1Z0HA

N-terminal helix reorients in recombinant c-fragment of clostridium botulinum type b
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
438
structure length
438
Chain Sequence
NKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title N-terminal helix reorients in recombinant C-fragment of Clostridium botulinum type B.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 101
structure length 438
sequence length 438
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2005-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1z0hA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1z0hA02
3UJ4A 3BAOA 4FPGA 5GJ6A 4R9BA 2R16A 5E89A 2KI6B 1ABRB 1W6PB 1W6NB 3DUIA 4UW6A 1N1TA 4KEJA 1PUUB 4PBPA 1NXD1 2VH9A 3VKFC 1V6VA 1M2TB 3PVEA 5GALA 2W68A 2DUQA 2GN3A 2VW0A 1MR5A 3W58A 1GICA 3IAGC 5FNXA 2ZGMA 3AP9A 3SLIA 5H9RA 2A6VA 1G9CA 4JCKA 1JOJA 5F8YA 4M3CE 5DG1A 1DQ5A 2XOAA 2VUAA 3WG4A 2MIBA 1DYPA 2I1BA 3USUB 2M49A 3N36A 3A4UA 3OJ2A 3WDVA 2DRYA 1LOFA 1WD3A 1QQKA 3WLUA 1E0OA 3ATGA 3FLTA 4G9NA 3T1LA 3UL2A 3N7MA 1DHKB 3M3OA 4DS0A 2WQZC 1HWOB 1WBCA 4P9XA 1LENA 3O4AA 3ZXEA 1II4A 1IRPA 1CVSA 2NMOA 1BARA 3ZC9A 1BKZA 2NTDA 4Q8KA 3UD9A 4GKYA 3O12A 3O5WB 1NZKA 1AX2A 2K8RA 1F31A 2BFHA 1ILR1 3NV3A 2JDZA 3INAA 2KI4A 1LOBA 4I4RA 2ESUA 4QALA 2BQPA 4LO3A 1S0DA 3E8LC 2QN4A 5EC5A 2Q3NB 4YW1A 3AZYA 1HWMB 1CE7B 3AX4A 4JQ0A 4GWMA 1Q1UA 3RRDA 2A3XA 1IT0A 2P23A 4Y22B 2R1DA 1F5FA 4XJ9A 2UWBA 1W6QB 5BVPI 5CBLA 1VAVA 4LO0C 1UN1A 2CY6A 2GMEA 4YW3A 4USOA 3W9TA 1OFSA 3N35A 2R9KB 3A0KA 1MC9A 1YTOA 2V5YA 4NOTA 2E6VA 5H9PA 4HANA 2VSEA 1UL9A 5GZEA 2AREA 4YZ1A 1WLDA 3POWA 1WBAA 5DUUA 2KH2A 1MVEA 2R49A 5KXDA 2E4MC 2PHFA 5GZFA 3AH2A 4XBNA 1GZCA 4XHXA 2D7IA 3WV6A 5BQUC 4KC3A 1WW5A 4AN6A 4QC4A 4J2SA 4YG0A 1Z0HA 2AFGA 2OVUA 1QDCA 3ZSMA 4XXPA 4II0A 2NP0A 4AWDA 3RMYA 1LHVA 2FGFA 1B09A 1LOEA 3FJ8A 5DZFA 3PUBA 1WLCA 1HIBA 3VKLA 2A7AA 1DGLA 3UD7A 3R05A 3M3QA 2ZGKA 4YGEA 3ILFA 1FWUA 1QOTA 1GBGA 3A21A 4IY9A 3BAUA 1RIRA 3OJBA 1DYKA 1O4ZA 4IY8A 2R0HA 3P6IA 4J23B 3V0AB 1Y7BA 4GAIA 1V6KA 1G82A 3AKIA 2Q5TA 1QMJA 3OBRA 3VKNA 5GLWA 5B2HA 1SCRA 5HPZA 3D6EA 2VW2A 4Y26A 1IS5A 1MACA 3MEPA 1HQLA 3JU9A 5DUVA 1CPNA 2ZGUA 2X2SA 2NZ9A 3CA3A 2V73A 1YXWA 3NV2A 4L4IA 2DV9A 1SBEA 1W6MA 4YOLA 1FNYA 4Q9PA 2AQZA 4FP2A 2HZ9A 2GNMA 4G6JA 1QKQA 2ZACA 3VSFA 3LSEA 1QU0A 1I1BA 5KXBA 2PHWA 2ERMA 4FVVA 21BIA 2ET2A 4YM0A 2FFVA 2OUJA 4RL7A 2E51A 1ZM1A 2ZGNA 3B01A 1ZA4A 2JJ6A 4JKXB 3FJJA 2MLLB 1AVXB 4ZFYB 4YM3A 3FGMA 4H04A 1ONKB 2E4MA 3VWCA 3WCSA 2QYIB 4XFSA 1W6OB 5BQUA 4J2YA 1JQZA 4ZGRB 1IHKA 1VCLA 4A7KA 4LO2C 3V0BA 3SISA 2XB6C 4LBLA 1AF9A 5BXRA 3M3CA 2E7QA 3WO4A 1IS3A 1FGAA 1PWAA 2ZGQA 4I4PA 4AGRA 1DZCA 3PJQA 4FPOB 1VAMA 4YGDA 5T5JA 1G86A 3N7LA 4FPFA 3Q7WA 1KJLA 5E24E 3M1HA 2NM1A 1V6OA 1DJSB 4HR6C 2LALA 1A78A 2P3KA 5DG2A 3WUDA 1XQNA 1GV9A 3OGGA 1KDMA 1S1AA 4PQ9A 5IK8A 1GNZA 1FV3A 2Q9XA 3ZXJA 1LGBA 4L4HA 3BX1C 1WW7A 1CQ9A 5GAQA 5FRAA 2R0FA 3QCWA 4FP3A 3I2AA 5T52A 1JLYA 1MZ6A 3FJDA 4BQ1A 3P6JA 1V6WA 3N3HA 3O44A 4I7IA 1SBFA 1GSLA 2P3JA 4IYBA 1G9DA 5IK4A 5F5QA 4K1YA 3CA0A 3N7KA 4YW2A 4LO1C 3WUCA 1KNMA 2EF6A 2GMPA 4F34A 2UWCA 1WLWA 4P9YA 41BIA 2ZGPA 4BM8A 3OBTA 2RHPA 1MS0A 2GN7A 2GNDA 2A75A 3WO3A 2WT0A 1FWVA 2H0BA 1BQPA 3V65A 1C57A 3A07A 5JVVA 4G6MA 1TIEA 2DS0A 1HQWA 1HKDA 4SLIA 1LCLA 2AR6A 1QGLA 4AGVA 3AYDA 3HALA 1LOFC 4YM1A 4A7ZA 5GLVA 3CRHA 2YMZA 1GANA 4I30A 4EKXB 5CB7A 1HCEA 3AXEA 3BA7A 3A22A 4XMAA 3RQ0A 3OPZA 3RTJB 4QKRA 1SBDA 4R9CA 1DQ0A 3OJVA 1JHNA 2DUPA 1LGCA 3B69A 1S0FA 5E88A 4IONA 4WBCA 4C1XA 3FJ9A 4CJMA 2GO2A 4CTEA 3ENRA 1LEMA 1DIWA 4I1EA 1LU1A 1YI7A 1LJ7A 1BASA 1CPMA 2HWMA 4CRQA 2ZR1B 4K20A 3I2XA 4G1RA 3FUOA 1N4KA 1BYHA 1HCDA 1DQ1A 1FQ9A 4P0JA 3ZXFA 1YIFA 1KQRA 4LBMA 3CNAA 2D3PA 4XJWA 2FO1A 1DFCA 2HW9A 2IWTB 3QYDA 2PHXA 5T50A 4FQZA 2GALA 4YG3A 5DUYA 4GKXA 3ZYPA 2RQ9A 1TWEA 1SCSA 4LO1A 1S0IA 4BLJA 4U36A 1AFCA 3SNVA 4FPHA 1A8DA 2CTVA 1CN1A 2YY1A 3BTAA 4DFSA 2JE9A 4KEKA 2ZHKA 4XIKA 3VT0A 1MD6A 4FOYA 2Z49A 2VW1A 4Y1UA 3BA4A 1UKGA 2SBAA 4DEPA 1X50A 2ZA9A 3CA5A 1G9FA 3BOPA 3NV1A 3CAHA 1W6MB 3PMEA 1YO8A 2DWRA 3A23A 3BODA 3N0KA 3IPVA 3BRDA 3BAQA 1LECA 5D62A 1FYUA 1A3KA 4RA0A 2D6LX 1ULGA 3WOGA 4K21A 1R1ZA 3B9UA 1BA7A 2P39A 1IS6A 1DBNA 2ZZJA 3I8TA 1Q56A 3QLQA 2RSTA 1MS1A 3WO2A 2GNTA 3PVOA 3NBCA 4OWLA 5T5PA 5F8SA 1BLDA 1QOOA 1ISYA 5GLUA 5BXPA 1R8OA 4QD2B 1WW4A 1M16A 3MW4A 1JYCA 2P2KA 5DSSB 4P6AA 4JRAA 4YZ3A 3O5SA 4WVWA 2DREA 1N47A 6I1BA 1G7YA 2EXKA 2D6KA 3H6QA 1BJQA 1S0JA 3AZWA 1N1YA 1VALA 3S8KA 3OJMA 3V0BB 2K43A 3HSMA 1RZOB 2NMNA 1Q8PA 2KLLA 4GXLA 3WG1A 5HCFA 3W59A 1Z2VA 2F2FA 4Z9WB 2GMMA 2PHTA 4LBJA 2A6YA 3B3QE 2CYFA 4AYUA 3VSZA 3FUQA 3PG0A 2YROA 3FLPA 4FPKA 3C9ZA 4ZXKA 1ULDA 1IRAX 4UW5A 2ARXA 4YZ5A 1G8WA 5LK5A 3AZZA 5IK7A 2PHUA 4QD2C 2ZBJA 1QNWA 4GWNA 4U2AA 3KM5A 4MYEA 2UURA 1YRZA 4QO3A 5BP5A 3F62B 4LO7C 4GP3A 4PF5A 3N7JA 3WHUA 1UX6A 1AVUA 4Q91A 2D7RA 4F83A 4I4UA 1APNA 1WUVA 4GA9A 3JUTA 1LGNA 2EALA 3O0VA 5IUQA 2ZGLA 1MVQA 1V6JA 2HYKA 2ZHMA 3BADA 4EFRA 1S0LA 3T2TA 4I96A 4J2KA 3HBWA 3R4UA 3BRFA 1GZ9A 1QOSA 1OQ1A 1S0BA 4UW3A 5DZEA 2NN8A 4I3NA 1FATA 4Q1RA 5JDBA 1GZWA 1RINA 4K1ZA 4Q1PA 1CJPA 3MW3A 3JRRA 1FNZA 3ILAA 1HWNB 4FPLA 2RG9B 2D22A 4GALA 1Q8VA 4ISQA 2ARBA 2EXIA 5EHAA 2AGSA 1AXZA 1GYKA 3Q7XA 4FOQA 5CNAA 3CQAA 3VT2A 3RSJA 4JKQA 1EVTA 4ZBVB 3D7WB 3KQRA 4NO4A 1PUMB 1J0SA 4EB2B 4XHBA 2WT1A 5DZGA 3S8JA 5JLVA 2OUHA 1D2SA 3ILNA 4FGFA 1G9BA 4FPYA 3LCPA 1AXMA 4I1BA 2A6ZA 5SV8A 3AKFA 1LHUA 3AXDA 2ZHLA 4HL0A 2K4AB 1FV2A 1W0PA 1AXKA 1IJTA 1PZ9A 1N3PA 1Z78A 3FJFA 4XE9A 1T9FA 2D23A 1AX0A 2PELA 3O0WA 4I4VA 3C2UA 3PVNA 5JOXA 1JUIA 4LBQA 3LTQA 3WHTA 1TOOA 2L5XA 4XYXA 2DU0A 1RY7A 1I1EA 1GGPB 3SNMA 2GNBA 2NVHA 3BRGC 4LBOA 3I4IA 2WBCA 1WD4A 5F9TA 3WCRA 3O4DA 3WDTA 5AVAA 1IS4A 2ZAAA 2OW4A 3FJHA 1DZQA 5EXOA 2D43A 1QXMA 4I4OA 3FJBA 3DGTA 3UJ0A 3HMYA 1UAIA 3IKWA 2KKIA 2LTNA 4BMEA 2WRYA 2DRZA 4Y24A 4YW4A 4XJZA 3FJAA 1Q8QA 4AVSA 3IM7A 3ASIA 4ASMB 3IIRA 4AVTA 2DTWA 1PZZA 1QNYA 3NBDA 1V6NA 2A3YA 1JBCA 1JN2P 4J2XA 4D0TA 3HN1A 3F1RA 2AH2A 4AGGA 3AP7A 2UUSA 4FOVA 3I29B 1KITA 1KRIA 4XKIA 3CRIA 1JT3A 2D6NA 1S0CA 4OWKA 3H6SE 4FPEA 3IPVB 4M3CF 1UMZA 4BOWA 4IZXA 3ZSLA 3ZC8A 1HLCA 4XJ8A 4R9DA 2D24A 3IMNA 3O49A 5DZUA 4GOVA 4EFPA 1W3AA 4FQ4A 4G9MA 1EYLA 1JY0A 2ZGSA 2YV8A 4JC1A 1V6XA 4TYSA 2UU8A 1TEIA 2Y9GA 1MS8A 3ZXLA 4I2SA 3RG0A 5BOWA 4OW4A 1LHOA 1NLSA 1FMMS 3TAYA 1MS5A 3BAVA 2CWMA 3IM0A 1SLBA 3WDXA 1DQ6A 9ILBA 2E7TA 3BIWE 1GLHA 4Q26A 2DVBA 2ES3A 1JT4A 1S0EA 2AENA 5FREA 4ZLBB 4YFWA 3ZXKA 2NYYA 2VY0A 3AYCA 4AN7B 3UD8A 3AKGA 4Y20A 3KMVA 3P53A 1QF3A 2P37A 2W52A 2FMDA 3AK0A 1D0HA 4YW5A 4A7YA 2DVFA 1JXNA 1F9KA 3CA1A 1KDKA 3PHZA 1MS3A 3M2MA 5DUXA 4P14A 4XJAA 3WDYA 4XTMA 2EAKA 1N1SA 5GLZA 5T55A 1SLIA 3V79C 4GOYA 1Q8OA 4BMBA 3CRGA 3AJ6A 1HDKA 1ISXA 1V6UA 3POYA 4XDQA 3JUUA 4Q2FA 2E53A 2ZHNA 4XJUA 2MC2A 5EYYA 3AJ5A 1C1LA 4GP0A 1N3QA 3NBNA 4XOGA 3ZSKA 5H9QA 3ZYRA 5FZYA 2ZMNA 3WINA 4QKSA 4TZDA 1LHWA 1XHBA 1BZWA 1G9AA 3BB2A 2DVAA 4I4YA 2BEBA 2D3RA 2F2FC 2I2SA 5KXCA 4IQPA 1RG8A 3FJEA 1SFYA 1LU2A 3K1XA 1GZWB 1LEDA 2DUOA 5HCBA 4TLPA 3WNXA 4XFTA 2ZGTA 4YGBA 1ITBA 4BPZA 1LHNA 2EXHA 4I4XA 1DZDA 1K5UA 2JE7A 3B9CA 1IKQA 3WDWA 4YLZA 3OY8A 4FPCA 3OYWA 1BLAA 3VKMA 4QBVA 5BP5C 1DLLA 4XBQA 3ZPYA 4Y1ZA 5D63A 4FPJA 2BEAA 1ISZA 4KBBA 3UK9A 3NV4A 5CA6A 3AP4A 1YBIA 4Y1XA 1UZYA 31BIA 1JW6A 3VUOA 2A5ZA 1EV2A 1V6LA 3RS6A 2GZBA 1QDOA 1T4QA 2Y9FA 3D5OA 2XG3A 4DQAA 4ZOTA 3TC2A 1BFCA 3WG2A 3H6RA 1CONA 1PZ8A 4M3CA 4H9WA 4XTPA 1SLAA 4LBQB 2WSUA 5D61A 4DCKC 4ISRA 1Q03A 5BXSA 4XIOA 4Y1VA 1BFGA 1SR4C 1P63A 1CVNA 5EYXA 3AYEA 2G4IA 4IHZA 1AXYA 2GDFA 4LO7B 2WKKA 2HWAA 2Y9XE 1O4YA 4CZSA 2A6XA 2D6OX 3UDAA 2DTYA 5BYNA 1ULEA 2AUYA 1N3OA 4HA2A 1CESA 2WLQA 1ULFA 4OEEA 1TTUA 1J1TA 1I3HA 2SLIA 1ENRA 2ZGRA 4XILA 1W3FA 5GLTA 3H0OA 1EPWA 1SLCA 2Z48A 4Z8SB 2WSVA 5BXTA 1Z4SA 3HOMA 3LSDA 4XXAA 3MALA 4PBOA 1H9WA 5FNWA 3AFKA 1MZ5A 1TWMA 2DYCA 3O4OA 4FOWA 2Y9WC 3AYAA 4ZFUB 5E8AA 1WBLA 1IILA 3CA4A 3TB0A 5IT6A 1WW6A 3R4SA 1ENSA 3O3QA 1H9PA 2A71A 3EF2A 2W39A 2ZMKA 3AJYA 4DPNA 4OUJA 4ATEA 1DQGA 1OQLB 4D8HA 2ZQNA 4I4SA 2KM2A 2VXTI 4YGCA 2D6PA 4ZKTB 1GNHA 1LTEA 3ZVXA 1FN0A 1AVBA 4M00A 1DQ4A 2VLCA 2LIQA 2AAIB 3QR5A 2D44A 4YZ2A 2LIEA 5GZGA 4USPA 3SITA 2YUGA 1PC8B 2WT2A 1V00A 1AVAC 3BAHA 3U4XA 1SR4A 5T54A 2F8XC 1ONAA 3POKA 4XBLA 1CIWA 2CNAA 3VV1A 2ENRA 4WV8A 4Y20B 1R8NA 4R6UB 4Q8LA 4XZPA 3D4KA 1GKBA 5G00A 2A70A 5GZDA 2A3WA 1XYFA 5FZUA 4OEGA 3O4BA 1W6PA 1W6NA 4WVVA 3MPPG 2CL2A 5KXEA 5H9SA 3L2YA 4P9WA 3RMXA 2PHRA 1YYNA 2P3IA 2VXRA 3A0NA 3WVJA 2AYHA 1LOAA 2W08A 4BLIA 4R9AA 1SLTA 1LOGA 3SH4A 2ERFA 1UPSA 3OGFA 1DQ2A 2VU9A 3WMVA 1RITA 3Q9OA 2WNEA 2ZABA 4I37A 2D3SA 3CA6A 3VEQA 2VSAA 4PCRA 4LBQD 2YZ4A 2D1ZA 4JP0A 2IHOA 2ZKNA 4YG6A 1ENQA 4QBCA 3FJIA 1DQOA 4EFQA 1AVWB 3HR9A 4YZ4A 3AH4A 3T1MA 1TP0A 4H55A 2JECA 3USUA 4LO0A 2D20A 1AJOA 2A6WA 5IK5A 1W3GA 4DRVA 3RTIB 2EIGA 3SH3A 4I8MA 5JOYA 4PC4A 3BA5A 2JD4A 2CWSA 1IOAA 2DU1A 4X38A 4DENA 4ATFA 1Q04A 3UJQA 1Q8SA 3B00A 3WDUA 4Y1YA 3O4CA 1BXHA 5GZCA 4JPZA 1SZ6B 2ZGOA 2WJSA 1AZDA 1WBFA 1FAYA 3VT1A 1YF8B 4WZFA 3WMUA 1HKNA 5GM0A 1KJRA 5L73A 1UZZA 3FLRA 3CU1B 3NJ5A 5T5LA 1RMLA 1LODA 4LBKA 1V6MA 5DVHA 1JT5A 3OY8B 2R1BA 5HCAA 3OYWB 4Y22A 1OKQA 1W6QA 5F8WA 1AX1A 4X3AA 1JT7A 3BAGA 2DVDA 3AZXA 3WINC 1LULA 3NWKA 3V64A 5JOWA 3AP6A 1LESA 3MW2A 3M3EA 1WCSA 1L2HA 4OWJA 5FZZA 1U0AA 4OEFA 1C1FA 8I1BA 2DURA 1ULCA 4LO8B 4I0YA 3H6RB 3FFZA 1SACA 3AJZA 5T5OA 4M3CB 1S0GA 4X37A 4M01A 3IM6A 1DFQA 4Z8BA 1VLNA 2D7FA 1V6IA 1H30A 3IM5A 1C4RA 4X39A 3Q7YA 1BFFA 3GNEA 4AVVA 4P0KA 2C5DA 4DRRA 5I1BA 2ZMLA 2FHRA 4ZFWB 3WZ1A 4C1WA 3WA1A 5DXDA 5EWSA 3FJKA 3POSA 2X2TA 1AJKA 3AKHA 1MS9A 1IKPA 5JMCA 3VKOA 1BFBA 1NUNA 2Z42A 4OZXA 2AXMA 1JTCA 1XZZA 4XMIA 4KEIA 3SH5A 2C9AA 3ZXGA 4GAFA 1ISWA 3APBA 4IZEA 1SLLA 3UJOA 3V0AA 3ZX7A 1TFMB 3AH1A 3ZXDA 5EG6C 3T8SA 1CR7A 1FMZA 5F90A 3GALA 4HJJA 4JAWA 3AZVA 3IN9A 3AP5A 4D0ZA 4Q9GA 5DUWA 4I6IA 1W0OA 3WG3A 4LO2A 3FJCA 3NBEA 2D6MA 4W65A 2B7YA 1JYIA 4XFUA 2FFUA 2EXJA 4UW4A 3ILRA 7I1BA 2FDBM 4ZA3B 1QQLA 1LOCA 1FX5A 4Q27A 3O0XA 2J3PA 4YFZA 4ENDA 4EEEB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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