1YXWA

A common binding site for disialyllactose and a tri-peptide in the c-fragment of tetanus neurotoxin
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Common binding site for disialyllactose and tri-peptide in C-fragment of tetanus neurotoxin
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Tetanus toxin (Tentoxylysin)
total genus 115
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2005-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1yxwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1yxwA02
4G9MA 2A5ZA 3AZVA 3TAYA 2E4MC 1NXD1 3HN1A 4DRVA 1A78A 4FOQA 4YZ1A 3C9ZA 1UX6A 3BOPA 2LALA 1KDMA 2VW2A 4Y22B 4FPEA 3FUQA 3RG0A 2NP0A 1IKQA 4KEJA 4AWDA 1TFMB 1BARA 4I1EA 5CNAA 4TZDA 1MS1A 1AVUA 4P6AA 2R0HA 2D6PA 3MW4A 1W0OA 3UK9A 2AXMA 1H9WA 4XKIA 4ZFWB 1KRIA 3ILFA 3WMVA 4DS0A 5IUQA 4ENDA 4BPZA 1GBGA 1CONA 1AX1A 1RG8A 4AGVA 4L4HA 1Q03A 3WHUA 1BLAA 5HCAA 1BFFA 2A70A 3F1RA 2YY1A 4JCKA 4XBLA 1YBIA 1QGLA 2VUAA 1DYPA 1X50A 2UWCA 4LO3A 3IKWA 3AYEA 1D0HA 4WBCA 2Z48A 5T50A 3HALA 4D8HA 2L5XA 2ZGSA 4RL7A 1W6MA 1JN2P 41BIA 2CNAA 4Q1RA 5HCBA 1UN1A 1UZZA 1N1TA 1ULCA 1LJ7A 2P23A 5H9SA 4BMBA 4RA0A 1FNZA 1W3FA 3ZVXA 1WLDA 3V64A 2PHUA 3I4IA 4YW4A 2CL2A 5D61A 2ZMLA 2ZR1B 1WD4A 3BAUA 3ZXLA 3AJYA 4Y1VA 1EYLA 5JOWA 1MS5A 3V79C 2DS0A 2JE7A 3O4BA 1C57A 5DSSB 1W6MB 3BAQA 2D23A 3NV3A 2Y9FA 1YTOA 5FNWA 3OBTA 1W6PA 3W58A 4DEPA 3T1LA 3BAOA 3AKGA 3M1HA 3ZXDA 1EPWA 4XOGA 3IM5A 3RRDA 5EWSA 5H9RA 2NN8A 5DUXA 3RQ0A 3VT1A 1BQPA 1ISWA 3ZSKA 2Q3NB 4M00A 4KC3A 3T8SA 2R9KB 5BXPA 4FPHA 2A3YA 4OWKA 3BADA 1N1VA 1DQ0A 1QKQA 3FLPA 4FQ4A 1FWVA 1O4YA 2CTVA 1MR5A 4U36A 2VW0A 3WO2A 2P34A 1OFSA 4USPA 2KI6B 1IKPA 2W68A 1W6PB 3WDXA 4LO0A 3GALA 3AKFA 3ZXEA 4HA2A 1DFQA 2PELA 2G4IA 1Y7BA 3KM5A 4LO1C 1FMZA 5FZUA 1QXMA 4CZSA 2Y9XE 4ATFA 1B09A 4DFSA 3AJ5A 2UURA 4C1WA 4ITCA 3VEQA 3VKOA 2JE9A 2HYKA 4FPGA 2ZHNA 4A7KA 1W6QA 3WDTA 1RINA 3D4KA 4DPNA 3JUUA 2DVDA 3O4AA 4JP0A 2Q9XA 4LBOA 2VSEA 4XJ9A 1KJRA 1ZA4A 1JLYA 3WLUA 2ARBA 4G6JA 1AJKA 4HANA 3CQAA 5E24E 3R4UA 3VKMA 1JT3A 2P3KA 1BFBA 1LHWA 3FBYA 4HR6C 1JTCA 1R8OA 2RSTA 5FZYA 1LEMA 4IY9A 1WBFA 1BA7A 3N0KA 3AP9A 4XBQA 1W3GA 2WRYA 1S1AA 1MS4A 1Q1UA 2AR6A 4NO4A 3AZYA 3AKHA 3WV6A 2ESUA 3O0VA 1TEIA 1W6QB 5DG2A 5BYNA 4IZEA 3IN9A 1MS9A 3FLRA 1ENRA 4K21A 3PVOA 3D5OA 1IOBA 3PUBA 2ZMKA 2IWTB 1NLSA 3UJ4A 2ARXA 2A71A 3VWCA 3ZSJA 2PHFA 1G9FA 2DREA 3FJCA 1BFGA 3POSA 4I4VA 3WZ1A 1DZCA 5DZFA 4X3AA 1CN1A 2CY6A 3AJ6A 3AYCA 4UW3A 3BAVA 4I4YA 5H9QA 3MPPG 4BOWA 3AKIA 3INAA 4G6MA 3AZWA 1Z0HA 4GKXA 1DZDA 3U4XA 3VT2A 1KNMA 4YGEA 2ZBJA 2NZ9A 3IPVA 4GWMA 3FJBA 3O0WA 1LEDA 1M16A 3I29B 3I8TA 3A23A 4Y20A 1MS8A 4UW6A 4LO7B 1SR4A 3N7LA 4Y26A 1BASA 3P6IA 2EXIA 1FN0A 2CWMA 1W6NA 2PHRA 5F8SA 1ONAA 4EFQA 3BRDA 4UW5A 3USUA 5IT6A 4XTPA 1WW5A 2ZGPA 1HQLA 3UDAA 4YGCA 3M3EA 1DBNA 2DVFA 2VU9A 4L8QA 1V6VA 3UL2A 2LIEA 4CJMA 5F8YA 1ABRB 2ZQOA 4FPJA 1G9DA 3NBNA 2D44A 4PBPA 3IPVB 1HDKA 5JOXA 4Y20B 2KLLA 1LOFC 3IM7A 1PUUB 3WO3A 1GYKA 3FJFA 4Q91A 3FJAA 2WT2A 2ZGTA 2W39A 3TB0A 1W6NB 5B2HA 5EYYA 1SLAA 1XYFA 4OWJA 4CTEA 2KM2A 1G86A 3UJQA 4IY8A 3USUB 1W3AA 4LBLA 3VV1A 4Q1PA 3AYDA 5GZDA 4P14A 4DENA 5T55A 4A7YA 1DQGA 2DRYA 4GALA 3ZXFA 1W0PA 3AXDA 1Z2VA 1SFYA 4DRRA 1PUMB 3BAHA 3FFZA 2ZGQA 5FRAA 2WKKA 2I2SA 1P63A 4OWLA 3ILAA 4AVVA 1UL9A 3IM0A 3ZXKA 4AYUA 4LBQA 1G8WA 4IQPA 4AVSA 2JECA 3WCRA 3N7JA 1IS6A 3OYWA 1C4RA 5E88A 4ZXKA 1F9KA 1WW6A 4FQZA 3P53A 2E53A 3POKA 5F9TA 2VSAA 4AGGA 4WVWA 3WINC 3FLTA 2A6WA 2ZKNA 5T5LA 2GO2A 1QF3A 3BA4A 4MYEA 2R1DA 4I3NA 1N3QA 2WQZC 2P2KA 4Q26A 4XMIA 3SH5A 2IHOA 4XJWA 1CIWA 4XE9A 3VSFA 3BB2A 4QC4A 5BXRA 3B9CA 1J0SA 3CA1A 4ZBVB 2WT0A 4LBQB 4FPCA 1SLTA 1LOEA 5KXDA 3VKFC 1YXWA 1WW7A 2D7FA 4IYBA 3KMVA 1AJOA 1LULA 3AK0A 3HR9A 3PG0A 4R9CA 1SCSA 1QOOA 1VAMA 4F34A 1IILA 1LHOA 4FPFA 3N36A 3WG4A 3LSDA 1JQZA 1O4ZA 3O49A 1MACA 4P9XA 4QBCA 1UAIA 1C1FA 4Q27A 1PC8B 3MEPA 2BEAA 1ILR1 2HW9A 3LLPA 1V6KA 1AXZA 1CVSA 5GAQA 4R6UB 3AFKA 4JAWA 4QKRA 3NV2A 1RZOB 2WNEA 5JOZA 31BIA 4I4XA 3WINA 5BOWA 1MVEA 3WDYA 1OQ1A 5JMCA 1Q56A 1JY0A 3HSMA 3AJZA 3ZXGA 2GNDA 1DQ5A 5IK5A 5EG6C 2D6KA 1BKZA 1A8DA 4P0LA 3SNVA 4ZGRB 1RIRA 3O0XA 3WVJA 3ZSMA 1W6OA 2OUJA 3AYAA 1SLCA 2F2FA 2AYHA 5GLTA 1GZCA 4X37A 1HWMB 4G1RA 2MC2A 1AZDA 3UD8A 4GAFA 3NBCA 1V6MA 6I1BA 3T2TA 3N7MA 2VW1A 4FOWA 3IM6A 4GKYA 4LO0C 1WLCA 1AX2A 3KQRA 1UKGA 4LO8B 5DZUA 4GOVA 4AN7B 1DYKA 1LHNA 4CRQA 5EC5A 3VKLA 4M3CA 1YI7A 4R9DA 2XB6C 3B00A 5JOYA 4I4UA 2YROA 3POWA 3N3HA 1JUIA 4Z8BA 3ZC8A 3A22A 1W6OB 2Y9GA 4I4QA 2HWMA 1ENQA 1JHNA 4OEEA 1V6XA 4LBNA 3WG1A 1H30A 1FV2A 2PHTA 3OJMA 4I4RA 3M2MA 3RTIB 3CAHA 8I1BA 4FPKA 4FP3A 3AH4A 4JQ0A 1G7YA 2FFUA 3V0AA 1LU1A 1I3HA 5AVAA 4BQ1A 5HPZA 4I6IA 2YXSA 4ZKTB 1R8NA 2B7YA 5GLZA 5JDBA 1AF9A 3V65A 1CJPA 3HOMA 2EIGA 1SZ6B 2AAIB 1JXNA 1Z78A 2X2SA 4M3CB 2C5DA 4EB2B 4QKSA 3O4CA 2GMPA 1WLWA 4BMEA 3Q9OA 3WO4A 3NV1A 2KI4A 1TWEA 4LO7C 1ISYA 1U0AA 5F8WA 1S0EA 1DIWA 2FDBM 3ENRA 2PHWA 5DZGA 1SBFA 2DU0A 2MLLB 4I4PA 5DUUA 3WG3A 2OVUA 3QCWA 1M2TB 4XDQA 4ISQA 5FREA 4EEEB 2UUSA 3V0AB 3R4SA 1ULEA 1AVXB 3RTJB 2ERFA 1YYNA 1S0DA 4FPOB 1ISVA 3OJVA 3JU9A 4QD2B 2LTNA 2WSUA 5GM0A 1S0JA 3O5WB 4U2AA 4YW1A 4WV8A 1N3OA 4PF5A 5CBLA 3AX4A 3CA4A 4I8MA 4LO2A 1PWAA 5EXOA 2VLCA 1BLDA 2KKIA 1LGBA 2D1ZA 3ASIA 2GNTA 1SR4C 1V6NA 1BYHA 1JBCA 4L4IA 2NMOA 5E8AA 1LOBA 1QOTA 3IAGC 1APNA 5GZFA 4XFSA 3ZYPA 3OBRA 1ENSA 1TWMA 2KH2A 3UJOA 3FUOA 2D43A 1AVWB 1N3PA 2D3SA 1EV2A 3Q7YA 2TEPA 3CNAA 2ZAAA 2D7RA 1II4A 5D63A 1V00A 2Y9WC 4I4SA 2D7IA 2X2TA 4BLJA 5DXDA 2ZHMA 2NTDA 4YGBA 2JDZA 4W65A 1DGLA 2E6VA 1E0OA 1Z4SA 3FJJA 3LSEA 3CU1B 3BRGC 3PJQA 4D69A 1KJLA 2DUPA 4J23B 3AXEA 3WUDA 1HIBA 2DRZA 4OEGA 4H55A 4J2SA 1DQ4A 1XHBA 1K5VA 2ES3A 5BP5A 1SBDA 7I1BA 1S0GA 4YG6A 3TC2A 3AZXA 1QQLA 5GZCA 1OQLB 1HQWA 2YUGA 4FGFA 1LGNA 2AUYA 4II0A 4I37A 3D6EA 4BM8A 4XILA 3ZPYA 3ZYRA 5CB7A 3OJ2A 1FATA 2XG3A 4UW4A 2FMDA 1T4QA 1V6OA 2DU1A 2WSVA 5GLUA 3O12A 3W59A 1NZKA 1AXKA 2XOAA 2YV8A 4NOTA 2A75A 4X39A 5DUWA 1CVNA 2ZHLA 1QNYA 2M49A 3PHZA 2DUOA 1FYUA 4XJUA 1IS5A 1GGPB 3B3QE 4Q2FA 2JJ6A 5T52A 5CA6A 1LECA 2DV9A 2GN7A 1G82A 2QYIB 4P0KA 4KEKA 4C1XA 2QN4A 4XJ8A 5T5JA 2R49A 1CE7B 1QNWA 2ET2A 2A6YA 3A21A 2ZGNA 1ISZA 4ZFUB 3CA0A 1LENA 4ZA3B 3FJ9A 3ZC9A 2A6VA 1LHUA 2GNBA 2DVBA 1N1YA 1LODA 5I1BA 5D62A 2D20A 2YZ4A 3MALA 3UD7A 4ISRA 5E89A 1DQ1A 1FAYA 2GALA 1HWPB 1HKNA 5KXBA 1N47A 4QALA 3FJHA 2DWRA 4XIKA 5FNXA 4D0ZA 3AP6A 2R0FA 4YLZA 3M3CA 2EAKA 4LBKA 1SCRA 4I30A 1DFCA 3F62B 4KEIA 1TTUA 2A3XA 4R9AA 1GZ9A 1WUVA 4YM1A 1TOOA 4BLIA 3WDUA 2ZGUA 3POYA 1WBCA 4DCKC 1TP0A 5H9PA 1UPSA 2NYYA 5EHAA 3SH3A 4YM0A 1I1EA 3BIWE 3WNXA 4YZ3A 2P39A 1SLIA 2OW4A 1IHKA 5DZEA 4A7ZA 1Q8VA 4YM3A 2F8XC 3LCPA 3WCSA 3FJDA 4YFWA 2FFVA 1FNYA 2F2FC 4YM2A 4HL0A 3BODA 4I96A 2E7QA 4ZOTA 1OKQA 1KITA 3LTQA 3H6SE 1XZZA 1IJTA 1JT7A 2W08A 4PC4A 1CESA 3E8LC 4TLPA 4M01A 1TIEA 1A3KA 3WHTA 1FV3A 2Z49A 1AX0A 3NJ5A 3DGTA 2P3JA 4PBOA 1F31A 2K43A 3W9TA 3A4UA 1QOSA 1KQRA 1GLHA 4AVTA 3UD9A 4OZXA 3CA3A 2E51A 4YW2A 3BX1C 2PHXA 5T54A 2ZGOA 4WZFA 1GSLA 2P3IA 4Y24A 3APBA 1ZM1A 1SLBA 5F90A 2E7TA 3ZSLA 1Q8PA 4DQAA 2ERMA 2H0BA 4R9BA 5DUVA 4OW4A 4JC1A 2JKBA 1YF8B 1HLCA 3ILRA 3A07A 3O4OA 1BXHA 1AXMA 4P0JA 2D3RA 2DTYA 5BQUA 2GN3A 1Q8QA 4QD2C 5SV8A 1WW4A 3O4DA 4XHBA 2V5YA 4Q8LA 4GWNA 1EVTA 5BXTA 1VCLA 2FHRA 3BA7A 5F5QA 2D6NA 1GZWA 2ZABA 4XFTA 2R1BA 4LBQD 3S8JA 1JW6A 3Q7WA 1ULFA 1HWNB 1GICA 5L73A 1SACA 3SLIA 1MS3A 3JRRA 1V6UA 1AFCA 3BRFA 2FO1A 3B9UA 2EXHA 1IS3A 4XZPA 1CR7A 2VH9A 4PCRA 4XYXA 4IZXA 1J1TA 2ZMNA 3HMYA 3RMYA 4QBVA 1MC9A 2C9AA 3AZZA 1MZ6A 4FPLA 4LBJA 3WOGA 4JPZA 2ZGMA 1JOJA 4Y1ZA 1ULDA 4I2SA 5IK8A 3WDWA 1WBAA 4F83A 2JD4A 1CPMA 3S8KA 2HZ9A 2A6XA 4GOYA 4LO2C 3H6RA 1GZWB 2E4MA 2GZBA 3NBEA 2DVAA 3MW2A 1UZYA 1QMJA 1I1BA 2AH2A 3FJ8A 3FJIA 4XJZA 5FZZA 3FJEA 3H6QA 1Q04A 1LTEA 1FGAA 4Z8SB 1MZ5A 2WLQA 2SBAA 4K1ZA 3PVNA 1T9FA 2YMZA 1IOAA 3P6JA 4JKQA 2D6LX 4ATEA 1D2SA 1KDKA 1URXA 2DURA 3WG2A 1BFCA 3PVEA 2K4AB 3WMUA 1XQNA 4YZ5A 2OUHA 3PMEA 1HKDA 1G9CA 2J3PA 2UU8A 2ZGRA 4XTMA 3H6RB 1IRPA 2NVHA 1LOAA 2DYCA 1LESA 2D24A 3GNEA 5GJ6A 3RS6A 4EFPA 4ZLBB 3DUIA 3FJKA 9ILBA 4YOLA 2AENA 1DQ6A 1QDOA 1GNZA 3O44A 1DZQA 1Q8OA 4FOVA 3L2YA 1IRAX 1V6IA 5BP5C 2V73A 1BJQA 1L2HA 5GZEA 4XFUA 1AXYA 1LOCA 4LBMA 3EF2A 3ATGA 1QQKA 2NMNA 2FGFA 2ZA9A 1GKBA 5GALA 4K1YA 1V6LA 4XIOA 4GXLA 1IS4A 3V0BA 3CRGA 2ENRA 3OGFA 3AP7A 1G9BA 4H04A 4J2KA 3B69A 3ZX7A 4Q8KA 3OGGA 4FP2A 4YFZA 1SLLA 2DVGA 4GP3A 2VXRA 1FWUA 1MD6A 1FX5A 2DTWA 2VY0A 1CQ9A 2I1BA 1RY7A 1PZ8A 3CRIA 1LHVA 1HCEA 3A0KA 2A7AA 3D7WB 2EXJA 3I2XA 5DG1A 4Y1YA 4D0TA 3OPZA 4KBBA 4WVVA 1DQ2A 1AVAC 5EYXA 2SLIA 4P9YA 3N35A 3OJBA 4YZ4A 4K20A 1S0CA 3N7KA 2RG9B 1G9AA 3VKNA 2GNMA 3V0BB 2Z42A 1RITA 3I2AA 3K1XA 1K5UA 2WT1A 5G00A 1QDCA 4I4OA 4YGDA 4SLIA 4TYSA 4XXAA 2D3PA 3CA5A 2RQ9A 4YW5A 3VUOA 1H9PA 4YG0A 3AP4A 1CPNA 2GDFA 3O3QA 1MS0A 1DHKB 1WD3A 1S0FA 4I0YA 2ZQNA 1LOGA 3SNMA 1GANA 4J2XA 1VALA 3O5SA 4H9WA 1C1LA 1JT5A 4LO1A 5LK5A 2K8RA 3SISA 1VAVA 3SITA 1FMMS 3WUCA 1F5FA 1QU0A 4USOA 4XBNA 4J2YA 1LU2A 4G9NA 4OEFA 1SBEA 1S0LA 3IMNA 3VT0A 1V6JA 1LGCA 3QLQA 2WJSA 1JYIA 4EFRA 2CWSA 5HCFA 4M3CF 2NM1A 4YW3A 5BXSA 4GAIA 2ZZJA 3UJ0A 4XMAA 1MVQA 4HJJA 3M3QA 5GLWA 1LCLA 2UWAA 2EALA 1N4KA 3WA1A 2HWAA 3QR5A 2BEBA 3CA6A 3AP5A 3NWKA 2GMEA 3VSZA 4AGRA 2WBCA 4Q9GA 2D6OX 2Q5TA 4JRAA 1WBLA 1ONKB 3R05A 1DJSB 3AH2A 5JVVA 3T1MA 3FGMA 4I1BA 2AREA 1NUNA 2VXTI 3BTAA 1HCDA 2D6MA 1WCSA 1FQ9A 4YZ2A 2R16A 2P37A 2MIBA 1DQOA 4P9WA 2A6ZA 1Q8SA 2BQPA 5DUYA 1GV9A 2AFGA 4FOYA 3HBWA 1PZ7A 2CYFA 1ULGA 3OY8A 4GA9A 1IT0A 2UWBA 3RMXA 1S0BA 3JUTA 1N1SA 5T5OA 1JYCA 5CAZA 5IK4A 21BIA 4XJAA 4Q9PA 4ZFYB 4GP0A 5T5PA 1S0IA 3M3OA 3SH4A 3NV4A 3BAGA 5BVPI 3NBDA 4PQ9A 3C2UA 4M3CE 4Y1XA 3ZXJA 5BQUC 2D22A 2EXKA 1GNHA 5DVHA 5JLVA 1VLNA 1YRZA 5GZGA 3B01A 4Y1UA 3AH1A 1JT4A 4AN6A 4QO3A 1HWOB 5IK7A 4XHXA 2DUQA 3OY8B 1DLLA 1VIWB 5KXEA 3IIRA 4ASMB 4Z9WB 3MW3A 1ISXA 1V6WA 1R1ZA 4XXPA 1PZZA 1YIFA 2W52A 2ZGLA 3QYDA 4Y22A 1LOFA 4OUJA 2ZGKA 4IHZA 4LO3C 1XG6A 4FPYA 2AQZA 3WDVA 2GMMA 5KXCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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