1WD4A

Crystal structure of arabinofuranosidase complexed with arabinose
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMENNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of a family 54 alpha-L-arabinofuranosidase reveals a novel carbohydrate-binding module that can bind arabinose
pubmed doi rcsb
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
total genus 157
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2004-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wd4A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1wd4A02
4GAFA 3O44A 1WBFA 5FNWA 3O12A 4YZ4A 1CE7B 21BIA 1N3PA 3MW4A 1DLLA 4GP0A 1V6LA 4Z8BA 2OVUA 3WMUA 1VAMA 2L5XA 5IK7A 1LESA 3P6JA 1HWMB 1MS5A 3M3QA 1DIWA 4I7IA 1ISYA 2Z49A 1O4ZA 1TWEA 1LECA 2ZGQA 3V64A 5BXPA 1ENSA 3SLIA 1DHKB 2WBCA 1WBLA 2ZHMA 5KXCA 1LGBA 4AN6A 2WNEA 2WT1A 1H30A 1CPMA 3ZXFA 3FBYA 4JRAA 3N0KA 4DQAA 3SNMA 5KXDA 2W08A 2YZ4A 1N1SA 2C9AA 1BASA 1N3OA 3BRGC 2K8RA 3OJVA 2A6XA 1E0OA 2LIEA 3B9CA 1N4KA 4GWNA 1II4A 3F1RA 2FDBM 4RA0A 3BAVA 1JN2P 3VKLA 2DVDA 4Q1RA 2EXIA 2ZABA 4DENA 4LBMA 2E6VA 2E4MA 3CRIA 2R0HA 1VLNA 3POWA 4K21A 3VKFC 1Z2VA 1VIWB 4IZXA 2GMEA 4LO3A 1W3GA 2DUOA 3WZ1A 1V6WA 3GNEA 3AH2A 1AXKA 2AUYA 3ZSJA 3WHUA 5DZFA 4D69A 4BMEA 1GNHA 4BQ1A 3D5OA 3LCPA 4BLIA 1JT4A 3A0KA 3RMXA 1LHVA 2VLCA 1Z4SA 4P0KA 1QGLA 5D63A 1JQZA 4I4XA 1V00A 2PELA 2MLLB 5IT6A 1XZZA 1T4QA 4QD2B 3UD9A 3OJ2A 3NV1A 4J2KA 3OJBA 5CAZA 3BA7A 1BKZA 2ZZJA 1RINA 2ERFA 4ZGRB 3WO3A 1AVAC 2D1ZA 2M49A 3WDYA 2J3PA 1DFCA 5BXTA 4HJJA 2ZGPA 1UX6A 1UAIA 3AYEA 1C1LA 3ZC9A 1FN0A 2C5DA 3I29B 1W6OA 2FFVA 1HIBA 4LO1C 3AP5A 1DQOA 4XILA 1FATA 4A7ZA 2WLQA 4LO7B 4EFPA 1FQ9A 3INAA 2GNBA 5IUQA 1HQWA 5GALA 1YRZA 3W9TA 2UWCA 4AWDA 2GDFA 1DQ1A 1PZ9A 4I37A 3B00A 2GZBA 3BA4A 1KQRA 3JU9A 1MZ6A 1TFMB 1R8NA 3RTJB 1GNZA 2A3YA 1OFSA 3UK9A 2CY6A 3R4SA 2KM2A 2Q5TA 4G1RA 1UL9A 1V6NA 4YLZA 4ZFWB 4J2XA 1FMZA 2VW1A 3H6RB 4FPFA 2DUQA 3SH5A 1WLWA 1LGNA 4K1ZA 5EYXA 4Q8KA 2IHOA 4JPZA 5CBLA 4JKXB 1LOAA 3M3OA 2AR6A 4Y1YA 4PCRA 2LALA 1EV2A 3FUOA 2NMNA 1BFFA 1ITBA 4I8MA 1FNYA 1W6NA 3AXEA 4FOQA 3O5WB 1S0JA 1OKQA 1W6MB 5GZEA 3AJ5A 3VKNA 2A3WA 4JAWA 1BARA 4QKRA 1AX0A 1ONKB 2D3PA 4LO2C 2ZGRA 3OY8A 1LULA 1GZWB 1RIRA 1SACA 4PBOA 5KXEA 3ILFA 3V0BB 4ITCA 3T8SA 2FGFA 1UZYA 1DQ6A 2DS0A 4XTPA 4Q27A 1B09A 3O0WA 4X39A 5BP5A 2DVGA 1HDKA 3CA6A 5DZUA 1LHWA 1XYFA 4CJMA 3VT2A 1MVEA 3IM7A 5CB7A 2P3JA 5GAQA 3IAGC 1LENA 1IRPA 4I2SA 4FGFA 4FOYA 2ZGKA 1LU2A 2EF6A 3MALA 3WHTA 4FQ4A 1LOGA 3R4UA 1SLBA 4JC1A 1W6QB 4Q2FA 4WV8A 3TAYA 5T5PA 3B01A 4Y1XA 3BRFA 4XHXA 1PZ8A 41BIA 3GALA 5DSSB 3AX4A 1BQPA 3N7LA 2A3XA 3O5SA 1QNWA 1QXMA 1URXA 1XQNA 2A6YA 2CTVA 4BLJA 3BB2A 1BJQA 9ILBA 4TYSA 4Q26A 4YZ3A 4IHZA 3PMEA 2ZBJA 1UZZA 1HLCA 4GOVA 3O0XA 4J2YA 2AYHA 2DUPA 4I4RA 3FJFA 2BQPA 3NV4A 3WUCA 2D6OX 4UW4A 3WDUA 1GSLA 4R9CA 1V6KA 3R05A 2RHPA 3NBDA 2P37A 1LOCA 1GANA 1ULCA 3RG0A 2FFUA 2KH2A 1Q1UA 4Z9WB 1NZKA 1DBNA 1EVTA 1IS4A 2NZ9A 2K4AB 4HL0A 4WVVA 4XFUA 4LBOA 4XE9A 3ZXLA 3K1XA 1QMJA 3ILNA 1C4RA 4L8QA 3CA5A 4FPGA 3FJAA 2R49A 2A6ZA 3PHZA 2DWRA 1FV2A 4ISQA 2D7IA 2XOAA 3KQRA 2HZ9A 3WDXA 4LBQD 5DZGA 1HQLA 3OYWA 5EXOA 1H9PA 2JECA 4LBNA 3WDWA 4A7KA 1Q56A 5BOWA 3T1MA 1DQ2A 1JT5A 1SBDA 3N7JA 2PHFA 4P6AA 1HCDA 5F8YA 2E53A 1SBFA 3V0AA 3AP7A 4LBQA 1LHUA 3VT0A 2VY0A 1AX1A 4EFQA 3VV1A 4J2SA 1WUVA 3OJMA 3MW3A 2EXKA 4FPLA 3PVEA 4FPCA 1PC8B 2MIBA 4G6JA 4XIOA 1V6IA 1NUNA 1APNA 3BODA 2G4IA 4A7YA 2P3IA 2GALA 2P23A 2GN7A 3VEQA 3ZSMA 3SH4A 3ZXJA 1KJLA 2WT0A 4F83A 2SLIA 1G7YA 1AVWB 3O0VA 4QD2C 3CU1B 2RQ9A 4GA9A 4XTMA 4YGDA 1AXZA 4OEEA 2ZGNA 3HSMA 5HCAA 2ZQNA 3BX1C 3JUTA 1YBIA 4BM8A 3KMVA 4QO3A 2D7FA 2V5YA 2CNAA 1ULGA 2DYCA 1R8OA 3P6IA 4P9XA 2XB6C 3AKIA 4Y20B 1MR5A 3OGGA 2E51A 1XG6A 4ATEA 3O4BA 2YXSA 3WDTA 2TEPA 2D24A 4I4YA 4M3CA 3AKHA 1VALA 4Y22B 4I1BA 4YZ1A 2A71A 1G9BA 1JY0A 4XYXA 4Q91A 3B3QE 5FZUA 3H0OA 4FPHA 3ASIA 4AVSA 3AZZA 2FMDA 3LLPA 4QC4A 1LOBA 4JCKA 1V6OA 1GKBA 5F5QA 5IK4A 1AVUA 1JT7A 4ZKTB 2ZGTA 1AVXB 1W6QA 5JOXA 3WG1A 3N35A 3SISA 1X50A 1SZ6B 4QKSA 5GLVA 2QN4A 1WW4A 4G6MA 1VAVA 1YIFA 3OBRA 2KKIA 2D6LX 4YZ2A 5T5LA 4FPKA 6I1BA 4XOGA 2A75A 3PG0A 4QALA 3LSDA 3O4AA 1IT0A 3ZXGA 2V73A 1BFGA 2A6WA 2Y9FA 2WRYA 5DXDA 2AREA 3QYDA 2F2FA 4KBBA 3AKGA 3A22A 4LBJA 4YM2A 5GM0A 2ZACA 1HCEA 3I8TA 4WBCA 2DVAA 3IKWA 5HCBA 1JBCA 2JDZA 3SITA 2NP0A 4I6IA 2OUJA 4DRRA 1Z78A 1SLIA 4PQ9A 3O4CA 4JQ0A 1V6JA 3FJKA 5E24E 1AXYA 3DUIA 4ZFYB 3NJ5A 5H9RA 2P39A 4XJUA 3WVJA 3USUA 4RL7A 4AYUA 4Y26A 3WO2A 4U36A 3BTAA 2SBAA 4CRQA 3I2XA 3M3CA 4FP3A 4DPNA 4M01A 1G8WA 3FLTA 1U0AA 3AYCA 5JOWA 2KI6B 1JXNA 1LEDA 5DUXA 3A4UA 1SLCA 2R0FA 8I1BA 1A8DA 1GV9A 1LOFC 3HALA 3E8LC 4K20A 1FWUA 5BXRA 1Z0HA 4DEPA 2VSEA 1QKQA 2UUSA 4XBNA 1WLCA 3D4KA 4H04A 4U2AA 2AAIB 5F9TA 1S0CA 1QNYA 1PZ7A 3D6EA 1PUMB 2UWAA 4R9AA 1DJSB 4XBQA 4KEJA 3IN9A 1IRAX 5JMCA 3WCRA 4C1WA 3VKMA 2WQZC 2D7RA 1IHKA 3WCSA 1W0PA 3CA0A 4GOYA 3B69A 2GMMA 1ISZA 3WINA 4D0ZA 3AP6A 1F5FA 2D44A 4IY8A 1WBAA 2YY1A 2RG9B 3AYDA 1W6OB 3B9UA 1LHOA 3W59A 5EC5A 3FJCA 1RG8A 2D3SA 3ATGA 3ZSLA 2D23A 1N1VA 3MEPA 3S8JA 3HMYA 4GWMA 5GZCA 1DQGA 3ENRA 1CESA 1JOJA 2JJ6A 1GBGA 1QF3A 3V65A 2CWMA 1XHBA 3CRGA 3UD7A 5E88A 2VXTI 1S0FA 1JW6A 3CNAA 4D8HA 1KITA 4GXLA 4FPYA 1MD6A 1QQKA 4XJAA 3OBTA 2H0BA 4ZOTA 1TP0A 1FV3A 4ENDA 1QQLA 4DS0A 2XG3A 1ISVA 1CQ9A 1DQ5A 4TZDA 1C57A 1W6NB 1W6MA 4M00A 3WLUA 4ATFA 1DYKA 1P63A 2GMPA 4YW2A 3C9ZA 5DZEA 4XXPA 2UU8A 4IZEA 1K5UA 1GLHA 3SNVA 2ZMLA 3NBEA 3ZPYA 4ASMB 2ZR1B 3HOMA 4AGVA 1AJOA 3H6QA 3CA4A 3O3QA 2VXRA 1BYHA 3AZYA 5CNAA 3ILAA 4AN7B 3M3EA 2WJSA 3TB0A 1LTEA 1J1TA 2P3KA 1Q8OA 2NTDA 1SR4C 1ZA4A 1WD4A 1UN1A 3AJYA 2YUGA 5SV8A 2VSAA 5I1BA 2ERMA 3V79C 5BVPI 1S0LA 1DGLA 1TEIA 1ULFA 3I4IA 5H9QA 4OWJA 1FWVA 2D43A 3O49A 4UW3A 3WA1A 5L73A 1GICA 2DTYA 3KM5A 2UWBA 1Q8PA 1C1FA 1Q8QA 4IY9A 1JUIA 2GNTA 3UL2A 3D7WB 2R1DA 3F62B 4ZLBB 3HR9A 1CJPA 1JLXA 1JHNA 1I3HA 1ULEA 4I4PA 3ZX7A 2VW2A 4FOWA 4YFZA 1DFQA 3NBCA 1DZCA 7I1BA 1WW5A 2D3RA 3UD8A 4LO0C 1M16A 4LO1A 2K43A 5AVAA 1Q04A 3Q7XA 1AXMA 3ZC8A 2GNDA 5DUYA 1DQ0A 3QR5A 1UMZA 1SLAA 3CAHA 4I4VA 3OGFA 1AFCA 4GALA 4II0A 2VH9A 3BRDA 5DUVA 4M3CF 2Y9GA 3IPVA 1HWNB 1N3QA 2R9KB 4WZFA 1GYKA 2AQZA 4Q9PA 2ZHKA 4I0YA 2D22A 2P34A 4OW4A 1PUUB 3AZXA 3RS6A 2A5ZA 4LBKA 3WUDA 1J0SA 1RZOB 3O4OA 3OYWB 4QBCA 3TC2A 2WSUA 4R6UB 3N7MA 1V6UA 1CN1A 3ZXKA 2A6VA 3ZXEA 1HWOB 3A23A 4DFSA 1LJ7A 1S1AA 2YMZA 1YYNA 2Y9WC 5DG1A 4KEKA 4YM3A 1Q03A 1IKPA 1W6PA 3POSA 1DZQA 1A78A 3NV3A 4ISRA 4ZBVB 3V0AB 3POKA 3FLPA 1LCLA 2Z42A 4LBQB 2X2TA 1M2TB 1WD3A 1CIWA 2ZQOA 4LO3C 1MZ5A 2ZGUA 4LO2A 1YI7A 3Q9OA 1G9AA 1S0BA 1EYLA 3LTQA 3N3HA 1RITA 3O4DA 3P53A 1NLSA 1LEMA 5JOZA 5IK8A 3EF2A 4F34A 5DVHA 5GLWA 1CR7A 4R9BA 4FPJA 2RSTA 2X2SA 3BAOA 3FGMA 2VW0A 4P0LA 1GZ9A 2HWAA 3AP9A 2CYFA 4XBLA 3RQ0A 4XJ8A 2WKKA 4YW4A 2PHTA 2ZMKA 3APBA 4Y1ZA 2EXJA 3AJ6A 5GJ6A 4FP2A 2EALA 1QOSA 4NOTA 3IIRA 3AP4A 1BXHA 4OEGA 4Y1UA 2OUHA 5DUWA 4P14A 4LO7C 1MS9A 3FJBA 4Q8LA 1SCRA 1UKGA 5T54A 1CONA 5FZZA 3WOGA 3ZSKA 3S8KA 4UW5A 2HW9A 4JKQA 2ARXA 5JVVA 1QDCA 1W0OA 4ZXKA 1FNZA 1IOBA 4YW3A 3FJ9A 4C1XA 3UDAA 3IM0A 3LSEA 3I2AA 3JUUA 1KDMA 1N1YA 2F8XC 3CA3A 4TLPA 4SLIA 1G86A 2LIQA 1SLTA 2IWTB 1NXD1 1ISXA 3VSZA 4HA2A 4LO0A 2DU0A 2ZHNA 3AKFA 1I1EA 4LO8B 2PHUA 1ZM1A 1WW6A 3VT1A 1IKQA 5GLTA 2AFGA 4DCKC 5CA6A 2KI4A 1WLDA 4FPOB 3FJ8A 5FRAA 1TIEA 3CRHA 2NMOA 1BA7A 3A21A 5FZYA 2EXHA 2ZMNA 1SLLA 4YM0A 2B7YA 4D0TA 1FYUA 2I1BA 2NM1A 4KEIA 4XMAA 1G9DA 2BEAA 3T2TA 5DG2A 5BYNA 3BAGA 2GN3A 4L4IA 4X37A 4Y1VA 4I30A 4BOWA 4I1EA 3H6SE 3WG3A 2AH2A 4XJZA 4GKXA 4EKXB 2AENA 4K1YA 3ZXDA 1OQ1A 3SH3A 3C2UA 4CTEA 5F8WA 4YG6A 1SBEA 1RY7A 4XMIA 5H9PA 3M1HA 4GP3A 3DGTA 1HKDA 5JOYA 5BXSA 1DZDA 5BP5C 5FREA 1MS8A 2UURA 4IONA 2HYKA 3USUB 5KXBA 2A70A 3N7KA 4W65A 3ZYPA 4IQPA 1LU1A 4XXAA 4XJ9A 3VKOA 2WT2A 1ABRB 5HPZA 1D0HA 3AYAA 4X38A 1Q8VA 2W68A 1VCLA 2LTNA 5F8SA 3WV6A 1JLYA 1V6MA 2HWMA 1A3KA 2Z48A 5FNXA 3BAHA 2D6NA 5T55A 4XFTA 2AXMA 5T50A 3OPZA 1SFYA 3L2YA 3QCWA 1LODA 4YZ5A 1MS3A 1SCSA 1EPWA 3WG2A 4USPA 1MVQA 1LOEA 4YGCA 4BMBA 1F9KA 3Q7YA 4NO4A 2YV8A 3HBWA 4FQZA 3IM6A 2ZGSA 1TTUA 1D2SA 5D61A 1ISWA 4ZFUB 4EEEB 4XDQA 3FLRA 3UJ4A 4I4OA 4H9WA 4EB2B 1GGPB 1S0EA 3M2MA 2Y9XE 2JE7A 4P9YA 2D6MA 4OZXA 1K5VA 1MACA 2E7QA 3AXDA 3WMVA 2EAKA 3QLQA 3UJOA 2MC2A 2P2KA 3WDVA 3RTIB 2QYIB 1MC9A 2D20A 4YGEA 1FX5A 2GNMA 4FVVA 1KRIA 4Q9GA 4M3CE 31BIA 3H6RA 1I1BA 3BOPA 1IJTA 1CVNA 3UJQA 3WO4A 1W3FA 1KJRA 3ILRA 1LHNA 1KNMA 5H9SA 1HKNA 1F31A 1BZWA 2ZGOA 4XFSA 5T52A 3ZVXA 4PF5A 2DREA 4ZA3B 5B2HA 1IOAA 3PJQA 2PHRA 1G9FA 2I2SA 1ENRA 4YM1A 1GZWA 1WCSA 3OY8B 4PBPA 3V0BA 1YTOA 4OWLA 4PC4A 5EWSA 1V6VA 4IYBA 3FUQA 1HWPB 1FAYA 3AZVA 3VUOA 2ARBA 1QOTA 2DRYA 5GZGA 1G9CA 1OQLB 2R16A 4FOVA 1S0GA 4LBLA 1WW7A 4OWKA 5HCFA 2FHRA 1PWAA 2W52A 2W39A 1JT3A 4MYEA 1T9FA 2DRZA 5BQUC 2ES3A 4I96A 1JTCA 1BLAA 1V6XA 2DVBA 1BFBA 1DQ4A 2DU1A 4H55A 4YG0A 1LOFA 3MW2A 3FJHA 4R9DA 2ET2A 3CQAA 3PUBA 3POYA 4USOA 5GZDA 4G9NA 4I3NA 5T5JA 1TOOA 4OUJA 1GZCA 5GLZA 5EYYA 1MS1A 4OEFA 1N47A 5IK5A 1IILA 3N36A 3BAUA 1BFCA 3U4XA 4XHBA 5JDBA 4YGBA 4X3AA 1S0IA 3JRRA 4DRVA 4HANA 1YXWA 4YW5A 1YF8B 2DURA 1IS5A 1TWMA 3IMNA 2AGSA 4BPZA 1QOOA 4XKIA 3ZYRA 4Z8SB 3VSFA 2PHXA 1AVBA 2R1BA 3BA5A 5GZFA 3WG4A 5G00A 1QU0A 4YW1A 2Q3NB 4QBVA 4GKYA 5D62A 2D6KA 2JKBA 2CWSA 1PZZA 3CA1A 2KLLA 1AZDA 3IPVB 1N1TA 1JYCA 1AX2A 3RRDA 1JYIA 1ONAA 4P9WA 4HR6C 2YROA 3MPPG 2DV9A 2D6PA 1RMLA 3RSJA 2F2FC 4KC3A 3BAQA 5T5OA 1CPNA 4UW6A 2NVHA 5EHAA 1S0DA 3NWKA 2Q9XA 3AK0A 1LGCA 3T1LA 1UPSA 1DYPA 3UJ0A 2JD4A 3FJIA 3A07A 3A0NA 2E4MC 5E8AA 3NBNA 1Q8SA 2ESUA 4AGRA 4Y24A 2E7TA 1R1ZA 1W6PB 2BFHA 3WNXA 1YO8A 4Q1PA 4YOLA 2VU9A 4L4HA 4I4UA 2FO1A 4AVTA 5E89A 4J23B 4AVVA 3PVOA 2ZGLA 4CZSA 4EFRA 1ENQA 4I4QA 2A7AA 3RMYA 1ILR1 3W58A 4FPEA 3HN1A 1O4YA 4XIKA 2WSVA 3FFZA 5F90A 1FGAA 2DTWA 1CVSA 1SR4A 1IS3A 3FJDA 1W3AA 2ZA9A 1KDKA 4P0JA 1Y7BA 2OW4A 4XJWA 4WVWA 2BEBA 4Y20A 5BQUA 4XZPA 4YG3A 3BIWE 2ZGMA 5DUUA 1AJKA 3NV2A 5LK5A 2JE9A 3FJJA 3AJZA 3AZWA 1G82A 2VUAA 3AFKA 3PVNA 4I4SA 1MS4A 3VWCA 1QDOA 2NYYA 2EIGA 1ULDA 4Y22A 3WINC 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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