2D43A

Crystal structure of arabinofuranosidase complexed with arabinotriose
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMANNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The family 42 carbohydrate-binding module of family 54 alpha-L-arabinofuranosidase specifically binds the arabinofuranose side chain of hemicellulose
pubmed doi rcsb
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
total genus 153
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2005-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2d43A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2d43A02
4OUJA 1ENQA 1UKGA 2LTNA 2RG9B 3POSA 2ZGOA 4FPYA 4L4HA 1CPMA 2BFHA 2R16A 1GV9A 1TWMA 1H9WA 1W6QA 1V6LA 3N7JA 1SLTA 5F9TA 1ULEA 2MLLB 2YUGA 4FGFA 5GLVA 5GJ6A 1SZ6B 5FZZA 1RG8A 1BA7A 1SLLA 1LJ7A 4FOWA 1YTOA 4QD2B 3WDVA 1YIFA 1LOBA 1AVAC 4XHBA 3FJ8A 4K21A 5GLTA 3AXEA 2IWTB 3FJEA 1W6MB 2AYHA 6I1BA 4K1YA 1W3FA 1WBAA 1H9PA 2CYFA 1FN0A 1W3AA 2K43A 1D0HA 3E8LC 2GO2A 3C2UA 2OVUA 3FJKA 4G9MA 1LHVA 3FUOA 4PC4A 3PVOA 5GLWA 4ASMB 3IN9A 4I4PA 2CY6A 2R49A 1IRAX 1VAVA 3ZX7A 4FQZA 3AYCA 5EWSA 3WO4A 3IMNA 4M3CB 2Z49A 1DQ1A 1AVXB 2DVAA 4OWJA 1GKBA 1EV2A 3USUB 4CJMA 1GZWB 3T2TA 1MZ5A 1BFCA 2D6KA 3Q7YA 1Z4SA 2JECA 5D63A 4QD2C 1ILR1 4LBQB 1SCSA 2Y9GA 1ULCA 1KITA 2WNEA 3WDWA 5DUYA 4FPEA 3HOMA 4XXAA 1IKPA 3B3QE 2PHTA 4JC1A 3HMYA 3AYDA 4XIOA 2DU1A 5I1BA 5DUUA 3UD7A 3WG3A 4XBLA 3PJQA 3W9TA 2OUJA 3UDAA 2R9KB 1AXMA 4HA2A 2CL2A 5T5OA 3FJ9A 2UUSA 3CA5A 3OGGA 4BOWA 3O4AA 1DFCA 5LK5A 1R8NA 5GZFA 5BXPA 2ZZJA 3AKGA 1N1TA 2ARBA 3WHTA 5JMCA 3OGFA 3R4SA 3BAOA 3ZC9A 5F90A 2X2SA 3CA4A 4XOGA 3CRIA 1Q1UA 3VKLA 1YO8A 4D69A 1S0LA 1W6NA 4LO0A 3UJ4A 4P0JA 1BJQA 4R9DA 4R9AA 3ZXJA 1Q8SA 4I0YA 2GMPA 2CWSA 1GYKA 3ZXFA 4XMAA 4U2AA 4GOYA 3BADA 1YBIA 3S8KA 2ZGPA 3A21A 3ZXKA 3VUOA 2GNBA 1DJSB 1K5VA 3C9ZA 3I2AA 4LO7B 2VXTI 2P37A 4Y1UA 3M1HA 1DQ5A 3FJCA 1IS3A 1AJOA 4GALA 2AH2A 2W39A 4TYSA 1TOOA 2DUOA 3UL2A 2F2FC 1S0IA 1V00A 1Z2VA 1YXWA 2PELA 2VLCA 4LO2C 2VW0A 4X37A 1UZYA 2AENA 1LOCA 2F2FA 3VKNA 2KKIA 3H6RA 4USPA 1HDKA 4I6IA 1QQLA 1A3KA 4FOYA 4ISQA 1N1YA 3AZZA 4CRQA 1X50A 2EF6A 2P23A 1G9DA 3BRGC 2R0HA 1LGCA 4L4IA 2WSUA 1DYPA 4FPFA 4Y20B 3CA6A 5BQUC 4IONA 1N1SA 5FNXA 4DCKC 4FPOB 3AP5A 4ZLBB 3V64A 3OYWB 4J23B 2Q9XA 3NV3A 4AGVA 1LESA 4AVSA 4XJ8A 3CA3A 2BQPA 4FQ4A 1QGLA 4Q8KA 1FV3A 4I4RA 3LTQA 3V0AB 1MVQA 3WNXA 2R1DA 2UU8A 4Y1ZA 4JQ0A 3Q7WA 1J1TA 1JXNA 1AXZA 4LBNA 4K1ZA 1WLCA 3BAUA 4LO7C 4ZKTB 1LECA 1HCDA 1K5UA 3O4DA 4CTEA 4GXLA 4D8HA 1GZ9A 1V6JA 1UAIA 4KC3A 1W6PB 1FV2A 2ZAAA 4OEFA 3FFZA 1DLLA 4IY8A 2SBAA 3WDUA 1RY7A 4IYBA 3O0VA 3WG4A 4UW3A 2DV9A 3OJBA 2ZHKA 2YY1A 3BRFA 3H0OA 4LBOA 3RQ0A 3R05A 3ILFA 3EF2A 4WBCA 2UWAA 1JT4A 3H6SE 3MEPA 3NV4A 3MPPG 5KXDA 4I96A 3D7WB 2NM1A 1TIEA 4A7ZA 4MYEA 2AXMA 1PZ9A 4P9WA 4LBJA 3RG0A 4H9WA 4DQAA 4QBVA 4YW1A 5IT6A 1LOGA 4AVVA 4EFQA 3KMVA 4Q9PA 2AREA 2ZQOA 2GMMA 3WMUA 1SBEA 1SBFA 5IUQA 2AR6A 3VEQA 3HALA 1IS6A 4HJJA 1PZ8A 2W68A 1V6MA 3N3HA 4Y22A 3FJHA 4UW6A 1BYHA 4EKXB 1CE7B 2QN4A 3OJ2A 3LCPA 1C57A 4I4YA 3VT2A 5E88A 4ZFYB 2MIBA 4AN6A 3IM6A 1S0BA 1DQGA 1W6QB 2ENRA 5GALA 4I4OA 3A23A 1IHKA 2GALA 4J2SA 3T1MA 1YRZA 3WLUA 9ILBA 3ZXLA 3PMEA 3BOPA 4X38A 4Q9GA 2RSTA 2QYIB 2DTYA 5H9RA 3WCRA 3B69A 1GNHA 3FJFA 2ZGTA 1R8OA 4XJ9A 3FLPA 1MC9A 4QKRA 3IPVA 3S8JA 4FPCA 3AP9A 1WBCA 3PVNA 3FJIA 3W59A 3BODA 3FUQA 1WW6A 4EB2B 4I30A 4YM3A 3CA1A 1C1LA 1LOFA 1HWNB 1S0JA 5BXRA 3N7KA 3BAQA 1SR4C 1WLDA 5IK8A 1IOBA 2H0BA 1CN1A 5FZUA 1ULDA 4UW5A 3WDXA 3UJ0A 2D3PA 4I8MA 1FATA 2WT0A 2AUYA 2W52A 3WDTA 3AKHA 4OWKA 4LO3C 1GICA 1DHKB 3BX1C 1HWPB 2A70A 2EIGA 1LHUA 1LULA 3BAVA 3WMVA 4GP0A 1GBGA 1YF8B 1PZZA 1UPSA 4F83A 1MVEA 4XMIA 3OY8A 1HQWA 4BPZA 1MS4A 3FJBA 5CA6A 3K1XA 3BA4A 3V79C 1BARA 1WCSA 1DQOA 3AFKA 5T5PA 1LTEA 1NLSA 3T1LA 3B9CA 5BXSA 4FP2A 4AN7B 4J2YA 1CJPA 3POWA 4YGCA 1DQ0A 1LU1A 2DWRA 3SNMA 3OBTA 5CB7A 4YM2A 3D5OA 5BOWA 1SLIA 2ZGNA 3CRGA 3ZSJA 1DYKA 3APBA 3CNAA 5GZGA 4QC4A 1G82A 2I1BA 3UJOA 1P63A 3WZ1A 4X39A 4ZA3B 2EXKA 3GALA 3WINC 2M49A 1QQKA 4KBBA 1PUUB 3ZSMA 1BLAA 1JLXA 5T55A 2D24A 1DGLA 2RHPA 4NOTA 3MW4A 1MR5A 1F9KA 2D3SA 4DS0A 5CNAA 3BRDA 2GNDA 3N7LA 3RSJA 1JW6A 1DZCA 1HKNA 4ZBVB 3NV2A 4XJUA 4GWMA 4JKQA 4EEEB 3F62B 4XILA 41BIA 1ONKB 2XG3A 2YZ4A 1GANA 4PF5A 2Q5TA 4W65A 2DVFA 1CR7A 2ZGSA 2LIQA 4P14A 2AQZA 1AVUA 2DURA 4I1BA 2NVHA 3I4IA 2E4MC 3VT0A 4ZFUB 2BEAA 1QOTA 1A78A 2P3KA 3JRRA 5JLVA 2A6WA 31BIA 1QU0A 4OW4A 1PC8B 5F5QA 2NMOA 4C1XA 2LIEA 1V6NA 2TEPA 4SLIA 2BEBA 1QOSA 3IM5A 3HR9A 2A3XA 4XJAA 2A7AA 1W6MA 1BLDA 1HCEA 4PCRA 4Y1YA 2P3IA 3NJ5A 3O4OA 4XJWA 4GWNA 2DRYA 3RRDA 5HCBA 3SITA 3MALA 1ULFA 2D22A 2ZHMA 4XXPA 1KQRA 5HPZA 2DRZA 3IM0A 4M3CF 4KEKA 1IT0A 5HCFA 1I3HA 2F8XC 3CRHA 3H6RB 1SACA 1RIRA 1WUVA 1V6OA 2D23A 1FWVA 4H55A 1BASA 3HN1A 4YM0A 3NBNA 3ZYPA 1PZ7A 2P34A 1DIWA 3P6JA 2A3WA 2D44A 2KH2A 2PHWA 1AJKA 2YV8A 1J0SA 3H6QA 1BXHA 2Q3NB 5D61A 1WW4A 3AJYA 4Q1PA 4DPNA 2UWBA 4RA0A 3UJQA 4M3CA 5FRAA 1SCRA 2DVGA 3NWKA 1S0FA 5IK4A 3AK0A 3OBRA 4BMEA 5GAQA 1VLNA 1WW7A 3ILRA 3BTAA 1N3QA 1AX1A 3A4UA 3I8TA 4FPGA 4IQPA 1DFQA 2GN7A 3O4BA 1TEIA 1UZZA 4LBQA 1QNYA 4GP3A 4DFSA 1OKQA 4IY9A 3NBDA 1HWMB 2DVBA 2ZMLA 5DUWA 1A8DA 1EPWA 2FHRA 2NTDA 4YGDA 4YG3A 1HWOB 1JOJA 4IHZA 4YM1A 2X2TA 3POKA 2Z42A 5EG6C 1V6VA 2GMEA 1GLHA 5KXBA 3CQAA 2JE9A 1IS5A 2A6ZA 2FGFA 4JAWA 2EALA 1LEMA 3LSEA 3DGTA 4YZ3A 3KM5A 4GOVA 3WOGA 1RITA 4LO2A 3QLQA 1Q8PA 4RL7A 4K20A 4WVWA 1QKQA 4J2XA 4YOLA 1BQPA 1R1ZA 1U0AA 3JU9A 1ISYA 2E51A 4L8QA 4Q27A 2D6PA 1AX0A 1JQZA 21BIA 2ZHNA 2YMZA 2VUAA 4NO4A 3OJMA 4QO3A 2WLQA 4I4VA 1ISZA 2AGSA 5BQUA 4YZ4A 2DS0A 4JRAA 5SV8A 4F34A 3VKMA 5DZFA 1MS8A 1N1VA 4GKXA 1NXD1 2VW1A 1FWUA 2DU0A 1PWAA 1JHNA 4D0ZA 5E89A 2ZACA 7I1BA 3P6IA 2PHXA 1BZWA 3WCSA 2YROA 3LSDA 4G6JA 3SH5A 4Y22B 5EC5A 3AH2A 2EXHA 2DUPA 2FFUA 2FDBM 4C1WA 1QXMA 1W6OB 2WKKA 1N3OA 5GLZA 4YZ2A 2W08A 5G00A 3M3CA 3RMYA 1LHWA 4A7YA 3BAGA 1VALA 2DUQA 4DEPA 5F8YA 4YFWA 4G1RA 5GM0A 4AWDA 3NV1A 5JOZA 1H30A 4GAFA 3FJJA 4Y26A 1GZCA 1CONA 2D3RA 1TFMB 1WW5A 3V0BB 3O5SA 3ZYRA 3TC2A 2VXRA 5DSSB 3FBYA 4BLJA 3AP6A 2P2KA 4DENA 3AH4A 3HBWA 4QBCA 1G9BA 3O3QA 4JKXB 1C4RA 1GSLA 1ULGA 2J3PA 2NMNA 5GZCA 1VAMA 1SLAA 4Y1VA 4OEGA 4YFZA 4P0KA 4Y20A 4XFUA 4ENDA 1V6WA 3B01A 5H9PA 3IKWA 5EHAA 3Q9OA 3OYWA 5BVPI 1CIWA 4Q26A 1CPNA 3AJ6A 3WA1A 4P9XA 4XYXA 1UMZA 5DUXA 3V0AA 5DZGA 2FO1A 2D6LX 5KXEA 4LBLA 1M16A 2DVDA 1O4YA 2HYKA 3AKIA 4Q1RA 4BLIA 4A7KA 4J2KA 1GNZA 4YGEA 2JJ6A 2E6VA 4YGBA 4GA9A 5IK7A 1E0OA 4QKSA 4OZXA 1LGBA 4FPLA 1W0PA 4USOA 1QDOA 4I7IA 1RINA 1W6PA 2A75A 3OJVA 1VIWB 3ATGA 1KNMA 3I2XA 4XFSA 2D7FA 2ZGRA 1MS1A 2JD4A 4XDQA 1D2SA 2ZR1B 1S0EA 2VU9A 3A07A 3N0KA 1ITBA 3A22A 2WQZC 3CU1B 1V6KA 3RS6A 1EYLA 1F31A 2XB6C 4LBKA 5D62A 1Z78A 2ZMNA 2ZGLA 2ZABA 1F5FA 3WUCA 1LEDA 1LODA 1MACA 1FYUA 1KDMA 1N47A 1C1FA 3ILAA 1APNA 4WZFA 5GLUA 4M01A 1N4KA 4LO8B 1ENSA 1JY0A 1G9CA 5T5LA 1JBCA 3BA5A 4BQ1A 1Q8VA 2KI6B 1LOAA 1SR4A 1BFFA 4GKYA 2Y9FA 3D4KA 5HCAA 2DTWA 3AZWA 2KM2A 2LALA 2D7IA 1G8WA 1O4ZA 3OPZA 4XHXA 1S0GA 1UL9A 3WO2A 1CESA 1Q8OA 4R9CA 4EFRA 4HR6C 3VWCA 3AP4A 3WO3A 4UW4A 2WJSA 1WD3A 4LO3A 3ZPYA 5JOXA 1S1AA 1IRPA 2HZ9A 3T8SA 2ERMA 1FQ9A 1EVTA 1MS9A 3MW3A 3BIWE 3ZXGA 1OQLB 1G7YA 1V6UA 1HIBA 1LCLA 4CZSA 3ILNA 3JUTA 4WVVA 1IS4A 1IKQA 3O44A 2ES3A 2ET2A 4IZEA 1DQ2A 1URXA 2ARXA 3QR5A 1LENA 1TP0A 4YLZA 4XTMA 5CAZA 1V6XA 4ISRA 3O5WB 3IAGC 1XYFA 2WT2A 1YI7A 2GNTA 3RMXA 2D20A 2E53A 2A5ZA 1IILA 5JDBA 5DXDA 2XOAA 1KJRA 3NBCA 1ENRA 1SLCA 3LLPA 2HW9A 2UURA 1YYNA 3PUBA 1KJLA 1AF9A 3AZXA 1IJTA 2VSEA 2ZGMA 3IIRA 3SH3A 3N35A 3AZVA 2A71A 1N3PA 3P53A 4ZFWB 1JT3A 4ATFA 4I2SA 3V65A 3CA0A 3O4CA 4Q8LA 3N36A 1MZ6A 4XBQA 3WINA 3JUUA 1JYCA 4P0LA 3VSZA 1LOEA 3INAA 4LBQD 1QDCA 2WBCA 1OFSA 3RTIB 1G9FA 4H04A 4XKIA 5IK5A 3RTJB 4BMBA 1JT5A 1M2TB 5H9QA 5FZYA 1W6NB 2B7YA 4FVVA 1SFYA 1BFBA 3NBEA 2G4IA 3WV6A 5L73A 5E24E 3AYAA 3VKOA 4R9BA 4XBNA 2FMDA 4XJZA 2E4MA 2FFVA 3TAYA 3A0KA 3FJAA 3WG2A 1AXYA 2YXSA 2Y9WC 1WBLA 1LU2A 1RZOB 1NZKA 3ASIA 3GNEA 1Q8QA 1MS5A 4I4SA 4Z8BA 5FNWA 5BXTA 1TWEA 1VCLA 1DZQA 1L2HA 4YW4A 2WRYA 3ZXDA 2UWCA 1BKZA 5T50A 3U4XA 3UK9A 4ZGRB 1AVWB 2JE7A 4FPKA 1AX2A 1AFCA 2GZBA 3FGMA 1HQLA 1JTCA 1S0DA 4I4QA 1LGNA 1XZZA 1ONAA 1MD6A 5BYNA 2D6OX 5AVAA 3SISA 1Z0HA 1HKDA 4ZXKA 1WLWA 4I37A 1FX5A 4QALA 1QOOA 3W58A 1KRIA 1Y7BA 1I1EA 2NP0A 4EFPA 2ZGUA 4XZPA 1FGAA 2VSAA 2D7RA 4HL0A 1Q04A 3POYA 4LO0C 4YW2A 4I1EA 4Y24A 4AVTA 4TLPA 3FJDA 4ATEA 3USUA 4FPJA 4WV8A 1GZWA 3SLIA 3VKFC 5H9SA 2HWAA 2ZGQA 1FMMS 3ZSKA 5T5JA 4Q91A 1RMLA 2V73A 3VV1A 2ZA9A 4G9NA 1FNYA 2EAKA 3L2YA 2CNAA 2ZMKA 2SLIA 1SLBA 4U36A 4LBMA 4I4XA 1S0CA 4HANA 4FOVA 4OWLA 3HSMA 3AJZA 4KEIA 3PHZA 2HWMA 1FMZA 1LHOA 2A6YA 4M3CE 3VSFA 1JUIA 4DRVA 3M3QA 2A3YA 5EXOA 3B9UA 3B00A 1TTUA 5CBLA 2KLLA 1QF3A 1PUMB 3ZSLA 4I4UA 1QMJA 3M3EA 2IHOA 4GAIA 2ZHLA 1JYIA 1MS0A 5GZDA 3KQRA 2E7TA 1G86A 2GN3A 4FPHA 5EYXA 3UD8A 4YW3A 1IOAA 5F8WA 1ZM1A 1B09A 4Z9WB 2MC2A 1ISXA 1AVBA 4TZDA 4AGRA 4DRRA 4YZ5A 1SBDA 1I1BA 1DQ6A 2EXIA 2ERFA 3AZYA 4LO1C 3AX4A 1XG6A 2RQ9A 4AYUA 2R0FA 3M2MA 4II0A 4XFTA 3QCWA 4P9YA 1JLYA 4XTPA 2JDZA 3WVJA 1MS3A 2OW4A 4LO1A 2VY0A 3WDYA 4P6AA 2P39A 3F1RA 2NN8A 4YZ1A 3R4UA 2Z48A 3O0XA 5DUVA 2CTVA 2WT1A 4XE9A 4Z8SB 5JOYA 2GDFA 3O49A 4XIKA 2OUHA 2KI4A 2DREA 1FAYA 3ZVXA 1AXKA 3IPVB 1G9AA 5DZEA 5B2HA 3VT1A 1DZDA 3BA7A 1WD4A 3ZC8A 3AH1A 3A0NA 4ITCA 2ZKNA 3SNVA 2L5XA 2EXJA 1W0OA 5BP5C 2GNMA 3PG0A 4D0TA 4OEEA 3CAHA 1CQ9A 3WUDA 5DZUA 1ISVA 3WG1A 2C5DA 2VW2A 2ZBJA 8I1BA 2AAIB 4PQ9A 5BP5A 2K4AB 4Y1XA 2A6XA 2CWMA 3N7MA 2PHUA 3I29B 1XHBA 1LHNA 4YG0A 4R6UB 4KEJA 5JVVA 5E8AA 4Q2FA 2V5YA 1DBNA 4PBPA 1OQ1A 1GGPB 1UN1A 1FNZA 2WSVA 4ZOTA 4YG6A 2PHFA 1Q56A 5DG1A 3DUIA 4JCKA 2D6MA 5JOWA 3BB2A 4I3NA 2Y9XE 3FLTA 1W3GA 3D6EA 5DG2A 1W6OA 1QNWA 1UX6A 2R1BA 3ZXEA 4PBOA 3BAHA 1JN2P 1V6IA 2E7QA 2ESUA 3O12A 1NUNA 3UD9A 4YW5A 2NZ9A 1KDKA 2NYYA 1DQ4A 3PVEA 3OY8B 2I2SA 3FLRA 3ENRA 5KXCA 3WHUA 3IM7A 4IZXA 4AGGA 1BFGA 3SH4A 3AP7A 3V0BA 2P3JA 2D6NA 2PHRA 1ABRB 1Q03A 1HLCA 1AZDA 3M3OA 1T4QA 1CVSA 2DYCA 5T52A 4FP3A 3AYEA 4X3AA 1LOFC 2JKBA 1ISWA 5FREA 2ZQNA 2VH9A 3Q7XA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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