1WD4A

Crystal structure of arabinofuranosidase complexed with arabinose
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMENNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of a family 54 alpha-L-arabinofuranosidase reveals a novel carbohydrate-binding module that can bind arabinose
pubmed doi rcsb
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
total genus 157
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2004-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wd4A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1wd4A02
3INAA 4I1BA 2R0FA 2HYKA 1JUIA 1HCEA 2WJSA 3VSFA 2DU0A 4ENDA 4P9YA 4GOYA 3FUOA 4J2SA 3FJIA 3RSJA 3OYWA 21BIA 4LO2A 1G9FA 3WHUA 2Q3NB 4C1WA 1TWMA 4I4VA 3BOPA 2K43A 1I3HA 1V6MA 3V64A 3JU9A 4KEKA 1LOFC 1DQ0A 4DRRA 1V6OA 2VH9A 4R9BA 2FO1A 4M3CE 4YGCA 4OEGA 2ZZJA 2KKIA 1C1LA 3SLIA 3WDTA 4XHXA 5DZFA 1FN0A 3BIWE 2ZGUA 5IK4A 2DVBA 3HBWA 1EV2A 4I4PA 3NV2A 1B09A 2OVUA 2VU9A 1MR5A 4ZBVB 4I4OA 1CN1A 4DFSA 1UPSA 3CA6A 2WSUA 1N4KA 2NVHA 1HKNA 2RQ9A 3N3HA 4KEIA 4ATFA 1XZZA 2VXTI 3AXDA 2V73A 3WDXA 2GNTA 3A4UA 3FUQA 1JYIA 4R9AA 4WBCA 3SH5A 1TP0A 2A3XA 1YF8B 2C9AA 1BLAA 1IT0A 3HSMA 4LBNA 1FQ9A 5FRAA 3AFKA 1XHBA 5GLTA 3BRFA 1UZZA 4DS0A 2P3KA 2AFGA 5JMCA 1RINA 1ITBA 1HCDA 4QBVA 3FLRA 1DZQA 3VKOA 5JDBA 2DREA 1ABRB 3V79C 1LOFA 2E7TA 4Y20B 4XJZA 1LHNA 4LBLA 5FZZA 1DGLA 1NUNA 1DFQA 3T2TA 1YI7A 4XOGA 1G9BA 4RL7A 3Q9OA 3DGTA 4Q1PA 2A71A 4PF5A 3D7WB 4L4IA 3OY8B 3W9TA 1KDKA 1FNYA 1AX1A 3ILRA 3WG1A 1DBNA 2M49A 5JOXA 2D7IA 2KLLA 4FVVA 4CTEA 2CL2A 3FGMA 2P3JA 3USUA 2X2SA 3BAUA 4XIKA 3JRRA 2NP0A 2FHRA 2D6LX 3FJ9A 3CA0A 1HWMB 4IQPA 1FWVA 2D20A 3WG2A 3WZ1A 1OQ1A 3IPVA 2RG9B 3FJFA 3ZSKA 2ZKNA 3FJAA 1JQZA 5DG2A 3T1LA 1OFSA 2EALA 3MALA 4OW4A 1ULDA 1MVEA 1GICA 2DVDA 1WW7A 1G9CA 7I1BA 1VCLA 1LECA 2ZGMA 2ZA9A 3VT1A 1FX5A 4IHZA 3HALA 1BZWA 4ZFYB 1QNYA 4GXLA 4USOA 3D5OA 1SCRA 1GSLA 1ZM1A 2PHTA 3AP7A 1HLCA 2ZACA 1W0OA 3Q7WA 4YZ2A 5KXBA 5IK7A 4AGGA 4P0KA 5E89A 4YZ5A 1NZKA 3I2AA 2R9KB 4X37A 3UD7A 4Z8SB 2D23A 3WDYA 3UL2A 1IOBA 2HW9A 4H9WA 1C4RA 2EIGA 2Y9XE 3WDVA 2ZHKA 3AZZA 4BQ1A 2WNEA 1J1TA 1DQOA 4GALA 1Q56A 1PZ9A 4OUJA 3WO4A 2VUAA 4AVVA 1T4QA 5IT6A 2X2TA 4H55A 3H6RA 1JT5A 4ZKTB 5DXDA 3O4AA 2ENRA 4PC4A 1DIWA 2P37A 1RZOB 5F8WA 4P0LA 1QKQA 1W6QA 2FDBM 2FFVA 1DZCA 2ET2A 3BB2A 3ZX7A 2PHUA 1G82A 1GKBA 2PHXA 1PWAA 1DQ1A 1H9PA 2A3WA 1I1BA 2AREA 3VT2A 1A3KA 1ULFA 3P53A 3A0KA 1M16A 1DQ6A 1DQGA 1IOAA 4XBQA 4I4QA 2B7YA 3BAVA 1OQLB 3IAGC 2EAKA 1GZWA 4F34A 1TTUA 2VSEA 4FPFA 1FYUA 4P6AA 1MS1A 1N1YA 3ASIA 1PUUB 5BOWA 4LO7C 1SBDA 3B3QE 3ZXEA 3AYCA 2EF6A 3V0BB 3M3QA 3AKGA 3WG3A 5EYYA 1LHWA 1GGPB 3OJ2A 1AVAC 1UL9A 3D4KA 3NV1A 4I8MA 1G8WA 5FZYA 4FPCA 1YTOA 4ZXKA 4ASMB 4ITCA 3AJ6A 3ATGA 4IY9A 4XIOA 4YGBA 1V6XA 4EEEB 2Z42A 1AFCA 4XJUA 1LU1A 5HCAA 2WRYA 2UWCA 2ZGPA 3AKIA 4HA2A 4W65A 3AH4A 3ZXJA 2GNDA 4AGVA 1FAYA 4YM0A 5T5JA 1TIEA 4YOLA 5DUXA 3WOGA 1QOSA 4AGRA 5F9TA 1CONA 1R8NA 1IRPA 4LBQA 1QU0A 1JLXA 1HWPB 1RITA 3AH2A 3M3CA 2DRZA 3AJYA 3CNAA 4WVVA 3RMYA 1AVXB 1N3QA 2ERMA 3I29B 4FQ4A 5GZCA 3OJMA 1BYHA 3APBA 1TFMB 3NBCA 4BMBA 3RS6A 3FBYA 4AVTA 1V6JA 2LTNA 2YY1A 3LSEA 5JOYA 1R8OA 3CRIA 4XKIA 3OJVA 3VKMA 3POWA 1ISWA 3BRGC 1LU2A 2SBAA 2K8RA 1QDCA 5CNAA 1EYLA 3FJEA 5EG6C 1PZZA 1MS4A 4K1ZA 3FJ8A 4LO3C 3PJQA 4FPGA 1LEDA 2WSVA 4AWDA 1IHKA 2QYIB 1W6PA 4JCKA 3GNEA 1HQLA 2PHRA 1W6OB 3NBNA 3WNXA 1ULGA 2DS0A 2DV9A 1RIRA 4Y22A 1ISVA 1XYFA 1LGBA 4ATEA 4GAFA 3VUOA 4JC1A 2R1DA 4IZEA 3UJQA 3WCRA 3WMUA 1SCSA 3BA5A 4BPZA 4R6UB 3BTAA 1JT7A 2KH2A 3QYDA 2YUGA 2Z48A 1ONKB 2JE9A 4DRVA 2GMMA 1F9KA 1FATA 2VW1A 2TEPA 3WUDA 3UJ0A 4Q9PA 2GO2A 4BLJA 4GKXA 4BOWA 1WLCA 5E24E 5BYNA 4LO3A 4Q8KA 3TAYA 4XE9A 41BIA 2D6MA 1E0OA 1PZ7A 1N1TA 4G1RA 2GDFA 1GANA 2YROA 3SNMA 5LK5A 3WMVA 3AP6A 1I1EA 3AXEA 1AJKA 2JECA 1SR4C 4II0A 3ZYRA 4GKYA 3ZXFA 5JVVA 3S8JA 3TC2A 5DZGA 4XFTA 1W6MB 2JDZA 4QC4A 3L2YA 1Z2VA 3RMXA 4G6JA 1WLWA 3MW3A 4FPLA 1HQWA 5GLWA 2GMPA 1JXNA 2QN4A 5CAZA 4XFUA 1Q04A 2ZQOA 2BEBA 3I2XA 3OGGA 3O0WA 2ZMLA 5G00A 1VAMA 2ZMKA 4Y20A 3IM5A 5IUQA 4NOTA 4ZOTA 2JJ6A 1YO8A 2D3SA 4ZFWB 4IONA 3OBTA 1CPNA 2A6WA 3WCSA 2WT2A 3H6QA 3FLPA 3WVJA 1N3OA 5BP5A 5JLVA 1KITA 1KJLA 1V00A 1Z78A 3WG4A 3CRHA 1JTCA 3T1MA 1QQLA 5DUVA 4XJWA 4OEFA 2D43A 5D62A 1V6VA 2W52A 4HL0A 4EKXB 4LBOA 5H9QA 1SR4A 2H0BA 3AYEA 4XMAA 4G9NA 3PUBA 1DQ5A 4JQ0A 2PELA 3TB0A 1KJRA 3ILFA 2A3YA 4A7ZA 3VKFC 4R9CA 3AKHA 1S1AA 3FJDA 2A6ZA 2Q5TA 2E7QA 1CQ9A 3N7KA 1IILA 1IJTA 2GZBA 4ZA3B 2R16A 4K21A 2D1ZA 1MS9A 5E88A 2L5XA 3O5SA 4K20A 3ZSLA 4F83A 3SISA 4FGFA 4L8QA 3PVNA 4IYBA 1FWUA 1WBFA 1RMLA 2F8XC 3ZXKA 4J2YA 1ILR1 1AXYA 1EPWA 3O0XA 2UURA 1WBCA 4I96A 4GP3A 1QQKA 4FPEA 3AP9A 4JAWA 1AXMA 2NTDA 4XHBA 3PVEA 1RG8A 3VKLA 3N7LA 1M2TB 1IKPA 5B2HA 4UW4A 4LO1C 4XXPA 4L4HA 1MS8A 1DLLA 3FJKA 2DWRA 4QD2B 3WA1A 3LLPA 4Q8LA 1MC9A 3AP4A 1IS4A 3AP5A 2DRYA 3V65A 2BFHA 3B9UA 4FPYA 2CNAA 3O5WB 1CE7B 2BQPA 1FV3A 4YZ3A 3WHTA 1HKDA 4I4YA 4XFSA 2XB6C 1IS6A 9ILBA 3IIRA 5IK8A 3N0KA 4WVWA 5IK5A 4FOYA 2ZGKA 2R1BA 2ZHNA 1LESA 1DJSB 1KQRA 5DG1A 2CTVA 4XMIA 2D7FA 2NMOA 1UZYA 4NO4A 4SLIA 4HR6C 1WBLA 2JKBA 3Q7YA 4M01A 4BM8A 5KXDA 4M3CA 1DYPA 2Y9GA 4JP0A 2D3RA 2UWBA 1LTEA 3B00A 1QOTA 4GP0A 2A75A 1DQ2A 5L73A 4LBQD 4YG0A 4YM2A 3V0BA 3FJJA 5I1BA 3VWCA 2E53A 3HOMA 4LO1A 2J3PA 4RA0A 1G7YA 3USUB 2GNBA 3ZXDA 4YW5A 1EVTA 1D2SA 4YZ4A 1II4A 2D44A 4DCKC 3CQAA 2AUYA 1QOOA 3AH1A 2YV8A 2WKKA 2ZGTA 2ZGOA 2CWSA 4FPOB 1CJPA 2LIEA 4J2XA 3NV3A 4A7KA 5AVAA 4TLPA 1SZ6B 5KXCA 4M3CF 1F5FA 4Y1YA 3O12A 3POSA 4PBPA 2JE7A 1T9FA 1CR7A 4Z8BA 4I4RA 2CYFA 4EFPA 1ULCA 1S0GA 1BARA 3A0NA 2YXSA 2AAIB 4I4SA 3UJ4A 3AYAA 1IS3A 1AX2A 4PQ9A 4XZPA 3WO3A 1KRIA 3W59A 4QKRA 4ZFUB 4G9MA 4GWMA 1UN1A 3POKA 1APNA 4YG6A 1JYCA 1QNWA 5DVHA 3SH4A 4XJAA 4OWKA 2Q9XA 4I0YA 3IMNA 4GA9A 1SLLA 2DVGA 3SNVA 1FNZA 4FOVA 3Q7XA 2NYYA 1SLAA 3O4BA 1IS5A 4TYSA 4I7IA 1AJOA 1Q03A 1S0IA 4Q2FA 1HDKA 4UW6A 4LBKA 2DVFA 3ZC8A 3MPPG 3P6IA 3AZVA 2KI6B 5GJ6A 1AVUA 1LOBA 3ENRA 3GALA 4J23B 2XOAA 5EXOA 1DFCA 2AYHA 4Y1VA 1L2HA 1MVQA 3O44A 4DEPA 3O4DA 2CY6A 1BA7A 2IWTB 3QR5A 4Y26A 2GMEA 5T5PA 3FFZA 5SV8A 1LULA 5DUWA 3ZYPA 1W6NB 1AVWB 5T52A 3AKFA 4UW3A 4USPA 4Q91A 1G9DA 4XTMA 2RHPA 4Q1RA 1GNZA 3NWKA 1JHNA 1W3FA 3OJBA 1BFBA 4XYXA 1F31A 4U36A 1GYKA 2A6YA 3I8TA 1GLHA 2DU1A 3A07A 1P63A 3ZXLA 4KEJA 1XG6A 3P6JA 3QCWA 4EB2B 3D6EA 4FPKA 2D3PA 1LCLA 2WT1A 1JT4A 2VW2A 3WDUA 5H9PA 1GZ9A 4EFRA 1WW5A 1JLYA 5GZGA 4I37A 4FQZA 2GNMA 3R4UA 1BFCA 5T50A 1Z4SA 1V6LA 4ZLBB 1QGLA 2KM2A 2DTYA 5T5LA 1OKQA 1Y7BA 4QKSA 2VSAA 4YW2A 2BEAA 1IKQA 1ONAA 5EHAA 5E8AA 4I6IA 1QXMA 3AYDA 1N3PA 1K5VA 2ZR1B 3IN9A 5FREA 5H9SA 1PZ8A 2AGSA 1SLCA 2D6PA 4GAIA 1H9WA 1CESA 4LBQB 5GZEA 4ZGRB 1SBFA 3C2UA 1BFGA 4TZDA 1DQ4A 3I4IA 4YW3A 3A22A 8I1BA 4XBLA 1ZA4A 2OUJA 3A21A 4LO7B 2OUHA 4WZFA 4DQAA 3JUUA 4D0TA 2W08A 4DPNA 4OWLA 4WV8A 1BFFA 1CVNA 5BXRA 2HWMA 1LOCA 5BP5C 1V6IA 2GN3A 2ZQNA 4ISQA 3V0AB 3A23A 4LO0C 1WCSA 1MS3A 5FZUA 1SBEA 3PHZA 1A8DA 3AZYA 3BRDA 3IM7A 4XTPA 3MEPA 1WLDA 1AVBA 2ZGLA 5F90A 3WO2A 1YYNA 3UK9A 2OW4A 1FMMS 2FGFA 3M2MA 3B01A 5H9RA 3CAHA 1CIWA 3N35A 5CA6A 2P34A 1LOAA 5JOZA 1XQNA 2AR6A 3O3QA 1BKZA 1FV2A 1LEMA 3BA7A 1C57A 4I3NA 2IHOA 1LOEA 2D6KA 4LBJA 1JN2P 2NN8A 1CVSA 3O4OA 1WD3A 3O0VA 2VW0A 2A70A 3DUIA 3RTJB 3VSZA 1TWEA 3M3EA 2WLQA 2DTWA 1X50A 2AXMA 3AJ5A 3ILAA 3FJHA 3OY8A 2JD4A 4XJ9A 4YM1A 3CA1A 1J0SA 5EWSA 3F62B 4AN7B 4GWNA 3BAQA 4LO0A 1ULEA 1ENRA 2ZGNA 5KXEA 4Y24A 3RQ0A 5DZUA 5HCFA 2WBCA 4G6MA 2ERFA 3BADA 2NZ9A 2HZ9A 1V6UA 4AN6A 4LBMA 2I2SA 3EF2A 1WD4A 1U0AA 3SH3A 3WLUA 3POYA 2VXRA 4I30A 1W3GA 1N47A 1A78A 3OYWB 5F8YA 3HN1A 1C1FA 1DHKB 3HMYA 3N36A 1DZDA 4QO3A 4X38A 2I1BA 1MS5A 1WUVA 1BASA 4BMEA 1FMZA 1LODA 1S0CA 1UX6A 1K5UA 1GBGA 3NV4A 1MZ6A 1BQPA 2D22A 3C9ZA 4GOVA 3OPZA 5BVPI 3RG0A 4Q27A 4H04A 2UWAA 4FP2A 3CU1B 2PHWA 3KMVA 1LENA 3UDAA 2LALA 4I4UA 5GAQA 1QMJA 3BX1C 2YZ4A 1ENQA 3IKWA 3ZSMA 1ISYA 1BJQA 1S0LA 3M3OA 1SACA 2DUPA 1G86A 2UU8A 1ENSA 4OEEA 2E4MC 3LSDA 1SLIA 3VEQA 3ZC9A 2A7AA 2V5YA 5BXSA 1WBAA 5GZFA 3BAHA 2SLIA 1LOGA 5GLUA 1O4ZA 1Q8VA 5DZEA 3UJOA 4FOQA 2MLLB 1W3AA 2WQZC 3NBEA 5DUYA 4D69A 1RY7A 1GZCA 6I1BA 4YZ1A 4P9WA 5F5QA 31BIA 2XG3A 5D61A 2E51A 1AF9A 2A6VA 2MIBA 4C1XA 2DUQA 1Q1UA 4X39A 4OZXA 1R1ZA 1VIWB 1BXHA 1TOOA 1PUMB 4XXAA 1PC8B 2W68A 1S0DA 2DURA 3HR9A 3LCPA 5BQUC 1SFYA 5T54A 3S8KA 3PG0A 2D6NA 2ARXA 3MW2A 1S0FA 3QLQA 4YFZA 1KDMA 3B69A 4XILA 2P2KA 3ZPYA 2VY0A 1HWNB 1LHOA 1YBIA 1LJ7A 2ZGQA 2EXKA 3LTQA 4Z9WB 4HJJA 4Q26A 1FGAA 2E4MA 3H6SE 1MZ5A 1ISXA 3AZXA 3F1RA 1LGNA 1Z0HA 2FMDA 4EFQA 4LO8B 3FJBA 2EXHA 4OWJA 2C5DA 2ZHLA 2K4AB 3E8LC 4JRAA 2GALA 3WV6A 2A5ZA 4FOWA 1W0PA 2ZMNA 3IPVB 2E6VA 1QF3A 5BXPA 1G9AA 4I4XA 5DUUA 1Q8OA 1CPMA 1SLTA 1Q8QA 3U4XA 5CBLA 4IZXA 4J2KA 1JW6A 3N7JA 5EYXA 5FNXA 1KNMA 3SITA 3CA5A 3ZVXA 1YRZA 1MACA 4CRQA 5CB7A 4XDQA 2WT0A 5GALA 4Q9GA 1VALA 2R49A 5BXTA 1GV9A 5BQUA 1JT3A 1NLSA 1N1SA 1JY0A 1VAVA 4P0JA 2W39A 2ESUA 1V6NA 1N1VA 2KI4A 3VT0A 2AENA 4YGEA 4AVSA 2F2FC 4Y1ZA 1LHUA 3K1XA 3KQRA 1W6NA 2ZGRA 2ZABA 5GLVA 3UD9A 2P3IA 3RTIB 2A6XA 3UD8A 2Y9FA 4M3CB 1S0EA 4YG3A 2HWAA 2MC2A 2EXJA 3AJZA 1V6WA 5HPZA 5T55A 3FLTA 4KBBA 2P39A 5D63A 3H6RB 3OBRA 3R4SA 2YMZA 1LHVA 4R9DA 1W6OA 2P23A 3VKNA 5F8SA 4P14A 2VLCA 1W6QB 1URXA 4Y1UA 1AXZA 5GLZA 3H0OA 4IY8A 4QBCA 2Z49A 3VV1A 3PMEA 1UKGA 1S0JA 4ISRA 3JUTA 3RRDA 1UAIA 2GN7A 3KM5A 1HWOB 2LIQA 4QALA 3AX4A 2ZGSA 4HANA 1GZWB 3W58A 2F2FA 4AYUA 3CA3A 3NBDA 3B9CA 3BAGA 4YLZA 1JOJA 5FNWA 3BA4A 1H30A 2CWMA 1MS0A 4YFWA 1UMZA 3ILNA 3PVOA 4PBOA 4BLIA 4Y1XA 4CZSA 4U2AA 3WINC 1GNHA 5GZDA 2D24A 3WDWA 3AZWA 1YIFA 4YM3A 1Q8SA 1DYKA 2ZBJA 1AZDA 2AH2A 3V0AA 1WW4A 3O4CA 5JOWA 1TEIA 1QDOA 4CJMA 3CA4A 3ZXGA 3BODA 2FFUA 2ZHMA 1V6KA 4I2SA 3WUCA 3R05A 3CRGA 4DENA 1AX0A 3OGFA 4YGDA 4JKXB 1ISZA 1WW6A 5GM0A 1YXWA 1W6MA 2UUSA 4M00A 4I1EA 1AXKA 4KC3A 5T5OA 4P9XA 2DYCA 3IM6A 2ARBA 5DSSB 1LGCA 1SLBA 2EXIA 1Q8PA 1VLNA 4LO2C 4JKQA 3T8SA 3ZSJA 2ES3A 3MW4A 4YW4A 4A7YA 3NJ5A 1D0HA 1NXD1 2NMNA 2ZAAA 2R0HA 3WINA 4D8HA 2PHFA 1O4YA 2G4IA 5HCBA 2D7RA 2DVAA 4XBNA 4FPJA 1BLDA 3O49A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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