1WD3A

Crystal structure of arabinofuranosidase
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMENNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of a family 54 alpha-L-arabinofuranosidase reveals a novel carbohydrate-binding module that can bind arabinose
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
total genus 154
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2004-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wd3A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1wd3A02
1LEMA 4PBOA 2WT0A 4AVTA 1LCLA 1LHOA 1MS1A 4JRAA 5JOZA 4MYEA 4CTEA 4H04A 2D3RA 3OPZA 1W6PB 1LHUA 3A07A 1WW6A 3SNVA 1G7YA 4X3AA 5EWSA 3AXDA 3WG2A 3A21A 5F5QA 2ZKNA 1LOEA 1KQRA 3N7MA 1HKDA 4WVVA 3F62B 5L73A 1JLXA 5GALA 3R05A 4Z8BA 3CRHA 2R16A 1LODA 4I4VA 3ILFA 4QBVA 2EXHA 1K5UA 2NYYA 4Q26A 1WW7A 1XQNA 2ZGOA 3AZVA 2VLCA 2ERMA 1GZCA 3AKGA 1OFSA 5EHAA 3VKLA 1R1ZA 4XHBA 2JD4A 2QYIB 1T4QA 4KEKA 4YG3A 5IUQA 2D6LX 2RHPA 2ES3A 4XMIA 4Y22B 5DUWA 5BQUA 3ZXJA 3T1MA 4ISRA 1UMZA 1WUVA 1ENQA 2C5DA 1W0OA 5JLVA 3O4OA 3O4DA 1C1LA 4DQAA 2ZABA 5FNXA 2Y9FA 3FLPA 5IK5A 3QCWA 3M3EA 1V6JA 2Z49A 1SLCA 5EC5A 4HL0A 4HJJA 2E4MA 4WBCA 3N7KA 4Z8SB 4R6UB 4YZ3A 7I1BA 1QKQA 2ZZJA 1QNYA 4X39A 4G6JA 1BASA 1RZOB 2OW4A 1V6IA 1GNHA 3GALA 1CE7B 4EEEB 4PBPA 2MLLB 1WLWA 1GICA 2AUYA 2VSAA 4X38A 3W58A 1IS3A 1B09A 4Q91A 3PG0A 2E53A 4UW3A 2YY1A 3VEQA 4NO4A 4PQ9A 3AFKA 3SNMA 4ATEA 4AN6A 2CYFA 4XBLA 5JOWA 1G9CA 3N0KA 4I1BA 4DEPA 2F8XC 4FPYA 3KMVA 2VW0A 4U2AA 2EALA 3O3QA 2ENRA 4YZ1A 3WDUA 3RTIB 4I4XA 3CA6A 1RITA 5T50A 1SLLA 3AYDA 1TFMB 3O0XA 2CWSA 4WV8A 2SLIA 3NBNA 1LGNA 3RRDA 5I1BA 2K4AB 1KITA 2ZMLA 2R49A 4ZFUB 4U36A 2DRYA 2XB6C 4XXPA 1QDCA 3APBA 1FNZA 1WD3A 2ZQNA 2GN3A 4NOTA 1N1VA 1MS3A 1QQKA 4GAIA 1GNZA 4XJ9A 1V6LA 5DSSB 3AZWA 3CNAA 2WSUA 2RQ9A 1S0CA 9ILBA 4JPZA 2FHRA 3AP7A 4KEIA 2FO1A 2A6WA 1DQGA 3A4UA 4OUJA 2ERFA 2ZGRA 2DUQA 1QGLA 2RG9B 4LO3C 3WDVA 4AGRA 2DVAA 1M16A 4LO0C 4DCKC 3WHTA 3B3QE 3BOPA 2R1BA 3WA1A 1WBCA 2EXJA 2NZ9A 1MC9A 1X50A 1AVAC 3S8KA 1VAVA 1VLNA 1R8NA 2HWAA 2E7QA 4I4QA 2ARXA 1I1EA 3JUTA 1G9AA 3UJOA 1DJSB 1V6XA 3AZZA 1JN2P 4R9AA 3CA3A 3TAYA 2ZGMA 1WLCA 4JP0A 5FREA 1W6NA 4FP2A 5F8WA 4FOWA 3IN9A 1RMLA 1TEIA 1TWMA 2NP0A 3B00A 1DFQA 3N7LA 1G9DA 1QOTA 4I4PA 3OGGA 1JT5A 4R9CA 4HR6C 1TIEA 3UD8A 3HN1A 1LHVA 3LLPA 4I4RA 5F8YA 2BQPA 1U0AA 4IY9A 1ISYA 1AXKA 3FJEA 5DG1A 2A6XA 1ULFA 2D3SA 3SISA 4ZA3B 2LALA 2GNMA 1QOSA 1NLSA 4FPKA 1KJRA 3C2UA 4AWDA 2DREA 4XJZA 4XYXA 3HSMA 4JQ0A 1PZ9A 2Z42A 4JAWA 3MW2A 4YW3A 3IPVB 4XHXA 2WQZC 4Q1RA 4K20A 4YM3A 1YRZA 1GZWA 5BP5A 4XKIA 3R4UA 4QC4A 1ZA4A 4I1EA 5GLVA 1G82A 1AX1A 4LBJA 1M2TB 4FVVA 3OY8A 4Q1PA 1HWMB 2QN4A 1DFCA 3IKWA 2C9AA 2WBCA 1Q03A 2ZHKA 1P63A 2AR6A 3NJ5A 5LK5A 3AJYA 4XJ8A 4IZEA 3M3CA 1IKPA 4M00A 4G9NA 3AXEA 4UW4A 4P9WA 1QF3A 1V6OA 3N36A 5BQUC 4FPCA 3Q7XA 4K1ZA 4IZXA 4IQPA 2W52A 5JDBA 1DHKB 1W6MA 2GNBA 1OQ1A 3B9UA 1UZYA 1S0DA 3UD9A 5CA6A 1DBNA 2YMZA 2RSTA 2ZGLA 3OBRA 1N3PA 2W08A 2GMPA 3AJZA 1HQLA 2DYCA 1RINA 1CPMA 2E4MC 3MPPG 1Q1UA 4YM0A 4XFUA 1BKZA 2GDFA 2PHRA 3O0WA 1DQ4A 1LECA 2UU8A 3WO2A 1YXWA 1SBDA 2DVGA 4K21A 2ZGKA 4AN7B 3VKMA 1MR5A 2IHOA 3CU1B 5GLTA 1G9BA 4YW1A 4FPJA 4QKSA 4GWNA 2ZGNA 3QYDA 2NTDA 4A7YA 4FGFA 1XYFA 1PC8B 3EF2A 1WCSA 3WV6A 1FGAA 41BIA 3NV3A 3SLIA 3JU9A 3W59A 3OJMA 3WINA 4Y24A 3NBEA 1WBLA 4FPEA 4LO1C 4CJMA 2P3IA 3OJBA 3V64A 4TLPA 4P6AA 1AXYA 2ZGPA 1N1YA 4I37A 1FNYA 1V6KA 1LOBA 3C9ZA 1WW5A 1IS5A 1YYNA 4XJUA 1JXNA 4USOA 1FV2A 1W6QA 4DRRA 1MD6A 1Q8QA 3QR5A 4ISQA 2DUOA 2E51A 2YZ4A 5DZEA 2DS0A 5FRAA 1W6OB 3I2XA 1QOOA 2H0BA 4YGCA 3VT2A 2D6NA 1ULCA 3ZXFA 2DVDA 2HYKA 3WG3A 1S0GA 4Y20B 3ZXLA 3WG4A 2CTVA 3RG0A 3ZSJA 2NM1A 1FV3A 1GZ9A 4YZ5A 4BOWA 4GP0A 3LSDA 3M1HA 5HPZA 1FQ9A 3O0VA 1F9KA 3AYCA 3PMEA 3H6SE 4M3CB 2AH2A 1HDKA 3BTAA 1LGBA 1GSLA 5H9SA 2UWAA 3POSA 3FJAA 4EB2B 3AKIA 1EPWA 3ZC8A 4L8QA 1Q8VA 3M3OA 2HZ9A 4OEEA 3A23A 1GZWB 4P0LA 4ENDA 1GANA 4AVSA 3CA4A 2P37A 3AP9A 5HCAA 3TC2A 4XBNA 1IOBA 2VW2A 4WVWA 3BRGC 4BLIA 3UD7A 3OY8B 4W65A 5EG6C 1QXMA 5CAZA 1GGPB 1Q8PA 4OWKA 1BYHA 5H9PA 3WMUA 3T1LA 1BZWA 2KM2A 2KKIA 4CZSA 1HKNA 2EXKA 1IHKA 1ISXA 3AX4A 3Q9OA 1EV2A 3VT1A 2UUSA 2HWMA 1LOFC 1BFBA 2M49A 2ZGTA 4BPZA 1ISWA 1MZ6A 4ZKTB 1V6UA 4HA2A 2BFHA 1MS8A 4LBLA 3UK9A 4EFPA 1I1BA 4II0A 5DUYA 5G00A 5BP5C 1Z4SA 1UL9A 1C4RA 4GALA 1W6MB 4KC3A 3IM5A 3CQAA 4XTPA 3GNEA 3ZC9A 4JKQA 2JDZA 1S0LA 2DRZA 4LO2A 1JHNA 2VXRA 1RY7A 4Q27A 2D6OX 2PELA 4PCRA 1W3AA 4AVVA 3F1RA 4KEJA 3FJDA 1JT7A 3SH5A 3AH4A 3POYA 1MZ5A 1IS6A 3BRFA 3VUOA 2IWTB 4G9MA 2E7TA 1SCSA 4ZFYB 3LCPA 1UPSA 5T5JA 3BAHA 1MS5A 5DUVA 5D61A 2OVUA 2D20A 1ONAA 3ILNA 4H9WA 5JOXA 4XIKA 2D6PA 3CA0A 3ZXDA 1II4A 3FJCA 3H0OA 1SR4A 3PJQA 5CNAA 4OW4A 4LBQD 5DUUA 1AVUA 2X2SA 1O4YA 2MC2A 2ZGSA 2JJ6A 4FP3A 3ZSKA 1V6NA 3P53A 1ISVA 1XG6A 2GMEA 1AVBA 1KRIA 5GZEA 1PUUB 3IM6A 2FMDA 3FJHA 3OJ2A 4XZPA 2YV8A 2ZR1B 2J3PA 3D7WB 4I4YA 1Z78A 3PVOA 4YGEA 5GJ6A 2R0HA 1W6QB 3PVEA 1TP0A 1IOAA 1JY0A 4Y1VA 2I1BA 3N7JA 5E88A 2W68A 4XOGA 4ZXKA 3VT0A 1S1AA 4I8MA 4BM8A 4I3NA 3CAHA 3OYWA 3OJVA 2A7AA 3WINC 4F34A 4I0YA 4EFQA 1YI7A 1V00A 1TWEA 5GLZA 21BIA 1AFCA 3FJJA 1N4KA 3INAA 2A71A 1ONKB 2OUHA 2ARBA 4LO7B 3POWA 1J0SA 2A3YA 4TYSA 5GZCA 1LOCA 4BMEA 2K8RA 4JKXB 3L2YA 4QKRA 3ZSLA 1RG8A 3CRIA 5FZUA 2KH2A 3OBTA 5IK4A 3WO3A 2D3PA 3WNXA 4LBQA 1QNWA 1D0HA 1ITBA 1OQLB 3H6QA 2ET2A 2XG3A 3AZXA 2X2TA 2AXMA 2AQZA 4TZDA 4IYBA 4ZOTA 1W6PA 2A3WA 2CL2A 2Q5TA 3KM5A 2G4IA 1LESA 2NMOA 4KBBA 2HW9A 3RTJB 2D6MA 4I7IA 3I8TA 4GKYA 1S0FA 2L5XA 3HR9A 1CN1A 1ULEA 4GA9A 4LO7C 2K43A 3WDTA 1HWNB 4L4IA 4OWJA 5KXBA 4YFWA 1AZDA 1O4ZA 1V6WA 2WLQA 3U4XA 1D2SA 1TOOA 1LHWA 2NN8A 1H9WA 3ZXEA 3ATGA 1C1FA 2W39A 1N1SA 4BQ1A 1BLAA 1QQLA 4ZGRB 3WDXA 1BA7A 3A0NA 2KLLA 3O49A 1IILA 4Y26A 5D62A 2I2SA 2A6VA 2JE9A 4Y22A 1JOJA 1DQ6A 2R0FA 3O44A 1WLDA 1DYPA 4GP3A 3AYEA 3DUIA 4A7KA 1QDOA 3D6EA 5JOYA 3BADA 2ZQOA 1YIFA 1IJTA 3BAGA 5KXDA 4IY8A 3FFZA 3N35A 4JCKA 4UW6A 1HWOB 2B7YA 3NV1A 3RS6A 3UJQA 2GALA 4Y1UA 4GWMA 3BA7A 4FOYA 2XOAA 1QMJA 3RSJA 4OEGA 1ENSA 4LBKA 2WT1A 2JKBA 3BA4A 5H9QA 3BA5A 3V0AA 4L4HA 3A22A 1GLHA 1XHBA 1UN1A 2YXSA 2FDBM 5T5OA 2JE7A 3VWCA 3V0BA 3BRDA 4D0TA 4C1XA 4LO2C 4P0JA 1N3QA 3IM0A 5IK7A 1GKBA 1XZZA 3NV2A 1MACA 1JQZA 4FQ4A 2Y9XE 3JUUA 2D1ZA 4Q9GA 3E8LC 1BFFA 2DVFA 4LO0A 4XTMA 1UZZA 2FGFA 3I2AA 2GZBA 5DVHA 4M3CE 4Q8KA 1EYLA 4D8HA 3FGMA 1KNMA 2DU1A 5T5PA 3OYWB 1AF9A 4I30A 1PZ8A 1V6MA 1URXA 3UJ0A 3O12A 2KI6B 2YUGA 2F2FA 1SLTA 1LOAA 4XBQA 3AKHA 3BAOA 2KI4A 1LTEA 3FJIA 4J23B 1A3KA 1HQWA 4BLJA 2CNAA 5D63A 1FWUA 1AX2A 1CVNA 3WZ1A 5BXSA 1F31A 3WCSA 1W6NB 4EKXB 3VKNA 1BXHA 3ASIA 5CBLA 1DLLA 2P3JA 2PHTA 1HCDA 4YW5A 4F83A 4XE9A 3BX1C 5F8SA 1LJ7A 1SLAA 4LBQB 3AP6A 2D6KA 3UDAA 2JECA 3BAUA 4OEFA 3AJ6A 3O5WB 4K1YA 2D24A 4YFZA 1YF8B 3PUBA 4GXLA 1FATA 3FJ9A 1Z2VA 3N3HA 2MIBA 3H6RA 1KDMA 1PWAA 3O4AA 2GN7A 6I1BA 1F5FA 1V6VA 4XFTA 4FQZA 3VKFC 3B01A 1C57A 2ZBJA 3MW3A 1DYKA 4P9YA 2LIEA 1H9PA 1SBEA 3RMXA 3WO4A 1WD4A 4H55A 5FZZA 5E8AA 2AREA 3NBDA 3T2TA 1IRPA 3CA5A 4X37A 2DUPA 3S8JA 3IIRA 5F9TA 2DU0A 4XXAA 5BXRA 1SCRA 4XDQA 1WW4A 1W3FA 2AENA 4R9DA 2CWMA 2GNTA 4I4SA 2NVHA 2E6VA 1Q8OA 5H9RA 3ZYRA 1IT0A 4Y1YA 4ATFA 4ZLBB 3I4IA 1Q8SA 4YGDA 5BVPI 1YO8A 3VSFA 4OZXA 5HCBA 4USPA 2AFGA 3VV1A 5BXPA 1E0OA 1CIWA 1DQ2A 1DQ1A 3ZVXA 4GOYA 3IPVA 2YROA 2VY0A 4CRQA 4QBCA 1DQOA 5BXTA 1FAYA 4I96A 2LIQA 3VSZA 5FNWA 1LULA 3FJKA 1JT3A 3BB2A 3AH1A 5GLWA 3HOMA 5DZGA 1WBAA 4YGBA 1IRAX 1Q04A 2ZACA 2A70A 3LTQA 4PC4A 2DURA 1JBCA 5B2HA 1MS4A 1AJKA 3V65A 4C1WA 1OKQA 1JW6A 1CQ9A 1FMZA 4J2KA 1PUMB 2R9KB 1DQ5A 2D7RA 2PHFA 4Y1XA 1G86A 2UWBA 4R9BA 3V0AB 2ESUA 1SZ6B 4FPHA 3AK0A 2AGSA 4P9XA 5E89A 3ILRA 3TB0A 4IONA 4G6MA 4ASMB 3V0BB 1HIBA 3AH2A 3NV4A 1RIRA 1CPNA 5KXCA 1FN0A 4D69A 4QD2B 3WG1A 1CESA 1FX5A 4I6IA 1SLBA 1NZKA 3USUA 1ULGA 1BFCA 4ITCA 1HWPB 1FMMS 2NMNA 3AKFA 4LO1A 4I4UA 4Q8LA 4GKXA 3UL2A 3FUQA 31BIA 4SLIA 2A75A 2GO2A 3O4BA 5JVVA 2FFUA 2LTNA 4XIOA 4GAFA 1H30A 1Z0HA 4FPGA 4XILA 1JT4A 1SACA 2BEAA 1LOGA 1LGCA 3FLTA 1VIWB 5CB7A 2Q3NB 1Q56A 1ULDA 3WCRA 4XFSA 2PHUA 1JTCA 3O4CA 5BOWA 2ZGQA 2Y9WC 3B69A 1A8DA 1MVEA 1DZQA 2VH9A 2A3XA 3K1XA 4YZ4A 4QD2C 1UAIA 5DXDA 4LBMA 2WJSA 4DS0A 1IS4A 1IKQA 2AYHA 2VUAA 3R4SA 4I2SA 3MALA 2DTWA 3UJ4A 1FWVA 3CRGA 1CR7A 4RA0A 1JUIA 2FFVA 4YM1A 3FLRA 1TTUA 4BMBA 4YW2A 2WNEA 2V73A 5GAQA 3ZPYA 1LU1A 1W0PA 2WSVA 3JRRA 3IM7A 2EXIA 4FPFA 2A5ZA 5T52A 4XMAA 5GM0A 1GYKA 3WUDA 2GNDA 4AGVA 1BARA 5T54A 2UURA 3AP5A 2OUJA 4P14A 3H6RB 2DVBA 4LBNA 3HBWA 2ZMNA 1A78A 3A0KA 1MS9A 2F2FC 1LENA 4FPOB 2P3KA 3ZSMA 1YBIA 3BIWE 3D4KA 4FPLA 3AP4A 5T5LA 3SITA 1W6OA 3QLQA 1AJOA 5GZGA 5GZDA 4XJAA 4A7ZA 2WKKA 3O5SA 1JYIA 2P23A 1G9FA 4Y20A 1N1TA 1BJQA 3M3QA 3BAVA 1S0IA 2D23A 5F90A 1NXD1 3OGFA 1UX6A 3P6JA 3POKA 4D0ZA 4M01A 1SFYA 3WOGA 2V5YA 3V79C 4J2XA 2VXTI 1LEDA 3ZX7A 4DPNA 3CA1A 1LU2A 5FZYA 1PZ7A 3WHUA 2D7IA 4YZ2A 4M3CA 4Y1ZA 5DG2A 3W9TA 4HANA 5BYNA 1LOFA 1MS0A 4DFSA 1Y7BA 3P6IA 3Q7YA 1K5VA 1L2HA 3I29B 3AJ5A 3RQ0A 1AXZA 3WDYA 3ZYPA 3Q7WA 2WT2A 1HCEA 1GV9A 3IAGC 4QALA 5IT6A 4YG0A 2ZHMA 4M3CF 2EAKA 4GOVA 4YM2A 1JYCA 4PF5A 5GLUA 2ZHLA 2ZAAA 4LO8B 4IHZA 1UKGA 2CY6A 1EVTA 2AAIB 4LBOA 3FBYA 1ILR1 2A6YA 4YG6A 1ABRB 3NBCA 3M2MA 4ZBVB 1BLDA 2R1DA 1LHNA 2VW1A 1KJLA 2DTYA 4AYUA 5AVAA 4EFRA 3FJFA 3ENRA 3HALA 2ZHNA 5EYYA 1PZZA 3SH3A 3AZYA 5DZFA 2UWCA 3KQRA 2EIGA 3WLUA 2EF6A 1HLCA 1N47A 2GMMA 3WMVA 1CVSA 4RL7A 1APNA 3USUB 4J2SA 2P39A 3ZXGA 1AVXB 3NWKA 2P34A 2VSEA 3MW4A 1N3OA 5T55A 4FOVA 4J2YA 2PHWA 1S0JA 1CONA 5GZFA 3FJBA 2A6ZA 2Q9XA 1WBFA 1AX0A 1DQ0A 1AXMA 2D22A 3ZXKA 1ENRA 4AGGA 3IMNA 1KDKA 3PVNA 4YW4A 4I4OA 3ILAA 4WZFA 3B9CA 2Z48A 1GBGA 2SBAA 2DWRA 8I1BA 1R8OA 5DZUA 2Y9GA 5IK8A 2D7FA 1VAMA 1S0EA 3PHZA 4JC1A 3DGTA 4DRVA 4G1RA 4LO3A 3VKOA 5KXEA 1S0BA 4DENA 3WVJA 1I3HA 4OWLA 1CJPA 2VU9A 2BEBA 4ZFWB 2WRYA 3T8SA 1SLIA 1MVQA 3WUCA 5EXOA 2ZGUA 5E24E 1J1TA 3SH4A 1AVWB 3WDWA 4YOLA 1BQPA 3BODA 5SV8A 4Q9PA 1SBFA 4Q2FA 3BAQA 4QO3A 5HCFA 1FYUA 1DZCA 1QU0A 4Z9WB 1NUNA 1DGLA 1SR4C 1ISZA 1VALA 3FJ8A 3AYAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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