2D44A

Crystal structure of arabinofuranosidase complexed with arabinofuranosyl-alpha-1,2-xylobiose
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMANNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The family 42 carbohydrate-binding module of family 54 alpha-L-arabinofuranosidase specifically binds the arabinofuranose side chain of hemicellulose
pubmed doi rcsb
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
total genus 155
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2005-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2d44A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2d44A02
3FLTA 2A3WA 4UW4A 2UUSA 4LO1C 1FWVA 4LO3C 2A5ZA 4JRAA 2D6KA 3FFZA 4GXLA 4FOYA 1R8NA 1LHVA 4LBLA 4H55A 1HWOB 2A70A 4OEGA 4XMAA 4I30A 4C1WA 4I6IA 3LSEA 3C2UA 2Q3NB 4LO7C 3O5WB 4LBQD 3AJYA 2V73A 3Q7YA 5HCAA 1DQ6A 5GZDA 1R1ZA 5T5LA 1SBFA 3APBA 4OUJA 1GGPB 2A6ZA 4QD2B 1LOAA 4PBOA 3ZSJA 4LO2C 4ZOTA 1AX1A 1UN1A 1CR7A 1I1BA 3IAGC 3N35A 2AAIB 3FJDA 1A78A 2DU1A 1TP0A 1CONA 5JDBA 3BRDA 4XJWA 1GZWA 1FN0A 5F8YA 1JT3A 4HR6C 4DENA 1DZQA 4LBJA 1LECA 1SLAA 4JAWA 1UZYA 4I4UA 1SBDA 4OWLA 2F2FC 3FJBA 2YZ4A 1HQWA 3P6JA 3AYEA 3O12A 3IIRA 2Q5TA 2ZA9A 3PHZA 4QKRA 3JRRA 1LEMA 5HCFA 2GDFA 4J2YA 2JECA 3KMVA 1V6IA 3AP9A 2LTNA 4JKXB 1FNZA 2B7YA 2KM2A 1G7YA 1LGCA 3AJ6A 3WOGA 2ARXA 1GYKA 4LBNA 2WT2A 1L2HA 4XDQA 4G6JA 1XZZA 4X3AA 3I29B 2P2KA 1S0BA 5JMCA 2NTDA 2NN8A 1MS8A 3AP7A 4IQPA 3A0KA 2D6OX 3BAHA 4II0A 4P9XA 2BFHA 5JVVA 3CA4A 5JOWA 4FPYA 4YW4A 1RMLA 4JCKA 4LO7B 1LEDA 3SNVA 4R9CA 2DTYA 2ZGTA 1IKPA 4ZKTB 3WDVA 3OYWB 4OEEA 3AZYA 3WHUA 2ZGPA 3NBEA 5F8SA 4Y20B 1Z2VA 8I1BA 2D24A 3OY8A 1YRZA 3I2XA 2KKIA 1QDOA 1G9DA 2ZHKA 4CZSA 2AFGA 1AVAC 4XILA 3CA5A 5BP5A 1LJ7A 3POSA 3BA4A 3WDXA 4JPZA 1JT7A 3AKFA 4Q1PA 5DUYA 5EXOA 4OW4A 1KDKA 1QU0A 2ZGNA 1W6NB 3B9UA 3ZXDA 1GNZA 1O4ZA 4H9WA 4BQ1A 3WG1A 1SR4A 4TYSA 3WO2A 1Q8QA 3QLQA 4L4IA 1ILR1 1EVTA 4TLPA 1ABRB 4GA9A 1WD4A 3ZSMA 5F90A 1IRPA 1MS5A 3ZYRA 3F62B 4M3CB 1K5VA 3AZXA 4I96A 2WSUA 4AVSA 1UAIA 3O4CA 5JOXA 2HZ9A 4XKIA 2I1BA 2DVBA 3IM5A 4GALA 2D23A 1JW6A 5DXDA 3ZC8A 3HALA 4XBNA 4PBPA 1F5FA 4M3CF 3WA1A 4GOYA 2W39A 1G9AA 4NO4A 2GNTA 3VUOA 2FFVA 4I8MA 3OBTA 3H6RB 1S1AA 1PWAA 4YW3A 4YZ4A 2R0FA 1LHNA 1BARA 4XXPA 2E53A 2VW1A 1FATA 1JLYA 4G1RA 3POWA 3POYA 3NV3A 3SITA 1XG6A 2VSEA 5GJ6A 31BIA 4EFPA 1KDMA 1BQPA 4YZ2A 3N7JA 2ZMKA 4YGBA 2D3PA 4BMEA 1FAYA 4FGFA 1YBIA 2ZGOA 5GAQA 1LOEA 4XOGA 5D62A 4XIKA 3JUTA 2ZHNA 2MLLB 3O44A 5FNXA 5E24E 3H6QA 2EXHA 4GP3A 3WO3A 4LO0C 1X50A 1UMZA 1W6MB 5KXEA 5EYXA 3SH3A 4XFSA 3VSZA 2OVUA 3T2TA 1ENRA 2A6XA 1JY0A 4J2SA 2MC2A 3UJOA 2HWMA 4LBQA 4ISQA 5BXSA 1SFYA 1ENSA 4UW5A 1W0OA 2D22A 1IILA 4JQ0A 4YOLA 3V0AA 5BOWA 4Y1VA 4HJJA 2D7RA 4XHXA 3WHTA 2P3IA 5CB7A 2GNMA 1DQOA 1HCDA 4R9BA 3A0NA 1JBCA 1FMZA 3AZWA 3IN9A 3I8TA 3OJMA 5GZFA 4JP0A 1WW7A 1HQLA 4GWNA 1VLNA 1AXMA 1AVXB 2EIGA 1CVNA 4R6UB 3CRHA 3WDWA 1VALA 3DGTA 2JE9A 3HSMA 4R9AA 3GNEA 3ASIA 1GLHA 3BODA 5H9SA 5HCBA 1MS3A 2ZHMA 1ENQA 1N3QA 4Z8BA 3L2YA 2ERFA 5GLVA 1ZA4A 4QBCA 3S8JA 1W3AA 3UL2A 1IT0A 1FV3A 3NV1A 3VKFC 3AYCA 4KEKA 3VV1A 4YG0A 1EPWA 4U2AA 4XJUA 1W6QA 1IOAA 4ZA3B 3V79C 3ILFA 2IHOA 3WMUA 4XJ8A 2FDBM 5DUWA 2NVHA 1KJRA 5FREA 3SLIA 3O0VA 4IONA 2G4IA 2RG9B 4DCKC 3BAVA 3HBWA 5GZGA 1JT5A 1ISXA 4FP3A 2YUGA 2RSTA 1ULEA 1A3KA 1BKZA 3AJ5A 1JYIA 1S0IA 4Y1ZA 4USPA 3MW4A 1YIFA 3FJFA 2GALA 2SLIA 4EKXB 3FJ8A 4XBQA 3WZ1A 3ZXFA 1LULA 4FPKA 1LHOA 1OQLB 2VXTI 41BIA 1IKQA 1GICA 4J2XA 2JD4A 1BA7A 4P6AA 5SV8A 2D43A 2P34A 1WW4A 1TWMA 1IHKA 5DZEA 2ZGSA 3BAGA 3B69A 4Y1XA 1YTOA 3CU1B 5DG1A 1WBLA 2CYFA 3WCSA 3BAOA 1DJSB 4I4SA 2NMOA 5H9PA 3CA6A 4XTPA 3M2MA 3FJJA 1QOSA 3NBCA 4AGVA 1PUMB 4IZXA 4YG6A 2PHUA 1HWMB 1WW5A 2DUPA 3O0XA 4Y1YA 5IK4A 4CTEA 3W58A 1DLLA 2J3PA 1DQ0A 4AVTA 1BXHA 1TOOA 3C9ZA 4YGDA 5F8WA 4KC3A 4ZFUB 3MEPA 3AK0A 3HOMA 4DS0A 1LHUA 1QNYA 5IK5A 4FQ4A 2D20A 1IRAX 3AP6A 4A7YA 4K21A 2PHFA 3QYDA 2JE7A 3NWKA 4YGCA 4LBMA 1QXMA 2FHRA 3PVOA 3AKHA 1IJTA 3IM6A 1IS3A 2VH9A 4Q8LA 1DHKB 2DWRA 21BIA 1DYPA 3T8SA 4I37A 1ULGA 2A6WA 4YM3A 1UZZA 1OKQA 1RITA 1WD3A 3P6IA 3NJ5A 1XQNA 2LIQA 1V6OA 4G9MA 3VT1A 4ZFWB 2VUAA 1SLCA 1QQKA 2DVFA 3RMYA 1EV2A 1MS0A 3JU9A 3OYWA 4RA0A 2YV8A 5E88A 1DZCA 2OW4A 2C9AA 2A6VA 4Y20A 3NV2A 4LO2A 2M49A 3WNXA 1HDKA 5EC5A 1NLSA 1WLCA 4GKYA 2VXRA 1APNA 2A71A 3UK9A 2WBCA 3IM0A 2DRYA 1W6PB 3HN1A 3O3QA 4XE9A 3D5OA 1HKDA 2A7AA 1S0EA 5EG6C 1UPSA 1W6NA 1K5UA 3ATGA 4YW5A 2A3XA 3M3EA 4QALA 2ZQNA 2OUHA 3AH2A 5BXTA 2F2FA 1YYNA 3ILRA 2DRZA 3O49A 2YY1A 4JC1A 5IK7A 3VKOA 4M3CA 2Y9FA 1SLIA 3OBRA 1BFGA 2ZQOA 4YZ5A 1RG8A 2Q9XA 3N36A 1MC9A 4I4RA 5FZYA 1AXKA 2DS0A 3O4OA 1Q8VA 1S0CA 3AXEA 1H9PA 1XYFA 2R0HA 2ZR1B 4I4XA 2CY6A 2EXJA 1T4QA 1MR5A 1QDCA 2E7QA 2KI4A 1G9FA 5CNAA 5JOZA 1WBCA 3H6RA 2Z49A 1GBGA 5E8AA 1VAMA 4YFWA 5E89A 4XFUA 1KJLA 3N0KA 5I1BA 4K1ZA 5GM0A 3AJZA 2JKBA 3OJBA 4H04A 2E4MC 3WUDA 4DPNA 2ET2A 1S0DA 2PHRA 3ILNA 2D6MA 3M3OA 2HWAA 2D6LX 3CNAA 2YMZA 1CVSA 1BASA 3MALA 3BAQA 4C1XA 4YFZA 1JTCA 2WRYA 4IY9A 3VSFA 1SLLA 4BMBA 3CRIA 1SLTA 3BRFA 1N1SA 4ISRA 4QKSA 1Q1UA 2UWAA 3OGGA 2WNEA 5F9TA 1W6MA 3A4UA 1SCRA 4U36A 1PUUB 4K1YA 5DUUA 3FJIA 3LLPA 1YXWA 4EFRA 1DFQA 4G9NA 2JDZA 3I4IA 1AX2A 2K43A 4I1BA 3VKNA 1N3PA 3WUCA 3AP4A 4XJ9A 1RIRA 1MVEA 2DV9A 5T50A 1QNWA 1BFCA 1ULFA 1LODA 1S0JA 1DZDA 3ENRA 2ZKNA 3W59A 4SLIA 1KQRA 1DQ5A 4XZPA 3WINA 4Q26A 2Y9XE 3RMXA 1M16A 1V00A 4Z9WB 4FPHA 2IWTB 3V0BB 1GZCA 1LOFC 3MW3A 3ZXEA 5DG2A 1AXYA 1ONAA 3GALA 2KH2A 1MZ5A 3FJAA 2D7FA 3VEQA 2LALA 4D0ZA 2Y9GA 4OEFA 4AN6A 1WW6A 5IT6A 1N4KA 1LGNA 2C5DA 2DVAA 5FRAA 2VW2A 4IYBA 1FYUA 1SCSA 2Z48A 3UD8A 1WBAA 1AVWB 1IS4A 3FJEA 2CWMA 2NYYA 3F1RA 1DQ2A 2V5YA 3IM7A 1ITBA 1AFCA 4DQAA 2R9KB 3T1MA 1G8WA 1V6UA 1W6OB 3INAA 1LESA 4USOA 3PUBA 1G82A 1ULDA 2WT0A 3VKLA 4FPLA 1VCLA 4BPZA 5BYNA 3PVNA 3FJCA 2OUJA 3WVJA 4I0YA 3NBNA 1W3GA 2EXKA 1HLCA 5FNWA 1SBEA 3CRGA 2NP0A 1JOJA 1AX0A 1H9WA 1S0GA 4YW1A 1HWNB 5DUVA 1SLBA 3N3HA 3AH1A 3S8KA 5EHAA 1LU1A 4DEPA 3O4DA 4YLZA 1NUNA 3OJ2A 1V6JA 3B9CA 4FP2A 3M3CA 3WDYA 2KI6B 4ZFYB 3AZZA 3ZC9A 1LENA 2NZ9A 5CAZA 2CTVA 2WKKA 4J2KA 3TC2A 1URXA 2TEPA 1E0OA 4J23B 3VKMA 2DUOA 1RINA 2WSVA 5DZGA 3WG3A 2H0BA 4D8HA 5T5PA 5KXDA 1BFFA 4L4HA 5KXCA 3ZXJA 2AYHA 3ILAA 4ZBVB 3KM5A 2ZACA 3UJ4A 1V6MA 5CBLA 3RTJB 1KNMA 1GZ9A 2FO1A 4PF5A 3B01A 4YW2A 2DU0A 1ISVA 4BLJA 3Q7XA 1B09A 1S0FA 1V6NA 2X2SA 5AVAA 1JLXA 5HPZA 3AP5A 3P53A 3FBYA 2GMMA 2GMEA 1U0AA 4GP0A 4IY8A 4I4VA 2ZGKA 2ZGMA 1QOOA 2ARBA 1G9CA 4EEEB 5G00A 4TZDA 2WJSA 5T54A 1YI7A 1R8OA 1W3FA 2Y9WC 5BQUC 4YGEA 1ISZA 1V6XA 1Q8SA 4Q1RA 1PZZA 4YZ3A 4K20A 1AXZA 5BVPI 4RL7A 3NBDA 3OGFA 4UW6A 1OFSA 1O4YA 1Q03A 4I3NA 2QN4A 1JYCA 4XYXA 5FZZA 3W9TA 3BAUA 1W0PA 3OPZA 3T1LA 3O0WA 2XOAA 4WVWA 3CA0A 2VSAA 1MVQA 2ZGUA 1LOGA 2ZMLA 1TIEA 4D0TA 3BRGC 3M1HA 4DRVA 3POKA 1AVBA 4WVVA 5T5JA 1JQZA 1Q8PA 3RTIB 2W68A 1Z0HA 3JUUA 4ZGRB 4OWJA 5DUXA 4AWDA 2UURA 1PZ7A 3OJVA 1W6PA 4EB2B 4GOVA 2D3RA 3WG2A 4MYEA 2A3YA 1CESA 4WBCA 3QR5A 1ISYA 2DYCA 2XG3A 9ILBA 2BEAA 1UX6A 4YM1A 5T52A 1AJKA 2GMPA 4X39A 3R05A 3AKIA 1N3OA 3CA1A 1DGLA 4XMIA 1QMJA 3TAYA 1GKBA 4ZLBB 4LO8B 4LO1A 1ZM1A 4LO3A 3VT0A 2P39A 2ZGLA 3PMEA 4Q9PA 4A7KA 2FFUA 2R49A 2Z42A 3UJ0A 2BEBA 3RRDA 1J0SA 3PG0A 3UJQA 4Y26A 4XBLA 4Q9GA 3IKWA 4ENDA 2DVDA 1JXNA 4JKQA 1TFMB 1FNYA 3LSDA 1DYKA 4Q27A 2UWCA 2D7IA 3PVEA 3LTQA 3ZPYA 1Q56A 1DQGA 2L5XA 2XB6C 4ATFA 4Y22B 3BOPA 2ESUA 2ZGRA 3HMYA 1F9KA 1D2SA 1DFCA 1DQ1A 3FJ9A 1V6WA 4GAIA 4M01A 5D63A 2DUQA 3WMVA 4PCRA 2AREA 4P14A 3USUB 1FGAA 1LGBA 5H9RA 3O5SA 1A8DA 2K4AB 2UU8A 4ATEA 3IPVB 4FOWA 4QC4A 3WO4A 3Q7WA 1TEIA 3AYAA 3WDUA 2WT1A 2ZHLA 3RQ0A 1NXD1 5T55A 3ZYPA 3A07A 2AR6A 4YM2A 1AVUA 2CNAA 3R4SA 1JT4A 1I3HA 3ZVXA 5FZUA 3SH4A 1C4RA 2K8RA 1VAVA 1IOBA 2ZZJA 2E7TA 1XHBA 4GKXA 2GNDA 1LTEA 3H6SE 4YM0A 2P23A 2P3JA 1GNHA 1Z4SA 3SNMA 4R9DA 1QQLA 3A21A 2HW9A 1MS1A 2YROA 3MPPG 3FUOA 1RZOB 2GNBA 2HYKA 1CJPA 4XTMA 4XJZA 5GLZA 2R1DA 2DURA 3KQRA 4YG3A 2SBAA 2A75A 3WV6A 3AYDA 1WLWA 3MW2A 1Q8OA 4PQ9A 3D4KA 2WLQA 2AENA 1LOCA 4OZXA 2W08A 1ISWA 5BP5C 2F8XC 3RSJA 3IMNA 3BA7A 1FQ9A 4ITCA 4FVVA 1S0LA 4FOQA 1VIWB 1SACA 4X37A 1CPNA 1H30A 1GZWB 4WZFA 2FGFA 1BZWA 2ERMA 4I4OA 1UKGA 3V0BA 3WG4A 1FMMS 3TB0A 4FOVA 1SR4C 1YO8A 1WLDA 1T9FA 4A7ZA 4FPGA 4XFTA 2P37A 1MS4A 1CIWA 1YF8B 3ZXGA 4PC4A 4IHZA 2W52A 3EF2A 4P9WA 1AZDA 1PZ9A 2E4MA 2AUYA 1ONKB 3O4AA 4YZ1A 5JLVA 1QGLA 1II4A 5DZUA 1LHWA 2EAKA 4F83A 3SH5A 2D3SA 1Z78A 1JHNA 1HWPB 1PZ8A 1CN1A 1W6OA 5DZFA 4CJMA 5CA6A 4I4PA 4CRQA 4Q8KA 2VY0A 1TTUA 2MIBA 2ZBJA 3QCWA 2ZMNA 3VT2A 4XHBA 3WINC 1MACA 3I2AA 3ZX7A 3FUQA 1MD6A 4Z8SB 1D0HA 5DVHA 3E8LC 3CAHA 1WUVA 3DUIA 1G9BA 5KXBA 1RY7A 5GLTA 1EYLA 1N1YA 4F34A 2EALA 4KEJA 2D1ZA 2DVGA 2GN7A 4I4YA 4AVVA 3AKGA 3OY8B 1OQ1A 3NV4A 1V6LA 1AJOA 5JOYA 2CL2A 3SISA 1QF3A 3VWCA 2JJ6A 3K1XA 2CWSA 3ZXLA 5L73A 2WQZC 1BYHA 2LIEA 5BXRA 1CE7B 1N1TA 1JUIA 4P9YA 1LOBA 1BFBA 4ZXKA 3FGMA 2ENRA 1MZ6A 2FMDA 1WCSA 1SZ6B 3UDAA 2ZABA 1NZKA 2UWBA 1LOFA 3UD9A 1HCEA 4HL0A 1I1EA 4P0KA 2P3KA 3BIWE 5GZEA 1UL9A 3ZSLA 2AQZA 4L8QA 3U4XA 1KITA 4FPFA 4LBKA 3FJKA 2EXIA 3V64A 1G86A 4D69A 4DRRA 3AXDA 3WDTA 1C1LA 4LO0A 2ZAAA 3M3QA 3AX4A 2GZBA 4KEIA 5GALA 4BM8A 1LU2A 2BQPA 4XXAA 1MS9A 3B3QE 4FQZA 3A23A 2E6VA 4P0JA 3V65A 3BA5A 4G6MA 3HR9A 2RQ9A 1CPMA 3CA3A 1FWUA 4I1EA 1TWEA 4AGRA 1M2TB 5D61A 3Q9OA 3N7MA 3A22A 5H9QA 1N1VA 5GZCA 2RHPA 4M00A 2PHTA 3R4UA 2AXMA 4QO3A 4Y1UA 2I2SA 2PHXA 3D6EA 4BOWA 5T5OA 3BTAA 4AN7B 1KRIA 1LCLA 2R1BA 3PJQA 1QOTA 1QKQA 1GANA 5BXPA 2AH2A 1IS5A 4I7IA 4AYUA 3O4BA 1DQ4A 2DTWA 4FPCA 6I1BA 1Y7BA 2DREA 3RG0A 4W65A 5EYYA 2AGSA 4LBOA 3BX1C 1BLAA 2E51A 4KBBA 3ZXKA 5IK8A 2NM1A 3ZSKA 4HA2A 1C57A 3FJHA 3N7LA 3UD7A 2GN3A 1AF9A 3FLPA 3N7KA 4FPEA 5GLWA 1GV9A 3D7WB 4OWKA 3RS6A 4QBVA 5GLUA 5IUQA 4DFSA 4P0LA 3BB2A 2KLLA 4LBQB 2QYIB 4AGGA 1BJQA 1FV2A 5F5QA 3BADA 2D44A 4EFQA 2X2TA 3V0AB 1F31A 2R16A 1DIWA 2GO2A 4ASMB 4X38A 4QD2C 4UW3A 3AZVA 3LCPA 1DBNA 3FLRA 4I2SA 5DSSB 1N47A 4I4QA 3H0OA 3AFKA 1HKNA 4IZEA 1V6VA 5LK5A 7I1BA 2PELA 2NMNA 3CQAA 2PHWA 2ZGQA 4Q2FA 2VU9A 1JN2P 2D6NA 3WCRA 3B00A 5BQUA 1CQ9A 2ES3A 4Y22A 4GAFA 1C1FA 1BLDA 2VLCA 1WBFA 1Q04A 4Y24A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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