1WD4A

Crystal structure of arabinofuranosidase complexed with arabinose
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMENNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of a family 54 alpha-L-arabinofuranosidase reveals a novel carbohydrate-binding module that can bind arabinose
pubmed doi rcsb
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
total genus 157
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2004-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wd4A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1wd4A02
1I1EA 3BA7A 3WINC 3I4IA 4Y22B 1PZ9A 4XMAA 4Y24A 3BTAA 2A71A 3BA5A 3VKMA 1GZWA 4OW4A 1F9KA 4QBCA 2EALA 4YFZA 1LOBA 2KM2A 1V00A 2AYHA 1AVBA 1IOAA 3WUCA 3M3QA 2D1ZA 1A78A 2FGFA 4I4XA 3BIWE 4CTEA 1SLBA 3O0VA 3MW2A 4OEEA 2BFHA 1WUVA 3NBEA 3NBDA 3ZXFA 4G9MA 2EIGA 4FQZA 3HN1A 2D43A 4ZLBB 4KEJA 4IY9A 3FJAA 5EC5A 2Q9XA 3AKIA 1A3KA 1SLTA 3WG1A 3AJ5A 2AAIB 1AJOA 1RMLA 5H9SA 1WBCA 2XG3A 2DUQA 3OYWA 4LO3C 1Q8OA 1XZZA 2DUPA 4FPJA 1HCDA 1W6NA 2SBAA 2J3PA 1JXNA 4CJMA 3BA4A 5BYNA 3SNMA 5DG1A 3O5WB 5LK5A 1TTUA 4YZ4A 1W6MB 3ZVXA 1ULDA 2DVGA 1R8OA 3CA1A 1BJQA 3AYEA 2K8RA 2XB6C 3O49A 4DEPA 2HWMA 3C9ZA 5GZFA 3CRHA 1GV9A 3ZC8A 1KJRA 2D20A 1U0AA 4M3CB 3ASIA 3PVNA 1LOCA 5GM0A 1MS1A 4J23B 2GDFA 3R4SA 2A3YA 1Q04A 3H0OA 2GNBA 1JQZA 1KDMA 2PHXA 3FJDA 2P37A 1CONA 3IM0A 4I0YA 3FJJA 1LJ7A 1QU0A 1J0SA 1AXKA 1WD3A 2A6YA 4FOQA 1AVUA 3ZSMA 1NUNA 7I1BA 2UUSA 2VSEA 3USUB 1N1VA 3AP5A 2ZGRA 2ARBA 1FX5A 1A8DA 3WO3A 5T54A 1S0BA 3A21A 3M3CA 1D0HA 1WBAA 3VKFC 2DVFA 2GO2A 5IK8A 2UWAA 1I3HA 1HLCA 2P34A 4XHXA 2UURA 2B7YA 4QC4A 4YM3A 1NLSA 2Y9GA 3NV4A 3FJ8A 2OVUA 2P3KA 4W65A 4PC4A 3ZXLA 1TEIA 1CVSA 1G8WA 3K1XA 2WT1A 3WINA 1P63A 3WDVA 1VLNA 5D63A 3AYCA 4I4YA 3H6RB 4DRRA 5JOZA 1Q8QA 2VLCA 1O4ZA 1G7YA 3V79C 1VAVA 1CPMA 1IRPA 1V6IA 1KJLA 2KLLA 2VSAA 4IY8A 1HKDA 3ZXKA 1G86A 2JD4A 4UW3A 1TWMA 4GXLA 1DZDA 2Z48A 1MS9A 3FFZA 1DQ2A 1FQ9A 4FPLA 2PHFA 4Q9GA 3UDAA 3JRRA 1H30A 4I7IA 3IPVA 1TWEA 3BAVA 1AZDA 1Q8SA 1FV3A 3N7KA 1WLCA 3N36A 1LESA 4GKXA 1C4RA 8I1BA 4AGRA 4BOWA 1N3PA 4LO1C 2YROA 3O0WA 1WD4A 1ISVA 1JTCA 5F8YA 4KC3A 4NO4A 1ISYA 3N35A 2CY6A 1GNHA 3VUOA 3MALA 3UD9A 1S0IA 2NZ9A 5DUUA 2DS0A 3RS6A 2RG9B 2ZGSA 4P9YA 3CA0A 1V6MA 4ZFYB 1JUIA 1UPSA 4PBOA 1W6QA 4XJZA 1RITA 5GLVA 1SFYA 1C1LA 4XBLA 3FBYA 1LECA 2A7AA 1UAIA 1GANA 1C57A 1UKGA 4OWJA 3LLPA 4ATEA 3BODA 2VW1A 4A7ZA 4Q2FA 4KEKA 3AH4A 4F83A 3AYDA 3O5SA 3GNEA 4Z8BA 2A3WA 3IIRA 3SH3A 2RSTA 5FZUA 1CN1A 3D5OA 2WT0A 1ISWA 2D3RA 4FP3A 1GSLA 1LENA 1D2SA 5G00A 3IM7A 2WKKA 3AH2A 31BIA 4L4HA 5CNAA 1UMZA 5GJ6A 3AXEA 4Q8KA 3O0XA 4BM8A 3WO4A 2D6NA 2E7QA 3OBRA 3A4UA 2ZGLA 1DHKB 4QBVA 5BXSA 1LULA 4I8MA 3ZSJA 1ONKB 3NWKA 3A22A 1NXD1 4G6MA 2ZMKA 3BAQA 5FZZA 1LGNA 4XYXA 4I2SA 1QNWA 4AWDA 1V6WA 5JOWA 1II4A 3CA5A 5L73A 3N7LA 5T5PA 2JE7A 4FVVA 2TEPA 3NBCA 2CYFA 4P0KA 4WBCA 1JYIA 3WMVA 1YIFA 1XG6A 1LEMA 2HYKA 2FFUA 2GNMA 4BLJA 5JDBA 3UD8A 2VUAA 4GA9A 2D6KA 2R9KB 2NP0A 4EKXB 1YF8B 4A7KA 4LBQD 1DFQA 1CIWA 1QDCA 3O12A 4RA0A 2EXHA 1V6NA 1BXHA 3KQRA 4LO1A 2D6PA 1N1SA 2UWBA 1SR4C 1DYPA 4XE9A 2E4MA 4GALA 3INAA 1ULFA 5BQUC 1DZQA 3CNAA 4DRVA 3SISA 4U2AA 1WW7A 4JQ0A 1QOTA 1W6PA 1V6LA 1FV2A 1WLWA 5GLZA 5DZGA 3VV1A 1DQOA 21BIA 5GZDA 1G9FA 1IKQA 5CAZA 1LOAA 4Y22A 2ZGUA 4YW2A 3FJIA 2JE9A 2ZABA 4YGDA 4UW5A 1YRZA 3SLIA 2FHRA 1MS0A 3V65A 2D7IA 1MR5A 4BMBA 3FUQA 2PELA 1W0PA 4Q27A 1G82A 4GOYA 2DVBA 4LO0C 3RSJA 2VW0A 3N0KA 1ABRB 2DTYA 4R9DA 1LHUA 3BADA 2EXJA 1KNMA 2YMZA 2A6XA 2K43A 3AK0A 2ZHNA 5GLTA 4LBLA 3AP4A 9ILBA 5D61A 1RY7A 2ZGMA 3AYAA 4LBKA 1CE7B 2WRYA 4XFSA 1ULCA 4J2YA 2FMDA 1IRAX 3RG0A 2FDBM 1PWAA 3ZC9A 3BB2A 1Q03A 4I4OA 4OEGA 1FYUA 3OY8B 4AVTA 4EFPA 3WDUA 3I8TA 2UU8A 4Q91A 1R1ZA 5KXDA 5EWSA 4PCRA 1VAMA 5HCFA 1DQ1A 1W3GA 4M3CF 1BFFA 2LIQA 3TAYA 4FPGA 2IWTB 3UJ0A 1GZ9A 4D69A 3ENRA 3W59A 3BOPA 4YW1A 3WNXA 2JDZA 3AZVA 1GNZA 1W6MA 3OGFA 1EPWA 1SBFA 2I1BA 2AREA 5F8WA 3ZPYA 3TB0A 3EF2A 3IM6A 3L2YA 2EF6A 3BRGC 3OJVA 1N3OA 5FRAA 4I1EA 4ZFUB 3RMXA 4I4VA 4AVVA 4M3CA 1UN1A 4XJWA 3T1MA 4WZFA 3B9UA 3D6EA 2AH2A 5CBLA 4YW4A 1HCEA 1S0EA 1SCSA 1GLHA 5F5QA 5T5JA 4AVSA 4YGBA 2Q5TA 3USUA 2DYCA 1TFMB 5T5OA 3ZYRA 1JLYA 4IONA 3POYA 1SR4A 2Q3NB 2P2KA 1WBLA 4XJ8A 2R0HA 5F90A 1SACA 1WW6A 4DS0A 3P6IA 5BQUA 1I1BA 3SITA 1DBNA 1R8NA 3N3HA 2P23A 2YZ4A 4XKIA 5E24E 2ZGNA 5T50A 1M2TB 1MVQA 4I4RA 3HSMA 2DVAA 1MACA 4YG6A 3NJ5A 1FMZA 3N7MA 1JN2P 4YW5A 2FO1A 4G6JA 5F8SA 3WCSA 1B09A 3B01A 1XYFA 1CR7A 1PZZA 3V0AB 1W3AA 3FUOA 1SBDA 5DZUA 2VXRA 2VH9A 2LIEA 3H6RA 5CB7A 4JCKA 3FLPA 1LHOA 4UW4A 1LHNA 2ZGKA 1QKQA 2A6VA 2A70A 4OEFA 1KQRA 4LO0A 2DV9A 2P3JA 3D4KA 3Q7YA 3O44A 2ES3A 3NV1A 1GKBA 4P0JA 4XHBA 2HW9A 1AFCA 1IHKA 2R1DA 3UJ4A 2E51A 2YV8A 1DYKA 5BXTA 1YXWA 2HZ9A 1SBEA 1IS6A 3JU9A 3DUIA 3S8JA 4K1ZA 1LU2A 3BAOA 1JT3A 1OKQA 1IS4A 1PC8B 4FPHA 3V0BB 3ZX7A 3QR5A 2E7TA 2VY0A 1QMJA 4YGEA 1QXMA 5GLWA 4CRQA 4Y1ZA 1FATA 2A6WA 2V5YA 3ILAA 4ISRA 1BLAA 4Q1PA 5D62A 4YZ3A 3C2UA 2DWRA 3POKA 4IYBA 3WDWA 1V6XA 2ARXA 2NMOA 1L2HA 4AGVA 4G1RA 4TYSA 2ZR1B 3WO2A 4XZPA 1N1YA 3S8KA 3P6JA 1ONAA 5BOWA 3FLRA 3E8LC 1Z4SA 4X3AA 1RIRA 1JOJA 4LBJA 1JBCA 3AJZA 4P0LA 4QKRA 1HWMB 1AX2A 5DUWA 4GWMA 4X39A 2YY1A 4M3CE 1YI7A 2L5XA 1GBGA 4HA2A 1AX1A 2ZHKA 2HWAA 4I4PA 1HWOB 4PBPA 1H9PA 1J1TA 4LO3A 2WJSA 4XDQA 1S0GA 1MZ5A 5BXRA 1DLLA 2C5DA 3VT1A 2D23A 4FOVA 3LTQA 4CZSA 2ZGPA 3RMYA 2EAKA 4FGFA 4XTPA 1TOOA 2WSUA 2D7RA 4J2SA 4TLPA 4GP0A 4HANA 1LGCA 1ENQA 2H0BA 3PHZA 3OPZA 1C1FA 1AVAC 1YYNA 4XBQA 2D24A 3OBTA 3OJMA 4H9WA 4GP3A 4XTMA 5KXBA 4OUJA 5DZEA 1OFSA 3LSDA 4M01A 3SH5A 2NVHA 5GALA 2JJ6A 4YM2A 1CPNA 1GYKA 5HPZA 3PVEA 2EXIA 2FFVA 2GNTA 3VSFA 4A7YA 1OQLB 3WMUA 3F62B 1DGLA 5IUQA 1AXYA 5T55A 3WG4A 1LOFC 4YM1A 4ZKTB 1ENSA 5T52A 3JUUA 3AX4A 2R16A 4Y20B 1YTOA 1N3QA 1CESA 3A0KA 2SLIA 1X50A 4F34A 3WV6A 1Z0HA 3I2XA 4K20A 3WDYA 1CQ9A 1SLIA 3AKHA 4XIKA 1SLAA 1DFCA 1JT7A 2R0FA 3MPPG 2F8XC 3VT2A 4QD2B 4D0ZA 4DFSA 2VXTI 4C1XA 3B00A 2ZQNA 2BQPA 4FQ4A 2NMNA 2ZACA 3POSA 2ZAAA 4DPNA 2R1BA 3H6SE 3V64A 1LOGA 3WA1A 1Y7BA 2I2SA 1W6OB 2DVDA 1K5UA 4XILA 4LBQB 1ULEA 3PMEA 4XBNA 3AP6A 2W68A 2AGSA 1AVXB 3LSEA 1EYLA 1MS8A 3NV3A 3W9TA 3PVOA 4JC1A 2GMPA 3A07A 5AVAA 2WLQA 1JLXA 1YBIA 3AJYA 1Z2VA 3MW3A 1IILA 2M49A 3HMYA 1LODA 1BARA 3WDTA 4K1YA 4Y1YA 3VKNA 1VCLA 1GICA 1FGAA 3OY8A 1IT0A 4ZA3B 1IOBA 1BFCA 4QKSA 1QQKA 1MZ6A 1S0DA 4Z9WB 1QF3A 4R9CA 3BX1C 4YOLA 4XXPA 1XHBA 2JECA 2ZKNA 1AJKA 4GAFA 2D6LX 5HCAA 2WNEA 4WV8A 3M2MA 3B9CA 4XFUA 1W0OA 2G4IA 1RINA 3Q7XA 3JUTA 4RL7A 2GN3A 1LEDA 3VKOA 2KH2A 2AR6A 4KBBA 3IMNA 3ZXGA 3M3EA 4LBOA 3ZSLA 3A23A 3O4AA 1QNYA 4EFRA 1ENRA 1HDKA 1QDOA 1HQLA 3OJBA 2ERMA 1SCRA 1DQ4A 3NV2A 1LOFA 2ZMLA 1LCLA 1LHWA 3CQAA 4UW6A 4Q26A 1FWVA 2W08A 4FOWA 1FNZA 4ZGRB 4BPZA 4I4SA 3PUBA 1BLDA 5E89A 2ZBJA 4FPOB 2QYIB 4XJAA 4YLZA 1ILR1 1UZZA 1FMMS 4AN6A 1AXMA 2ZMNA 1LU1A 1S0LA 3RTIB 4Z8SB 2BEAA 2OUHA 5H9RA 4JKXB 3U4XA 1LGBA 4GKYA 3IKWA 1PUMB 2Y9FA 5GLUA 4X37A 5FNWA 3ZYPA 3H6QA 3V0AA 4ATFA 1ISZA 4JPZA 1S0FA 4D8HA 3NBNA 5FZYA 5H9PA 3QLQA 3WOGA 1DQ0A 1V6JA 3MW4A 2ZHLA 1YO8A 2CL2A 3APBA 1QOOA 4R9AA 2F2FC 1F31A 1S1AA 3AP9A 4M00A 2DRYA 1OQ1A 3AKGA 4AN7B 4P9XA 4Y1UA 5DVHA 3ATGA 2DTWA 1FNYA 3KM5A 3ILRA 2VW2A 5JVVA 2AXMA 4J2XA 5F9TA 1G9AA 3V0BA 3N7JA 2PHTA 1JHNA 3O3QA 4OWLA 5SV8A 2RQ9A 4FPKA 2Z42A 1ULGA 2ZGOA 2IHOA 4ZFWB 1H9WA 3W58A 4WVWA 3ILFA 3T1LA 3AJ6A 4OWKA 4YG3A 1BFGA 3WHUA 4H55A 4YM0A 3B69A 4LBNA 2D3PA 3CA6A 2LTNA 1ISXA 2RHPA 3WG2A 4QD2C 4HJJA 1GZWB 3UL2A 3HOMA 4YW3A 4I6IA 2EXKA 1PZ7A 2ERFA 4ASMB 3AZYA 2NM1A 5GZEA 2A3XA 41BIA 1WBFA 4ZOTA 2MC2A 3R05A 1HWPB 3CRGA 3AFKA 4BMEA 4YFWA 1Q8PA 5JOYA 2PHRA 5DUXA 1HQWA 2D44A 5I1BA 1TIEA 4FPFA 1Q8VA 4YZ2A 4D0TA 5DUVA 5DZFA 4PF5A 2W52A 1QQLA 1N47A 3FJKA 2AUYA 4YZ1A 4MYEA 3PG0A 3CAHA 2DU0A 2D7FA 2WQZC 3D7WB 3AH1A 3IN9A 3KMVA 2VU9A 3T8SA 1PUUB 5JMCA 4JP0A 2OW4A 3WVJA 3AXDA 4LO2C 3GALA 1EVTA 4PQ9A 1CJPA 3OYWB 2D22A 4LO7B 2NTDA 4GWNA 1S0CA 3FGMA 1W6NB 1V6UA 4IHZA 1PZ8A 3AZWA 4DCKC 2ZQOA 1GZCA 2A75A 3TC2A 2XOAA 4L4IA 3RRDA 4R9BA 3O4CA 5DG2A 3ZXJA 3IAGC 2KI6B 2PHWA 3FJEA 1DQ6A 4ITCA 4XIOA 4XJUA 1Q1UA 5IT6A 3P53A 1N1TA 3ZXEA 3FJCA 3M1HA 2MLLB 3FJBA 4BLIA 4X38A 1IS3A 1URXA 4LBMA 2CWSA 6I1BA 4II0A 2F2FA 1HWNB 2GN7A 2MIBA 1KITA 1QOSA 1JT4A 3FLTA 2E6VA 2DURA 4L8QA 1DQGA 1SLCA 1UZYA 3ZSKA 5DUYA 2Y9XE 4BQ1A 2WT2A 4K21A 4FPCA 3WCRA 2OUJA 1S0JA 3FJ9A 4JKQA 4XXAA 1V6KA 3WLUA 4XOGA 4Y20A 1AX0A 1N4KA 1G9BA 2W39A 2E4MC 2X2SA 3O4DA 3OJ2A 2WSVA 3OGGA 4I96A 3O4BA 2X2TA 2Y9WC 4EB2B 5CA6A 3CA3A 1JT5A 3WZ1A 3CA4A 1LHVA 2K4AB 5GZGA 5JLVA 2WBCA 5BVPI 2P3IA 4LO8B 4OZXA 3I29B 2CWMA 1WW5A 5GAQA 4H04A 3Q9OA 4Y1XA 1EV2A 1FAYA 4FOYA 5KXEA 3UK9A 2Z49A 3WDXA 3T2TA 1SZ6B 1MVEA 2ZHMA 4HL0A 3HALA 5BP5C 2A5ZA 1W6OA 3HBWA 1CVNA 2NN8A 2D3SA 2KKIA 1XQNA 1NZKA 5E8AA 4ZXKA 4USPA 3RTJB 1BKZA 4LBQA 4XMIA 1G9DA 3R4UA 4I37A 2C9AA 5B2HA 4XJ9A 3VKLA 2GMMA 3O4OA 3DGTA 3IPVB 3VWCA 1UL9A 1VALA 3WHTA 5KXCA 2AQZA 3AZXA 4NOTA 3FJFA 2DRZA 4GOVA 4GAIA 1E0OA 2DU1A 2CTVA 4R6UB 4LO2A 1MS3A 1ZA4A 4Q8LA 4FPEA 1BYHA 4YZ5A 2A6ZA 1K5VA 1LOEA 1UX6A 5BXPA 1QGLA 1RG8A 4JRAA 3WUDA 3POWA 2V73A 2QN4A 3F1RA 2E53A 3CU1B 5H9QA 3ILNA 1TP0A 2GMEA 1W6QB 2BEBA 5DSSB 2PHUA 1KRIA 1WLDA 1IKPA 1FWUA 3HR9A 4P9WA 4YGCA 2P39A 1BASA 4IZXA 1VIWB 5IK5A 5DXDA 1HKNA 4WVVA 4DQAA 2DUOA 3LCPA 5HCBA 3CRIA 3SNVA 1Q56A 1MS4A 2ZZJA 1MD6A 1HIBA 3I2AA 1ITBA 4Y26A 4Q9PA 2UWCA 3PJQA 1MS5A 1DZCA 4SLIA 4I4QA 1G9CA 4EFQA 3MEPA 1DQ5A 3BRDA 1IJTA 1GGPB 3A0NA 2D6MA 1JYCA 2ET2A 1WCSA 3QCWA 4Q1RA 3SH4A 4IZEA 4EEEB 1MC9A 3RQ0A 3BAHA 1DJSB 4QALA 1F5FA 4ENDA 5EYXA 3Q7WA 1WW4A 3VSZA 5JOXA 2GNDA 3AKFA 2GZBA 4FPYA 4Y1VA 4LO7C 5EXOA 1BZWA 5EG6C 4QO3A 3VEQA 1V6VA 2ZGTA 2GALA 1BA7A 4HR6C 4I4UA 1JY0A 2LALA 3BAUA 4IQPA 2AENA 5T5LA 2AFGA 1LTEA 2D6OX 1DIWA 4USOA 1JW6A 3BRFA 2CNAA 4FP2A 1AF9A 4J2KA 1T4QA 1ZM1A 5IK7A 5BP5A 3B3QE 5EHAA 2YXSA 3IM5A 4KEIA 1W3FA 3QYDA 2ENRA 4U36A 1IS5A 3UJQA 1FN0A 1RZOB 2R49A 3WG3A 4AYUA 3AZZA 3ZXDA 4I30A 1BFBA 1KDKA 4YG0A 3M3OA 4G9NA 2ESUA 3UD7A 4P14A 2ZGQA 2DREA 2KI4A 3UJOA 4I1BA 1O4YA 2JKBA 1SLLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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