1YYNA

A common binding site for disialyllactose and a tri-peptide in the c-fragment of tetanus neurotoxin
Total Genus 112
50100150200250300350400020406080100
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
50100150200250300350400400300200100
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium tetani
publication title Common binding site for disialyllactose and tri-peptide in C-fragment of tetanus neurotoxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tetanus toxin
total genus 112
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2005-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1yynA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1yynA02
3WDTA 1HCEA 3Q7WA 4DRVA 4GOVA 3FJAA 4P9YA 1MVQA 1MR5A 3B9UA 2PELA 5BXSA 3O4OA 4YLZA 2PHTA 4Y1VA 1WLWA 3D5OA 2DUQA 2W52A 5IK7A 5GZEA 5EC5A 2AXMA 1VLNA 2EAKA 1X50A 1SCSA 3CA5A 3MW4A 4R9AA 3ZPYA 2E4MA 2Q9XA 3UL2A 1TWEA 2CY6A 5L73A 3WDWA 1J1TA 4P0JA 4Y24A 2WLQA 5EHAA 2NMNA 3AYAA 2D6PA 1ABRB 3OYWB 1IS3A 4USPA 5GLZA 3OGGA 2NM1A 2YY1A 3M3EA 3AXEA 5KXCA 1H30A 3BAVA 3N7MA 2ZGMA 1WD4A 2ZGKA 4Q91A 1DQOA 1G82A 2WKKA 5DZUA 1VAMA 3WCSA 1UAIA 1QDOA 2GNMA 3OGFA 3T1LA 4ATEA 1CIWA 3PUBA 3O5WB 3AYEA 3FJ9A 3BAUA 5EYXA 4D0TA 4ATFA 1S0FA 3O4AA 1PZ9A 1ENQA 3M2MA 4F34A 4GKXA 4YM2A 1S0CA 2A5ZA 1P63A 3SNMA 1G9BA 1V6LA 4BMBA 4HJJA 1OQLB 1JT5A 3CA1A 1LHOA 2K43A 1N3QA 3ILRA 3A0NA 5AVAA 1DFQA 2GO2A 3NBCA 4YOLA 4LO7C 3NWKA 2UUSA 4JRAA 4BMEA 4GXLA 3ZXKA 3WLUA 5H9SA 4QBCA 4M3CE 1WBFA 3OPZA 1D2SA 3AH1A 1S0JA 5CBLA 4LO2A 1SLTA 2KKIA 1FATA 5BXRA 3D7WB 3ZC9A 1S1AA 4AWDA 4FPHA 3O5SA 4AGRA 1EV2A 4G9NA 3A23A 4IHZA 5SV8A 3N7JA 3AK0A 1U0AA 5GALA 3BODA 5FZYA 4LBQD 3POYA 2I1BA 3IIRA 1JYCA 3UJOA 2GMEA 1ZM1A 4FPJA 1C57A 4I1EA 5JMCA 31BIA 1APNA 3FGMA 1GLHA 1NUNA 2AFGA 1JT7A 3NV2A 1V6OA 2ZHKA 1XG6A 5BOWA 1RZOB 4QO3A 1Q8PA 4MYEA 3ZSKA 4XXPA 3I4IA 1LENA 3LSEA 2A70A 2HYKA 2XOAA 2GNTA 3AZXA 4EB2B 4PCRA 3ZVXA 2LTNA 1TIEA 1EVTA 5GZGA 4TZDA 3USUA 4RL7A 1BARA 5T52A 1AZDA 2W08A 5GZFA 4Y1YA 3FJHA 2VH9A 5FNXA 1BLDA 3FBYA 3CRGA 2VU9A 1FN0A 1KJRA 2D6OX 4I4VA 2YZ4A 1JLXA 1UZYA 1QXMA 5JLVA 3WG2A 4OWLA 2PHXA 4H55A 3APBA 5T5PA 5H9PA 2EXKA 1ULEA 2E51A 2G4IA 5FRAA 1V6JA 1W6PA 2NZ9A 2ZHMA 3PMEA 3ZXFA 5T5OA 1QQLA 9ILBA 1ILR1 1IOAA 2XG3A 5H9RA 6I1BA 1VIWB 1WBLA 1DQ6A 3M3CA 4X38A 1LOCA 2SLIA 4DS0A 4JKQA 1R8NA 1BLAA 2ZHLA 4DFSA 3H6QA 4QD2C 2HZ9A 1UX6A 2D43A 2X2SA 4K20A 2D3RA 4I4SA 4G6JA 2A6ZA 2OUHA 1HWNB 3KMVA 1AXMA 5DG2A 1IT0A 5HCAA 3FLPA 3WDXA 4WVWA 4PC4A 3UJQA 3WINC 1LECA 1PUUB 1E0OA 1TTUA 2FFUA 3AP9A 2Y9GA 3AP7A 1G8WA 4IYBA 2ZKNA 3CU1B 1M16A 2ZZJA 1SR4C 2FDBM 3M1HA 2BQPA 4Q9PA 1JBCA 1TEIA 3UD9A 3CA0A 4YFWA 1AVAC 3WVJA 2A6VA 4Y1XA 4AVVA 4YW4A 3OBRA 3WOGA 2RSTA 3FUOA 5DZGA 3SNVA 4D69A 4XKIA 2ZQOA 1M2TB 4FPEA 1ULCA 1DYKA 4QKSA 1FNYA 2LIEA 3A4UA 4Q8KA 2AGSA 3B01A 2HW9A 4XBLA 4AGVA 3CAHA 4LO0C 3BA4A 1PWAA 2WT0A 1BA7A 2OVUA 1S0LA 2K4AB 2A7AA 1N1YA 2R16A 3IPVB 1FX5A 4J2YA 3O0XA 4OEEA 4LBQA 1EPWA 5GZCA 2P37A 1HKNA 3CRHA 1S0BA 3F62B 1G9CA 5DUVA 2P34A 2OW4A 5G00A 3FFZA 4LBKA 1QF3A 5HPZA 1BYHA 2ZGSA 4FOWA 3ILAA 4LO1C 4IZEA 3ZYRA 3AXDA 1S0IA 3V79C 2MIBA 2GDFA 1HDKA 5IK8A 4WBCA 1CN1A 2F2FA 4LBLA 4XBQA 3ZSJA 1TWMA 4GWMA 1SFYA 3ZSMA 4OEFA 2E53A 2R0HA 4Z9WB 1XHBA 1WW6A 3N35A 3FLRA 4F83A 1WW4A 2ESUA 2Y9WC 4XMIA 3CA4A 3BAOA 4XBNA 1K5UA 3I2XA 3AP5A 4CRQA 2A6YA 1GV9A 3IN9A 4I37A 5F9TA 4DQAA 1IKPA 4XIKA 3BAQA 4D8HA 1JHNA 4M3CF 2R1BA 1D0HA 3B00A 3WZ1A 1IRAX 1HWPB 3O49A 3LSDA 2GZBA 3IKWA 4AN7B 3IM7A 3UJ0A 2IHOA 3C9ZA 3RSJA 5DSSB 4M3CA 2V5YA 2DRZA 4CZSA 3AX4A 1I1EA 1XYFA 2UU8A 1LTEA 2JE9A 3IAGC 1VALA 4GA9A 1DIWA 4U36A 2D6KA 3ZXJA 1Q03A 1BZWA 1II4A 4P0LA 1AFCA 3AH4A 4FVVA 2AUYA 1C4RA 3FUQA 2QN4A 4IQPA 4KC3A 2P2KA 4I6IA 2CWSA 1T9FA 1MS9A 1BFFA 2DVBA 1UZZA 4YM0A 2VY0A 2DURA 1GNHA 1C1LA 2FMDA 3OJ2A 2ENRA 4QKRA 2NP0A 4QALA 2WSVA 3PVOA 4L4IA 1KDMA 1I3HA 1W6NA 4JAWA 1LODA 5B2HA 1ONAA 3O0VA 4YFZA 2A3YA 3A0KA 1B09A 1LGBA 3N3HA 1HWOB 3OJMA 2ARBA 1YYNA 1LOEA 1BXHA 4ISRA 2K8RA 4KEJA 4K1YA 2FO1A 1DQ5A 4R9DA 3UD8A 2YXSA 2DU1A 3FJJA 4H04A 3NV1A 1DZDA 1Q8OA 1CVSA 4I7IA 2D23A 1EYLA 3VKLA 4G6MA 4YGDA 2Q3NB 4J2SA 4YZ4A 1NXD1 4Q27A 1AJKA 2D7RA 2AENA 4XTPA 2R9KB 5EYYA 3JUUA 1SLCA 4M3CB 5JOYA 2WSUA 4XTMA 4FPLA 3ZXLA 2J3PA 2YUGA 1FGAA 2HWMA 4A7ZA 3H6RB 3S8KA 5BYNA 4FQ4A 3V0AB 1W6QB 2P3IA 3WUDA 5E24E 2TEPA 3VT2A 2D22A 1G9AA 5IT6A 1SBDA 4XXAA 3FJKA 4OWJA 3RG0A 4Q9GA 1R1ZA 1TOOA 4IONA 1AX2A 4XDQA 4Y1UA 4EFQA 3BRGC 3W58A 3OJVA 3WO4A 4FPCA 2DUOA 4I96A 1BFGA 1OQ1A 4Y20B 5JOWA 2AR6A 1GZCA 2VXRA 4XJZA 5JOZA 1W6NB 4YW1A 2ZMKA 3POWA 1DQ0A 1WD3A 3VUOA 1O4ZA 1Q8QA 2E7TA 1GYKA 1AX1A 2I2SA 1V6XA 3HBWA 4I4QA 4ZBVB 1FV2A 4ITCA 3W9TA 1LHUA 1RINA 1MS5A 4HL0A 2D44A 5FZZA 5GM0A 3O3QA 4FPGA 3D4KA 4LO7B 4TLPA 3HMYA 4HANA 3WMUA 1AVWB 1ITBA 1JT3A 3DUIA 1V00A 4NOTA 1PZZA 4X39A 5JVVA 4J2XA 3UDAA 2ZR1B 5CNAA 3Q7YA 4LO8B 1ENSA 2GMPA 4BOWA 1H9PA 3TB0A 1VCLA 4C1XA 2E4MC 3WINA 5D61A 4XJ9A 1QDCA 4CJMA 4YZ1A 5DG1A 5LK5A 2JD4A 1GKBA 1XQNA 41BIA 3FJBA 1MS4A 4JC1A 2X2TA 1N3OA 4YG6A 1BQPA 3WO3A 2ZMNA 3HOMA 3HN1A 3P53A 4HA2A 2DTWA 2A3WA 2BFHA 4FGFA 1MVEA 3IPVA 3CRIA 1LOGA 3NV4A 5EWSA 3PVEA 1OKQA 2P39A 2ZBJA 1AF9A 4AVSA 4BPZA 2WQZC 1HCDA 2IWTB 1LU2A 2WRYA 1BASA 1QNYA 3RMYA 3AFKA 1HLCA 1V6UA 1Z78A 1GZWB 1PZ8A 2C5DA 3O4BA 4I2SA 2D6NA 1ULFA 3HALA 2P3JA 4YZ2A 2D3SA 2DYCA 1GBGA 3AKHA 2Z42A 1WCSA 2H0BA 1ENRA 5GJ6A 3T2TA 5EXOA 1W0PA 3VT0A 3JU9A 2D7IA 1DLLA 4YG0A 4GOYA 1CPNA 1AXZA 4IZXA 2JE7A 4LO1A 1Q8SA 2DVFA 1ULDA 5EG6C 1JXNA 3U4XA 4XJAA 2DU0A 1DBNA 3CNAA 1FMZA 4I4UA 3WO2A 3MW3A 4PBOA 5GLVA 4ZFUB 2PHFA 4QD2B 3Q9OA 4FPFA 2Q5TA 1ISZA 2R49A 5BVPI 1JOJA 2DRYA 4R9BA 3HSMA 4UW4A 4YM1A 3RRDA 1AVBA 2VLCA 1V6NA 4I30A 1UN1A 2WT2A 3N7KA 2W39A 1IS5A 4AGGA 1UKGA 2A6WA 2CYFA 4YW3A 4I0YA 2VW1A 4XFSA 4P9WA 4Q1RA 1AVUA 4LO3C 3OJBA 3AJYA 1KNMA 1HIBA 1YXWA 3AZWA 1Q8VA 4AN6A 2EXJA 3KQRA 1IS6A 3TAYA 1G86A 2VXTI 3O4DA 4A7KA 1LJ7A 4FPYA 5F8YA 3AZZA 4FOVA 1LEMA 5DZFA 3CA6A 1AXKA 4ZFYB 1RY7A 4OZXA 1RMLA 3IM5A 3AKFA 4LBJA 2VSEA 1BJQA 2ZGNA 2PHUA 1QNWA 1IRPA 5GLUA 1SLBA 1WLDA 5CB7A 4GWNA 3S8JA 3AH2A 3RMXA 1XZZA 4XHXA 4YZ5A 1W3AA 4QC4A 3IMNA 3VKOA 2DV9A 5F8SA 4M00A 3WG4A 4KBBA 1A8DA 1DQ4A 3AZYA 3AJZA 1MS0A 1Q04A 1URXA 5T54A 1TP0A 1JW6A 2UURA 3PHZA 1NZKA 3O44A 2DTYA 1FWUA 1F31A 4XILA 4ENDA 2YROA 2Y9XE 1MZ6A 1SBEA 1BFCA 3RS6A 5BP5C 1V6WA 1LOFC 2NYYA 5GLTA 7I1BA 1F5FA 4XE9A 2AREA 1DQGA 3AP6A 2D7FA 2KM2A 1BFBA 4YW5A 1V6IA 1DGLA 2PHWA 2M49A 3BTAA 1J0SA 4GKYA 1LOAA 1AXYA 4ZKTB 3A07A 2BEBA 3ZXGA 1A3KA 4K21A 2UWCA 3AZVA 3N0KA 1QGLA 4XJ8A 3WMVA 4XOGA 4XZPA 2GALA 1MC9A 1QQKA 2KH2A 4BLJA 3VSFA 2WBCA 4X3AA 1KRIA 4Y22A 1JQZA 3MEPA 4ZLBB 3B69A 4OUJA 3OBTA 3SISA 1YRZA 2EF6A 2JECA 3H6RA 1JTCA 5DUXA 2E7QA 2V73A 4DPNA 4BQ1A 1VAVA 3V0AA 3ZYPA 3JRRA 1W6QA 4ASMB 3QLQA 2DREA 4AVTA 5HCBA 3VT1A 3RTJB 1DHKB 2B7YA 1DQ1A 4Q8LA 5F5QA 4A7YA 2A71A 2YV8A 1JN2P 3FLTA 5IK5A 3LCPA 1LGNA 4GP3A 4Q26A 1W6MA 1TFMB 3AYCA 3UJ4A 1GNZA 3IM6A 4JQ0A 2Z49A 4Y20A 1G9FA 2ZGOA 4I4PA 5E8AA 1GICA 3IM0A 3NBDA 2ZGQA 4YZ3A 1Q1UA 3P6IA 4D0ZA 4I8MA 1SBFA 1CPMA 4I3NA 1LESA 1GSLA 1C1FA 1AVXB 2ERMA 3SITA 4XJWA 3WHTA 1WLCA 4LBMA 5KXBA 1QKQA 4M01A 3R05A 4L4HA 2C9AA 1MACA 2WT1A 3T8SA 2DS0A 1W6OA 2ZGTA 2ET2A 5F90A 4AYUA 3PG0A 3FJEA 4ZFWB 1SLAA 3BADA 1NLSA 4USOA 5IUQA 3NBNA 1W3GA 3O4CA 3POKA 1YO8A 3FJ8A 2VW0A 3WG1A 4U2AA 2WJSA 1PZ7A 1DZCA 3R4SA 5CA6A 4I4RA 1MD6A 2MC2A 4IY8A 1IJTA 1WW5A 4C1WA 2OUJA 3I2AA 4PQ9A 4Y22B 1K5VA 3VKFC 1QU0A 4H9WA 5D63A 2L5XA 4P0KA 3I29B 1CVNA 5HCFA 3B3QE 2XB6C 1DJSB 1A78A 4BLIA 3OY8A 5IK4A 1W0OA 2CL2A 4LBOA 3MPPG 4WV8A 1AX0A 1DZQA 1YF8B 8I1BA 3INAA 5GAQA 1GZWA 3JUTA 1IOBA 1S0EA 1W6MB 3EF2A 3ILNA 3M3OA 4G1RA 1Q56A 1RITA 2ARXA 2UWBA 1Z4SA 1S0DA 2KI4A 1YBIA 1FQ9A 2D1ZA 1IHKA 3K1XA 1KDKA 2ZHNA 4I4YA 4HR6C 1HKDA 3VEQA 2VSAA 3LTQA 1CESA 3UK9A 1AJOA 1ISVA 3VSZA 1SACA 5BQUC 3RQ0A 1ZA4A 3A21A 2GMMA 3T1MA 2LIQA 4IY9A 4KEKA 3N36A 2P3KA 1LCLA 2RQ9A 1WUVA 1W6OB 3NJ5A 3W59A 4FPOB 1WBCA 1T4QA 3WV6A 1OFSA 1ISWA 1HQWA 4JP0A 2FFVA 3QCWA 3AKGA 3GALA 3BA5A 2EXHA 4XMAA 1GANA 3BRDA 4EKXB 2UWAA 3BA7A 1SLLA 1ULGA 4P9XA 1WBAA 1MS3A 2KLLA 2NN8A 3L2YA 1MS8A 2ZGRA 4FPKA 1BKZA 1UPSA 5JOXA 1SR4A 3ZXDA 4ZXKA 1QOSA 2NVHA 4YGCA 4UW3A 4DCKC 1DFCA 4PBPA 1SZ6B 3TC2A 2ERFA 4ZGRB 1QMJA 2DVAA 4GAIA 2AQZA 1JUIA 1H9WA 1DYPA 1MS1A 1GZ9A 2GN3A 1LU1A 4Y1ZA 2A3XA 4I1BA 3OY8B 4DRRA 2GNBA 4JKXB 4Q2FA 1G7YA 3SLIA 2YMZA 4LO3A 1FAYA 4LO0A 3R4UA 5DUYA 3BX1C 1UMZA 4Y26A 1ISYA 2EALA 2DUPA 3V0BA 1S0GA 1GGPB 5JDBA 1LHWA 4FOYA 5D62A 3WUCA 1HQLA 3Q7XA 1MZ5A 4ISQA 4YG3A 2WNEA 1RIRA 4TYSA 3CA3A 2HWAA 4G9MA 1FV3A 2JJ6A 1LULA 3A22A 4GP0A 1CJPA 3AJ6A 4LO2C 2DWRA 1LGCA 1IILA 1JLYA 4WZFA 2P23A 3WDUA 3WHUA 3ZC8A 3FJCA 2QYIB 4R9CA 5E88A 5DZEA 5BP5A 3C2UA 1LOFA 2ZQNA 3VKMA 5DXDA 3WDYA 1Z0HA 1IKQA 2JKBA 3SH5A 4KEIA 2ZGUA 3M3QA 4NO4A 4BM8A 4DENA 4XIOA 4X37A 4XFTA 5F8WA 3BB2A 3QYDA 2ZGLA 1N1VA 3VV1A 4GALA 3SH4A 3AYDA 5BXPA 4EEEB 3SH3A 4P14A 3ILFA 4EFPA 1SCRA 1WW7A 3PVNA 3POSA 3FJDA 4XJUA 1N47A 3B9CA 2AH2A 1O4YA 4JPZA 1FMMS 3WCRA 21BIA 1Y7BA 2ZA9A 1LEDA 5T55A 5GLWA 2D24A 4R6UB 5FNWA 1CE7B 2CWMA 3H0OA 2PHRA 4Z8SB 5FZUA 3BOPA 3O0WA 1DQ2A 2SBAA 3USUB 4GAFA 1JY0A 2AAIB 3MALA 1LHVA 5H9QA 4QBVA 4YM3A 3RTIB 3V0BB 1V6MA 5T50A 3AP4A 2GN7A 1W3FA 4XFUA 5GZDA 2W68A 2AYHA 1F9KA 3P6JA 2CNAA 4I4OA 4YGBA 2D20A 4J2KA 1QOTA 2JDZA 3ZXEA 2NMOA 3AKIA 3NBEA 1W6PB 5I1BA 3V64A 5KXDA 4Q1PA 3WNXA 1IS4A 1ISXA 3BAGA 4DEPA 3FJIA 4SLIA 2EXIA 3KM5A 4FQZA 3BIWE 4FOQA 3QR5A 2ZAAA 2RHPA 2DVDA 5T5JA 3N7LA 1L2HA 3AJ5A 4II0A 2KI6B 1FNZA 1I1BA 3H6SE 3VKNA 3BRFA 3PJQA 4OWKA 5BXTA 1Z2VA 3VWCA 5KXEA 2A6XA 5DUUA 3GNEA 1G9DA 1PUMB 4ZOTA 2ZABA 1FWVA 2MLLB 3WG3A 2ZMLA 3ASIA 3MW2A 1V6VA 3UD7A 3HR9A 2D6MA 3ENRA 4UW6A 4RA0A 3F1RA 3LLPA 5E89A 2LALA 1YTOA 2R0FA 2VW2A 4YGEA 3WA1A 3OYWA 1V6KA 4LBNA 4XYXA 4WVVA 1KQRA 2A75A 4XHBA 4OW4A 5CAZA 2EIGA 2ES3A 3WDVA 1ONKB 3ATGA 1N1SA 4YW2A 3V65A 3I8TA 4PF5A 3FJFA 1QOOA 4OEGA 4CTEA 1R8OA 1JYIA 2FGFA 4ZA3B 4EFRA 2DVGA 3ZX7A 3BAHA 2F8XC 3NV3A 3ZSLA 2Z48A 4I4XA 2E6VA 4J23B 2RG9B 2Y9FA 4FP2A 1RG8A 2BEAA 1YI7A 3CQAA 2R1DA 3D6EA 2VUAA 4W65A 2GNDA 3E8LC 1PC8B 4LBQB 3O12A 4JCKA 3DGTA 4K1ZA 4L8QA 1UL9A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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