2D43A

Crystal structure of arabinofuranosidase complexed with arabinotriose
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMANNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The family 42 carbohydrate-binding module of family 54 alpha-L-arabinofuranosidase specifically binds the arabinofuranose side chain of hemicellulose
pubmed doi rcsb
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
total genus 153
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2005-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2d43A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2d43A02
3SH5A 1BASA 3BAOA 1HLCA 4ATEA 2G4IA 3CRGA 2D6PA 2ZHKA 3NV2A 2ZGRA 1SZ6B 1Q1UA 1W3AA 4UW4A 2E7QA 5IK7A 2F2FC 1WLWA 3WDYA 1AFCA 2FMDA 1BFFA 5BXTA 1CE7B 5E8AA 2JKBA 3O0XA 2MLLB 3ZXFA 2A6VA 1N1TA 4D0TA 3GALA 1WBAA 4OW4A 2D3SA 4R9AA 3A22A 3OJVA 1V6WA 3ZXJA 3AZWA 3IN9A 4GOYA 1APNA 5IK8A 5F90A 3IPVB 1PC8B 1VIWB 1M2TB 2OUHA 3OPZA 4R9CA 2Q9XA 3O4AA 2EXIA 3UJ0A 1DYPA 1MS5A 4I30A 1FN0A 3UD8A 1TWEA 2GNDA 2R0FA 4GAIA 1IS3A 1KRIA 1GZ9A 4JKXB 1XZZA 4IY8A 2WSVA 1RG8A 4Q2FA 1H30A 1DZQA 2K8RA 3I4IA 1D0HA 4U2AA 3AH1A 3IAGC 1URXA 2IWTB 1Z0HA 2CWMA 2VSEA 2E6VA 5D61A 3P53A 1W6PA 1DYKA 4EEEB 4H04A 5SV8A 1HCEA 4M3CB 3ZSKA 1WW7A 3RMYA 3KM5A 1GGPB 1MD6A 4FPJA 2ET2A 4G9MA 1LCLA 3OJMA 3AP5A 3VWCA 1AX0A 1KDMA 1WBCA 2GALA 1PZ7A 5F8WA 1YF8B 2A71A 2E4MA 5H9QA 4IY9A 5EG6C 3KQRA 1YI7A 1BKZA 1DQ0A 1R8OA 1KJRA 1SR4C 2ZGSA 2AAIB 1HIBA 5AVAA 5GZCA 1FYUA 2WBCA 1CJPA 1HKDA 1ENQA 3P6IA 4JKQA 4EFPA 1MS0A 2M49A 2FHRA 4BOWA 3OBRA 1LHNA 3BRFA 1DHKB 1QDCA 1OQ1A 2VLCA 5H9RA 3CA6A 5T54A 2ZR1B 2HYKA 4AN7B 1MS9A 1S0LA 4ZFYB 1MZ5A 3WCSA 1TIEA 4YM1A 1YRZA 3BIWE 3HBWA 4GWNA 3BADA 2GNTA 3FUOA 3ENRA 1GZWA 4YG0A 4AVSA 3R4SA 1QQLA 1ONAA 2AREA 1V00A 4Q8KA 3WO4A 4FPYA 3USUA 3W9TA 1N47A 4LBJA 3BOPA 4HR6C 1AZDA 4EFQA 4FOYA 3M3QA 1IHKA 2KI6B 5DUXA 4Y1YA 3D7WB 3SLIA 4ZBVB 5GALA 2JDZA 2DVFA 3N36A 1C1LA 1K5VA 4PC4A 1W6NA 3CNAA 2CY6A 1LOAA 4H55A 1DFQA 1U0AA 3UJQA 4HJJA 3MW2A 1HDKA 4QBVA 4XKIA 2ZKNA 2KKIA 3ILRA 1IS5A 3POYA 5HCFA 3FUQA 5EYXA 2HWAA 1CONA 1Z4SA 1EPWA 1VAVA 2D6MA 3WV6A 3VT2A 4ENDA 3IM5A 1JHNA 1LGNA 4P9XA 4IZEA 1W3GA 4XMAA 1JW6A 5GM0A 4A7ZA 3CA3A 3WINC 3S8KA 2NVHA 3WG2A 1V6MA 2PHWA 4YZ5A 1MVQA 3PG0A 1NLSA 4ZLBB 2ZGPA 1WUVA 1QOSA 3MEPA 3IM6A 4YM3A 1YXWA 4JAWA 4LBQB 1QKQA 1WBFA 4LO2C 3WHTA 4I1EA 2A3WA 5JMCA 3A0NA 4XXAA 3B9UA 2R9KB 1II4A 4YZ4A 2DU0A 2RG9B 1EV2A 4Q1RA 4CTEA 5GLTA 5FRAA 5DUVA 4Y1UA 2CL2A 5EC5A 4LBQD 2QYIB 4JP0A 5GZGA 3F62B 3ZYPA 1AVWB 1WLCA 1ULDA 2H0BA 1JLYA 4XTPA 1RIRA 4FP2A 2NN8A 2Y9XE 3E8LC 1GANA 3ZPYA 3PMEA 4BQ1A 2E4MC 1LEDA 1T4QA 1XQNA 5IK5A 2ZAAA 1B09A 1IT0A 2R0HA 1QOOA 1FGAA 3WHUA 5FZUA 3ILNA 3AKIA 1X50A 4YGCA 3FJIA 5H9PA 5CB7A 4M00A 5FNXA 2FGFA 2ZA9A 5GLUA 1WW6A 5F8YA 4LO3A 1ZM1A 1DJSB 1RMLA 1O4YA 1QQKA 1O4ZA 3N3HA 1BFGA 3AZYA 1CESA 3MPPG 4DENA 2ZGOA 3NBEA 2ZMNA 4XBLA 1XHBA 1FMMS 4IONA 5BOWA 2AXMA 2HWMA 2YXSA 1PWAA 1IRAX 3JUUA 1MS1A 4SLIA 3O44A 3M2MA 4Q9GA 3WG4A 3ZSMA 1BFCA 3Q7WA 3ZXLA 1C57A 1ENRA 3AP9A 2VXTI 5L73A 4XXPA 3BTAA 2Q3NB 3CAHA 2DWRA 4FVVA 2E7TA 4FGFA 5DVHA 4Q27A 3OJ2A 4RL7A 5BXRA 3K1XA 2DVBA 3O0WA 3LCPA 2NMNA 3INAA 3AXDA 2W39A 1L2HA 3QCWA 4KEJA 4UW6A 1MVEA 4I4XA 1LHVA 2A70A 3VT1A 4TYSA 4FPFA 5DZUA 1GYKA 1IOAA 2ZMLA 4KEKA 1G9BA 9ILBA 1RINA 2YROA 3FGMA 2PELA 4J2SA 1DIWA 4OWKA 1Q8PA 5KXDA 4F34A 5CAZA 3WOGA 2GMEA 1WD4A 3B3QE 4Q26A 4OZXA 3V0BA 4I96A 5CA6A 1JY0A 2X2SA 2ZBJA 1HQLA 3AXEA 5DUUA 3VV1A 1N3QA 1FNYA 3O5WB 5IT6A 1JT5A 4TLPA 2BEBA 4Y26A 2RSTA 4P6AA 2ZGNA 1Y7BA 1I1BA 1DQ1A 1GZWB 2R1DA 4ZFWB 1XG6A 3BAVA 2BFHA 1DLLA 5DSSB 2ZACA 1FX5A 1N3OA 1Q03A 2IHOA 8I1BA 1S0CA 1DQGA 1ISZA 3USUB 1W6MA 1TEIA 2JE9A 4WZFA 3POKA 1JT7A 3CA5A 3AKFA 1ILR1 1AXKA 4FP3A 2XG3A 1SBEA 1AVAC 5KXCA 1BLAA 3MALA 3ZC9A 1FNZA 2JE7A 4Y1XA 2CYFA 1W6NB 3OGFA 3M3CA 1G8WA 2AQZA 3LTQA 2UWCA 2KLLA 1YBIA 1KDKA 4IHZA 2YY1A 2NZ9A 4XJZA 2D22A 4ITCA 3AYEA 4M3CF 2VSAA 2D6KA 4J2KA 4H9WA 2DVAA 2ZGTA 1JT4A 4DQAA 2DTWA 2ZQNA 3WINA 1QU0A 3WMVA 2UURA 3WO2A 4LBKA 2P34A 3FJ9A 1D2SA 6I1BA 4YOLA 2DURA 1IILA 1XYFA 3MW4A 2A3YA 1AXMA 3ZX7A 4LO2A 3ILAA 4LO3C 2NM1A 2JJ6A 3FJEA 1OKQA 1MZ6A 4P14A 1IJTA 2UWAA 2DRZA 4YW2A 2JD4A 3WZ1A 3AJ5A 4KEIA 4G9NA 3IKWA 4K1YA 2P39A 1OQLB 4I4VA 4I6IA 3FJAA 3PHZA 3UDAA 3A4UA 4I3NA 4FPHA 1UZZA 4QD2C 2ZZJA 4YZ1A 3CQAA 4I4PA 3DGTA 2X2TA 4I4OA 4QKSA 1R1ZA 2OUJA 2ZGKA 3OJBA 2EALA 4Y1VA 3NV1A 1LOFA 2GDFA 2AGSA 4Y20B 2DTYA 3IIRA 3NV3A 3D4KA 2DV9A 1LECA 4K1ZA 3NBCA 1W0PA 1LTEA 2WKKA 1M16A 4I4QA 1GZCA 1UX6A 2D6LX 3ZXKA 3OYWB 2DYCA 3T1LA 2ES3A 2GN7A 4OEGA 2YZ4A 2FFUA 2RHPA 4YW1A 1S1AA 1AVXB 4I4SA 2P23A 3QLQA 1A3KA 3CRIA 1GSLA 4AVTA 5JVVA 3O4DA 2C9AA 1YYNA 3O4OA 4AGRA 4K20A 2MIBA 4LO0A 1HCDA 1LEMA 4XE9A 1SLCA 3M3EA 3VUOA 2WT2A 4TZDA 4JRAA 2I1BA 1SBDA 3HOMA 4R9BA 3OY8A 3KMVA 2ERFA 1N1VA 4ISRA 2V73A 2ZGLA 3H0OA 2J3PA 2EXHA 2VXRA 3BAUA 5GLWA 3IM0A 2A7AA 4GXLA 1JQZA 4KBBA 1V6UA 4LBNA 3Q7XA 4DRVA 3CA1A 2D20A 3SNMA 3FJFA 1VAMA 3VT0A 2E51A 1EVTA 2GO2A 3SH4A 4R6UB 4QD2B 4A7YA 1ENSA 4D8HA 5GLZA 3FLTA 4GAFA 5E88A 5GLVA 2VW2A 4L4HA 5H9SA 5DZGA 3FJKA 1VALA 4IQPA 4BMEA 2D3PA 2PHRA 3APBA 2NYYA 5KXBA 3F1RA 5GJ6A 4JPZA 1HKNA 2SLIA 1J0SA 1PUUB 4MYEA 4QKRA 1TTUA 1JT3A 1LHUA 1JYCA 4XTMA 3QR5A 4GWMA 2A6YA 1W6QA 4AGGA 1RY7A 3HSMA 4XBNA 1G82A 3ZSLA 1QOTA 4DEPA 2D6NA 1MACA 1F5FA 2AR6A 3N7KA 1JXNA 3VKMA 3FLPA 2Y9GA 4BMBA 3NWKA 5FNWA 3BRDA 3ZSJA 2KH2A 4EB2B 4GKXA 4U36A 4AYUA 4X39A 2PHFA 3V0AA 3ZC8A 2UWBA 3A07A 1DQ4A 3H6RB 3V0BB 4W65A 1K5UA 3WDUA 1G9CA 5FZYA 2D7FA 1BARA 2ZABA 1V6NA 4PCRA 1FATA 3VKFC 4J2XA 2WSUA 1S0IA 5KXEA 2PHTA 5DG2A 4II0A 1QGLA 3CU1B 4XFTA 1GNHA 4PBPA 1G9FA 1LESA 4Y20A 2C5DA 1DQ2A 2EXJA 5BQUA 3POWA 3UL2A 4XDQA 1LU2A 4EKXB 1FWVA 4OWLA 4CZSA 3FFZA 4I4YA 1LOFC 1UAIA 2KM2A 2UU8A 3A21A 1MC9A 3OYWA 3IMNA 4G6MA 2ZHNA 1LOCA 1CIWA 5EXOA 1W6MB 4LO1A 1NXD1 1S0GA 3N35A 2DUQA 1V6OA 2P37A 3AFKA 4XIOA 4XFSA 4Y24A 1SCSA 5LK5A 1OFSA 3M1HA 4XJ9A 5BP5A 3VKLA 3AYDA 4XJ8A 2Q5TA 1ISWA 4JQ0A 4GOVA 1KNMA 1JBCA 3W58A 1FMZA 3UJ4A 1UMZA 2DS0A 21BIA 3H6SE 1AX1A 5IK4A 2P3JA 3B01A 3RMXA 1F31A 4WV8A 2D1ZA 4XHBA 4LO0C 1S0JA 3HR9A 3M3OA 1WW5A 4P0KA 5T5PA 4FPLA 4YM0A 5HCAA 5JDBA 4YW3A 2VU9A 3WO3A 2D43A 4ZKTB 1HWOB 1W6OA 1SLAA 5I1BA 4M01A 3BAGA 1BYHA 1CPMA 2GMMA 4J2YA 3RS6A 3AH2A 2YUGA 4XJUA 4I4RA 3Q7YA 3ZXGA 3JU9A 2Z49A 4LBLA 2D7RA 1PZZA 4XILA 1S0BA 1Q04A 2JECA 3CA4A 2DREA 1C4RA 3FJBA 5DXDA 4I1BA 1AXZA 5F8SA 3AX4A 3UK9A 4FPGA 5JOXA 5JOZA 2VY0A 1LHOA 4YFZA 1KJLA 4YG3A 3B69A 2D24A 3I29B 3WG3A 4BLIA 5GZDA 3BAHA 2QN4A 3SNVA 2DUPA 4YLZA 3O3QA 4A7KA 4DFSA 4YGEA 1Q8SA 4OWJA 1PZ9A 2UUSA 4GKYA 5T55A 1BZWA 4BLJA 1DBNA 3TAYA 3WMUA 4FOVA 3H6RA 4NOTA 1S0DA 1YTOA 1SLBA 3LSDA 1BQPA 4ATFA 4JCKA 7I1BA 3AP4A 4FPCA 4YM2A 1S0FA 5D63A 3OY8B 3AP6A 3T1MA 3ATGA 4Q1PA 3T2TA 2A75A 1SLIA 3T8SA 4PF5A 3WUDA 2A3XA 1WW4A 4XYXA 4USOA 1DZDA 5T5OA 1GICA 3PVEA 4Q8LA 1QDOA 3BA4A 2W68A 1MS4A 1YIFA 5BQUC 2EAKA 4ISQA 1GV9A 3O4BA 3EF2A 3BODA 3W59A 4UW3A 4FPOB 2WT0A 2ARXA 4FOWA 1GBGA 2Z42A 4LO1C 3AKGA 1ITBA 4WVWA 1PUMB 1IKPA 2NP0A 1AVUA 1FQ9A 3AZZA 3VKOA 4RA0A 1S0EA 5BP5C 3ZXDA 1DZCA 1VLNA 3AJZA 1Q8VA 2E53A 4XHXA 2ZMKA 1LOEA 4FQZA 2ZQOA 1V6KA 1EYLA 2WLQA 4FPEA 4QO3A 3D6EA 3LLPA 1W6QB 1N3PA 4GP0A 1W0OA 5GZEA 3NBDA 1BXHA 1ABRB 1IKQA 2V5YA 3SH3A 1LODA 4YZ3A 1AJKA 4Y22A 3V64A 3H6QA 3S8JA 2NTDA 2GN3A 2CTVA 2A6WA 2VUAA 3RG0A 3WDTA 1NZKA 3P6JA 3HMYA 1BLDA 4Q9PA 3V0AB 2ENRA 3LSEA 1Z2VA 3O4CA 2DU1A 2R1BA 1Q56A 3CRHA 5DUYA 1UN1A 1IS4A 1LOBA 3UD9A 4K21A 4GP3A 2D3RA 1WBLA 2EXKA 1BA7A 4YGBA 3JUTA 3BB2A 1ZA4A 1HWMB 5G00A 3A0KA 3N7MA 3RRDA 3BAQA 1LU1A 1C1FA 2CWSA 3VKNA 3RQ0A 4LO8B 2MC2A 4XMIA 2ZHMA 5BXPA 3I8TA 2A6ZA 1RZOB 1CQ9A 2GZBA 4D69A 2EIGA 2PHXA 1UL9A 4DRRA 5IUQA 4QALA 3BRGC 1HQWA 3AYCA 2KI4A 1R8NA 3WUCA 3R05A 3UJOA 1ISYA 1ISXA 2YMZA 1BFBA 2P3IA 3WDVA 5T5JA 2RQ9A 2K4AB 1N1SA 5JLVA 4QBCA 3FLRA 4XJAA 3VEQA 2L5XA 4L8QA 4G6JA 2DRYA 4I7IA 1I3HA 3B9CA 3HALA 3FJCA 5BVPI 3QYDA 3A23A 3C9ZA 4IYBA 1UZYA 1CVNA 3WLUA 4Q91A 4ZFUB 1WCSA 3B00A 1AXYA 3N7JA 4R9DA 1NUNA 1MS3A 4PBOA 1FV3A 1ULGA 2OW4A 1Z78A 1H9PA 1IRPA 3PVOA 1G7YA 2DUOA 2HW9A 3AYAA 1FAYA 2LIQA 4LBOA 1LGCA 1MR5A 2I2SA 5EHAA 1T9FA 4OEFA 1DGLA 4Y1ZA 1W6OB 3SISA 4DCKC 4LO7C 5F9TA 4X3AA 2AYHA 3ASIA 4AGVA 1ISVA 3I2XA 1A78A 4AVVA 2A5ZA 1AX2A 1FWUA 4P9WA 4YG6A 3AZVA 4DS0A 4ZOTA 2BQPA 3PUBA 4JC1A 4XFUA 3JRRA 5CNAA 4YFWA 3RTJB 2D6OX 2WQZC 2ZGMA 2R49A 1CVSA 1E0OA 5T50A 1TFMB 3NJ5A 2BEAA 2VH9A 4FQ4A 2LIEA 4BM8A 1QNYA 2VW1A 4ZXKA 1G86A 4YW4A 2ARBA 1ULFA 2GNMA 4FOQA 2GNBA 3VSZA 1BJQA 1AVBA 3POSA 2A6XA 2K43A 4UW5A 3FJHA 2XOAA 3ZYRA 5E24E 5T5LA 5T52A 1ULEA 2NMOA 3IPVA 3AZXA 1LENA 3ZXEA 1V6XA 4XJWA 5GZFA 2W08A 2HZ9A 3N7LA 1SLTA 1QNWA 31BIA 4USPA 2YV8A 3NBNA 2WNEA 2Z48A 4C1WA 2FFVA 3FJJA 3GNEA 4P0LA 3IM7A 3I2AA 3BX1C 5FREA 1CN1A 2VW0A 1RITA 1G9AA 3SITA 5BXSA 2OVUA 3ZVXA 2AH2A 1LOGA 3UD7A 2WJSA 4HL0A 3AJ6A 1SFYA 2GMPA 3O0VA 3DUIA 1WD3A 4XIKA 1IOBA 3OGGA 4XZPA 2WRYA 3Q9OA 4M3CE 4I0YA 4GA9A 1DQOA 1SCRA 3MW3A 4LO7B 3O12A 4M3CA 2EF6A 4I8MA 1TWMA 3WDXA 1Q8OA 1FV2A 1AF9A 2F8XC 5HPZA 1G9DA 1JN2P 4F83A 2DVGA 4ZGRB 5CBLA 3RSJA 1W3FA 5D62A 4FPKA 2AUYA 3L2YA 2XB6C 2F2FA 4X37A 4DPNA 1JTCA 2D23A 3WDWA 2SBAA 1SBFA 1YO8A 3O49A 4AN6A 5DZFA 1CPNA 1V6JA 4HANA 3AK0A 1A8DA 2ESUA 1TOOA 3D5OA 4D0ZA 5JOWA 4HA2A 1H9WA 1MS8A 3WNXA 2FDBM 2ZGQA 4IZXA 4ZA3B 1N1YA 1KITA 3AP7A 5E89A 1SACA 1UKGA 4BPZA 3BA7A 4I2SA 3PJQA 4XOGA 3VSFA 4X38A 4XBQA 5DUWA 2WT1A 5F5QA 1SLLA 4AWDA 2B7YA 1QMJA 2P2KA 3WCRA 1TP0A 3N0KA 4Y22B 1N4KA 4CJMA 1KQRA 3BA5A 4YGDA 4PQ9A 2LTNA 1GLHA 2AENA 1GKBA 1GNZA 2R16A 4KC3A 4I37A 4Z9WB 3FJDA 5HCBA 4GALA 4CRQA 1LJ7A 1Q8QA 4YW5A 1JUIA 1DFCA 1AJOA 4C1XA 3NV4A 1LHWA 2Y9WC 5FZZA 3HN1A 1DQ5A 5JOYA 3AH4A 1LGBA 3AKHA 4L4IA 3V65A 2CNAA 2P3KA 4G1RA 3V79C 2Y9FA 1CR7A 1W6PB 1ULCA 1IS6A 1LULA 3R4UA 1HWPB 2FO1A 2ZGUA 4LBMA 2ERMA 3O5SA 3RTIB 3TC2A 4WBCA 1UPSA 3TB0A 3C2UA 3CA0A 4P9YA 4EFRA 3WVJA 2D44A 1SR4A 2W52A 1WLDA 3OBTA 3FBYA 2TEPA 1P63A 2LALA 1I1EA 4I4UA 4YZ2A 5EYYA 1F9KA 3ILFA 3WG1A 4Z8BA 1VCLA 2PHUA 2ZHLA 5DZEA 3WA1A 4J23B 4LBQA 41BIA 4OEEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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