2D43A

Crystal structure of arabinofuranosidase complexed with arabinotriose
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMANNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The family 42 carbohydrate-binding module of family 54 alpha-L-arabinofuranosidase specifically binds the arabinofuranose side chain of hemicellulose
pubmed doi rcsb
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
total genus 153
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2005-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2d43A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2d43A02
4II0A 2OUJA 4Y26A 2X2TA 3OJVA 3FJ9A 1QDOA 3C2UA 2EIGA 2JKBA 5DUWA 4P6AA 4ZFYB 4Q9PA 1MS0A 4XOGA 1UAIA 3R05A 1K5VA 3ZXKA 3R4UA 1LHNA 2D6MA 5D61A 4X38A 4YW3A 2FO1A 1B09A 5DZEA 2PHUA 3RG0A 5DG2A 1IILA 1PUUB 4LBNA 2EAKA 4GWNA 3RMYA 3K1XA 5LK5A 2D6NA 2ZHKA 1VLNA 4UW3A 2SLIA 5IUQA 3MW4A 1O4YA 3MPPG 1DYKA 2WT1A 3PMEA 4IHZA 5F8WA 1DYPA 4C1WA 4ATEA 3EF2A 4LBLA 3BADA 2AENA 3VSFA 3S8JA 5GM0A 1NUNA 2WNEA 1IOBA 3AYDA 1FQ9A 1D0HA 4Y1XA 1Q03A 1SR4C 4J2SA 3HSMA 4LO7C 4XTPA 3SH5A 1CIWA 1ENSA 1V6LA 3N3HA 4XJWA 3CRIA 4USPA 5KXEA 3AJYA 1UKGA 4GALA 1G8WA 1S0EA 1SR4A 3M1HA 1KDMA 4G9MA 3POSA 2ZQOA 4EKXB 4KEJA 2A6YA 5EYXA 1HIBA 3AJZA 2D7FA 4QBCA 1TFMB 4BLIA 5BOWA 4EFQA 1R1ZA 3OYWB 3JUTA 3DUIA 4X37A 1TTUA 1XHBA 4YG3A 4QALA 2D6LX 1Q1UA 2V5YA 4YZ5A 1I1EA 2D44A 5DZGA 1MVEA 4Y20B 2NN8A 2EXKA 1WD3A 5H9QA 3ZX7A 5FZZA 4R9AA 2E4MC 2P37A 5G00A 2LTNA 1W3GA 3BX1C 3AKGA 2PHRA 5H9PA 5BQUC 1GKBA 1Q8VA 1NXD1 3SLIA 3AYEA 1FAYA 1IS6A 5FRAA 4SLIA 3N7KA 1LHVA 4GKXA 5BVPI 3B00A 1GNHA 5CNAA 2E4MA 1VALA 1DFQA 5DUVA 41BIA 2YXSA 5BQUA 4F83A 5KXCA 5IK5A 1L2HA 3UDAA 3PG0A 3B01A 2ZGKA 3PJQA 3GALA 3JUUA 5HCFA 3ZYPA 1W0OA 3OY8A 3NWKA 1W6OA 3CA1A 2AYHA 4F34A 1YYNA 1C1LA 4Y1YA 2ZR1B 1AXKA 3AKIA 4I4XA 3CA0A 5DUXA 1ULGA 3WG2A 3HR9A 4Q8LA 4IY9A 2D22A 3AP7A 2DUOA 2VW1A 4FOWA 4ATFA 5H9RA 1W6NB 3BAOA 4CTEA 3ZSKA 2ERMA 3WLUA 1RZOB 3WUDA 2VH9A 2ARXA 1MS1A 4Z8BA 1UMZA 2AFGA 4FOVA 1AZDA 4XFUA 3BIWE 4OWKA 3IMNA 3WDTA 2TEPA 5DZFA 3UJOA 4ITCA 4GA9A 1FMZA 1VAVA 3AYAA 2AAIB 4XE9A 1Z4SA 4KC3A 1QNYA 1Q8PA 3P6IA 4NO4A 2Z42A 1IKQA 3H0OA 3V0AB 4Q27A 3N35A 4OW4A 3FLRA 4XFTA 2Q5TA 2IWTB 4GXLA 1G9FA 4ZKTB 1N3OA 1JYCA 2OW4A 4JC1A 2SBAA 1CN1A 1ULCA 3ILAA 4WBCA 5HPZA 2DUPA 3OGGA 2ZGPA 2W39A 3CNAA 5T50A 1MS8A 2XB6C 3W9TA 2BEAA 3CA6A 3WG3A 5T54A 5BYNA 2WT2A 2HWAA 4G6JA 1CR7A 4ZA3B 2DU0A 2AREA 1FMMS 2I2SA 4Q8KA 1N1TA 4I1BA 3BB2A 2WSUA 2GZBA 1AVUA 2A6ZA 3VT2A 1A78A 1H9WA 3OYWA 2GMMA 3BA4A 1S0LA 1KJLA 4YW1A 4A7YA 1SCSA 1HQLA 2WRYA 1RIRA 1TWEA 4ZBVB 1H30A 4HJJA 1A8DA 4YOLA 3USUB 1Q04A 3LLPA 3WNXA 1J1TA 4YG0A 4YM3A 3HOMA 1LHOA 3ZXGA 5GLZA 3WZ1A 1S0DA 2CL2A 1AX2A 3ZSMA 2DVGA 2VUAA 2GMPA 1DJSB 1PC8B 2LIEA 5FNWA 5BP5C 1ZA4A 1V6JA 3ZXJA 3VKFC 1WD4A 1LGNA 3O44A 1YBIA 3WA1A 1APNA 4L8QA 2ARBA 4XHXA 3LSDA 4AGRA 2W52A 3PVEA 1G9DA 3UD9A 5L73A 1DGLA 5BP5A 3AP6A 1GZ9A 1KRIA 1URXA 2JDZA 3IAGC 4XMIA 3O12A 4I96A 3IN9A 5DVHA 1FV3A 1GYKA 5CBLA 1CVNA 3NJ5A 4J2XA 4YFZA 4I4QA 1TEIA 4XJ9A 5EC5A 1W6NA 4AVVA 1QOSA 4OEFA 1AVBA 2M49A 4Q9GA 4LBQD 1FN0A 4XJ8A 4J2YA 4YGCA 2UWCA 3UL2A 2E53A 3ZC8A 5JOWA 3BODA 4FP3A 4I4OA 5H9SA 2GNTA 3AH2A 5F90A 2FMDA 1ULFA 3UD8A 1BLDA 5KXDA 1EV2A 3O4DA 3CRGA 4K1YA 3W58A 2A6WA 1IS3A 4D0ZA 2WT0A 1IS5A 1LOGA 5CA6A 3V0AA 2PHFA 3WO3A 3OPZA 1V6MA 3ZC9A 9ILBA 1BA7A 4XIOA 4U2AA 3FJEA 1ENRA 5F5QA 5T5OA 3WHUA 4FOQA 4YW4A 2F8XC 3D4KA 1U0AA 1V6OA 3NBNA 1Q8QA 4WVWA 2A3XA 1DQ1A 4P0LA 2PHWA 4ZLBB 4USOA 4L4IA 1MS9A 2UWAA 3O4BA 3IM0A 2DURA 3A4UA 4XMAA 4DRVA 1WW5A 4XBQA 4PQ9A 1SLBA 2ZACA 2MIBA 2A6XA 1MC9A 2AGSA 3NV1A 4IONA 1BARA 2NYYA 1XG6A 1SBDA 4I2SA 2NZ9A 3UJ0A 2YMZA 1GANA 3USUA 1JYIA 3NV2A 3I8TA 4GOVA 3LSEA 1JBCA 4BM8A 1JLXA 3L2YA 5F8SA 3GNEA 2D6KA 1BZWA 2ZGOA 3POWA 2J3PA 2RHPA 1FV2A 4XTMA 4DEPA 1W6PB 2GDFA 2A75A 3SISA 4TYSA 5GLUA 1DQ2A 1F5FA 3BAHA 3IM5A 4YLZA 1ULDA 1W3FA 1HWMB 1WLCA 1DQ0A 3RS6A 1RG8A 4QD2B 1G82A 4XBNA 4JPZA 4GAIA 2RSTA 4I0YA 3T2TA 4K1ZA 4GP3A 2D3SA 1N3PA 3VKMA 4XIKA 2DWRA 3O4CA 3O4AA 4XZPA 1BKZA 4TLPA 3C9ZA 1WLWA 1LODA 2NMOA 4G1RA 4DPNA 2V73A 2ESUA 1S0CA 4OWLA 4UW4A 1JLYA 3A23A 4DENA 1EPWA 2Y9FA 4FPCA 4ISRA 4P9YA 2GNBA 4PBPA 2D6PA 2CWMA 2ZMLA 1ISYA 1FNZA 4FPLA 2LIQA 1DQ4A 4YZ2A 4JQ0A 3OGFA 4I7IA 1V6NA 2YV8A 2GN7A 3IKWA 1QKQA 4XJUA 1IKPA 4FP2A 4H9WA 4Z8SB 2D7IA 2I1BA 4YGEA 2ZHNA 3UJQA 1DQ6A 2A71A 1BASA 1JT7A 1P63A 2CNAA 3WUCA 1AVXB 4QO3A 1CE7B 3AFKA 1NZKA 4YGDA 1N1YA 3V64A 2EXHA 3WMVA 2ZAAA 3CU1B 4ZFUB 1BQPA 1SBEA 5FZYA 4LBKA 1LJ7A 2PELA 2XOAA 1Q8SA 2Z49A 3BTAA 4LO1C 1PZ7A 5GZFA 1CVSA 4FGFA 1JN2P 1JW6A 3ZXDA 3WDWA 3WCSA 1WW7A 1SCRA 1D2SA 2VY0A 4GP0A 5JOZA 1FATA 3P6JA 1GNZA 4FQZA 4M3CE 4QBVA 4FPFA 3OBRA 4D69A 3RTJB 4LO1A 1BFCA 4BMBA 3I4IA 2DTWA 3N36A 1V6UA 3F1RA 4JKQA 3BRGC 3RMXA 2EALA 2RG9B 4FPGA 1PZZA 2XG3A 3Q9OA 3N0KA 3VT1A 4LBJA 1N4KA 1W6PA 1CJPA 1Z2VA 4FVVA 4DCKC 1HKDA 2VW0A 4QD2C 5B2HA 2P2KA 4HANA 4YZ4A 5E88A 5FNXA 1LESA 1ISVA 2D23A 1MS4A 1WLDA 2JD4A 4ZFWB 3TB0A 4HR6C 2GN3A 3UD7A 1Q56A 2GMEA 2ZHLA 1HWNB 1QQLA 3DGTA 4YFWA 4H04A 3AP9A 4XXAA 3WO4A 5JOYA 1V6XA 2F2FC 1UN1A 3O3QA 1C4RA 3T1MA 3RTIB 3ZSLA 3O5SA 3ZXEA 4Y1VA 3POKA 3M2MA 4K21A 1HKNA 2ERFA 2BQPA 2CYFA 1BYHA 2BFHA 2DS0A 1R8OA 4LBMA 1MZ5A 3CA4A 2HW9A 1FWVA 4QKRA 2KLLA 2F2FA 1YF8B 4XYXA 4YW5A 1V6VA 2VSEA 2YROA 1AX0A 1QOOA 4D0TA 3NV3A 3Q7WA 1J0SA 3M3QA 2VLCA 5KXBA 4J23B 3FJCA 2DRZA 2DREA 4AN7B 5DG1A 4FPJA 1MACA 3PVNA 4I4SA 3H6QA 1UZYA 5BXRA 1GLHA 1G9BA 3FLPA 1N1SA 4IQPA 2R0FA 3KQRA 5SV8A 4P0KA 1SLIA 2ET2A 1AF9A 1QU0A 1DFCA 1BFBA 2GNDA 3PVOA 4AVTA 5JOXA 2JE7A 2D20A 1UX6A 4FPYA 1V6IA 3FGMA 1FWUA 3BRDA 4ISQA 4YM2A 1LU1A 1AJOA 3M3CA 2DVAA 1WW6A 1GZWB 1V6KA 2ZGSA 5F8YA 1K5UA 2X2SA 2DYCA 2NTDA 1PZ9A 1SLLA 2WLQA 4Q1RA 2C5DA 1RY7A 3AZVA 3IPVB 5F9TA 1BFFA 4OWJA 4XDQA 5IK4A 1LOAA 1KITA 3VEQA 4CZSA 1F31A 2ZZJA 4X3AA 1C57A 3FJIA 1GICA 2R49A 4R6UB 3SH3A 3P53A 1OFSA 1Y7BA 2ZGNA 1LEMA 1MR5A 2DRYA 1I1BA 5IK8A 3QLQA 2MC2A 4WZFA 1CESA 2D43A 1G86A 1N1VA 3N7MA 3BAVA 4IY8A 2A7AA 2C9AA 3ZXLA 1ISXA 4RL7A 2ZGQA 4FPOB 2JECA 1AVWB 5D63A 4GWMA 3BAQA 1BJQA 1SLAA 5BXTA 4LO0C 2JJ6A 3A0NA 4XBLA 3SITA 5EG6C 3WDVA 1QXMA 1JQZA 4HA2A 2Y9WC 3WG1A 5EYYA 1WCSA 5T5JA 5T5LA 1WBCA 1UPSA 2UUSA 3FJDA 5DXDA 4EEEB 1SLCA 1CPMA 4LO0A 5CAZA 3D6EA 3O49A 1ONKB 2ZGRA 2KM2A 2EXJA 4ZOTA 6I1BA 3PUBA 2QN4A 3VT0A 4FOYA 4CJMA 1II4A 1S0BA 5GLWA 1N47A 3VUOA 4GOYA 5DSSB 3B69A 1OKQA 1IOAA 4YZ3A 1ONAA 1W6MB 3RSJA 5CB7A 4PC4A 2A3WA 5DZUA 4OEGA 1FX5A 2W08A 2CTVA 1JUIA 1AVAC 2FFVA 1XZZA 3B9CA 1XQNA 4P14A 1G9AA 2YZ4A 1SFYA 3JU9A 1WBLA 3RQ0A 1DQGA 2A3YA 4AN6A 2QYIB 2A6VA 2E7QA 3MALA 1CQ9A 1DHKB 3OJMA 4D8HA 4L4HA 5EXOA 1N3QA 4LBQB 3E8LC 3H6SE 4XXPA 1MZ6A 2ZMKA 5FREA 2DVFA 1E0OA 1H9PA 3WDUA 2HWMA 1GV9A 2FDBM 1FYUA 2AUYA 4P9XA 2FHRA 1GBGA 2HYKA 1JT4A 3AKFA 4FPHA 1RMLA 2DVBA 1LECA 3WCRA 2ZABA 4IZEA 5GJ6A 3A0KA 2D3RA 31BIA 1JY0A 2ENRA 2AQZA 3LCPA 1GZWA 1IRPA 4ZXKA 1SLTA 4I4UA 3WDYA 4HL0A 2R16A 3SNMA 3WINC 5BXPA 21BIA 2VXTI 4YZ1A 2Q9XA 4LO8B 3M3OA 1AX1A 5GLVA 2LALA 3WG4A 1FNYA 1ISWA 3IPVA 3WVJA 2UU8A 4I6IA 4Z9WB 2NP0A 2MLLB 4LO2C 1O4ZA 2E51A 1S0FA 1IHKA 3WINA 1JHNA 4LBOA 3T8SA 2DUQA 3MW3A 2EF6A 1TOOA 4M00A 1VIWB 1LGCA 4YM0A 1IRAX 4GKYA 1DLLA 4LO2A 4LO3C 5GZDA 4CRQA 3BAUA 1RINA 2G4IA 2P39A 3AP5A 5JMCA 3N7JA 3VKLA 3VKNA 1MD6A 2Y9XE 3FUQA 1UL9A 2ZMNA 4LO3A 1DQOA 3AZXA 4QKSA 3AZZA 1LEDA 3MW2A 3ZPYA 5E8AA 1DZDA 3IM7A 5JVVA 4FPKA 4XILA 4I4YA 2ZBJA 1QQKA 4FPEA 3A22A 3N7LA 2L5XA 1LTEA 3FJHA 2D6OX 3O5WB 4OEEA 2OVUA 4YG6A 1PWAA 3HMYA 3AYCA 3BRFA 5EWSA 1XYFA 3O4OA 1YI7A 4G6MA 4JP0A 5GAQA 3B9UA 3ZSJA 1ULEA 1YRZA 1KQRA 1ILR1 4WVVA 5GZGA 3NBDA 2D1ZA 2P34A 2GALA 1T9FA 1MS3A 1AXZA 4BPZA 4GAFA 2NMNA 1A3KA 2B7YA 4Q1PA 2FFUA 4U36A 2ZGLA 4MYEA 4DS0A 3O0VA 2NVHA 2WJSA 3NBEA 8I1BA 1W6MA 1LENA 2DU1A 3V65A 1GZCA 5DUYA 1PUMB 4XKIA 4AYUA 1AXYA 4C1XA 2VXRA 3JRRA 1KDKA 1RITA 3AKHA 2A5ZA 4I30A 4WV8A 4PF5A 3UK9A 3AJ6A 5IT6A 2VU9A 4QC4A 5HCAA 2DTYA 5JDBA 3D7WB 4LBQA 1CONA 4IYBA 2OUHA 1KJRA 2WSVA 4ENDA 2D3PA 2YUGA 1YIFA 2ZA9A 1JT3A 3FJJA 4RA0A 4YGBA 2K43A 1GSLA 2CWSA 2R1BA 3I2XA 3ASIA 3RRDA 3LTQA 4KBBA 1V6WA 4EFPA 7I1BA 2JE9A 3AP4A 4YW2A 1DBNA 3VWCA 2EXIA 4ZGRB 5GZCA 3OJBA 4I1EA 3AX4A 4EFRA 1HWPB 3ILNA 2P3IA 5I1BA 1AFCA 3H6RB 2HZ9A 3AZWA 4NOTA 3VKOA 1LU2A 1ITBA 1I3HA 5GZEA 4XJAA 2KI4A 3CAHA 4JAWA 3FUOA 2Y9GA 1Q8OA 4DQAA 2AR6A 4W65A 3B3QE 1M16A 4BMEA 1SBFA 1VAMA 5IK7A 1QNWA 5E24E 2H0BA 5T55A 3IIRA 1HCDA 4Y22B 3AXDA 3QYDA 2ZQNA 3MEPA 3FFZA 4PBOA 3Q7YA 3WDXA 2K8RA 4JKXB 3POYA 1JXNA 1WBFA 3NBCA 2D7RA 1HLCA 4BOWA 3V0BB 1TIEA 4M3CB 1LOEA 2KKIA 4I4RA 1DZCA 3ZYRA 3UJ4A 2DV9A 1W6QB 1C1FA 5DUUA 3PHZA 1UZZA 5E89A 1BLAA 3HBWA 2ZGMA 1FGAA 5D62A 2FGFA 1IS4A 4A7ZA 3AXEA 3HALA 2ZGUA 3ZXFA 1G9CA 3I29B 4R9DA 1VCLA 4KEIA 1OQ1A 1ENQA 1QOTA 4UW6A 4AWDA 4K20A 3BOPA 2E6VA 4P0JA 1WW4A 2KI6B 3WMUA 2K4AB 3AK0A 1IT0A 1PZ8A 1EYLA 1EVTA 5T5PA 3A07A 4AGVA 2VSAA 3T1LA 2WBCA 3A21A 4AVSA 2P3KA 3VSZA 3KM5A 3WHTA 4I3NA 3O0XA 1ZM1A 2P3JA 1LGBA 5GALA 3VV1A 1WBAA 4Y20A 4M3CF 2AXMA 4I4PA 4KEKA 4I37A 1W0PA 4TZDA 1G7YA 4DFSA 1LOCA 2GO2A 2NM1A 1JT5A 3OJ2A 3WV6A 4BQ1A 3FJ8A 3S8KA 3SH4A 2CY6A 2UWBA 3D5OA 2Q3NB 3I2AA 1NLSA 1TP0A 1YXWA 3CQAA 1HDKA 2ZKNA 1BXHA 2E7TA 2PHTA 3Q7XA 1ABRB 2W68A 4A7KA 4Q91A 2UURA 1QF3A 2R1DA 4Y1UA 2R0HA 1JTCA 5T52A 1LOBA 4IZXA 3KMVA 3BA5A 1S0JA 5GLTA 3H6RA 1LHUA 4Q26A 3AJ5A 3TC2A 1AJKA 1MS5A 3W59A 4Q2FA 1S0IA 1V00A 4G9NA 1X50A 3CA5A 3F62B 4P9WA 3FBYA 4R9BA 4JCKA 4I4VA 2BEBA 3U4XA 1Z0HA 1R8NA 3HN1A 4XHBA 3ENRA 5EHAA 1T4QA 3QR5A 3V79C 1DZQA 4BLJA 3IM6A 4FQ4A 3ZVXA 3AZYA 1KNMA 2ZGTA 3INAA 1LCLA 2ES3A 1DQ5A 4OUJA 2GNMA 2RQ9A 1Z78A 2AH2A 1HQWA 4XJZA 4Y22A 3ILRA 1SACA 1QGLA 4YM1A 1M2TB 2KH2A 1JOJA 3NV4A 3AH1A 1LOFC 3FJKA 4X39A 3QCWA 4H55A 4LO7B 3V0BA 1ISZA 3CA3A 1HWOB 4EB2B 2DVDA 4M3CA 4JRAA 3M3EA 1S1AA 1DIWA 2IHOA 1LULA 5HCBA 1LOFA 2ZHMA 1W6QA 1GGPB 3BAGA 3FLTA 1MVQA 3FJFA 3BA7A 3FJBA 4DRRA 1W3AA 5FZUA 4M01A 2Z48A 1IJTA 2A70A 3WOGA 3OBTA 5JLVA 3CRHA 1BFGA 2PHXA 2WKKA 3AH4A 4OZXA 1HCEA 1YTOA 4XFSA 1QDCA 4ASMB 5BXSA 3R4SA 2P23A 4UW5A 1SZ6B 1WUVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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