1Z0HA

N-terminal helix reorients in recombinant c-fragment of clostridium botulinum type b
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
438
structure length
438
Chain Sequence
NKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title N-terminal helix reorients in recombinant C-fragment of Clostridium botulinum type B.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
total genus 101
structure length 438
sequence length 438
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2005-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1z0hA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1z0hA02
2CNAA 3IKWA 4A7ZA 4WVWA 1RMLA 4IQPA 1J0SA 1FWVA 2Y9FA 5G00A 3WV6A 4YG6A 3VSFA 1MC9A 2VLCA 5GZCA 4GAFA 3ZXEA 1LGNA 4ASMB 1HIBA 1GZ9A 1AX2A 2IHOA 2OUJA 4Y1ZA 1LU2A 5E88A 3IM5A 1IOAA 1TFMB 1G9CA 4P9WA 4R9BA 4XXAA 2K4AB 1GICA 4TLPA 5GM0A 4R9AA 2EXJA 1I1BA 1Z4SA 1LU1A 4LBKA 3T1MA 5DZFA 2HYKA 4Z8BA 2V5YA 2QN4A 1ISXA 4P0JA 1QNYA 1LEMA 3QCWA 4M3CF 2A7AA 1FN0A 3O12A 3NV3A 4Q8KA 3WLUA 1BASA 3WO2A 3BA5A 1VLNA 2WSUA 3MW4A 1SLAA 3NBEA 1V6MA 3WDWA 3V0BB 2UU8A 1SR4C 4LO0C 2A75A 2PHFA 4HA2A 4AN7B 3WVJA 2A6XA 3O3QA 3BAGA 3LCPA 3WHUA 3FJKA 5DSSB 3CQAA 5F8WA 3RMYA 3H6SE 3P6JA 1SBEA 3Q9OA 1DQOA 4FOYA 3Q7WA 3CA1A 3A23A 1IHKA 1QDCA 4H04A 3UJ4A 4JPZA 3AYDA 1QKQA 1WUVA 3O4AA 4H55A 4P9XA 2D3SA 2YUGA 1JLXA 1GZWA 2KI4A 1IJTA 2E6VA 1IS3A 1C4RA 4J23B 1DHKB 4I4RA 4D0ZA 1DQ6A 4XIKA 5EG6C 4XJUA 4D8HA 3P6IA 4ZKTB 2R49A 3BAVA 2EAKA 3B3QE 1V6WA 2OW4A 1V6VA 3OY8B 1FV3A 3VSZA 5DUUA 1BFBA 4XFSA 1GKBA 2XOAA 1QU0A 2AGSA 1IKQA 4QBVA 3N35A 5EHAA 1SLLA 1WLWA 4C1WA 1BFCA 2K8RA 2W08A 3ZXKA 1Q8OA 3KM5A 3AX4A 2RSTA 2AYHA 1DGLA 3AH1A 3AKFA 2RHPA 3V79C 1FGAA 1JUIA 2ZGMA 3POKA 1ISWA 1PWAA 2IWTB 2ZA9A 3BAHA 4QC4A 2UUSA 2D1ZA 1JT3A 3VUOA 1G9AA 1S0LA 1W6OB 3AKHA 1KDKA 3WG1A 3FJCA 5DUVA 5F9TA 3AJYA 1LHOA 3T1LA 1ISZA 3SNVA 4X39A 2OVUA 3WO3A 3V0BA 1Q1UA 3B9UA 3CA0A 3W59A 2A6WA 4FP3A 1F5FA 4LO1A 2W39A 1S0IA 5SV8A 2WSVA 5LK5A 4I4QA 1VAMA 2F2FC 4GKXA 4XMAA 1T9FA 3O0WA 4SLIA 1UX6A 1YXWA 3USUB 4FVVA 1G86A 1FMMS 4RL7A 4GALA 1WBAA 2MLLB 3AXDA 1XG6A 1IILA 2P39A 3I2AA 1FWUA 3OBTA 4P14A 4GP3A 3BB2A 3NV4A 1N1SA 2W52A 1II4A 1DQ5A 21BIA 5JOYA 2TEPA 3V65A 4QD2B 1PZ8A 3IM6A 4ATEA 3D4KA 5T5LA 2ESUA 2JDZA 4BPZA 1N1TA 1A78A 3WINC 2DU1A 1LOFA 3HSMA 1V00A 2DUPA 1TTUA 2SBAA 4AWDA 4BQ1A 1DQ0A 5T52A 4GWMA 3BRFA 4M01A 1N1YA 1XYFA 4I4UA 2WJSA 2D23A 1S0DA 1KNMA 1JYCA 2FMDA 3OY8A 2VH9A 5FNWA 3ILAA 4ATFA 1MVQA 2P3IA 2ZGRA 5DG1A 4JKQA 1HCDA 1ENQA 3ZPYA 1TIEA 3APBA 1CN1A 3FLTA 4KBBA 4FPYA 2A3WA 1YF8B 1WW4A 1Q8PA 3UK9A 4I3NA 4LBJA 2HW9A 1CPNA 2ZKNA 3VKOA 3ZSLA 1W6QB 3NJ5A 3ZC8A 1LGBA 2WQZC 2R16A 5KXBA 1HCEA 1LGCA 3BIWE 3WG2A 3AXEA 3R05A 1QDOA 1AXMA 4HJJA 1LJ7A 4H9WA 3A0KA 4YGDA 4YM3A 5CA6A 3MEPA 2EXHA 5EWSA 3BX1C 2DRZA 1MS4A 1WW5A 1DJSB 1S0JA 4OZXA 2E4MC 2ZHMA 1W6OA 1AVWB 4DEPA 5IK4A 3TC2A 2NM1A 3IPVB 2JE9A 2D6MA 2D6NA 2NMOA 1O4YA 2WT0A 1S0GA 4JC1A 4YG0A 4XIOA 1QGLA 5JOXA 3UD9A 5DUWA 2G4IA 4YGBA 2D43A 1Y7BA 3M3CA 3BAOA 4II0A 3AJ6A 3USUA 2XB6C 3VV1A 3V64A 3DGTA 4Y1YA 5IK5A 1HWNB 3CRHA 3F62B 2LALA 4FOQA 3INAA 1AFCA 2DRYA 3CA5A 3AJ5A 3AKGA 4M3CE 2D6OX 1N47A 3MW2A 2K43A 1WCSA 4UW3A 2A70A 2JD4A 2D6PA 4IONA 3A4UA 2ERMA 2Y9XE 1PC8B 3UD7A 1AVBA 1UZYA 4HL0A 1JXNA 3O4OA 4CJMA 2ZGQA 2VW1A 2ZHLA 5GZGA 4I6IA 1IT0A 1PZZA 1N3PA 1QOTA 2L5XA 3AFKA 4I0YA 1O4ZA 3CA6A 4ZBVB 5FZZA 4IZXA 2P3JA 1URXA 1IS6A 2DVGA 5H9QA 4ZFYB 3OJVA 2DWRA 4R9DA 4FPCA 2ZHKA 1JN2P 2FGFA 3KQRA 1W6QA 4FPJA 1DQGA 4Q26A 4Q2FA 2BEBA 2YROA 3H6QA 3HN1A 3WDXA 2GMPA 2M49A 1LULA 4LBQB 2UURA 2GNMA 1GANA 1ILR1 1MZ6A 2XG3A 4XOGA 2AENA 1H9WA 2D6LX 2ZGOA 4PCRA 1BARA 3M2MA 1MR5A 4L4IA 1DBNA 3IPVA 1SZ6B 4A7KA 1GBGA 1UMZA 5EC5A 4X38A 5CB7A 1QQKA 2EF6A 2Z42A 4CTEA 3PVEA 3SITA 1D0HA 2X2SA 4XBNA 2ZQOA 4XFUA 1HWMB 1ISYA 4I4SA 3TB0A 1AXZA 1V6NA 2A71A 5F5QA 3W9TA 1ABRB 2ZGNA 1N4KA 1SLIA 4F83A 5F90A 4DPNA 3R4UA 3I2XA 4R9CA 4G9NA 1LECA 3FJAA 3UD8A 1OKQA 2ENRA 2P23A 2PHTA 3AZZA 5T5PA 4X37A 5IUQA 2OUHA 1WD3A 2YXSA 1EVTA 3Q7XA 4NO4A 1A8DA 5FREA 5DXDA 1V6KA 1GGPB 2WRYA 1TEIA 3FLPA 3RS6A 2Q9XA 4Z9WB 1XQNA 1ONKB 2DUQA 4D69A 2E51A 2FDBM 1Z0HA 2Q5TA 3WMVA 2D44A 4OEEA 4AVTA 1P63A 3ZXDA 5H9RA 1I1EA 3BODA 1PZ9A 1WW6A 2E7QA 3VWCA 3MALA 1QMJA 3K1XA 2D22A 4R6UB 1QF3A 4Z8SB 1G8WA 2ZGTA 1MS9A 1L2HA 2GNTA 3M3EA 3ATGA 2J3PA 1FAYA 1CVNA 3CA4A 3NBNA 4LBQA 3B69A 3CNAA 1GSLA 2WKKA 3SH5A 4Q1RA 5DZGA 3AZYA 3WDUA 2WNEA 1RZOB 3NBDA 5FZUA 4XTMA 5KXCA 1DLLA 2NTDA 3JRRA 1ISVA 1AVAC 1WD4A 2V73A 1ENSA 5I1BA 1FV2A 2A3YA 2PHRA 1GLHA 3FGMA 3ZSKA 5CNAA 1DZQA 2ES3A 4BLJA 2A6ZA 2ZGUA 4Q9PA 2KLLA 3BRDA 4P6AA 1BKZA 1MS5A 1G82A 4XMIA 3WNXA 3PJQA 1YIFA 3SLIA 1BYHA 1LOCA 4Y22A 3UDAA 2FFUA 3UJ0A 3AZXA 4L8QA 1DYPA 4XZPA 1G9BA 4YZ1A 2C9AA 4KEIA 5GLZA 1S0CA 5BVPI 4ITCA 3ZX7A 5EYXA 4YFZA 1SLTA 1VCLA 2P2KA 2ZZJA 3WG3A 2AH2A 4JRAA 3QR5A 1MS8A 2GDFA 1DIWA 4MYEA 5DG2A 1R8OA 3WO4A 1CQ9A 4LO2A 4XJAA 2ZQNA 4XDQA 2NVHA 2EXIA 3RSJA 5BOWA 4FQ4A 4PBPA 3ASIA 3N7KA 1WBLA 3FJDA 3JUUA 5GZDA 4GOYA 1JYIA 2WT2A 3O5SA 4Y1UA 2QYIB 1C57A 2NMNA 3S8JA 3N7JA 2ET2A 4IZEA 4GOVA 3T2TA 1ULDA 2D7FA 4G9MA 4Y26A 1R1ZA 1HKNA 1AVUA 3I4IA 2R9KB 4QALA 2B7YA 4LO8B 5T5OA 1LOBA 4GWNA 1EYLA 1NZKA 4ZLBB 1LOAA 1GZCA 5JOZA 5B2HA 2Y9GA 2GN7A 2LIEA 2WBCA 2ZMNA 2ZAAA 3AYCA 2DS0A 3AJZA 3BOPA 2D3RA 4IHZA 2DREA 3AYEA 1K5UA 4Y20B 3AP7A 3NV1A 3NBCA 3ILRA 1Q03A 2ZGPA 8I1BA 1RINA 1AXYA 1WLCA 3OPZA 5D62A 1J1TA 4YZ5A 3AZVA 1SCRA 4FPHA 4YGEA 1EPWA 3WCSA 3WCRA 4LO7C 4UW6A 3O4CA 2I2SA 5KXDA 4YLZA 5GLTA 2DVBA 4HANA 2JKBA 4I1EA 1SBFA 5H9SA 4ZA3B 4DCKC 4OWKA 4C1XA 2ZACA 1V6UA 3ENRA 1DQ4A 1MD6A 3WA1A 2CTVA 4WBCA 1RG8A 3WDYA 4IY8A 4KEKA 1PUMB 5T54A 1AX0A 4I1BA 1LENA 4QBCA 1OFSA 3H0OA 2HWMA 2A3XA 1SLBA 1ULEA 1TWMA 1UZZA 2R0HA 4FPFA 3SH4A 4AGGA 2YV8A 1C1FA 1FYUA 2X2TA 3ZYRA 1W6PB 5EYYA 4YW2A 3FJ8A 5JOWA 1YBIA 2Y9WC 1KITA 2PHUA 3WOGA 4X3AA 4L4HA 1R8NA 2VSAA 3IIRA 3O49A 3N7MA 1AF9A 1RIRA 1WW7A 1UKGA 2A5ZA 5BXPA 1KDMA 2GMMA 1IS4A 2GALA 3B9CA 2Q3NB 4K21A 4DRRA 2HZ9A 1VALA 1LOGA 5GLWA 4LBMA 5D61A 1HQLA 1XZZA 3AP4A 3RTIB 1MZ5A 1N1VA 1JTCA 4IY9A 4F34A 4I4PA 1SR4A 2JECA 1QXMA 4JQ0A 4LO0A 5HCAA 1YYNA 3LSEA 1YRZA 1W3GA 4YFWA 2ZHNA 4Y20A 5HCFA 4FQZA 4EEEB 4FOVA 1CONA 1GYKA 4K20A 1TP0A 4PC4A 1S1AA 3I8TA 1LHVA 1UL9A 3A0NA 2D24A 1DZDA 4XBLA 2MC2A 4WZFA 4BM8A 5CBLA 3DUIA 2RG9B 1JW6A 5EXOA 4YZ4A 2VXRA 3O0XA 2D20A 1RY7A 3O44A 3H6RB 4XBQA 2P3KA 1HKDA 1BQPA 1SCSA 4YOLA 3AZWA 4LO1C 3FLRA 2DVDA 4M3CB 1M16A 3EF2A 3POWA 2R0FA 1BXHA 1Q8QA 3VT1A 2C5DA 4P0LA 1HDKA 2VW2A 5T50A 4I37A 4XKIA 3OJMA 1SACA 3VT0A 1CR7A 2BQPA 1JT4A 2ARBA 2PELA 3FJFA 2Z49A 3FJJA 2AAIB 1WBFA 2ZABA 1U0AA 3PVOA 1DFQA 4YZ2A 3IN9A 3AH2A 1NLSA 3D5OA 4QO3A 1AXKA 4M00A 1K5VA 1LHWA 9ILBA 1LOFC 3D6EA 4I8MA 4EFQA 2ZGSA 5DUXA 4EB2B 4XYXA 1IOBA 1V6OA 1Z2VA 1AVXB 2E7TA 2D7RA 4BMBA 5CAZA 4JAWA 4QKRA 2GO2A 2DU0A 2VUAA 3VT2A 1IRAX 1V6JA 2AUYA 1ULGA 4U36A 1WLDA 3OBRA 3PMEA 1C1LA 3HR9A 2F2FA 2D3PA 1W6MB 3P53A 4Q8LA 3IMNA 3FUOA 2BEAA 4JCKA 3B00A 4ZXKA 5BXRA 3PVNA 4LBQD 5IK8A 4DENA 3LTQA 3WZ1A 4I4XA 2PHWA 3ZXGA 3M3QA 1KJLA 1W3FA 3ZXFA 4ZOTA 1GV9A 2DYCA 3VEQA 1LEDA 3W58A 4GAIA 1MACA 3N0KA 1Q8VA 3AP6A 3I29B 1CJPA 4AYUA 4K1YA 3VKMA 4G6MA 1DFCA 4EKXB 3O4BA 2PHXA 3AH4A 3H6RA 5JDBA 3WINA 3JUTA 2EXKA 1QOOA 1CPMA 4M3CA 3BA7A 4BMEA 1PZ7A 3GNEA 1JLYA 1JT5A 3R4SA 4FPLA 2Z48A 5IT6A 1ULCA 3A21A 1NXD1 3RRDA 2GZBA 3AP9A 3OGFA 1TWEA 3MW3A 3CAHA 4YM1A 1A3KA 4FP2A 2KKIA 3BADA 1AJKA 2MIBA 4CZSA 1KJRA 4GKYA 4J2SA 4Y1XA 3MPPG 1E0OA 2SLIA 4QD2C 1MS3A 4AGVA 3ZYPA 1Q04A 2H0BA 4GA9A 7I1BA 3CRGA 2KH2A 3M3OA 3FJHA 4GXLA 4XJWA 3L2YA 1GNHA 41BIA 1BFFA 1M2TB 4FPKA 2E4MA 5BXTA 5HCBA 1QOSA 1LOEA 4XJ8A 1G9FA 2WT1A 4I96A 2CY6A 1JBCA 1V6IA 1T4QA 3N3HA 3OJ2A 1LODA 1FATA 4ZGRB 4RA0A 3LSDA 2VW0A 4TYSA 2BFHA 1YTOA 4J2XA 3WUCA 2R1BA 4ISQA 4G6JA 4USPA 5D63A 3N36A 3OYWB 4YW1A 2P34A 3RTJB 1W6MA 3V0AB 1LESA 2JE7A 5DZEA 4ENDA 1CVSA 4I4OA 3O4DA 3OGGA 3VKLA 4K1ZA 1JT7A 4WVVA 2ZGKA 5GJ6A 1LHUA 4LBLA 1QNWA 3T8SA 1BLAA 1SLCA 3RG0A 4TZDA 1DQ2A 5BP5A 4OW4A 1IS5A 4USOA 2CWSA 3PHZA 1ENRA 1YI7A 4FPOB 1JY0A 1FNYA 1XHBA 3KMVA 1BZWA 4YW5A 1I3HA 3TAYA 2DVFA 4A7YA 1WBCA 3CRIA 1S0EA 2ZMKA 1TOOA 4YM2A 4EFRA 2FHRA 1LTEA 1B09A 4DRVA 5H9PA 5BXSA 2ZMLA 1VAVA 3JU9A 1RITA 2DV9A 5IK7A 2HWAA 3FJ9A 5BYNA 1JHNA 1HQWA 3WMUA 1NUNA 4AN6A 2W68A 1G7YA 1PUUB 2NZ9A 4OWJA 3RMXA 1BFGA 1HWPB 2GN3A 1N3QA 3SISA 31BIA 4J2YA 1UN1A 2A6VA 4FPEA 4BOWA 3PUBA 3AYAA 4YW3A 1W6NB 2CYFA 4OWLA 4KC3A 3O0VA 4YG3A 4DFSA 2ERFA 4D0TA 2VXTI 3GALA 1LCLA 4ZFWB 4I30A 3WHTA 3UJQA 4LO3A 4AGRA 2VSEA 3E8LC 5T5JA 5AVAA 3HBWA 1F31A 5GZFA 3F1RA 5F8SA 3ZXJA 5KXEA 3B01A 1ULFA 4XJ9A 1UPSA 3ZVXA 4ZFUB 3VKNA 1JQZA 2YMZA 3WUDA 1YO8A 2JJ6A 4OUJA 3POYA 2D6KA 3BTAA 4XILA 5E24E 4UW5A 2EALA 3HMYA 1ZA4A 4XFTA 5BQUA 2GNDA 3HOMA 2CWMA 3IM7A 2YZ4A 3A07A 1V6XA 3N7LA 2DTYA 5FNXA 4AVSA 3S8KA 1V6LA 1JOJA 3OYWA 3AKIA 4Y24A 3V0AA 1SBDA 4FOWA 4EFPA 4DQAA 1HWOB 1DZCA 4J2KA 1FX5A 1CE7B 1ZM1A 3WDTA 4HR6C 4XTPA 3D7WB 2EIGA 4I2SA 2DTWA 4G1RA 4IYBA 1W0PA 3SH3A 3UJOA 4YGCA 2NP0A 4PQ9A 1IKPA 1AX1A 3BAUA 1ITBA 3O5WB 1FQ9A 5T55A 2DUOA 1AJOA 1ONAA 2DVAA 1D2SA 2E53A 1W3AA 3WDVA 4PBOA 4I4VA 4NOTA 5F8YA 4UW4A 1KQRA 4Q91A 1S0FA 1DYKA 4XXPA 2AREA 4P9YA 4OEFA 4DS0A 1SFYA 1Q8SA 3CA3A 2NN8A 3FJEA 5GZEA 3HALA 5JVVA 4ISRA 3PG0A 2R1DA 1DQ1A 3BA4A 1G9DA 1BA7A 3VKFC 3ZC9A 1W6NA 1KRIA 4I7IA 2VY0A 5GAQA 1UAIA 1FNZA 2ZGLA 2LIQA 4XJZA 1HLCA 3AK0A 4FPGA 2UWAA 2AQZA 4JKXB 4CRQA 3ILNA 2ARXA 2KI6B 3A22A 3WG4A 4P0KA 5L73A 3ILFA 3C2UA 2ZBJA 4Y1VA 2P37A 5GLVA 4LO2C 3QYDA 1CESA 4YW4A 3QLQA 2UWBA 3BAQA 5BP5C 1EV2A 2KM2A 2AFGA 1QQLA 4Q27A 1H9PA 3FUQA 4U2AA 1IRPA 6I1BA 3FJIA 4Q9GA 1GNZA 4AVVA 5DVHA 1W0OA 1OQLB 2AXMA 1F9KA 2WLQA 4WV8A 1N3OA 4BLIA 3U4XA 2D7IA 4GP0A 3NV2A 2CL2A 4Q1PA 4PF5A 5GLUA 4LO7B 1S0BA 4OEGA 2FO1A 1MS0A 3POSA 4XE9A 2RQ9A 5FRAA 1FMZA 3Q7YA 5HPZA 1BJQA 3OJBA 1X50A 5JLVA 4XHBA 3AP5A 3ZXLA 4LBOA 4JP0A 2I1BA 3ZSJA 1MVEA 1APNA 3LLPA 1BLDA 2A6YA 1W6PA 1H30A 5FZYA 3ZSMA 4I4YA 4FGFA 3IAGC 1Q56A 1Z78A 4KEJA 4YZ3A 5JMCA 3FFZA 4LO3C 1CIWA 3UL2A 2NYYA 4XHXA 4QKSA 1AZDA 3FBYA 5GALA 3RQ0A 2LTNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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