1YXWA

A common binding site for disialyllactose and a tri-peptide in the c-fragment of tetanus neurotoxin
Total Genus 115
50100150200250300350400020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
50100150200250300350400400300200100
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
publication title Common binding site for disialyllactose and tri-peptide in C-fragment of tetanus neurotoxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tetanus toxin (Tentoxylysin)
total genus 115
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2005-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1yxwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1yxwA02
1N1YA 3AFKA 2E4MA 1BLAA 1ISYA 3IAGC 1L2HA 1R8OA 1F31A 3BADA 5F5QA 4I37A 1SZ6B 4L4HA 1JW6A 1UL9A 4I4UA 1JXNA 4II0A 1BYHA 4HANA 3OGFA 1V6VA 1KJRA 1LOAA 2D6NA 2KI4A 3OJ2A 5T5PA 3UJ0A 4XFUA 1CVSA 2ZHMA 1SLTA 3QR5A 1GZCA 4Q8LA 2A3YA 4YM2A 1N3OA 3NBCA 1W0PA 4Y24A 4YZ1A 3MALA 1AX2A 2WT0A 3SISA 5EWSA 2B7YA 3QCWA 2R1BA 2PELA 3AZYA 1IT0A 4YZ3A 4ZOTA 3W59A 4QKRA 2J3PA 3ENRA 1K5VA 1ISXA 2D1ZA 1PZ9A 1Z0HA 1S1AA 1JY0A 2QYIB 5BXTA 3NV3A 1JN2P 1QGLA 3VKNA 4LO7C 3CRGA 2R9KB 3M2MA 3AP6A 1UAIA 2XOAA 2V73A 3FJKA 4XFSA 4X37A 1E0OA 2ZGNA 5DSSB 1OKQA 4XMIA 2A6WA 2JD4A 1RMLA 4P9WA 3MPPG 4UW3A 4FPYA 3WG4A 3WG3A 1TWMA 1PC8B 4DRRA 2NMOA 2ZHNA 5E24E 2R1DA 1AJOA 2CWSA 5CB7A 3IM7A 1APNA 1DQ4A 1V6KA 4ZFYB 5HCFA 5F90A 2JJ6A 3FJHA 4FOVA 2D23A 3OJMA 3H6RB 1SR4C 2WSUA 4EKXB 3AKFA 4XZPA 1FN0A 1IKQA 2PHRA 4YOLA 3B69A 1ITBA 1ONKB 1G9FA 5JVVA 1FMZA 1GZWB 1SR4A 2DS0A 1A78A 2ZAAA 1KITA 4FPHA 1UMZA 1GICA 3HMYA 5EYXA 1LODA 2EF6A 3OJBA 1JBCA 1SCRA 5KXDA 2DVAA 3FJAA 1IS5A 3UJQA 1GNZA 2NTDA 1MC9A 1LOEA 4BLJA 4I6IA 1FV3A 4R9BA 3AYCA 3SLIA 2Y9GA 4QALA 2NYYA 4AGGA 1BFFA 1W0OA 1LECA 4XJZA 4XJAA 4ATFA 3O0VA 4BQ1A 2WSVA 2FDBM 4HJJA 1Q1UA 4AGVA 3POKA 3UDAA 3HALA 2DYCA 3NBDA 2D6OX 4FPLA 1HQWA 3BIWE 2K43A 4P9XA 3PUBA 3FJ9A 3WDYA 1VAMA 2E51A 5IK7A 4YW1A 3PMEA 2ZABA 3AXEA 2UWAA 3PHZA 5JDBA 4GA9A 3HSMA 2D24A 2MC2A 3VKLA 4LO2C 3WG1A 1DYPA 4OZXA 2A6ZA 1LHOA 3KQRA 4IY9A 1Z78A 4QC4A 2FO1A 4ZA3B 4I4SA 3FLRA 3D4KA 5IK5A 1IOBA 3RRDA 4LO2A 1BXHA 2E7TA 3V79C 3L2YA 4D0TA 3ZXJA 3IPVA 2C5DA 4FVVA 4A7ZA 2R16A 1OFSA 2GNBA 2ZGUA 1WUVA 2W08A 3OYWA 1IRPA 5BXPA 5DZFA 3H6SE 4DPNA 1UKGA 1LEMA 5GALA 5IT6A 2AUYA 2Z48A 3PJQA 2WKKA 1XZZA 1AF9A 1LGNA 1WBFA 4XIKA 3R4SA 1WBCA 2PHTA 4J23B 2MLLB 2WT2A 4OWJA 1UZYA 5GLVA 4IONA 1Q8QA 5DZUA 1ENQA 4FPJA 5JLVA 3VT1A 2YY1A 4MYEA 1XQNA 2Z49A 2I2SA 3WVJA 1ULGA 2A6YA 2ZGOA 4XHBA 1A3KA 3OPZA 1GZWA 1S0GA 3E8LC 3WO2A 2Q9XA 3NJ5A 1JLXA 2D7RA 2PHFA 3WOGA 2X2TA 2KM2A 2WT1A 1S0DA 5T50A 4OWKA 1W6OB 8I1BA 3FUQA 4AYUA 4FPCA 3Q7WA 4LO1C 4ATEA 1VAVA 2ZZJA 4BLIA 3IKWA 3A0NA 4NOTA 1HWNB 2VXTI 4WVWA 2AYHA 1XYFA 3WDWA 4XOGA 5JOWA 3BRDA 2GDFA 2ARXA 4LO1A 1X50A 1A8DA 4Z8SB 4AVVA 3CAHA 1W3FA 4I30A 2Q5TA 1FYUA 2WQZC 1LHWA 4I4VA 3I8TA 1TTUA 3AH4A 1QNWA 1ZA4A 2YZ4A 1UX6A 1YF8B 31BIA 4XTPA 1SLBA 5JOXA 3BAHA 2FHRA 1SLIA 1AX1A 5T5LA 1LTEA 4J2YA 2SLIA 1M2TB 3FJ8A 1GSLA 2W52A 2ZGSA 3WZ1A 1LHVA 5FNXA 4YW3A 2D44A 1T4QA 5T5JA 1HIBA 4FOQA 3FJBA 5D61A 1V6NA 3BA5A 1V6IA 2DRYA 4SLIA 5KXCA 5IK8A 4OEFA 4CZSA 1LU2A 5DG1A 4M3CE 1IS4A 5FRAA 4FPEA 5CBLA 3N36A 3ZSLA 4YZ5A 1G9AA 2P34A 5FNWA 3ZXLA 4FPFA 4YW2A 4AN6A 3P6IA 1TFMB 4ZGRB 4XBQA 2BEAA 1Z4SA 2K8RA 4LBOA 2W68A 1N47A 4R9CA 2FFVA 5DG2A 3USUA 1WD3A 4CRQA 4AVSA 2P23A 1UN1A 1AFCA 1ABRB 4QO3A 2DWRA 4D69A 3BAVA 1SCSA 4KEJA 1TOOA 1NLSA 5GLUA 1VALA 1BJQA 3BOPA 3O4DA 2DREA 2MIBA 2P3JA 3WO4A 1LHUA 3WUCA 4TZDA 9ILBA 4P14A 4LBLA 5BXSA 2D6LX 5G00A 5H9RA 1R8NA 4I0YA 3IN9A 1QXMA 1LJ7A 1F9KA 1QU0A 4ZKTB 1AVBA 1HWPB 1CE7B 4YM0A 1CQ9A 2ESUA 4QBVA 3PVNA 1U0AA 3AZZA 1JUIA 3ZYPA 5D62A 3WMUA 3BB2A 3SNMA 4XFTA 2DVGA 1BA7A 4BMBA 4GP3A 2LIEA 4LBJA 3AXDA 3IMNA 1SLLA 1AVWB 3FJEA 1W6MA 1LENA 3CA0A 1EVTA 3AP5A 4FP2A 1HCEA 1LGBA 5B2HA 1UPSA 3O44A 1ENRA 5BOWA 3FGMA 2VXRA 2CNAA 4LBQB 3F1RA 3U4XA 3ILNA 2ZGKA 1S0FA 4YGCA 4DFSA 1WD4A 3WLUA 2GN3A 1HKNA 1BARA 1KNMA 2PHWA 2DUPA 3A23A 3WCRA 3ILAA 3N7KA 3B3QE 1DQ5A 1V6LA 2DU1A 3ZSMA 4L4IA 4AVTA 2A3XA 3WDXA 2VW2A 2A5ZA 2NM1A 2ZGPA 3Q7YA 2CTVA 4UW6A 4Q9GA 3UJOA 1VCLA 4I1EA 2VSEA 4X38A 2NP0A 7I1BA 2ZQNA 3FBYA 4H04A 3ILFA 3NWKA 4I96A 2C9AA 3UJ4A 2EXKA 1DQ0A 1I3HA 3PG0A 3RQ0A 1HCDA 4YZ2A 3DUIA 2P39A 2ET2A 2X2SA 5GZGA 3AZXA 3RSJA 3HR9A 3O0WA 5GLWA 3O4AA 4G6MA 3MW4A 4YG3A 5H9SA 4P0JA 4LBNA 1AXYA 3H0OA 3C9ZA 1DQGA 4J2SA 5HCBA 2DUQA 1MS1A 3MEPA 3M3QA 1JT4A 2BFHA 2NVHA 3WMVA 4JKXB 4M01A 2E6VA 1VIWB 3ZXKA 3FFZA 2XG3A 3ILRA 1OQ1A 1Q8OA 4WV8A 1PUUB 4XXAA 5GZFA 3LSDA 3WDTA 4PCRA 1P63A 1NZKA 4P0LA 4CTEA 1QMJA 3VSFA 5T55A 5FZZA 4FOYA 1DLLA 1GZ9A 4D8HA 4HA2A 1W6PB 2Y9FA 2CYFA 1DZDA 1CONA 2R49A 3BRFA 4Q91A 4FPOB 3BAGA 4D0ZA 1QDOA 3N3HA 4XKIA 1LHNA 3M3EA 2KH2A 1BFGA 3N7LA 3O4CA 2GO2A 1JYCA 1ILR1 3ZYRA 1M16A 3V65A 3O12A 2I1BA 3KMVA 1RZOB 1EPWA 3VKFC 2H0BA 4EEEB 1EV2A 1Z2VA 1Q56A 1N3PA 3N35A 4IZEA 3BX1C 1JQZA 3R05A 4R9AA 3WINC 3WDVA 1AXZA 1YYNA 4GXLA 4PBOA 5L73A 4KC3A 2GALA 2JKBA 1ULEA 2NZ9A 4LBQA 1PZ8A 3D7WB 2R0FA 3WINA 4L8QA 2D43A 3V0AB 3POWA 2JDZA 1R1ZA 3Q9OA 3FJDA 4XHXA 3JUTA 3CU1B 3AYAA 3BAOA 4H9WA 3ZXEA 1WLCA 1D0HA 2UURA 1ULCA 2E7QA 1DQ6A 1GYKA 4ISQA 1YRZA 3W58A 1FAYA 2FGFA 4Y22B 3C2UA 1GLHA 1HQLA 3BTAA 5DXDA 3SH4A 5SV8A 5GZDA 3NBEA 1QOTA 3VWCA 3CA3A 3AH2A 4GALA 2DVBA 4GAIA 3VKOA 1YXWA 5E88A 1N1SA 3B00A 1XG6A 2D6KA 3VUOA 1AXKA 1J1TA 1SBEA 1V6JA 3VT2A 5JOZA 1FV2A 3GNEA 1F5FA 1Q8PA 2DVFA 2JE9A 3SH5A 3H6RA 1N3QA 2EXIA 1GV9A 3A07A 3RG0A 4CJMA 5GM0A 3O4OA 5CA6A 1QNYA 3ZXGA 4OUJA 4GWMA 4A7KA 3CA6A 2A6VA 2DRZA 3AKIA 3SITA 4JRAA 3W9TA 1Q03A 2ZGMA 3FJCA 3APBA 5FZYA 4G9MA 1CVNA 2KLLA 3OY8B 4OEEA 2CY6A 2ZACA 5GZCA 4DCKC 1MZ5A 5KXBA 3ZXDA 3O0XA 1WW5A 1CJPA 1IRAX 1RITA 3AH1A 3TC2A 4WZFA 4JC1A 5H9QA 3FUOA 1C4RA 2ARBA 2VUAA 4GOYA 4QBCA 2A71A 4M00A 4I4RA 3PVEA 1ISVA 2ZHLA 2WBCA 2DTWA 3T8SA 1DIWA 1ULFA 1MACA 4G1RA 1IS3A 4AN7B 2SBAA 4FOWA 3ZXFA 4AWDA 5DZGA 1LOGA 21BIA 1V6WA 1TP0A 2CL2A 3I2XA 3INAA 1AZDA 4DEPA 1V6XA 2D3SA 1RINA 5E8AA 4YFWA 5IUQA 3CNAA 1ZM1A 3IM0A 1KJLA 2AR6A 2D6MA 1CESA 2D3RA 3UL2A 4ASMB 3T1MA 3ZX7A 3AYDA 4I2SA 1YIFA 2DTYA 4M3CF 4XDQA 4JAWA 4G6JA 4BPZA 3O49A 2WRYA 3ZC9A 1S0LA 5T5OA 4Y26A 1W3GA 5BQUC 1LESA 1LGCA 3ASIA 4YZ4A 2FFUA 2W39A 1HWMB 3WUDA 3VV1A 1LU1A 1BFCA 2YXSA 1KDMA 3AJ6A 2NN8A 4P9YA 1H9PA 4YGBA 4BM8A 5BQUA 4GKYA 4Y22A 4W65A 1QKQA 2AFGA 3WV6A 4FGFA 5F8SA 4XBNA 2IWTB 3ZVXA 1CIWA 1DYKA 4I4XA 4K21A 4XE9A 1GBGA 4EFPA 4IHZA 4YG0A 2PHUA 3RTJB 3LTQA 1V00A 2VLCA 4YG6A 1N1VA 2BQPA 5EXOA 4HR6C 1G7YA 1MS8A 4XTMA 4FP3A 2VSAA 2ZGLA 4DRVA 3B9CA 3A22A 3HN1A 2F8XC 4I4OA 2UU8A 1DQ2A 2LIQA 5BVPI 2P37A 5BYNA 3WHUA 2DU0A 4RL7A 2GMMA 4Y20B 3AP9A 4QD2B 5DUVA 1PZZA 2OVUA 2OW4A 4ZBVB 1GANA 5HPZA 2GZBA 5HCAA 4WBCA 2AH2A 1S0BA 5F8YA 1W6OA 2G4IA 3FJJA 2ZGQA 4HL0A 3AJ5A 5GLTA 4XBLA 2V5YA 1C1FA 1J0SA 3ATGA 3A4UA 2D7FA 2Z42A 2HWAA 4U36A 5GLZA 3AKHA 1Q8SA 2ENRA 4EFQA 1IOAA 1RY7A 3D6EA 1O4YA 3A0KA 1RIRA 2ZGTA 3DGTA 2ZKNA 3IM5A 1O4ZA 2A70A 1SLCA 4ZXKA 4OW4A 3M3OA 1WW7A 4C1XA 2UWCA 1S0JA 3ZSKA 1OQLB 3T2TA 3SNVA 3QYDA 2AREA 4KEKA 4GOVA 1G9CA 3AKGA 1FGAA 3BA4A 1FMMS 3N0KA 3A21A 5I1BA 2AXMA 2KI6B 2CWMA 2PHXA 5H9PA 1FNZA 5F9TA 3UD8A 4FPKA 1MZ6A 2EXJA 1WBLA 1JTCA 3POYA 4PF5A 1MS9A 5AVAA 4PQ9A 2UUSA 2E53A 1ULDA 4XJUA 1IHKA 3ZPYA 1BFBA 4DQAA 2AAIB 2P3KA 4P0KA 1S0CA 2TEPA 1AJKA 4NO4A 3POSA 4H55A 3TAYA 4C1WA 1DBNA 2ZQOA 1SACA 3BODA 5EHAA 3IPVB 4I4YA 4X3AA 4LBKA 1MS4A 2JE7A 3AJYA 2DV9A 4JPZA 1QQLA 1HDKA 4TLPA 3EF2A 2OUHA 3OYWB 2P3IA 1AVAC 3V0BB 3UD7A 5JMCA 4YGDA 3CA1A 1CR7A 1IJTA 1W6NB 1GKBA 1V6OA 1V6MA 4LBMA 1KQRA 3LSEA 1BQPA 4DS0A 3AK0A 4QD2C 1UZZA 1CPMA 1CPNA 4Q1PA 1S0IA 2EXHA 2NMNA 3M3CA 5IK4A 3FJIA 2BEBA 5DVHA 2ERMA 4OWLA 3GALA 3LCPA 1WLWA 2P2KA 4Y20A 3D5OA 4EB2B 1SBDA 4DENA 2GNMA 2VH9A 1JT3A 5LK5A 3N7JA 1C1LA 4I8MA 4ZFUB 2ZBJA 2YROA 4ZFWB 4G9NA 5T52A 3CA5A 4XJWA 3NV1A 3BA7A 4Q9PA 1W6QB 2LALA 4ISRA 3S8KA 1V6UA 4LO3C 5DUUA 4LO0C 4PC4A 4Y1VA 3JRRA 5D63A 1SFYA 4USPA 2VW0A 3NV2A 1I1EA 3BRGC 5T54A 1SBFA 2D3PA 3RMXA 4LO3A 2D22A 4LO0A 3O5SA 2ES3A 1AVXB 2UWBA 2DVDA 1II4A 2JECA 3AYEA 1W3AA 2XB6C 4ZLBB 2RHPA 2VY0A 4M3CB 1TIEA 3IM6A 3VEQA 1JLYA 2OUJA 3AJZA 4PBPA 2RG9B 5GJ6A 4X39A 4BMEA 3CRIA 1ISWA 4F34A 2Y9WC 3RTIB 1ENSA 5DUYA 1BKZA 2Q3NB 2LTNA 1DQ1A 1GNHA 5BP5C 3AP4A 3FLPA 2M49A 3JU9A 2QN4A 4R9DA 2ZR1B 4ITCA 4I4QA 41BIA 5EYYA 3AP7A 2GMEA 4IYBA 3OGGA 2HZ9A 4Y1ZA 5BP5A 4XJ9A 4Y1XA 5EC5A 2D20A 1HWOB 4K1ZA 4Q1RA 3OBRA 3WDUA 1FWVA 3B9UA 2DURA 4IY8A 4QKSA 1XHBA 1DFCA 1DFQA 1LCLA 4YGEA 1WW6A 2FMDA 3Q7XA 1LOFC 1JT7A 1AX0A 1BLDA 4WVVA 3P53A 5EG6C 3TB0A 4J2KA 3OJVA 1AVUA 4XMAA 3LLPA 4JKQA 1LOFA 1FATA 2GMPA 1MS5A 2K4AB 1H30A 1PWAA 4R6UB 2IHOA 3V0BA 1ISZA 2A75A 2ZA9A 5E89A 1QOSA 2VU9A 1DHKB 4RA0A 1SLAA 1C57A 1W6NA 2ZMLA 1MR5A 1DZQA 2L5XA 3USUB 2A6XA 1LOBA 1Q04A 5GZEA 3KM5A 3BAQA 1YI7A 4JQ0A 4XXPA 1MS3A 2WLQA 4I1BA 3HOMA 3I4IA 1FNYA 4Z8BA 1K5UA 2DUOA 3IIRA 4J2XA 2R0HA 3AX4A 4YM3A 1DZCA 2YMZA 1YO8A 2VW1A 4EFRA 1LOCA 3WO3A 5GAQA 1N1TA 1MVQA 3RMYA 1WLDA 1MD6A 1WBAA 1HLCA 2EIGA 4FPGA 1KDKA 2HYKA 1W6QA 1WCSA 4Q8KA 3HBWA 1QDCA 4Z9WB 1PZ7A 1FQ9A 2YUGA 1W6PA 3R4UA 1EYLA 2YV8A 4LO8B 2AQZA 1YBIA 3K1XA 3FJFA 3AZVA 4JCKA 3I29B 4GAFA 2F2FC 2ZMKA 3N7MA 4ENDA 1NUNA 1URXA 2ZMNA 4M3CA 4YW4A 3BAUA 2RSTA 2RQ9A 3B01A 5KXEA 4KBBA 1FWUA 4IQPA 1G86A 1N4KA 3S8JA 4Q26A 5F8WA 3WA1A 2F2FA 2ZHKA 3WNXA 3CQAA 1ONAA 1Y7BA 4XJ8A 3VSZA 3FLTA 4YFZA 2GNDA 2D6PA 4UW4A 3WG2A 1W6MB 3WHTA 4XILA 1MS0A 2HWMA 3OBTA 2A3WA 5FREA 4I3NA 1LEDA 4A7YA 3RS6A 4GKXA 1T9FA 4I7IA 3V0AA 4TYSA 5DUWA 6I1BA 1MVEA 4JP0A 1DJSB 4Y1UA 1WW4A 3WCSA 4Q2FA 3O5WB 4Y1YA 1H9WA 5FZUA 3MW3A 1IILA 3QLQA 4USOA 3AZWA 4XYXA 2HW9A 1QF3A 4F83A 1B09A 2AGSA 1VLNA 5CNAA 3SH3A 1LULA 1Q8VA 1HKDA 3F62B 3H6QA 4FQZA 2ERFA 2EAKA 1CN1A 1QQKA 3VKMA 4K1YA 2Y9XE 1JT5A 1IKPA 4YW5A 5CAZA 4FQ4A 4LO7B 1TWEA 3P6JA 2WJSA 4IZXA 4AGRA 1YTOA 4LBQD 1G9DA 4I4PA 2AENA 1JYIA 3MW2A 1D2SA 1JHNA 4Q27A 3ZC8A 4GWNA 2GNTA 4UW5A 5DUXA 1AXMA 1G9BA 3ZSJA 3O4BA 3T1LA 1PUMB 4KEIA 5DZEA 1I1BA 1S0EA 4BOWA 3M1HA 1DGLA 2WNEA 3I2AA 3UD9A 1BASA 2ZGRA 3NV4A 5BXRA 3CA4A 1G82A 4U2AA 3JUUA 1G8WA 4YM1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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