1YYNA

A common binding site for disialyllactose and a tri-peptide in the c-fragment of tetanus neurotoxin
Total Genus 112
50100150200250300350400020406080100
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
50100150200250300350400400300200100
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium tetani
publication title Common binding site for disialyllactose and tri-peptide in C-fragment of tetanus neurotoxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tetanus toxin
total genus 112
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2005-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1yynA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1yynA02
2KI6B 3PMEA 2AAIB 1AJKA 2ZGRA 2WKKA 4QO3A 4YLZA 4J2KA 3FJ8A 3RMXA 1WBFA 1QF3A 2E51A 2AUYA 2ARBA 5DUWA 4JAWA 4WV8A 2ZAAA 3WDXA 5CB7A 1Z4SA 4ZKTB 4K21A 4D69A 4IYBA 1N1TA 3HN1A 1N3PA 3H6QA 1Z0HA 4FPFA 1PZ7A 3BA5A 1BFGA 3D5OA 2GNBA 3N35A 3HBWA 1PC8B 4ENDA 1AX1A 3WG4A 2VSEA 1AJOA 2EXHA 2ENRA 4WVWA 3WOGA 3FLPA 3AH2A 2D6NA 3FBYA 2GMEA 3WZ1A 2D20A 1N3OA 4W65A 4Y20B 1ITBA 2DVBA 4XJ8A 4EKXB 4Z8SB 4YGEA 2XB6C 2WBCA 1JYCA 2HWMA 2GMPA 1GNHA 4XILA 3D4KA 3VT0A 2GO2A 1W6QA 3PVNA 4RA0A 4ASMB 3M3OA 4YGBA 3WLUA 1TEIA 5E24E 4D0TA 2ZGQA 2CTVA 4FP3A 2UWCA 1KDKA 1LHOA 4HA2A 2CWMA 2A7AA 2ZGMA 4YW2A 3AP6A 2A6XA 1SBDA 4YM3A 4I4PA 3FLTA 4QALA 3ASIA 4QD2C 3INAA 4UW4A 3B69A 2PHXA 2ARXA 1VAMA 2Y9XE 1FQ9A 1LOCA 3BAUA 4YM0A 1DQOA 4CRQA 2ZHKA 5HCFA 4DCKC 1APNA 2YUGA 3ZVXA 2EALA 3A21A 2EAKA 3AFKA 4G9NA 2DREA 1AVXB 5F5QA 1AVUA 3AJZA 2ZHLA 3O0WA 1H9WA 3BOPA 4XTPA 4YGCA 3FJCA 1H30A 3HR9A 3VT1A 1GV9A 1IILA 2W52A 2VLCA 4YZ4A 1CQ9A 3IN9A 4DPNA 2Z42A 2ZACA 1FX5A 1Q56A 3W58A 3AP7A 2HZ9A 2Y9WC 1S0IA 4M3CB 1WW5A 4Y1UA 2JE7A 3QLQA 5E88A 1ULGA 2F8XC 4G6MA 4ISQA 2CNAA 3BRDA 1C57A 3I4IA 3B3QE 5GLUA 1JT7A 3ZPYA 2A75A 4FQ4A 4OWKA 1ISZA 1H9PA 1YI7A 5BXSA 3JRRA 5EG6C 1SCSA 5BP5A 5DZEA 3N0KA 2FO1A 3AKIA 2E53A 4FPEA 1VLNA 1QOOA 5BXTA 3GNEA 3V65A 1QDCA 4P0LA 3BTAA 1FWVA 1KQRA 4FPJA 3NV1A 2UURA 3USUA 1DQ6A 2ERFA 2E4MC 1LENA 4IONA 1KJRA 1JT5A 3RS6A 3FJJA 4AWDA 2W08A 1V6UA 2ZKNA 1FATA 2Q5TA 1M2TB 3AYEA 1WBAA 4FGFA 2EXKA 2D6OX 1DZDA 5GLWA 3B00A 3WUCA 3IM0A 2ERMA 4LO1A 2P23A 4C1XA 2K43A 3OGGA 1HDKA 3N7LA 1S0JA 2JD4A 4GOVA 3AKGA 2BFHA 3R4UA 3CA4A 1W6OA 1DHKB 1MS1A 2JE9A 3ZSKA 3WHUA 1R8NA 4LBQA 2J3PA 1QQLA 3SLIA 1RZOB 5IK7A 2D7IA 4GP0A 3BRGC 3ZYPA 2DRZA 3BX1C 1QDOA 4QD2B 3MEPA 1HLCA 2GN3A 3H6RA 4I4SA 2X2SA 3ILAA 2P3JA 3O0VA 2AREA 3CA5A 5D63A 2WSVA 2WT1A 1WBCA 2WLQA 3TAYA 3M3EA 1UKGA 1SLIA 4Q91A 1II4A 2D22A 3CRIA 2QYIB 3OJVA 3O5WB 1FN0A 1HQLA 1MS5A 1CPNA 3VWCA 3W9TA 3OPZA 5T5LA 4XBQA 1FMMS 4BPZA 3ZXJA 3UD7A 3AP4A 2ZQNA 4LO2A 1JN2P 4Q8LA 2AH2A 1ENRA 4RL7A 5DZGA 4Z8BA 2VXRA 1RG8A 4HANA 1T9FA 1PZ8A 2ZBJA 3WCRA 4Y1XA 1Q8PA 4JCKA 4R9AA 4LBKA 1W6MA 4P9YA 1GKBA 4CTEA 1QMJA 3Q9OA 2H0BA 1AF9A 1IKPA 1ULEA 5T52A 1ENQA 4OUJA 5LK5A 2VU9A 3FJEA 1AVBA 1PUUB 4YZ1A 2KLLA 3ILNA 1LTEA 5BOWA 1VAVA 5DUVA 3DUIA 2M49A 2A71A 3N3HA 4R9DA 1IRPA 2AR6A 4DRVA 2RHPA 1SLTA 2LIQA 4AGRA 4XJ9A 2QN4A 5DUYA 3IPVA 4Q1RA 5CNAA 5DG2A 1IOBA 3BADA 5BYNA 5BP5C 4I4VA 1V6XA 1V6NA 1KITA 4LBOA 3T8SA 1AX2A 3HSMA 4YFWA 1WLWA 5GAQA 5JOWA 4XXAA 3NBCA 3O4DA 4DEPA 4J2XA 3PVEA 2AFGA 4AYUA 1VIWB 1MS3A 4Y1VA 4XZPA 4C1WA 3A4UA 1V00A 3WUDA 4LBQD 1UAIA 2A70A 4HL0A 4A7KA 4LO7C 3T1LA 2YXSA 3ZSMA 4BOWA 1DQ4A 4P14A 3FJAA 1G9BA 4FPHA 3PHZA 2YY1A 5GZFA 1C4RA 1UL9A 4LO1C 3WCSA 3WG2A 3OY8A 2KKIA 1BQPA 4USOA 3IKWA 4I3NA 4R9CA 1FV3A 1W6QB 4QKSA 1GSLA 1IS5A 2GALA 4ITCA 4BMBA 4YM2A 3O44A 1G9AA 1T4QA 5GZDA 1WD3A 1SBEA 1W3AA 3O3QA 2V5YA 4XKIA 2CL2A 3C9ZA 2YV8A 1IS6A 3VSZA 1V6KA 3PJQA 1AFCA 1XHBA 4X37A 2OUJA 2UWAA 5IUQA 1KJLA 3FUOA 4LBLA 4XIOA 4IZEA 3B9UA 1CE7B 1LOFA 1Q8QA 2GDFA 3RSJA 4CJMA 3P6JA 1GBGA 5IT6A 2E4MA 3OBTA 1BFCA 2HWAA 4ATEA 1XQNA 2PHRA 5GM0A 1BASA 3RG0A 3ZX7A 1I1EA 1FNYA 2OW4A 1G8WA 3MW2A 1ISVA 3T1MA 1AXKA 2AENA 1GZCA 1TP0A 3O4AA 5FREA 2R9KB 1MVQA 3N7JA 3MPPG 3WO2A 1WD4A 5T5OA 4LO2C 3BAGA 3IM5A 3IIRA 4AGVA 4AN7B 2YROA 1BJQA 3E8LC 3SNVA 4USPA 1JLYA 1N3QA 5FNXA 1S0GA 2B7YA 2ZHMA 1OKQA 4JKXB 3QR5A 3WMUA 2R0FA 3BODA 2KM2A 1DQGA 2ZGNA 2D6MA 2R1DA 4GWMA 1LEDA 1BA7A 2R16A 4JP0A 3P6IA 3FJ9A 4AVSA 5F8YA 3C2UA 4GOYA 1FMZA 4P0KA 4JKQA 3ZXEA 1AVWB 2VUAA 1LHNA 2ZMLA 4YG3A 4LO8B 1WUVA 4YW4A 2WT0A 1JY0A 2WQZC 4ZFYB 1HKNA 4FOQA 4TYSA 4GWNA 5DZUA 3O12A 3N7KA 4XMIA 2ESUA 1Q04A 1GNZA 1N1SA 3POSA 2GN7A 3D6EA 1CPMA 3USUB 3VUOA 1TTUA 1LECA 1WCSA 3MALA 2E7QA 3BB2A 4ZLBB 2DV9A 1LOEA 1A78A 1HWOB 1PUMB 3H6SE 3WDWA 2GMMA 4BMEA 4YGDA 4LO7B 4I4UA 1FAYA 1VALA 3WINA 3A07A 1P63A 1KRIA 1LOAA 3N7MA 3WV6A 1UMZA 4CZSA 1V6LA 4HR6C 4BLIA 2W39A 2BEAA 1SCRA 4H55A 1S0LA 4UW6A 1LULA 1CR7A 4P6AA 1URXA 3H0OA 4R9BA 1LCLA 4TZDA 2D1ZA 1AZDA 1W6OB 1LHUA 2DUPA 4HJJA 1UZYA 3BAOA 2IHOA 1LGCA 1QKQA 1M16A 3AJ6A 1Q8OA 3AP5A 1GZ9A 4LBQB 5EXOA 3UJQA 2D3SA 2ZMKA 4GA9A 4I30A 1ILR1 4P0JA 4XOGA 1BLAA 1HCEA 3BAHA 3ZC9A 5DUXA 3ZXKA 2ZGLA 2Z48A 4XE9A 5DVHA 4GAFA 4XFUA 5BVPI 1WLDA 1S0BA 4XFSA 1SZ6B 3H6RB 1KDMA 1GICA 3ENRA 2D44A 4PC4A 5HCAA 4IY8A 4J23B 2PHUA 1VCLA 5EWSA 1QQKA 3NV3A 1NUNA 3AKHA 1EYLA 3BA4A 3AYDA 1FV2A 4Q27A 3O4CA 3JU9A 1YYNA 4Y26A 2I2SA 4IY9A 1DFCA 1G9FA 4M3CE 2A5ZA 1WW7A 8I1BA 4PBOA 3UK9A 3EF2A 1DQ5A 4YW5A 1LOFC 4WZFA 4I2SA 2P37A 1D0HA 4X38A 2ZR1B 1LOGA 5EYXA 2EF6A 3AJ5A 3CA6A 1LOBA 5H9QA 2DTYA 2D6PA 4XIKA 1TWMA 3FJDA 1YIFA 5D61A 2MC2A 2YZ4A 4QBCA 1RY7A 4OEGA 1RMLA 5F8WA 1Q03A 2MIBA 1MZ6A 1SBFA 3F1RA 2R0HA 3FJFA 2E7TA 1ZA4A 1MACA 2DVGA 3UD9A 4YFZA 4PF5A 2R1BA 4Q9GA 1TFMB 2DS0A 4I96A 3A0KA 2WJSA 1N1VA 4XTMA 4YW3A 4YW1A 3WNXA 1ULFA 1MR5A 3AZWA 5E89A 3AYAA 3FLRA 2NM1A 1HKDA 4L4HA 1DIWA 3UJOA 1HWNB 2FMDA 2FGFA 5DUUA 4I6IA 3SNMA 5CA6A 4BQ1A 2D3RA 3CNAA 3M3QA 4ZFWB 3SH5A 2A3XA 1S0CA 3IPVB 4A7YA 4KEKA 3VKLA 1ISYA 4GAIA 2Y9FA 2ZGUA 4KEJA 4OEEA 2Y9GA 2A3YA 1R1ZA 3O4BA 7I1BA 3WG3A 3FGMA 1SLAA 4FVVA 4ZXKA 1AXYA 5KXCA 2I1BA 4AGGA 4PCRA 5HCBA 2NP0A 3V0AA 3OYWA 5G00A 3AXDA 1BARA 3VKNA 1PZ9A 3PVOA 1SFYA 2E6VA 1UZZA 5T50A 4D0ZA 3AKFA 3Q7YA 2FFUA 1PWAA 2D7FA 3WINC 3B01A 4EFQA 1DJSB 5H9RA 2DRYA 1GYKA 4F34A 1DZQA 6I1BA 1W6NA 1W6PA 3O49A 2GZBA 1JT4A 1LHWA 2ES3A 3OBRA 3OY8B 3POKA 4FPLA 2NMOA 3NV2A 4YZ2A 1I1BA 1X50A 3S8KA 3CU1B 1MS0A 3D7WB 2D6KA 1F5FA 3MW3A 1ONKB 1GZWA 4FPCA 1EVTA 1IT0A 4ZOTA 1G9DA 1ULCA 1LJ7A 2A6VA 4U36A 1DQ2A 3UJ4A 1YBIA 2D43A 2ZGKA 2V73A 2FDBM 4L8QA 4K1YA 1S1AA 2ZABA 4DFSA 4LBMA 5E8AA 3VKFC 5H9SA 4GP3A 1LU1A 3PG0A 5I1BA 1ISXA 3M1HA 3AXEA 3NWKA 2ZGPA 5DXDA 3WDVA 5AVAA 3TC2A 2JECA 4XBNA 2NZ9A 5GZEA 2ZQOA 2ZZJA 1EPWA 3F62B 1XG6A 3KQRA 5JMCA 3FJHA 1ULDA 3K1XA 4FPGA 4IZXA 1QGLA 4TLPA 1CESA 3NJ5A 3RRDA 4XJAA 4Q1PA 3I8TA 1LGBA 4X3AA 2PHTA 4ATFA 2RG9B 4IHZA 2C9AA 1Z78A 1AVAC 2DURA 1FGAA 1O4ZA 4LO3A 1J1TA 5GLVA 3AZZA 3OJMA 2AXMA 4PBPA 4XXPA 1UX6A 4ZA3B 1G7YA 1IS4A 1RINA 5T54A 1JT3A 4DS0A 3ZSJA 2VY0A 5BXRA 1IHKA 4OEFA 3ZYRA 5IK8A 1Q8SA 3RMYA 1LHVA 1G86A 4I0YA 5DZFA 1SLLA 1YXWA 2DUQA 4XBLA 2DU1A 1MS4A 4FQZA 5CAZA 3V0BA 1K5VA 1C1FA 1DFQA 1Y7BA 3IMNA 3NBDA 1YRZA 2AYHA 1WW4A 1SACA 1U0AA 1SLCA 3NBNA 3ILFA 1QOTA 3LCPA 21BIA 3SH3A 3VV1A 2NYYA 2IWTB 4I8MA 4UW3A 1BFBA 4Q2FA 3VKOA 1WLCA 3CA1A 2W68A 3MW4A 1N4KA 3LLPA 3AZVA 2P3IA 4LO0A 1C1LA 1D2SA 4QKRA 4I4YA 4M3CF 1V6VA 2HYKA 2G4IA 1XYFA 3O5SA 1YTOA 1QNYA 2P39A 3GALA 3ZXGA 3WA1A 4JC1A 4FPOB 4BM8A 4UW5A 1MC9A 3L2YA 2P3KA 3HALA 1TWEA 3B9CA 4DQAA 2FFVA 3POWA 1S0FA 5L73A 3AH4A 2WNEA 5GZGA 3CA3A 3O4OA 1W0PA 5T55A 2RSTA 1R8OA 1FWUA 2LALA 3ZXLA 3M3CA 2XG3A 1DZCA 4Y22A 1GANA 4YZ5A 3APBA 2L5XA 2FHRA 3AYCA 2GNMA 1IOAA 1A8DA 1AXZA 3LSDA 4R6UB 1ONAA 2CYFA 1CVSA 2D24A 3VT2A 4OWJA 2UWBA 3LSEA 2K8RA 2LTNA 3A22A 4ZBVB 2NN8A 1LESA 1BFFA 2F2FC 1LEMA 1HQWA 3CQAA 4WBCA 4J2YA 4XMAA 3T2TA 1XZZA 3AK0A 4I4RA 2DU0A 1G82A 1JOJA 2DWRA 3ZXDA 4I1BA 2DTWA 1N47A 5BXPA 2P2KA 1FYUA 5B2HA 4XYXA 1HIBA 3UJ0A 4KEIA 2K4AB 3BA7A 5JLVA 5EYYA 2Q3NB 2AGSA 3NBEA 4P9XA 4LBNA 1LODA 3WDYA 3SISA 3P53A 1RITA 2SLIA 3FFZA 1BYHA 4LO3C 2A3WA 1E0OA 1IS3A 2JKBA 3OJ2A 4YZ3A 2TEPA 1AX0A 2NTDA 1SR4A 1MD6A 2OUHA 2SBAA 4J2SA 5FZZA 4Z9WB 3BRFA 2VW0A 4H04A 4Q8KA 5GALA 2DUOA 2D23A 2X2TA 4XJZA 1HWPB 4QBVA 3FUQA 4Q26A 3PUBA 1CVNA 4G1RA 5F9TA 5JOZA 3I2XA 4LBJA 2EXJA 4GALA 3U4XA 3V0AB 4Y1ZA 2UU8A 1MZ5A 1V6WA 3OYWB 4FOYA 4NO4A 1O4YA 4JQ0A 3M2MA 4Y24A 2RQ9A 1JBCA 3AZYA 3FJIA 5KXBA 3CRHA 1V6JA 3V64A 3UDAA 4Y20A 3QYDA 5FNWA 4IQPA 1JYIA 2NVHA 2CY6A 1G9CA 4LO0C 2DVDA 2ET2A 5JOXA 4YG0A 4OW4A 1W6NB 1W6PB 5HPZA 5KXDA 1V6IA 3VEQA 2DYCA 2D6LX 1W6MB 1GZWB 4I1EA 5DSSB 4Q9PA 1IRAX 1BLDA 1JTCA 3BAQA 1DQ0A 5JDBA 3SITA 9ILBA 4QC4A 1QOSA 2PELA 1DLLA 2A6YA 3LTQA 3AX4A 3IM7A 3POYA 2YMZA 3Q7XA 1Z2VA 4I4OA 3WDUA 3W59A 3S8JA 1AXMA 1W0OA 5FZUA 1J0SA 1BXHA 3VKMA 4YOLA 3JUUA 5F90A 5BQUA 1W3FA 2ZMNA 1IKQA 3NV4A 3AZXA 4K1ZA 1DYPA 4I7IA 1K5UA 1FNZA 4XFTA 3ILRA 3RTJB 2ZGOA 1HCDA 2P34A 2ZGTA 5DG1A 2ZA9A 3WMVA 1DYKA 3OGFA 3FJBA 3O0XA 4GXLA 5JOYA 3WHTA 1NXD1 1MVEA 2NMNA 3I29B 5F8SA 3ZSLA 3OJBA 2VW1A 1V6MA 5GZCA 2C5DA 3R4SA 4AN6A 2VW2A 5GLZA 3IM6A 4M3CA 4XDQA 1OQ1A 4XHBA 2JDZA 4X39A 1TIEA 5GJ6A 31BIA 4YM1A 4G6JA 1CONA 1JUIA 4ISRA 3QCWA 2OVUA 4YG6A 1IJTA 2LIEA 2DVAA 3WG1A 3FJKA 1WW6A 2VXTI 1S0DA 3N36A 3Q7WA 4I4QA 3CA0A 1N1YA 1PZZA 2BQPA 2DVFA 5H9PA 3I2AA 2PHWA 3V0BB 4G9MA 1JHNA 4EFPA 2KI4A 4D8HA 3ATGA 2ZHNA 4XJUA 4JRAA 2BEBA 1WBLA 4L4IA 4EB2B 5T5PA 3UL2A 3ZC8A 2Z49A 1JLXA 2PHFA 4FPKA 5GLTA 41BIA 4ZGRB 4XHXA 1SR4C 5CBLA 3CAHA 3DGTA 3WDTA 2F2FA 3RQ0A 2R49A 2HW9A 4I37A 5KXEA 4H9WA 1HWMB 2KH2A 4KC3A 4ZFUB 3JUTA 1QXMA 1TOOA 2VSAA 4K20A 1DGLA 3R05A 2WRYA 1A3KA 1OQLB 2VH9A 4BLJA 1KNMA 5IK4A 3HOMA 2MLLB 1UPSA 3WVJA 2GNDA 4XJWA 4II0A 3AJYA 1GLHA 4NOTA 3IAGC 1BKZA 3VSFA 4EFRA 1BZWA 1LU2A 5FRAA 1F31A 1YF8B 2GNTA 3CRGA 2A6WA 1SLBA 2WT2A 1JQZA 3UD8A 4Y22B 1JXNA 4PQ9A 5JVVA 3TB0A 1CN1A 1MS9A 2A6ZA 1I3HA 4FPYA 5SV8A 5EHAA 1LGNA 2D3PA 5D62A 2CWSA 1CIWA 2AQZA 1W3GA 5IK5A 1B09A 3HMYA 3SH4A 4JPZA 1UN1A 4OZXA 3A23A 4EEEB 3A0NA 2JJ6A 1OFSA 4I4XA 2EIGA 4FOWA 1EV2A 3KM5A 1NZKA 3ZXFA 4GKXA 2EXIA 1ABRB 4FOVA 4AVVA 4MYEA 3AH1A 1L2HA 3RTIB 4WVVA 5BQUC 1QU0A 1JW6A 4SLIA 2Q9XA 1Q8VA 4M01A 4FP2A 4GKYA 4OWLA 1DQ1A 3KMVA 2D7RA 3V79C 1CJPA 5FZYA 1RIRA 4KBBA 4Y1YA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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