9WA 3AJ5A 3V0BB 1D0HA 3HMYA 1BA7A 4Y20A 1IS6A 3JRRA 3AX4A 3AZYA 1Z2VA 3ILAA 4IY9A 3N36A 4M3CF 2D6MA 4Q9GA 3AJYA 1WW4A 3MW4A 4LO2A 4XJUA 2NN8A 4UW6A 1QQKA 3OGFA 2PHXA 1FV2A 1SBEA 1HDKA 3B9CA 3SH4A 3WOGA 1MS8A 1N1SA 3AYEA 2VY0A 4I6IA 5GAQA 4ENDA 1QXMA 5AVAA 5EC5A 4AVTA 2ZGMA 3VWCA 2ZABA 1ITBA 1IT0A 3VUOA 1CN1A 1IRAX 4YW4A 2NMNA 1HQWA 3HBWA 3O0VA 1N3QA 1JYCA 2E53A 1SLBA 2CWMA 2ZHNA 5JMCA 1VLNA 5EYXA 5GALA 4XIOA 2AXMA 1Q8PA 1S1AA 2X2TA 1HWNB 2L5XA 3INAA 2NYYA 1S0IA 2D44A 3O44A 3AZWA 3UJ0A 3VKLA 2GDFA 4FOYA 4LO8B 4QD2C 1HQLA 4I4UA 3PMEA 1VAMA 3I8TA 1JT7A 4J2SA 4LBJA 4YW3A 1W6PA 1XHBA 4U36A 4LBOA 5T5JA 2DVGA 3KQRA 4PCRA 1BASA 3QR5A 2W39A 4Y24A 5GZEA 4LO3C 4KEJA 1ULCA 3FJ8A 4QBCA 3RTJB 4I3NA 1I1BA 2DTWA 2A6YA 3AJZA 3L2YA 1H9PA 3FLRA 4QALA 2NZ9A 1Z78A 1YO8A 1V6VA 3FGMA 3FJ9A 4G1RA 3FJAA 5BOWA 4XTMA 5BXSA 1R8NA 1ENQA 4Y1XA 5H9QA 4GOVA 3T1MA 3CA4A 5BVPI 1QKQA 1W6MA 3UJ4A 1IJTA 3A23A 3ZC8A 2ZGNA 1N1YA 1Q04A 3O4BA 1QDOA 1DBNA 3FBYA 1DGLA 5DG1A 4YM3A 2MIBA 4GOYA 4NOTA 4HJJA 1QOSA 4I4XA 3SH5A 3AYAA 5T5OA 1MVEA 3A4UA 2D3SA 2BQPA 4DEPA 1IS5A 3ZYPA 1DYKA 4BM8A 4YFZA 3W58A 4G9MA 5KXDA 4AGGA 1S0CA 3N0KA 4DRVA 4X3AA 2HW9A 1ISXA 3AYDA 1KNMA 3HN1A 5DSSB 4OEGA 1BLDA 3WDYA 4KEKA 4AN6A 1FMMS 4FPEA 4OZXA 4X38A 3AXDA 1IKPA 2YROA 3A21A 4EFRA 2A6XA 3RQ0A 1KITA 5GLVA 4CTEA 4OEFA 4Z8BA 1S0JA 4AGVA 1KQRA 1GNZA 3BOPA 1WBLA 2FGFA 3WHTA 1EVTA 3KMVA 1MS0A 3V65A 3RG0A 3BRGC 1JTCA 7I1BA 4BQ1A 3PHZA 1LULA 2VUAA 4GXLA 3O12A 4IHZA 3LCPA 3FJEA 3N3HA 3EF2A 2UUSA 1T4QA 1RINA 2Y9XE 3FJKA 1GZWB 1GNHA 1XQNA 1PZZA 2D24A 4YZ2A 3PVOA 2RHPA 3DUIA 1IILA 3LSEA 1AVWB 2JECA 1CESA 4GALA 2W52A 3AXEA 3ILRA 3FJDA 4LO7B 1LOBA 2VXRA 1ULFA 2AH2A 4R9DA 3IPVB 1V6MA 4PQ9A 1W6QA 5D62A 1G8WA 4EB2B 1CPMA 2YV8A 3H6RB 4I4YA 3CRGA 5FNXA 3M3CA 4XBLA 4K20A 1FWVA 4JRAA 2V73A 1YBIA 3T1LA 4I8MA 3POKA 3GALA 3ZSMA 2FFVA 1BFBA 3I2XA 1SBDA 3O5SA 1SFYA 4EFQA 4M00A 4Y26A 1BFCA 2FFUA 1W0OA 1RIRA 1KDMA 1XG6A 3ZSLA 3W9TA 4OWKA 2ZGOA 2GN3A 3AH4A 5FZYA 5F8WA 1YIFA 4JKXB 4AN7B 3M3QA 5DUWA 4I4SA 1PZ8A 2DUPA 2WSUA 3BAUA 2D6KA 4PC4A 1PC8B 1MZ6A 4YGEA 3BA7A 4R9CA 1HCDA 4ZFUB 1G9AA 3CRIA 3ZYRA 4TZDA 2J3PA 5E89A 2ZMKA 1F5FA 1V6OA 4GP0A 3MW3A 1DFCA 3WG1A 2A5ZA 3B00A 5BP5C 2QN4A 5EWSA 3H6SE 5F8YA 3IPVA 1PUUB 2VLCA 1MS5A 1V6NA 5GJ6A 4GA9A 4XJAA 3A0NA 3KM5A 3UK9A 1ULEA 1MC9A 1AXYA 1YYNA 1JY0A 2DYCA 3WO3A 1ISWA 4XHXA 1LESA 2PHUA 1SLLA 4XJ9A 2ZACA 1G9DA 2BEBA 3BAOA 1TIEA 2GNTA 1BFGA 3IM5A 3N7LA 1BJQA 1AJOA 4QO3A 5BQUC 3SNMA 1URXA 4FPGA 1QF3A 4KEIA 3AZZA 1AX1A 3ZXDA 3UJOA 5IT6A 1JN2P 1IOAA 1C4RA 1GZ9A 4Y20B 3UD8A 4FQZA 2OW4A 4WZFA 3WA1A 5H9SA 2WNEA 4K21A 3IN9A 3AK0A 5GLWA 4Q91A 3MALA 3OJMA 1Z0HA 4YM0A 4BMBA 1FMZA 4WVWA 4OUJA 3ZC9A 2DS0A 3IAGC 3PUBA 3ASIA 5B2HA 1DQ1A 4X39A 2E51A 4LO1C 2GALA 2E4MC 2VW1A 4YM1A 2GMMA 2PHFA 4LBLA 1IOBA 2CTVA 2VW2A 1WBCA 2Q9XA 2ERMA 1APNA 1W6OB 4FPYA 4ZBVB 2NVHA 1VIWB 3ZXLA 4L8QA 4K1ZA 5HCBA 3CRHA 4JQ0A 1BXHA 1TEIA 2RG9B 3T2TA 2WSVA 1OQLB 4ATFA 3FFZA 4XFSA 1Z4SA 4KC3A 2JD4A 2RSTA 4OW4A 3OGGA 3POWA 1V6UA 1JXNA 1QMJA 1Y7BA 2A3YA 4Y1VA 5GLUA 1CQ9A 4YZ4A 4I4QA 1O4YA 3V79C 1RZOB 1JQZA 2R9KB 1YTOA 5JOWA 4FPKA 2DVBA 1M16A 3WUCA 1QDCA 1FN0A 2EAKA 2Y9FA 5T55A 3BAQA 3K1XA 1W6PB 3TB0A 2A6ZA 4IZXA 3U4XA 1Q03A 4RL7A 3WO2A 1AZDA 1WW6A 3UL2A 1BLAA 1WLDA 2PHTA 1OKQA 3ENRA 5BXRA 4HANA 4GAIA 4OEEA 1WD3A 1G86A 2I1BA 4JKQA 3P6JA 1Q1UA 2XOAA 2UU8A 1KRIA 4XXAA 3WUDA 2NP0A 3B69A 5GM0A 2DWRA 4LO0A 3IKWA 1LTEA 1W6OA 4GAFA 2JE9A 5E24E 4D0ZA 3BRDA 1G7YA 4TLPA 2ZGTA 3CQAA 3PVEA 3A07A 2ZBJA 2ZHKA 3OYWA 4Q26A 4FOQA 2GZBA 2ZAAA 1W6MB 4P0KA 3AZXA 4ZOTA 2ZGLA 4F83A 2R1BA 1TWMA 1ULDA 1TFMB 2M49A 3P53A 2ZHLA 3BAGA 2P34A 4FPJA 1Q8VA 1HWOB 1LGCA 4M3CB 3AKHA 1IHKA 1LOGA 1MACA 1WW7A 1LOCA 2AREA 4UW4A 2ESUA 3I4IA 2UWBA 4GKYA 1JT5A 3BODA 5G00A 3SISA 4P0LA 2ARXA 3FJHA 1FX5A 3S8JA 3OBTA 2R0HA 1W3GA 1Q8QA 3WINC 1HWPB 21BIA 3PG0A 2D3PA 2D6NA 3O0WA 3WG3A 4ZFWB 1PZ9A 4ZA3B 3RS6A 1ISYA 1DQ5A 1LEDA 3FLTA 5LK5A 3VKOA 1ENSA 1V6LA 4XHBA 1S0DA 1SACA 2WLQA 2HWMA 3IM0A 4C1WA 3ZSKA 2YXSA 1AVUA 1LGNA 1IKQA 4XILA 2K43A 3FLPA 5GZFA 1FQ9A 4PF5A 2VXTI 2KKIA 2PELA 4QBVA 1LHOA 1SBFA 3CA6A 5BQUA 2CL2A 3D6EA 1DHKB 1U0AA 1DQ4A 2CWSA 1DQ0A 1W3AA 1AF9A 1SLCA 8I1BA 4LBQD 3OPZA 4NO4A 5IUQA 4ISRA 3H6QA 1X50A 3TC2A 3AP5A 4IY8A 2UWCA 4XDQA 1ZM1A 3R4UA 4M3CA 2LTNA 5DUVA 3IMNA 1CPNA 1GANA 2WBCA 3CA0A 31BIA 2A75A 2R1DA 2ARBA 4EFPA 2A3XA 1TP0A 2WJSA 4LO1A 2E4MA 3NBNA 1E0OA 1EV2A 3V0AB 4I96A 3AZVA 1LOFA 3RMYA 4I0YA 3JUTA 2P37A 4WV8A 1W6QB 3QLQA 1DFQA 1K5UA 5H9RA 3F1RA 4XFUA 2Z42A 1YRZA 2F2FC 4K1YA 4W65A 2A3WA 1DLLA 3B01A 2D43A 3RSJA 5DVHA 2YZ4A 4I4VA 4I7IA 2EIGA 2NMOA 1JUIA 4Q8LA 4Q27A 1LCLA 2EXHA 2Z48A 3OJ2A 3O4DA 1SR4C 3USUB 1VAVA 4H55A 5IK5A 3RMXA 2CNAA 3LSDA 1S0EA 5CB7A 1MZ5A 4ATEA 3O49A 2D1ZA 3WDTA 4DS0A 3SH3A 2ZGRA 3S8KA 4QD2B 1GLHA 2ES3A 1CVNA 4XBQA 2FHRA 1W3FA 5KXBA 3B3QE 5BYNA 2A6VA 4DQAA 1SCSA 5T52A 2KLLA 1H9WA 3O0XA 1QGLA 2PHWA 4JCKA 1LODA 5DUYA 4XXPA 6I1BA 2BEAA 3NBCA 3GNEA 4QC4A 1UPSA 5DUXA 1C1FA 4LBQB 5DG2A 3V0AA 3ZX7A 3N7MA 2D7IA 2W68A 2ZHMA 2GNBA 1MS1A 1QOTA 4YZ5A 2ZGSA 1HIBA 1BFFA 1RITA 2B7YA 1YI7A 4X37A 4ASMB 1WBAA 4Y1ZA 5E88A 3WHUA 3USUA 1DIWA 3BADA 4OWJA 3UD9A 2JJ6A 2DUOA 4I37A 2PHRA 4P9XA 1PZ7A 1DZDA 1F9KA 1LENA 2A6WA 3AP6A 1RMLA 4R9BA 2BFHA 4DENA 2OUJA 5F8SA 2FMDA 1H30A 4CJMA 41BIA 4G6MA 5I1BA 1I1EA 3AJ6A 3FJCA 4DPNA 3VT2A 2LALA 2WKKA 2ZGPA 1FGAA 1Q8OA 4YGCA 3Q7YA 3NV1A 2EXIA 1WCSA 4JAWA 4LO3A 1BYHA 2P3KA 1JOJA 2R0FA 4BMEA 5JLVA 1EYLA 2D7RA 5EG6C 2KI4A 4DCKC 1ABRB 1VCLA 4M3CE 3MW2A 1IRPA 2D22A 4Y1UA 4J2XA 3HALA 1F31A 4LBQA 5T50A 4F34A 1BKZA 4JC1A 1UMZA 1LU2A 3HOMA 3VKMA 3BAHA 4BPZA 2Q3NB 3VKFC 5GLZA 1UX6A 2ET2A 3VT1A 3WV6A 1MS4A 3N7JA 2K8RA 3AP7A 1TOOA 1MS9A 1WLWA 2YY1A 4USOA 4XKIA 1QOOA 1WUVA 1LHNA 2D6LX 2RQ9A 2E7QA 3UD7A 1HKDA 3O4CA 3VV1A 3CA3A 1DQ2A 2DUQA 1AVBA 3ZSJA 4HR6C 5GZCA 2P3JA 4XJ8A 1C1LA 1W6NB 2ZKNA 1GKBA 1RG8A 4CRQA 3Q7WA 3AP9A 4D0TA 1HWMB 1GV9A 5KXEA 3D4KA 1AFCA 4AYUA 2A70A 2GNDA 1RY7A 1N1VA 3LLPA 2F8XC 4DFSA 3NV3A 1SZ6B 2LIEA 2ZMLA 1QQLA 5CAZA 3JU9A 4YOLA 2WRYA 4FOWA 1JT4A 3LTQA 1SCRA 1UZZA 4Q2FA 1MR5A 4ZKTB 4HA2A 1MVQA 4IZEA 2A7AA 1UL9A 4JPZA 3OJVA 2X2SA 3FUOA 3WMVA 3A22A 4YW5A 4H9WA 3FJBA 5HCAA 1IS4A 4ISQA 1SLAA 2SLIA 2DVFA 3OYWB 4FPHA 2D3RA 3VSZA 3BA5A 2VH9A 1LU1A 1V6JA 2HZ9A 2CY6A 1WW5A 1LHUA 1BARA 1W6NA 4Y1YA 2AYHA 5EHAA 4LBMA 3M2MA 3WMUA 2Y9GA 1G82A 4Q9PA 4IQPA 2WT2A 3WDVA 1JT3A 4TYSA 4D8HA 1XZZA 4MYEA 1N4KA 2YMZA 1JLYA 3BRFA 3POYA 2DREA 1YF8B 2DRYA 1AVAC 4BLIA 1FAYA 5IK4A 4GKXA 2WT1A 3ZXJA 1PUMB 1T9FA 2VSAA 1N47A 3ZPYA 3P6IA 4Z8SB 4DRRA 3AYCA 4FOVA 2GMEA 2I2SA 3BX1C 2Z49A 2EF6A 3ILFA 4Y22A 1CONA 3A0KA 4OWLA 5T5LA 1JHNA 5BXTA 3VSFA 1CVSA 3R05A 5JDBA 3ZXKA 3QCWA 2ZMNA 2E7TA 1ENRA 4YW2A 2C5DA 1LGBA 1LJ7A 4LBKA 1P63A 3VEQA 4II0A 2HWAA 1DYPA 1AXZA 4ZFYB 3N35A 5IK7A 3FJIA 3IM7A 4XIKA 2KH2A 4GWNA 1CIWA 5GZGA 2HYKA 4Q8KA 2JDZA 1JLXA 2WT0A 4UW3A 2VSEA 1NXD1 1Q56A 1V6WA 5JVVA 4FP2A 5F90A 4L4IA 4YFWA 5KXCA 1BZWA 3WO4A 3AFKA 4XZPA 1UN1A 3I29B 3WNXA 1WD4A 1R1ZA 1S0LA 3NBEA 1G9BA 3ZXFA 2K4AB 2V5YA 1KJLA 3OY8B 2EALA 4XYXA 2NTDA 4YGBA 1N1TA 2EXKA 2GMPA 3C9ZA 4FPLA 3FJJA 2GNMA 3ILNA 4ZLBB 3V0BA 5BP5A 1GZCA 1CJPA 2AENA 2D23A 2XB6C 1CE7B 2DTYA 5EXOA 1K5VA 1HKNA 4I4RA 4AVVA 4G6JA 3AKGA 4FQ4A 3O4OA 2Y9WC 1V00A 4YZ3A 4P0JA 4GP3A 3B9UA 3OJBA 3AP4A 1AVXB 1QU0A 2VU9A 4ZGRB 5CA6A 1GYKA 4XBNA 3TAYA 4LO7C 1JYIA 3AH1A 5DUUA 4ITCA 3NV4A 3R4SA 3PJQA 1HCEA 2Q5TA 3M3EA 4UW5A 2AR6A 4BOWA 4PBPA 3D7WB 2EXJA 4YG6A 3M1HA 3IM6A 5JOZA 5JOXA 4I1EA 4QKRA 1PWAA 3H0OA 4RA0A 3OY8A 4D69A 1DQ6A 2ERFA 5FNWA 4Q1PA 5H9PA 1TWEA 1FYUA 1A8DA 3I2AA 4A7ZA 3FJFA 4XMAA 2P39A 5E8AA 4SLIA 4YM2A 2P3IA 3CA5A 4A7KA 1OFSA 3WVJA 1D2SA 4H04A 4ZXKA 3NWKA 1AXKA 2W08A 1AX0A 3IIRA 2TEPA 1Q8SA 3CU1B 4HL0A 5HPZA 2D6PA 1M2TB 4FGFA 3RRDA 1TTUA 3WDXA 1G9FA 4YG0A 1WBFA 2ZGKA 2WQZC 1KJRA 3SLIA 4I2SA 1FNYA 1BQPA 3POSA 1ULGA 1L2HA 3HSMA 3MEPA 1FATA 1LEMA 5DZUA 2JE7A 1N3OA 1V6IA 1I3HA 2LIQA 1EPWA 2AUYA 1G9CA 4IONA 3NV2A 1C57A 2C9AA 1NLSA 5SV8A 1LHWA 5IK8A 1UAIA 3ZXEA 2DU1A 4PBOA 5HCFA 4Z9WB 4U2AA 4Q1RA 2QYIB 4EKXB 1MD6A 4JP0A 4L4HA 1LOAA 3WG4A 5DZEA 3WZ1A 1NZKA 1J0SA 3WLUA 3UJQA 3JUUA 3BAVA 2MC2A 1A3KA 3N7KA 2R49A 1FV3A 3Q9OA 3WCRA 1V6KA 1II4A 4QKSA 5D61A 1YXWA 1S0GA 5D63A 2JKBA 5CNAA 1DQOA 5T5PA 3PVNA 2AFGA 3W59A 1ONAA 2KM2A 3WCSA 1A78A 4M01A 4XOGA 2E6VA 2ZQOA 1AX2A 5FZZA 1LECA 4LO2C 5F5QA 1CR7A 2ZA9A 1O4ZA 2ZR1B 3APBA 2AAIB 4YZ1A 4XJWA 2MLLB 2DRZA 1LHVA 4AVSA 1SLTA 3SITA 1KDKA 1WLCA 4LO0C 3BB2A 4I4PA 2P2KA 3AH2A 4BLJA 5FZUA 1DZCA 1NUNA 2AQZA 4CZSA 1UZYA 2DU0A 2DVAA 3O5WB 4EEEB 2DVDA 1S0FA 1AJKA 5T54A 1AXMA 3D5OA 4AGRA 2IHOA 2GN7A 1GGPB 4G9NA 4LBNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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