1WD3A

Crystal structure of arabinofuranosidase
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMENNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of a family 54 alpha-L-arabinofuranosidase reveals a novel carbohydrate-binding module that can bind arabinose
pubmed doi rcsb
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
total genus 154
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2004-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wd3A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1wd3A02
1N1VA 1X50A 3O12A 4OZXA 1JT7A 2E6VA 1PWAA 2FFVA 1XG6A 4CJMA 3FBYA 1DQ6A 2ZGPA 4YFZA 3E8LC 1C1LA 3CRHA 3LTQA 3BAHA 4XFSA 3POWA 3D5OA 1LESA 3AH4A 1ONAA 1V6MA 3OGFA 1DQ1A 1MACA 2E53A 4FGFA 3IM0A 4P9YA 3PMEA 5DG2A 4NO4A 2AENA 2AYHA 5DZFA 3V0AB 3NBNA 4OW4A 4YM3A 3VKNA 1MS1A 1WD3A 1D2SA 3VV1A 1AX2A 4M01A 4CTEA 4G6JA 4TZDA 4XJAA 5HCFA 1ISXA 5GM0A 2QN4A 4YZ2A 3AZZA 4YGEA 2AH2A 4XDQA 2D7RA 1W3GA 2CL2A 4KC3A 4K20A 1WBFA 5BYNA 3T2TA 1JYCA 5EYYA 4AVTA 1ULDA 3RQ0A 4R6UB 4XTPA 4YM0A 3MW3A 5JVVA 2RG9B 3O44A 4P0LA 3OBTA 2VSEA 1AJOA 1LOEA 1YXWA 3IAGC 4EFPA 3M3EA 2DUOA 4KBBA 3SH3A 5IUQA 3AJYA 4Q9GA 3UJ4A 4X38A 4GP0A 1FWVA 2WKKA 2K4AB 5BXSA 1FX5A 3AH2A 3WO2A 4EFQA 3N7MA 4GP3A 1GLHA 3UD8A 4I96A 5T52A 1JHNA 2D6OX 1DQOA 2DVGA 5DSSB 1LENA 3KMVA 1TTUA 1GANA 1FATA 4ZXKA 1U0AA 2DTYA 1S0CA 3OJMA 3DGTA 3V65A 3O4AA 4GA9A 1FGAA 4FP3A 1IOBA 3IM6A 1V6IA 3O4DA 5H9PA 3AX4A 4KEJA 3IM7A 2VSAA 1VAMA 4L4HA 2ZHMA 3I8TA 3R4SA 1SACA 1A3KA 2P23A 3AKIA 5GAQA 3OYWB 1IS6A 1CN1A 1EYLA 4XKIA 1C4RA 1ISYA 2IHOA 2YROA 1GYKA 2SLIA 3M2MA 1TIEA 4J2KA 1SCSA 2RSTA 4R9CA 4OEGA 4G1RA 2GMPA 1FAYA 3BAVA 1R8NA 5DUUA 2Z42A 2P39A 5KXBA 1URXA 3TB0A 4WVWA 2VLCA 1AXYA 1XZZA 3WNXA 1CJPA 3SH4A 1KDMA 3FUQA 4YZ4A 3PVOA 3A0NA 1JN2P 4EEEB 4YW2A 2CWMA 3FUOA 1HQLA 4Q27A 1W6MA 2BEBA 2R9KB 1LHVA 1LHWA 5F90A 3BOPA 4XILA 2DWRA 2GNMA 2E4MC 2AUYA 1AZDA 1GICA 5CA6A 2HZ9A 4LO0A 1DHKB 3AKHA 3WDUA 4XBLA 4IQPA 2A5ZA 1GZCA 3AP7A 2D3SA 1HLCA 3CA0A 4YW4A 4USOA 1UPSA 1ABRB 5DZUA 1S0DA 2ZHNA 3AYDA 4I4YA 3WDVA 5D62A 4FVVA 1QKQA 4BLJA 3H6SE 5GLZA 4Y1VA 2B7YA 1IILA 2M49A 4LO8B 5GZDA 2VY0A 2FGFA 3UJ0A 2E7TA 3VSFA 1CE7B 5BVPI 3WINA 3VT1A 1CQ9A 1WLWA 1G9AA 2D23A 1JLYA 2WNEA 3HMYA 3FJEA 3O4CA 4QD2B 4JC1A 1R8OA 4I2SA 1MZ6A 1ULCA 3AP4A 1OQLB 4D0TA 3V0BB 1JY0A 3AZWA 2GMEA 1WD4A 2ZGOA 3FLRA 5FREA 5GLWA 4Y1YA 3I29B 1N3PA 3RTJB 4D0ZA 2WT2A 5SV8A 4XFUA 2W08A 3S8JA 2AFGA 2WBCA 2UUSA 4I4VA 3D6EA 4I30A 2ERMA 3D7WB 2LTNA 2R49A 5E88A 2R1DA 5DZEA 3HN1A 1NLSA 1F9KA 3ZSJA 5BXTA 4TLPA 4FPYA 2ARBA 4EB2B 3O3QA 3FFZA 1SLIA 4QC4A 4YZ3A 2F8XC 1PC8B 4IYBA 4BMEA 3RMYA 4LO2A 4Q1PA 4DENA 1S0GA 3AP6A 4IHZA 3BADA 2KM2A 1UMZA 1HWMB 4Q26A 2VH9A 4Y22B 4YFWA 5JLVA 2D43A 1MD6A 1I1BA 3AJ6A 3TAYA 1HDKA 2YMZA 1FYUA 4LBNA 1JOJA 3APBA 3QYDA 4I4OA 1KNMA 4KEIA 2NMOA 1BJQA 4Q8KA 4QALA 1BASA 2SBAA 5F8YA 1GZWB 1BFBA 2A3XA 3QR5A 4IZEA 4I37A 1W6QB 3ZC9A 1S0LA 4AVVA 4UW4A 5FRAA 3T1MA 5DUWA 1APNA 2ENRA 1ULFA 2G4IA 2V73A 4WZFA 1WUVA 2D7IA 4ZFUB 4J2XA 5IT6A 3HALA 2R0HA 1HQWA 1SBEA 4GOYA 1AVWB 1W6OB 5BOWA 2E51A 1GSLA 3WG2A 4ZKTB 1TWMA 3AH1A 3GNEA 1LOCA 3USUA 3ILNA 3M3OA 1IKQA 1W6PA 1MS5A 4D8HA 3NBDA 1SBDA 3MW4A 3ZXJA 3FGMA 4LBQA 3OGGA 4JP0A 3VWCA 5DUXA 2ZGUA 4EFRA 3V79C 1SCRA 2CY6A 3UK9A 3PHZA 2W39A 4CZSA 4WV8A 1SLTA 3WCSA 1CIWA 5JOZA 4ZFWB 2NN8A 3AYAA 1W6NB 2DU1A 4I4QA 2P34A 1YTOA 1M16A 1JYIA 4ISQA 4IY9A 1PUMB 5BP5A 2D6MA 3VKOA 5KXCA 3WA1A 3KQRA 3RTIB 1LULA 1W0PA 3BODA 1DYKA 3FJAA 1VLNA 4PBOA 3V0AA 4ATEA 2DRZA 1BLDA 5EXOA 4FP2A 1C1FA 3CA3A 3ILAA 3OY8B 3P6JA 1G8WA 2I2SA 2VUAA 2ZGQA 3A23A 2YUGA 2AQZA 3OPZA 1LCLA 2ET2A 2Q5TA 4AN7B 2P37A 3A0KA 3CA1A 2A6YA 4I4XA 1DQ0A 2Y9WC 3INAA 4XJ8A 2DURA 4EKXB 3N3HA 2JE9A 4LO7B 5JOWA 1KITA 4FQ4A 1IHKA 1Q8QA 4ZA3B 2ERFA 3FJ9A 1MVQA 1N3OA 1KDKA 4LO7C 1B09A 1DFQA 1WLCA 3FJBA 4AGGA 3SH5A 5CNAA 1Z2VA 4PCRA 4BMBA 2K43A 1DZDA 4I3NA 5D61A 3ASIA 3NV2A 1BQPA 4XBQA 4M3CB 1HKNA 3W59A 1FQ9A 3B9UA 2E7QA 3H6RB 3AP5A 4XJZA 3W58A 1BFFA 5CBLA 5CAZA 5GZFA 2JDZA 1Z78A 1YI7A 3OJ2A 5G00A 1LOGA 4XJWA 2TEPA 5HPZA 4GXLA 2GO2A 1XQNA 3TC2A 4P6AA 3ZSLA 41BIA 1V6VA 2ZHLA 4C1XA 4BOWA 4FPLA 1GZ9A 3AKFA 3WCRA 3N7KA 3OYWA 3VT0A 1UX6A 5EWSA 1Y7BA 1QOTA 2NVHA 4Q1RA 5DG1A 2F2FC 2HWMA 3WMVA 1KRIA 4DEPA 3WZ1A 5E89A 1V6KA 1RZOB 3BA5A 3ATGA 1WLDA 1HWPB 1CPNA 1JLXA 1QNYA 1AVBA 5F9TA 2P3KA 1GGPB 4LBMA 5H9QA 4LO3A 1AVAC 2A75A 5EYXA 3ZSMA 4P0KA 4OEEA 3N35A 2RQ9A 2PELA 5T5PA 5EG6C 3W9TA 3ZX7A 4AGVA 1FV3A 3N36A 1WW5A 4BQ1A 1BARA 4K1YA 2W68A 3BTAA 3SNMA 2OW4A 4IONA 5FNWA 1S0JA 1LGCA 2EXKA 1VAVA 1JT5A 3ZXEA 4F83A 3BB2A 4I7IA 2A6XA 4ENDA 1UZZA 1VALA 3ZXFA 1JT4A 3C9ZA 3T8SA 2ZABA 4I4RA 4AN6A 1LU1A 1UAIA 4FOVA 4I1BA 3CRIA 1DQ5A 3QCWA 4LBLA 2HW9A 4FOYA 4YW3A 2BFHA 3JUTA 5GLTA 1SBFA 4JAWA 2UWAA 5D63A 4Y1XA 4FPGA 1BYHA 2C5DA 4Z8SB 2MIBA 1Z4SA 1D0HA 3Q7YA 4DPNA 2ZMNA 4OWKA 2D7FA 2EIGA 2WT0A 1XYFA 3CU1B 4UW6A 8I1BA 3P53A 4ASMB 1KQRA 4YM2A 3SNVA 1RG8A 5IK4A 1CONA 4G9MA 4K1ZA 1JW6A 3NJ5A 3I2XA 3WUDA 4SLIA 1DQ4A 1YIFA 4I0YA 3POSA 3OBRA 1EPWA 1Q8PA 4LO1A 3AKGA 4II0A 1QQLA 4YGCA 4QKSA 4UW5A 5T5JA 2BEAA 1I1EA 1ISWA 5JMCA 1JT3A 4ZOTA 4XHBA 1N1YA 3WDTA 3ZXGA 2ZBJA 2DREA 2D6NA 3CA6A 3WMUA 3EF2A 4L4IA 3AYCA 1AX0A 4BLIA 4X37A 1QF3A 5FZYA 1SLLA 3CAHA 1MS8A 1Q56A 1ULEA 3UJQA 2R16A 1DZQA 1SR4A 1GKBA 1WBAA 2A6WA 2QYIB 2JD4A 1G7YA 2PHUA 2A6ZA 3AJZA 3C2UA 2ZHKA 4P14A 2D3PA 21BIA 4FPHA 3BAGA 2ESUA 4XZPA 1DGLA 2UU8A 3NBCA 3N7LA 4USPA 3BRGC 3PUBA 2D24A 1GZWA 4H55A 2EAKA 1LHUA 2UWBA 1W6QA 1Q04A 2UURA 4DQAA 4DFSA 1YYNA 1V6UA 1WCSA 2VXRA 2NZ9A 3PVEA 1YBIA 5BQUA 3O0WA 1BA7A 4CRQA 1II4A 1ENQA 2VXTI 1V6JA 2Z49A 3FJFA 2XG3A 1GNHA 2L5XA 3HR9A 1V6XA 5LK5A 2WJSA 1QOOA 4M3CF 2CNAA 1WW6A 3CQAA 1NXD1 5T5OA 3VSZA 4X39A 4DRRA 5GLVA 1LGNA 3F62B 4ZGRB 2VW1A 1G9BA 2XOAA 3AK0A 1CR7A 5GZEA 1S0IA 3D4KA 3NV4A 4LO0C 4YGDA 3VKFC 1WBCA 4FPFA 1DZCA 5JOXA 1HIBA 1WW7A 2AGSA 3N7JA 1G9DA 1ENRA 2P3IA 5DXDA 1WBLA 4YLZA 4FPJA 3FJKA 1IRAX 1YO8A 3NV1A 1TEIA 3Q7XA 1ENSA 2WT1A 2ZQOA 2VU9A 4I1EA 3WINC 2NMNA 2R0FA 3A21A 4YGBA 3BIWE 1SLCA 3VEQA 3IM5A 2AR6A 4G6MA 2LALA 1LOBA 4LBKA 1OQ1A 1VCLA 3AZVA 3FJCA 3SISA 3N0KA 3O4OA 2OVUA 1AVUA 3ZXLA 1LOFA 2DTWA 1FN0A 3WOGA 3PG0A 4AYUA 1LHNA 3OY8A 1QXMA 4GWNA 1LJ7A 4QO3A 2ZMKA 4D69A 5FNXA 3I4IA 4XJ9A 3T1LA 1Q8VA 4Z8BA 1Q8OA 3FJDA 1P63A 4RA0A 4XTMA 4FOWA 1CESA 2A3YA 4I4UA 1OKQA 1MVEA 4Z9WB 3AZXA 4XIOA 5T54A 1SLBA 3LSDA 1ITBA 4LO2C 2FDBM 1LU2A 1N4KA 2PHRA 3IKWA 1VIWB 2ZKNA 4M3CA 4GKYA 2K8RA 4J23B 4J2SA 2AAIB 5CB7A 3H6RA 3VT2A 4ZBVB 2A3WA 3ZVXA 1DQ2A 3V64A 2YY1A 1BXHA 5DVHA 1LEDA 3WVJA 1BZWA 1DIWA 4MYEA 1FNZA 4Y20B 3AZYA 1LHOA 5AVAA 3HOMA 4I6IA 5GZCA 4YZ1A 1QGLA 3SITA 4JPZA 1O4YA 1BLAA 1NZKA 3BAQA 3BAOA 2CTVA 1V6NA 1Q8SA 1QU0A 1HCDA 2ZZJA 4XHXA 2VW0A 1JUIA 1YRZA 2XB6C 2ZACA 4Q91A 1H9PA 4TYSA 3IPVB 1JBCA 2DVBA 2PHFA 3A07A 1G86A 5IK5A 3USUB 5B2HA 3UJOA 1W6PB 1UKGA 4RL7A 1V00A 2DS0A 1C57A 3M3QA 4FPEA 4Q2FA 2Q3NB 2A6VA 4OUJA 5IK7A 1SFYA 3PJQA 3B9CA 2ZGMA 3FLPA 4Q9PA 2OUHA 1V6WA 5BXRA 1RMLA 2DVFA 2P3JA 2KH2A 1LOAA 2ZMLA 1ISZA 2BQPA 1PUUB 2FMDA 9ILBA 2AREA 4QKRA 2ZA9A 4LBJA 2R1BA 4NOTA 1Z0HA 5GJ6A 2ZGNA 2DRYA 1G9CA 3FLTA 1RY7A 4Y24A 5BP5C 6I1BA 3WG1A 3B01A 4Y1ZA 2PHTA 3SLIA 4XE9A 3WDXA 4M00A 4ISRA 2JECA 3H6QA 3WDWA 2KLLA 1Q03A 1HWNB 4HR6C 1K5VA 3NBEA 2FHRA 5E24E 4FOQA 5GALA 1S0EA 2EXIA 3O0XA 4XIKA 1W3FA 3HBWA 2D3RA 1W3AA 3WHUA 3MEPA 2DVDA 2P2KA 2WRYA 3O5SA 3IIRA 1RIRA 2EXJA 1EVTA 1UL9A 1F31A 4PQ9A 2ZR1B 3AP9A 2ZGLA 2FFUA 3P6IA 3CA4A 1DYPA 3ILFA 2KKIA 2E4MA 1RINA 1SZ6B 4XMAA 3WDYA 4IZXA 1GBGA 3AJ5A 1FMZA 3Q9OA 4GALA 3MALA 4A7KA 4YOLA 4FPCA 3BRFA 3HSMA 5H9SA 2JKBA 3POYA 1PZZA 3CRGA 3S8KA 4HJJA 4FQZA 3BA4A 3U4XA 1GNZA 1ONKB 2X2SA 1CVNA 1A8DA 4XFTA 1W0OA 3POKA 4DS0A 4OWJA 3JUUA 1AJKA 1FWUA 1JQZA 3F1RA 1LTEA 4GKXA 1UZYA 1DBNA 3JU9A 1IT0A 3BX1C 3RRDA 2A70A 2ZAAA 1JXNA 3AXDA 4YW5A 4QBVA 1KJRA 1PZ7A 1T9FA 5EHAA 3V0BA 3ZXDA 1GV9A 3O4BA 4AWDA 4Y1UA 4XMIA 4GAFA 4FPKA 2D44A 5E8AA 4GAIA 4HL0A 5T55A 3NV3A 1UN1A 1AF9A 4A7ZA 4YG6A 2LIQA 2ZGTA 2GDFA 3O5WB 1BKZA 4HA2A 1AFCA 3AFKA 4C1WA 5DUVA 3L2YA 1ZA4A 2DUPA 2D20A 2OUJA 3RMXA 4P9XA 3I2AA 3H0OA 3BA7A 2D1ZA 1NUNA 2GN7A 3R05A 2D22A 4GOVA 1QMJA 4Y26A 2PHWA 1N3QA 2NM1A 1DLLA 4FPOB 4J2YA 4LO3C 2ZGRA 1DQGA 2FO1A 4BM8A 2CYFA 5L73A 2DVAA 2A7AA 4JCKA 4XYXA 1XHBA 3B00A 2UWCA 1QDOA 1J1TA 2Z48A 4Y22A 4YM1A 1PZ8A 1IS3A 3WO4A 1H9WA 1MC9A 1OFSA 1LECA 1QOSA 2KI6B 1KJLA 3RSJA 3PVNA 1IKPA 3WHTA 2GZBA 3WV6A 4OEFA 2X2TA 4JKQA 4YW1A 5T5LA 3WUCA 4ZLBB 2GNTA 5HCAA 3FJJA 5DUYA 3UD9A 2YZ4A 4XXPA 4LBOA 2ES3A 2RHPA 2GMMA 1ULGA 3KM5A 3LCPA 3R4UA 2DU0A 4QD2C 2LIEA 1N1SA 5JDBA 1MS0A 1RITA 4A7YA 1S1AA 1N47A 4YG3A 1FV2A 5KXEA 1AXMA 2W52A 1FMMS 1HKDA 1BFGA 1V6OA 3RG0A 1V6LA 1QDCA 2ZGKA 4DRVA 1W6MB 31BIA 4QBCA 2DV9A 2JE7A 1W6OA 3DUIA 4HANA 4R9DA 5F8SA 1LEMA 1CPMA 1S0BA 4LO1C 1AXZA 2Q9XA 5IK8A 1T4QA 5JOYA 1MS9A 1AXKA 4ATFA 2WQZC 1K5UA 4XOGA 1G9FA 1LGBA 5HCBA 3B69A 4GWMA 3LLPA 2DUQA 4UW3A 4IY8A 3ZC8A 1SLAA 3NWKA 4OWLA 1O4ZA 3B3QE 3ZSKA 2Y9GA 4H9WA 5GLUA 2GALA 4P0JA 5FZUA 2NYYA 2WSVA 1DJSB 4M3CE 1W6NA 1SR4C 3AXEA 4U2AA 4AVSA 2D6LX 4L8QA 3FJ8A 2AXMA 2A71A 1H30A 3LSEA 2ZQNA 2D6PA 3FJIA 5F5QA 3MW2A 1ILR1 2I1BA 4WBCA 3CA5A 2VW2A 3IMNA 1BFCA 1WW4A 1AX1A 4Y20A 1TWEA 3VUOA 1MR5A 1MZ5A 3M1HA 3ZYPA 4X3AA 3Q7WA 1MS3A 1PZ9A 4YG0A 2PHXA 1F5FA 4DCKC 3IN9A 1IOAA 5BQUC 4Q8LA 4JQ0A 2ZGSA 1ISVA 3ZYRA 3IPVA 3CNAA 2YXSA 2J3PA 3ENRA 3OJBA 3UDAA 1I3HA 2HYKA 4F34A 1IS5A 3VKLA 3WLUA 3AYEA 4XBNA 2WSUA 3VKMA 4ZFYB 1N1TA 5EC5A 4P9WA 2IWTB 1DFCA 2GNBA 4KEKA 1TP0A 4BPZA 4JRAA 1QNWA 4U36A 2DYCA 3BAUA 4R9BA 3OJVA 1R1ZA 1M2TB 3MPPG 5FZZA 3BRDA 1TFMB 1AVXB 4I8MA 3ZPYA 4R9AA 1YF8B 3ILRA 3QLQA 2NTDA 1QQKA 4XJUA 1ZM1A 4H04A 5F8WA 4I4PA 3ZXKA 3UL2A 3JRRA 2JJ6A 1EV2A 1HCEA 1Q1UA 1JTCA 2EALA 2CWSA 4AGRA 5DZGA 4XXAA 1FNYA 2Y9FA 4PC4A 5H9RA 5KXDA 4K21A 3O49A 3GALA 2F2FA 1E0OA 2GN3A 2Y9XE 3M3CA 1G82A 1A78A 1LOFC 1S0FA 2YV8A 3K1XA 3A4UA 5BXPA 3O0VA 1IS4A 2C9AA 2NP0A 1TOOA 3WO3A 3WG3A 7I1BA 4LBQD 2MLLB 3RS6A 4I4SA 2EXHA 2H0BA 2KI4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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