1Z0HA

N-terminal helix reorients in recombinant c-fragment of clostridium botulinum type b
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
438
structure length
438
Chain Sequence
NKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title N-terminal helix reorients in recombinant C-fragment of Clostridium botulinum type B.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 101
structure length 438
sequence length 438
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2005-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1z0hA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1z0hA02
3RSJA 5T5JA 1SBDA 3BA4A 2WJSA 3B00A 3AP9A 1JT5A 4Q2FA 1PWAA 4G6MA 2R0HA 1X50A 4ZLBB 2FGFA 5IK4A 3FLTA 2A6VA 4QD2B 4ZFWB 4OUJA 1SBEA 1UAIA 2AGSA 2I1BA 1ENSA 3OYWA 4FP2A 5FRAA 3M3EA 3BAOA 2ZACA 4HL0A 4X37A 4Q1RA 3INAA 1R8OA 3AKGA 1V6WA 1ONAA 4Z9WB 4I4OA 5KXEA 5JVVA 2OUJA 4LO2C 3PVEA 2Y9GA 1W6QB 4QC4A 3A0KA 1UZYA 2R9KB 4A7ZA 3WA1A 3IM5A 3ZVXA 3WDWA 4USOA 3FJHA 3T1LA 4ZBVB 4LBKA 1R8NA 3VKOA 1S0IA 2X2TA 2J3PA 1W6MA 1H9PA 3FLRA 1J1TA 4HANA 4R9CA 4I7IA 1F5FA 4GOYA 2WQZC 3RG0A 1W6PB 4GXLA 2W52A 4LO2A 3UDAA 4PF5A 5HCBA 4XHBA 1WBCA 2K43A 3OY8B 2WT1A 4I4QA 5DG2A 1NXD1 2WRYA 4BOWA 2PHRA 2VXRA 5DZFA 3O4DA 1S0DA 1UL9A 2DS0A 4Y1YA 1CN1A 1JXNA 2BEBA 2ZGOA 1II4A 3Q7YA 3AXEA 1AVXB 2ZGSA 1TIEA 1V6VA 4I4RA 3ENRA 4L4HA 4GP0A 3NBNA 1WLWA 4H04A 3IKWA 4G9MA 4XIKA 4DRVA 4OEEA 4P0LA 2X2SA 2DVDA 1HDKA 1I3HA 4LO8B 4M3CA 3MW4A 2YXSA 2AH2A 1JLYA 3ILAA 2A3YA 4J2SA 1DYKA 3BTAA 4K1ZA 4QBCA 2JE7A 1Q04A 3FJ9A 4Y20B 4FOQA 3QLQA 4XFSA 3ZX7A 1WLDA 3HSMA 4I4YA 2UUSA 3GALA 3O0XA 1PUUB 2AREA 3N7JA 2P23A 1V6IA 2C5DA 4YZ3A 3GNEA 2GZBA 4YM3A 1DBNA 3PVNA 3IM7A 1DZQA 4A7KA 4BPZA 1KITA 1A78A 1GANA 4M3CF 2CY6A 3LSDA 1KDMA 4LBOA 3QCWA 3USUB 2BFHA 1FGAA 1YIFA 3BB2A 3BRDA 1KDKA 3WOGA 1S0CA 4I3NA 3ZXLA 4G9NA 3NV1A 4ZFYB 3V65A 3CNAA 1MS0A 2YZ4A 4YGCA 3NV2A 4XJAA 1IHKA 1CJPA 1SFYA 1Z2VA 3N7KA 1CE7B 2D6PA 1SLTA 1IS6A 3O0VA 1IOBA 3IMNA 4Y26A 2FHRA 4RA0A 2EF6A 5H9SA 5JOZA 3NJ5A 3SLIA 2A7AA 2ESUA 1Z0HA 1W6NB 1XYFA 1SR4A 1FWVA 3SH3A 2CYFA 2PHWA 5EYXA 3ZXJA 3RMYA 2VH9A 5BOWA 3M3QA 4XZPA 4I4VA 3QYDA 4R6UB 4CJMA 1UX6A 2JECA 4KEKA 5F8YA 4UW6A 4YW4A 4JAWA 4KBBA 2HW9A 1LCLA 2E51A 4YFWA 4GP3A 3BADA 2IWTB 3H6QA 5FREA 1QOSA 2DV9A 3VSFA 4JCKA 4XJWA 3CA3A 2YUGA 3WV6A 3ZXDA 4FPFA 4KC3A 1AX1A 5DSSB 3HN1A 2E4MC 1S0LA 4XOGA 1AVAC 1ISVA 1NUNA 4YZ5A 1SCRA 1LJ7A 2VXTI 3B9CA 1TWEA 4I4UA 3SITA 1TFMB 2E6VA 2D20A 4XBLA 1LTEA 3OJBA 4WVWA 4XXPA 1CQ9A 4R9DA 3VEQA 4P14A 4Q91A 5CB7A 3IAGC 5L73A 1LU1A 2H0BA 4IONA 3IN9A 4YG0A 1HIBA 1JN2P 3H6RA 3FGMA 1FV2A 2WSUA 2Y9WC 2FO1A 4OEGA 3M2MA 3UJ4A 4JC1A 2E4MA 3FJAA 1Y7BA 3FJBA 1YYNA 4Q1PA 1JYCA 1TWMA 2Y9FA 4EFQA 3ILFA 2A3XA 2ARBA 1NLSA 3FFZA 1DQ6A 1XZZA 3JUTA 5GALA 2DRYA 2ZBJA 4II0A 2AYHA 5GZCA 5IK8A 1Q03A 1IJTA 4C1XA 3C2UA 5BP5C 1LESA 4I96A 5DUWA 3VKLA 2UWBA 1RINA 1CIWA 4Y20A 2FFUA 1G9DA 4Y1XA 2DWRA 3WHUA 1IS4A 4BLIA 1VCLA 1PZ8A 4PCRA 2WT0A 1VALA 3CA5A 2LIQA 2Q3NB 3VKNA 2DUQA 2NP0A 1CESA 3A4UA 1HWOB 1ENQA 4D0TA 2DU1A 2GO2A 1IS3A 2DVFA 3JU9A 4LBMA 2P34A 1HCEA 2VU9A 3KMVA 3WVJA 2HZ9A 2Q5TA 5BP5A 5FNWA 3WO3A 4XTPA 3USUA 1HQLA 1HKDA 4I1EA 4KEJA 3B3QE 1XG6A 2CL2A 2AAIB 1J0SA 5GZDA 1W6MB 2WBCA 1AVUA 1H9WA 5JMCA 2GMEA 3B9UA 1LULA 1OQLB 3JRRA 3JUUA 4M3CE 4TLPA 2R16A 4FPCA 4YW2A 3OJVA 3AKIA 1DZCA 4ZFUB 1HKNA 1V6LA 1W6NA 3A22A 3ZSKA 2ET2A 1DQ2A 3SNVA 4D0ZA 3TB0A 3KQRA 4FPYA 4UW3A 1Q8VA 2A6ZA 4GAFA 1LOFA 2GALA 2D1ZA 4GALA 3O4BA 4D69A 3NBDA 2D6KA 5DUYA 1YTOA 2R49A 1GNZA 1GZWA 31BIA 2ZGRA 3ZSMA 5BQUC 1N3PA 1LGCA 4ATEA 2YMZA 2D7IA 2RQ9A 4D8HA 3NV3A 2ARXA 3O5WB 4UW5A 1FMZA 3R4UA 3AXDA 1LEMA 5D62A 1S1AA 3NV4A 3MW3A 4DS0A 3AYCA 3O0WA 3O49A 1LOEA 2ERMA 3F62B 2GMPA 3I2XA 3FJIA 3K1XA 1BFFA 3CAHA 2BEAA 3LCPA 1JT3A 2D6LX 2RSTA 4XFUA 2LIEA 3IM6A 1R1ZA 2A6YA 1MS8A 5BQUA 1DQGA 3WMVA 3AZVA 4I4SA 1BA7A 5EC5A 1WLCA 1MACA 2P39A 1G82A 3ZSLA 2JDZA 2WLQA 3IM0A 1V6NA 3D6EA 1YRZA 3BIWE 3EF2A 3PG0A 1WW6A 3HBWA 3V0AA 1ZM1A 1QDCA 1UPSA 1BLAA 3H6SE 1VIWB 1Q56A 4PBOA 4YOLA 4AVVA 5G00A 3BA7A 1MR5A 3TAYA 3BRFA 1IRAX 2ZHLA 3U4XA 3AP5A 3PHZA 5DUXA 2UWAA 4NO4A 4GWNA 4Y22A 2DYCA 4AVSA 4AWDA 3IIRA 1JHNA 1T9FA 4LO1C 5JOWA 4FOYA 1LHNA 1BKZA 4P0KA 3PVOA 4ZKTB 1DHKB 1MS3A 3WMUA 7I1BA 4F34A 2K4AB 2Z42A 3UK9A 5BXTA 1N3OA 2P37A 2VW1A 2LALA 3P6JA 3O12A 2SLIA 1KQRA 1LOGA 3BAHA 2ZR1B 3ZYRA 1QNWA 4I2SA 5F5QA 3WINC 2E7QA 4Q8LA 21BIA 3UJ0A 4X3AA 4H55A 3Q7WA 4LO1A 1GICA 5T50A 2KI4A 3WG4A 3T8SA 4YFZA 1JUIA 2EXJA 4Q9GA 1QNYA 4YM2A 1LOBA 2D7RA 2AXMA 1W0PA 4FPEA 3W59A 4AN7B 5E8AA 3UL2A 3AZYA 1PZZA 3N36A 3OBRA 4FP3A 1MS1A 1QKQA 3H6RB 3WDVA 4Q26A 2TEPA 3F1RA 1IS5A 2AENA 3SISA 2D6OX 2ES3A 2Z48A 1WD3A 3M3OA 4ENDA 1APNA 3WINA 1EPWA 4ISQA 2M49A 3PUBA 1G8WA 2GNDA 4FPGA 1CPMA 3FUQA 3SH4A 3B01A 1YI7A 2SBAA 1MS4A 2VSEA 1QQKA 3APBA 3NBCA 3FJFA 4R9BA 2EXKA 3ZSJA 1B09A 3POKA 4ISRA 2PHTA 1ISYA 2Q9XA 3VSZA 4IQPA 5GM0A 3WHTA 1Q8SA 1QOOA 3FJJA 1G7YA 4QO3A 4ZGRB 5FZUA 2RHPA 2W39A 1FQ9A 5E24E 4LBNA 2AFGA 4GWMA 5H9PA 1HLCA 2ZGKA 2YY1A 1FWUA 4Z8BA 4BLJA 1SR4C 3FJ8A 4RL7A 2XOAA 2ZGPA 1IOAA 3A21A 2DUPA 1WW4A 2W08A 5DZGA 5T54A 5D61A 4HR6C 1IKPA 3FLPA 1RMLA 1MC9A 3CRHA 3MALA 3WUCA 2NVHA 2ZHKA 1O4YA 4P9YA 1V6JA 3WCSA 1AJKA 1AVWB 1SLCA 4X38A 2MLLB 4X39A 3WG3A 1BFBA 3MEPA 5GLUA 1CVSA 1TEIA 2EXIA 5T5PA 4WV8A 1GLHA 4XHXA 1S0FA 2R1DA 1OQ1A 1AFCA 1ULFA 3AH4A 3WNXA 3HR9A 2F8XC 5BYNA 1BQPA 1OKQA 2D6NA 4XIOA 2Z49A 1MZ5A 5DZUA 1C1LA 3OGFA 3O4AA 1G9FA 4EFRA 1GZCA 1G9CA 1FNYA 4IZXA 3ZC9A 2D44A 5F90A 1HCDA 3AJYA 2ZABA 5JOXA 2DTWA 4AVTA 2ZGMA 3AJZA 2A71A 1GNHA 1GZWB 4OEFA 3E8LC 3WG1A 3AKHA 2NM1A 2EAKA 1LHWA 2CNAA 3S8JA 1FATA 1SCSA 4JQ0A 1S0JA 1JW6A 1W6OA 3BAQA 1FMMS 3WLUA 4I30A 4JP0A 5I1BA 3CRGA 1LHVA 1WBLA 2NMNA 3RTJB 1AJOA 2OW4A 3B69A 1C4RA 5FNXA 2ZHNA 1BFCA 1ISZA 4W65A 1RG8A 4XKIA 1LEDA 3CA4A 5GZFA 1JQZA 2DTYA 4AYUA 3D4KA 3I2AA 4P9XA 2ZMLA 1W0OA 5IT6A 2BQPA 5EYYA 1O4ZA 3VWCA 4OWJA 3A0NA 4YGDA 3V0AB 3O3QA 4G6JA 4KEIA 2DVBA 5EXOA 4P0JA 3O4OA 5BXPA 4XTMA 2DVGA 4FQZA 2VW0A 4JRAA 4U2AA 5F8SA 3AZXA 1Z4SA 5H9QA 1OFSA 5D63A 2D6MA 4LBJA 4Y22B 4Q9PA 4Y24A 3OPZA 3POSA 4IYBA 1A3KA 4BMBA 1SLBA 4M01A 2IHOA 2OUHA 1VAVA 2WT2A 3AP6A 3CA0A 2YV8A 2ZGNA 5DXDA 4ATFA 4DENA 3RTIB 2JJ6A 4SLIA 1TOOA 1ISXA 4J2XA 2UURA 4DFSA 1E0OA 4L4IA 1LOFC 1RITA 3M3CA 4L8QA 4YZ4A 2B7YA 1Z78A 2A70A 1S0GA 1ULGA 1JLXA 3WDUA 4K21A 4XJUA 3CA6A 3O4CA 1JY0A 1LOAA 1LU2A 3WZ1A 3FJCA 6I1BA 1D0HA 1AXZA 1N1TA 2A6XA 4P9WA 1HWPB 1K5VA 1F31A 2ENRA 3ILRA 2ERFA 3LLPA 1CR7A 1C1FA 5DVHA 4M00A 4YW5A 4BM8A 2XG3A 4YM1A 3O44A 2K8RA 2ZGQA 4FVVA 1N3QA 2D3RA 3LSEA 5T5OA 3OBTA 3D7WB 1FAYA 2DRZA 2GN7A 2QN4A 2JD4A 5IUQA 4EKXB 3P6IA 1YXWA 1D2SA 1M2TB 4LBQA 3ZXEA 4DEPA 1KNMA 1UKGA 1ULDA 5DUUA 2VW2A 3ZYPA 3UJQA 1QOTA 4QALA 2WKKA 2ZMNA 1JOJA 4TYSA 2ZA9A 5DUVA 4F83A 2ZKNA 4I8MA 2WNEA 3AYEA 5GLVA 3RRDA 1URXA 1Q1UA 2EIGA 3L2YA 3AJ5A 2EXHA 4FPJA 5T55A 4XXAA 1GYKA 2F2FC 1G86A 2GNBA 1S0EA 2YROA 1AZDA 4FPKA 4WZFA 4PQ9A 3A07A 3ILNA 2L5XA 2CWSA 1RIRA 4PBPA 1L2HA 3CQAA 1G9BA 2P3IA 2CWMA 5DZEA 4DRRA 1FV3A 3V0BA 3RQ0A 3AYDA 1W3FA 1VAMA 4QBVA 1MS9A 3BAGA 4HA2A 5GZGA 2G4IA 3VV1A 4CRQA 4QKSA 5DG1A 4H9WA 5AVAA 4AGGA 2V5YA 4FOWA 1MS5A 1G9AA 1IT0A 3WO4A 2HYKA 2JE9A 4HJJA 1YO8A 3C9ZA 1ZA4A 3BRGC 3I29B 2F2FA 4R9AA 2P3JA 2EALA 3VT1A 1HWMB 4ZA3B 1ULCA 2GMMA 2UU8A 5JDBA 3TC2A 1AX0A 3Q7XA 4BQ1A 3Q9OA 1A8DA 4QKRA 3WDXA 4YM0A 1BZWA 3AZZA 1JT4A 4YGBA 3V64A 4OW4A 3FJKA 1AXYA 2NZ9A 3IPVA 2ZGTA 3UJOA 3UD8A 1V6OA 1W6OB 1GGPB 4J23B 4IY9A 1N4KA 1W3GA 4FGFA 2PHXA 4Q27A 2VUAA 2R1BA 1PZ9A 5HPZA 2C9AA 1XQNA 2DVAA 1ULEA 4J2KA 5JLVA 3POWA 3WO2A 4EEEB 3PMEA 1QMJA 1N1VA 3VKFC 3O5SA 1LHOA 1SLLA 1AX2A 1MVEA 2PELA 1V6MA 5IK5A 4XE9A 4IHZA 3HMYA 3DUIA 3N35A 4XMIA 4FPOB 1CPNA 1BLDA 1H30A 2UWCA 4LBLA 4YGEA 5B2HA 2DURA 2PHFA 1RY7A 2FFVA 1WW7A 4IZEA 2D7FA 4XYXA 1WW5A 3OJ2A 5CA6A 4YW1A 3QR5A 2ZAAA 4I4PA 3NBEA 4XJ8A 5GLTA 1IILA 4AN6A 3SH5A 1AXKA 1GV9A 1N1SA 3AZWA 3D5OA 1AF9A 3SNMA 4XJZA 4LO7B 1SBFA 4CZSA 2LTNA 4QD2C 1JT7A 1V00A 4GAIA 5F9TA 3UD7A 2I2SA 2OVUA 3CA1A 1MD6A 1M16A 2D43A 3W9TA 4FPHA 4YLZA 4CTEA 1QGLA 1DGLA 1KRIA 1AXMA 1PZ7A 1CONA 4MYEA 4GOVA 3FJEA 5SV8A 1HQWA 1JTCA 5GLWA 3WCRA 3VUOA 2A6WA 5BXSA 1DQ1A 3AYAA 1AVBA 1QDOA 1BASA 3ZXFA 2ZQOA 1UMZA 3POYA 2FMDA 2RG9B 1NZKA 2NMOA 4OWKA 3BX1C 2E7TA 2KI6B 3AKFA 3AP7A 1JBCA 1T4QA 1HWNB 5E88A 1XHBA 4WVVA 2AR6A 2GNMA 4Q8KA 4K20A 3M1HA 1I1BA 3ZXGA 1UN1A 2ZMKA 1YF8B 4JKQA 1BYHA 3UD9A 1DFCA 3VT2A 3AH1A 3NWKA 2VSAA 1ENRA 3AFKA 1W6QA 1ABRB 3N7MA 3MW2A 1DLLA 1UZZA 1BXHA 1LGNA 2DUOA 2DREA 1DQOA 1YBIA 1LODA 4USPA 4LBQB 4FPLA 4I4XA 2MC2A 3W58A 4XBNA 1GBGA 4EB2B 2MIBA 1SLIA 5BXRA 2DU0A 1ILR1 2W68A 4DPNA 2GNTA 3RMXA 4A7YA 2JKBA 4ZOTA 3ZXKA 4YZ2A 2FDBM 1F9KA 5FZYA 4ZXKA 4LO3C 4BMEA 2NTDA 1W6PA 4JPZA 4LO0C 5KXBA 1MVQA 4GKYA 5H9RA 5BVPI 3OY8A 5IK7A 2P3KA 1QU0A 3HOMA 2A75A 1C57A 2PHUA 2QYIB 1GSLA 3AX4A 4LO7C 2VY0A 3WDYA 4EFPA 1DQ0A 4Z8SB 1BJQA 3A23A 2XB6C 3H0OA 5JOYA 3V0BB 2Y9XE 1KJLA 2E53A 4J2YA 5EHAA 1DQ5A 2NYYA 3ZC8A 1FX5A 2HWMA 4ASMB 1WUVA 2D3SA 5T5LA 4Y1ZA 4NOTA 4XILA 3CRIA 5GAQA 4XBQA 5EWSA 3AK0A 4LO3A 4XMAA 3MPPG 4LO0A 4UW4A 1GKBA 2D23A 1V6KA 3FJDA 1DIWA 4C1WA 3AJ6A 1IKQA 4I1BA 1ISWA 2KKIA 1V6UA 2WSVA 2D24A 5F8WA 1GZ9A 4DQAA 3OYWB 1TP0A 4IY8A 1CVNA 5CBLA 5EG6C 1RZOB 1DJSB 4PC4A 1KJRA 5GJ6A 2A5ZA 3N7LA 4GA9A 4OWLA 4YG3A 2HWAA 1LGBA 4XDQA 4LBQD 3ZPYA 2V73A 2GDFA 4JKXB 2ZGLA 4AGVA 4TZDA 4ITCA 5CNAA 3V79C 1DFQA 3VT0A 1VLNA 1Q8PA 1BFGA 5LK5A 2ZGUA 5KXCA 4Y1UA 3ASIA 2GN3A 2D22A 3IPVB 1K5UA 2VLCA 2ZQNA 2D3PA 4G1RA 3KM5A 2R0FA 5KXDA 3BODA 4K1YA 1SACA 3VKMA 5HCFA 1LOCA 3FBYA 4YG6A 4I0YA 3CU1B 4FOVA 1SZ6B 1MZ6A 4XFTA 1WD4A 1WBAA 4FQ4A 5GZEA 1LENA 2P2KA 1EV2A 5E89A 3AH2A 3ATGA 3WDTA 1PUMB 2CTVA 4AGRA 1N1YA 4OZXA 4XJ9A 3WG2A 3AP4A 3T1MA 1QF3A 9ILBA 4YZ1A 3RS6A 2A3WA 1V6XA 2AQZA 1SLAA 1EVTA 2NN8A 3BAUA 5HCAA 1ITBA 1WCSA 1ONKB 3HALA 1EYLA 2ZZJA 3P53A 4P6AA 1P63A 2KLLA 1PC8B 3FUOA 5T52A 1S0BA 3PJQA 3BOPA 3BAVA 41BIA 1Q8OA 4Y1VA 3T2TA 3I4IA 1BARA 3N0KA 1FYUA 8I1BA 3R05A 1LHUA 4I37A 2KM2A 1FN0A 4M3CB 3N3HA 5GLZA 4WBCA 5FZZA 4I6IA 3I8TA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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