2D44A

Crystal structure of arabinofuranosidase complexed with arabinofuranosyl-alpha-1,2-xylobiose
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMANNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The family 42 carbohydrate-binding module of family 54 alpha-L-arabinofuranosidase specifically binds the arabinofuranose side chain of hemicellulose
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
total genus 155
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2005-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2d44A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2d44A02
31BIA 1ENRA 2ZR1B 4Y1XA 1QDCA 1WBLA 5DG2A 1RY7A 1GSLA 3KMVA 2DVAA 2PHFA 2DVGA 4GP3A 2DRYA 2EALA 1ONAA 2ZKNA 1SZ6B 2Y9XE 1BFFA 5BXRA 7I1BA 1CR7A 1BJQA 4ZLBB 1GICA 4XJWA 2D3SA 1DQ5A 1T9FA 3VV1A 2D1ZA 1MS3A 2VSAA 1SLAA 1O4YA 2DVDA 4J2SA 4XJAA 4LBLA 5GZGA 4KEIA 3BAUA 3BX1C 4YLZA 3AZWA 3IIRA 4HANA 4D8HA 2YMZA 5GAQA 5CNAA 3RG0A 2A5ZA 3V0BA 1XZZA 1O4ZA 4I1BA 3RMXA 5GLUA 3BA7A 5HPZA 1DZQA 3A4UA 1LU1A 1WW5A 4DRVA 1MVEA 3AK0A 1GLHA 3ATGA 4FPEA 4BQ1A 5JOYA 5KXDA 1GNHA 4I30A 4CJMA 3ZC9A 3BTAA 1KJRA 1V6MA 3GALA 2E4MC 4FPFA 1FV3A 3RS6A 5CAZA 5DUWA 4PBOA 4Q9PA 2WJSA 4AYUA 5BYNA 1N3OA 1NXD1 3FJDA 2D24A 2ZGLA 4P6AA 3APBA 3AXEA 3ZC8A 5DVHA 3CA6A 3DGTA 1AVWB 3UDAA 3WCRA 1YYNA 3T1LA 5BXSA 1B09A 3FBYA 1W6MB 4U36A 1QDOA 2ES3A 5GJ6A 1W6PA 2XB6C 3NV4A 1DQ4A 2VXTI 5F8WA 3N7JA 1CJPA 3H6QA 2CTVA 1UX6A 4I0YA 4AGVA 2R0FA 1QNWA 4IONA 1F31A 3VKLA 4OWLA 3SNMA 2NTDA 3AJ5A 1OKQA 3FUOA 2A71A 3TC2A 3D7WB 4ITCA 4PF5A 4TYSA 1Z2VA 3GNEA 2AYHA 4GWNA 4M00A 3C2UA 2CWMA 1S0DA 2AAIB 4FOWA 3UK9A 1LOEA 5JOWA 1YBIA 1L2HA 3OBRA 4GXLA 3I4IA 4I4SA 3IN9A 3ZSMA 1ULDA 3E8LC 1SBDA 3WO4A 3NBDA 3OY8B 1DFCA 5T5LA 1WLWA 1MACA 3SH4A 1C57A 3CA5A 2E53A 2D22A 3AZZA 2ZACA 4H55A 3A0KA 4R9AA 5BP5A 4LO1A 4M3CF 3DUIA 2EIGA 1R1ZA 2I1BA 2GMEA 4XKIA 4LO2A 3NBNA 3F1RA 1LCLA 1AZDA 1GZWB 1AX1A 2WNEA 4YW5A 1IT0A 2ZHKA 1YIFA 4LBQD 5DZGA 3BAOA 2P37A 1N4KA 2GN3A 4XIKA 1Y7BA 2FFUA 4CRQA 1DZCA 1W6PB 4P9WA 3FJFA 1CVNA 1GBGA 1BQPA 1AXKA 4P0JA 2A6ZA 3AP6A 3M3CA 4AN7B 4IY9A 1G9DA 2EXKA 3WDWA 1EPWA 4YW1A 2ZGRA 2VUAA 2JE7A 5BVPI 1A3KA 2F8XC 4Y22A 4XJZA 1AJKA 1HKNA 4XHBA 3B9UA 2IHOA 4G9MA 1V6JA 4K21A 3M2MA 4UW3A 4ZA3B 4YG6A 3M3QA 3IM6A 3HBWA 1N1SA 4K20A 1P63A 4YFZA 5GLTA 4GOVA 4SLIA 2KM2A 5HCAA 2EAKA 3WINC 1G7YA 1W3AA 3M1HA 4AWDA 2NVHA 4BMBA 4YZ1A 4TZDA 1W0PA 5FREA 1LGNA 1LGCA 5BXTA 2JECA 4LBQA 1ZM1A 4Q1RA 3AYAA 2CNAA 3ZXDA 1M2TB 3AH4A 1HQLA 3RRDA 3WLUA 2E7TA 4ZKTB 3N3HA 3W59A 2LTNA 4QD2C 1JTCA 4I4VA 3B01A 2L5XA 1PUMB 4AVVA 4H04A 1DZDA 4XMIA 1LOBA 1LOFC 3A0NA 4FP2A 2FO1A 1E0OA 4QALA 4GA9A 3JUUA 5T55A 3VT0A 1FAYA 2OUHA 2MC2A 3RTJB 3WG1A 2GNDA 3SLIA 3O0XA 2XG3A 1C4RA 4DEPA 4FQ4A 4F34A 2LALA 1V6IA 3D6EA 1Z0HA 1MS8A 5F5QA 3WDXA 1J1TA 4TLPA 3UD9A 1GNZA 2VU9A 4LBJA 5CB7A 2R49A 2ZBJA 2P39A 1FWUA 1HWOB 3FJJA 3NBCA 4FOQA 4FPOB 4X3AA 2TEPA 4A7KA 1ZA4A 3PHZA 4FVVA 3N7LA 4Y20B 4D0TA 2D3RA 3INAA 2W52A 4MYEA 2GMPA 4JCKA 2WSVA 1ULFA 3A21A 2YV8A 1N1TA 2ENRA 4P9YA 5F8SA 5F90A 4ENDA 1DYKA 4LO0C 1LGBA 4Y22B 2ZQOA 1Q8VA 3U4XA 3ILAA 1IS3A 2JDZA 3QCWA 5FZYA 5BQUA 4I4QA 1NZKA 2A6YA 1JXNA 2Z49A 1S0JA 1HDKA 1WW6A 4DQAA 4JAWA 21BIA 1SACA 2GNMA 8I1BA 2OW4A 4XFTA 3V64A 1N3QA 3BRFA 4LBQB 2WLQA 2D6PA 4R9CA 1H9WA 3WVJA 1BFBA 5FRAA 2HYKA 1V6VA 2A3WA 3QLQA 1PZ9A 3EF2A 2NN8A 4HJJA 1APNA 2GZBA 2GALA 4YM0A 4YZ3A 4YZ4A 3N0KA 2ESUA 1BZWA 2X2SA 3PVEA 3KM5A 1RITA 3IM7A 2P3JA 3S8JA 3OGGA 3UJ0A 2VW0A 4LO8B 3ILFA 4EB2B 4X37A 4ZBVB 3FLRA 1G9BA 4G6MA 3O49A 3B69A 4X38A 4GWMA 4GP0A 4ISRA 2ERFA 1S0CA 4I8MA 4I3NA 2R0HA 3ILRA 1W6MA 3A07A 2ZHMA 4CTEA 2Z42A 4Q8LA 1SCRA 3WG3A 3ZSKA 2MIBA 3A22A 4USPA 2BQPA 4PC4A 3ZXKA 5IK4A 1RINA 1LHNA 4XZPA 4FPCA 4FOVA 4JQ0A 2VXRA 1AJOA 4ASMB 4QKRA 5SV8A 2RQ9A 3M3EA 4A7ZA 1ULEA 5EHAA 4L4HA 4LBOA 2C9AA 1T4QA 3AJ6A 1MS5A 2AR6A 3LSDA 3AKIA 1OQLB 1W6NA 1DIWA 4YM1A 3M3OA 1JBCA 5E88A 1YI7A 1SFYA 4BPZA 5GZCA 5GZDA 3NV3A 4P9XA 5EWSA 3O4OA 4DFSA 4LO3C 3CNAA 4I4YA 3AZXA 1YO8A 5EG6C 2EF6A 4YGDA 1R8NA 1PZ8A 2NMOA 3OYWA 4R9DA 3I2AA 1C1LA 1QQKA 3OY8A 1XHBA 4YFWA 1FV2A 4J2YA 2AUYA 4QO3A 1W3GA 2EXIA 5KXEA 4R9BA 4JKXB 4C1WA 5FNWA 1F9KA 1UL9A 4Y1UA 3FJIA 2IWTB 2UU8A 4Y1ZA 1LJ7A 3NV1A 3WG2A 1HLCA 1R8OA 3WMUA 2A7AA 2R1BA 1TTUA 4XTPA 2D7FA 4XMAA 5IK7A 1EV2A 3R4UA 1GZWA 3ZXEA 3VUOA 2E4MA 4IHZA 3BRGC 5IUQA 2GDFA 4LO7C 3HMYA 3H6RA 1IS5A 1ULGA 4J2KA 4W65A 3BB2A 5JDBA 2G4IA 3TB0A 4DPNA 2ERMA 2HZ9A 2D6OX 3AZVA 3LSEA 1OQ1A 4FP3A 2DU1A 3P6JA 3ZYPA 2RG9B 3WO3A 1TP0A 3WDTA 3AP4A 3MEPA 4II0A 1SBFA 2JD4A 2YZ4A 3CU1B 1EVTA 3WG4A 3AJZA 4IY8A 3SH3A 3AH2A 1KNMA 1KJLA 2UUSA 4I7IA 1IS6A 1QGLA 1MS1A 1S1AA 3BAQA 1N3PA 1ISZA 2ZMKA 5T50A 3IAGC 2PHTA 3ZYRA 1PWAA 4M01A 3IM0A 3WA1A 1W6NB 3FUQA 1AXMA 1WW4A 5JLVA 2B7YA 4XHXA 3V0AA 5T5JA 1K5VA 2DREA 4G6JA 1SLTA 5DG1A 2D6KA 5E24E 4U2AA 4BLJA 3KQRA 3UL2A 4EKXB 2YROA 2HWAA 1A78A 3OYWB 2ZQNA 2WT1A 3O12A 3MPPG 4FGFA 2Q5TA 1NLSA 4J23B 1KRIA 2JE9A 1MZ5A 1WUVA 4YOLA 2FHRA 3A23A 3NJ5A 1HKDA 3FLPA 4XBQA 4Q9GA 5GZEA 3WO2A 2DS0A 4P14A 2GNTA 1LEDA 4ATEA 4YGCA 3V79C 3WHTA 2BEBA 1GV9A 2DVBA 1S0LA 3AKGA 1LEMA 1AVUA 1V00A 4DCKC 1VAMA 4XDQA 4XIOA 4AGRA 3H6RB 4GALA 2AGSA 1IILA 1JYCA 1LU2A 3WCSA 3AP5A 2R16A 1H30A 1C1FA 2VY0A 4XYXA 1S0IA 3FJ9A 2FGFA 4QKSA 1SLIA 4Y20A 3ZXFA 1S0GA 2ZAAA 2D23A 5GLVA 4OWKA 2WT2A 4Q8KA 3FJBA 3R05A 4Q91A 4HR6C 1YRZA 2ARXA 1HWPB 3CAHA 1BA7A 3CA1A 3AJYA 3NV2A 1JW6A 1JYIA 3SNVA 5E8AA 1V6UA 3POWA 1LESA 4Y1VA 1RMLA 4USOA 4LBKA 2ZGTA 1TFMB 4IYBA 3Q9OA 4Q1PA 1Q04A 1G86A 4BLIA 3VT2A 2D44A 4WV8A 3V0AB 4Y24A 1DQ6A 2AH2A 1D2SA 4UW5A 1ISWA 2CWSA 4R6UB 1LHVA 3USUA 2UURA 1V6XA 1D0HA 1H9PA 1N1VA 1Q56A 4JPZA 3Q7WA 1SR4C 2D3PA 3ZVXA 4XFUA 1N1YA 1K5UA 3HR9A 1KDMA 3WDVA 1J0SA 1VLNA 3T1MA 1LOGA 2D6LX 3WINA 2PHRA 2GNBA 1WD3A 2VH9A 4K1ZA 1U0AA 2VLCA 1Z4SA 2QN4A 2F2FC 4BM8A 2D43A 3LCPA 2RHPA 2WT0A 3CA3A 4GOYA 3N7MA 4FOYA 1QOSA 1CN1A 3ZSJA 1DFQA 2ZGKA 2A6WA 3JU9A 1JT4A 1VIWB 2ARBA 4EFRA 1QNYA 1JQZA 1VCLA 1AVBA 1II4A 4M3CE 4AVSA 3O44A 1W6OB 3RQ0A 1BLAA 5L73A 5JVVA 3VKFC 5H9PA 1LOFA 2AREA 2E7QA 4OEFA 3AZYA 3RMYA 5JOXA 4XBLA 1FWVA 3B00A 2K8RA 2J3PA 5F9TA 1X50A 2P3KA 5GALA 2X2TA 3W58A 2UWAA 2VW2A 1JT7A 4OWJA 1MS9A 5H9QA 1BFCA 3F62B 2A75A 4J2XA 3BODA 3POSA 1CQ9A 4XXPA 2CY6A 4AGGA 1ULCA 1HWMB 1BKZA 4XE9A 1FN0A 2DU0A 3IM5A 5CBLA 3ZSLA 1VALA 4OW4A 2DYCA 4YGBA 5KXCA 4DRRA 2K43A 1IKQA 1HIBA 2ZHNA 3POKA 4YZ2A 2RSTA 2CL2A 2ZMNA 4Z8BA 4JP0A 4LO0A 2WQZC 2NM1A 1S0FA 2ZGUA 2ZHLA 3WV6A 1JT3A 3PVOA 4KBBA 4H9WA 4IZXA 1EYLA 5H9RA 3I29B 2VW1A 1PUUB 1UN1A 3QR5A 3OJBA 3USUB 1TOOA 1UZZA 3IMNA 1DQOA 2V73A 1ISYA 4Z9WB 1WBCA 2D7RA 3FJCA 4Q26A 2D7IA 5GZFA 2D6MA 4XTMA 4PBPA 2E51A 3VWCA 2BEAA 2KI4A 1URXA 1TWEA 2NZ9A 5D63A 1QF3A 3H0OA 4X39A 2D6NA 4PQ9A 3FFZA 1CIWA 1LOCA 2KLLA 3OPZA 2DUQA 4KC3A 1UZYA 4QD2B 1A8DA 4I37A 3O4CA 1V6WA 1XQNA 4EFQA 3T2TA 1WCSA 3D4KA 1ISXA 3RTIB 2M49A 2AFGA 3WUCA 4BOWA 1AF9A 2Q3NB 4YM3A 3OGFA 5IT6A 2VSEA 4FQZA 2LIQA 3JRRA 1TIEA 5DZEA 2DURA 3O0VA 3BOPA 1PZ7A 5EYXA 2ET2A 3V65A 1SCSA 1LHOA 2WKKA 3R4SA 3L2YA 2WBCA 1WBFA 2NP0A 1IRPA 1V6OA 2DUOA 4FPLA 1BXHA 1G9CA 2UWBA 2PHWA 2ZGMA 2JJ6A 3BA4A 2R1DA 3C9ZA 1N47A 2KI6B 5KXBA 1W6QA 3ENRA 4WVWA 3O4DA 2D20A 3S8KA 4P0LA 3O0WA 2JKBA 1DQ0A 3VKOA 6I1BA 1FMZA 5T52A 1QQLA 4QC4A 3ZXGA 2AXMA 4HA2A 3QYDA 1AVXB 5DSSB 2DTWA 1I1BA 5FZUA 2SLIA 4ZFYB 4ZGRB 1IJTA 5DZUA 4DENA 1IOBA 2W08A 3UJQA 3MW4A 1FGAA 4L8QA 5CA6A 3HALA 3T8SA 5HCBA 1FQ9A 5FZZA 4LO3A 1GZ9A 3MALA 2ZMLA 3AYEA 3AFKA 4ISQA 3CA0A 1TEIA 5I1BA 1DLLA 3AXDA 1ENQA 3Q7XA 4FPJA 2BFHA 4YGEA 3MW3A 1BFGA 1CVSA 4A7YA 1I3HA 5JMCA 1RG8A 3HN1A 3LLPA 1AXYA 1HCEA 2P2KA 3SH5A 4D69A 4KEKA 5D61A 3BAGA 2Y9GA 4YG0A 1MZ6A 2KH2A 4I4PA 3BAHA 3OJVA 3CRGA 5E89A 5JOZA 3WOGA 3AX4A 4M3CB 3ZX7A 2PHXA 1SLCA 3UJOA 2ZGQA 2XOAA 3CRIA 1KQRA 4XBNA 4JRAA 1GANA 2Y9WC 1FATA 3SITA 1WBAA 3AH1A 1QKQA 4WBCA 3WHUA 4WVVA 3BADA 5LK5A 3N36A 3WMVA 4UW4A 1W3FA 1Q8QA 2OVUA 5T5PA 4ZOTA 4GAIA 3ASIA 3ZXJA 3AP7A 3ZPYA 2YXSA 1V6NA 5IK8A 3CQAA 4I4XA 3PMEA 2C5DA 5FNXA 1W6QB 4XOGA 1DBNA 2DV9A 1F5FA 2I2SA 4OEEA 1DQ2A 1OFSA 2ZGSA 4I4OA 3PVNA 5GLZA 4QBCA 4OEGA 3OBTA 1S0BA 2AQZA 4LBMA 2HW9A 1JLXA 2P23A 4EEEB 2ZA9A 3AYCA 1RIRA 5DZFA 2DRZA 3JUTA 4DS0A 3WDYA 1CE7B 1M16A 3WUDA 1JUIA 4BMEA 2WRYA 4FPGA 1JT5A 1GYKA 4I6IA 2DVFA 3IPVA 3UD8A 5BXPA 2H0BA 1MS0A 4LBNA 1IS4A 1CESA 4AN6A 3V0BB 1FNYA 3N35A 2Z48A 4NOTA 1HQWA 5DUYA 3K1XA 1YF8B 2DUPA 3O3QA 1JHNA 4P0KA 5BP5C 1LODA 4LO1C 3B3QE 4I96A 2A3XA 1V6KA 2K4AB 3B9CA 4XILA 4XJ9A 1W6OA 4LO2C 1UAIA 4RL7A 4XJUA 3FJEA 3BA5A 3VSFA 1Z78A 1W0OA 4GKXA 2ZZJA 2P34A 3VEQA 3O4AA 4JC1A 3FJKA 3HOMA 4I4RA 1PC8B 4LO7B 1WLCA 1WD4A 2ZABA 2ZGNA 4XJ8A 2EXHA 2DTYA 3FJ8A 3VT1A 1YXWA 1LECA 1Q8OA 3OJ2A 1MS4A 3P6IA 3BIWE 1Q1UA 2A70A 2GMMA 1ONKB 1ENSA 3VKMA 5DUXA 1SBEA 2P3IA 1GKBA 4NO4A 1G82A 2GN7A 1AFCA 4I2SA 1CPNA 5H9SA 3PG0A 1FNZA 4EFPA 2SBAA 2ZGOA 1G9AA 1LOAA 1DGLA 4G9NA 1FMMS 3FLTA 2Y9FA 1ITBA 3UD7A 4FPHA 4YW3A 5D62A 2FMDA 3LTQA 5B2HA 3TAYA 1FX5A 3VKNA 1DQ1A 3AP9A 2W39A 2V5YA 5GLWA 41BIA 3AKHA 4D0ZA 3N7KA 3NWKA 2PHUA 1KITA 1FYUA 3P53A 3IPVB 2UWCA 5BOWA 2YUGA 1LTEA 1SR4A 1JN2P 3PJQA 1QOTA 3UJ4A 1G8WA 1AVAC 2AENA 3HSMA 1IHKA 1Q03A 4G1RA 2HWMA 5AVAA 3NBEA 1V6LA 3WZ1A 4GKYA 2ZGPA 5HCFA 1MC9A 4KEJA 1UMZA 1JLYA 3O5SA 2KKIA 1QOOA 3MW2A 2Q9XA 1BARA 1AX0A 3BRDA 2F2FA 5T5OA 5T54A 2FFVA 4AVTA 4YW2A 4ZFWB 4Y1YA 1BASA 1HWNB 4YW4A 1GGPB 1QMJA 2OUJA 4OUJA 4ZXKA 2QYIB 1YTOA 1SLBA 3CRHA 4CZSA 1G9FA 1WW7A 4YM2A 4I1EA 9ILBA 2MLLB 1JOJA 1BLDA 3PUBA 3I2XA 4Q27A 1CPMA 5EYYA 3FGMA 4YZ5A 2PELA 3O4BA 2A6XA 1WLDA 1LENA 1AX2A 2FDBM 3H6SE 2LIEA 4XFSA 1DJSB 3ILNA 4Z8SB 5G00A 4Y26A 1RZOB 2W68A 4FPKA 3OJMA 3I8TA 3POYA 5DUUA 4FPYA 5EC5A 2GO2A 3FJAA 1S0EA 5BQUC 1ILR1 5EXOA 2R9KB 4UW6A 3W9TA 2E6VA 4IZEA 1IOAA 5IK5A 4C1XA 2NYYA 4WZFA 1MD6A 3WNXA 1IKPA 1UKGA 1SLLA 4OZXA 1XYFA 3RSJA 4RA0A 2YY1A 1PZZA 3ZXLA 2NMNA 3WDUA 3O5WB 2DWRA 1TWMA 3SISA 1IRAX 1LHWA 1CONA 1QXMA 4K1YA 1ABRB 2A3YA 3IKWA 1Q8SA 1BYHA 3VSZA 4JKQA 5F8YA 3Q7YA 4I4UA 3AKFA 1MVQA 5GM0A 1ISVA 1LHUA 1DYPA 4IQPA 1MR5A 1DHKB 1HCDA 4QBVA 1DQGA 3BAVA 4PCRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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